Name: In vivo (İn canlı) Drosophila melanogasterde TurboID Tabanlı Yakınlık Etiketleme Uygulaması (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-06-13T13:15:00.000+00:00
Duration: 9 min 59 s
Description: Öğrenin Drosophila melanogaster yumurta hücrelerinde TurboID tabanlı yakınlık etiketleme ile zucchini protein etkileşimlerini haritalama. Bu yöntem, protein katlanması ve membran organizasyonu gibi süreçleri incelemek için yeni etkileşimleri ortaya çıkarır.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Kim, D. I., Roux, K. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Filling+the+void%3A+Proximity-based+labeling+of+proteins+in+living+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Trend+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Filling the void: Proximity-based labeling of proteins in living cells.</a> Trend Cell Biol. 26 (11), 804-817 (2016).</li>
<li>Mair, A., Xu, S. L., Branon, T. C., Ting, A. Y., Bergmann, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Proximity+labeling+of+protein+complexes+and+cell-type-specific+organellar+proteomes+in+Arabidopsis+enabled+by+turboid%5BTitle%5D)+AND+%22eLife%22%5BJournal%5D)">Proximity labeling of protein complexes and cell-type-specific organellar proteomes in Arabidopsis enabled by turboid.</a> eLife. 8, e47864(2019).</li>
<li>Qi, Y., Katagiri, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Purification+of+low-abundance+Arabidopsis+plasma-membrane+protein+complexes+and+identification+of+candidate+components%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+J%22%5BJournal%5D)">Purification of low-abundance Arabidopsis plasma-membrane protein complexes and identification of candidate components.</a> Plant J. 57 (5), 932-944 (2009).</li>
<li>Branon, T. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Efficient+proximity+labeling+in+living+cells+and+organisms+with+turboid%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Efficient proximity labeling in living cells and organisms with turboid.</a> Nat Biotechnol. 36 (9), 880-887 (2018).</li>
<li>Rhee, H. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Proteomic+mapping+of+mitochondria+in+living+cells+via+spatially+restricted+enzymatic+tagging%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Proteomic mapping of mitochondria in living cells via spatially restricted enzymatic tagging.</a> Science. 339 (6125), 1328-1331 (2013).</li>
<li>Roux, K. J., Kim, D. I., Raida, M., Burke, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+promiscuous+biotin+ligase+fusion+protein+identifies+proximal+and+interacting+proteins+in+mammalian+cells%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">A promiscuous biotin ligase fusion protein identifies proximal and interacting proteins in mammalian cells.</a> J Cell Biol. 196 (6), 801-810 (2012).</li>
<li>Quantitative Proteomics. , 
 <a target="_blank" href="https://case.edu/medicine/nutrition/centers-and-collaborations/case-center-proteomics-and-bioinformatics/proteomics-and-small-molecule-mass-spectrometry-core/quantitative-proteomics">https://case.edu/medicine/nutrition/centers-and-collaborations/case-center-proteomics-and-bioinformatics/proteomics-and-small-molecule-mass-spectrometry-core/quantitative-proteomics</a> (2025).</li>
<li>Udeshi, N. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antibodies+to+biotin+enable+large-scale+detection+of+biotinylation+sites+on+proteins%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Meth%22%5BJournal%5D)">Antibodies to biotin enable large-scale detection of biotinylation sites on proteins.</a> Nat Meth. 14 (12), 1167-1170 (2017).</li>
<li>Ummethum, H., Hamperl, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Proximity+labeling+techniques+to+study+chromatin%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Genet%22%5BJournal%5D)">Proximity labeling techniques to study chromatin.</a> Front Genet. 11, 450(2020).</li>
<li>Han, S., Li, J., Ting, A. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Proximity+labeling%3A+Spatially+resolved+proteomic+mapping+for+neurobiology%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Opin+Neurobiol%22%5BJournal%5D)">Proximity labeling: Spatially resolved proteomic mapping for neurobiology.</a> Curr Opin Neurobiol. 50, 17-23 (2018).</li>
<li>Nishimasu, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structure+and+function+of+zucchini+endoribonuclease+in+pirna+biogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Structure and function of zucchini endoribonuclease in pirna biogenesis.</a> Nature. 491 (7423), 284-287 (2012).</li>
