Name: Tahıllarda Bitki-Mikrop Etkileşimi Çalışmaları için Bitki-Mikrop Etkileşim Çalışmaları İçin Bitki Gnotobiyotik Büyüme Sisteminin Montajı ve Kullanımı (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-06-26T13:00:00.000+00:00
Duration: 7 min 47 s
Description: Öğrenin GNOVA gnotobiyotik sisteminin montajını ve kullanımını; buğday ve mısır gibi tahıllarda bitki-mikrop etkileşimlerini uzun süreli çalışmak için gelişmiş koşullar sunar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

<ol><li>Batista, B. D., Singh, B. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Realities+and+hopes+in+the+application+of+microbial+tools+in+agriculture%5BTitle%5D)+AND+%22Microbial+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Realities and hopes in the application of microbial tools in agriculture.</a> Microbial Biotechnology. , (2021).</li>
<li>Parnell, J. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((From+the+Lab+to+the+Farm%3A+An+Industrial+Perspective+of+Plant+Beneficial+Microorganisms%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Plant+Science%22%5BJournal%5D)">From the Lab to the Farm: An Industrial Perspective of Plant Beneficial Microorganisms.</a> Frontiers in Plant Science. , (2016).</li>
<li>Busby, P. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Research+priorities+for+harnessing+plant+microbiomes+in+sustainable+agriculture%5BTitle%5D)+AND+%22PLOS+Biology%22%5BJournal%5D)">Research priorities for harnessing plant microbiomes in sustainable agriculture.</a> PLOS Biology. , (2017).</li>
<li>Compant, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Harnessing+the+plant+microbiome+for+sustainable+crop+production%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Reviews+Microbiology%22%5BJournal%5D)">Harnessing the plant microbiome for sustainable crop production.</a> Nature Reviews Microbiology. , (2025).</li>
<li>Vorholt, J. A., Vogel, C., Carlström, C. I., Müller, D. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Establishing+Causality%3A+Opportunities+of+Synthetic+Communities+for+Plant+Microbiome+Research%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Host+and+Microbe%22%5BJournal%5D)">Establishing Causality: Opportunities of Synthetic Communities for Plant Microbiome Research.</a> Cell Host and Microbe. , (2017).</li>
<li>Liu, Y. X., Qin, Y., Bai, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reductionist+synthetic+community+approaches+in+root+microbiome+research%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Opinion+in+Microbiology%22%5BJournal%5D)">Reductionist synthetic community approaches in root microbiome research.</a> Current Opinion in Microbiology. , (2019).</li>
<li>Basic, M., Bleich, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gnotobiotics%3A+Past%2C+present+and+future%5BTitle%5D)+AND+%22Laboratory+Animals%22%5BJournal%5D)">Gnotobiotics: Past, present and future.</a> Laboratory Animals. , (2019).</li>
<li>Williams, S. C. P. Gnotobiotics. Proceedings of the National Academy of Sciences, , (2014).</li>
<li>Bennett, R. A., Lynch, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bacterial+Growth+and+Development+in+the+Rhizosphere+of+Gnotobiotic+Cereal+Plants%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiology%22%5BJournal%5D)">Bacterial Growth and Development in the Rhizosphere of Gnotobiotic Cereal Plants.</a> Microbiology. , (1981).</li>
<li>Lindberg, T., Granhall, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Acetylene+reduction+in+gnotobiotic+cultures+with+rhizosphere+bacteria+and+wheat%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+and+Soil%22%5BJournal%5D)">Acetylene reduction in gnotobiotic cultures with rhizosphere bacteria and wheat.</a> Plant and Soil. , (1986).</li>
<li>Maplestone, P. A., Campbell, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Colonization+of+roots+of+wheat+seedlings+by+bacilli+proposed+as+biocontrol+agents+against+take-all%5BTitle%5D)+AND+%22Soil+Biology+and+Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Colonization of roots of wheat seedlings by bacilli proposed as biocontrol agents against take-all.</a> Soil Biology and Biochemistry. , (1989).</li>
