Name: Doğal γH2A ile yaygın kırılgan bölge kırılmalarının yakalanması. X ChIP (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-01-24T14:20:00.000+00:00
Duration: 9 min 46 s
Description: Keşfedin, doğal γH2A.X ChIP yöntemiyle yaygın kırılgan bölge kırılmalarını hızlı ve verimli bir şekilde tespit etme tekniğini. Bu yöntem, kanser araştırmalarında genomik instabilite çalışmalarını kolaylaştırır.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Glover, T. W., Berger, C., Coyle, J., Echo, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+polymerase+alpha+inhibition+by+aphidicolin+induces+gaps+and+breaks+at+common+fragile+sites+in+human+chromosomes%5BTitle%5D)+AND+%22Hum+Genet%22%5BJournal%5D)">DNA polymerase alpha inhibition by aphidicolin induces gaps and breaks at common fragile sites in human chromosomes.</a> Hum Genet. 67 (2), 136-142 (1984).</li>
<li>Bignell, G. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Signatures+of+mutation+and+selection+in+the+cancer+genome%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Signatures of mutation and selection in the cancer genome.</a> Nature. 463 (7283), 893-898 (2010).</li>
<li>Hellman, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+role+for+common+fragile+site+induction+in+amplification+of+human+oncogenes%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Cell%22%5BJournal%5D)">A role for common fragile site induction in amplification of human oncogenes.</a> Cancer Cell. 1 (1), 89-97 (2002).</li>
<li>Kotzot, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Parental+origin+and+mechanisms+of+formation+of+cytogenetically+recognisable+de+novo+direct+and+inverted+duplications%5BTitle%5D)+AND+%22J+Med+Genet%22%5BJournal%5D)">Parental origin and mechanisms of formation of cytogenetically recognisable de novo direct and inverted duplications.</a> J Med Genet. 37 (4), 281-286 (2000).</li>
<li>Miller, C. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genomic+amplification+of+MET+with+boundaries+within+fragile+site+FRA7G+and+upregulation+of+MET+pathways+in+esophageal+adenocarcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Oncogene%22%5BJournal%5D)">Genomic amplification of MET with boundaries within fragile site FRA7G and upregulation of MET pathways in esophageal adenocarcinoma.</a> Oncogene. 25 (3), 409-418 (2006).</li>
<li>Zack, T. I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pan-cancer+patterns+of+somatic+copy+number+alteration%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Genet%22%5BJournal%5D)">Pan-cancer patterns of somatic copy number alteration.</a> Nat Genet. 45 (10), 1134-1140 (2013).</li>
<li>Gao, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Common+fragile+sites+%28CFS%29+and+extremely+large+CFS+genes+are+targets+for+human+papillomavirus+integrations+and+chromosome+rearrangements+in+oropharyngeal+squamous+cell+carcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+Chromosomes+Cancer%22%5BJournal%5D)">Common fragile sites (CFS) and extremely large CFS genes are targets for human papillomavirus integrations and chromosome rearrangements in oropharyngeal squamous cell carcinoma.</a> Genes Chromosomes Cancer. 56 (1), 59-74 (2017).</li>
<li>Thorland, E. C., Myers, S. L., Gostout, B. S., Smith, D. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Common+fragile+sites+are+preferential+targets+for+HPV16+integrations+in+cervical+tumors%5BTitle%5D)+AND+%22Oncogene%22%5BJournal%5D)">Common fragile sites are preferential targets for HPV16 integrations in cervical tumors.</a> Oncogene. 22 (8), 1225-1377 (2003).</li>
<li>Matovina, M., Sabol, I., Grubisić, G., Gasperov, N. M., Grce, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+human+papillomavirus+type+16+integration+sites+in+high-grade+precancerous+cervical+lesions%5BTitle%5D)+AND+%22Gynecol+Oncol%22%5BJournal%5D)">Identification of human papillomavirus type 16 integration sites in high-grade precancerous cervical lesions.</a> Gynecol Oncol. 113 (1), 120-127 (2009).</li>
<li>Yu, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+role+of+viral+integration+in+the+development+of+cervical+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Genet+Cytogenet%22%5BJournal%5D)">The role of viral integration in the development of cervical cancer.</a> Cancer Genet Cytogenet. 158 (1), 27-34 (2005).</li>
<li>Bignell, G. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Signatures+of+mutation+and+selection+in+the+cancer+genome%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Signatures of mutation and selection in the cancer genome.</a> Nature. 463 (7283), 893-898 (2010).</li>