<li>Zamudio, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+methylation+restrains+transposons+from+adopting+a+chromatin+signature+permissive+for+meiotic+recombination%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+Dev%22%5BJournal%5D)">DNA methylation restrains transposons from adopting a chromatin signature permissive for meiotic recombination.</a> Genes Dev. 29 (12), 1256-1270 (2015).</li>
<li>Cha, S. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Therapeutic+modulation+of+gsto+activity+rescues+fus-associated+neurotoxicity+via+deglutathionylation+in+als+disease+models%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Cell%22%5BJournal%5D)">Therapeutic modulation of gsto activity rescues fus-associated neurotoxicity via deglutathionylation in als disease models.</a> Dev Cell. 57 (6), 783-798.e8 (2022).</li>
<li>Pulver, S. R., Berni, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+fundamentals+of+flying%3A+Simple+and+inexpensive+strategies+for+employing+Drosophila+genetics+in+neuroscience+teaching+laboratories%5BTitle%5D)+AND+%22J+Undergrad+Neurosci+Educ%22%5BJournal%5D)">The fundamentals of flying: Simple and inexpensive strategies for employing Drosophila genetics in neuroscience teaching laboratories.</a> J Undergrad Neurosci Educ. 11 (1), A139-A148 (2012).</li>
<li>Feizy, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vivo+identification+of+Drosophila+rhodopsin+interaction+partners+by+biotin+proximity+labeling%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">In vivo identification of Drosophila rhodopsin interaction partners by biotin proximity labeling.</a> Sci Rep. 14 (1), 1986(1986).</li>
<li>Zhang, B., Zhang, Y., Liu, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Highly+effective+proximate+labeling+in+Drosophila%5BTitle%5D)+AND+%22G3%22%5BJournal%5D)">Highly effective proximate labeling in Drosophila.</a> G3. 11 (5), jkab077(2021).</li>
<li>Hudson, A. M., Cooley, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Methods+for+studying+oogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Methods%22%5BJournal%5D)">Methods for studying oogenesis.</a> Methods. 68 (1), 207-217 (2014).</li>
<li>Waring, G. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Morphogenesis+of+the+eggshells+in+Drosophila%5BTitle%5D)+AND+%22Int+Rev+Cytol%22%5BJournal%5D)">Morphogenesis of the eggshells in Drosophila.</a> Int Rev Cytol. 198, 67-108 (2000).</li>
<li>Weil, T. T., Parton, R. M., Davis, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Preparing+individual+drosophila+egg+chambers+for+live+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Preparing individual drosophila egg chambers for live imaging.</a> J Vis Exp. (60), e3679(2012).</li>
<li>Nguyen, T. T. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vivo+profiling+of+the+zucchini+proximal+proteome+in+the+Drosophila+ovary%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">In vivo profiling of the zucchini proximal proteome in the Drosophila ovary.</a> Development. 150 (4), dev201220(2023).</li>
<li>Ahmadi, S., Winter, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+poly%28ethylene+glycol%29+and+poly%28ethylene+glycol%29-based+detergents+using+peptide+search+engines%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Identification of poly(ethylene glycol) and poly(ethylene glycol)-based detergents using peptide search engines.</a> Anal Chem. 90 (11), 6594-6600 (2018).</li>
<li>Zada, A., Khan, I., Zhang, M., Cheng, Y., Hu, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Airid-based+proximity+labeling+for+protein-protein+interaction+in+plants%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Airid-based proximity labeling for protein-protein interaction in plants.</a> J Vis Exp. (187), e64428(2022).</li>
<li>Fang, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lowering+sample+requirements+to+study+tyrosine+kinase+signaling+using+phosphoproteomics+with+the+tmt+calibrator+approach%5BTitle%5D)+AND+%22Proteomics%22%5BJournal%5D)">Lowering sample requirements to study tyrosine kinase signaling using phosphoproteomics with the tmt calibrator approach.</a> Proteomics. 20 (24), 2000116(2020).</li>
<li>Park, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((One-stage+tip+method+for+tmt-based+proteomic+analysis+of+a+minimal+amount+of+cells%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Omega%22%5BJournal%5D)">One-stage tip method for tmt-based proteomic analysis of a minimal amount of cells.</a> ACS Omega. 8 (22), 19741-19751 (2023).</li>
