ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol>
	<li>Wood SH et al. Circadian clock mechanism driving mammalian photoperiodism. Nat Commun. 2020;11:4291.</li>
	<li>Wikelski M et al. Avian circannual clocks: adaptive significance and possible involvement of energy turnover in their proximate control. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2008;363:411-23.</li>
	<li>Wang Q et al. Plants distinguish different photoperiods to independently control seasonal flowering and growth. Science. 2024;383:eadg9196.</li>
	<li>Tan Y, Merrow M, Roenneberg T. Photoperiodism in Neurospora crassa. J Biol Rhythms. 2004;19:135-43.</li>
	<li>Kumar V. Photoperiodism in higher vertebrates: an adaptive strategy in temporal environment. Indian J Exp Biol. 1997;35:427-37.</li>
	<li>Jabbur ML et al. Bacteria can anticipate the seasons: photoperiodism in cyanobacteria. Science. 2024;385:1105-11.</li>
	<li>Ikeno T et al. Photoperiodic diapause under the control of circadian clock genes in an insect. BMC Biol. 2010;8:116.</li>
	<li>Arendt J. Melatonin and the pineal gland: influence on mammalian seasonal and circadian physiology. Rev Reprod. 1998;3:13-22.</li>
	<li>Kronstad JW, Staben C. Mating type in filamentous fungi. Annu Rev Genet. 1997;31:245-76.</li>
	<li>Innocenti FD, Pohl U, Russo VE. Photoinduction of protoperithecia in Neurospora crassa by blue light. Photochem Photobiol. 1983;37:49-51.</li>
	<li>Carrillo AJ et al. Functional profiling of transcription factor genes in Neurospora crassa. G3 (Bethesda). 2017;7:2945-56.</li>
	<li>Belden WJ et al. The band mutation in Neurospora crassa is a dominant allele of ras-1 implicating RAS signaling in circadian output. Genes Dev. 2007;21:1494-05.</li>
	<li>Colot HV et al. A high-throughput gene knockout procedure for Neurospora reveals functions for multiple transcription factors. Proc Natl Acad Sci U S A. 2006;103:10352-7.</li>
	<li>Galagan JE et al. The genome sequence of the filamentous fungus Neurospora crassa. Nature. 2003;422:859-68.</li>
	<li>Perkins DD. How to choose and prepare media. Available from: https://www.fgsc.net/neurosporaprotocols/How%20to%20choose%20and%20prepare%20media.pdf. Accessed April 10, 2026.</li>
	<li>Corrochano LM. Fungal photobiology: a synopsis. IMA Fungus. 2011;2:25-8.</li>
	<li>Corrochano LM. Light in the fungal world: from photoreception to gene transcription and beyond. Annu Rev Genet. 2019;53:149-70.</li>
	<li>Roenneberg T, Merrow M. Seasonality and photoperiodism in fungi. J Biol Rhythms. 2001;16:403-14.</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Agar</td><td>BD</td><td>90000-786</td><td>Sentetik Çapraz Ortam/Minimal Ortam için</td></tr><tr><td>Alcohol burner flame</td><td>Wards</td><td>470346-104</td><td>İnokülasyon döngüsünü sterilize etmek için</td></tr><tr><td>Ammonium iron sulfate hexahydrate</td><td>Supelco</td><td>FX0245-1</td><td>Sentetik Çapraz Ortam/Minimal Ortam için</td></tr><tr><td>Ammonium nitrate (NH4NO3)</td><td>BeanTown Chemical</td><td>BT134170-250G</td><td>Minimal Ortam için</td></tr><tr><td>Autoclave</td><td>VWR International</td><td>76683-456</td><td>Cam eşyaları ve ortamları sterilize etmek için</td></tr><tr><td>Biological Safety Cabinet</td><td>ThermoFischer Scientific&nbsp;</td><td>1323TS</td><td>Plakaların ve laboratuvarın kontaminasyonunu azaltmak için</td></tr><tr><td>Biotin</td><td>VWR</td><td>97061-444</td><td>Sentetik Çapraz Ortam için</td></tr><tr><td>Boric acid (H3BO3)</td><td>Electron Microscopy Sciences</td><td>100503-696</td><td>Sentetik Çapraz Ortam/Minimal Ortam için</td></tr><tr><td>Calcium chloride (CaCl2)</td><td>AVANTOR PERFORMANCE MATERIAL LLC</td><td>JT1311-1</td><td>Sentetik Çapraz Ortam