ويصف هذا البروتوكول الفحص المجهري الفلوري الخفيف والأساليب الآلية بمساعدة البرمجيات لتصور طفيليات المثقبيات والخلايا التائية المنتشرة والنائمة في الأعضاء والأنسجة السليمة والواضحة وتحديدها كميا بدقة. توفر هذه التقنيات طريقة موثوقة لتقييم نتائج العلاج وتقديم رؤى جديدة حول التفاعلات بين الطفيليات والمضيف.