<li>Zhang, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Turboid-based+proximity+labeling+for+in+planta+identification+of+protein-protein+interaction+networks%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Turboid-based proximity labeling for in planta identification of protein-protein interaction networks.</a> J Vis Exp. (159), e60728(2020).</li>
<li>Trinkle-Mulcahy, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recent+advances+in+proximity-based+labeling+methods+for+interactome+mapping%5BTitle%5D)+AND+%22F1000Res%22%5BJournal%5D)">Recent advances in proximity-based labeling methods for interactome mapping.</a> F1000Res. 8, Faculty Rev-135 F1000(2019).</li>
<li>Wei, X. F., Li, S., Hu, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+turboid-based+proximity+labelling+approach+for+identifying+the+DNA-binding+proteins%5BTitle%5D)+AND+%22STAR+Protoc%22%5BJournal%5D)">A turboid-based proximity labelling approach for identifying the DNA-binding proteins.</a> STAR Protoc. 4 (1), 102139(2023).</li>
<li>Bosch, J. A., Chen, C. L., Perrimon, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Proximity-dependent+labeling+methods+for+proteomic+profiling+in+living+cells%3A+An+update%5BTitle%5D)+AND+%22WIREs+Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">Proximity-dependent labeling methods for proteomic profiling in living cells: An update.</a> WIREs Dev Biol. 10 (1), e392(2021).</li>
<li>Rayaprolu, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+type-specific+biotin+labeling+in+vivo+resolves+regional+neuronal+and+astrocyte+proteomic+differences+in+mouse+brain%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Cell type-specific biotin labeling in vivo resolves regional neuronal and astrocyte proteomic differences in mouse brain.</a> Nat Commun. 13, 2927(2022).</li>
<li>Uckun, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vivo+profiling+of+the+alk+proximitome+in+the+developing+Drosophila+brain%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">In vivo profiling of the alk proximitome in the developing Drosophila brain.</a> J Mol Biol. 433 (23), 167282(2021).</li>
<li>Xiong, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vivo+proteomic+mapping+through+gfp-directed+proximity-dependent+biotin+labelling+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Elife%22%5BJournal%5D)">In vivo proteomic mapping through gfp-directed proximity-dependent biotin labelling in zebrafish.</a> Elife. 10, e64631(2021).</li>
<li>Holzer, E., Rumpf-Kienzl, C., Falk, S., Dammermann, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+modified+turboid+approach+identifies+tissue-specific+centriolar+components+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">A modified turboid approach identifies tissue-specific centriolar components in C. elegans.</a> PLoS Genet. 18 (4), e1010150(2022).</li>
<li>Artan, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interactome+analysis+of+Caenorhabditis+elegans+synapses+by+turboid-based+proximity+labeling%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Interactome analysis of Caenorhabditis elegans synapses by turboid-based proximity labeling.</a> J Biol Chem. 297 (3), 101094(2021).</li>
<li>Zhang, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Turboid-based+proximity+labeling+reveals+that+ubr7+is+a+regulator+of+n+nlr+immune+receptor-mediated+immunity%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Comm%22%5BJournal%5D)">Turboid-based proximity labeling reveals that ubr7 is a regulator of n nlr immune receptor-mediated immunity.</a> Nat Comm. 10 (1), 3252(2019).</li>
<li>Baumgartner, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Drosophila+zad+zinc+finger+protein+kipferl+guides+rhino+to+pirna+clusters%5BTitle%5D)+AND+%22eLife%22%5BJournal%5D)">The Drosophila zad zinc finger protein kipferl guides rhino to pirna clusters.</a> eLife. 11, e80067(2022).