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Métabolique Pré-conditionnement Des Cellules Cultivées Dans Des Concentrations Physiologiques D'insuline: Résistance à La Génération Des Effets Des Lipides Du Plasma-accumulation Dans Les Hépatocytes

Biotechnology and Bioengineering. Jun, 2002  |  Pubmed ID: 12001167

Comprendre la régulation du métabolisme lipidique des hépatocytes est important pour plusieurs applications biotechnologiques impliquant des cellules du foie. Pendant l'exposition des hépatocytes au plasma, comme c'est le cas dans le foie bioartificiel extracorporel dispositifs d'assistance, il a été rapporté que les fonctions spécifiques hépatique, la synthèse, par exemple, l'albumine et l'urée et l'élimination du diazépam, sont considérablement compromise et les hépatocytes s'accumulent progressivement gouttelettes lipidiques cytoplasmiques. Nous émettons l'hypothèse que la composition du milieu de culture des hépatocytes affecte de manière significative le métabolisme des lipides lors de l'exposition plasmatique ultérieure. Hépatocytes de rat ont été cultivées dans un milieu contenant soit physiologique (50 microU / mL) des niveaux d'insuline ou supra-physiologiques (500 mU / ml) pendant 1 semaine, puis exposé au plasma humain complété avec ou sans acides aminés. Nous avons trouvé des effets anabolisants que l'insuline, tels que la stimulation du stockage des triglycérides, ont été réalisées au cours du conditionnement pré-à la période d'exposition du plasma. Alors que les hépatocytes cultivés en milieu d'insuline élevé accumulé de grandes quantités de triglycérides lors de l'exposition plasmatique subséquente, de la culture dans un milieu d'insuline à faible largement empêché l'accumulation de lipides. L'urée et la sécrétion de l'albumine, ainsi que le taux d'enlèvement d'ammoniaque, étaient largement épargnés par l'insuline, mais a augmenté avec la supplémentation en acides aminés. Ainsi, le métabolisme hépatocytaire lors de l'exposition plasmatique peut être modulée par le milieu de pré-conditionnement et suppléments ajoutés au plasma.

Relation Inverse Entre Six Réponse Semaine Après La Vaccination Contre La Varicelle Anticorps Au Vaccin Contre La Probabilité D'infection Et De Rupture à Long Terme

The Pediatric Infectious Disease Journal. Apr, 2002  |  Pubmed ID: 12075766

Nous avons utilisé la base de données clinique de grande envergure qui a soutenu le développement de la souche Oka / Merck vaccin contre la varicelle pour étudier la relation entre la réponse anticorps primaire contre la varicelle, tel que déterminé par gpELISA, un dosage immuno-enzymatique qui détecte les anticorps au virus varicelle-zona (VZV) glycoprotéine , et le risque ultérieur de la percée après la vaccination contre la varicelle.

Une Comparaison De La Sécurité, La Tolérabilité Et L'immunogénicité De La Souche Oka / Merck Vaccin Contre La Varicelle Et VARILRIX En Santé Des Enfants

Vaccine. Jul, 2002  |  Pubmed ID: 12126906

Cette étude a comparé la sécurité, la tolérabilité et l'immunogénicité du vaccin varicelle Oka / Merck et VARILRIX [Oka-RIT souche SmithKline Beecham Biologicals] chez les enfants en bonne santé 12-24 mois d'âge. Sujets ont été randomisés dans cette étude en double aveugle pour recevoir soit une dose unique de Oka / Merck vaccin contre la varicelle, (environ 50.000 unités formant des plages (UFP), Groupe A ou environ 16.000 UFP, Groupe B) dose ou 1 de VARILRIX, (environ 40.000 UFP / dose, Groupe C). Profils de sécurité dans chaque groupe de traitement étaient similaires. Les proportions de sujets ayant atteint un titre post-vaccination de 6 semaines> ou = 5 unités gpELISA dans les Groupes A, B ou C étaient 97,1, 95,2 et 85,6%, respectivement.

La Vaccination Contre La Rougeole, Les Oreillons Et La Rubéole Et Les Vaccins Contre La Varicelle: Innocuité, La Tolérabilité, L'immunogénicité, La Persistance Des Anticorps Et Durée De La Protection Contre La Varicelle Chez Les Enfants En Bonne Santé

The Pediatric Infectious Disease Journal. Jun, 2002  |  Pubmed ID: 12182381

L'administration du vaccin ROR II (rougeole, les oreillons et vaccin contre la rubéole, en direct) et VARIVAX [virus de la varicelle vaccin vivant (Oka / Merck)] administré en des sites d'injection séparés lors de la visite même bureau pourrait accroître la conformité des vaccins par la réduction du nombre de soins de santé visites pour les vaccinations. Nous avons comparé l'innocuité et l'immunogénicité du vaccin ROR II et VARIVAX administré en des sites distincts (Groupe A) avec l'administration des deux vaccins 6 semaines d'intervalle (groupe B) ainsi que la persistance des anticorps contre la varicelle et la durée de protection conférée par le vaccin contre la varicelle .

Changements Moléculaires Associés à L'acquisition De Oestrogène Hypersensibilité à Cellules MCF-7 Du Cancer Du Sein Sur La Déchéance Oestrogènes à Long Terme

The Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology. Aug, 2002  |  Pubmed ID: 12361723

La dépendance à l'égard de croissance de nombreux cancers du sein sur l'oestrogène a été exploitée par la carence en estrogènes thérapeutique, mais presque tous les patients finissent par développer une résistance en grande partie par des mécanismes inconnus. De type sauvage (WT) cellules MCF-7 ont été cultivées dans l'oestrogène milieu déficient pendant 90 semaines afin d'établir à long terme d'oestrogène-privé MCF-7 (LTÉE) qui est finalement devenue indépendante de l'œstrogène exogène de la croissance. Après 15 semaines de repos (LTÉE-Q), le taux de croissance basale a augmenté en parallèle avec la sensibilité d'œstrogènes augmente. Alors que 10 M (-9) œstradiol (E2) la croissance stimulée au maximum WT, l'hypersensible LTÉE (LTÉE-H) étaient au maximum la croissance stimulée par 10 (-13) M E2. En semaine 50, une hypersensibilité a été apparemment perdu et les cellules sont devenues oestrogène indépendante (LTÉE-I), bien que le pur anti-oestrogène ICI182780 encore inhibé la croissance cellulaire et d'inverser l'effet inhibiteur de 10 (-9) M E2 à 10 (-12) à 10 (-7) M. Le tamoxifène (10 (-7) à 10 (-6) M) a eu un effet agoniste partiel sur le WT, mais n'a eu aucun effet stimulant sur LTÉE. Alors que les cellules LTÉE avoir un récepteur de la progestérone faible (PgR) expression dans toutes les phases, récepteur des oestrogènes (ER) une expression était, en moyenne, élevée de cinq et sept fois plus LTÉE-H et LTÉE-I, respectivement, et a été phosphorylée serine118 . L'expression a été ERbeta régulée à la hausse et les niveaux de insulin receptor substrate 1 (IRS-1) est resté faible pendant toutes les phases. Les niveaux de RIP140mRNA semblait diminuer à environ 50% du message WT dans LTÉE-Q et est restée constante dans la phase hypersensible. Aucun changement significatif n'a été observé dans l'expression de SUG-1, TIF-1 et SMRT dans LTÉE. Les changements globaux dans nucléaires protéines qui interagissent récepteurs ne semblent pas être impliqués dans l'hypersensibilité. Ainsi, la résistance de ces cellules humaines de cancer du sein à l'œstrogène privation semble être due à une hypersensibilité acquise qui pourrait être expliqué en partie par des niveaux accrus de ERalpha et phosphorylée.

Utilisation De Modèles Statistiques Pour L'évaluation De La Réponse Anticorps Comme Un Corrélat De Protection Contre La Varicelle

Statistics in Medicine. Nov, 2002  |  Pubmed ID: 12407681

Dans les essais cliniques de vaccins, les réponses en anticorps humoraux sont souvent utilisés pour mesurer l'effet d'un vaccin parce qu'ils en corrélation avec l'efficacité protectrice d'un vaccin contre la maladie cible. Bien que le concept d'un corrélat de protection se réfère généralement à l'établissement d'un niveau de protection de titre d'anticorps, identification d'une valeur nette est souvent impossible en raison efficacité du vaccin n'est pas liée uniquement à titre d'anticorps. Nous proposons d'examiner la relation entre la protection maladie et l'ensemble de la distribution des réponses d'anticorps plutôt que d'une seule coupure de niveau. En particulier, nous utilisons l'échec-temps des modèles pour estimer la relation entre la maladie percées à long terme et les réponses d'anticorps après la vaccination primaire. Nous appliquons ces modèles pour montrer que la réponse anticorps contre la varicelle mesurée par la glycoprotéine enzyme-linked immunosorbent assay 6 semaines après la vaccination fortement corrélés à la protection contre la varicelle (varicelle); nous avons utilisé de 7 ans de suivi des données des enfants qui ont reçu une dose d'un vivant atténué contre la varicelle (Oka / Merck) le vaccin. En outre, nous explorons la possibilité d'utiliser ces modèles pour prédire à long terme des taux de rupture de la maladie et d'estimer l'efficacité du vaccin prédit d'un vaccin contre la varicelle semblable faite avec un procédé de fabrication modifié.