için</td></tr><tr><td>Calcium chloride dihydrate (CaCl2·2H2O)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>223506-25G</td><td>Minimal Ortam için</td></tr><tr><td>Citric acid monohydrate (C6H8O7·H2O)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>1002440500</td><td>Sentetik Çapraz Ortam/Minimal Ortam için</td></tr><tr><td>Copper sulfate pentahydrate (CuSO4·5H2O H2O)</td><td>BeanTown Chemical</td><td>BT121245-1KG</td><td>Sentetik Çapraz Ortam/Minimal Ortam için</td></tr><tr><td>Ethanol</td><td>Decon Labs</td><td>71001-754</td><td>Konidyaları plaka yüzeyinden çıkarmak ve inokülasyon döngüsünü sterilize etmek için kullanılır</td></tr><tr><td>FIJI/ImageJ</td><td>National Institutes of Health (NIH)</td><td>N/A</td><td>Görüntü analizi/sayım için</td></tr><tr><td>Gloves</td><td>SW Safety Solutions</td><td>76382-944</td><td>Güvenlik için</td></tr><tr><td>GraphPad Prism</td><td>GraphPad Software, LLC</td><td>N/A</td><td>İstatistiksel testler yapmak ve şekiller oluşturmak için</td></tr><tr><td>Growth Chamber</td><td>Caron Products & Services</td><td>6320 & 6340 Series</td><td>Fotoperiyot döngüleri için programlanabilir</td></tr><tr><td>HOBO Data Logger</td><td>Onset Computer Corporation</td><td>MX2202</td><td>Işık yoğunluğu ve sıcaklık kaydı için</td></tr><tr><td>Inoculation loop</td><td>VWR International</td><td>10806-354</td><td>Mantar malzemesini petri kabına aktarmk için</td></tr><tr><td>Magnesium sulfate heptahydrate (MgSO4·7H2O)</td><td>BeanTown Chemical</td><td>BT145380-1KG</td><td>Sentetik Çapraz Ortam/Minimal Ortam için</td></tr><tr><td>Manganese sulfate monohydrate (MnSO4·H2O H2O)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>1059410250</td><td>Sentetik Çapraz Ortam/Minimal Ortam için</td></tr><tr><td>Microscope (Leica S6 D Greenough Stereo Microscope)</td><td>Leica Microsystems</td><td>10446297</td><td>Görüntüleme için</td></tr><tr><td>Neurospora crassa FGSC 2489</td><td>Fungal Genetics Stock Center</td><td>74-OR23-1VA, JCM19069</td><td>Mantar suşu</td></tr><tr><td>Paper Towels</td><td>Kimberly-Clark Professional, Scott and Kleenex</td><td>6666114</td><td>Ortam dökmek için</td></tr><tr><td>Permanent Marker</td><td>Sharpie</td><td>30072</td><td>Plakaları etiketlemek için</td></tr><tr><td>Petri Dishes</td><td>VWR International</td><td>25384-164</td><td>Sentetik Çapraz Ortam plakalama için</td></tr><tr><td>Pipettes</td><td>VWR International</td><td>75816-090</td><td>Ortam dökmek için</td></tr><tr><td>Potassium dihydrogen phosphate (KH2PO4)</td><td>BeanTown Chemical</td><td>BT225070-500G</td><td>Sentetik Çapraz Ortam/Minimal Ortam için</td></tr><tr><td>Potassium nitrate (KNO3)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>221295-100G</td><td>Sentetik Çapraz Ortam için</td></tr><tr><td>Small Disposable Glass Test Tubes</td><td>VWR International</td><td>470211-698</td><td>İlk mantar suşu büyümesi için</td></tr><tr><td>Sodium chloride (NaCl)</td><td>VWR International</td><td>BDH9286-500G</td><td>Sentetik Çapraz Ortam için</td></tr><tr><td>Sodium citrate dihydrate (Na3C6H5O7·2H2O)</td><td>VWR</td><td>97061-008</td><td>Minimal Ortam için</td></tr><tr><td>Sodium hydroxide (NaOH)</td><td>AVANTOR PERFORMANCE MATERIAL LLC</td><td>JT5635-2</td><td>Sentetik Çapraz Ortam için</td></tr><tr><td>Sodium molybdate dihydrate (Na2MoO4·2H2O)</td><td>Supelco</td><td>1.06524.1000</td><td>Sentetik Çapraz Ortam/Minimal Ortam için</td></tr><tr><td>Sucrose</td><td>VWR International</td><td>BDH9308-500G</td><td>Sentetik Çapraz Ortam/Minimal Ortam için</td></tr><tr><td>Zinc sulfate heptahydrate (ZnSO4·7H2O)</td><td>BeanTown Chemical</td><td>BT122545-500G</td><td>Sentetik Çapraz Ortam/Minimal Ortam için</td></tr></tbody></table>

