Name: Caenorhabditis elegansta embriyonik ölümcüllük oranının nicelendirilmesi (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-06-12T15:15:00.000+00:00
Duration: 11 min 35 s
Description: Öğrenin Caenorhabditis elegans'ta embriyonik ölümcüllük oranını ölçmek için düşük maliyetli, ekipman gerektirmeyen bu erişilebilir yöntemi. Genetik ve çevresel faktörlerin gelişimsel kusurlarını güvenilir şekilde değerlendirin.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

<ol>
	<li>Corsi A. K., Wightman B., Chalfie M. A Transparent window into biology: A primer on Caenorhabditis elegans. WormBook Online Rev C Elegans. Biol. 2015; doi/10.1895/wormbook.1.177.1.</li>
	<li>Kwah J. K., Jaramillo-Lambert A. Measuring Embryonic viability and brood size in Caenorhabditis elegans. J Vis Exp. 2023;192:e65064.</li>
	<li>Harlow P. H. et al. The nematode Caenorhabditis elegans. as a tool to predict chemical activity on mammalian development and identify mechanisms influencing toxicological outcome. Sci Rep. 2016;6:22965.</li>
	<li>Wang S. et al. A high-content imaging approach to profile C. elegans. embryonic development. Development. 2019;146(7):dev174029.</li>
	<li>Mendoza A. D., Woodruff T. K., Wignall S. M., O&#8217;Halloran T. V. Zinc availability during germline development impacts embryo viability in Caenorhabditis elegans. Comp Biochem Physiol Toxicol Pharmacol CBP. 2017;191:194&#8211;202.</li>
	<li>Baris Atakan H., Alkanat T., Cornaglia M., Trouillon R., Gijs M. A. M. Automated phenotyping of Caenorhabditis elegans. embryos with a high-throughput-screening microfluidic platform. Microsyst Nanoeng. 2020;6:24.</li>
	<li>Guan G., Zhao Z., Tang C. Delineating the mechanisms and design principles of Caenorhabditis elegans. embryogenesis using in toto high-resolution imaging data and computational modeling. Comput Struct Biotechnol J. 2022;20:5500&#8211;15.</li>
	<li>Zipperlen P., Fraser A. G., Kamath R. S., Martinez-Campos M., Ahringer J. Roles for 147 embryonic lethal genes on C. elegans. chromosome I identified by RNA interference and video microscopy. EMBO J. 2001;20(15):3984&#8211;92.</li>
	<li>Kamath R. S. et al. Systematic functional analysis of the Caenorhabditis elegans. genome using RNAi. Nature. 2003;421(6920):231&#8211;7.</li>
	<li>Bergwell M. et al. A primary microcephaly-associated sas-6 mutation perturbs centrosome duplication, dendrite morphogenesis, and ciliogenesis in Caenorhabditis elegans. Genetics. 2023;224(4):iyad105.</li>
	<li>Stiernagle T. Maintenance of C. elegans. WormBook Online Rev C Elegans. Biol. 2006;1&#8211;1.</li>
	<li>S&#246;nnichsen B. et al. Full-genome RNAi profiling of early embryogenesis in Caenorhabditis elegans. Nature. 2005;434(7032):462&#8211;9.</li>
	<li>Bolker, B. M. Ecological models and data in R. Princeton University Press. Princeton, NJ (2008); ISBN9780691125220.</li>
	<li>Sulston J. E., Schierenberg E., White J. G., Thomson J. N. The embryonic cell lineage of the nematode Caenorhabditis elegans. Dev Biol. 1983;100(1):64&#8211;119.</li>
	<li>Giunti S., Blanco M. G., De Rosa M. J., Rayes D. The ketone body &#946;-hydroxybutyrate ameliorates neurodevelopmental deficits in the GABAergic system of daf-18/PTEN Caenorhabditis elegans. mutants. eLife. 2024;13:RP94520.</li>
	<li>Choi B., Kang J., Park Y. S., Lee J., Cho N. J. A possible role for FRM-1, a C. elegans. FERM family protein, in embryonic development. Mol Cells. 2011;31(5):455&#8211;9.</li>
	<li>Wong A., Boutis P., Hekimi S. Mutations in the clk-1 gene of Caenorhabditis elegans. affect developmental and behavioral timing. Genetics. 1995;139(3):1247&#8211;59.</li>
	<li>Libina N., Berman J. R., Kenyon C. Tissue-specific activities of C. elegans. DAF-16 in the regulation of lifespan. Cell. 2003 Nov;115(4):489&#8211;502.</li>
	<li>Bayer E. A. et al. Insulin signaling and osmotic stress response regulate arousal and developmental progression of C. elegans. at hatching. Genetics. 2022;220(1):iyab202.</li>
	<li>Muschiol D., Schroeder F., Traunspurger W. Life cycle and population growth rate of Caenorhabditis elegans. studied by a new method. BMC Ecol. 2009;9:14.</li>
	<li>Geens E. et al. Yolk-deprived Caenorhabditis elegans. secure brood size at the expense of competitive fitness. Life Sci Alliance. 2023 Jun;6(6):e202201675.</li>
	<li>Ponomarova O. et al. A D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase mutant reveals a critical role for ketone body metabolism in Caenorhabditis elegans. development. PLoS Biol. 2023;21(4):e3002057.</li>
	<li>Ponomarova O. et al. idh-1 neomorphic mutation confers sensitivity to vitamin B12 in Caenorhabditis elegans. Life Sci Alliance. 2024;7(10):e202402924.</li>
	<li>Kamath R. S., Ahringer J. Genome-wide RNAi screening in Caenorhabditis elegans. Methods. 2003;30(4):313&#8211;21.</li>
