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Articles by Catherine Joce in JoVE
JoVE General
ToxRアッセイによって決定される膜貫通ドメインのオリゴマー化の傾向
Department of Chemistry and Biochemistry, University of Colorado at Boulder
一回膜貫通ドメイン（TMDS）のオリゴマー化の傾向を評価するための効率的な手順が説明されています。 ToxRに融合されたTMDからなるキメラタンパク質は、大腸菌のレポーター株に発現されています。 TMD誘発性オリゴマーはToxR、転写およびレポータータンパク質の生産、-ガラクトシダーゼの活性化の二量体化を引き起こす。
Other articles by Catherine Joce on PubMed
Bisindolylmaleimide シクロファン類の形態的な安定性: コンフォーマ最初」7 件安定 Atropisomeric Bisindolylmaleimides するから。
Bisindolylmaleimides は、2 つの制限ジアステレオマ （syn と反） コンホメーションを採用することができます選択的タンパク質キナーゼ阻害剤です。置換の範囲の形態的な安定性と大環状 bisindolylmaleimides の適切な手法を用いて検討しました。制約のない bisindolylmaleimides とサイズ 2-インドリル置換基の形態的な安定性に影響を十分に atropisomeric bisindolylmaleimides を取得する許可がされた.しかし、場所 2 つのインドール窒素原子間のテザーで 2-インドリル置換基の立体効果の形態的な安定性に大きな違いにつながる誇張されました。20 以上規模大環状リング内に制約があった bisindolylmaleimide リング システムの置換を通じて様々 な syn と反コンフォーマの相互変換率。確かに、」7 件安定した atropisomeric bisindolylmaleimides の最初の例が報告されている;これらの化合物の室温での epimerisation の半減期と推定された目 10 (7) 年。
Bioorthogonal タグで安定した S-アデノシルメチオニン (SAM) 類縁体 Derivatised の同定： はエシェリヒア属大腸菌のメチオニン リプレッサー、MetJ、そのオペレーター DNA の親和性に及ぼす配位子の。
安定した SAM ミメティクスの範囲と大腸菌メチオニン リプレッサー (MetJ) そのオペレーター DNA への結合を促進する彼らの能力の効率的な合成を説明します。
タンパク質間相互作用のための選択的阻害剤を識別するためのシリコハイスループットスクリーニングにおける新規のアプリケーション
計算研究のための可能な標的タンパク質の構造の数を増やすと、最初のヒット领域の構造ベースのスクリーニングのパラダイムをより魅力的になります。我々は結合自由エネルギーを評価するために、分子力学（MM）/暗黙的な溶剤のメソッドを取り入れたin silicoスクリーニング手法で小説を開発し、TLR4/MD-2相互作用の阻害剤の同定には、この技術を適用しました。
潜在的膜タンパク質1のホモオリゴマーのインタフェースとバインディングホットスポットを調査するために使用する膜貫通ペプチド
Epstein-Barrウイルス（EBV）、ヒトγ-ヘルペスウイルスは、記憶B細胞を介してホストの適応免疫系を標的とすることで生涯感染が確立されます。通常は良性ですが、EBVは免疫低下個体におけるリンパ系悪性腫瘍とリンパ球増殖症候群に貢献しています。ウイルスの遺伝子産物の潜在的な膜蛋白質1（LMP-1）EBVによるBリンパ球不死化に必須である。 LMP-1の構成的シグナル伝達活性は、6つのスパニング疎水性の膜貫通ドメイン（TMD）のホモオリゴマー形成に依存しています。しかし、LMP-1分子間相互作用を駆動するメカニズムはあまり理解されていない。ここでは、強くLMP-1の第五膜貫通ヘリックス（TM5）膜、D150に埋め込まれた極性残基によってhomotrimeric複雑な媒介を形成する自己関連付け、ことを示している。アラニン、このアスパラギン酸残基の置換は、界面活性剤ミセルと細菌の細胞膜のTM5自己会合を中断します。 D150Aの置換を保有する完全長のLMP-1変異体は、この遺伝子産物によるシグナル伝達の恒常的活性化の5番目の膜貫通ヘリックスの重要な役割をサポートし、NFκBの活性化に欠損している。
マルチToxの：マルチパスタンパク質の膜貫通ドメインのオリゴマー化の研究にToxR転写レポーターアッセイへの応用
ToxRベースの転写レポーターアッセイは、生体膜の膜貫通ヘリックス間相互作用の強度を測定することができます。以前は、これらのアッセイは、1回膜貫通型システムを研究するために使用されています。多面体の膜貫通ドメイン（TMD）オリゴマーの調査を容易にするために、我々は "マルチToxの"与えるために、マルチパスTMDオリゴマー化の研究にToxR手法を適用した。ウイルス腫瘍性タンパク質の結合性向、潜在的な膜タンパク質-1（LMP-1）、大腸菌膜積分ジアシルグリセロールキナーゼ（DAGK）は、特定の機序に重要な残基を強調し、マルチToxのことで検討した。ホモ - およびヘテロoligomerizations両方を検討した。
設計・合成・新規二価 S-アデノシルメチオニン類縁体の in Vitro 評価。
最適の場合は、その蛋白質ターゲットに非常に高い親和性 2価リガンドをバインドできます。ただし、2 つのバインド グループの完全に向き、最適化されたリンカー、設計挑戦、そしてまだ両方フラグメント ベースのリガンド設計と臓器移植酵素阻害剤の発見が重要です。リンカー デザイン、新規 2価のシリーズの私達の理解を促進するため s-アデノシルメチオニン (SAM) 類縁体 MetJ ダイマー二価感覚 (1:1 リガンド/MetJ ダイマー) とのやり取りを目的として設計されました。配位子の範囲だった合成および大腸菌大腸菌メチオニン リプレッサー、MetJ、そのオペレーター DNA への結合を促進する能力の分析を行った。類縁体 SAM 二価演算子の存在下で MetJ ホモ二量体への結合 DNA 蛍光異方性とリンカー長さの影響によって評価し、構造を調べた。識別が最も効果的な二価リガンドは柔軟なリンカーと対応する一価制御化合物の 21 倍低濃度で DNA 蛋白質の相互作用を促進します。
