Name: Gerçek Zamanlı PCR Kullanılarak SNP Genotipleme ile Caenorhabditis elegans Mayozunda Çaprazlama Sıklığı ve Dağılımı (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-07-11T15:30:00.000+00:00
Duration: 6 min 18 s
Description: Keşfedin, Caenorhabditis elegans mayozunda çaprazlama sıklığını ve dağılımını ölçmek için gerçek zamanlı PCR tabanlı SNP genotipleme yöntemini. Bu basit ve doğru yaklaşım, genetik araştırmalarda meiyotik rekombinasyon düzenlemesini anlamaya yardımcı olur.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Jones, G., Kleckner, N., Zickler, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Meiosis+through+three+centuries%5BTitle%5D)+AND+%22Chromosoma%22%5BJournal%5D)">Meiosis through three centuries.</a> Chromosoma. 133 (2), 93-115 (2024).</li>
<li>Hassold, T. J., Hunt, P. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Missed+connections%3A+Recombination+and+human+aneuploidy%5BTitle%5D)+AND+%22Prenat+Diagn%22%5BJournal%5D)">Missed connections: Recombination and human aneuploidy.</a> Prenat Diagn. 41 (5), 584-590 (2021).</li>
<li>Barnes, T. M., Kohara, Y., Coulson, A., Hekimi, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Meiotic+recombination%2C+noncoding+DNA+and+genomic+organization+in+caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Meiotic recombination, noncoding DNA and genomic organization in caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 141 (1), 159-179 (1995).</li>
<li>Lim, J. G., Stine, R. R., Yanowitz, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Domain-specific+regulation+of+recombination+in+Caenorhabditis+elegans+in+response+to+temperature%2C+age%2C+and+sex%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Domain-specific regulation of recombination in Caenorhabditis elegans in response to temperature, age, and sex.</a> Genetics. 180 (2), 715-726 (2008).</li>
<li>Rockman, M. V., Kruglyak, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recombinational+landscape+and+population+genomics+of+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">Recombinational landscape and population genomics of Caenorhabditis elegans.</a> PLoS Genet. 5 (3), e1000419(2009).</li>
<li>Brenner, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+genetics+of+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">The genetics of Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 77 (1), 71-94 (1974).</li>
<li>Li, W., Yanowitz, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Atm+and+atr+influence+meiotic+crossover+formation+through+antagonistic+and+overlapping+functions+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Atm and atr influence meiotic crossover formation through antagonistic and overlapping functions in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 212 (2), 431-443 (2019).</li>
<li>Rose, A. M., Baillie, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+effect+of+temperature+and+parental+age+on+recombination+and+nondisjunction+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">The effect of temperature and parental age on recombination and nondisjunction in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 92 (2), 409-418 (1979).</li>
<li>Villeneuve, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+cis-acting+locus+that+promotes+crossing+over+between+X+chromosomes+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">A cis-acting locus that promotes crossing over between X chromosomes in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 136 (3), 887-902 (1994).</li>
<li>Youds, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rtel-1+enforces+meiotic+crossover+interference+and+homeostasis%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Rtel-1 enforces meiotic crossover interference and homeostasis.</a> Science. 327 (5970), 1254-1258 (2010).</li>
<li>Emmons, S. W., Yesner, L., Ruan, K. S., Katzenberg, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evidence+for+a+transposon+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Evidence for a transposon in Caenorhabditis elegans.</a> Cell. 32 (1), 55-65 (1983).</li>
