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Una piattaforma di spettrometria di massa a scambio idrogeno-deuterio (HDX-MS) per lo studio degli enzimi biosintetici peptidici
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A Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry (HDX-MS) Platform for Investigating Peptide Biosynthetic Enzymes
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Una piattaforma di spettrometria di massa a scambio idrogeno-deuterio (HDX-MS) per lo studio degli enzimi biosintetici peptidici

DOI:
10.3791/61053-v

•

11:32 min

•

May 04, 2020

•

,
1Department of Chemistry,McGill University

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:36Bottom-Up Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS) Reference Sample Workflow Preparation
  • 01:18Reference Data Processing and Peptide List Definition
  • 05:05Hydrogen-Deuterium Exchange (HDX) Reactions
  • 06:36HDX Data Processing, Analysis, and Visualization
  • 09:03Results: Reapresentative HDX-MS Peptide Biosynthetic Enzyme Evaluation
  • 10:44Conclusion

Summary

Automatic Translation

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Le sintetasi lanthipeptide catalizzano reazioni multistep durante la biosintesi dei prodotti naturali peptidici. Qui descriviamo un flusso di lavoro continuo, dal basso verso l'alto, di spettrometria di massa a scambio idrogeno-deuterio (HDX-MS) che può essere utilizzato per studiare la dinamica conformazionale delle sintetasi lantaipeptide, così come altri enzimi simili coinvolti nella biosintesi del prodotto naturale peptidico.

Tags

Keywords: Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry (HDX-MS)Protein Conformational DynamicsProtein Of InterestQuench BufferBottom-up Liquid Chromatography Mass SpectrometryProteomic Software ProgramFASTA FormatElectrospray MSEGlucan One Fiber No Peptide BNonspecific DigestCarbamidomethyl CApex 3DPeptide 3DIon Accounting

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