<li>Simons, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gnotobiotic+System+for+Studying+Rhizosphere+Colonization+by+Plant+Growth-Promoting+Pseudomonas+Bacteria%5BTitle%5D)+AND+%22MPMI%22%5BJournal%5D)">Gnotobiotic System for Studying Rhizosphere Colonization by Plant Growth-Promoting Pseudomonas Bacteria.</a> MPMI. , (1996).</li>
<li>Walley, F. L., Germida, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Response+of+spring+wheat+to+interactions+between+Pseudomonas+species+and+Glomus+clarum+NT4%5BTitle%5D)+AND+%22Biology+and+Fertility+of+Soils%22%5BJournal%5D)">Response of spring wheat to interactions between Pseudomonas species and Glomus clarum NT4.</a> Biology and Fertility of Soils. , (1997).</li>
<li>Ma, K. W., Ordon, J., Schulze-Lefert, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gnotobiotic+Plant+Systems+for+Reconstitution+and+Functional+Studies+of+the+Root+Microbiota%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Protocols%22%5BJournal%5D)">Gnotobiotic Plant Systems for Reconstitution and Functional Studies of the Root Microbiota.</a> Current Protocols. , (2022).</li>
<li>Niu, B., Paulson, J. N., Zheng, X., Kolter, R. Simplified and representative bacterial community of maize roots. Proceedings of the National Academy of Sciences, , (2017).</li>
<li>Hsu, P. C. L., O’Callaghan, M., Condron, L., Hurst, M. R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+a+gnotobiotic+plant+assay+for+assessing+root+colonization+and+mineral+phosphate+solubilization%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+and+Soil%22%5BJournal%5D)">Use of a gnotobiotic plant assay for assessing root colonization and mineral phosphate solubilization.</a> Plant and Soil. , (2018).</li>
<li>McLaughlin, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Versatile+Glass+Jar+System+for+Semihydroponic+Root+Exudate+Profiling%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">A Versatile Glass Jar System for Semihydroponic Root Exudate Profiling.</a> Journal of Visualized Experiments. , (2023).</li>
<li>Miebach, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Litterbox%E2%80%94A+gnotobiotic+Zeolite-Clay+System+to+Investigate+Arabidopsis%E2%80%93Microbe+Interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Microorganisms%22%5BJournal%5D)">Litterbox—A gnotobiotic Zeolite-Clay System to Investigate Arabidopsis–Microbe Interactions.</a> Microorganisms. , (2020).</li>
<li>Salvato, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+Protein+Extraction+Methods+for+Metaproteomic+Analyses+of+Root-Associated+Microbes%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+Plant-Microbe+Interactions%22%5BJournal%5D)">Evaluation of Protein Extraction Methods for Metaproteomic Analyses of Root-Associated Microbes.</a> Molecular Plant-Microbe Interactions. , (2022).</li>
<li>Kawasaki, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+sterile+hydroponic+system+for+characterising+root+exudates%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Methods%22%5BJournal%5D)">A sterile hydroponic system for characterising root exudates.</a> Plant Methods. , (2018).</li>
<li>Kremer, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Peat-based+gnotobiotic+plant+growth+systems+for+Arabidopsis+microbiome+research%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Protocols%22%5BJournal%5D)">Peat-based gnotobiotic plant growth systems for Arabidopsis microbiome research.</a> Nature Protocols. , (2021).</li>
<li>Nezhad, A. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microfluidic+platforms+for+plant+cells+studies%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+on+a+Chip%22%5BJournal%5D)">Microfluidic platforms for plant cells studies.</a> Lab on a Chip. , (2014).</li>
<li>Gao, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ecosystem+Fabrication+protocols+for+plant-microbe+interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Ecosystem Fabrication protocols for plant-microbe interactions.</a> Journal of Visualized Experiments. , (2018).</li>
<li>Gupta, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((EcoFAB+3.0%3A+a+sterile+system+for+studying+sorghum%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Plant+Science%22%5BJournal%5D)">EcoFAB 3.0: a sterile system for studying sorghum.</a> Frontiers in Plant Science. , (2024).</li>
