Journal
/
Genetics
/
Uzunluk Ölçekleri Arasında Kromozom Konformasyonunu Yakalama
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Capturing Chromosome Conformation Across Length Scales
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Uzunluk Ölçekleri Arasında Kromozom Konformasyonunu Yakalama

DOI:
10.3791/64001-v

•

10:15 min

•

January 20, 2023

•

, , ,
1Department of Systems Biology,University of Massachusetts Medical School, 2Howard Hughes Medical Institute

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:45Fixation by Crosslinking
  • 03:32Chromosome Conformation Capture
  • 08:22Results: Three‐Dimensional Chromatin Interactions Detection
  • 09:44Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Hi-C 3.0, sinyal-gürültü oranını ve kromatin etkileşimi algılamasının çözünürlüğünü artırmak için formaldehit ve dissüksinimidil glutarat çapraz bağlayıcılarını DpnII ve DdeI kısıtlama enzimlerinin bir kokteyli ile birleştiren geliştirilmiş bir Hi-C protokolüdür.

Tags

Chromosome ConformationDNAChromatinCross-linkingRestriction EndonucleasesLigationLibrary PreparationHi-C3C4C5CSequencingGenomeProtocolDSGFormaldehydeGlycineCell CultureCentrifugationFixation

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Sıvı Kromatografi / Kütle Spektrometresi zehirlidir pufferfish Geliştirilmiş Polimeraz Zincir Reaksiyonu-kısıtlama Parça Uzunluk Polimorfizmi Genotiplemesi

Peptit kaynaklı Yöntem Bitkiler Genler ve Proteinler Hücresel karşısında ve Organel Engeller Transport

Hızlandırılmış radyasyon Biodosimetry tarafından otomatik Disentrik kromozom tanımlama (ADCI) ve doz tahmini

Havuza alınan shRNA MeCP2 reaktivasyonu üzerinde etkin olmayan X kromozomu için ekran

Genom çapında kromatin Conformation yakalama kitaplıklardan sıkıca aşamalı erken Drosophila embriyo nesil

Amplifikasyon tam uzunlukta HIV-1 Proviruses yakınındaki yeni nesil sıralama için

Gen düzenleyici dizileri dairesel kromozom Conformation yeni nesil sıralama kullanarak yüksek üretilen iş tanımlaması yakalama (4C-seq)

Pasif X kromozom üzerinde Mecp2 farmakolojik yeniden aktivasyonu için rasgele olmayan bir fare modeli

Zebrabalığı Spermatositlerinden Meiotik Kromozom Spreadlerinin Hazırlanması

Kantitatif Kromozom Konformasyon Yakalama (4C) ile Embriyoid Cisimlerde Arttırıcı-Organizatör Kontalarının Belirlenmesi

Read Article