<li>Williams, B. D., Schrank, B., Huynh, C., Shownkeen, R., Waterston, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+genetic+mapping+system+in+Caenorhabditis+elegans+based+on+polymorphic+sequence-tagged+sites%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">A genetic mapping system in Caenorhabditis elegans based on polymorphic sequence-tagged sites.</a> Genetics. 131 (3), 609-624 (1992).</li>
<li>Hillers, K. J., Villeneuve, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromosome-wide+control+of+meiotic+crossing+over+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Chromosome-wide control of meiotic crossing over in C. elegans.</a> Curr Biol. 13 (18), 1641-1647 (2003).</li>
<li>Wicks, S. R., Yeh, R. T., Gish, W. R., Waterston, R. H., Plasterk, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+gene+mapping+in+Caenorhabditis+elegans+using+a+high-density+polymorphism+map%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Genet%22%5BJournal%5D)">Rapid gene mapping in Caenorhabditis elegans using a high-density polymorphism map.</a> Nat Genet. 28 (2), 160-164 (2001).</li>
<li>Campos, T. L., Korhonen, P. K., Sternberg, P. W., Gasser, R. B., Young, N. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Predicting+gene+essentiality+in+Caenorhabditis+elegans+by+feature+engineering+and+machine-learning%5BTitle%5D)+AND+%22Comput+Struct+Biotechnol+J%22%5BJournal%5D)">Predicting gene essentiality in Caenorhabditis elegans by feature engineering and machine-learning.</a> Comput Struct Biotechnol J. 18, 1093-1102 (2020).</li>
<li>Fay, D., Bender, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Snps%3A+Introduction+and+two-point+mapping%5BTitle%5D)+AND+%22WormBook%22%5BJournal%5D)">Snps: Introduction and two-point mapping.</a> WormBook. , (2008).</li>
<li>Hwang, H. Y., Wang, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fast+genetic+mapping+using+insertion-deletion+polymorphisms+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Fast genetic mapping using insertion-deletion polymorphisms in Caenorhabditis elegans.</a> Sci Rep. 11 (1), 11017(2021).</li>
<li>Davis, M. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+single+nucleotide+polymorphism+mapping+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">Rapid single nucleotide polymorphism mapping in C. elegans.</a> BMC Genomics. 6, 118(2005).</li>
<li>Livak, K. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Allelic+discrimination+using+fluorogenic+probes+and+the+5%27+nuclease+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Genet+Anal%22%5BJournal%5D)">Allelic discrimination using fluorogenic probes and the 5' nuclease assay.</a> Genet Anal. 14 (5-6), 143-149 (1999).</li>
<li>Li, Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+tumor+suppressor+BRCA1-BARD1+complex+localizes+to+the+synaptonemal+complex+and+regulates+recombination+under+meiotic+dysfunction+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">The tumor suppressor BRCA1-BARD1 complex localizes to the synaptonemal complex and regulates recombination under meiotic dysfunction in Caenorhabditis elegans.</a> PLoS Genet. 14 (11), e1007701(2018).</li>
<li>Saito, T. T., Lui, D. Y., Kim, H. M., Meyer, K., Colaiacovo, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interplay+between+structure-specific+endonucleases+for+crossover+control+during+Caenorhabditis+elegans+meiosis%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">Interplay between structure-specific endonucleases for crossover control during Caenorhabditis elegans meiosis.</a> PLoS Genet. 9 (7), e1003586(2013).</li>
<li>Saito, T. T., Youds, J. L., Boulton, S. J., Colaiacovo, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Caenorhabditis+elegans+him-18%2Fslx-4+interacts+with+slx-1+and+xpf-1+and+maintains+genomic+integrity+in+the+germline+by+processing+recombination+intermediates%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">Caenorhabditis elegans him-18/slx-4 interacts with slx-1 and xpf-1 and maintains genomic integrity in the germline by processing recombination intermediates.</a> PLoS Genet. 5 (11), e1000735(2009).</li>