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td><güçlü > Antikorlar< / güçlü ></td><td></td><td></td><td></td></tr> <tr><td>Keçi anti-fare IgG (H + L) ikincil antikor, HRP</td><td>Invitrogen</td><td>31430</td><td>Analitik dereceli, ışığa duyarlı</td></tr><tr><td>Keçi tavşan önleyici IgG (H + L) yüksek çapraz adsorbe edilmiş ikincil antikor, alexa fluor plus 488</td><td>Invitrogen</td><td>A32731</td><td>Analitik dereceli, ışığa duyarlı</td></tr><tr><td>Keçi anti-tavşan IgG (H + L) ikincil antikoru, HRP</td><td>Invitrogen</td><td>31460</td><td>Analitik sınıf, ışığa duyarlı</td></tr><tr><td>HSP90 antikoru (tavşan)</td><td>Hücre Sinyalizasyon Teknolojisi</td><td>4874</td><td>Poliklonal antikor</td></tr><tr><td>Pierce Streptavidin proteini, HRP</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>21126</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Streptavidin, Alexa Fluor 594 konjuge</td><td>Invitrogen</td><td>S11227</td><td>Işığa duyarlı, analitik sınıf</td></tr><tr><td>V5-etiket antikoru (fare)</td><td>İnvitrojen</td><td>R960-25</td><td>Monoklonal antikor</td></tr><tr><td>V5-etiket antikoru (tavşan) (D3H8Q)</td><td>Hücre Sinyalizasyon Teknolojisi</td><td>13202</td><td>Monoklonal antikor</td></tr><tr><td><güçlü>Sinek Hatları</güçlü></td><td><güçlü>Şirket</güçlü></td><td><güçlü>Katalog Numarası</td><td>Yorumlar/Açıklama</td></tr><tr><td>pUASp Tom20 V5-TurboID/ TM3</td><td>Kore Drosophila Stok Merkezi</td><td>2373-2</td><td>Fly stok</td></tr><tr><td>pUASp Kabak V5-TurboID/Cyo</td><td>Kore Drosophila Stok Merkezi</td><td>2188</td><td>Fly stok</td></tr><tr><td>pUASP_attB_V5-TurboID-NES / Cyo</td><td>Kore Drosophila Stok Merkezi</td><td>2635-4</td><td>Fly stok</td></tr><tr><td>w [*]; P{w[+mC]=matalpha4-GAL-VP16}V2H</td><td>Bloomington Drosophila Stok Merkezi</td><td>7062</td><td>Fly stok</td></tr><tr><td><güçlü>Ekipmanlar ve Malzemeler<</td><td>strong>Company</td><td>Katalog Numarası</td><td>Yorumlar/Açıklama</td></tr><tr><td>Analitik Terazi</td><td>Mettler Toledo</td><td>ME204</td><td>0.1 mg okunabilirlik</td></tr><tr><td>Amersham Protran 0.45 NC nitroselüloz batı kurutma membranları (300 mm ve kez; 4 m)</td><td>Cytiva</td><td></td><td></td></tr> <tr><td>10600002-Axygen 1.7 mL MaxyClear Snaplock Mikrosantrifüj Tüpü</td><td>Corning</td><td>MCT-175-C</td><td>Ko-polimer</td></tr><tr><td>MARKA&nbsp; Kapak Camı (22 mm x 22 mm)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>BR470055</td><td>Borosilikat cam</td></tr><tr><td>Toplu Pipet Uçları (10 & mikro; L)</td> <td>Vertex</td><td>4110N00</td><td>Propilen</td></tr><tr><td>Toplu Pipet Uçları (1000 & mikro; L)</td><td>Vertex</td><td>4330N00</td><td>Propilen</td></tr><tr><td>Toplu Pipet Uçları (200 & mikro; L)</td><td>Vertex</td><td>4230N00</td><td>Propilen</td></tr><tr><td>Hücre Kültürü Plakası (96 oyuklu)</td><td>SPL</td><td>300096</td><td>Polistiren, düz tabanlı</td></tr><tr><td>tip Santrifüj (1.5-2 mL tüp boyutunda rotorlu)</td><td>Eppendorf</td><td>5424 R</td><td>Sabit açılı, soğutmalı</td></tr><tr><td>Santrifüj (5 mL tüp boyutunda rotorlu)</td><td>Eppendorf</td><td>5425 R</td><td>Sabit açılı, soğutmalı</td></tr><tr><td>Kimyasal Kaşık</td><td>-</td><td>- </td><td>Paslanmaz çelik</td></tr><tr><td>ChemiDoc Görüntüleme sistemi</td><td>Biorad</td><td>12003153</td><td>Western blot görüntüleme sistemi</td></tr><tr><td>CO2 sinek pedi</td><td></td> <td>-</td> <td>Anestezik levha</td></tr><tr><td>CO2 tankı ve regülatör</td> <td>-</td><td></td> <td>Yüksek basınçlı gaz ve baş dönmesine dikkat</td></tr><tr><td>Kompakt inkübatör</td><td>JSR</td><td>JSGI-10T</td><td>Yüksek uyarı sıcaklık</td></tr><tr><td>Konfokal lazer tarama mikroskobu</td><td>Zeiss</td><td>LSM 710</td><td>Yoğun lazer ışınına dikkat</td></tr><tr><td>Konik tüp (15 mL)</td><td>SPL</td><td>50015</td><td>Polipropilen / Yüksek yoğunluklu polietilen&nbsp;</td></tr><tr><td>Konik boru (50 mL)</td><td>SPL</td><td>50050</td><td>Polipropilen /Yüksek yoğunluklu polietilen&nbsp;</td></tr><tr><td>Dijital denge</td> <td>-</td><td>-</td><td></td></tr><tr><td>Dijital zamanlayıcı</td> <td>-</td><td>-</td><td></td></tr> <tr><td>Diseksiyon çanağı</td> <td>-</td><td>-</td> <td>Silikon</td></tr><tr><td>Dumont #5SF Forseps&nbsp;</td><td>Güzel Bilim Araçları</td><td>11252-00</td><td>Süper ince uçlar, keskin nesnelerin dikkati</td></tr><tr><td>DynaMag-2 mıknatıs</td><td>Invitrogen</td><td>12321D</td><td>1.5-2 mL boyutlu mikrosantrifüj tüpleri için</td></tr><tr><td>Fisherbrand&nbsp; Superfrost Plus mikroskop slaytları (25 mm x 75 mm)</td><td>Fisher Scientific</td><td>12-550-15</td><td>Keskin cisimlere dikkat</td></tr><tr><td>Fly gıda şişeleri (kağıt tapalı)</td><td>Hansol Tech</td><td>FFB-21010-Fly</td><td></td></tr> <tr><td>gıda şişeleri (pamuk kapaklı)</td><td>Hansol Tech</td><td>FFV-11010-Odaklanmış</td><td></td></tr> <tr><td>ultrasonik</td><td>Covaris</td><td>M220</td><td>Ultrasonik dalga</td></tr><tr><td>Jel bıçak</td><td>Invitrogen</td> uyarısı<td>EI9010</td><td>Plastik