<li>Verma, S. K., et al. Exploring Endophytic Communities of Plants. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aVerma%2C+SK+%22Seed+Endophytes%3A+Biology+and+Biotechnology%22">Seed Endophytes: Biology and Biotechnology</a>. , Springer. Cham. (2019).</li>
<li>Parnell, J. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effective+Seed+Sterilization+Methods+Require+Optimization+Across+Maize+Genotypes%5BTitle%5D)+AND+%22Phytobiomes+Journal%22%5BJournal%5D)">Effective Seed Sterilization Methods Require Optimization Across Maize Genotypes.</a> Phytobiomes Journal. , (2024).</li>
<li>Lee, J., Kim, H. S., Jo, H. Y., Kwon, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Revisiting+soil+bacterial+counting+methods%5BTitle%5D)+AND+%22PLOS+One%22%5BJournal%5D)">Revisiting soil bacterial counting methods.</a> PLOS One. , (2021).</li>
<li>Thomas, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimization+of+single+plate-serial+dilution+spotting+method%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechnology+Reports%22%5BJournal%5D)">Optimization of single plate-serial dilution spotting method.</a> Biotechnology Reports. , (2015).</li>
<li>Munkager, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((AgNO3+Sterilizes+Grains+of+Barley+without+Inhibiting+Germination%5BTitle%5D)+AND+%22Plants%22%5BJournal%5D)">AgNO3 Sterilizes Grains of Barley without Inhibiting Germination.</a> Plants. , (2020).</li>
<li>Wagner, M. R., et al. Microbe-dependent heterosis in maize. Proceedings of the National Academy of Sciences, , (2021).</li>
<li>Poorter, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pot+size+matters%3A+effects+of+rooting+volume+on+plant+growth%5BTitle%5D)+AND+%22Functional+Plant+Biology%22%5BJournal%5D)">Pot size matters: effects of rooting volume on plant growth.</a> Functional Plant Biology. , (2012).</li>
<li>Ferrante, A., Mariani, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Agronomic+management+for+enhancing+plant+tolerance+to+abiotic+stresses%5BTitle%5D)+AND+%22Horticulturae%22%5BJournal%5D)">Agronomic management for enhancing plant tolerance to abiotic stresses.</a> Horticulturae. , (2018).</li>
<li>Vollmer, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effect+of+Gas+Exchange+Rate+and+Vessel+Type+on+plant+growth%5BTitle%5D)+AND+%22Plants%22%5BJournal%5D)">Effect of Gas Exchange Rate and Vessel Type on plant growth.</a> Plants. , (2024).</li>
<li>Cardoso, E. J. B. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Soil+health%3A+suitable+indicators+for+assessment%5BTitle%5D)+AND+%22Scientia+Agricola%22%5BJournal%5D)">Soil health: suitable indicators for assessment.</a> Scientia Agricola. , (2013).</li>
<li>Sinclair, T. R., Ludlow, M. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Influence+of+soil+water+supply+on+plant+water+balance%5BTitle%5D)+AND+%22Australian+Journal+of+Plant+Physiology%22%5BJournal%5D)">Influence of soil water supply on plant water balance.</a> Australian Journal of Plant Physiology. , (1986).</li>
<li>Döll, S., Koller, H., van Dam, N. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protocol+for+collecting+root+exudates+from+soil+grown+plants%5BTitle%5D)+AND+%22Rhizosphere%22%5BJournal%5D)">Protocol for collecting root exudates from soil grown plants.</a> Rhizosphere. , (2024).</li>
<li>Williams, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparing+root+exudate+collection+techniques%5BTitle%5D)+AND+%22Soil+Biology+and+Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Comparing root exudate collection techniques.</a> Soil Biology and Biochemistry. , (2021).</li>
<li>Carlström, C. I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synthetic+microbiota+reveal+priority+effects+and+keystone+strains%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Ecology+and+Evolution%22%5BJournal%5D)">Synthetic microbiota reveal priority effects and keystone strains.</a> Nature Ecology and Evolution. , (2019).</li>
<li>Seethepalli, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((RhizoVision+Explorer%3A+software+for+root+image+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22AoB+Plants%22%5BJournal%5D)">RhizoVision Explorer: software for root image analysis.</a> AoB Plants. , (2021).</li>
<li>Pace, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+maize+seedling+roots+using+ARIA%5BTitle%5D)+AND+%22PLOS+One%22%5BJournal%5D)">Analysis of maize seedling roots using ARIA.</a> PLOS One. , (2014).</li>