<li>Longo, M. C., Berninger, M. S., Hartley, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+uracil+DNA+glycosylase+to+control+carry-over+contamination+in+polymerase+chain+reactions%5BTitle%5D)+AND+%22Gene%22%5BJournal%5D)">Use of uracil DNA glycosylase to control carry-over contamination in polymerase chain reactions.</a> Gene. 93 (1), 125-128 (1990).</li>
<li>Kutyavin, I. V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((3%27-minor+groove+binder-DNA+probes+increase+sequence+specificity+at+pcr+extension+temperatures%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">3'-minor groove binder-DNA probes increase sequence specificity at pcr extension temperatures.</a> Nucleic Acids Res. 28 (2), 655-661 (2000).</li>
<li>Hammarlund, M., Davis, M. W., Nguyen, H., Dayton, D., Jorgensen, E. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Heterozygous+insertions+alter+crossover+distribution+but+allow+crossover+interference+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Heterozygous insertions alter crossover distribution but allow crossover interference in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 171 (3), 1047-1056 (2005).</li>
<li>Hodgkin, J., Horvitz, H. R., Brenner, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nondisjunction+mutants+of+the+nematode+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Nondisjunction mutants of the nematode Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 91 (1), 67-94 (1979).</li>
<li>Meneely, P. M., Farago, A. F., Kauffman, T. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Crossover+distribution+and+high+interference+for+both+the+X+chromosome+and+an+autosome+during+oogenesis+and+spermatogenesis+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Crossover distribution and high interference for both the X chromosome and an autosome during oogenesis and spermatogenesis in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 162 (3), 1169-1177 (2002).</li>
<li>Nabeshima, K., Villeneuve, A. M., Hillers, K. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromosome-wide+regulation+of+meiotic+crossover+formation+in+Caenorhabditis+elegans+requires+properly+assembled+chromosome+axes%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Chromosome-wide regulation of meiotic crossover formation in Caenorhabditis elegans requires properly assembled chromosome axes.</a> Genetics. 168 (3), 1275-1292 (2004).</li>
<li>Phillips, C. M., Dernburg, A. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+family+of+zinc-finger+proteins+is+required+for+chromosome-specific+pairing+and+synapsis+during+meiosis+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Cell%22%5BJournal%5D)">A family of zinc-finger proteins is required for chromosome-specific pairing and synapsis during meiosis in C. elegans.</a> Dev Cell. 11 (6), 817-829 (2006).</li>
<li>Mancera, E., Bourgon, R., Brozzi, A., Huber, W., Steinmetz, L. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-resolution+mapping+of+meiotic+crossovers+and+non-crossovers+in+yeast%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">High-resolution mapping of meiotic crossovers and non-crossovers in yeast.</a> Nature. 454 (7203), 479-485 (2008).</li>
<li>Qi, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+meiotic+crossovers+and+gene+conversion+by+whole-genome+sequencing+in+Saccharomyces+cerevisiae%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">Characterization of meiotic crossovers and gene conversion by whole-genome sequencing in Saccharomyces cerevisiae.</a> BMC Genomics. 10, 475(2009).</li>
<li>Miller, D. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+whole-chromosome+analysis+of+meiotic+recombination+in+Drosophila+melanogaster%5BTitle%5D)+AND+%22G3+%28Bethesda%29%22%5BJournal%5D)">A whole-chromosome analysis of meiotic recombination in Drosophila melanogaster.</a> G3 (Bethesda). 2 (2), 249-260 (2012).</li>
<li>Carlton, P. M., Farruggio, A. P., Dernburg, A. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+link+between+meiotic+prophase+progression+and+crossover+control%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">A link between meiotic prophase progression and crossover control.</a> PLoS Genet. 2 (2), e12(2006).</li>