saplı paslanmaz çelik</td></tr><tr><td>Sınıf 3MM Chr kurutma kağıdı (46 cm ve kez; 57 cm)</td><td>Cytiva</td><td>3030-917</td><td>Whatmann kağıdı</td></tr><tr><td>El tipi homojenizatör ve plastik tokmak</td><td>Kimble</td><td>749540-0000</td><td>Akülü motor</td></tr><tr><td>Isı bloğu</td><td>İnce PCR</td><td>ALB6400</td><td>Yüksek sıcaklıkta</td></tr><tr><td>Tüy bırakmayan dokuya</td> dikkat <td>Yuhan-Kimberly</td><td>41112</td><td>- </td></tr><tr><td>Sıvı azot</td> <td>-</td><td></td> <td>Donma ve yanık uyarısı</td></tr><tr><td>Mikroplaka spektrofotometresi</td><td>Agilent Technologies</td><td>Epoch</td><td>Monokromatör tabanlı optikler</td></tr><tr><td>Mikrodalga</td> <td>-</td><td></td> <td>Yüksek sıcaklığa dikkat</td></tr><tr><td>milliTUBE 1 mL AFA fiber</td><td>Covaris</td><td>PN 520135</td><td>Cam</td></tr><tr><td>Mini jel tankı</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>A25977</td><td>Yüksek sıcaklıkta</td></tr><tr><td>NuPAGE Bis-tris mini protein jellerine dikkat edin, 4&ndash; %12, 1.0&ndash; 1,5 mm, 10 oyuklu</td><td>Invitrogen</td><td>NP0323BOX</td><td>Poliakrilamid içerir, toksisite uyarısı</td></tr><tr><td>NuPAGE Bis-tris mini protein jelleri, 4&ndash; %12, 1.0&ndash; 1,5 mm, 15 oyuklu</td><td>Invitrogen</td><td>NP0321BOX</td><td>Poliakrilamid içerir, toksisite uyarısı</td></tr><tr><td>Boya fırçası (&Oslash; 1,8 mm)</td><td>Hwa hong</td><td>791240-Pipetman</td><td></td></tr> <tr><td>L (P1000L)</td><td>Gilson</td><td>FA10006M</td><td>Metal ejektörlü tek kanallı mikropipet</td></tr><tr><td>Pipetman L (P200L)</td><td>Gilson</td><td>FA10005M</td><td>Metal ejektörlü tek kanallı mikropipet</td></tr><tr><td>Pipetman L ( P20L)</td><td>Gilson</td><td>FA10003M</td><td>Metal ejektörlü tek kanallı mikropipet</td></tr><tr><td>Pipetman L (P2L)</td><td>Gilson</td><td>FA10001M</td><td>Metal ejektörlü tek kanallı mikropipet</td></tr><tr><td>Güç kaynağı</td><td>Başlıca bilim</td><td>MP-310</td><td>Yüksek voltajlı elektriğe dikkat</td></tr><tr><td>Programlanabilir döndürücü</td><td>Biosan</td><td>RS-24-Protein</td><td></td></tr> <tr><td>LoBind&nbsp; tüpler</td><td>Eppendorf</td><td></td> <td>30108302-Tıraş</td></tr> <tr><td>bıçağı</td><td>Dorco</td><td>304020</td><td>Paslanmaz çelik, keskin nesnelere dikkat</td></tr><tr><td>Rulo</td><td>-</td><td>-</td><td></td></tr><tr><td>Serolojik pipet (10 mL)</td><td>SPL</td><td>91010</td><td>Polistiren</td></tr><tr><td>Serolojik pipet (25 mL)</td><td>SPL</td><td>91025</td><td>Polistiren</td></tr><tr><td>Serolojik pipet (5 mL)</td><td>SPL</td><td>91005</td><td>Polistiren</td></tr><tr><td>Serolojik pipet (50 mL)</td><td>SPL</td><td>91050</td><td>Polistiren</td></tr><tr><td>Çıtçıtlı kapaklı düşük retansiyonlu mikrosantrifüj tüpleri (1,5 mL)</td><td>Thermo Scientific</td><td>3451PK</td><td></td></tr><tr><td>Polipropilen Sünger ped</td><td>Invitrogen</td><td>EI9052-Stereo</td><td></td></tr> <tr><td>mikroskop</td><td>Zeiss</td><td>Stemi 508-Stereo</td><td></td></tr> <tr><td>mikroskop&nbsp;</td><td>Leica</td><td></td><td></td></tr><tr><td>ThermoMixer&nbsp; C</td><td>Eppendorf</td><td>5382000015</td><td>1,5 ve 5 mL boyutlu bloklarla</td></tr><tr><td>Cımbız</td><td>Aven Araçları</td><td>18526</td><td>Plastik, düz uçlar</td></tr><tr><td>Vorteks karıştırıcı</td><td>Scientific Industries</td><td>SI-0236-XCell</td><td></td></tr> <tr><td>II Leke modülü</td><td>Invitrogen</td><td>EI9051</td><td>Yüksek sıcaklığa dikkat</td></tr><tr><td>XCell&nbsp; SureLock mini hücreli</td><td>Invitrogen</td><td>EI0001</td><td>Yüksek sıcaklık</td></tr> <tr><td><güçlü > Kimyasallar< / güçlü > <</td> <td>güçlü > Şirket< / güçlü ></td> <td>< güçlü > Katalog Numarası< / güçlü ></td> <td>< güçlü > Yorumlar / Açıklama< / güçlü ></td></tr> <tr><td>Aseton</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>650501</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Asetonitril</td><td>Supelco</td><td>1.00029.1000</td><td>LC-MS derecesi, soluma toksisitesi ve yanıcı</td></tr><tr><td>Albümin standart ampullerine dikkat (% 0.9 salin ve% 0.05 sodyum azid içinde 2 mg / mL'de sığır serum albümini (BSA) içerir)</td><td>Thermo Scientific</td><td>23209</td><td>Pierce BCA Protein Test Kitlerinin Bir Parçası (Thermo Scientific, 23225)</td></tr> <tr><td>Albümin, sığır serumu</td><td>Bioshop</td><td>ALB001</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Amonyum bikarbonat</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>09830</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Biotin&nbsp;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>B4639</td><td>Hücre