protoperithecia gelişimi kullanarak neurospora crassa'da fotoperiyodik yanıtların nicelendirilmesi için plaka tabanlı görüntüleme testi

Plate-Based Imaging Assay for Quantifying Photoperiodic Responses in Neurospora crassa Using Protoperithecia Development

Vahşi tip suşla aşılandıktan sonra, konidyumlar SC yüzeyini 36–48 saat içinde kapladı. 7 gün fotoperiyot maruz kaldıktan sonra, yoğun bir konidial tabaka oluştu ve %70 etanol ile doydurulmuş nemli bir kağıt havluyla çıkarıldı (Şekil 1). Bu adım, altta yatan protoperithecia'ları ortaya çıkardı ama yapılarını bozdu. Mikroskopi altında, protoperithecia, levha yüzeyine dağılmış koyu, dairesel yapılar olarak görülürdü. Bu yapılar küresel bir morfoloji sergiliyor ve çevresindeki hiflerden ayırt ed...

Protoperithecia gelişimi kullanarak neurospora crassa'da fotoperiyodik yanıtların nicelendirilmesi için plaka tabanlı görüntüleme testi

Neurospora crassa is a well-established model organism for studying biological timing and light-regulated development. The Protoperithecia Assay (PPA) is ...

plate-based-imaging-assay-for-quantifying-photoperiodic-responses

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Burada bir biyolüminesens muhabir kullanarak yaklaşım -imaging bir roman Ca 2 + sunuyoruz. Bu yaklaşım, Ca2 + bağlanan ve hafif uyarılması için ihtiyacı ortadan kaldırarak, ışık yayan bir kaynaşık konstrukt GFP Aequorini kullanır. Anlamlı bu yöntem derin beyin yapıları ve yüksek temporal çözünürlük uzun sürekli görüntüleme, erişime izin verir.

Bioluminescent Kalsiyum Göstergesi GFP-aequorin dayanarak Vivo Fonksiyonel Beyin Görüntüleme Yaklaşım

sirkadiyen saat Arabidopsis transcriptome yaklaşık üçte düzenler, ancak timekeeping içine geri besleme genlerin yüzdesi bilinmemektedir. Burada hızla geçici protoplastlar ifade bir sirkadiyen muhabiri Işıklı görüntüleme kullanarak Arabidopsis herhangi mutant doğrultusunda sirkadiyen fenotipleri değerlendirmek için bir yöntem görselleştirmek.

Bir Lüminesans Saat Reporter ile Arabidopsis Protoplasts transfekte içinde Sirkadiyen fenotipleri Hızlı Analizi

C. elegans erkeklerin verimli kalsiyum görüntüleme için bir adapte "koku çip" kullanımı burada açıklanmıştır. Gliserol ve bir feromon erkek maruz çalışmaların da gösterilir.

Yanıt olarak erkek C. Elegans baş nöronlar Feromonlar nöronal aktivite görüntüleme için adapte mikrosıvısal koku kozu kullanımı

Burada, nörogelişme sırasında tek hücreli dinamikleri anlamak için C. elegans embriyoları yaşayan yüksek çözünürlüklü mikroskobik, Hesaplamalı araçlar ve tek hücreli etiketleme kullanarak bir Kombinatoryal yaklaşım sunuyoruz.

