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C. 埃莱甘斯 运动跟踪:评估蠕虫运动的方法

 
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C. 埃莱甘斯 运动跟踪:评估蠕虫运动的方法

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-评估 C. elegans 的运动请使用相机记录蠕虫 agar上的运动确保在录制过程中甚至照亮 限制蠕虫周围的移动请使用环。 C. elegans 具有反作用因此蠕虫缠绕

几个放在一个板上,同时跟踪每个中的蠕虫允许相同的条件下控制实验动物进行评估减少日常变化,允许并排比较。记录蠕虫设定的时间间隔内的移动使用计算机软件分析机车行为的特征移动速度行驶距离

示例协议我们将看到运动跟踪检测的演示测试酒精蠕虫运动速度的影响

- 首先分钟更短的时间每个实验10只蠕虫转移到适应上的中心这是一个没有乙醇盘子避免蠕虫转移食物因为它减少它们运动。 避免损坏阿加表面因为蠕虫挖洞。 记录加载板上的时间并确保蠕虫转移到每个超过两分钟,以便每个可以在适当的时间间隔内单独拍摄

每个适应温下孵育30分钟。 然后,蠕虫转移到检测板中,按照用于蠕虫放在适应板上的顺序进行。 使用细菌的薄边扁平蠕虫采摘使用铲取运动收集扁平采摘顶部蠕虫然后,实验室密封,以尽量减少乙醇蒸发的损失

- 在这个步骤动物的转移速度非常重要因为转移动物暴露在乙醇中的时间更长。 因此最好先实验复制旋转放置盘子上的菌株

-现在需要一台分辨率摄像机显微镜拍摄蠕虫即使是照明,例如来自三英寸方形背光的照明,对于分析也至关重要然后,为了保持对比度,介质向上。

准备图像分析软件以每秒的速度捕捉 120 、12 位、灰度、延时电影 为了减少输出文件大小同时保留足够的图像分辨率,请使用二乘二的装箱模式。

现在每个盘子录制两分钟的电影,在最后一蠕虫放置盘子10分钟后然后进行第二次两分钟的录制,在蠕虫被放置在板上 30 分钟后。 对于演示,使用 Image-Pro Plus 软件因为各种其他软件可以适应该技术。 电影分析两分钟的片段。

首先过滤器应用于将背景夷为平地的图像增强蠕虫对象对比度菜单下,选择"过程",然后筛选,然后增强,然后平整。设置背景 20 Pix 功能宽度的参数

现在,一个重叠圆形感兴趣区域,分别分析每个动物运动

"跟踪数据表"窗口中,使用"跟踪选项"按钮特定轨道排除在外,并限制任何实验物。自动跟踪选项卡下,轨道参数设置 400 微米的速度限制加速限制设置自动。

最小轨道长度设置 400 微米,并将主要运动类型设置混沌。然后轨道参数下,设置对象使部分轨道的最小长度 21 ,并具有跟踪投影深度

现在,启动跟踪过程,请首先单击"查找所有曲目"自动功能按钮。 这将弹出计数/大小选项对话跟踪对话框。 计数/大小对话选择强度范围选择的手动选项 提供了个重要阈值步骤。 然后调整强度阈值滑块以创建一个突出显示深色对象包容性范围比例尺的良好起点 0 1,500 之间

现在应用大小过滤器排除大于小于蠕虫对象 "测量"菜单,然后选择"测量"菜单。 这将打开计数/大小选项对话框。 在那里,区域范围设置 28,000 120,000 平方微米。 并将周界范围设置 600 2,500 微米。 使用异常大小的蠕虫,对这些参数进行调整

现在,通过单击"继续"在跟踪对话完成跟踪过程仔细检查输出是否与电影素材起跟踪。除非明确的理由过滤否则请确保表示每蠕虫然后,手动删除非蠕虫对象生成曲目

接下来,通过平均之间的距离来计算每个蠕虫的速度并为每个种群轨道创建平均速度

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空值,问题,
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