	<li>Zhou X. et al. Nuclear RNAi contributes to the silencing of off-target genes and repetitive sequences in Caenorhabditis elegans. Genetics. 2014;197(1):121&#8211;32.</li>
	<li>De-Souza E. A. et al. RNA interference may result in unexpected phenotypes in Caenorhabditis elegans. Nucleic Acids Res. 2019;47(8):3957&#8211;69.</li>
	<li>Perez M. F., Francesconi M., Hidalgo-Carcedo C., Lehner B. Maternal age generates phenotypic variation in Caenorhabditis elegans. Nature. 2017;552(7683):106&#8211;9.</li>
	<li>Lanier V. J., White A. M., Faumont S., Lockery S. R. Theory and practice of using cell strainers to sort Caenorhabditis elegans. by size. PloS One. 2023;18(2):e0280999.</li>
	<li>Bai X. et al. Loss of the seipin gene perturbs eggshell formation in Caenorhabditis elegans. Development. 2020;147(20):dev192997.</li>
	<li>Green R. A. et al. Automated profiling of gene function during embryonic development. Cell. 2024;187(12):3141-3160.e23.</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Ampicillin sodium salt</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A9518</td><td></td></tr><tr><td>Bacteriological peptone</td><td>Fischer Scientific</td><td>DF0118-17-0</td><td></td></tr><tr><td>C. elegans N2</td><td>Caenorhabditis Genetics Center</td><td>N2</td><td>wild type</td></tr><tr><td>C. elegans NL2099</td><td>Caenorhabditis Genetics Center</td><td>NL2099</td><td>rrf-3(pk1426) II. RNAi hypersensitive</td></tr><tr><td>Calcium chloride, anhydrous</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>746495</td><td></td></tr><tr><td>Cholesterol</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C3045</td><td></td></tr><tr><td>Conical tubes, 15 mL</td><td>VWR</td><td>60818-725</td><td></td></tr><tr><td>Culture tubes, 14 mL</td><td>VWR</td><td>470150-966</td><td></td></tr><tr><td>Diaphragm vacuum pump</td><td>Amazon</td><td>TC-100</td><td></td></tr><tr><td>Dissecting microscope</td><td>AmScope&nbsp;</td><td>SM-2</td><td></td></tr><tr><td>Escherichia coli HT115</td><td>Caenorhabditis Genetics Center</td><td></td><td>RNAse III-deficient, used for RNAi by feeding experiments</td></tr><tr><td>Escherichia coli OP50</td><td>Caenorhabditis Genetics Center</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Granulated agar</td><td>Fischer Scientific</td><td>BP97445</td><td></td></tr><tr><td>Handheld tally counter</td><td>LabDepot</td><td>HTCP01</td><td></td></tr><tr><td>IPTG, dioxane free (Isopropyl-b-D-thiogalactoside)</td><td>US Biological</td><td>I8500</td><td></td></tr><tr><td>LB Broth (Miller)</td><td>US Biological</td><td>L1520</td><td>LB ortamı yapmak için 25 g LB tozunu 1 L damıtılmış suda çözün. 121.1 &deg;C'de 20 dakika boyunca otoklavlayın.</td></tr><tr><td>Luer Lok disposable syringe</td><td>BH Supplies</td><td>BH20LL</td><td></td></tr><tr><td>Magnesium sulfate</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>M2643</td><td></td></tr><tr><td>Microscopy slides</td><td>Sail Brand</td><td>7101</td><td></td></tr><tr><td>Petri dishes, 100 mm</td><td>Tritech Research</td><td>T3371</td><td></td></tr><tr><td>Petri dishes, 35 mm</td><td>Tritech Research</td><td>T3501</td><td></td></tr><tr><td>Potassium Phosphate Buffer (PPB)</td><td></td><td></td><td>Potasyum fosfat tamponu (1 M) yapmak için 98 g potasyum fosfat monobazik ve 48 g potasyum fosfat dibazik'i 1 L damıtılmış suda çözün. pH'ı 6'ya ayarlayın. 121 &deg;C'de 20 dakika boyunca otoklavlayın.</td></tr><tr><td>Potassium phosphate dibasic</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>795496</td><td></td></tr><tr><td>Potassium phosphate monobasic</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>529568</td><td></td></tr><tr><td>Rocker (nutating mixer)</td><td>Corning LSE</td><td>6720</td><td></td></tr><tr><td>Serological pipettes, 25 mL&nbsp;</td><td>Corning</td><td>4489</td><td></td></tr><tr><td>Serological pipettes, 5 mL&nbsp;</td><td>Celltreat</td><td>229235</td><td></td></tr><tr><td>Shaking incubator Infors Multitron</td><td>INFORS HT</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>Sodium chloride</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S9888</td><td></td></tr><tr><td>Sodium hydroxide solution, 5 N</td><td>Fisher Scientific</td><td>&nbsp;SS256-500</td><td></td></tr><tr><td>Sodium hypochlorite, 5%</td><td>LabDepot</td><td>LC246302</td><td></td></tr><tr><td>Sodium phosphate dibasic</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S9763</td><td></td></tr><tr><td>Sorvall ST1 Plus Centrifuge</td><td>Thermo Scientific</td><td>75016030</td><td></td></tr><tr><td>Stir plate</td><td>&nbsp;ONilab</td><td>ONi28-S</td><td></td></tr><tr><td>Syringe filters</td><td>Semmerfeld</td><td>JQP033022QE1</td><td></td></tr><tr><td>Water bath</td><td>FOUR E's Scientific</td><td>WB401</td><td></td></tr></tbody></table>

