Name: Glycomein Kütle Spektrometrisi Kullanılarak Mekânsal Moleküler Görüntülemesi (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-11-28T12:40:00.000+00:00
Duration: 8 min 52 s
Description: Keşfedin kütle spektrometrisi görüntüleme ile karaciğer dokularında glikojen ve N-bağlı glikanların mekânsal dağılımını. Bu yöntem, glikobiyoloji araştırmalarında biyolojik işlevleri anlamak için değerli bilgiler sunar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

<ol><li>Caprioli, R. M., Farmer, T. B., Gile, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+imaging+of+biological+samples%3A+Localization+of+peptides+and+proteins+using+MALDI-TOF+MS%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Molecular imaging of biological samples: Localization of peptides and proteins using MALDI-TOF MS.</a> Anal Chem. 69 (23), 4751-4760 (1997).</li>
<li>Buchberger, A. R., Delaney, K., Johnson, J., Li, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mass+spectrometry+imaging%3A+A+review+of+emerging+advancements+and+future+insights%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Mass spectrometry imaging: A review of emerging advancements and future insights.</a> Anal Chem. 90 (1), 240-265 (2018).</li>
<li>Ouedraogo, R., Daumas, A., Capo, C., Mege, J. L., Textoris, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Whole-cell+MALDI-TOF+mass+spectrometry+is+an+accurate+and+rapid+method+to+analyze+different+modes+of+macrophage+activation%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Whole-cell MALDI-TOF mass spectrometry is an accurate and rapid method to analyze different modes of macrophage activation.</a> J Vis Exp. 82, e50926(2013).</li>
<li>Khalil, S. M., Cappuccio, G., Li, F., Maletic-Savatic, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+imaging+of+human+brain+organoids+using+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Molecular imaging of human brain organoids using mass spectrometry.</a> J Vis Exp. 211, e66997(2024).</li>
<li>Sun, R. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Brain+glycogen+serves+as+a+critical+glucosamine+cache+required+for+protein+glycosylation%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Metab%22%5BJournal%5D)">Brain glycogen serves as a critical glucosamine cache required for protein glycosylation.</a> Cell Metab. 33 (7), 1404-1417 (2021).</li>
<li>Aichler, M., Walch, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Maldi+imaging+mass+spectrometry%3A+Current+frontiers+and+perspectives+in+pathology+research+and+practice%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+Invest%22%5BJournal%5D)">Maldi imaging mass spectrometry: Current frontiers and perspectives in pathology research and practice.</a> Lab Invest. 95 (4), 422-431 (2015).</li>
<li>Conroy, L. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-dimensionality+reduction+clustering+of+complex+carbohydrates+to+study+lung+cancer+metabolic+heterogeneity%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Cancer+Res%22%5BJournal%5D)">High-dimensionality reduction clustering of complex carbohydrates to study lung cancer metabolic heterogeneity.</a> Adv Cancer Res. 154, 227-251 (2022).</li>
<li>Seeley, E. H., Caprioli, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+imaging+of+proteins+in+tissues+by+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Molecular imaging of proteins in tissues by mass spectrometry.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 105 (47), 18126-18131 (2008).</li>
<li>Powers, T. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Matrix-assisted+laser+desorption+ionization+imaging+mass+spectrometry+workflow+for+spatial+profiling+analysis+of+N-linked+glycan+expression+in+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Matrix-assisted laser desorption ionization imaging mass spectrometry workflow for spatial profiling analysis of N-linked glycan expression in tissues.</a> Anal Chem. 85 (20), 9799-9806 (2013).</li>
<li>Drake, R. R., Powers, T. W., Norris-Caneda, K., Mehta, A. S., Angel, P. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+situ+imaging+of+N-glycans+by+MALDI+imaging+mass+spectrometry+of+fresh+or+formalin-fixed+paraffin-embedded+tissue%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Protoc+Protein+Sci%22%5BJournal%5D)">In situ imaging of N-glycans by MALDI imaging mass spectrometry of fresh or formalin-fixed paraffin-embedded tissue.</a> Curr Protoc Protein Sci. 94 (1), e68(2018).</li>
<li>Stanback, A. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regional+n-glycan+and+lipid+analysis+from+tissues+using+MALDI-MS+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22STAR+Protoc%22%5BJournal%5D)">Regional n-glycan and lipid analysis from tissues using MALDI-MS imaging.</a> STAR Protoc. 2 (1), 100304(2021).</li>
<li>Hawkinson, T. R., Sun, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Matrix-assisted+laser+desorption%2Fionization+mass+spectrometry+imaging+of+glycogen+in+situ%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry imaging of glycogen in situ.</a> Methods Mol Biol. 2437, 215-228 (2022).</li>
<li>Young, L. E. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+situ+mass+spectrometry+imaging+reveals+heterogeneous+glycogen+stores+in+human+normal+and+cancerous+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+Mol+Med%22%5BJournal%5D)">In situ mass spectrometry imaging reveals heterogeneous glycogen stores in human normal and cancerous tissues.</a> EMBO Mol Med. 14 (11), e16029(2022).</li>