Analyse De Flux Métabolique Des Hépatocytes Cultivés Exposée Au Plasma

Biotechnology and Bioengineering. Jan, 2003  |  Pubmed ID: 12432579

Le métabolisme hépatique peut être étudiée en utilisant l'analyse des flux métaboliques (MFA), qui fournit un aperçu complet de la distribution du flux métabolique intracellulaire. La caractérisation du métabolisme intermédiaire dans les hépatocytes est important pour toutes les applications biotechnologiques impliquant des cellules du foie, y compris le développement de foie bioartificiel (BAL) des dispositifs. Pendant le fonctionnement BAL, les hépatocytes sont exposés à plasma ou le sang du patient, date à laquelle elles sont sujettes à accumuler des lipides intracellulaires et présentent pauvres du foie fonctions spécifiques. Dans une étude antérieure, nous avons trouvé que le préconditionnement des hépatocytes primaires de rat dans un milieu de culture contenant des concentrations physiologiques d'insuline, par opposition aux niveaux typiques supraphysiologiques trouvés dans les milieux de culture standards hépatocytes, réduit l'accumulation de lipides pendant l'exposition plasmatique ultérieure. En outre, complétant le plasma avec des acides aminés restauré fonctions hepatospecific. Dans l'étude actuelle, nous avons utilisé l'AMF afin de quantifier les changements dans les flux de voie intracellulaire des hépatocytes primaires de rat en réponse à l'insuline à faible préconditionnement et la supplémentation en acides aminés. Nous avons trouvé que les hépatocytes en culture dans un milieu contenant de faibles concentrations physiologiques d'insuline a diminué la clairance du glucose et du glycérol avec une diminution concomitante de la glycolyse. Ces résultats sont cohérents avec l'idée générale que l'insuline faible, surtout dans la présence de niveaux élevés de glucagon, régule à la baisse de la glycolyse en faveur de la néoglucogenèse dans les hépatocytes. Le modèle montre que l'AMF, lors de l'exposition plasmatique ultérieure, faible d'insuline pré-conditionnement de la néoglucogenèse régulés à la hausse, avec du lactate comme le principal précurseur dans le plasma non supplémenté, avec une plus grande contribution de désaminées acides aminés dans le plasma d'acide aminé-complété. Parallèlement, l'insuline à faible préconditionnement augmentation de l'oxydation des acides gras, un effet qui a été renforcée par la supplémentation en acides aminés dans le plasma. L'augmentation de l'oxydation des acides gras a réduit l'accumulation de triglycérides intracellulaires. Dans l'ensemble, ces résultats sont cohérents avec la notion que le niveau d'insuline dans les presets du milieu de culture de la machinerie métabolique des hépatocytes telles qu'il influe directement sur leur comportement métabolique pendant la culture du plasma ultérieure.

La Vaccination Contre La Varicelle Chez Les Enfants Souffrant D'insuffisance Rénale Chronique. Un Rapport Du Groupe Sud-Ouest De Néphrologie Pédiatrique D'étude

Pediatric Nephrology (Berlin, Germany). Jan, 2003  |  Pubmed ID: 12488988

Les enfants atteints de maladie rénale sont à risque de graves complications liées à la varicelle-. Pour évaluer l'innocuité et l'immunogénicité d'un schéma à deux doses de vaccin contre la varicelle chez les enfants (âgés de 1-19 ans) atteints d'insuffisance rénale chronique et la dialyse, le Sud-Ouest Groupe d'étude pédiatrique Néphrologie (SPNSG) a entrepris une étude ouverte-, multi-centre , prospective de 3 ans essai clinique. Quatre-vingt-six patients sans antécédents de varicelle ont été inscrits. Cinquante (âge moyen 4,2 ans) n'avait pas détectable virus varicelle-zona (VZV) antibody; 98% avaient séroconverti après le schéma à deux doses. A 1, 2 et 3 ans de suivi, tous les patients étudiés maintenu anticorps VZV, dont 16 qui ont reçu une greffe. Aucun vaccin importantes associées à des événements indésirables ont été observés. Un sujet développé la varicelle légère (10-50 lésions maculopapuleuses) 16 post-transplantation mois. En analyse de régression multivariée, les patients vaccinés après l'âge de 6 ans avaient des niveaux d'anticorps anti-VZV 73% (95% intervalle de confiance 33% -89%) plus faible que les patients vaccinés avant l'âge de 6 ans après le contrôle pour le sexe, taux estimé de filtration glomérulaire, et un traitement de dialyse. Analyse ajusté a également montré que les taux d'anticorps anti-VZV étaient plus bas après transplantation rénale, mais cela semblait être un phénomène transitoire. Dans cette étude, vaccination contre la varicelle avec un schéma à deux doses de vaccin contre la varicelle a été généralement bien toléré et très immunogène chez les enfants atteints de maladie rénale chronique.

La Vaccination Contre La Varicelle Chez Les Enfants Atteints Du Syndrome Néphrotique: Un Rapport Du Groupe Sud-Ouest De Néphrologie Pédiatrique D'étude

The Journal of Pediatrics. Feb, 2003  |  Pubmed ID: 12584535

Pour évaluer l'innocuité et l'immunogénicité du vaccin contre la varicelle chez les enfants atteints du syndrome néphrotique, y compris ceux qui prennent de faibles doses, autre-jour de prednisone.

Mesure De L'immunité à Médiation Cellulaire Avec Un Virus Varicelle-zona Spécifique Interféron-gamma Test ELISPOT: Réponses Dans Une Population âgée De Réception Une Vaccination De Rappel

Journal of Medical Virology. 2003  |  Pubmed ID: 12627485

Un dosage d'interféron-gamma ELISPOT a été développé pour l'évaluation des réponses immunitaires cellulaires à virus varicelle-zona (VZV) dans de grands essais multicentriques cliniques de vaccins. Nous montrons que le test le plus performant lors des essais des cellules mononucléées du sang périphérique (CMSP) qui avaient été isolés et ensuite congelé le même jour que le sang a été établi, et que PBMC de congélation du sang qui a été stockée pendant la nuit avant de traiter abouti à des réponses radicalement réduits. Cet essai a été utilisé pour surveiller immunité à médiation cellulaire (CMI) en réponse à une vaccination de rappel avec un expérimental vivant, atténué VZV vaccin dans une population âgée qui avait été vacciné 8-10 ans auparavant. Le vaccin de rappel a induit une augmentation de 1,6 à 1,7-fois lieu dans le VZV spécifique la réponse immunitaire cellulaire, telle que mesurée par le test ELISPOT. L'augmentation, avant et après la réponse la vaccination de rappel a été plus prononcée (hausse d'environ 2,2 fois) dans un sous-ensemble de sujets qui avaient reçu deux vaccinations antérieures avec un vaccin vivant atténué.

Application De L'analyse Multivariée Pour Optimiser La Fonction Des Hépatocytes Cultivés

Biotechnology Progress. Mar-Apr, 2003  |  Pubmed ID: 12675604

Comprendre les voies métaboliques et de régulation des hépatocytes est important pour des applications biotechnologiques impliquant des cellules du foie, y compris le développement de la bio-artificiels du foie (BAL) des dispositifs. Pour caractériser le métabolisme intermédiaire dans les hépatocytes, l'analyse des flux métaboliques (MFA) a été appliqué à élucider les changements dans les flux de voie intracellulaire de hépatocytes primaires de rat exposées au plasma humain et de fournir un aperçu complet du profil métabolique hépatique. Dans l'étude actuelle, la combinaison de préconditionnement et la supplémentation en plasma produit distincts états métaboliques. La combinaison de la distribution du flux métabolique obtenu par l'AMF avec des méthodologies telles que l'analyse discriminante de Fisher (FDA) et des moindres carrés partiels ou de projection de structures latentes (PLS) a fourni des indications sur la structure sous-jacente et de la relation de cause à effet dans les données. Avec l'aide de ces analyses, les modèles dans la réponse cellulaire des hépatocytes qui ont contribué à la séparation des états hépatiques différents ont été identifiés. Un intérêt particulier a été la reconnaissance des voies distales que fortement corrélés avec une fonction hépatique en particulier. Les fonctions hépatiques étudiés étaient accumulation de triglycérides intracellulaire et la production d'urée. Cette étude illustre un cadre pour l'optimisation de la fonction hépatique et une possibilité d'identifier des cibles potentielles pour l'amélioration des fonctions hépatiques.