<li>Jensen, T. B. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+DNA+extraction+and+metagenome+preparation%5BTitle%5D)+AND+%22PLOS+One%22%5BJournal%5D)">High-throughput DNA extraction and metagenome preparation.</a> PLOS One. , (2024).</li>
<li>Romero-Salas, E. A., Ibarra-Sánchez, C. L. Isolation of Metagenomic DNA from Plant Roots. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aRomero-Salas%2C+EA+%22Plant+Microbiome+Engineering%22">Plant Microbiome Engineering</a>. , Springer. New York. (2025).</li>
<li>Su, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recovery+of+metagenome-assembled+genomes+from+rice+phyllosphere%5BTitle%5D)+AND+%22Scientific+Data%22%5BJournal%5D)">Recovery of metagenome-assembled genomes from rice phyllosphere.</a> Scientific Data. , (2022).</li>
<li>Northen, T. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Community+standards+for+synthetic+communities+in+plant%E2%80%93microbiota+research%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Microbiology%22%5BJournal%5D)">Community standards for synthetic communities in plant–microbiota research.</a> Nature Microbiology. , (2024).</li>
<li>Poursalavati, A., Javaran, V. J., Laforest-Lapointe, I., Fall, M. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Soil+Metatranscriptomics%3A+improved+RNA+extraction+method%5BTitle%5D)+AND+%22Phytobiomes+Journal%22%5BJournal%5D)">Soil Metatranscriptomics: improved RNA extraction method.</a> Phytobiomes Journal. , (2023).</li>
<li>Vannier, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-resolved+metatranscriptomics+reveals+conserved+root+colonization+determinants%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Communications%22%5BJournal%5D)">Genome-resolved metatranscriptomics reveals conserved root colonization determinants.</a> Nature Communications. , (2023).</li>
<li>Zheng, L., et al. Extraction of Proteins from Soil. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aZheng%2C+L+%22Metaproteomics%3A+Methods+and+Protocols%22">Metaproteomics: Methods and Protocols</a>. , Springer. New York. (2024).</li>
<li>Zheng, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparative+physiological+and+proteomic+response+to+phosphate+deficiency%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Proteomics%22%5BJournal%5D)">Comparative physiological and proteomic response to phosphate deficiency.</a> Journal of Proteomics. , (2023).</li>
<li>Rieusset, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cross-metabolomic+approach+in+wheat%E2%80%93Pseudomonas+interaction%5BTitle%5D)+AND+%22Metabolites%22%5BJournal%5D)">Cross-metabolomic approach in wheat–Pseudomonas interaction.</a> Metabolites. , (2021).</li>
<li>Zhang, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metabolite-mediated+responses+of+phyllosphere+microbiota%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiology+Spectrum%22%5BJournal%5D)">Metabolite-mediated responses of phyllosphere microbiota.</a> Microbiology Spectrum. , (2023).</li>
<li>Swenson, T. L., Northen, T. R. Untargeted Soil Metabolomics. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSwenson%2C+TL+%22Microbial+Metabolomics%3A+Methods+and+Protocols%22">Microbial Metabolomics: Methods and Protocols</a>. , Springer. New York. (2019).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Powerconnect cordless drill &amp; 100-Piece Kit</td><td>Black+Decker</td><td>BDC120VA100</td><td>1/4" and 1/8" drill bits needed. </td></tr><tr><td>Vinyl tape, yellow, 1" wide x 36 yards&nbsp;</td><td>3M</td><td>471</td><td>Tüketim malzemesi</td></tr><tr><td>Sterling Rubber bands size #32&nbsp; (2 rubber bands per system)</td><td>Amazon</td><td>B001I1QO00</td><td>Tüketim malzemesi. </td></tr><tr><td>Wheat seed</td><td></td><td></td><td>Bu deneyde kullanılan çeşit: Catawba</td></tr><tr><td>Fiberglass pipe wrap insulation, 3 " widex 1/2 " thick&nbsp; (2 pre-cut circles per system)</td><td>Lowe's</td><td>28930</td><td>2 7/8 " (7.3 cm) çapında daireler halinde kesildi. Tüketim malzemesi. Yüksek verimli üretim için daireleri kesmek için yalıtım örtüsünü yuvarlayın ve çömlek ağzının açık kenarını kullanarak örtü yalıtımının üzerine çömleği yerleştirin, baskı uygulayın ve çevirin. </td></tr><tr><td>DW4 Filter media, Pre-cut to 15" x 75 yards&nbsp; (1 cut circle per system)</td><td>Class Biological Clean, Ltd</td><td>NA</td><td>6.3 " (16.02 cm) çapında daireler halinde kesildi. CBC'nin satın alınabilir alternatif olarak diğer önceden kesilmiş veya standart rulo boyutları vardır.  