<li>Conroy, L. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spatial+metabolomics+reveals+glycogen+as+an+actionable+target+for+pulmonary+fibrosis%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Spatial metabolomics reveals glycogen as an actionable target for pulmonary fibrosis.</a> Nat Commun. 14 (1), 2759(2023).</li>
<li>Clarke, H. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glycogen+drives+tumor+initiation+and+progression+in+lung+adenocarcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Metab%22%5BJournal%5D)">Glycogen drives tumor initiation and progression in lung adenocarcinoma.</a> Nat Metab. 7 (5), 952-965 (2025).</li>
<li>Wallace, E. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+N-glycome+tissue+atlas+of+15+human+normal+and+cancer+tissue+types+determined+by+MALDI+imaging+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">An N-glycome tissue atlas of 15 human normal and cancer tissue types determined by MALDI imaging mass spectrometry.</a> Sci Rep. 14 (1), 489(2024).</li>
<li>Veerasammy, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sample+preparation+for+metabolic+profiling+using+MALDI+mass+spectrometry+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Sample preparation for metabolic profiling using MALDI mass spectrometry imaging.</a> J Vis Exp. 166, e62008(2020).</li>
<li>Mcdowell, C. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+mass+spectrometry+and+lectin+analysis+of+N-linked+glycans+in+carbohydrate+antigen-defined+pancreatic+cancer+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell+Proteomics%22%5BJournal%5D)">Imaging mass spectrometry and lectin analysis of N-linked glycans in carbohydrate antigen-defined pancreatic cancer tissues.</a> Mol Cell Proteomics. 20, 100012(2021).</li>
<li>Palmer, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((FDR-controlled+metabolite+annotation+for+high-resolution+imaging+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">FDR-controlled metabolite annotation for high-resolution imaging mass spectrometry.</a> Nat Methods. 14 (1), 57-60 (2017).</li>
<li>Colpaert, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Neurological+glycogen+storage+diseases+and+emerging+therapeutics%5BTitle%5D)+AND+%22Neurotherapeutics%22%5BJournal%5D)">Neurological glycogen storage diseases and emerging therapeutics.</a> Neurotherapeutics. 21 (5), e00446(2024).</li>
<li>Taylor, M. J., Lukowski, J. K., Anderton, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spatially+resolved+mass+spectrometry+at+the+single+cell%3A+Recent+innovations+in+proteomics+and+metabolomics%5BTitle%5D)+AND+%22J+Am+Soc+Mass+Spectrom%22%5BJournal%5D)">Spatially resolved mass spectrometry at the single cell: Recent innovations in proteomics and metabolomics.</a> J Am Soc Mass Spectrom. 32 (4), 872-894 (2021).</li>
<li>Chan, Y. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gel-assisted+mass+spectrometry+imaging+enables+sub-micrometer+spatial+lipidomics%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Gel-assisted mass spectrometry imaging enables sub-micrometer spatial lipidomics.</a> Nat Commun. 15 (1), 5036(2024).</li>
<li>Lim, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Maldi+Hiplex-IC%3A+Multiomic+and+multimodal+imaging+of+targeted+intact+proteins+in+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Chem%22%5BJournal%5D)">Maldi Hiplex-IC: Multiomic and multimodal imaging of targeted intact proteins in tissues.</a> Front Chem. 11, 1182404(2023).</li>
<li>Hankin, J. A., Barkley, R. M., Murphy, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sublimation+as+a+method+of+matrix+application+for+mass+spectrometric+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22J+Am+Soc+Mass+Spectrom%22%5BJournal%5D)">Sublimation as a method of matrix application for mass spectrometric imaging.</a> J Am Soc Mass Spectrom. 18 (9), 1646-1652 (2007).</li>
<li>Rappez, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spacem+reveals+metabolic+states+of+single+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Spacem reveals metabolic states of single cells.</a> Nat Methods. 18 (7), 799-805 (2021).</li>
<li>Grgic, A., Cuypers, E., Dubois, L. J., Ellis, S. R., Heeren, R. M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Maldi+MSI+protocol+for+spatial+bottom-up+proteomics+at+single-cell+resolution%5BTitle%5D)+AND+%22J+Proteome+Res%22%5BJournal%5D)">Maldi MSI protocol for spatial bottom-up proteomics at single-cell resolution.</a> J Proteome Res. 23 (12), 5372-5379 (2024).</li>
<li>Dressman, J. W., Bayram, M. F., Angel, P. M., Drake, R. R., Mehta, A. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+multiomic+MALDI-MSI+analysis+of+lipids+and+N-glycans+through+affinity+array+capture%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Single-cell multiomic MALDI-MSI analysis of lipids and N-glycans through affinity array capture.</a> Anal Chem. 97 (24), 12493-12502 (2025).</li>
<li>Clarke, H. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spatial+mapping+of+the+brain+metabolome%2C+lipidome%2C+and+glycome%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Spatial mapping of the brain metabolome, lipidome, and glycome.</a> Nat Commun. 16 (1), 4373(2025).</li>