<li>Tsai, C. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Meiotic+crossover+number+and+distribution+are+regulated+by+a+dosage+compensation+protein+that+resembles+a+condensin+subunit%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+Dev%22%5BJournal%5D)">Meiotic crossover number and distribution are regulated by a dosage compensation protein that resembles a condensin subunit.</a> Genes Dev. 22 (2), 194-211 (2008).</li>
<li>Bhalla, N., Wynne, D. J., Jantsch, V., Dernburg, A. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zhp-3+acts+at+crossovers+to+couple+meiotic+recombination+with+synaptonemal+complex+disassembly+and+bivalent+formation+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">Zhp-3 acts at crossovers to couple meiotic recombination with synaptonemal complex disassembly and bivalent formation in C. elegans.</a> PLoS Genet. 4 (10), e1000235(2008).</li>
<li>Yokoo, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cosa-1+reveals+robust+homeostasis+and+separable+licensing+and+reinforcement+steps+governing+meiotic+crossovers%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Cosa-1 reveals robust homeostasis and separable licensing and reinforcement steps governing meiotic crossovers.</a> Cell. 149 (1), 75-87 (2012).</li>
<li>Almanzar, D. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Meiotic+DNA+exchanges+in+C.+elegans+are+promoted+by+proximity+to+the+synaptonemal+complex%5BTitle%5D)+AND+%22Life+Sci+Alliance%22%5BJournal%5D)">Meiotic DNA exchanges in C. elegans are promoted by proximity to the synaptonemal complex.</a> Life Sci Alliance. 6 (4), e202301906(2023).</li>
<li>De Los Santos, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+mus81%2Fmms4+endonuclease+acts+independently+of+double-holliday+junction+resolution+to+promote+a+distinct+subset+of+crossovers+during+meiosis+in+budding+yeast%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">The mus81/mms4 endonuclease acts independently of double-holliday junction resolution to promote a distinct subset of crossovers during meiosis in budding yeast.</a> Genetics. 164 (1), 81-94 (2003).</li>
<li>Saito, T. T., Colaiacovo, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regulation+of+crossover+frequency+and+distribution+during+meiotic+recombination%5BTitle%5D)+AND+%22Cold+Spring+Harb+Symp+Quant+Biol%22%5BJournal%5D)">Regulation of crossover frequency and distribution during meiotic recombination.</a> Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 82, 223-234 (2017).</li>
<li>Zalevsky, J., Macqueen, A. J., Duffy, J. B., Kemphues, K. J., Villeneuve, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Crossing+over+during+Caenorhabditis+elegans+meiosis+requires+a+conserved+mutS-based+pathway+that+is+partially+dispensable+in+budding+yeast%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Crossing over during Caenorhabditis elegans meiosis requires a conserved mutS-based pathway that is partially dispensable in budding yeast.</a> Genetics. 153 (3), 1271-1283 (1999).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>101-1000&mu; l Pipet Ucu</td><td>QSP</td><td>111-N-Q</td><td></td></tr><tr><td>0,5 mol/I-EDTA Çözeltisi (pH 8,0)</td><td>Nacalai tesque</td><td>14347-21</td><td></td></tr><tr><td>10mol/I-Sodyum Hidroksit Çözeltisi</td><td>Nacalai tesque</td><td>94611-45</td><td></td></tr><tr><td>10X DreamTaq Yeşil Tampon</td><td>Thermo Fisher Scientific&nbsp;</td><td>EP0713</td><td></td></tr><tr><td>10&mu; L, Uzun Uçlu, Görkemli</td><td>FUKAEKASEI, WATSON</td><td>110-207C</td><td></td></tr><tr><td>200&mu; L, Standart Uç, Dereceli</td><td>FUKAEKASEI, WATSON</td><td>110-705C</td><td></td></tr><tr><td>Agar Tozu</td><td>Nacalai tesque</td><td>01028-14</td><td></td></tr><tr><td>Agaroz</td><td>PH Japonya</td><td>PH108 Serisi</td><td></td></tr><tr><td>Otoklav TOMY model ES-215 Yüksek Basınçlı Buhar Sterilizatörü</td><td>TOMY SEIKO</td><td>ES-215</td><td></td></tr><tr><td>Bacto Pepton