Tüketim malzemesi. Daire şablonunu kartondan kesin ve DW4 malzemesinin alanı boyunca daireler çizmek için bunu kullanın ve makasla kesin.</td></tr><tr><td>Silicon tubing, Versilon SPX-50 High-strength, 1/8" ID x 1/4" OD x 1/16" wall thickness</td><td>Saint-Gobain</td><td>ABX00007</td><td>İki uzun parçaya ( 16" // 40.64 cm) ve üç kısa parçaya (2.5" // 6.35 cm) kesildi&nbsp;</td></tr><tr><td>Sodium hypoclorite 5% available chlorine in aqueous solution</td><td>VWR</td><td>JT9416-1</td><td>Mısır sterilizasyon protokolü için %2 v/v'ye seyreltin</td></tr><tr><td>Murashige &amp; Skoog medium, micro and macro elements. 25 L</td><td>Research Products International</td><td>M10200-25.0</td><td>0,5x'e seyreltilmiş</td></tr><tr><td>Ethanol, 100%, Deacon Labs</td><td>Fisher scientific</td><td>04-355-451</td><td>95% v/v'ye seyreltin</td></tr><tr><td>Syringe 3 mL, luer lock unsterile&nbsp; (2 per system)</td><td>Fisher scientific</td><td>14-817-117</td><td>Pistonu atın ve sadece varilleri saklayın, cam yünü ile doldurun ve folyo ile kapatın.</td></tr><tr><td>Glass beakers, 250 mL&nbsp;</td><td>VWR</td><td>470191-150</td><td>Buğday tohumunun sterilizasyonu için beş gerekir</td></tr><tr><td>Maize seed</td><td></td><td></td><td>Bu deneyde kullanılan genotip: Mexico 21&ndash;22 B73XMo17</td></tr><tr><td>Aluminum baking tray 18" x 26"&nbsp;</td><td>Amazon</td><td>B01FIK54LQ</td><td>Akış başlığınızın boyutlarına uygun olduğundan emin olun</td></tr><tr><td>Sodium Chloride</td><td>Fisher scientific</td><td>BP358-1</td><td>0,145 M çözelti hazırlayın.</td></tr><tr><td>3D printed base, polylactic acid (PLA) filament used (1 per system)</td><td>Protolabs</td><td>NA</td><td>Baskı ve düzenlenebilir dosyalar ek materyallerde bulunabilir. Dryad.org DOI https://doi.org/10.5061/dryad.f7m0cfzbc adresinde dosyalar mevcuttur. Eğer taban için PLA filament kullanılmışsa, OTOMKLAVLAMAMA YAPMAYIN. PLA, 150 &deg;C'nin üzerinde erişecek ve 60 &deg;C'nin üzerinde deforme olabilir. Tabanın 40 &deg;C'nin üzerindeki sıcaklıklarda kullanılması gerekiyorsa PLA 3D baskı tabanının bütünlüğünün test edilmesi önerilir. PETG (Polietilen Tereftalat Glikol) veya PC (polikarbonat) gibi daha yüksek ısı dayanımına sahip malzemeler kullanılabilir; bu, parçanın maliyetini artıracaktır ve hala otomklavlanan olmayabilir. Prototiplerin 3D baskısı, 256 &times; 256 &times; 256 mm (uzunluk &times; genişlik &times; yükseklik) yapı hacmine sahip bir kişisel yazıcıda gerçekleştirildi. Hız ve maliyet verimliliği için yerel ticari 3D baskı servis sağlayıcılarında toplu baskı yapılmasını öneririz. </td></tr><tr><td>Male luer to hose barb fitting 1/8 " ID, animal derivative-free polypropelene&nbsp; (2 per system)</td><td>Cole-Parmer</td><td>EW-50114-69</td><td>Protokolde 1 numaralı bağlantı olarak geçer</td></tr><tr><td>Male slip luer to hose barb fitting 1/8 " ID, animal derivative-free polyproylene&nbsp; (1 per system)</td><td>Cole-Parmer</td><td>EW-50114-63</td><td>Protokolde 2 numaralı bağlantı olarak geçer</td></tr><tr><td>201 Stainless steel worm gear hose clamps, 1 1/2" -3 1/2" clamping diameter (1 per system)</td><td>Grainger</td><td>5CZF2</td><td>Protokolde hortum kelepçeleri olarak geçer</td></tr><tr><td>Airstream Gen 3 Laminar flow cabinet with simple switch, dimensions 24 1/4" x 47 " x 28 1/4 "&nbsp;</td><td>ESCO Lifesciences</td><td>2120707</td><td>Protokolde laminar akış başlığı olarak geçer. Benzer boyutlara sahip herhangi bir laminar akış başlığı çalışır. Daha küçük akış başlıklarında modifikasyonlar gerekebilir. </td></tr><tr><td>Play sand, Quikrete Premium. 50 lb</td><td>The Home Depot</td><td>1001709466</td><td>Protokolde kum olarak geçer</td></tr><tr><td>304 Stainless steel woven wire, 120 mesh (1 per system)</td><td>Amazon</td><td>B09KRS5F7T</td><td>Makalede paslanmaz çelik tel örgü olarak geçer. 4.7" (11.9 cm) çapında daireler halinde kesildi. Yüksek verimli üretim veya daire üretimi için kartondan daire şablonu kesildi ve bu şablon kull