<li>Juras, J. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+situ+microwave+fixation+provides+an+instantaneous+snapshot+of+the+brain+metabolome%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Rep+Methods%22%5BJournal%5D)">In situ microwave fixation provides an instantaneous snapshot of the brain metabolome.</a> Cell Rep Methods. 3 (4), 100455(2023).</li>
<li>Cantrell, A. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protocol+for+high-power%2C+brain-focused+microwave+fixation+to+define+rodent+metabolism%5BTitle%5D)+AND+%22STAR+Protoc%22%5BJournal%5D)">Protocol for high-power, brain-focused microwave fixation to define rodent metabolism.</a> STAR Protoc. 6 (2), 103794(2025).</li>
<li>Ma, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+AI-driven+framework+to+map+the+brain+metabolome+in+three+dimensions%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Metab%22%5BJournal%5D)">An AI-driven framework to map the brain metabolome in three dimensions.</a> Nat Metab. 7 (4), 842-853 (2025).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Emici alt pad</td><td>Denville Scientific</td><td>B1623</td><td></td></tr><tr><td>Asetonitril (ACN)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>34851-4X4L</td><td></td></tr><tr><td>Alüminyum folyo</td><td>Fisher Scientific&nbsp;</td><td>15078292</td><td></td></tr><tr><td>Sitrakonik anhidrit</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>125318</td><td></td></tr><tr><td>Konik tüp (15mL)</td><td>Alkali Scientific</td><td>CW5600</td><td></td></tr><tr><td>Coplin Kavanozları</td><td>DWK Yaşam Bilimleri</td><td>900570</td><td></td></tr><tr><td>Cryostat&nbsp;</td><td>Leica</td><td>CM1860</td><td></td></tr><tr><td>Kriyostat çakması</td><td>Leica</td><td>14041926491</td><td></td></tr><tr><td>Kurutucu</td><td>Bel Art</td><td>F424004131</td><td></td></tr><tr><td>Diyaliz kupası</td><td>Thermo Fisher</td><td>88400</td><td></td></tr><tr><td>Etanol</td><td>Fisher Scientific&nbsp;</td><td>22032601</td><td></td></tr><tr><td>Gıda buharlaştırıcısı</td><td>Rival&nbsp;</td><td>CKRVSTLM21&nbsp; &nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>Cam iç (70 mm)</td><td>Gel Company</td><td>LGI50</td><td></td></tr><tr><td>Glikojen</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G8876</td><td>Standart</td></tr><tr><td>Dağ Renkli Peroksidaz (HRP)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P8125</td><td>Standart</td></tr><tr><td>HPLC suyu</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>270733-4X4L</td><td></td></tr><tr><td>HTX Sprey</td><td>HTX Teknolojileri</td><td>M5</td><td></td></tr><tr><td>Hidroklorik asit</td><td>Fisher Scientific&nbsp;</td><td>A144-500</td><td></td></tr><tr><td>İzoamilaza</td><td>Megazyme</td><td>E-ISAMY</td><td></td></tr><tr><td>Knauer pompası</td><td>Knauer</td><td>P 4.1 S</td><td></td></tr><tr><td>Düşük profilli bıçak</td><td>Elektron Mikroskopi Bilimleri</td><td>63059-01</td><td></td></tr><tr><td>M1 montaj ortamı</td><td>Epredia</td><td>1310</td><td></td></tr><tr><td>Kütle Spektrometresi</td><td>Bruker Daltonics</td><td>timsTOF fleX</td><td></td></tr><tr><td>Microfuge tüpü (1.5mL)</td><td>Alkali Scientific</td><td>CN3016</td><td></td></tr><tr><td>İğne</td><td>BD</td><td>305109</td><td></td></tr><tr><td>Nötr tamponlu formalin NBF</td><td>Millipore sigma</td><td>HT501128-4L</td><td></td></tr><tr><td>Azot gazı</td><td>Airgas</td><td>NIUHP300</td><td></td></tr><tr><td>PBS</td><td>Fisher Scientific&nbsp;</td><td>SH30256. FS</td><td></td></tr><tr><td>PCR tüpleri</td><td>MedSupply Ortakları</td><td>62-1091-1</td><td></td></tr><tr><td>PNGase F PRIME -LY ULTRA&nbsp;</td><td>Bulldog Biyografisi</td><td>NZPULT10LY</td><td></td></tr><tr><td>SCiLS Laboratuvarı</td><td>Bruker Daltonics</td><td>1889000</td><td></td></tr><tr><td>Shaker</td><td>Termo Bilimsel</td><td>88882007</td><td></td></tr><tr><td>Slide&nbsp; &nbsp;</td><td>Elektron Mikroskobu Bilimleri</td><td>71873-02</td><td></td></tr><tr><td>Slayt postası</td><td>RPI ürünleri</td><td>212620A</td><td></td></tr><tr><td>Sonikater (Bioruptor Pico)</td><td>Diyagen düğümü</td><td>B01080010</td><td></td></tr><tr><td>Steril Penseps</td><td>DR Enstrümanları</td><td>S08098</td><td></td></tr><tr><td>Steril Sstürpel</td><td>WPI</td><td>WPI-500240</td><td></td></tr><tr><td>Steril Makas</td><td>Güzel Bilim Araçları</td><td>14084-08</td><td></td></tr><tr><td>Şırınge&nbsp; &nbsp;</td><td>Grainger</td><td>19G342</td><td></td></tr><tr><td>Şırınga pompası</td><td>Yeni Dönem</td><td>NE-300</td><td></td></tr><tr><td>Bant</td><td>Fisher Scientific&nbsp;</td><td>15-901-R</td><td></td></tr><tr><td>İnce fırça</td><td>Anezus</td><td>#00</td><td></td></tr><tr><td>Trifluoroasetik asit</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T6508-1L</td><td></td></tr><tr><td>Tune Mix, ESI düşük konsantrasyon.</td><td>Çevik</td><td>G1969-85000</td><td></td></tr><tr><td>Ağırlık tekneleri</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>HS120882</td><td></td></tr><tr><td>Ksilen</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>534056</td><td></td></tr><tr><td>&alpha;-siyano-4-hidroksisinamik asit (CHCA)</td><td>Cayman Kimya Şirketi</td><td>15254</td><td></td></tr></tbody></table>

