Name: Uzun Okuma Dizileme Teknolojilerini Kullanarak Amplikon Dizileme (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-08-29T13:40:00.000+00:00
Duration: 8 min 57 s
Description: Keşfedin, uzun okuma dizileme ile kaynakları kısıtlı ortamlarda tüberküloz ilaç direnci tanısı için amplikon dizileme protokolünü. Bu yöntem, kapsamlı direnç profili sunarak altın standartlarla karşılaştırılabilir doğruluk sağlar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Tuberculosis report. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Baltimore+Health+News%22">Baltimore Health News</a>. , WHO. (2022).</li>
<li>WHO Malaria Department report. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Report+20-23%22">Report 20-23</a>. , WHO. (2023).</li>
<li><a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22The+End+Strategy+TB%22">The End Strategy TB</a>. 53 (1), WHO. 1689-1699 (2015).</li>
<li>Cabibbe, A. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+targeted+nextgeneration+sequencing+assay+on+a+portable+sequencing+platform+for+culturefree+detection+of+drugresistant+tuberculosis+from+clinical+samples%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Application of targeted nextgeneration sequencing assay on a portable sequencing platform for culturefree detection of drugresistant tuberculosis from clinical samples.</a> J Clin Microbiol. 58 (10), e0063220(2020).</li>
<li>Jouet, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Deep+amplicon+sequencing+for+culturefree+prediction+of+susceptibility+or+resistance+to+13+antituberculous+drugs%5BTitle%5D)+AND+%22Eur+Respir+J%22%5BJournal%5D)">Deep amplicon sequencing for culturefree prediction of susceptibility or resistance to 13 antituberculous drugs.</a> Eur Respir J. 57 (3), 2002338(2021).</li>
<li>NG, K. C. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((How+well+do+routine+molecular+diagnostics+detect+Rifampin%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">How well do routine molecular diagnostics detect Rifampin.</a> J Clin Microbiol. 57 (1), e0128723(2019).</li>
<li>MacLean, E., Kohli, M., Weber, S. F., Suresh, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advances+in+molecular+diagnosis+of+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Advances in molecular diagnosis of tuberculosis.</a> J Clin Microbiol. 58 (10), e0158219(2020).</li>
<li>Sibandze, D. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+molecular+diagnostics+of+tuberculosis+resistance+by+targeted+stool+sequencing%5BTitle%5D)+AND+%22Genome+Med%22%5BJournal%5D)">Rapid molecular diagnostics of tuberculosis resistance by targeted stool sequencing.</a> Genome Med. 14 (1), 42(2022).</li>
<li>Shah, M., Chihota, V., Coetzee, G., Churchyard, G., Dorman, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+of+laboratory+costs+of+rapid+molecular+tests+and+conventional+diagnostics+for+detection+of+tuberculosis+and+drugresistant+tuberculosis+in+South+Africa%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Infect.+Dis%22%5BJournal%5D)">Comparison of laboratory costs of rapid molecular tests and conventional diagnostics for detection of tuberculosis and drugresistant tuberculosis in South Africa.</a> BMC Infect. Dis. 13 (1), 352(2013).</li>
<li>Hu, T., Chitnis, N., Monos, D., Dinh, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nextgeneration+sequencing+technologies%3A+An+overview%5BTitle%5D)+AND+%22Hum+Immunol%22%5BJournal%5D)">Nextgeneration sequencing technologies: An overview.</a> Hum Immunol. 82 (10), 801-811 (2021).</li>
<li>Pervez, M. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+comprehensive+review+of+performance+of+nextgeneration+sequencing+platforms%5BTitle%5D)+AND+%22Biomed+Res+Int%22%5BJournal%5D)">A comprehensive review of performance of nextgeneration sequencing platforms.</a> Biomed Res Int. 2022, 3457806(2022).</li>