tahıllarda bitki-mikrop etkileşimi Çalışmaları için bitki-mikrop etkileşim Çalışmaları İçin bitki gnotobiyotik büyüme sisteminin montajı ve kullanımı

Assembly and Use of a Plant Gnotobiotic Growth System for Plant&#8211;Microbe Interaction Studies in Cereals

Tahıllarda Bitki-Mikrop Etkileşimi Çalışmaları için Bitki-Mikrop Etkileşim Çalışmaları İçin Bitki Gnotobiyotik Büyüme Sisteminin Montajı ve Kullanımı

The development of microbial-based agricultural amendments that work consistently in the field requires an understanding of the molecular mechanisms of ...

Araştırmamız, mikroorganizmaların bitki köklerini nasıl kolonize ettiğini ve bitkilerin strese karşı dayanıklılığını nasıl etkilediğini incelemektedir. Bu protokol, geleneksel küçük model bitkilerin ötesine geçerek, çok çeşitli bitki türlerinde bitki-mikrop etkileşimlerini incelemek için uygulanabilir.Başlamak için, deney için hazırlanan saksıları alın ve plastik kapaklarını çıkarın. Saksıya 378 mililitre yarı konsantrasyonlu Murashige and Skoog besiyeri dökün. Kil ve kum substratları için, gözenek boşluğunun %70'ini suyla doldurmak amacıyla sırasıyla 360 ve 350 mililitre kullanın. Steril cımbızlar yardımıyla, sterilize edilmiş tohumları uygun derinliğe dikin. Buğdayı 0,5 inç, mısırı ise 1 inç derinliğe ekin. Plastik kapağı saksının üzerine tekrar kapatın ve ardından saksıyı steril kabinden çıkarın. Alternatif olarak, steril ön çimlendirilmiş fideleri GNOVA'ya ekin. Saksı ve cam silindiri büyüme odasına aktardıktan sonra, cam silindiri alt kısmı aşağı bakacak şekilde saksıya yakın tutun. Sterilizasyon sargısını ve plastik kapağı tutun. Tek bir hareketle plastik kapağı hızla saksıdan, sterilizasyon sargısını ise cam silindirden çıkarın. Cam silindiri üst kısma doğru indirin ve 3D yazıcıyla basılmış tabanın kenarına oturtun. Buğdayı, 12 saatlik fotoperiyot altında, floresan ışıklar altında gündüz 22 °C ve gece 16 °C'de yetiştirin. Mısır için, aynı koşullar altında gündüz 27 °C ve gece 23 °C sıcaklığı koruyun.Şişe üstü dağıtıcıya uzun bir silikon boru parçası takın. Alevi sulama hattının yakınına yerleştirin. Şırınga gövdesini sulama hattından ve filtre tutucudan çıkarın. Tüm boru uçlarını alev bölgesinde tutun. Filtre tutucuyu sulama hattına takın. İki şırınga gövdesini birbirine bağlayın. Ardından, şişe üstü dağıtıcıya bağlı olan uzun boru parçasını filtre tutucunun alt portuna bağlayın. 150 mililitre yarı konsantrasyonlu Murashige ve Skoog besiyeri dağıtın. İki şırınga gövdesini birbirinden ayırın. Silikon boruyu filtre tutucudan ayırın ve filtre tutucuyu sulama hattından sökün. Bunun yerine bir şırınga gövdesi yerleştirin.Sulama verimliliğini artırmak için 50'den fazla örneğin bulunduğu büyük deneylerde %10'luk çamaşır suyu irrigasyon stratejisini kullanın. İki küçük plastik behere hacimce %10'luk çamaşır suyu çözeltisi doldurun. Beherleri sulama hattının yakınına yerleştirin ve şırınga gövdesini sulama hattından çıkarın. Tüp uçlarını, ihtiyaç duyulana kadar %10'luk çamaşır suyu çözeltisinin içinde bekletin. Şırınga gövdesini filtre tutucudan çıkarın. Tüm tüp uçlarını, ihtiyaç duyulana kadar %10'luk çamaşır suyu çözeltisine daldırın. Fazla çamaşır suyu çözeltisini silkeleyerek uzaklaştırın. Filtre tutucuyu saksıların sulama hattına takın. Şişe üstü dağıtıcıya bağlı olan uzun tüp parçasını filtre tutucunun alt portuna bağlayın. 