<li>Thavathiru, E., Ludes-Meyers, J. H., MacLeod, M. C., Aldaz, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Expression+of+common+chromosomal+fragile+site+genes%2C+WWOX%2FFRA16D+and+FHIT%2FFRA3B+is+downregulated+by+exposure+to+environmental+carcinogens%2C+UV%2C+and+BPDE+but+not+by+IR%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Carcinog%22%5BJournal%5D)">Expression of common chromosomal fragile site genes, WWOX/FRA16D and FHIT/FRA3B is downregulated by exposure to environmental carcinogens, UV, and BPDE but not by IR.</a> Mol Carcinog. 44 (3), 174-182 (2005).</li>
<li>Sirbu, B. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+protein+dynamics+at+active%2C+stalled%2C+and+collapsed+replication+forks%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+Dev%22%5BJournal%5D)">Analysis of protein dynamics at active, stalled, and collapsed replication forks.</a> Genes Dev. 25 (12), 1320-1327 (2011).</li>
<li>Barlow, J. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+early+replicating+fragile+sites+that+contribute+to+genome+instability%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Identification of early replicating fragile sites that contribute to genome instability.</a> Cell. 152 (3), 620-632 (2013).</li>
<li>Petermann, E., Orta, M. L., Issaeva, N., Schultz, N., Helleday, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hydroxyurea-stalled+replication+forks+become+progressively+inactivated+and+require+two+different+RAD51-mediated+pathways+for+restart+and+repair%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell%22%5BJournal%5D)">Hydroxyurea-stalled replication forks become progressively inactivated and require two different RAD51-mediated pathways for restart and repair.</a> Mol Cell. 37 (4), 492-502 (2010).</li>
<li>Rogakou, E. P., Pilch, D. R., Orr, A. H., Ivanova, V. S., Bonner, W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+double-stranded+breaks+induce+histone+H2AX+phosphorylation+on+serine+139%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">DNA double-stranded breaks induce histone H2AX phosphorylation on serine 139.</a> J Biol Chem. 273 (10), 5858-5868 (1998).</li>
<li>Shanbhag, N. M., Rafalska-Metcalf, I. U., Balane-Bolivar, C., Janicki, S. M., Greenberg, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ATM-dependent+chromatin+changes+silence+transcription+in+cis+to+DNA+double-strand+breaks%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">ATM-dependent chromatin changes silence transcription in cis to DNA double-strand breaks.</a> Cell. 141 (6), 970-981 (2010).</li>
<li>Stiff, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ATR-dependent+phosphorylation+and+activation+of+ATM+in+response+to+UV+treatment+or+replication+fork+stalling%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">ATR-dependent phosphorylation and activation of ATM in response to UV treatment or replication fork stalling.</a> EMBO J. 25 (24), 5775-5782 (2006).</li>
<li>Nelson, J. D., Denisenko, O., Bomsztyk, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fast+chromatin+immunoprecipitation+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Nuc+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Fast chromatin immunoprecipitation assay.</a> Nuc Acids Res. 34 (5), e2(2006).</li>
<li>Dorbic, T., Wittig, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+of+oligonucleosomes+from+active+chromatin+using+HMG17-specific+monoclonal+antibodies%5BTitle%5D)+AND+%22Nuc+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Isolation of oligonucleosomes from active chromatin using HMG17-specific monoclonal antibodies.</a> Nuc Acids Res. 14 (8), 3363-3376 (1986).</li>
<li>Dorbic, T., Wittig, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromatin+from+transcribed+genes+contains+HMG17+only+downstream+from+the+starting+point+of+transcription%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">Chromatin from transcribed genes contains HMG17 only downstream from the starting point of transcription.</a> EMBO J. 6 (8), 2393-2399 (1987).</li>
<li>Hebbes, T. R., Thorne, A. W., Crane-Robinson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+direct+link+between+core+histone+acetylation+and+transcriptionally+active+chromatin%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">A direct link between core histone acetylation and transcriptionally active chromatin.</a> EMBO J. 7 (5), 1395-1402 (1988).</li>
<li>Hebbes, T. R., Thorne, A. W., Clayton, A. L., Crane-Robinson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Histone+acetylation+and+globin+gene+switching%5BTitle%5D)+AND+%22Nuc+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Histone acetylation and globin gene switching.</a> Nuc Acids Res. 20 (5), 1017-1022 (1992).</li>