caenorhabditis elegans'ta embriyonik ölümcüllük oranının nicelendirilmesi

Quantifying Embryonic Lethality Rate in Caenorhabditis elegans

Caenorhabditis elegans'ta embriyonik ölümcüllük oranının nicelendirilmesi

Embryonic lethality is a cornerstone phenotype used in Caenorhabditis elegans research to characterize developmental defects arising from factors such as ...

Our research focuses on measuring embryonic lethality in Caenorhabditis elegans and determining how strongly a perturbation affects development. This protocol can be applied to assess embryonic lethality caused by genetic mutations, RNAi knockdowns, drug treatment, nutritional supplementation, or environmental perturbations.To begin, gather the required reagents. Prepare 1 liter of nematode growth medium or NGM in a 2-liter bottle. Allow the medium to cool to 55 degrees Celsius in a water bath. After placing the bottle on a stir plate, aseptically add the required reagents. Pour approximately 25 milliliters of medium into each 100-milliliter plate. Inoculate 200 milliliters of LB medium with a single E. coli OP50 colony using a sterile inoculation loop. Place the flask on an orbital shaker at 200 revolutions per minute, and incubate overnight at 37 degrees Celsius. Transfer the E. coli OP50 culture into autoclaved centrifuge bottles. After centrifugation, resuspend the bacterial pellet in 1/20th of the original volume. Seed each 100-millimeter NGM plate with one to 1.5 milliliters of the concentrated culture, and incubate overnight at room temperature to allow the bacteria to grow.

quantifying-embryonic-lethality-rate-in-caenorhabditis-elegans

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

Gelişim Biyolojisi

Bu videoda, C. elegans'ın ömrünü ölçmek için geleneksel, plaka tabanlı bir yöntem açıklanmaktadır. Örnek protokol, RNAi ile tedavi edilen solucanların ömrünü ölçer.

Yaşam Süresi Analizi: C. elegans Uzun Ömürlülüğün Ölçülmesi

C. elegans yumurtlama davranışı, gelişimsel, üreme ve anatomik çalışmalarda önemli bilgiler sağlayabilir. Bu video, bir yumurtlama testinin önemli adımlarını tanıtır ve bir ilacın üreme toksisitesi açısından test edildiği örnek bir deneyi gösterir.