ve doku kültürü sınıfı</td></tr><tr><td>Kalsiyum klorür (CaCl2)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C5670</td><td>Hücre kültürü sınıfı</td></tr><tr><td>Netlik batı ECL substratı</td><td>Biorad</td><td>1705060</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>DAPI</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>MBD0015</td><td>Işığa duyarlı, analitik sınıf</td></tr><tr><td>Dithiothreitol (DTT)</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>R0861</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Fetal sığır serumu</td><td>Corning</td><td>35-015-CV</td><td>Hücre kültürü sınıfı</td></tr><tr><td>Formik asit</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>F0507</td><td>Reaktif sınıfı, soluma toksisitesine dikkat</td></tr><tr><td>Grace'in böcek ortamı</td><td>Gibco</td><td>11595030</td><td>Hücre kültürü sınıfı</td></tr><tr><td>Anında kuru maya</td><td>Marka Yok</td><td>N1019</td><td>-</td></tr><tr><td>İyodoasetamid</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>I1149</td><td>Işığa duyarlı, analitik sınıf</td></tr><tr><td>Metanol</td><td>Carlo Erba</td><td>41484</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Oje</td> <td>-</td><td></td> <td>Şeffaf tip</td></tr><tr><td>Novex Tris-glisin SDS numune tamponu (2X)</td> <td>Invitrogen</td><td>LC2676</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>NuPAGE MOPS SDS Koşu Tamponu (20X)</td> <td>Invitrogen</td><td>NP0001</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>PageRuler Önceden boyanmış protein merdiveni</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>26616</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Fenilmetansülfonil florür ve nbsp;</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>36978</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Fosfat tampon salin</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P4417</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Pierce %16 Formaldehit (w/h)</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>28908</td><td>Analitik sınıf, ışığa duyarlı</td></tr><tr><td>Pierce BCA protein test kitleri</td><td>Thermo Scientific</td><td>23225</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Pierce BCA reaktifi A (0.1 M sodyum hidroksit içinde sodyum karbonat, sodyum bikarbonat, bikinkoninik asit ve sodyum tartrat içerir)</td><td>Thermo Scientific</td><td>23228</td><td>Pierce BCA Protein Test Kitlerinin Bir Parçası (Thermo Scientific, 23225)</td></tr><tr><td>Pierce BCA reaktifi B (%4 bakır sülfat içerir)</td><td>Thermo Scientific</td><td>1859078</td><td>Pierce BCA Protein Test Kitlerinin Bir Parçası (Thermo Scientific, 23225)</td></tr><tr><td>Propiyonik asit</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>402907</td><td>ACS sınıfı</td></tr><tr><td>Proteaz inhibitörü kokteyl seti III</td><td>Calbiochem</td><td>539134</td><td>Hücre ve doku kültürü sınıfı</td></tr><tr><td>SlowFade Gold Antifade Mountant</td><td>Invitrogen</td><td>S36936</td><td>Işığa duyarlı</td></tr><tr><td>Sodyum klorür (NaCl)</td><td>Bioneer</td><td>C-9025</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Sodyum deoksikolat</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>D6750</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Sodyum dodesil sülfat</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>71736</td><td>Moleküler sınıf</td></tr><tr><td>Sodyum hidroksit (NaOH)</td> <td>Biosesang</td><td>SR2018-100-00</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Üçlü damıtılmış su</td> <td>-</td><td></td> <td>Ultra saf (tip 1)</td></tr> <tr><td>Tris tamponlu salin</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>94158</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Tris-glisin transfer tamponu</td><td>Koma Biotech</td><td>K0341001</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Tris-HCl, pH 8</td><td>Bioneer</td><td>C-9006</td><td>Analitik sınıf</td></tr><tr><td>Triton x-100</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>93443</td><td>Moleküler sınıf</td></tr><tr><td>Tripsin</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>20233</td><td>Hücre kültürü sınıfı</td></tr><tr><td>Tween 20</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P9416</td><td>Moleküler sınıf</td></tr><tr><td>Üre</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>U5378</td><td>Moleküler & hücre kültürü sınıfı</td></tr></tbody></table>

