ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol>
	<li>Vogelstein, B., Gillespie, D. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preparative+and+analytical+purification+of+DNA+from+agarose.">Preparative and analytical purification of DNA from agarose.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 76 (2), 615-619 (1979).</li><li>Boom, W. R., Adriaanse, H. M. A., Kievits, T., Lens, P. F. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Process+for+isolating+nucleic+acid.">Process for isolating nucleic acid.</a> US patent. , (1993).</li><li>Guerry, P., LeBlanc, D. J., Falkow, S. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=General+method+for+the+isolation+of+plasmid+deoxyribonucleic+acid.">General method for the isolation of plasmid deoxyribonucleic acid.</a> J Bacteriol. 116 (2), 1064-1066 (1973).</li><li>Borodina, T. A., Lehrach, H., Soldatov, A. V. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=DNA+purification+on+homemade+silica+spin-columns.">DNA purification on homemade silica spin-columns.</a> Anal Biochem. 321 (1), 135-137 (2003).</li><li>Liao, P. C., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+of+mitochondria+from+cells+and+tissues.">Isolation of mitochondria from cells and tissues.</a> Methods Cell Biol. 155, 3-31 (2020).</li><li>Terp, S. K., Pedersen, I. S., Stoico, M. P. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Extraction+of+cell-free+DNA:+evaluation+of+efficiency,+quantity,+and+quality.">Extraction of cell-free DNA: evaluation of efficiency, quantity, and quality.</a> J Mol Diagn. 26 (4), 310-319 (2024).</li><li>Wang, Q., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluation+and+application+of+an+efficient+plant+DNA+extraction+protocol+for+laboratory+and+field+testing.">Evaluation and application of an efficient plant DNA extraction protocol for laboratory and field testing.</a> J Zhejiang Univ Sci B. 22 (2), 99-111 (2021).</li><li>Espy, M. J., Patel, R., Paya, C. V., Smith, T. F. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+three+methods+for+extraction+of+viral+nucleic+acids+from+blood+cultures.">Comparison of three methods for extraction of viral nucleic acids from blood cultures.</a> J Clin Microbiol. 33 (1), 41-44 (1995).</li><li>Pueschel, L., Li, H., Hymes, M. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Streamlined+purification+of+plasmid+DNA+from+prokaryotic+cultures.">Streamlined purification of plasmid DNA from prokaryotic cultures.</a> J Vis Exp. (47), e2407 (2011).</li><li>. QIAvac accessories Available from: <a target="_blank" href="https://www.qiagen.com/us/products/discovery-and-translational-research/lab-essentials/vacuum-manifolds-and-accessories/qiavac-accessories">https://www.qiagen.com/us/products/discovery-and-translational-research/lab-essentials/vacuum-manifolds-and-accessories/qiavac-accessories</a> (2025)</li><li>Clark, P., Greenizen, K. E., Doyle, J. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multifunctional+vacuum+manifold.">Multifunctional vacuum manifold.</a> US patent. , (2009).</li><li>. QIAcube Connect DNA and RNA extraction instrument Available from: <a target="_blank" href="https://www.qiagen.com/us/products/discovery-and-translational-research/dna-rna-purification/instruments-equipment/qiacube-connect">https://www.qiagen.com/us/products/discovery-and-translational-research/dna-rna-purification/instruments-equipment/qiacube-connect</a> (2025)</li><li>. NucleoVac 24 vacuum manifold&#8212;vacuum processing of nucleic acid purification columns Available from: <a target="_blank" href="https://www.takarabio.com/products/nucleic-acid-purification/accessories-and-components/htp-accessories/nucleovac-24-vacuum-manifold">https://www.takarabio.com/products/nucleic-acid-purification/accessories-and-components/htp-accessories/nucleovac-24-vacuum-manifold</a> (2025)</li><li>. QIAquick 96 PCR purification kits Available from: <a target="_blank" href="https://www.qiagen.com/us/products/discovery-and-translational-research/dna-rna-purification/dna-purification/dna-clean-up/qiaquick-96-pcr-purification-kits">https://www.qiagen.com/us/products/discovery-and-translational-research/dna-rna-purification/dna-purification/dna-clean-up/qiaquick-96-pcr-purification-kits</a> (2025)</li></ol>