glycome'in kütle spektrometrisi kullanılarak mekânsal moleküler görüntülemesi

Spatial Molecular Imaging of the Glycome Using Mass Spectrometry

Glycome'in Kütle Spektrometrisi Kullanılarak Mekânsal Moleküler Görüntülemesi

The spatial organization of the glycome within tissues is key to the molecular basis for physiological function. The diverse and dynamic glycome is ...

spatial-molecular-imaging-of-the-glycome-using-mass-spectrometry

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Biyokimya

Bir ekstrasellüler matriks polisakkaritlerin yapısına anlayışlar kazanmak için hızlı bir şekilde açıklanmıştır. Yöntemi dakika miktarda malzeme analiz edilmesi için izin kütle spektrometresi glycosylhydrolases özgüllüğü ve duyarlılığı yararlanır. Bu teknikte doku kendisini doğrudan kullanılmak üzere uyarlanabilir.

Ekstrasellüler polisakkaritler Oligo Kitle Profil (Olimp)

Bağışıklık, organlar ve hücreler içinde glycosphingolipid antijenlerin ekspresyonu profili içgörü kazanmak için bir spesifik ve duyarlı bir yöntem açıklanmıştır. Yöntem, kimyasal olarak sentezlenmiş bir standartlarına göre yapısal analizi için glycosphingolipid moleküllerinin adım adım parçalanma sağlayan iyon tuzak kütle spektrometri avantajına sahiptir.