<li>Hebbes, T. R., Clayton, A. L., Thorne, A. W., Crane-Robinson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Core+histone+hyperacetylation+co-maps+with+generalized+DNase+I+sensitivity+in+the+chicken+beta-globin+chromosomal+domain%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">Core histone hyperacetylation co-maps with generalized DNase I sensitivity in the chicken beta-globin chromosomal domain.</a> EMBO J. 13 (8), 1823-1830 (1994).</li>
<li>Orlando, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mapping+chromosomal+proteins+in+vivo+by+formaldehyde-crosslinked-chromatin+immunoprecipitation%5BTitle%5D)+AND+%22Trend+Biochem%2C+Sci%22%5BJournal%5D)">Mapping chromosomal proteins in vivo by formaldehyde-crosslinked-chromatin immunoprecipitation.</a> Trend Biochem, Sci. 25 (3), 99-104 (2000).</li>
<li>Myers, F. A., Evans, D. R., Clayton, A. L., Thorne, A. W., Crane-Robinson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Targeted+and+extended+acetylation+of+histones+H4+and+H3+at+active+and+inactive+genes+in+chicken+embryo+erythrocytes%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Targeted and extended acetylation of histones H4 and H3 at active and inactive genes in chicken embryo erythrocytes.</a> J Biol Chem. 276 (23), 20197-20205 (2001).</li>
<li>Litt, M. D., Simpson, M., Recillas-Targa, F., Prioleau, M. N., Felsenfeld, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transitions+in+histone+acetylation+reveal+boundaries+of+three+separately+regulated+neighboring+loci%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">Transitions in histone acetylation reveal boundaries of three separately regulated neighboring loci.</a> EMBO J. 20 (9), 2224-2235 (2001).</li>
<li>Madisen, L., Krumm, A., Hebbes, T. R., Groudine, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+immunoglobulin+heavy+chain+locus+control+region+increases+histone+acetylation+along+linked+c-myc+genes%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">The immunoglobulin heavy chain locus control region increases histone acetylation along linked c-myc genes.</a> Mol Cell Biol. 18 (11), 6281-6292 (1998).</li>
<li>Clayton, A. L., Hebbes, T. R., Thorne, A. W., Crane-Robinson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Histone+acetylation+and+gene+induction+in+human+cells%5BTitle%5D)+AND+%22FEBS+Lett%22%5BJournal%5D)">Histone acetylation and gene induction in human cells.</a> FEBS Lett. 336 (1), 23-26 (1993).</li>
<li>Tseng, Z., Wu, T., Liu, Y., Zhong, M., Xiao, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Using+native+chromatin+immunoprecipitation+to+interrogate+histone+variant+protein+deposition+in+embryonic+stem+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Using native chromatin immunoprecipitation to interrogate histone variant protein deposition in embryonic stem cells.</a> Methods Mol Biol. 1176, 11-22 (2014).</li>
<li>Durkin, S. G., Glover, T. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromosome+fragile+sites%5BTitle%5D)+AND+%22Ann+Rev+Genetics%22%5BJournal%5D)">Chromosome fragile sites.</a> Ann Rev Genetics. 41, 169-192 (2007).</li>
<li>Lee, J. B., Keung, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromatin+immunoprecipitation+in+human+and+yeast+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Chromatin immunoprecipitation in human and yeast cells.</a> Methods Mol Biol. 1767, 257-269 (2018).</li>
<li>Miyamoto, R., Yokoyama, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protocol+for+fractionation-assisted+native+ChIP+%28fanChIP%29+to+capture+protein-protein%2FDNA+interactions+on+chromatin%5BTitle%5D)+AND+%22STAR+Protoc%22%5BJournal%5D)">Protocol for fractionation-assisted native ChIP (fanChIP) to capture protein-protein/DNA interactions on chromatin.</a> STAR Protoc. 2 (2), 100404(2021).</li>
<li>Mendez, J., Stillman, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromatin+association+of+human+origin+recognition+complex%2C+cdc6%2C+and+minichromosome+maintenance+proteins+during+the+cell+cycle%3A+Assembly+of+prereplication+complexes+in+late+mitosis%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Chromatin association of human origin recognition complex, cdc6, and minichromosome maintenance proteins during the cell cycle: Assembly of prereplication complexes in late mitosis.</a> Mol Cell Biol. 20 (22), 8602-8612 (2000).</li>
<li>Nowak, D. E., Tian, B., Brasier, A. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Two-step+cross-linking+method+for+identification+of+NF-%CE%BAB+gene+network+by+chromatin+immunoprecipitation%5BTitle%5D)+AND+%22BioTechniques%22%5BJournal%5D)">Two-step cross-linking method for identification of NF-κB gene network by chromatin immunoprecipitation.</a> BioTechniques. 39 (5), 715-725 (2005).</li>