<table><tbody><tr><td>3D Printer Filament</td><td>NIT, Rusya</td><td>-</td><td>PETG veya PLA önerilir</td></tr><tr><td>Buffer N3</td><td>Qiagen, Hollanda</td><td>19064</td><td></td></tr><tr><td>Buffer P1</td><td>Qiagen, Hollanda</td><td>19051</td><td></td></tr><tr><td>Buffer P2</td><td>Qiagen, Hollanda</td><td>19052</td><td></td></tr><tr><td>Creality Ender-3 S1 Pro</td><td>Creality, Çin</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Elution Buffer</td><td>Qiagen, Hollanda</td><td>19086</td><td></td></tr><tr><td>Eppendorf Santrifüj 5702</td><td>Eppendorf, Almanya</td><td>22626001</td><td>Sabit açılı rotor</td></tr><tr><td>Eppendorf Santrifüj 5804 R</td><td>Eppendorf, Almanya</td><td>22625080</td><td>Salınımlı kova plaka rotoru</td></tr><tr><td>Etidyum Bromür</td><td>Biolabmix, Rusya</td><td>EtBr-10</td><td></td></tr><tr><td>Frit of 1000 &mu;L Filtre Pipet Ucu</td><td>GenFollower, Çin</td><td>E-FTB1000</td><td>Filtre Kolonlarının parçası</td></tr><tr><td>Filtre Engeli Olmayan Miniprep</td><td>JVLAB, Çin</td><td>-</td><td>Filtre Kolonlarının parçası</td></tr><tr><td>Phenol Red</td><td>Lenreactiv, Rusya</td><td>200125</td><td></td></tr><tr><td>PrusaSlicer</td><td>Prusa Research, Çek Cumhuriyeti</td><td></td><td></td></tr><tr><td>QIAprep 2.0 Spin Miniprep Kolonları</td><td>Qiagen, Hollanda</td><td>27115</td><td></td></tr><tr><td>RNase A</td><td>Qiagen, Hollanda</td><td>19101</td><td></td></tr><tr><td>Yıkama Tamponu</td><td>Qiagen, Hollanda</td><td>19065</td><td></td></tr></tbody></table>

24 kuyu rafları kullanarak orta verimlilikli kolon dna çıkarımı

Medium-Throughput Column DNA Extraction Using 24-Well Racks

24 kuyu rafları kullanarak orta verimlilikli kolon DNA çıkarımı

Silica-membrane spin column extraction is the standard for high-quality DNA purification but is labor-intensive and difficult to scale manually beyond ...