Analyse Des Flux Métaboliques De La Fonction Hépatocytaire De L'hormone De-et Amino-acide Complété Plasma

Metabolic Engineering. Jan, 2003  |  Pubmed ID: 12749840

Comprendre les voies métaboliques et de régulation des hépatocytes est important pour des applications biotechnologiques impliquant des cellules du foie. Les tentatives précédentes pour la culture des hépatocytes dans le plasma donné de mauvais résultats fonctionnels. Récemment, nous avons signalé cette hormone (l'insuline et hydrocortisone) et supplémentation en acides aminés réduit l'accumulation des lipides intracellulaires et restaure le foie fonction spécifique dans les hépatocytes exposés au plasma humain hépariné. Dans l'étude actuelle, nous avons effectué une analyse des flux métaboliques (MFA) en utilisant un modèle de réseau simplifiée métabolique des hépatocytes cultivés à quantitativement évaluer les changements dans le métabolisme des lipides et des voies de signalisation intracellulaires pertinentes en réponse à l'hormone de et la supplémentation en acides aminés. Le modèle représente la majorité du carbone central et métabolisme de l'azote, et assume pseudo-état stable sans cycles métaboliques futiles. Nous avons constaté que les flux du cycle de bêta-oxydation et de l'acide tricarboxylique (TCA) ont été régulés à la hausse à la fois par l'hormone et la supplémentation en acides aminés, améliorant ainsi le taux d'oxydation des lipides. Parallèlement, l'hormone et supplémentation en acides aminés a augmenté les flux de la néoglucogenèse. Ceci, combiné avec une augmentation du taux de clairance du glucose, a provoqué une augmentation de la synthèse du glycogène prédit. Synthèse de l'urée a été principalement tirés à partir d'ammoniac et de l'aspartate générée par des réactions de transamination, tandis que l'élimination d'ammoniac exogène ne représentaient que 3-6% de l'azote d'urée. Supplémentation en acides aminés a augmenté la synthèse endogène de l'oxaloacétate, et à son tour celle de l'aspartate, un substrat nécessaire à la cycle de l'urée. Ces conclusions de l'AMF fournir des indices quant à quels gènes et voies pertinentes pour l'oxydation des acides gras, la production d'urée, et de la néoglucogenèse peut être augmentée par la supplémentation en plasma, et sont compatibles avec les connaissances actuelles sur le métabolisme des acides aminés hépatique, qui fournit plus de crédibilité à cette approche pour l'évaluation de l'état métabolique des hépatocytes dans diverses conditions environnementales.

Extraction Directe Des Génomes De L'homme à Partir De Poliovirus Sabin échantillons Fécaux Aide D'une Méthode D'extraction De Guanidine Thiocyanate

Journal of Virological Methods. Jun, 2003  |  Pubmed ID: 12798248

Pour permettre la détection rapide et efficace des poliovirus de type Sabin 3 à partir de l'homme des échantillons fécaux, nous avons développé un thiocyanate de guanidine (GuSCN) extraction et inverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR). En utilisant 10 dilutions de stock-Sabin Leon 12 Type de poliovirus a1b 3 à 10 (7) TCID (50) par 0,1 ml, génome a été détecté à une dilution de 10 (3) TCID (50) pour 0,1 ml. Un total de 40 archivés échantillons fécaux ont été examinés à l'aide de cette méthode d'extraction GuSCN suivie par RT-PCR. Quatorze de 20 poliovirus de type 3 de culture de tissu échantillons positifs (70%) et deux de 20 échantillons de tissus culture négative (10%) ont été détectés par GuSCN extraction et RT-PCR. Tous les contrôles positifs et négatifs d'extraction et de RT-PCR ont été identifiés avec précision. Cette extraction GuSCN et RT-PCR technique est rapide, peu coûteuse et peut être facilement adaptée pour identifier les séquences génomiques de types d'entérovirus dans d'autres grands nombres d'échantillons fécaux. En outre, la technique de l'ARN viral extrait GuSCN directement à partir d'échantillons fécaux, permettant l'observation des modifications dans les séquences génomiques in vivo de. D'autres études sont en cours pour examiner l'évolution de mutations ponctuelles dans le révertantes poliovirus Sabin de type 3 génome après l'administration orale du vaccin Sabin du poliovirus oral trivalent pour les humains.

Enlèvement Splinter

American Family Physician. Jun, 2003  |  Pubmed ID: 12825845

Splinter blessures sont monnaie courante, mais des éclats vastes et plus profondes sont souvent difficiles et douloureux de retirer à la maison. Ces éclats se présentent souvent comme un corps étranger incorporé dans les tissus superficiels ou sous-cutanée mous. Chaque fois que possible, les objets réactifs tels que le bois, des épines, des épines, et le matériel végétal doit être enlevé immédiatement, avant que l'inflammation ou l'infection se produit. Superficielles éclats horizontaux sont généralement visibles sur inspection, ou facilement palpée. Un éclat horizontale est exposée complètement par incision de la peau sur la longueur de l'axe long de la paille, et retiré en le soulevant à la pince. Un éclat sous-unguéale peut être retiré en découpant un morceau en forme de V de l'ongle. La pointe du V est à l'extrémité proximale de l'éclat, qui est saisi et retiré, prenant un soin particulier à ne pas pousser l'écharde plus loin dans le lit de l'ongle. Retrait d'un dissident insaisissable peut être difficile et peut nécessiter l'utilisation de modalités d'imagerie pour une meilleure localisation. Deeper éclats, en particulier ceux à proximité de structures importantes telles que les nerfs, les tendons, les vaisseaux sanguins ou des organes vitaux, devrait être renvoyé pour enlèvement.

Baisse De La Varicelle-zona (VZV) Spécifique Immunité à Médiation Cellulaire Augmente Avec L'âge Et Rappel Avec Un Vaccin à Dose élevée VZV

The Journal of Infectious Diseases. Nov, 2003  |  Pubmed ID: 14593591

L'innocuité et l'immunogénicité d'une dose de rappel du vaccin vivant atténué contre la varicelle-zona (VZV) vaccin a été évalué chez 196 sujets sains,> ou = 60 ans, qui avait déjà reçu un vaccin VZV> 5 ans auparavant. Cette dose de rappel de répétition a été bien toléré. Immunité à médiation cellulaire (CMI) à VZV a été mesurée par un interféron-gamma (IFN-gamma) immuno-enzymatique place de formation cellulaire (ELISPOT) de dosage et une fréquence de dilution limite de cellules répondeur (RCF) dosage. Réponses avant la vaccination a diminué en fonction de l'âge augmente, mais étaient détectables dans tous les sujets par l'utilisation du test ELISPOT IFN-gamma. Dans la plupart des sujets, spécifique anti-VVZ CMI a été augmenté à 6 semaines après la vaccination. L'ampleur de la induite par le vaccin de l'IFN-gamma réponse ELISPOT était inversement liée à des valeurs qu'avant la vaccination. Bien qu'il y ait une corrélation significative entre l'ELISPOT IFN-gamma et des dosages de FCR, le test ELISPOT eu une plus grande sensibilité et une plage dynamique plus large. Un vaccin vivant atténué VZV est sûr et immunogène chez une population âgée, et l'immunité induite par le vaccin peut être contrôlé par le dosage de l'IFN-gamma ELISPOT.

La Déduction Chemins Et Les Réseaux Avec Un Cadre Bayésien

FASEB Journal : Official Publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology. Apr, 2004  |  Pubmed ID: 14766801

De nombreuses méthodes mathématiques ont été adaptées et développées pour inverser quantitativement réseaux ingénieur biologiques, par exemple, les voies de transduction du signal, à partir de micro-array expérimentales données. Par rapport aux méthodes stochastiques, tels que les réseaux booléens, et les méthodes déterministes, comme thermodynamique ou équation différentielle à base de modèles, l'analyse de réseau bayésien a la capacité d'évaluer, avec les paramètres de notation, les relations causales basées sur les probabilités conditionnelles et permettre ainsi des tests d'hypothèses. Le but de cet article est d'illustrer l'intégration de plusieurs techniques basées sur bayésiens dans un cadre bayésien unifié qui peut déduire les réseaux hépatocellulaires à partir des données métaboliques. La rétro-ingénierie des voies et des réseaux fournit un cadre pour la modélisation prédictive et tester des hypothèses à approfondir la connaissance dans les organismes vivants, les mécanismes de la maladie, et des thérapies ciblées. L'évaluation de cette méthode d'abord contre le réseau connu biochimique donne confiance dans les réseaux qui sont découverts à partir des données expérimentales en utilisant ce cadre. A partir des données métaboliques nous avons déduit le connu des sous-réseaux, tels que l'acide tricarboxylique (TCA) et les cycles de l'urée. En outre, nous avons combiné les relations tirées des données et nos connaissances actuelles sur le système biologique de postuler plusieurs alternatives métaboliques sous-réseau modèles qui peuvent prédire une fonction cellulaire particulière, tels que l'accumulation des triglycérides intracellulaires.

Modélisation Inverse En Utilisant Multi-bloc PLS Pour Déterminer Les Conditions Environnementales Qui Offrir Un Niveau Optimal La Fonction Cellulaire

Bioinformatics (Oxford, England). Mar, 2004  |  Pubmed ID: 14990444

MOTIVATIONS: Le génie tissulaire constitue un domaine important avec son potentiel de remédier à la pénurie actuelle dans la disponibilité des organes. Pour développer avec succès de l'ingénierie tissulaire organes, il est crucial de comprendre comment maintenir les cellules dans des conditions qui maximisent leur capacité d'exercer leurs rôles physiologiques, quel que soit l'environnement, si les cellules font partie d'un système extracorporel, tels que le foie bioartificiel dispositif d'assistance, ou un implantable par génie tissulaire périphérique. Nos objectifs sont de (1) donnent un aperçu de la façon dont les cellules se comportent lorsqu'ils sont confrontés à des changements dans son environnement et (2) déterminer les facteurs environnementaux optimales pour atteindre un niveau désiré de la fonction cellulaire. RÉSULTATS: divers ensembles de facteurs environnementaux ont été utilisés pour systématiquement perturber le comportement métabolique associé à un pré-conditionnement et la supplémentation en plasma. Afin de sonder l'état métabolique des hépatocytes, analyse de flux métabolique a été utilisée pour obtenir le profil métabolique. Nous avons appliqué un multi-bloc partiel au carré (MPLS) modèle de relier les facteurs environnementaux et des flux à des niveaux de lipides intracellulaires et synthèse de l'urée. Le modèle MPLS identifiés: (1) les facteurs les plus influents de l'environnement et (2) la manière dont les voies métaboliques sont altérées par ces facteurs. Enfin, nous avons inversé le modèle MPLS afin de déterminer les concentrations et les types de facteurs environnementaux nécessaires pour obtenir la solution la plus économique pour atteindre des niveaux optimaux de la fonction cellulaire pour les situations pratiques.