Proteinin Enzimatik Sindirimi</td><td>Thermo Fisher Scientific&nbsp;</td><td>211677</td><td></td></tr><tr><td>Borik asit</td><td>Nacalai tesque</td><td>05215-05</td><td></td></tr><tr><td>Caenorhabditis elegans Bristol yabani-tip&nbsp;</td><td>Caenorhabditis Genetik Merkezi</td><td>N2</td><td></td></tr><tr><td>Caenorhabditis elegans Hawaii vahşi tipi</td><td>Caenorhabditis Genetik Merkezi</td><td>CB4856 Serisi</td><td></td></tr><tr><td>Kalsiyum klorür</td><td>Nacalai tesque</td><td>06729-55</td><td></td></tr><tr><td>ccIs4251 [(pSAK2) myo-3p::GFP::LacZ::NLS + (pSAK4) myo-3p::mitokondriyal GFP + dpy-20(+)] I</td><td>Saito laboratuvarı</td><td>TTS24</td><td>aslen PD4251'den</td></tr><tr><td>Kolesterol</td><td>Nacalai tesque</td><td>08721-62</td><td></td></tr><tr><td>Özel TaqMan SNP Genotipleme Testleri</td><td>Thermo Fisher Scientific&nbsp;</td><td>4332077</td><td></td></tr><tr><td>Deoksinükleotid (dNTP) Çözelti Karışımı</td><td>New England Biyolaboratuvarları</td><td>N04470</td><td></td></tr><tr><td>DigPrint Doküman Tablet DP-T130z</td><td>Biyo Araçlar</td><td>DP-T130z</td><td></td></tr><tr><td>di-Potasyum Hidrojenfosfat</td><td>Nacalai tesque</td><td>28726-05</td><td></td></tr><tr><td>Diseksiyon Mikroskobu</td><td>Nikon</td><td>SMZ-745 C-DS</td><td></td></tr><tr><td>Rüya Taq DNA Polimeraz</td><td>Thermo Fisher Scientific&nbsp;</td><td>EP0713</td><td></td></tr><tr><td>Etidyum Bromür Çözeltisi</td><td>Nacalai tesque</td><td>14631-94</td><td></td></tr><tr><td>WBVar01973670 için İleri Primer</td><td>IDT</td><td>103988736</td><td>atgtctcacccaaggttgaa</td></tr><tr><td>jelatin</td><td>Nacalai tesque</td><td>166-31</td><td></td></tr><tr><td>Gilson PIPETMAN Klasik Pipet</td><td>Thermo Fisher Scientific&nbsp;</td><td></td><td></td></tr><tr><td>IGEPAL CA-630</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>18896</td><td></td></tr><tr><td>Magnezyum Sülfat Heptahidrat</td><td>Nacalai tesque</td><td>21003-75</td><td></td></tr><tr><td>MicroAmp Optik 96 Kuyulu Reacton Plakası</td><td>Thermo Fisher Scientific&nbsp;</td><td>N8010560</td><td></td></tr><tr><td>MicroAmp Optik Yapıştırma Filmi</td><td>Thermo Fisher Scientific&nbsp;</td><td>4311971</td><td></td></tr><tr><td>Mini Amp&nbsp; termal döngüleyici</td><td>Thermo Fisher Scientific&nbsp;</td><td>Mini Amfi</td><td></td></tr><tr><td>Mini-Sub Cell GT Yatay Elektroforez Sistemi, 7 x 10 cm tepsi</td><td>Bio-Rad Laboratuvarları</td><td>1704466</td><td></td></tr><tr><td>Nichipet EXII</td><td>Nichiryo</td><td>00-NPX2-2</td><td></td></tr><tr><td>Nichipet EXII ÇOKLU</td><td>Nichiryo</td><td>00-NPM-12VP</td><td></td></tr><tr><td>Pippete Mate NEO</td><td>Nichiryo</td><td>00-PMNEO</td><td></td></tr><tr><td>Potasyum klorür</td><td>Nacalai tesque</td><td>285-38</td><td></td></tr><tr><td>Potasyum Dihidrojenfosfat</td><td>Nacalai tesque</td><td>28720-65</td><td></td></tr><tr><td>Proteinaz K</td><td>Thermo Fisher Scientific&nbsp;</td><td>EO0491</td><td></td></tr><tr><td>QuantStudio 1 Gerçek Zamanlı PCR Sistemi, 96 oyuklu, 0,2 mL</td><td>Thermo Fisher Scientific&nbsp;</td><td>A40426 Serisi</td><td></td></tr><tr><td>Hızlı Yüklenen Mor 1kb Plus DNA Merdiveni</td><td>New England Biyolaboratuvarları</td><td>N0550S</td><td></td></tr><tr><td>WBVar01973670 için Ters Primer</td><td>IDT</td><td>103988737</td><td>Tggctactcctagtcactga</td></tr><tr><td>Sodyum Kloridler</td><td>Nacalai tesque</td><td>31319-45</td><td></td></tr><tr><td>TaqPath ProAmp Ana Karışımı</td><td>Thermo Fisher Scientific&nbsp;</td><td>A30866 Serisi</td><td></td></tr><tr><td>TC Çanak 35, Standart</td><td>SARSTEDT</td><td>83.3900</td><td></td></tr><tr><td>Tris (hidroksimetil) aminometan</td><td>Nacalai tesque</td><td>35406-75</td><td></td></tr><tr><td>Trizma tabanı</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>&nbsp; T1503-1KG</td><td></td></tr><tr><td>Ara 20</td><td>Yoneyama Reaktifi</td><td>03706</td><td></td></tr><tr><td>WormStuff Solucan Seçimi</td><td>Genesee Bilimsel</td><td>59-AWP</td><td></td></tr><tr><td>WormStuff Solucan Seçim Uçları(90/10% Pt/Ir, 30 Gauge)</td><td>Genesee Bilimsel</td><td>59-30PI36</td><td></td></tr></tbody></table>