Glycosphingolipid Antijenler Kütle Spektrometrik Analizi

Bu makale, GC-MS tarafından tespit edilmek üzere glikanların bileşen bağlarına özgü monosakkaritlere kimyasal olarak parçalanması yoluyla fraksiyonlanmamış biyoakışkanlardaki glikanların havuzlanmış bileşim profilini analiz etmek için tasarlanmış yeni bir aşağıdan yukarıya glikomik tekniğinin geliştirilmiş bir biçimini sunmaktadır. Potansiyel uygulamalar arasında kanser ve diğer glikan-afektif bozuklukların erken tespiti yer alır.

Glycan Düğüm Analizi: Glikomik A Aşağıdan yukarı Yaklaşım

Bu kağıt, ECM protein bileşiminin (1) analizi, glikozilasyon yerleri (2) tespit edilmesi ve glıkan formlarının (3) yapısal karakterizasyon için sağlar, MS analizi için kardiyovasküler doku örnekleri hazırlamak için bir yöntem anlatılmaktadır. Bu metodoloji, diğer dokularda ECM'nin çalışma, minör modifikasyonlarla, uygulanabilir.

Hücre dışı Matrix Glycoproteomics: Kütle Spektrometresi kullanarak Sağlam GLİKOPEPTİT Analizi için Bir Yöntem

Numune hazırlama bir roman yöntemi görüntüleme kütle spektrometresi kullanılarak küçük molekül alışverişte algılamak için hücre ve doku coculture karşılamak için geliştirilmiştir.

Doku ve kütle spektrometresi Imaging kullanarak hücreleri arasında küçük molekül iletişim yakalama

Bu protokol, kanserlerin glikobiyolojisini daha iyi anlamak için gerekli olan karmaşık tümör mikro ortamlarındaki heterojen glikoproteom hakkında kapsamlı bilgiler sunan entegre bir omik teknolojisi olan glikomik kılavuzlu glikoproteomik yöntemini detaylandırır.

Glikomik kılavuzluğunda glikoproteomikler, karmaşık tümör mikro ortamlarında glikoproteomun kapsamlı profilini kolaylaştırır 

Burada, müsinlerden O-glikanların salınması ve ardından MALDI-TOF kütle spektrometresi kullanılarak tuzdan arındırma, permetilasyon ve analiz için ayrıntılı bir protokol sunuyoruz.

Matris Destekli Lazer Desorpsiyon/İyonizasyon Uçuş Süresi Kütle Spektrometresi Kullanılarak Permetillenmiş Müsin O-glikanlarının Profillenmesi

Mikroglial hücrelerden saflaştırılmış mitokondrinin hazırlanması, N-glikan salınımı için mitokondriyal proteinlerin izolasyonu ve yüksek çözünürlüklü doğru kütle analizörü kütle spektrometresine bağlı kızılötesi matris destekli lazer desorpsiyon elektrosprey iyonizasyonu kullanılarak hücre altı, mitokondriyal glikanların hızlı tespiti için bir protokol geliştirilmiştir.

Glikan Analizi için Microglia'dan Mitokondriyal Hazırlık

Uyumlu esneklik proteini fonksiyonunda önemli bir rol oynamaktadır. Burada, düzenli ve düzensiz protein işlevi sürücü hızlı yapısal değişiklikleri algılama için hidrojen döteryum değişimi bağlanmış zamana bağımlı elektrosprey iyonizasyon kütle spektrometresi kullanılmasını tarif eder.

Zaman çözülmesi elektro sprey iyonizasyon Hidrojen-döteryum Değişim Kütle Spektrometre Protein Yapısı ve Dinamikleri incelenmesi için

Burada bir etiket bilgilerini kantitatif kütle spektrometresi kullanılarak protein korelasyon profil ardından afinite protein komplekslerinin saflaştırılması ve mavi doğal PAGE ile onların ayrılması için protokoller, mevcut. Bu yöntem, farklı protein kompleksleri halinde interactomes çözmek için yararlıdır.

Mavi Yerli PAGE ve Protein İlişkisi Profil Yöntemi ile Affinity Saf protein Kompleksler çözümleniyor

Keşfedin kütle spektrometrisi görüntüleme ile karaciğer dokularında glikojen ve N-bağlı glikanların mekânsal dağılımını. Bu yöntem, glikobiyoloji araştırmalarında biyolojik işlevleri anlamak için değerli bilgiler sunar.

Glycome'in Kütle Spektrometrisi Kullanılarak Mekânsal Moleküler Görüntülemesi

Daha fazla video keşfet