L'administration Concomitante D'un Type Bivalent Haemophilus Influenzae B-vaccin Contre L'hépatite B, Rougeole-oreillons-rubéole Et Du Vaccin Contre La Varicelle: Innocuité, La Tolérabilité Et L'immunogénicité

The Pediatric Infectious Disease Journal. Mar, 2004  |  Pubmed ID: 15014300

L'étude a été réalisée afin de vérifier que l'administration concomitante d'un type bivalent Haemophilus influenzae type b-hépatite B (Comvax), la rougeole-oreillons-rubéole (MM-RII) et vaccin contre la varicelle (Varivax) serait bien toléré et immunogène convenablement avec respecter pour tous les antigènes vaccinaux.

Dépôts Sélectifs Multicouches De Polyélectrolytes Sur: Monocouches Auto-assemblées De M-dPEG Acides Comme Modèle Moléculaire

Journal of the American Chemical Society. Apr, 2004  |  Pubmed ID: 15070388

Cet article décrit la fabrication de monocouches auto-assemblées (SAM) les modèles de MD-poly (éthylène glycol) (m-dPEG) molécules acides sur des multicouches de polyélectrolytes (PEMS). Les motifs sur SAM PEM ont été créés par des interactions ioniques en utilisant l'impression par microcontact (microCP) technique. Le créé m-dPEG motifs acide monocouche sur acte PEM en tant que modèles résistifs, et donc les dépôts supplémentaires consistant consécutive poly (anion) / poly (cations) paires de résultat particules chargées dans la formation de trois dimensions (3D) à motif PEM films ou des dépôts de particules sélectives au sommet des originaux des films minces multicouches. Dans cette étude, nous illustrons les méthodes de modélisation et nonlithographic contrôle 3-D architectures PEM et les dépôts de particules sélectifs. Nous avons étudié l'effet des variables - le choix du solvant, la concentration, temps de contact de pH, le prétraitement du substrat, et le cachet - sur l'impression par microcontact de molécules d'acide m-DPEG sur des films PEM afin de déterminer les conditions optimales de ces paramètres pour réaliser un transfert efficace des profils d'acides m-DPEG SUR DES PEM. Parmi les variables, le pH de la solution d'acide m-dPEG encre joué le rôle le plus important dans l'efficacité du transfert des motifs sur les films multicouches. Les films à motifs ont été caractérisées par microscopie optique et la microscopie à force atomique (AFM).

Intégrer L'expression Génique Et Profils Métaboliques

The Journal of Biological Chemistry. Jun, 2004  |  Pubmed ID: 15107427

Les progrès récents dans les technologies à haut débit ont généré une abondance de l'information biologique, telles que l'expression des gènes, interaction protéine-protéine, et les données métaboliques. Ces différents types de capture de données différents aspects de la réponse cellulaire à des facteurs environnementaux. Intégration de données à partir de différentes mesures renforce la capacité des cadres de modélisation pour prédire la fonction cellulaire avec plus de précision et peut conduire à une reconstruction plus cohérent de la structure du réseau de réglementation sous-jacente. Différentes techniques, nouvellement développés et empruntés, ont été appliquées dans le but d'extraire cette information à partir des données expérimentales. Dans cette étude, nous avons développé un cadre pour intégrer les profils d'expression génique métaboliques et pour un système de hépatocellulaire. Plus précisément, nous avons appliqué un algorithme génétique et au carré analyse partielle pour identifier les gènes importants pertinents à une fonction cellulaire spécifique. Nous avons identifié des gènes dont l'expression 1) les niveaux de prédire quantitativement une fonction métabolique et 2) qui jouent un rôle dans la régulation de la fonction hépatocellulaire et reconstruit leur rôle dans le réseau métabolique. Les cadres prétraite 1) les données d'expression génique utilisant des techniques statistiques, 2) sélectionne des gènes en utilisant un algorithme génétique et les couples à une analyse partielle des moindres carrés pour prédire la fonction cellulaire, et 3) reconstruit, avec l'aide d'une recherche documentaire, les voies qui régulent la fonction cellulaire, triglycéride savoir intracellulaire et synthèse de l'urée. Cela fournit un cadre pour identifier les mécanismes cellulaires qui sont actifs en fonction de l'environnement et à son tour contribue à faire apparaître l'interaction entre les gènes et les réseaux métaboliques.

La Propagation Du Poliovirus De Type Sabin 3 Contenant La Mutation Ponctuelle De Nucléotides 472 Uracile à La Cytosine Après L'administration Du Vaccin Antipoliomyélitique Oral

The Journal of Infectious Diseases. Jul, 2004  |  Pubmed ID: 15216480

Une mutation ponctuelle uracile à la cytosine au nucléotide (nt) 472 du vaccin Sabin antipoliomyélitique oral (VPO) de type 3 se trouve en conjonction avec le vaccin poliomyélite paralytique associée (PPAV). Direct extraction de l'ARN et l'analyse des virus mutants par amplification en chaîne par polymérase et le clivage des enzymes de restriction ont été utilisés pour identifier cette mutation ponctuelle dans des échantillons cliniques. Un total de 238 échantillons de selles ont été obtenus à partir de 28 nourrissons en bonne santé pendant 6 semaines après vaccination par le VPO. Plus de 25% des nourrissons versé VPO3 dans la semaine après la vaccination, avec une diminution au jour 6. Une deuxième vague de VPO3 effusion produite à partir de la deuxième semaine après la vaccination et a été maintenue jusqu'à la fin de la période d'étude. Pendant la première semaine après la vaccination, la proportion de mutants nt 472 dans le hangar VPO3 augmenté, passant de indétectable à près de 100%. Au cours de la période de l'excrétion d'autre part, la proportion de mutants nt 472 est resté proche de 100%. Ces résultats suggèrent que la mutation sélective entraîne la mutation associée à nt PPAV point de 472 pour le VPO3 dans le tractus gastro-intestinal humain.

Extraction D'informations à Partir De Novel Données D'expression Génique

Trends in Biotechnology. Aug, 2004  |  Pubmed ID: 15283978

Les données de technologies à haut débit, tels que les puces à ADN, nécessitent le développement de nouvelles méthodes de calcul pour analyser l'information dimensionnelle élevée contenue dans les données d'expression génique. Groupe Liao a suggéré l'utilisation de l'analyse en composantes réseau pour prédire les activités des facteurs de transcription par l'intégration de données d'expression génique à partir d'Escherichia coli avec les informations de connectivité connue entre leurs gènes et des facteurs de transcription. Cela introduit une méthode pour obtenir des informations inédites à partir des données d'expression génique.

Génie Tissulaire Hépatique Pour Le Soutien De Foie Auxiliaire Et Temporaire: Technologies Critiques

Liver Transplantation : Official Publication of the American Association for the Study of Liver Diseases and the International Liver Transplantation Society. Nov, 2004  |  Pubmed ID: 15497161

La pénurie de donneurs d'sévère du foie, le coût élevé, et la complexité de la transplantation hépatique orthotopique ont incité la recherche de stratégies alternatives de traitement pour une maladie du foie en phase terminale, ce qui exigerait moins de matières donateurs, être moins cher, et moins invasive. L'ingénierie tissulaire hépatique englobe plusieurs approches pour développer des méthodes internes de soutien auxiliaires du foie, comme la transplantation d'hépatocytes et implantables hépatocytes périphériques basés sur, ainsi que temporaires extracorporelles techniques d'assistance hépatique, comme le foie bioartificiel dispositifs d'assistance. Beaucoup de systèmes de soutien de l'ingénierie tissulaire du foie ont adopté la «preuve de principe" de test dans les études précliniques et cliniques, mais ils n'ont pas encore été trouvé suffisamment fiable efficace pour une utilisation clinique de routine. Dans cette revue, nous décrivons, à partir d'un point de vue technique, le progrès et les défis restants qui doivent être résolues afin de développer la prochaine génération de dispositifs implantables et extracorporelle pour le foie complément ou temporaire d'aider.