<li>Tafess, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Targetedsequencing+workflows+for+comprehensive+drug+resistance+profiling+of+Mycobacterium+tuberculosis+cultures+using+two+commercial+sequencing+platforms%3A+Comparison+of+analytical+and+diagnostic+performance%2C+turnaround+time%2C+and+cost%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Chem%22%5BJournal%5D)">Targetedsequencing workflows for comprehensive drug resistance profiling of Mycobacterium tuberculosis cultures using two commercial sequencing platforms: Comparison of analytical and diagnostic performance, turnaround time, and cost.</a> Clin Chem. 66 (6), 809-820 (2020).</li>
<li>Use of targeted nextgeneration sequencing to detect drugresistant tuberculosis. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22WHO+rapid+communication%22">WHO rapid communication</a>. , WHO. https://www.who.int/publications/i/item/9789240076372 (2023).</li>
<li>Hazra, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Impact+of+wholegenome+sequencing+of+Mycobacterium+tuberculosis+on+treatment+outcomes+for+MDRTB%2FXDRTB%3A+A+systematic+review%5BTitle%5D)+AND+%22Pharmaceutics%22%5BJournal%5D)">Impact of wholegenome sequencing of Mycobacterium tuberculosis on treatment outcomes for MDRTB/XDRTB: A systematic review.</a> Pharmaceutics. 15 (6), 1408(2023).</li>
<li>Shea, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comprehensive+wholegenome+sequencing+and+reporting+of+drug+resistance+profiles+on+clinical+cases+of+Mycobacterium+tuberculosis+in+New+York+State%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Comprehensive wholegenome sequencing and reporting of drug resistance profiles on clinical cases of Mycobacterium tuberculosis in New York State.</a> J Clin Microbiol. 55 (6), 1871-1882 (2017).</li>
<li>Meehan, C. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Whole+genome+sequencing+of+Mycobacterium+tuberculosis%3A+Current+standards+and+open+issues%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Whole genome sequencing of Mycobacterium tuberculosis: Current standards and open issues.</a> Nat Rev Microbiol. 17 (10), 533-545 (2019).</li>
<li>Heupink, T. H., Verboven, L., Warren, R. M., Van Rie, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comprehensive+and+accurate+genetic+variant+identification+from+contaminated+and+lowcoverage+Mycobacterium+tuberculosis+whole+genome+sequencing+data%5BTitle%5D)+AND+%22Microb+Genom%22%5BJournal%5D)">Comprehensive and accurate genetic variant identification from contaminated and lowcoverage Mycobacterium tuberculosis whole genome sequencing data.</a> Microb Genom. 7 (1), e000555(2021).</li>
<li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interpretation+of+the+third+edition+of+WHO+consolidated+guidelines+on+tuberculosis%3A+Module+3%3A+Diagnosis%3A+Rapid+diagnostics+for+tuberculosis+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Chin+J+Antituberc%22%5BJournal%5D)">Interpretation of the third edition of WHO consolidated guidelines on tuberculosis: Module 3: Diagnosis: Rapid diagnostics for tuberculosis detection.</a> Chin J Antituberc. 46 (2), 120-130 (2024).</li>
<li>Kambli, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Targeted+nextgeneration+sequencing+directly+from+sputum+for+comprehensive+genetic+information+on+drugresistant+Mycobacterium+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22Tuberculosis%22%5BJournal%5D)">Targeted nextgeneration sequencing directly from sputum for comprehensive genetic information on drugresistant Mycobacterium tuberculosis.</a> Tuberculosis. 127 (1), 102051(2021).</li>
<li>Use of targeted nextgeneration sequencing to detect drugresistant tuberculosis. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Rapid+Communication%22">Rapid Communication</a>. , WHO. 1-8 (2023).</li>
<li>Nandlal, L., Perumal, R., Naidoo, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+molecular+assays+for+the+diagnosis+of+drugresistant+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22Infect+Drug+Resist%22%5BJournal%5D)">Rapid molecular assays for the diagnosis of drugresistant tuberculosis.</a> Infect Drug Resist. 15 (1), 4971-4984 (2022).</li>