in vivo (İn canlı) drosophila melanogaster'de turboid tabanlı yakınlık etiketleme uygulaması

In Vivo Application of TurboID-based Proximity Labeling in Drosophila melanogaster

Örnek çıktılar Şekil 1, Şekil 2, Şekil 3, Şekil 4'te daha önce Nguyen ve ark.20 tarafından yayınlanmıştır. Şekil 1, Drosophila yumurtalığında TurboID tabanlı PL'nin deneysel prosedürünü göstermektedir. İlk olarak, Zuc ve TurboID'yi birleştiren bir yapı oluşturuldu (Zuc-V5-TurboID). Nükleer ihracat sinyali (NE...

In vivo (İn canlı) Drosophila melanogaster'de TurboID Tabanlı Yakınlık Etiketleme Uygulaması

Proximity labeling (PL) is a powerful method for mapping protein-protein interaction networks. Advances in labeling enzymes, especially TurboID, have ...

in-vivo-application-turboid-based-proximity-labeling-drosophila

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Bu protokol, mikroenjeksiyon ve yüksek çözünürlüklü görüntüleme kullanımı...

Mitoz incelenmesi için Mikroenjeksiyon Teknikleri Drosophila melanogaster Sinsityal Embriyo

Mezoskopik floresan tomografi doku kesit floresan mikroskopi penetrasyon sınırları ötesinde faaliyet göstermektedir. Tekniği çok projeksiyon aydınlatma ve foton bir taşıma açıklamasına dayanmaktadır. Biz, in vivo morfolojilerinden tüm vücut 3B görselleştirme, GFP ifade kanat hayali diskler...