Araştırmamız, manuel ve otomatik yöntemler arasında köprü kuran, paralel spin-kolon DNA ve RNA ekstraksiyonu için 3D yazıcıyla üretilmiş raklara odaklanmaktadır. Bu çalışma, 116'ya kadar DNA veya RNA örneğinin eş zamanlı olarak işlenmesine olanak tanıyarak, iş gücü yoğun manuel spin-kolon yöntemlerinin kısıtlamalarını gidermektedir. Başlamak için, rakla yazdırmak amacıyla 0,4 milimetre nozullu bir eritme telli modelleme (FFF) 3D yazıcısı kullanın.%100 doluluk oranına sahip genel polilaktid (PLA), polietilen tereftalat glikol (PETG) veya akrilonitril bütadien stiren (ABS) filament kullanın. Katman yüksekliğini 0,1 milimetre olarak ayarlayın ve yüzey düzeltmeyi etkinleştirin. Su sızdırmazlığını ve mekanik stabiliteyi sağlamak için baskı ayarlarını düzenleyin.Raftları ilk kez kullanmadan önce sızdırmazlık açısından test edin. Kullanım öncesinde testi gerçekleştirmek için basılı rezervuarı %70 ethanol ile doldurun. Sızıntı veya yapısal hasar olmadığını doğrulamak için kademeli olarak artan sürelerde santrifüjleyin.Yapıştırıcı kullanarak yapılan testler başarıyla tamamlandıktan sonra, sızdırmaz bir ünite oluşturmak için taban rezervuar bileşenlerini birbirine birleştirin. Escherichia coli veya E.Coli transformantlarını, uygun antibiyotikler içeren üç ila beş mililitre lizojeni broth veya LB besiyerine inoküle edin. Kültürü, çalkalamalı inkübatörde 37 °C'de 12 ila 16 saat boyunca inkübe edin.Hücreleri toplamak için 2000 G'de 10 dakika boyunca santrifüjleyin. Süpernatantı atın. Pellete 250 microliter yeniden süspansiyon tamponu ekleyin.Ardından, peleti vorteksleyerek veya pipetleyerek tamamen yeniden süspanse edin. 250 µL lizis tamponu ekleyin. Tüpü dört ila altı kez tersyüz ederek veya 24 kuyucuklu plakayı sallayarak nazikçe karıştırın.350 µL nötralizasyon tamponu ekleyin ve karıştırın. Başarılı bir nötralizasyonu onaylamak için beyaz bir çökelek oluşumunu gözlemleyin. Titanyum dioksit tozu içeren bir tüpe lizis tamponu ekleyin.İkiye bir hacim-kütle oranı ekleyin. Lizata 250 µL titanyum dioksit süspansiyonu ekleyin. Tüpü çalkalayarak karıştırın.350 µL nötralizasyon tamponu ekleyin ve iyice karıştırın. 2000 G'de 10 dakika boyunca santrifüjleyin. Titanyum dioksit varlığında hücre peletinin tamamen çöktüğünü ve süpernatanın tamamen şeffaf göründüğünü gözlemleyin.Titanyum dioksit yokluğunda, süpernatantta kalıntı sedimentin varlığını not edin. Çökelmeyi rahatsız etmeden süpernatantı toplayın ve bağlama kolonuna aktarın. DNA bağlama kolonlarını, rafın kolon tutucu katmanına yerleştirin.Santrifüjleme sırasında sabit kalmaları için kolon kapaklarını belirlenmiş yuvalara yerleştirin. Berraklaştırma veya filtre kolonlarını, bağlama kolonlarının hemen üzerindeki filtre kolonu katmanına yerleştirin. Hazırlanan nötralize lizatı filtrasyon kolonlarına aktarın.Birleştirilmiş rafı, sallanan kova plakalı bir rotora yerleştirin. Oda sıcaklığında, 2000 G'de bir dakika boyunca santrifüjleyin. Rafı santrifüjden çıkardıktan sonra, filtre kolon katmanını çıkarın ve atın.Rezervuardan gelen akış sıvısını bir atık kabına boşaltın. Bağlama kolonlarını kullanarak rafı tekrar birleştirin. Her bir bağlama kolonuna 500 ila 700 µL yıkama tamponu ekleyin.2000 G'de bir dakika boyunca santrifüjleyin. Rezervuardaki akış sıvısını atın ve daha önce gösterildiği gibi yıkama adımını tekrarlayın. Bağlama kolonlarını raktan çıkarın ve iki mililitrelik toplama tüplerine aktarın.Membranı kurutmak için 10,000 G veya daha yüksek hızda bir dakika boyunca santrifüjleyin. Kolonları temiz 1.5 mililitrelik tüplere aktarın. Membran üzerine doğrudan 50 mikrolitre elüsyon tamponu veya su ekleyin ve kolonları oda sıcaklığında bir dakika boyunca inkübe edin.DNA'yı elüe etmek için 10, 000 G veya daha yüksek hızda bir dakika boyunca santrifüjleyin. Toplam plazmit verimi, geleneksel yöntem ile raf konfigürasyonları kullanılarak yapılan ekstraksiyon arasında anlamlı bir fark göstermemiştir. Plazmit doğrulaması; relaks, lineerize ve süper kıvrımlı formların benzer dağılımlarıyla korunmuştur.Boya dağılımı, yüklü kolonların hemen altındaki atık alanı ile sınırlı kalmış; bitişik kuyucuklarda veya komşu kolon uçlarında görünür bir sinyal saptanmamıştır; bu durum, raf tasarımının sıçrama ve kolonlar arası transfer olasılığını azalttığını göstermektedir. Amplifikasyon, yalnızca amplikon eklenen kolonlardan elde edilen elüsyonlarda saptanmıştır. Bu partikül, araştırmacıların klonlama, sekanslama ve PCR analizi dahil olmak üzere sonraki uygulamalar için yüksek kaliteli plazmid DNA elde etmelerini sağlar.Bu protokolü uygularken en önemli husus, su sızdırmaz, taşma yapmayan ve 3D yazıcıyla üretilmiş rezervuarlar kullanarak çapraz kontaminasyonu önlemektir. Ek olarak, bu prosedürün ardından söz konusu raflar, kolon tabanlı tüm nükleik asit ekstraksiyon analizleri için kullanılabilir.