İzotropik hafif levha mikroskobu ve otomatik hücre Lineage analizleri kataloğa Caenorhabditis elegans Embriyogenesis Subcellular çözünürlük ile

Hayati floresan boyalar modern mantar hücre biyolojisinde canlı hücre görüntüleme analizleri için gerekli araçlardır. Bu yazıda, filamentöz mantarlarda plazma membran dinamiği, endo-/eksositoz ve hücre duvarı morfogenezinin izlenmesi için kurulmuş ve daha az bilinen floresan boyaların uygulanması ayrıntılı olarak anlatılır.

Filamentöz Mantarların Canlı Hücre Görüntülemesi İçin Membran ve Hücre Duvarı Seçici Floresan Boyaların Uygulanması

Burada, de novo protein sentezini in vivo değerlendirmek için, fotobeyazrlama (FRAP) sonrası nematod Caenorhabditis elegans ve floresan kurtarma kullanan radyoaktif olmayan ve noninvaziv bir yöntem sınıyoruz ve tanımlıyoruz. Bu yöntem, protein sentezinin yeni modülatörlerini belirlemek için genetik ve/veya farmakolojik ekranlar ile kombine edilebilir.

Caenorhabditis elegans de novo Protein Sentez Oranlarının Değerlendirilmesi

Dinamik mikrotübüllerin floresan etiketli Uç bağlayıcı protein kullanılarak vivo olarak görüntülenmesi için bir protokol sunulmuştur. C. elegans'ınPosterior lateral mikrotübül (PLM) nöronunda dinamik mikrotübülleri etiketleme, görüntüleme ve analiz etme yöntemlerini açıkladık.

In vivo Caenorhabditis elegans Nöronlarında Mikrotübül Dinamiklerinin ve Oryantasyonunun Değerlendirilmesi

Filamentli mantar A. nidulanslarının hem batık kültürlerde hem de katı ortamda görüntülerini yakalamak, analiz etmek ve büyüme kinetiğini ölçmek için iletilen ışık mikroskopi tekniklerini kullanarak etiketsiz canlı görüntüleme protokolü sunuyoruz. Bu protokol floresan mikroskopi ile birlikte kullanılabilir.

Canlı Mikroskopi ve Açık Kaynaklı Yazılım Kullanılarak Aspergillus nidulans Büyüme Hızının Nicel Analizi

Bi-stabil fotopigmentleri elektrofizyolojik olarak karakterize etmek için bir protokol sunuyoruz: (i) foton absorpsiyonunu takiben fotopigment molekülleri içindeki yük yer değiştirmelerini ve fotoreseptörlerdeki büyük miktarlarını kullanmak ve (ii) rodopsin ve metarodopsin fotopigment durumlarının emilim-spektrum farklılıklarından yararlanmak. Bu protokoller, bi-stabil fotopigment sistemlerini etkileyen mutasyonları taramak için yararlıdır.

Drosophila Fotoreseptörlerinde Fotopigment Düzeylerini Ölçmek için Elektrofizyolojik Yöntemler

Çoğu yüzme fotoototrofik organizması, foto-kaynaklı davranış değişiklikleri (fotodavranış) gösterir. Mevcut protokol, Chlamydomonas reinhardtii model organizmasında söz konusu fotodavranışı gözlemlemektedir.

Chlamydomonas reinhardtii'de Fotodavranışın Gözlemlenmesi

Burada, Arabidopsis fide de-etiolasyonunun erken aşamalarında klorofil biyosentezinin izlenmesi için tasarlanmış gelişmiş bir aracı açıklıyoruz. Yeni metodoloji, yüksek uzamsal ve zamansal çözünürlükte non-invaziv gerçek zamanlı klorofil floresan görüntüleme sağlar.

Arabidopsis De-etiolasyonunun Erken Aşamalarında Klorofil Biyosentez Kinetiğinin Belirlenmesi için Non-İnvaziv Test

The State University of New Jersey.  Protoperithecia Testi, Neurospora crassa'da fotoperiyodik yanıtları, tanımlanmış ışık-karanlık döngüler altında protoperithecia oluşumunu ölçerek niceliklerini nicelikle değerlendirir. Bu plaka tabanlı yöntem, deneysel koşullar arasında fotoperiyoda bağlı gelişimsel yanıtların karşılaştırılması için basit ve ölçeklenebilir bir yaklaşım sunar.

Protoperithecia gelişimi kullanarak neurospora crassa'da fotoperiyodik yanıtların nicelendirilmesi için plaka tabanlı görüntüleme testi

Daha fazla video keşfet