150 milliliters yarı konsantrasyonlu Murashige ve Skoog besiyeri dağıtın. Uzun silikon tüp parçasını filtre tutucunun alt portundan ayırın. Fazla çamaşır suyunu uzaklaştırdıktan sonra, sulama hattındaki filtreyi bir şırınga gövdesiyle değiştirin. Sulama hacmi değişirse, hattı doldurmak (prime) için yaklaşık 20 milliliters besiyeri kullanın.Hasat protokolünü, spesifik araştırma hedefleriyle ve işlenen örnek hacmiyle uyumlu olacak şekilde düzenleyin. Cam silindiri saksıdan çıkarın. Saksıyı hızla laminer akışlı kabine yerleştirin ve 3D baskılı tabandan ayırın. Bitkiyi tabanından tutun ve toprak substratını bir kaba boşaltın. Köklerdeki büyük toprak topaklarını nazikçe temizleyin. Gerekiyorsa, spesifik araştırma amaçları doğrultusunda toprak örnekleri toplayın. Steril makas kullanarak sürgünleri köklerden ayırın. Taze sürgün ağırlığını kaydedin. Kökleri, deiyonize su içeren bir beher içerisinde nazikçe sallayarak temizleyin. Kökleri kurulama kağıdıyla kurulayın. Taze kök ağırlığını kaydedin ve gerekiyorsa, spesifik araştırma amaçlarına göre kök örnekleri toplayın.Buğday ve mısır GNOVA içerisinde %100 çimlenme oranına ulaşırken, torba sisteminde iki hafta sonunda buğday %67, mısır ise %75 çimlenme oranına ulaşmıştır. GNOVA içerisinde yetiştirilen buğday Zadok büyüme evresi 13'e ulaşmışken, torba sisteminde yetiştirilen buğday Zadok büyüme evresi 11'de kalmıştır. 5. haftada, GNOVA'daki buğdaylar kardeşlerin oluşumuyla belirtilen Zadok büyüme evresi 21'e ulaşmış, buna karşılık torba sisteminde kardeşler oluşmamış ve bitkiler Zadok büyüme evresi 13'te kalmıştır. GNOVA'da 12 haftalık büyümeden sonra buğday bitkileri daha klorotik yapraklar sergilemiş ve cam silindir bitki biyokütlesi ile dolmuştur. Buğday bitkileri GNOVA'da iki hafta daha yetiştirildiğinde biyokütlede gözle görülür bir artış olmamıştır. Mısırın büyümesi GNOVA içerisinde dört hafta boyunca değerlendirilmiş ve torbalarda yetiştirilen mısırla karşılaştırılmıştır. GNOVA'da yetiştirilen mısırın taze biyokütlesi, torba sisteminde yetiştirilenle kıyaslandığında %593 oranında artmıştır. GNOVA içerisinde yetiştirilen mısırın sürgün ve kök uzunluğu, torba sisteminde yetiştirilen mısırdan anlamlı derecede daha fazla çıkmıştır.Bu protokol, araştırmacıların kontrollü koşullar altında bitki-mikrop etkileşimlerini incelemelerine ve mikrobiyal efektörler ile bitki tepkileri arasındaki nedenselliği belirlemelerine olanak tanır. Bu protokolün en zorlayıcı yönü, steriliteyi korumak için sulama hatlarının dikkatli bir şekilde yönetilmesidir. Gelecekteki çalışmalar, bitki büyümesini teşvik eden efektörleri tanımlamak ve mikrobiyal topluluk oluşum mekanizmalarını araştırmak için bu sistemi sentetik mikrobiyal topluluklarla birleştirebilir.