Mezoskopik Floresans Tomografi için In-vivo Görüntüleme Geliştirme Drosophila</em

Drosophila hemocytes gelişmekte olan embriyonun bütünlüğü içinde dağılırlar . Bu protokol, floresan etiketli hemocytes embriyoları kullanılarak bu göçler montaj ve görüntü nasıl gösteriyor.

Uygulamalarda Canlı Görüntüleme Drosophila melanogaster Embriyonik Hemocyte Göçler

Bu protokol, bozulmamış anesthetization ve görüntüleme için güvenilir bir yöntem...

Alt hücresel Çözünürlük bozulmamış Drosophila Larva in vivo Görüntüleme

Biz, merkezi sinir sistemi içinde tek nöron etiketlenmesine yönelik bir yöntem (CNS)...

Merkez Sinir Sistemi Tek Hücreler Etiketleme<em&gt; Drosophila melanogaster</em

Bu kağıdı doğrudan puparium aracılığıyla görüntü hücre davranışı hızlı bir tarama konfokal mikroskop kullanımını gösterir. Sağlam pupa davayı bırakarak, bu yöntem doğrudan çalışma zordur Drosophila bir gelişme aşamasında gözlem ve dinamik hücre süreçlerinin ölçülmesini sağlar.

Ve Pupa Durumunda sayesinde görüntüleme<em&gt; Drosophila melanogaster</em

Bu protokol, canlı Drosophila pupa göz nöroepitelini görüntülemek için etkili bir yöntem sunar. Bu yöntem, doku hareketini ve düzensiz topolojiyi telafi eder, birden fazla GFP etiketli bağlantı proteininin kullanılması yoluyla hücre sınırlarının görselleştirilmesini geliştirir ve kolayca monte edilebilen bir görüntüleme teçhizatı kullanır.

Canlı-görüntüleme Drosophila Pupa Göz

Açıklanan RNA in situ hibridizasyon Protokolü RNA algılama bütün Drosophila embriyo veya disseke doku sağlar. 96-de microtiter plakaları ve tyramide sinyal Güçlendirme kullanma, yüksek kararlılık, duyarlılık ve işlem hacmi ve nispeten düşük bir maliyetle transkript tespit edilebilir.

Yüksek çözünürlüklü Floresan Situ hibridizasyon Drosophila embriyo ve Tyramide sinyal güçlendirme kullanarak doku

Burada biz göstermek tek molekül fotoğraf-harekete geçirmek yerelleştirme mikroskobu canlı Drosophila melanogaster motor sinir terminal üzerinde yürütülen olabilir nasıl üçüncü larva biçim.

Vivo Tek molekül Drosophila Presynaptic Motor sinir Terminal izleme

Burada, moleküler işaretleri kullanarak canlı Drosophila melanogaster yumurta odasında endojen mRNA kaçakçılığı görselleştirme, algılama, analiz ve izleme için bir protokol sunuyoruz, iplik disk konfokka mikroskopi, ve açık kaynak Analizi Yazılım.

Canlı Drosophila melanogaster yumurta Chambers Içinde endojen mrnas görselleştirme ve izleme

Erken Drosophila embriyosunda, birçok organel hareketlidir. Prensip olarak, belirli floresan problar aracılığıyla canlı olarak görüntülenebilirler, ancak yumurta kabuğu embriyoya doğrudan uygulamayı önler. Bu protokol, bu tür probların mikroenjeksiyon yoluyla nasıl tanıtılacağını ve daha sonra parçacık  görüntü velosimetrisi yoluyla toplu organel hareketinin nasıl analiz edileceğini açıklar.

Drosophila Embriyolarında Lipid İçeren Organellerin Sitoiskelete Bağımlı Ticaretinin Görselleştirilmesi

Öğrenin Drosophila melanogaster yumurta hücrelerinde TurboID tabanlı yakınlık etiketleme ile zucchini protein etkileşimlerini haritalama. Bu yöntem, protein katlanması ve membran organizasyonu gibi süreçleri incelemek için yeni etkileşimleri ortaya çıkarır.

In vivo (İn canlı) Drosophila melanogaster'de TurboID Tabanlı Yakınlık Etiketleme Uygulaması

Daha fazla video keşfet