medium-throughput-column-dna-extraction-using-24-well-racks

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Biz sezyum klorür yoğunluk gradiyenti santrifüj arıtma için 0.22 mikron Sterivex filtreler, konsantre planktonik biyokütle yüksek molekül ağırlıklı genomik DNA çıkarılması için bir metodu tanımlar.

0.22 mcM Sterivex Filtreler ve Sezyum Klorür Yoğunluk Gradient Santrifüj DNA Ekstraksiyon

Biz hypersaline mikrobiyal paspaslar yüksek molekül ağırlıklı DNA ayıklamak için geliştirilmiş bir protokol sağlar. Mikrobiyal hücrelerin DNA ekstraksiyonu ve saflaştırma mat matris önce ayrılır. Bu konsantrasyonları, kalite ve DNA boyutunu artırır. Bu protokol, diğer refrakter numuneler için kullanılabilir.

Mikrobiyal Paspas Yüksek Moleküler Ağırlıklı DNA çıkarımı

TruTip bir gözenekli, monolitik bağlayıcı bir matris bir pipet sokulur sayede basit bir nükleik asit çıkarma teknolojidir. Sonuç olarak, örnek hazırlama biçimi pek çok sıvı taşıma araçları ile uyumlu ve yüksek verimli klinik uygulama ve örnek tipleri için birçok orta için kullanılabilir.

Ortak Liquid Handling Robotlar TruTip Teknoloji kullanarak Klinik Örneklerden DNA ve RNA yüksek verimlilik, Otomatik Ekstraksiyon

Bu el yazması, yeni nesil dizileme için DNA parçalarını saflaştırmak için otomatik bir jel boyutu seçim yaklaşımını açıklamaktadır. Ranger Teknolojisi, agaroz jel yükleme, elektroforetik analiz ve hedeflenen DNA parçalarının geri kazanılması sürecinin tamamının tam otomasyonunu sağlayarak yüksek verimli ve yüksek kaliteli yeni nesil dizileme kitaplıklarına olanak tanır.

Otomatik Jel Boyut Seçimi Çevre Su Örneklerinden hazırlanmıştır nesil Sıralama Kütüphaneler Kalitesi Geliştirmek için

Bu modifiye çıkarma protokolü histopatolojik doku blokları ilgi daha doğrusu hedef bölgelerden RNA ve DNA verimi artırır.

RNA ve DNA Ekstraksiyon hem Formalin sabit Parafin gömülü Doku Çekirdek hazırlanması

İki bitki organelleri DNA zenginleştirme yönteminin karşılaştırılması ve optimizasyonu sunulmaktadır: geleneksel diferansiyel santrifüjleme ve metilasyon durumuna dayalı toplam gDNA'nın fraksiyonlanması. Ortaya çıkan DNA miktarını ve kalitesini değerlendirir, kısa okunmuş yeni nesil dizilemede performans gösteririz ve uzun okunan tek moleküllü dizilemede kullanım potansiyelini tartışırız.