<li>Dippenaar, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanopore+sequencing+for+Mycobacterium+tuberculosis%3A+A+critical+review+of+the+literature%2C+new+developments%2C+and+future+opportunities%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Nanopore sequencing for Mycobacterium tuberculosis: A critical review of the literature, new developments, and future opportunities.</a> J Clin Microbiol. 60 (5), e0123422(2022).</li>
<li>Chan, W. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+and+economical+drug+resistance+profiling+with+nanopore+MinION+for+clinical+specimens+with+low+bacillary+burden+of+Mycobacterium+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Res+Notes%22%5BJournal%5D)">Rapid and economical drug resistance profiling with nanopore MinION for clinical specimens with low bacillary burden of Mycobacterium tuberculosis.</a> BMC Res Notes. 13 (1), 123(2020).</li>
<li>Feuerriegel, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+genomic+first+and+secondline+drug+resistance+prediction+from+clinical+Mycobacterium+tuberculosis+specimens+using+DeeplexMycTB%5BTitle%5D)+AND+%22Eur+Respir+J%22%5BJournal%5D)">Rapid genomic first and secondline drug resistance prediction from clinical Mycobacterium tuberculosis specimens using DeeplexMycTB.</a> Eur Respir J. 57 (4), 2004784(2021).</li>
<li>GenoScreen product brochure. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Deeplex+MycTB%22">Deeplex MycTB</a>. , GenoScreen. (2023).</li>
<li>Mtafya, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+practical+approach+to+render+tuberculosis+samples+safe+for+application+of+tuberculosis+molecular+bacterial+load+assay+in+clinical+settings+without+a+biosafety+level+3+laboratory%5BTitle%5D)+AND+%22Tuberculosis%22%5BJournal%5D)">A practical approach to render tuberculosis samples safe for application of tuberculosis molecular bacterial load assay in clinical settings without a biosafety level 3 laboratory.</a> Tuberculosis. 138 (1), 102194(2023).</li>
<li>Suganthi, P., Usharani, B., Venkateswari, R., Muthuraj, M. Biosafety practices in mycobacteriology laboratory. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSuganthi%2C+P+%22Research+Advances+in+Microbiology+and+Biotechnology%22">Research Advances in Microbiology and Biotechnology</a>. 3, B P International (a part of SCIENCEDOMAIN International). Chennai. 1-39 (2023).</li>
<li>consolidated guidelines on tuberculosis. Module 4: Treatment and care. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22WHO+guideline%22">WHO guideline</a>. , WHO. (2022).</li>
<li>Williams, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Matrixbased+DNA+extraction+for+targeted+nextgeneration+sequencing+on+decontaminated+sputum+samples%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Matrixbased DNA extraction for targeted nextgeneration sequencing on decontaminated sputum samples.</a> J Vis Exp. (181), e68147(2025).</li>
<li>Delahaye, C., Nicolas, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sequencing+DNA+with+nanopores%3A+Troubles+and+biases%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Sequencing DNA with nanopores: Troubles and biases.</a> PLoS One. 16 (2), e0245534(2021).</li>
<li>Zhao, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+identification+of+drugresistant+tuberculosis+genes+using+direct+PCR+amplification+and+Oxford+Nanopore+Technology+sequencing%5BTitle%5D)+AND+%22Can+J+Infect+Dis+Med+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Rapid identification of drugresistant tuberculosis genes using direct PCR amplification and Oxford Nanopore Technology sequencing.</a> Can J Infect Dis Med Microbiol. 2022, 8845672(2022).</li>