gerçek zamanlı pcr kullanılarak snp genotipleme ile caenorhabditis elegans mayozunda Çaprazlama sıklığı ve dağılımı

Frequency and Distribution of Crossovers in Caenorhabditis elegans Meiosis by SNP Genotyping using Real-time PCR

C. elegans'ta kromozom II üzerindeki dört SNP bölgesini, sol kolda, orta bölgede ve sağ kolda kromozomun tam uzunluğu başına çaprazlama oluşumunu ölçmek için SNP genotipleme testi ile tespit ettik. SNP'lerin tespiti, üreticinin talimatlarına göre gerçekleştirilir. Ana karışım, Taq DNA Polimeraz, Isıya kararsız urasil-N-glikosilaz (UNG), dUTP'li dNTP ve Pasif referans ROX boyası içerir. Taq DNA polimeraz 95 °C'de aktive edilir ve düşük sıcaklıklarda spesifik olmayan amplifikasyonun inhibisyonunu sağlar. UNG ve dU...

Gerçek Zamanlı PCR Kullanılarak SNP Genotipleme ile Caenorhabditis elegans Mayozunda Çaprazlama Sıklığı ve Dağılımı

Caenorhabditis elegans is an excellent model organism for studying meiosis. In addition to general advantages, such as a short reproductive cycle, many ...

frequency-distribution-crossovers-caenorhabditis-elegans-meiosis-snp

Research

JoVE Journal

Genetics

Genetik

Bu videoda, PCR taraması ile tek bir nematodun genetik bir belirteç için hızlı bir şekilde taranması için kullanılan bir teknik açıklanmaktadır. Örnek protokolde, CRISPR tabanlı genom düzenlemeyi tarıyoruz.

Tek Solucan PCR: Genomik DNA'yı Çıkarmak ve Çoğaltmak için Bir Yöntem

Bu protokol, ultraviyole (UV) ışınlaması kullanılarak transgenik ekstrakromozomal dizilerin Caenorhabditis elegans genomuna entegrasyonu için hızlı ve düşük malzeme tüketen bir prosedürü tanımlar. Ayrıca, bu protokol özellikle ekstrakromozomal dizileri yüksek oranda ileten transgenik hatlar için çok uygundur.

Yüksek İletim Hızına Sahip Ekstrakromozomal Dizileri C. elegans Genomuna Entegre Etmek İçin Hızlı Bir Protokol

Genetik olarak kodlanmış histon miniSOG mavi ışığa bağımlı bir şekilde genom kalıtsal mutasyonlara neden olur. Bu mutajenez yöntemi, hızlı, basit toksik kimyasalların serbest ve ileri genetik tarama ve transgen entegrasyonu için çok uygundur.

Histon-miniSOG Kullanılan optogenetic rastgele mutagenez<em&gt; C. elegans</em

Bu yöntemi tetraploid ve triploid Caenorhabditis nematodlar diploit herhangi bir zorlanma nesil olanak sağlar. Bu yöntemle üretilen polyploid suşları segregasyonun profaz etkileşimlerde kromozom çalışma için kullanılan ve bu yöntem hücre, gelişimsel, evrim, ve kanser Biyoloji önemli temel sorular incelenmesi için yararlı olur.

