Sinkrotron-X-ray tomografi Sub-mikron Çözünürlük ile Non-invaziv 3D Görselleştirme

Hello.My isim, Tubing Üniversitesi'ndeki Yarasalar Laboratuvarı'ndan Michelle Ov ve bu sunumda, mikron altı çözünürlüğe sahip senkrotron X-ışını tomografisi kullanılarak mikro AHR putlarının iç organizasyonunun invaziv olmayan üç boyutlu görselleştirmesi hakkında konuşmak istiyorum. Üzerinde çalıştığımız model sistem, vücut büyüklüğü 800 mikron ile bir milimetre arasında değişen bir mikro COLYER AHR çıkışı olan yörüngeli akar Aus Long osis'tir. Bu, alglerle beslenen hayvanları görebileceğiniz tüm laboratuvar kültüründen alınmış bir resim.

Argos'un iç organizasyonunu incelemek için, SRF ve Grable'da tomografik VOX verileri üretmek için senkrotron x-ışını radyasyonu kullanıyoruz. Burada büyük saklama halkası ile ESRF'nin bir resmini görüyorsunuz ve sağ üst köşede halkanın dışında bulunan ID 19'un deney salonunu görüyorsunuz Ölçümler için numuneler kritik olarak sağa dönüktü ve süper yapıştırıcı kullanılarak plastik pimlere monte edildi. Deneyler 20.5 KEV'de gerçekleştirildi ve rekonstrüksiyonlar için 1.500 projeksiyon alındı.

Burada ortak çalışan bir CCD çipi, 14 bit dinamik aralık ve dört megapiksel ile kamerayı görüyorsunuz. Bu resmin altında gösterilen simülatör, x-ışınlarını görünür ışığa çevirir. Bu, numune tutucunun ve döndürme tablasının yakın çekimidir.

Numune, numunenin ışın içinde uygun bir şekilde yönlendirilmesini sağlamak için Goya metre kafasına monte edilir. Deney düzeneğinin ayrıntılı bir açıklaması 2007 yılında Journal of Microscopy'deki makalemizde verilmiştir. Bu sunumda, Fiji Studio Max yazılımını kullanarak üç boyutlu görselleştirme ile ilgili veri analizörlerine odaklanacağım.

İlk olarak, örnek bilgileri çıkarmak için gri değerleri arka plandan nasıl kaldıracağınızı göstereceğim. Histogramda, esas olarak arka plandaki gri değerlere ait olan büyük bir tepe görürsünüz. Bu tepe noktasını histogramdan çıkardıktan sonra, örneğin gri küpten çıktığını görebilirsiniz.

Daha sonra, anahtar çerçeveleyici VG stüdyosunu kullanarak nesneyi nasıl döndüreceğinizi göstereceğim. Max'in önceden tanımlanmış bir dizi kamera yörüngesi vardır. Burada dikey X'lerin etrafında dönüş oluşturmak için XY dairesini kullanıyorum ve bu son animasyon.

Hayvanın arka tarafındaki büyük yapı, süper yapıştırıcının yüzeyine karşılık gelir. Şimdi size, numunenin iç organizasyonuna üç boyutlu bir bakış atabilmek için sanal bir kesme düzleminin nasıl ayarlanacağını göstereceğim. Bir kesme düzleminin önden gerçek coşkuyla ayarlanabileceği üç yönelim vardır.

Burada ön düzlemi kullanıyorum ve hayvanın ortasında bir yerde, bu kesme düzleminin statik olması gerekmeyen bir bölgede bir kesme pozisyonu buluyorum. Yine, anahtar çerçeveleyici kullanılarak herhangi bir eksen boyunca hareket ettirilebilir. Bu örnekte, kesme düzlemini numunenin uzunlamasına bir ekseni boyunca hareket ettirmek için önceden ayarlanmış klip Z'yi kullanıyorum ve son animasyon adım adım böyle görünüyor, tüm iç yapıların 3B organizasyonunu yalnızca 0,7 mikronluk bir P çözünürlüğü ile görebilir ve takip edebilirsiniz.

Önceden tanımlanmış kamera yörüngelerinin yanı sıra, kullanıcıya özel kamera yolları oluşturmak da mümkündür. Bunu yapmak için, ücretsiz kamera bakış modunu seçin ve kamerayı ve sanal lensin odak mesafesini istediğiniz herhangi bir konuma ayarlayın. Adım adım, herhangi bir karmaşıklıkta bireysel bir yolu takip etmek için yeni kamera konumları tanımlanabilir.

Sol üstteki 3D pencere, tüm kamera ayarlarının etkisini gerçek zamanlı olarak gösterir. Son örnek, sizi hayvanın tüm sindirim sistemini takip eden sanal bir uçuşa çıkarıyor. Burada gma, kömür ocağı, labrum ve rotella'nın bazı kısımlarını görüyorsunuz.

Yaklaşıyoruz ve hayvanın ağzına giriyoruz. Burada sırt tarafında PHN'leri görebilirsiniz. Şimdi ventriküle girmek için yemek borusundan geçiyoruz.

Perçinlenmiş akarlarımızın iki büyük keri vardır. Bunlar sindirim fonksiyonu olan benzer yapılardır. Doğru seum'a giriyoruz.

Küçük açıklığı sayesinde çok sayıda IDE hücresi görebilirsiniz. Bunlar sindirimde önemli bir rol oynar, ancak tam işlev ve mekanizma henüz tam olarak anlaşılamamıştır. Ventriküllere geri döndüğümüzde, ventriküllerin ve kolonun tam sınırında, bir dakika önce ventriküllere gerçekten girdiğimiz Isal valf olan belirli bir yapı görüyoruz.

Sıkıştırılmış ve atrofik zarla çevrili bir yiyecek boğası görebilirsiniz. Yiyecek bolusunun arkasında bir dışkı paleti görüyorsunuz. Şu anda bu FE paletinde uçuyoruz.

Daha sonra kısa inter kolon'u geçtik ve post kolona girdik. Burada büyük ve karakteristik mikrobiyal olarak görüyorsunuz. Son olarak, burada belirli hayvan plakalarının iç yüzeyini görebilirsiniz, tıpkı bir fe paleti gibi.

Sindirim sisteminden ayrılıyoruz. Şimdi hayvanın dış ventral tarafına kısa bir son bakış atıyoruz ve bir hayvan plakalarını, AAL plakalarını ve genital plakaları görüyoruz.