Contrôle Primaire D'adhérence Des Hépatocytes Et D'épandage Sur Les Protéines Sans Polyélectrolytes Films Multicouches

Journal of the American Chemical Society. Dec, 2004  |  Pubmed ID: 15600306

Le développement de nouvelles méthodes pour la fabrication de couches minces qui offrent un contrôle précis de la topographie en trois dimensions et l'adhérence cellulaire pourrait conduire à des avancées significatives dans les domaines de l'ingénierie tissulaire et biocapteurs. Cette communication décrit l'attachement de succès et la diffusion des hépatocytes primaires sur polyélectrolytes multicouches (PEM) des films sans l'utilisation de protéines adhésives telles que le collagène ou de fibronectine. Nous démontrons que la fixation et la diffusion des hépatocytes primaires peuvent être contrôlés à l'aide de ce dépôt couche par couche de polymères ioniques. Dans notre étude, nous avons utilisé les polymères synthétiques, à savoir le poly (chlorure de diallyldiméthylammonium) (ACPE) et sulfoné poly (styrène) (SPS) que le polycation et polyanion, respectivement, pour construire les multicouches. Hépatocytes primaires rattachées et la propagation de préférence sur des surfaces SPS sur des surfaces PDAC. Modèles SPS ont été formées sur les surfaces PEM, soit par impression par microcontact de SPS sur des surfaces PDAC ou vice versa, pour obtenir des motifs d'hépatocytes primaires. PEM est une technique utile pour la fabrication contrôlée co-cultures avec spécifiés interactions cellule-cellule et cellule-surface sur un environnement exempt de protéines, fournissant ainsi une flexibilité dans la conception de la cellule-spécifiques surfaces pour des applications de génie tissulaire.

La Concentration D'insuline Au Cours Du Préconditionnement Médiateur Du Règlement De La Synthèse De L'urée Pendant L'exposition Au Plasma D'acide Aminé-complété

Tissue Engineering. Nov-Dec, 2004  |  Pubmed ID: 15684682

Comprendre les effets du préconditionnement sur le métabolisme cellulaire est important en fournissant des éclaircissements sur la façon dont les cellules et les tissus peuvent se comporter lorsqu'ils sont confrontés à des altérations de leur environnement. Auparavant, l'accumulation élevée de lipides et un taux réduit en conséquence de la synthèse de l'urée ont été trouvés dans heptocytes primaires préconditionnés en milieu de culture contenant des niveaux élevés d'insuline, puis exposé à un plasma. Des études ultérieures ont trouvé que le préconditionnement des hépatocytes primaires dans un milieu contenant de faibles niveaux d'insuline avant l'exposition au plasma complétée avec des acides aminés a été en mesure de conférer une résistance à l'effet des lipides s'accumulent de l'exposition plasmatique et synthèse de l'urée restauré. Dans l'étude actuelle, nous avons étudié les effets de l'insuline et préconditionnement supplémentation en acides aminés sur le profil d'expression génique du cycle de l'urée et d'acide gras enzymes du métabolisme. Nous avons constaté que l'insuline pré-conditionnement médiatise les effets des acides aminés dans la période d'exposition du plasma sur la synthèse de l'urée. Synthèse de l'urée est régulée par l'insuline et des acides aminés par le biais à la fois le contrôle à court terme et à long terme. Les mécanismes possibles de contrôle à long terme par le biais régulation transcriptionnelle de la synthèse de l'urée par l'insuline, les acides aminés, enzymes et des facteurs de transcription associés au métabolisme des lipides sont discutés.

Palmitique Et Stéarique Acides Gras Provoquer La Maladie D'Alzheimer-like Hyperphosphorylation De Tau Dans Les Neurones De Rat Corticale Primaire

Neuroscience Letters. Aug, 2005  |  Pubmed ID: 15939536

Les études épidémiologiques suggèrent que les régimes riches en matières grasses augmenter de manière significative le risque de la maladie d'Alzheimer (AD). En outre, le cerveau AD est caractérisé par une teneur élevée en acide gras par rapport à celle de sujets sains. Néanmoins, le mécanisme de base relatives élevées d'acides gras et la pathogénie de la MA reste incertaine. La présente étude examine le rôle des acides gras dans l'apparition hyperphosphorylation de la protéine tau, une des signatures caractéristiques de la pathologie AD. L'hyperphosphorylation de tau perturbe le cytosquelette de la cellule et conduit à la dégénérescence neuronale. Ici, les neurones corticaux primaires de rat et les astrocytes ont été traités avec saturés en acides gras libres (AGL), les acides palmitique et stéarique. Il y avait pas de changement dans les niveaux de tau phosphorylée dans les neurones corticaux de rat traités directement avec ces AGL. Les milieux conditionnés provenant de la FFA-traités astrocytes, cependant, causé hyperphosphorylation de tau dans les neurones corticaux à AD-phospho-épitopes spécifiques. Co-traitement de neurones avec la N-acétyl cystéine, un antioxydant, réduite FFA induite hyperphosphorylation de tau. Les résultats actuels d'établir un rôle central de l'AGL en entraînant l'hyperphosphorylation de tau dans les astrocytes médiée par le stress oxydatif.

Maintien De L'équilibre Sulfatation Chondroïtine Par Chondroïtine-4-sulfotransférase 1 Est Requis Pour Le Développement Des Chondrocytes Et De Signalisation Du Facteur De Croissance Pendant La Morphogénèse Du Cartilage

Development (Cambridge, England). Sep, 2005  |  Pubmed ID: 16079159

Glycosaminoglycanes (GAG) tels que le sulfate d'héparane et le sulfate de chondroïtine sont des chaînes polysaccharidiques qui sont attachés à des protéines essentielles pour former des protéoglycanes. La biosynthèse de GAG ​​est un procédé à plusieurs étapes comprenant la fixation de groupes sulfate aux positions spécifiques des chaînes polysaccharidiques selon sulfotransférases. Héparane-sulfate et l'héparane sulfate des sulfotransférases jouent un rôle important dans la signalisation du facteur de croissance et le développement des animaux. Toutefois, l'importance biologique de sulfatation chondroïtine au cours du développement chez les mammifères et de signalisation du facteur de croissance est mal comprise. On montre une mutation qui piège gène dans la BMP-induite chondroïtine-4-sulfotransférase 1 (C4st1) gène (également appelé glucides 11 sulfotransférase - Chst11), qui code pour une enzyme spécifique pour le transfert de groupes sulfate à l'4-O-position de en chondroïtine, provoque chondrodysplasie sévère caractérisée par une plaque de croissance du cartilage désorganisé ainsi que des altérations spécifiques à l'orientation des colonnes de chondrocytes. Ce phénotype est associé à un déséquilibre de sulfatation chondroïtine, de sulfate de chondroïtine mauvaise localisation dans la plaque de croissance et un déséquilibre de signaux apoptotiques. Analyse de plusieurs voies de signalisation du facteur de croissance qui sont importants dans le développement plaque cartilage de croissance a montré que le C4st1 (gt / gt) mutation conduit à une régulation positive forte de TGFbeta de signalisation avec la régulation négative concomitante de signalisation BMP, tandis Indian hedgehog (Ihh) de signalisation n'a pas été affectée. Ces résultats montrent que la chondroïtine 4-O-sulfatation par C4st1 est nécessaire pour la localisation du sulfate de chondroïtine correcte, la modulation de différentes voies de signalisation et de la morphogenèse plaque cartilage de croissance. Notre étude démontre un rôle biologique important du différentiel de chondroïtine sulfatation dans le développement des mammifères.

L'ertapénème Versus Ceftriaxone Et Métronidazole Comme Traitement Pour Les Intra-abdominales Compliquées Infections

International Journal of Surgery (London, England). 2005  |  Pubmed ID: 17462256

Une prompte intervention chirurgicale complétée par une thérapie antimicrobienne appropriée est habituellement requis pour la réussite du traitement des complexes infections intra-abdominales. L'objectif de cette étude était d'évaluer plus en détail l'efficacité et la sécurité d'un parent ertapénème à la ceftriaxone / métronidazole en tant que traitement pour intra-abdominales compliquées d'infections.

Utilisation D'un Modèle D'État-espace Avec Variables Cachées De Déduire Le Facteur De Transcription Activités

Bioinformatics (Oxford, England). Mar, 2006  |  Pubmed ID: 16403793

Dans un réseau de gènes de régulation, les gènes sont généralement régis par des facteurs de transcription (FT). L'activité du facteur de transcription (TFA) est plus difficile à mesurer que les niveaux d'expression des gènes sont. D'autres modèles ont extrait des informations sur TFA à partir des données d'expression génique, mais sans modéliser de manière explicite les informations à partir des gènes. Nous présentons un modèle espace d'état (SSM), avec des variables cachées. Les variables cachées sont des motifs de régulation dans le réseau de gènes, tels que des boucles de rétroaction et d'auto-régulation, ce qui rend SSM un complément utile aux modèles existants.

