DOI: 10.3791/69400-v
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Bu protokol, yeni ortaya çıkan geliştirici transkriptleri ölçmek için kolaylaştırılmış bir hesaplama hattı sağlar. Kromatin erişilebilirliğini, kromatin özelliğini ve transkripsiyonel verileri entegre ederek, karmaşık intragenik bölgelerdeki güçlendirici aktivitenin doğru tespitine ve ipliğe özgü analizine olanak tanırken, kapsamlı biyoinformatik eğitimi olmayan araştırmacılar için de erişilebilir olmaya devam eder.
Grubumuz, artırıcı epigenetiği ve epitranskriptomikleri incelerek, artırıcı RNA'ları güçlendirici aktivasyonun göstergeleri olarak niceliklendirmek için doğru yöntem geliştirmeye odaklanmaktadır. İntragenik güçlendiriciler konak transkriptleriyle birlikte olduğundan, güçlendirici DER sinyallerini ayırt etmek ve kesin olarak nicelendirmek zordur. Başlamak için terminali açın ve gerekli dosyaları ve referansları geliştirmek için komutu yazın.
Çalışma dizinine girmek için terminale komutu yazın. Sonra, geliştirici tanımlama bediklerini mevcut dizine kopyalayan komutu çalıştırın. Sonra ilgili komutu çalıştırarak promotor bölgeleri, gen gövdeleri ve protein kodlayan genler için gen kodu notlaması kullanarak BED dosyaları oluşturulur.
08:01
Related Videos
10.9K Views
09:03
Related Videos
12.1K Views
11:25
Related Videos
11.4K Views
09:07
Related Videos
8.7K Views
10:46
Related Videos
9.8K Views
08:30
Related Videos
14K Views
10:02
Related Videos
7.1K Views
09:32
Related Videos
4.6K Views
06:04
Related Videos
1.6K Views
09:14
Related Videos
1.8K Views