Yumurtlama Deneyi: C. elegans'ın Yumurtlama Davranışını Ölçmek İçin Bir Yöntem

Kaynak: Anderson, Q. L., ve diğerleri. Yüksek verimli, Yüksek içerikli, Sıvı bazlı bir C. elegans Patosystem. J. Vis. Uzm. (2018)Video, genetiği değiştirilmiş C. elegans larvalarının bir mikroplakada patojenik bakterilere maruz bırakıldığı sıvı bazlı bir testi göstermektedir. Ortama salgılanan bakteriyel toksinler, konakçı stresine ve ölümüne neden olur. Bir floresan boya, ölü solucanları boyayarak, genetik duyarlılığı veya direnci değerlendirmek için görüntülemeye dayalı ölüm oranının...

C. elegans Larvalarında Patojenik Bakteri Kaynaklı Mortalitenin Değerlendirilmesi

Bir yumurta-in-solucan (EIW) testi yumurtlama davranışı ölçmek için yararlı bir yöntemdir. Yumurtlama değişiklikler model organizma bir davranış tepki...

Üzerinde Bakterilerin Etkilerinin Ölçme<em&gt; C. Elegans</emBir Yumurta Tutma Testi Kullanma&gt; Davranış

Germ hattı toksisitesini değerlendirmek için kullanılan nematod Caenorhabditis elegans'ta yüksek verimli bir kimyasal testin ayrıntılı adımlarını açıklıyoruz. Bu tahlilde, kimyasal maruziyeti takiben germ hattı fonksiyonunun bozulması, anöploid embriyolara özgü bir floresan raportör kullanılarak izlenir.

Nematod kullanma Germline Kimyasal zehirlilik Kapsamlı Değerlendirme<em&gt; Caenorhabditis elegans</em

Burada, nematod Caenorhabditis elegans'ın embriyonik uzamasının erken ve geç aşamalarında meydana gelen morfojenik kusurları izlemek için özel olarak tasarlanmış protokolleri detaylandırıyoruz. Sonuç olarak, bu protokoller, bu fazları düzenleyen genleri tanımlamak ve embriyonun antero-arka ekseni boyunca diferansiyel gereksinimlerini karakterize etmek için tasarlanmıştır.

Roman Metrik Nematodu Embriyonik Uzama karakterize etmek<em&gt; Caenorhabditis elegans</em

Burada biz yineleme kümesi yöntemi, bir yaklaşım kantitatif ölçmek C. elegans ömrü/hayatta kalma ve healthspan yüksek üretilen iş ve sağlam bir şekilde böylece veri kalite ödün vermeden birçok koşullar tarama izin tanımlamak. Bu iletişim kuralı strateji detayları ve yineleme kümesi veri çözümlemesi için bir yazılım aracı sağlar.

Yineleme kümesi yöntemi: Bir yüksek-den geçerek yaklaşım kantitatif ölçü Caenorhabditis elegans ömrü

Bu çalışma, embriyogenezin 80-100 C.'de eşzamanlı 3Boyutlu hızlandırılmış görüntülemesine olanak tanıyan yarı-yüksek iş letme protokolünü açıklamaktadır. Ayrıca, veri çözümlemesi kolaylaştırmak için görüntü işleme ve görselleştirme araçları dahildir. Bu yöntemlerin özel muhabir suşları ile birleşimi embriyogenezin ayrıntılı olarak izlenmesini sağlar.

C. elegans Embriyonik Gelişimi Analiz Etmek Için Yarı-yüksek-throughput Görüntüleme Yöntemi ve Veri Görselleştirme Araç Seti

Refakatçi-refakatçi ve refakatçi-substrat etkileşimlerini incelemek için, hafif mutasyonlar veya refakatçilerin aşırı ekspresyumu ile birlikte RNA paraziti kullanarak Caenorhabditis elegans'ta sentetik etkileşim ekranları gerçekleştiriyoruz ve dokuya özgü protein disfonksiyonunu organizma düzeyinde izliyoruz.

Dokuya Özgü Chaperone Etkileşimlerini Taramak için Caenorhabditis elegans'ı Kullanma

Burada, C. elegans model organizmasını kullanarak embriyonik canlılığı ve üretilen toplam embriyo sayısını (kuluçka) belirlemek için genel bir yöntem sunuyoruz.

Caenorhabditis elegans'ta embriyonik canlılık ve yavru büyüklüğünün ölçülmesi

Öğrenin Caenorhabditis elegans'ta embriyonik ölümcüllük oranını ölçmek için düşük maliyetli, ekipman gerektirmeyen bu erişilebilir yöntemi. Genetik ve çevresel faktörlerin gelişimsel kusurlarını güvenilir şekilde değerlendirin.

Caenorhabditis elegans'ta embriyonik ölümcüllük oranının nicelendirilmesi

Daha fazla video keşfet