Efficacité Et Innocuité De L'ertapénème Versus Pipéracilline-tazobactam Pour Le Traitement Des Infections Intra-abdominales Nécessitant Une Intervention Chirurgicale

Journal of Gastrointestinal Surgery : Official Journal of the Society for Surgery of the Alimentary Tract. Apr, 2006  |  Pubmed ID: 16627223

Intra-abdominales compliquées d'infections en général mandater une intervention chirurgicale rapide complétée par un traitement antimicrobien approprié. Le but de cette étude était de démontrer que l'ertapénème n'est pas inférieure à la pipéracilline-tazobactam pour le traitement de la communauté acquises infections intra-abdominales. Une étude randomisée en ouvert comparateur actif essai clinique a été menée à 48 centres médicaux répartis sur quatre continents à partir de Décembre 2001 à Février 2003. Patients adultes atteints d'infections intra-abdominales nécessitant une intervention chirurgicale ont été randomisés pour recevoir soit l'ertapénème 1 g par jour ou pipéracilline / tazobactam 13,5 g par jour en 3-4 doses fractionnées. L'analyse primaire d'efficacité était le taux de réponse clinique dans cliniquement et microbiologiquement patients évaluables à l'évaluation de test de guérison 2 semaines après la fin du traitement. Tous les patients traités ont été inclus dans l'analyse de sûreté. La démographie des patients, les caractéristiques de la maladie et la durée de traitement dans les deux groupes de traitement étaient généralement similaires. Les agents pathogènes les plus fréquemment isolées au départ étaient E. coli (supérieure à 50% des cas dans chaque groupe) et B fragilis (environ 9%). Favorables des taux de réponse clinique étaient 107/119 (90%) pour les bénéficiaires de l'ertapénème et 107/114 (94%) pour la pipéracilline / tazobactam bénéficiaires. Les fréquences liées à la drogue événements indésirables, le plus souvent la diarrhée et une élévation des taux sériques d'alanine aminotransférases, étaient similaires dans les deux groupes de traitement. Six des bénéficiaires ertapénème 180 (3%) et deux de 190 pipéracilline / tazobactam bénéficiaires (1%) a eu de graves liés à la drogue effets indésirables. Dans cette étude, l'ertapénème et de la pipéracilline / tazobactam étaient des traitements comparables sûrs et efficaces pour les patients adultes atteints intra-abdominales compliquées d'infections.

Acide Palmitique Traités Astrocytes Provoquer BACE1 Régulation à La Hausse Et L'accumulation De Fragment C-terminal De L'APP Dans Le Primaire Neurones Corticaux

Neuroscience Letters. Oct, 2006  |  Pubmed ID: 16904262

Haute teneur en graisses est un facteur de risque important pour le développement de la maladie d'Alzheimer (AD). En outre, le cerveau MA est caractérisée par des niveaux élevés d'acides gras par rapport à celle des témoins sains. Malgré cela, on voit mal comment des niveaux élevés d'acides gras sont liés à la pathogenèse de la MA. La présente étude examine le rôle des acides gras saturés, l'acide palmitique (PA), en provoquant BACE1 régulation à la hausse et par conséquent le traitement amyloïdogénique de la protéine précurseur bêta-amyloïde (APP), l'une des signatures principales caractéristiques de la pathologie AD. Ici, les neurones corticaux primaires de rat et les astrocytes ont été traités avec une concentration pathologique de PA. Il y avait pas de changement dans les niveaux BACE1 dans les neurones corticaux de rat traités directement avec les PA par rapport aux témoins. Le milieu conditionné à partir de PA-traités astrocytes, cependant, causé BACE1 régulation à la hausse dans les neurones corticaux. En outre, une augmentation conséquente de la coupure de l'APP conduisant à l'accumulation du fragment C-terminal de l'APP (C99) dans les neurones corticaux. Le co-traitement des neurones avec le 1,3-diméthyl urée (DMU), un antioxydant, une diminution de PA induite par la régulation positive des niveaux de BACE1 et C99. Les présents résultats établissent un rôle important d'acides gras saturés dans la MA-associé amyloïdogénèse travers astroglie médiée par le stress oxydatif.

Innocuité, La Tolérabilité Et L'immunogénicité D'un Schéma à Deux Doses De La Haute-titre Vaccin Contre La Varicelle Chez Les Sujets De ≥ 13 Ans De L'âge

Vaccine. Nov, 2006  |  Pubmed ID: 17050042

Un nouveau procédé de fabrication, connue en tant que processus de mise à niveau vaccin contre la varicelle (PUVV) a été développé pour une formulation réfrigérée de vaccin contre la varicelle et pour un vaccin contre le zona expérimental. La sécurité et la tolérabilité d'un schéma à deux doses de haute-titré (environ 50.000 UFP) PUVV ont été comparées à une formulation à faible titre (environ 5400 UFP) de VARIVAX; en 1366 des sujets sains> ou = 13 ans. Un seul vaccin cliniques portant sur l'expérience indésirable grave (prurit; pas d'hospitalisation) a été signalé, dans le groupe VARIVAX. Au site d'injection effets indésirables suivants ont été une dose plus élevée dans le groupe PUVV, 70,0%, que dans le groupe VARIVAX, 56,2%, mais en général, étaient d'intensité légère. Immunogénicité étaient semblables dans les deux groupes sur des sujets séronégatifs. PUVV était généralement bien toléré, et a suscité une réponse immunitaire semblable à celle induite par la formulation commercialisée de VARIVAX.

Approches à L'optimisation De La Fonction Cellulaire Des Tissus D'ingénierie: Cellulaires Des Tissus à L'informatique

Advances in Biochemical Engineering/biotechnology. 2006  |  Pubmed ID: 17089789

Le génie tissulaire est un pleine expansion, champ multidisciplinaire dans le domaine biomédical. Il offre la possibilité de manipuler les cellules vivantes et des biomatériaux dans le but de restaurer, maintenir et améliorer le tissu et la fonction des organes. Des scientifiques ont conçu divers tissus dans le corps, à partir de substituts cutanés au niveau des nerfs artificiels à des tissus cardiaques, à des degrés divers de succès. Bien que le domaine du génie tissulaire a parcouru un long chemin depuis sa démonstration réussie d'abord par Bisceglie dans les années 1930, les méthodes de les amadouer en tissus fonctionnels ont été principalement empirique à ce jour. Pour développer avec succès de l'ingénierie tissulaire organes, il est important de comprendre comment maintenir les cellules dans des conditions qui maximisent leur capacité d'exercer leurs rôles physiologiques, indépendamment de leur environnement. Dans ce contexte, une méthodologie qui combine les données empiriques avec des techniques mathématiques et statistiques, comme le génie métabolique et de l'informatique, les cellulaires pour établir systématiquement le optimale (1) type de cellule à utiliser, (2) propriétés d'échafaudage et les conditions de traitement correspondant à la réalisation ces propriétés, et (3) les types et les niveaux requis de facteurs environnementaux et les conditions d'exploitation nécessaires dans le bioréacteur, permettra la conception de tissus viables et fonctionnelles adaptées aux besoins spécifiques des situations individuelles.

Hypocholestérolémiant Capacité D'un Phytostanol Softgel Supplément Chez Les Adultes Atteints Hypercholestérolémie Légère à Modérée

Lipids. Feb, 2006  |  Pubmed ID: 17707978

Les stérols végétaux, incorporés dans les marges et autres sources de nourriture, ont été montré pour abaisser les concentrations de cholestérol sérique. L'effet de la supplémentation en gélule phytostanol formulaire n'a pas été évalué. Notre objectif était d'examiner les effets de sitostanol sous forme d'ester en gélule sitostanol forme sur les concentrations sériques de lipides chez les personnes hypercholestérolémiques. Trente adultes hypercholestérolémiques ont été complétés avec 1,6 g d'équivalents libres phytostanol que l'ester de phytostanol (2,7 g esters de stanols) ou un placebo par jour pendant 28 jours dans une étude randomisée, en double aveugle, conception de l'étude parallèle. Supplémentation phytostanol a entraîné une diminution significative du cholestérol total (CT) (-8%) et de LDL-cholestérol (-9%). Il n'y avait pas des modifications des concentrations de HDL-cholestérol ou TG. N'étaient pas non plus les ratios de LDL / HDL ou TC / HDL sensiblement modifié. Ainsi, l'utilisation de l'ester de phytostanol gélule suppléments améliorée sérique total et le LDL-cholestérol chez les personnes hypercholestérolémiques concentrations.

Un Modèle De Régression Fondée Sur La Connaissance De L'expression Génétique Et De L'analyse De Puces à ADN

Conference Proceedings : ... Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Conference. 2006  |  Pubmed ID: 17945892

Le modèle de régression linéaire a été largement utilisé dans l'analyse de l'expression génique et de données de biopuces pour identifier un sous-ensemble de gènes qui sont importants pour une fonction métabolique donnée. L'un des défis clés à appliquer le modèle de régression linéaire pour l'expression du gène de données provient de l'analyse du problème de données clairsemée, dans lequel le nombre de gènes est sensiblement plus grande que le nombre de conditions. Pour résoudre ce problème, nous présentons un modèle de régression fondée sur la connaissance qui intègre la connaissance des gènes de la Gene Ontology (GO) base de données dans le modèle de régression linéaire. Il est basé sur l'hypothèse que deux gènes sont susceptibles d'être affectés poids similaires quand ils partagent des ensembles similaires de codes OK. Les études empiriques montrent que le modèle de régression des connaissances proposée entraînée est efficace pour réduire les erreurs de régression, et, en outre efficace pour identifier les gènes qui sont pertinents à un métabolite donné.