Yeni nesil Sıralama için Uygun Bitki Organelleri DNA Zenginleştirme Yöntemlerinin Optimizasyonu ve Karşılaştırmalı Analizi

Uzun okunur dizileri büyük ölçüde karmaşık genleri ve yapısal değişim karakterizasyonu montajı kolaylaştırmak. Biz sıralama nanopore tabanlı platformlar tarafından olağanüstü uzun dizileri oluşturmak için bir yöntem açıklanmaktadır. Yaklaşım kilobaz okuma orta kapsama ile yüzlerce insan hücreleri oluşturmak için değiştirilen kitaplığı hazırlıklar ardından en iyi duruma getirilmiş bir DNA ekstraksiyon benimser.

Bütün genomik DNA analizi için olağanüstü uzun okunur sıralama

Bu protokol, akustik damlacık fırlatma teknolojisini kullanarak 384-Well plakasında memelinin hücrelerinin yüksek verim Plasmid transfeksiyonunu açıklar. Zaman alıcı, hataya eğilimli DNA dağıtımı ve çoğullama, aynı zamanda transfeksiyon reaktif dispenpleme, yazılım odaklı ve bir nanodispenser cihaz tarafından gerçekleştirilir. Hücreler daha sonra bu önceden doldurulmuş kuyuların içinde tohumlandı.

Akustik Nanodispensing teknolojisini kullanarak yüksek verim DNA Plasmid multiplexing ve transfeksiyon

Kiaz inhibitörlerinin taranması için kendi kendine biraraya getirilen insan proteinmikrodizilerinin üretimi için ayrıntılı bir protokol sunulmuştur.

Kendi kendine monte Edilen İnsan Protein Mikrodizilerinde Kiaz Inhibitörü Taraması

DNA ekstraksiyonları için 96 kuyulu plakayükleme için mevcut yöntemler kontaminasyona yatkın olabilir. Kuyular arasında çapraz kontaminasyon riskini azaltan 96 kuyulu plakaların yüklenmesi için yeni bir yöntem ayrıntılı olarak inceleniyoruz. Yöntemimiz, diğer araştırmacıların yüksek verimli DNA çıkarma tekniklerinin verimliliğinden yararlanmalarına ve kontaminasyon riskini en aza indirmelerine yardımcı olacaktır.

Yüksek İşlemli DNA Çıkarma Plakalarının Yüklenmesinde Modifiye Yöntemler Kontaminasyon Potansiyelini Azaltır

Bu protokol, insan mantar patojeni Candida albicans'ta nükleaz (CUT&amp;RUN) kullanarak hedefler altında bölünme ve salınım için deneysel bir yöntem ve veri analizi iş akışını açıklamaktadır.

Candida albicans'ta Transkripsiyon Faktörü-DNA Bağlanma Etkileşimlerinin Genom Çapında Profillenmesi: Kapsamlı Bir CUT&amp;RUN Yöntemi ve Veri Analizi İş Akışı

99 Görüntüleme.  Research Institute of Systems Biology and Medicine of Rospotrebnadzor. Araştırmamız, paralel spin-kolon, DNA ve RNA ekstraksiyonu için 3D baskılı raylar üzerinde yoğunlaşıyor ve manuel ile otomatik yöntemler arasında bir köprü kuruyor. Bu parçacık, manuel spin kolon yöntemlerinin emek yoğun sınırlamalarını, 116 DNA veya RNA örneğinin aynı anda işlenmesini sağlayarak aşmaktadır. Başlamak için, rafı baskı için 0,4 milimetre nozullu bir füzyon filamentli 3D yazıcı kullanın.Genel polilaktit veya PLA, polietilen terifatal ...

24 kuyu rafları kullanarak orta verimlilikli kolon DNA çıkarımı

Daha fazla video keşfet