CRISPR/Cas9 brukes i økende grad til å karakterisere genfunksjonen i ikke-modellorganismer. Denne protokollen beskriver hvordan du genererer knock-out linjer av Culex pipiens, fra å forberede injeksjonsblandinger, til å skaffe og injisere myggembryoer, samt hvordan du kan bake, krysse og skjerminnsprøyte mygg og deres avkom for ønskede mutasjoner.