<li>Schmittgen, T. D., Livak, K. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analyzing+real-time+PCR+data+by+the+comparative+C%28T%29+method%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Analyzing real-time PCR data by the comparative C(T) method.</a> Nat Protoc. 3 (6), 1101-1108 (2008).</li>
<li>Lu, X., Parvathaneni, S., Hara, T., Lal, A., Sharma, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Replication+stress+induces+specific+enrichment+of+RECQ1+at+common+fragile+sites+FRA3B+and+FRA16D%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cancer%22%5BJournal%5D)">Replication stress induces specific enrichment of RECQ1 at common fragile sites FRA3B and FRA16D.</a> Mol Cancer. 12, 29(2013).</li>
<li>Ruijter, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Amplification+efficiency%3A+linking+baseline+and+bias+in+the+analysis+of+quantitative+PCR+data%5BTitle%5D)+AND+%22Nucl+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Amplification efficiency: linking baseline and bias in the analysis of quantitative PCR data.</a> Nucl Acids Res. 37 (6), e45(2009).</li>
<li>Lyu, X., Chastain, M., Chai, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-wide+mapping+and+profiling+of+%CE%B3H2AX+binding+hotspots+in+response+to+different+replication+stress+inducers%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">Genome-wide mapping and profiling of γH2AX binding hotspots in response to different replication stress inducers.</a> BMC Genomics. 20, 579(2019).</li>
<li>Farmer, P. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+epidemiology+studies+of+carcinogenic+environmental+pollutants.+Effects+of+polycyclic+aromatic+hydrocarbons+%28PAHs%29+in+environmental+pollution+on+exogenous+and+oxidative+DNA+damage%5BTitle%5D)+AND+%22Mutat+Res%22%5BJournal%5D)">Molecular epidemiology studies of carcinogenic environmental pollutants. Effects of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) in environmental pollution on exogenous and oxidative DNA damage.</a> Mutat Res. 544 (2-3), 397-402 (2003).</li>
<li>Phillips, D. H., Arlt, V. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genotoxicity%3A+damage+to+DNA+and+its+consequences%5BTitle%5D)+AND+%22EXS%22%5BJournal%5D)">Genotoxicity: damage to DNA and its consequences.</a> EXS. 99, 87-110 (2009).</li>
<li>Nitsch, S., Schneider, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Native+ChIP%3A+Studying+the+genome-wide+distribution+of+histone+modifications+in+cells+and+tissue%5BTitle%5D)+AND+%22Meth+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Native ChIP: Studying the genome-wide distribution of histone modifications in cells and tissue.</a> Meth Mol Biol. 2846, (2024).</li>
<li>Nikitina, T., Wang, D., Gomberg, M., Grigoryev, S. A., Zhurkin, V. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Combined+micrococcal+nuclease+and+exonuclease+III+digestion+reveals+precise+positions+of+the+nucleosome+core%2Flinker+junctions%3A+implications+for+high-resolution+nucleosome+mapping%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Combined micrococcal nuclease and exonuclease III digestion reveals precise positions of the nucleosome core/linker junctions: implications for high-resolution nucleosome mapping.</a> J Mol Biol. 425 (11), 1946-1960 (2013).</li>
<li>Teves, S. S., Henikoff, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Salt+fractionation+of+nucleosomes+for+genome-wide+profiling%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Salt fractionation of nucleosomes for genome-wide profiling.</a> Methods Mol Biol. 833, 421-432 (2012).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>0.2 &mikro; m nitroselüloz membran</td><td>Amersham</td><td>10600011</td><td></td></tr><tr><td>Aktin B</td><td>protein teknolojisi</td><td>20536-1-AP</td><td></td></tr><tr><td>Afidikolin</td><td>MedChemExpress</td><td>HY-N6733 Serisi</td><td></td></tr><tr><td>ChIP sınıfı manyetik Protein A/G boncukları</td><td>Termo Fisher</td><td>26162</td><td></td></tr><tr><td>Berraklık Batı ECL Yüzey</td><td>Biyo-Rad</td><td>#1705061</td><td></td></tr><tr><td>Glikojen, moleküler biyoloji sınıfı</td><td>Termo Fisher</td><td>Kedi. No.&nbsp; R0561 Serisi</td><td></td></tr><tr><td>HRP-konjuge ikincil antikor&nbsp;</td><td>protein teknolojisi</td><td>SA00001-2</td><td></td></tr><tr><td>hidroksiüre&nbsp;</td><td>MedChemExpress</td><td>HY-B0313</td><td></td></tr><tr><td>Mikrokokal Nükleaz&nbsp;</td><td>NEB</td><td>M0247S</td><td></td></tr><tr><td>normal IgG&nbsp;</td><td>Santa Cruz</td><td>SC-2025</td><td></td></tr><tr><td>Taq Universal SYBR Yeşil Supermix&nbsp;</td><td>BioRad</td><td>1725120</td><td></td></tr><tr><td>&gamma; H2A. X antikoru&nbsp; (ChIP için)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>05-636</td><td></td></tr><tr><td>&gamma; H2A. X antikoru (WB için)</td><td>Hücre Sinyali</td><td>#25955</td><td></td></tr></tbody></table>

