I Parkinsons sykdom (PD), substantia nigra (SNC) dopaminerge nevroner utarte, som fører til motorisk dysfunksjon. Her rapporterer vi en protokoll for dyrking av ventral midthjernen nerveceller fra en mus som uttrykker EGFP drevet av en tyrosinhydroksylase (TH) promotorsekvens, høsting individuelle fluorescerende nevroner fra kulturer, og måle deres transkriptom bruker RNA-seq.