Caenorhabditis elegans Ploitlik manipülasyon

Burada, CRISPR-Cas9 ribonucleoproteins ve homoloji bağımlı onarım şablonları kullanarak C. elegans genom mühendisi bir yöntem mevcut.

Bir hızlı ve genomik noktası mutantlar C. elegans kullanarak CRISPR/Cas9 Ribonucleoproteins üreten Facile boru hattı

Burada, fare embriyonik kök Southern blot ve/veya PCR kullanarak hücre Homolog rekombinasyon olayları tanımlamak için detaylı bir iletişim kuralı mevcut. Bu yöntem ile nonmuscle myosin II genetik değiştirme fare modelleri geleneksel embriyonik kök hücre tabanlı Homolog rekombinasyon aracılı hedefleme teknolojisi kullanarak oluşturma tarafından örneklenir.

Fare embriyonik kök hücre kullanarak Southern blot ve polimeraz zincir reaksiyonu Homolog rekombinasyon olaylar tanımlaması

Bu makalede, tek veya toplu C. elegans örneklerinde gen ekspresyon seviyelerinin hızlı ve güvenilir bir şekilde belirlenmesi için yüksek aktarım hızı protokolü açıklanmıştır. Bu protokol RNA yalıtımı gerektirmez ve doğrudan örneklerden cDNA üretir. Yüksek verimli çok katlı nanoakışkan gerçek zamanlı qPCR platformları ile birlikte kullanılabilir.

Nanoakışkan Teknoloji Kullanarak Tek ve Toplu C. elegans Örneklerinde Yüksek Verimli Nicel RT-PCR

Bu protokol, kendi kendine Caenorhabditis nematodlarının büyük ölçekli ekolojik araştırmalarını gerçekleştirmek için kullanılabilir. Bu yöntemin birincil avantajı, doğadan toplanan nematodlarla ilişkili ekolojik ve moleküler verilerin verimli bir şekilde düzenlenmesi ve analiz edilmesidir.

Kendinden Çıkan Caenorhabditis Nematodlarının Ekolojik Araştırmalarını Gerçekleştirmek için Yüksek Oranda Ölçeklenebilir Bir Yaklaşım

RNA dizilimi için bireysel nematod dokularını izole etmek için lazer mikrodiseksiyonu kullanan bir protokol tanımlanmıştır. Protokol, türe özgü genetik araç setleri gerektirmez ve gen ekspresyon profillerinin tek doku örnekleri düzeyinde farklı türler arasında karşılaştırılmasına izin verir.

Türlerden Agnostik Tek Doku Uygulamaları için Lazer Mikrodiseksiyonu

Bu, C. elegans gonad diseksiyonu ve ardından antikor boyama yoluyla immünofloresan için germline örnekleri üreten donma çatlağı veya DNA'yı görselleştirmek için basit DAPI boyama için yaygın olarak kullanılan bir yöntemdir. Bu protokol, bir araştırma laboratuvarında ve ders tabanlı bir lisans araştırma deneyiminde lisans öğrencileri için başarılı olmuştur.

C. elegans · İmmünofloresan ve DAPI Boyama için Gonad Diseksiyonu ve Dondurucu Çatlak

Burada, sadece 30 μL solucan pelleti kullanılarak L4-aşama Caenorhabditis elegans tüm solucanında uygulanacak hızlı ve basit bir ATAC-seq protokolünü sunuyoruz.

Bütün Caenorhabditis elegans L4 larvalarda kromatin erişilebilirlik profili

Keşfedin, Caenorhabditis elegans mayozunda çaprazlama sıklığını ve dağılımını ölçmek için gerçek zamanlı PCR tabanlı SNP genotipleme yöntemini. Bu basit ve doğru yaklaşım, genetik araştırmalarda meiyotik rekombinasyon düzenlemesini anlamaya yardımcı olur.

Gerçek Zamanlı PCR Kullanılarak SNP Genotipleme ile Caenorhabditis elegans Mayozunda Çaprazlama Sıklığı ve Dağılımı

Daha fazla video keşfet