Peroxyde D'hydrogène Et Les Radicaux Hydroxyles Médiation Palmitate Induite Par La Cytotoxicité Des Cellules D'hépatome: Relation Avec Transition De Perméabilité Mitochondriale

Free Radical Research. Jan, 2007  |  Pubmed ID: 17164177

Nous avons étudié les réponses toxicologiques d'une lignée cellulaire humaine hépatoblastome (HepG2/C3A) à divers acides gras libres (FFA) afin d'identifier la relation entre les espèces réactives de l'oxygène (ROS) de production et de transition de perméabilité mitochondriale (MPT). L'exposition à la FFA saturé, le palmitate, conduit à une production dépendant du temps ROS et la libération de peroxyde d'hydrogène ainsi que d'une perte de potentiel mitochondrial. La cytotoxicité du palmitate a été sensiblement réduite par traitement avec piégeurs de peroxyde d'hydrogène, des radicaux hydroxyle et l'accepteur de spin alpha-(4-pyridyl-1-oxyde)-N-tert-butyl nitrone (POBN). Superoxyde dismutase (SOD) mimiques, au trésor de l'oxyde nitrique et l'inhibiteur de la céramide de synthèse de novo n'a eu aucun effet sur la toxicité. MPT-inhibiteur, la cyclosporine, a empêché la perte de potentiel mitochondrial, mais n'a pas réduit la cytotoxicité. En revanche, l'inhibition des complexes mitochondriaux I et III réduit le potentiel de la perte précoce et la cytotoxicité. Ces résultats suggèrent que le palmitate-la cytotoxicité des cellules d'hépatome est médiée par la production de H2O2 et OH * et indépendante de MPT.

Sirolimus Bloque L'accumulation D'acide Hyaluronique (HA) Par Cellules Musculaires Lisses Artérielles Et Réduit L'adhérence Des Monocytes à L'ECM

Atherosclerosis. Nov, 2007  |  Pubmed ID: 17174314

Le sirolimus (SRL), un inhibiteur de cellules humaines muscle lisse artériel (ASMC) prolifération et la migration, empêche resténose intra-stent (ISR). On connaît peu l'effet de la SRL sur la matrice extracellulaire (ECM) composant, l'acide hyaluronique, une macromolécule clé dans l'hyperplasie néo-intimale et de l'inflammation. Dans cette étude, nous avons étudié SRL régulation de la synthèse d'acide hyaluronique par ASMC humaine cultivée et l'effet de l'acide hyaluronique SRL sur l'adhésion des monocytes induite à l'ECM. La production acide hyaluronique sur une base par cellule a été significativement inhibée par SRL moins 4 jours et le sont restés dans les 10 jours. Cette réduction a été corrélée avec des niveaux réduits d'ARNm hyaluronane synthase tandis que les taux de dégradation acide hyaluronique sont demeurées inchangées. Poly I: C, un mimétique virale, provoquée par une accumulation accrue hyaluronane couches de cellules ASMC et cette augmentation a été inhibée par SRL. L'inhibition a été de pair avec une réduction de l'acide hyaluronique-dépendante l'adhésion des monocytes à l'ECM. Cette étude démontre que non seulement SRL régule la prolifération des ASMC, mais réduit la production de l'acide hyaluronique par ces cellules. Cette altération dans les résultats de la composition d'ECM dans l'adhésion des monocytes réduit à l'ECM dans les cultures de ASMC. Modifications de l'accumulation de l'acide hyaluronique peut contribuer à l'inhibition de rapport de recherche internationale qui est atteint par SRL.

L'interleukine-1beta Diminue De Façon Sélective La Synthèse De Versican Par Cellules Musculaires Lisses Artérielles

Journal of Cellular Biochemistry. Jun, 2007  |  Pubmed ID: 17226775

Les protéoglycanes s'accumulent dans les lésions d'athérosclérose, mais peu est connu sous le nom de facteurs qui régulent la synthèse de ces molécules. L'interleukine-1beta (IL-1beta) est une cytokine impliquée dans le développement des lésions vasculaires, mais il n'est pas clair si elle a des effets spécifiques sur la synthèse des protéoglycanes par les cellules musculaires lisses artérielles (ASMC). Singe ASMC ont été traités avec de l'IL-1beta et la synthèse des protéoglycanes évaluée à l'aide [(35) S]-sulfate et [(35) S]-Trans étiquetage des acides aminés. Quatre populations de taille éminents de protéoglycanes, tel que déterminé par électrophorèse SDS-PAGE sur gel à gradient, ont été observées dans le milieu de culture et identifiés comme versicane, biglycane, décorine, et une population inconnue qui a migré vers l'interface gel. IL-1beta traitement a diminué de façon significative la synthèse de versicane, tout en augmentant la synthèse de décorine, mais n'ayant pas d'effet sur la synthèse biglycane. Analyses par Northern blot a confirmé cet effet sélectif sur versicane et transcrits d'ARNm décorine. Nucléaires études d'inhibition s'exécutent sur l'ARN et a montré que l'ARNm a diminué pour versicane était due à la dégradation de l'ARNm a augmenté et non pas à des changements dans la transcription. En outre, l'IL-1bêta augmenté la synthèse de la population des protéoglycanes que séparés à l'interface gel de SDS-PAGE. Chondroïtinase ABC lyase la digestion de cette population révélé un complexe de protéines composé de versicane (350 kDa), une protéine non identifiée (215 kDa), et une protéine 23 kDa identifié par les analyses de séquence en tant serglycin. Ces données montrent que l'IL-1beta atténue sélectivement la synthèse versicane par ASMC, tandis que la régulation positive de la synthèse des protéoglycanes autres.

Les Obstacles Et Les Occasions Ratées Dans Le Sein Et Le Dépistage Du Cancer Du Col Utérin Chez Les Femmes âgées De 50 Ans Et Plus, à New York, 2002

Journal of Women's Health (2002). Jan-Feb, 2007  |  Pubmed ID: 17324096

Du sein et le dépistage du cancer du col utérin à la fois sont systématiquement recommandée pour les femmes. Toutefois, les données sont rares sur les facteurs associés aux comportements de dépistage communs. Notre objectif de décrire les facteurs associés à la recevoir à la fois, un, ou aucun des deux test de dépistage chez les femmes âgées> ou = 50.

Calqué Co-culture D'hépatocytes Primaires Et Des Fibroblastes à L'aide De Polyélectrolytes Modèles Multicouches

Macromolecular Bioscience. Mar, 2007  |  Pubmed ID: 17370273

Ce document décrit la formation de la cellule motif des co-cultures en utilisant le dépôt de la couche par couche de polymères synthétiques ioniques et sans l'aide de protéines adhésives ou ligands tels que le collagène ou de fibronectine. Dans cette étude, nous avons utilisé les polymères synthétiques, à savoir le poly (chlorure de diallyldiméthylammonium) (ACPE) et le polystyrène sulfoné (SPS) que le polycation et polyanion, respectivement, de construire des films multicouches. Nous avons formé les modèles SPS sur polyélectrolytes multicouches (PEM) des surfaces, soit par l'ACPE impression par microcontact sur des surfaces SPS ou vice-versa. Pour créer un motif co-cultures sur PEM, nous capitalisons sur l'attachement préférentiel et la diffusion des hépatocytes primaires sur les mesures SPS, par opposition aux surfaces PDAC. En revanche, les fibroblastes facilement attaché à la fois l'ACPE et les surfaces SPS, et, par conséquent, nous avons pu obtenir des motifs co-cultures de fibroblastes et les hépatocytes primaires sur des surfaces synthétiques PEM. Nous avons caractérisé la morphologie et hépatique des fonctions spécifiques de la cellule motif des co-cultures avec la microscopie et des tests biochimiques. Nos résultats suggèrent une approche alternative à la fabrication contrôlée des co-cultures avec caractéristiques spécifiées interactions cellule-cellule et cellule-surface; cette approche offre une flexibilité dans la conception de la cellule-spécifiques surfaces pour des applications de génie tissulaire.

Une Modification Polymérase Chain Reaction Au Long De L'analyse De Série Du Protocole Expression Génique Identifie Transcriptions Nouveaux Dans L'homme Cellules CD34 + De Moelle Osseuse

Stem Cells (Dayton, Ohio). Jul, 2007  |  Pubmed ID: 17412892

Profils en transcriptomique offre une approche puissante pour l'étude des processus de développement. Longue analyse en série de l'expression des gènes (LongSAGE) est particulièrement intéressante à cet effet en raison de ses propres caractéristiques quantitatives et de l'indépendance des variables d'hybridation des deux et des connaissances préalables de l'identité transcription. Ici, nous décrivons la validation et l'application initiale d'un protocole modifié pour amplifier préparations d'ADNc de <10 ng d'ARN (<10 (3) les cellules) pour permettre aux bibliothèques LongSAGE représentatives pour être construit à partir de rares enrichie de cellules souches populations. Quantitative en temps réel la réaction en chaîne par polymérase (Q-RT-PCR) et des analyses de comparaison des fréquences de balises dans les bibliothèques LongSAGE répétés produites à partir de amplifiés et non amplifiée préparations d'ADNc en évidence la préservation des niveaux relatifs de différents transcrits présents à l'origine à des niveaux très variables. Ce protocole PCR-LongSAGE a ensuite été utilisée pour obtenir une bibliothèque de 200.000 tag de la sous-ensemble de cellules CD34 + normales adultes des cellules de moelle osseuse. L'analyse de cette bibliothèque a révélé de nombreuses transcriptions prévues, ainsi que des transcriptions pas déjà connus pour être présents dans les cellules CD34 + hématopoïétiques. Celui-ci comprenait de nombreuses nouvelles balises qui correspondaient à des sites uniques et conservée dans le génome humain, mais pas encore identifiés comme des éléments transcrits dans les cellules humaines. Q-RT-PCR a été utilisée pour démontrer que 10 de ces balises nouvelles ont été exprimées dans les piscines d'ADNc et présente dans les extraits d'autres sources d'humains normaux cellules hématopoïétiques CD34 +. Ces résultats illustrent la puissance de LongSAGE d'identifier de nouveaux relevés dans enrichie de cellules souches populations et indiquer le potentiel de cette approche soient étendus à d'autres sources de cellules rares. Divulgation des conflits d'intérêts potentiels se trouve à la fin de cet article.

