-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

TR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

tr_TR

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
Fotosentetik Mikropların ve Virüslerinin Çevresel Örneklemesi: Tarladan Laboratuvara
Fotosentetik Mikropların ve Virüslerinin Çevresel Örneklemesi: Tarladan Laboratuvara
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Environmental Sampling of Photosynthetic Microbes and Their Viruses: From Field to Lab

Fotosentetik Mikropların ve Virüslerinin Çevresel Örneklemesi: Tarladan Laboratuvara

Full Text
935 Views
08:01 min
July 3, 2025

DOI: 10.3791/68379-v

Sobroney Heng*1, Ruben Michael Ceballos*1,2

1Department of Molecular and Cell Biology,University of California, Merced, 2Quantitative Systems Biology Program,University of California, Merced

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study focuses on methodologies for sampling from euphotic zones in marine and freshwater ecosystems to isolate cyanophages and their hosts. The research outlines the processes for enriching single genotypes and characterizing dynamics in virus-host interactions, employing advanced techniques for physiological analysis and modeling.

Key Study Components

Research Area

  • Virus-host interactions
  • Cyanophage dynamics
  • Microbial ecology in aquatic systems

Background

  • Importance of quantifying viral infections
  • Challenges in generating pure viral stocks
  • Need for predictive models in virology

Methods Used

  • Environmental sampling techniques
  • Cyanobacteria and microalgae as model organisms
  • Electron microscopy, quantitative PCR, and high-throughput sequencing

Main Results

  • Successful isolation of single genotype virus stocks
  • Characterization of virus-host dynamics through growth curves and microscopy
  • Identification of cyanobacterial species using 16S rRNA sequencing

Conclusions

  • This study demonstrates effective methods for isolating and characterizing cyanophages and their hosts.
  • Findings contribute significantly to our understanding of viral ecology in freshwater and marine environments.

Frequently Asked Questions

What are cyanophages?
Cyanophages are viruses that specifically infect cyanobacteria, playing significant roles in aquatic ecosystems.
How are viral titers determined?
Viral titers are determined through robust bioinformatics and quantification methods during experimental infections.
What is the significance of single genotype isolation?
Isolating single genotypes helps in accurately studying virus-host dynamics and interactions.
What technologies are employed in this study?
The study uses high-throughput sequencing, quantitative PCR, and transmission electron microscopy.
Why is understanding virus-host interactions crucial?
Understanding these interactions helps predict ecological changes and viral behavior in various environments.
What organisms were used as models in this research?
Cyanobacteria and microalgae were used as model organisms to study virus-host dynamics.
How does this research impact future virology studies?
The methodologies developed can enhance virology studies, informing predictive models and ecological assessments.

Burada, siyanofajları (ve konakçılarını) izole etmek için deniz ve tatlı su ekosistemlerinin öfotik bölgelerinden örnekleme yöntemlerini ve tek genotipleri zenginleştiren ve virüs-konak etkileşim dinamiklerini karakterize eden örnekleme sonrası süreçleri açıklıyoruz.

Bu projelerin amacı, viral enfeksiyonlardaki fizyolojik parametreleri ölçmek, ardından omik substratları gözlemlenen fizyolojiye eşlemek ve virolojide virüs-konakçı dinamiklerindeki değişiklikleri tahmin eden modellere veya yasalara yol açmaktır. Yüksek verimli dizileme ve kolaylaştırılmış biyoinformatik iş akışlarındaki gelişmelerle, fizyolojik fenomenleri belirli omik substratların bir fonksiyonu olarak açıklama fırsatı sağlayan çoklu omik analizlere kolayca erişilebilir. Deneysel enfeksiyonlar, elektron mikroskobu, kantitatif PCR yeni nesil dizileme ve sağlam biyoinformatik boru hatları kullanan ağ analizleri, tahmine dayalı modellerin geliştirilmesini bilgilendiren omikler ve fizyolojik değişkenler arasındaki ilişkileri belirleyebilir.

En büyük zorluk, deneysel enfeksiyonlar için enfeksiyon çokluğunun belirlenebilmesi için doğru titrelere sahip saf tek genotip virüs stokları oluşturmaktır. Titre tayini virolojide bir sorun olmaya devam etmektedir. Tek konaklı/tek virüslü enfeksiyonlarda bir konakçıyı enfekte eden iki virüs veya farklı konakçıları enfekte eden bir virüs arasındaki nispi virülansı hesaplamak için ölçümler geliştirdik.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

JoVE'de bu ay sayı 221

Related Videos

Su Sistemleri Virüs Üretim Oranlar tahmin

10:49

Su Sistemleri Virüs Üretim Oranlar tahmin

Related Videos

13.1K Views

'Tek Virüs Genomik' kullanarak Tek viryonlar İzolasyonu ve Genom Analizi

08:31

'Tek Virüs Genomik' kullanarak Tek viryonlar İzolasyonu ve Genom Analizi

Related Videos

11.6K Views

Su Kimya ve Deniz Mikrobiyoloji A Field Guide - Okyanusu'nda gaybı Oyuncular çözülüyor

10:43

Su Kimya ve Deniz Mikrobiyoloji A Field Guide - Okyanusu'nda gaybı Oyuncular çözülüyor

Related Videos

26.4K Views

Faj Phenomics: Fizyolojik Yaklaşımlar Roman Viral Proteinler karakterize etmek

09:40

Faj Phenomics: Fizyolojik Yaklaşımlar Roman Viral Proteinler karakterize etmek

Related Videos

12.9K Views

Kompozisyon ve Bioaerosols farklı çevresel koşullar altında dağıtım Analizi

05:45

Kompozisyon ve Bioaerosols farklı çevresel koşullar altında dağıtım Analizi

Related Videos

12.4K Views

Yaprak Reflektasyonu ve Klorofil Floresan Analizlerinin Eşzamanlı Ölçümleri ile Fotosentetik Davranışların Değerlendirilmesi

10:20

Yaprak Reflektasyonu ve Klorofil Floresan Analizlerinin Eşzamanlı Ölçümleri ile Fotosentetik Davranışların Değerlendirilmesi

Related Videos

13.3K Views

Metaorganizma Araştırma ve Koruma için Biyoremediasyon ve Probiyotikler Gelişimi için Mikrobiyal Suşların Prospektileri

09:49

Metaorganizma Araştırma ve Koruma için Biyoremediasyon ve Probiyotikler Gelişimi için Mikrobiyal Suşların Prospektileri

Related Videos

23.3K Views

Yağsız Süt Flokülasyonu ve Ultrafiltrasyon Kullanılarak Çevresel Su ve Atık Su Numunelerinden Virüs Partiküllerinin Konsantrasyonu

10:53

Yağsız Süt Flokülasyonu ve Ultrafiltrasyon Kullanılarak Çevresel Su ve Atık Su Numunelerinden Virüs Partiküllerinin Konsantrasyonu

Related Videos

2.5K Views

Termit Gut Mikroplar (Zootermopsis Angusticollis) DNA ayıklanıyor ve Gut Mikroplar görselleştirme

15:27

Termit Gut Mikroplar (Zootermopsis Angusticollis) DNA ayıklanıyor ve Gut Mikroplar görselleştirme

Related Videos

16.1K Views

Deniz suyu Örnekleme ve Tahsilat

08:23

Deniz suyu Örnekleme ve Tahsilat

Related Videos

20.9K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code