<li>Tagliani, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Culture+and+nextgeneration+sequencingbased+drug+susceptibility+testing+unveil+high+levels+of+drugresistantTB+in+Djibouti%3A+Results+from+the+first+national+survey%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Culture and nextgeneration sequencingbased drug susceptibility testing unveil high levels of drugresistantTB in Djibouti: Results from the first national survey.</a> Sci Rep. 7 (1), 15076(2017).</li>
<li>Smith, C., Halse, T. A., Shea, J., Modestil, H., Fowler, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assessing+nanopore+sequencing+for+clinical+diagnostics%3A+For+Mycobacterium+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Assessing nanopore sequencing for clinical diagnostics: For Mycobacterium tuberculosis.</a> J Clin Microbiol. 59 (7), e0123421(2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>15 mL & 1.5 mL veya 2 mL Lo-bağlanma Tüpleri</td><td>Eppendorf</td><td>EP0030108051-250EA</td><td></td></tr><tr><td>1kb merdiven</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>SM0311</td><td></td></tr><tr><td>2 mL vida kapaklı tüpler</td><td>Bilimsel Uzmanlıklar Şirketi</td><td>P2TUB056C-0001.5ST</td><td></td></tr><tr><td>2 mm steril cam boncuklar</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Z273627-1EA</td><td></td></tr><tr><td>AMPure XP Boncuk</td><td>Beckman Colter</td><td>A63881</td><td></td></tr><tr><td>Deeplex Myc-TB&nbsp;</td><td>GenoScreen</td><td>20090205</td><td></td></tr><tr><td>Elektroforez odası</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>A25977</td><td></td></tr><tr><td>Etil alkol, saf</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>E7023-500ML</td><td></td></tr><tr><td>FastPrep Homojenizer</td><td>MP Biyomedikal</td><td>116005500</td><td></td></tr><tr><td>Filtre pipet uçları (10 & mikro; L)&nbsp;</td><td>Biyo-Akıllı Bilimsel</td><td>FT-10-R</td><td></td></tr><tr><td>Filtre pipet uçları (1000 &micro; L)&nbsp;</td><td>Biyo-Akıllı Bilimsel</td><td>FT-1000-R</td><td></td></tr><tr><td>Filtre pipet uçları (20 & mikro; L)&nbsp;</td><td>Biyo-Akıllı Bilimsel</td><td>FT-20-R</td><td></td></tr><tr><td>Filtre pipet uçları (200 & mikro; L)&nbsp;</td><td>Biyo-Akıllı Bilimsel</td><td>FT-200-R</td><td></td></tr><tr><td>Akış-hücresi&nbsp;</td><td>Oxford Nanopore Teknolojileri</td><td>FLO-MIN114</td><td></td></tr><tr><td>Isıtma bloğu</td><td>Eppendorf</td><td>5382000031</td><td></td></tr><tr><td>InstaGene Matrisi</td><td>Bio-Rad</td><td>BBRD7326030</td><td></td></tr><tr><td>Manyetik Raf&nbsp;</td><td>Thermo Fisher Scientific&nbsp;</td><td>12321D</td><td></td></tr><tr><td>Mikrosantrifüj</td><td>Eppendorf&nbsp;</td><td>5406000046</td><td></td></tr><tr><td>MinION</td><td>Oxford Nanopore Teknolojileri</td><td>MK1B</td><td></td></tr><tr><td>Yerel barkod kiti V14&nbsp;</td><td>Oxford Nanopore Teknolojileri</td><td>SQK-NBD114.24</td><td></td></tr><tr><td>NEB Blunt/TA Ligase Master Mix</td><td>NEB</td><td>M0367</td><td></td></tr><tr><td>NEBNext Hızlı Ligasyon Modülü</td><td>NEB</td><td>E6056</td><td></td></tr><tr><td>NEBNext Ultra II Son Tamir/dA-tailing Modülü</td><td>NEB</td><td>E7546</td><td></td></tr><tr><td>Nükleazsız su (NFW)</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>AM9937</td><td></td></tr><tr><td>Pipetler (P10, P20, P200 ve P1000)</td><td>Eppendorf</td><td>EP3123000918-1EA</td><td></td></tr><tr><td>Kubit Analiz Trubları</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>Q32856</td><td></td></tr><tr><td>Qubit dsDNA HS Test Kiti</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>Q33231</td><td></td></tr><tr><td>Kubit florometre</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>Q33226</td><td></td></tr><tr><td>SYBR Güvenli DNA Jel Türü</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>S33102</td><td></td></tr><tr><td>UltraPure Agarose</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>17852</td><td></td></tr><tr><td>Evrensel Hood III transilluminatör (Moleküler Görüntüleyici Jel Doc XR Sistemi)</td><td>Bio-Rad</td><td>170-8170</td><td></td></tr><tr><td>Vortex mikser</td><td>Lasec</td><td>WMBB0L0E0216</td><td></td></tr></tbody></table>

