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Capture promoteur Salut-c : Haute résolution, Genome-wide profilage des Interactions de promoteur
JoVE Journal
Genetics
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JoVE Journal Genetics
Promoter Capture Hi-C: High-resolution, Genome-wide Profiling of Promoter Interactions
DOI:

10:16 min

June 28, 2018

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Chapters

  • 00:04Title
  • 00:52Formaldehyde Fixation
  • 02:14HindIII Digestion and Biotinylation of Restriction Fragment Overhangs
  • 04:09Hybrid In-solution Capture
  • 06:53Isolation of Promoter Fragment-containing Ligation Products
  • 08:55Results: IL8 PCHi-C Profile in Human Hematopoietic Cells
  • 09:34Conclusion

Summary

Automatic Translation

Éléments de régulation de l’ADN, comme améliorateurs, contrôlent l’expression des gènes en contactant physiquement les promoteurs de gènes cibles, souvent par le biais des interactions chromosomiques à longue portée, s’étendant sur grandes distances de génomiques. Promoteur de Capture Hi-C (DAPE-C) identifie des interactions significatives entre les promoteurs et les régions distales, permettant l’attribution des séquences régulatrices potentiels de leurs gènes cibles.

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