Exploring Protein-Glycan Interactions: Advances in Nuclear Magnetic Resonance

Fabio C. L. Almeida; Francisco Felipe Bezerra; Ariana  A. Vasconcelos

doi:10.3791/68674

Protein-Glikan Etkileşimlerini Keşfetmek: Nükleer Manyetik Rezonanstaki Gelişmeler

JoVE Journal
Biochemistry

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Biochemistry

Exploring Protein-Glycan Interactions: Advances in Nuclear Magnetic Resonance

Protein-Glikan Etkileşimlerini Keşfetmek: Nükleer Manyetik Rezonanstaki Gelişmeler

Full Text

589 Views

10:07 min

August 26, 2025

DOI: 10.3791/68674-v

Fabio C. L. Almeida^1,2, Francisco Felipe Bezerra^1,3, Ariana A. Vasconcelos^1,2

¹Institute of Medical Biochemistry Leopoldo de Meis (IBqM),Federal University of Rio de Janeiro (UFRJ), ²National Center for Structural Biology and Bioimaging (CENABIO),Federal University of Rio de Janeiro (UFRJ), ³Laboratory of Connective Tissue,Clementino Fraga Filho University Hospital

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Bu NMR tabanlı protokol, siyanovirin-N ve D-mannoz kullanarak zayıf protein-glikan etkileşimlerini araştırır. Ligand ve protein tarafından tespit edilen yöntemleri birleştirerek, bağlanma bölgelerini haritalandırır, allosterik etkileri tespit eder ve karşılaşma komplekslerini tanımlar. Yaklaşım, glikana özgü teşhis ve tanıma mekanizmaları için değerli yapısal ve dinamik bilgiler sunarak numune hazırlama ve veri analizini ana hatlarıyla belirtir.

İntegrin-disintegrin kompleksine odaklanarak protein-protein ve protein-glikan etkileşimlerini inceliyoruz. Modelimiz yapısal dinamikleri araştırıyor ve yüzey kuvvetinin karmaşık oluşum ve etkileşim stabilitesine aracılık etmedeki rolünü vurguluyor. Grubumuz, proteinlerde bulunan yüzey hidrofobik kümelerini inceleyerek bağlanma bölgelerinin moleküler tanınması ve evriminde yüzey kuvvetlerinin rolünün incelenmesine adanmıştır.

NMR çözeltisi, protein etkileşimlerinin saptanmasını sağlar. Zayıf etkileşimler yaşam için gerekli olsa da, birçok önemli biyolojik fonksiyonda mevcut olmalarına rağmen, yüksek afiniteli komplekslere karşı bir önyargı vardır. Grubumuz, büyük protein kompleksini incelemek için bütünleştirici yapısal biyoloji yaklaşımlarını kullanmaya odaklanıyor.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Explore More Videos

JoVE'de Bu Ay Sayı 222