uzun okuma dizileme teknolojilerini kullanarak amplikon dizileme

Amplicon Sequencing using the Long-Read Sequencing Technologies

Uzun Okuma Dizileme Teknolojilerini Kullanarak Amplikon Dizileme

The World Health Organization (WHO) continues to emphasize the urgent need for a rapid, cost-effective, and user-friendly diagnostic method for ...

amplicon-sequencing-using-the-long-read-sequencing-technologies

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Biyokimya

Burada T7 lineer RNA amplifikasyon dayalı gen ekspresyon analizi için iki tek okudum ve eşleştirilmiş sonuna Illumina mRNA Seq sıralama kütüphaneler hazırlanması için bir yöntem açıklanmaktadır. Bu protokol, toplam RNA başlayan sadece 10 nanogram gerektirir ve tüm transkript temsil eden son derece tutarlı bir kütüphane oluşturur.

10 nanogram Total RNA tek okuyun ve Eşleştirilmiş Sona mRNA-Seq Illumina Kütüphaneler

Mikrobiyal topluluğu karakterize etmek, çevresel mikrobiyolojide uzun süredir devam eden bir hedef olmuştur. Yeni nesil dizileme yöntemleri artık mikrobiyal toplulukların minimum maliyet ve iş gücü ile benzeri görülmemiş bir derinlikte karakterizasyonuna izin veriyor. Burada, bir tezgah üstü dizileyici kullanarak bakteriyel 16S ribozomal RNA genlerini dizileme yaklaşımımızı detaylandırıyoruz.

16S Ribozomal RNA Gen amplikonlarının nesil Sıralama

Bu iletişim kuralı için siteleri işleme eşleme pre-mRNA 3' ucu bir yöntemi açıklar.

A-seq2 ile kütüphane hazırlık sıralama 3' ucu

Tam uzunlukta bireysel proviral sıralama (döndürür) amplifikasyon ve sıralama tek, tam uzunlukta (sağlam ve arızalı) HIV-1 proviruses yakınındaki bir verimli ve yüksek işlem hacmi yöntemi sağlar ve potansiyellerini belirlenmesi için izin verir çoğaltma-yetkinlik. DÖNDÜRÜR önceki deneyleri gizli HIV-1 rezervuar sıralamak için tasarlanmış sınırlamalar üstesinden gelir.

Amplifikasyon tam uzunlukta HIV-1 Proviruses yakınındaki yeni nesil sıralama için

Uzun okunur dizileri büyük ölçüde karmaşık genleri ve yapısal değişim karakterizasyonu montajı kolaylaştırmak. Biz sıralama nanopore tabanlı platformlar tarafından olağanüstü uzun dizileri oluşturmak için bir yöntem açıklanmaktadır. Yaklaşım kilobaz okuma orta kapsama ile yüzlerce insan hücreleri oluşturmak için değiştirilen kitaplığı hazırlıklar ardından en iyi duruma getirilmiş bir DNA ekstraksiyon benimser.

Bütün genomik DNA analizi için olağanüstü uzun okunur sıralama

Nanopore sıralamasını uzak konumlarda ve kaynak kötü ayarlarında maliyet-etkili sıralamaya izin veren bir yeni teknoloji. Burada, mRNAs 'ın bu şartlar ile uyumlu olan tüm kandan sıralanması için bir protokol sunuyoruz.

Nanopore sıralamayı kullanarak tüm kan mRNA sıralaması

Bu protokol, uygun maliyetli transkriptom tabanlı ilaç taraması için ex vivo veya in vitro hücre kültürlerinden transkriptomik veri ön işlemeye kadar bir iş akışını açıklar.

Uygun Maliyetli Transkriptomik Tabanlı İlaç Taraması

Mevcut çalışma, kromozom dizisi zaten biliniyor veya ilgi çekici olmayan plazmidlerin nanopore dizileme iş akışını açıklıyor. Başlangıçta bir plazmid DNA zenginleştirme adımı, optimal plazmid dizisi derinliğini sağlar ve akış hücresi başına dizilenebilen örnek sayısını maksimize eder.

Nanopore dizileme tabanlı iş akışları kullanarak uzun okuma plazmid dizileme ve montajı

Bu da çalışmanın Rab10 fosforilasyon endojen düzeyleri lösin yönünden zengin tekrar kinaz 2 algılama basit bir yöntem açıklanır.

Rab10 fosforilasyon algılama SDS-sayfa bir fosfat bağlayıcı etiketi ile kullanarak LRRK2 etkinliğini tarafından

Organizmalar hayatları boyunca karşılaştığınız en zor stres koşulları oksidanlar birikimi içerir. Oksidatif stres sırasında hücreleri moleküler chaperones güveniyorsun. Burada, redoks düzenlenir anti-toplama etkinliği, de araştırmak için refakatçi işlev HDX-MS kullanarak yöneten yapısal değişiklikleri izlemek için kullanılan bir yöntem mevcut.

Hsp33'ın redoks düzenlenir refakatçi etkinlik tanımlama ve Hsp33 konformasyon değişiklikleri hidrojen-döteryum Exchange kütle spektrometresi kullanarak eşleme

Keşfedin, uzun okuma dizileme ile kaynakları kısıtlı ortamlarda tüberküloz ilaç direnci tanısı için amplikon dizileme protokolünü. Bu yöntem, kapsamlı direnç profili sunarak altın standartlarla karşılaştırılabilir doğruluk sağlar.

Uzun Okuma Dizileme Teknolojilerini Kullanarak Amplikon Dizileme

Daha fazla video keşfet