doğal γh2a ile yaygın kırılgan bölge kırılmalarının yakalanması. x chip

Capturing Common Fragile Site Breaks by Native &#947;H2A.X ChIP

Kromatin fragmanlarının boyutu, antikor bağlanması için DNA bölgelerinin erişilebilirliğini doğrudan etkilediği için Native ChIP'nin başarısı için çok önemlidir. Kromatin parçalanması için optimal MNaz konsantrasyonunu belirlemek için, değişen konsantrasyonlarda MNaz içeren bir dizi mikrosantrifüj tüpü hazırladık (ör., 0.0625 U, 0.125 U, 0.25 U, 0.5 U, 1 U, 2 U, 4 U, reaksiyon başına 8 U) ve 40 μL izole çekirdek. Her reaksiyon, bir dizi kromatin fragman boyutu elde etmek için 37 ° C'de 5 dakika inkübe edildi. MNase sindi...

Doğal γH2A ile yaygın kırılgan bölge kırılmalarının yakalanması. X ChIP

Replication stress induced by exposure to extrinsic agents can lead to DNA breaks at common fragile sites, which are regions in the genome known to be ...

capturing-common-fragile-site-breaks-by-native-h2ax-chip

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Biyokimya

Biz burada onların tam replikatif ve / veya kronolojik ömrü boyunca tek tomurcuklanan maya hücreleri sürekli ve yüksek çözünürlüklü mikroskopik görüntüleme sağlayan bir mikroakışkan cihazın çalışmasını gösterir.

Replikatif sürekli yüksek çözünürlüklü Mikroskobik Gözlem geliştirici Maya Yaşlanma

Bu yazıda tek bir hücre analizi için bir mikroakışkan çip sunuyoruz. Bu sağlar: hücre içi proteinler, enzimler, kofaktörler, ve floresan deneyleri veya bağışıklık aracılığıyla ikinci haberciler miktar.

Tek Hücrelerinin yönlü Kimyasal Analiz için mikroakışkan Chip

Çip üstü ara bağlantı yığınlarındaki zamana bağlı dielektrik bozulma (TDDB), mikroelektronik cihazlar için en kritik arıza mekanizmalarından biridir. Bu makale, transmisyon elektron mikroskobunda yerinde bir TDDB deneyinin prosedürünü göstermektedir ve bu, mikroelektronik ürünlerdeki arıza mekanizmasını incelemek için bir olasılık sunar.