assembly-use-plant-gnotobiotic-growth-system-for-plantmicrobe

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Biz giriş, izleme ve bitki hücrelerinde GFP ifade kantitatif analizi için bir yöntem raporu. Bu yöntem, zaman içinde, çok sayıda örneklerin yarı-sürekli bir resim koleksiyonu için özel olarak tasarlanmış bir robotik sistem kullanır. Ayrıca görüntü serisi analizi için ImageJ ve ImageReady kullanımını göstermek.

Bitkisel Dokular Gen İfade Araştırmalar Robotik ve Dinamik Görüntü Analizi

Biz nasıl bir iyon kanalı fonksiyonu tek bir nokta mutasyonu etkisinin araştırılması gösterecektir.

İyon Kanalları ve Fonksiyonel Analiz Mutagenez Heterologously Memeli Hücreleri cinsinden ifade edilir

Clathrin-aracılı endositoz kargo seçimi ve clathrin kat montaj koordine adaptör proteinler bağlıdır. Burada bir model olarak maya endositik adaptör protein Sla1p kullanarak adaptörü clathrin fiziksel etkileşim ve canlı hücre görüntüleme yaklaşımları incelemek için prosedürler açıklanmaktadır.

In vivo ve in vitro Adaptör-clathrin Etkileşim Çalışmaları

Proteinin saflaştırılması işleminde kullanılmak üzere uygun hidrofobik etkileşim kromatografısi (HIC) ortam tanımlanması için otomatik bir yöntem sunulmaktadır. Otomatik bir yöntem tampon karışım, dinamik bir örnek enjeksiyon döngüsü, ardışık sütun seçimi, çoklu dalga boyu analizi, ve iki fraksiyon eluat toplama dahil olmak üzere, orta basınçlı sıvı kromatografisi sistemi kullanır.

Protein Saflaştırma Kullanım için Otomatik Hidrofobik Etkileşim Kromatografisi Sütun Seçimi

Biz predasyon riski artan stres taleplerini karşılamak için diyet değişiklikleri uyararak otobur yırtıcı kimyasal kalitesini değiştirebilir nasıl değerlendirmek için yöntemler sunmak, ve nasıl bu stresli otobur gelen karkasların ayrışma toprak mikroplar tarafından sonradan bitki çöp ayrıştırma yavaşlatır.

Predasyon Risk, Herbivore Fizyolojik Stres ve Bitki Çöp mikrobiyal bozunma Bağlama

Lateral Kök İndüklenebilir Sistemi (LRIS), lateral köklerin senkron indüksiyonuna izin verir ve Arabidopsis thaliana ve mısır için sunulmuştur.

Lateral Kök İndüklenebilir Sistemi<em&gt; Arabidopsis</em&gt; Ve Mısır

Burada, iki orta-den geçerek deneyleri Ca2 +etkileri değerlendirilmesi için-sinyalizasyon ve acrosome tepki insan sperm olarak açıklanmıştır. Bu deneyleri bileşikler üzerinde Ca2 +etkileri için büyük miktarda hızlı ve kolay bir ekran için kullanılabilir-insan sperm sinyal ve acrosome reaksiyon.

Orta-den geçerek deneyleri Ca2 +etkileri değerlendirilmesi için eleme-sinyal ve insan Sperm Acrosome reaksiyon

Bu protokol, hücreleri hareketsiz etmek için aljinat hızlı fiziksel jelleşme tarafından bir hücre kapsülleme yöntemi gösterilmektedir. Elde edilen mikroboncuk zaman içinde amiloid-β kontrollü ve sürekli salgılanmasını sağlar ve salgılanan amiloid-β in vitro ve in vivo modellerde etkilerini incelemek için kullanılabilir.

Alzheimer hastalığının modellenmesi için amiloid-β-salgıcı alginat Mikroboncuk imalatı

Bu protokol, yumurta vakalarını (oothecae) kuluçkadan önce yüzey sterilize ederek gnotobiyotik Amerikan hamamböceği(Periplaneta americana)kurulmasında ve sürdürülmesinde kullanılır. Bu gnotobiyotik böcekler dikey olarak bulaşan Blattabacterium endombiyotlarını içerir, ancak eksenik bağırsaklara sahiptir.

Gnotobiyotik Amerikan Hamamböceklerinin Kurulması ve Bakımı (Periplaneta americana)

Burada, BiFC tabanlı FRET-FLIM test tarafından floresan etiketli proteinler kullanarak üç protein ortağı arasındaki üçlü kompleks oluşumunu görselleştirmek için bir yöntem sunuyoruz. Bu yöntem, protein-proteinetkileşim komplekslerini vivo olarak incelemek için değerlidir.

BiFC-FRET-FLIM Tahlilinde MADS Kutusu Transkripsiyon Faktörünün İki Monomeri ile Kalsiyum Sensör Proteini Arasındaki Üçlü Etkileşimin Belirlenmesi

Öğrenin GNOVA gnotobiyotik sisteminin montajını ve kullanımını; buğday ve mısır gibi tahıllarda bitki-mikrop etkileşimlerini uzun süreli çalışmak için gelişmiş koşullar sunar.

Tahıllarda Bitki-Mikrop Etkileşimi Çalışmaları için Bitki-Mikrop Etkileşim Çalışmaları İçin Bitki Gnotobiyotik Büyüme Sisteminin Montajı ve Kullanımı (Video) | JoVE Journal

Tahıllarda Bitki-Mikrop Etkileşimi Çalışmaları için Bitki-Mikrop Etkileşim Çalışmaları İçin Bitki Gnotobiyotik Büyüme Sisteminin Montajı ve Kullanımı

Daha fazla video keşfet