Transmisyon Elektron Mikroskobu Situ Zamana bağlı Dielektrik Dağılımı In: Bir imkanı Mikroelektronik aygıtlar Başarısızlık Mekanizması Anlayın

Yüzey modelleme için Taramalı Tünelleme Mikroskobunun atomik metrolojisini seçici Atomik Katman Biriktirme ve Reaktif İyon Aşındırma ile birleştirmek için bir protokol rapor ediyoruz. Çok sayıda atmosferik maruziyet ve taşımayı içeren sağlam bir süreç kullanılarak, atomik metrolojiye sahip 3D nanoyapılar üretilir.

Atomik İzlenebilir Nanoyapı İmalatı

Burada deneysel protokoller gerçek zamanlı gözlem kendinden montajlı işlem için tanıtmak sıvı hücreli transmisyon elektron mikroskobu kullanarak.

Hücre içi sıvı iletim elektron mikroskobu nano tanecikleri, kendinden montajlı takibi için

Burada, açıklar gerilebilir, Çift Kanal imalatı, organ çip mikrosıvısal hücre kültür cihazlar organ düzeyi işlevlerine içinde in vitrorecapitulating için bir iletişim kuralı mevcut.

Ölçeklenebilir gerilebilir, Çift kanal, mikrosıvısal Organ cips imalatı

Bu makalede, yüksek basınç koşullarına uygun iki mikroakışkan üretim tekniğinin karşılaştırmalı bir çalışması olan fotolitografi/ıslak gravür/termal yapıştırma ve Seçici Lazer kaynaklı Gravür (SLE) gibi karşılaştırmalı bir çalışma anlatılmaktadır. Bu teknikler, rezervuar koşullarında taşıyıcı anne ve kırık sistemlerde sıvı akışının doğrudan gözlemi için platformları oluşturmaktadır.

Kırık Konvansiyonel Olmayan Rezervuarlarda Mikroölçekli Süperkritik CO2 Köpük Taşımanın Yüksek Basınçlı Testlerinde Mikroakışkan Üretim Teknikleri

Burada, yaygın olarak kullanılan birkaç numune hazırlama yöntemini detaylandırırken in situ TEM kapalı hücreli gaz reaksiyonu deneyleri yapmak için bir protokol sunuyoruz.

İletim Elektron Mikroskobunda In Situ Kapalı Hücreli Gaz Reaksiyonlarının Gerçekleştirilmesi

Mikroakışkan bir çip üzerinde fare embriyonik dokusunun kültürü ve manipülasyonu için bir protokol sağlanır. Yol modülatörlerinin darbelerini uygulayarak, bu sistem fare somitogenezinin fonksiyonel araştırması için sinyal salınımlarını harici olarak kontrol etmek için kullanılabilir.

Somitogenezi Yöneten Sinyal Salınımlarının Fonksiyonel Olarak İncelenmesi İçin Bir Mikroakışkan Yaklaşımı

Bu makale, tasarımdan fabrikasyona ve karakterizasyona kadar bir silisyum nitrür membran rezonatörünün yaşam döngüsünü izlemektedir.

High-Q Silisyum Nitrür Membran Rezonatörlerinin İmalatı ve Karakterizasyonu

Polidimetilsiloksan (PDMS) çip cihazlarının zarları için su geçirmez silikon bazlı contalar üretmek için yenilikçi bir sızdırmazlık protokolü. Laboratuvarlarda çip modelleri kurmak ve küçük ölçekli çip platformu geliştirme için tasarlanmıştır. Protokolü plastik ve doğal doku zarları kullanarak gösteriyoruz. Bu işlem yalnızca PDMS, toluen, küf, membran ve vakum odası gerektirir.

Esnek ve Güvenilir Yapıştırma için Erişilebilir Silikon Çip-Membran Sızdırmazlık Prosedürü

Keşfedin, doğal γH2A.X ChIP yöntemiyle yaygın kırılgan bölge kırılmalarını hızlı ve verimli bir şekilde tespit etme tekniğini. Bu yöntem, kanser araştırmalarında genomik instabilite çalışmalarını kolaylaştırır.

Doğal γH2A ile yaygın kırılgan bölge kırılmalarının yakalanması. X ChIP

Daha fazla video keşfet