Une Approche Hiérarchique Employant Profils D'expression Génique Du Métabolisme Et De D'identifier Les Voies Qui Leur Confèrent Une Cytotoxicité Dans Les Cellules HepG2

BMC Systems Biology. 2007  |  Pubmed ID: 17498300

Les acides gras libres (FFA) et tumor necrosis factor alpha (TNF-alpha) ont été impliqués dans la pathogénie de nombreux troubles métaboliques liés à l'obésité. Lorsque les cellules humaines hépatoblastome (HepG2) ont été exposés à différents types de FFA et le TNF-alpha, en acides gras saturés a été révélé cytotoxique et sa toxicité a été exacerbée par le TNF-alpha. Afin d'identifier les processus associés à la toxicité de la FFA et saturée de TNF-alpha, les profils d'expression génique et métaboliques ont été mesurés pour caractériser les états cellulaires. Un modèle de calcul a été développé pour intégrer ces données disparates afin de révéler les voies sous-jacentes et les mécanismes impliqués dans la toxicité d'acide gras saturé.

La Colonisation Du Côlon Avec Des Entérocoques Résistants Après Antimicrobial Therapy Pour Les Infections Intra-abdominales: Observations De 2 Essais Cliniques Comparatifs Randomisés De L'ertapénème Thérapie

Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. Aug, 2007  |  Pubmed ID: 17509789

L'impact des différents schémas thérapeutiques antimicrobiens pour infections intra-abdominales sur la fréquence de la colonisation intestinale avec résistant à la vancomycine vancomycine (ERV) a été examiné en 2 randomisée, en ouvert des essais de l'infection intra-abdominale comparant pipéracilline-tazobactam ou à la ceftriaxone / métronidazole par l'ertapénème. Dans ces études à court terme, les taux globaux de la colonisation intestinale par des ERV étaient généralement comparables après un traitement avec de la pipéracilline-tazobactam, la ceftriaxone / métronidazole, ou ertapénème.

Cell Adhesion Sur Polyélectrolytes Multicouches Surfaces Enduites Avec Polydiméthylsiloxane Topographies Différentes

Tissue Engineering. Aug, 2007  |  Pubmed ID: 17518734

Cet article montre que la topographie de micro-de la surface par rapport à la taille de motif et l'adhérence cellulaire et de la prolifération des influences tangage. Des recherches approfondies ont montré la dépendance de la prolifération cellulaire sur la chimie du substrat, mais l'influence de la topographie du substrat sur la fixation des cellules n'a été que récemment apprécié. Pour évaluer l'effet des propriétés du substrat physique (c.-microstructures périodiques) sur la fixation des cellules et la morphologie, nous avons comparé la réponse de plusieurs types cellulaires (fibroblastes, HeLa, et les hépatocytes primaires) cultivées sur divers polydiméthylsiloxane (PDMS) modèles. PDMS a été utilisé comme une construction artificielle de mimer des structures biologiques. Bien que le PDMS est largement utilisé dans des applications biomédicales, technologie des membranes, et microlithographie, il est difficile de maintenir les cellules sur PDMS pendant de longues périodes, et le polymère s'est avéré être un substrat relativement inefficace pour l'adhésion cellulaire. Pour améliorer l'adhérence, nous avons construit des multicouches de polyélectrolytes (PEM) sur des surfaces de PDMS à augmenter la mouillabilité de surface, améliorant ainsi l'attachement et l'étalement des cellules. Micrographies démontrer la réponse cellulaire à des paramètres physiques, tels que la taille du motif et de tangage, et suggèrent que la topographie de surface, en partie, réglemente l'adhésion cellulaire et la prolifération. Par conséquent, varier la topographie de la surface peut fournir une méthode pour influencer l'attachement et la prolifération cellulaire pour l'ingénierie tissulaire applications.

Adipocyte A3 Sérum Amyloïde Et L'acide Hyaluronique Jouer Un Rôle Dans Le Recrutement Des Monocytes Et Adhésion

Diabetes. Sep, 2007  |  Pubmed ID: 17563062

L'obésité est caractérisée par une hypertrophie des adipocytes et l'accumulation de macrophages dans le tissu adipeux. Monocyte la protéine-1 chimiotactique (MCP-1) joue un rôle dans le recrutement des macrophages dans le tissu adipeux. Toutefois, d'autres adipocytes dérivés facteurs, par exemple amyloïdes, l'acide hyaluronique et le sérum A. (ASA), peut faciliter l'adhésion des monocytes et la chimiotaxie, respectivement L'objectif était de tester l'implication potentielle de ces facteurs dans le recrutement des macrophages. Différenciés adipocytes 3T3-L1 faites hypertrophique par la croissance dans des conditions élevées de glucose ont été utilisées pour étudier la SAA et l'acide hyaluronique réglementation in vitro. Deux modèles de souris de l'obésité ont été utilisés pour étudier leur expression in vivo. Facteur nucléaire kappa B était régulée à la hausse et peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) gamma était négative dans hypertrophiques cellules 3T3-L1, avec une expression accrue de SAA3 et augmentation de la production acide hyaluronique. La rosiglitazone, un agoniste PPARy, infirmé ces changements. Adipocytes hypertrophiques démontré la surexpression de SAA3 et hyaluronane synthase 2 in vitro et in vivo chez l'obésité induite par l'alimentation et génétique. ASA et l'acide hyaluronique existe dans le cadre d'une matrice complexe que l'augmentation de l'adhérence et la rétention des monocytes. Ce complexe, purifié par se lier à une protéine biotinylée hyaluronane colonne d'affinité de liaison, également montré une activité chimiotactique des monocytes, qui était dépendante de la présence de l'acide hyaluronique et SAA3 mais indépendant de MCP-1. Nous émettons l'hypothèse que l'hypertrophie des adipocytes conduit à une production accrue de SAA et l'acide hyaluronique, qui agissent de concert pour recruter et retenir les monocytes, ce qui conduit à une inflammation locale dans le tissu adipeux.

Un Troisième Stade De La Recherche Intégrative Pathway (TIPS) Cadre Pour Identifier Les Gènes De Toxicité Pertinents Et Des Sentiers

BMC Bioinformatics. 2007  |  Pubmed ID: 17570844

La capacité d'obtenir des profils d'expression des gènes, les protéines et les métabolites avec l'avènement de technologies à haut débit a progressé l'étude de la voie et la reconstruction du réseau. La reconstruction du réseau à l'échelle du génome nécessite des mesures d'interaction soit ou grande quantité de données de perturbation, souvent ne sont pas disponibles pour les systèmes cellulaires de mammifères. Pour combler ces lacunes, nous avons développé une recherche de trois Stade Pathway intégrative (TIPS (c)) approche pour reconstruire un contexte spécifique des voies actives impliquées dans conférer un phénotype particulier, de la quantité limitée de données de perturbation. L'approche a été testée sur des cellules hépatiques humaines pour identifier les voies qui leur confèrent une cytotoxicité.

Transducteur De Signal Et Activateur De La Transcription 3 Est Impliquée Dans La Croissance Cellulaire Et La Survie De Rhabdomyosarcome Humain Et Les Cellules D'ostéosarcome

BMC Cancer. 2007  |  Pubmed ID: 17598902

Stat3 a été classé comme un proto-oncogène de signalisation et constitutive de Stat3 semble être impliqué dans l'oncogenèse des cancers humains. Toutefois, si la signalisation constitutive de Stat3 joue un rôle dans la survie et la croissance des ostéosarcomes, rhabdomyosarcomes, et sarcomes des tissus mous est encore incertaine.

Implication Des Céramides Astrogliales En Acide Palmitique-induites D'Alzheimer Comme Des Changements Dans Les Neurones Primaires

The European Journal of Neuroscience. Oct, 2007  |  Pubmed ID: 17908174

Un régime riche en graisses a été démontré de manière significative augmenter le risque de développement de la maladie d'Alzheimer (AD), une maladie neurodégénérative caractérisée par histochimie par l'accumulation de bêta-amyloïde (Abeta) protéines dans les plaques séniles et tau hyperphosphorylée chez les enchevêtrements neurofibrillaires. Auparavant, nous avons montré que saturés en acides gras libres (AGL), les acides palmitique et stéarique, causé amyloïdogénèse augmenté et hyperphosphorylaion tau dans les neurones corticaux primaires de rat. Ces effets induits par la FFA observés dans les neurones ont été trouvés à être médiatisée par astrogliale FFA métabolisme. Par conséquent, dans la présente étude, nous avons étudié le mécanisme de base relatives astrogliale FFA métabolisme et AD-comme des changements observés dans les neurones. Nous avons constaté que l'acide palmitique augmenté de façon significative la synthèse de novo de céramide dans les astrocytes, qui à son tour a été impliqué dans l'induction de la production accrue de la protéine Abeta et hyperphosphorylation de la protéine tau. Amyloïdogénèse accrue et de la protéine tau hyperphoshorylation conduire à la formation des deux plus importantes caractéristiques physiopathologiques associés à la MA, ou Abeta plaques séniles et les dégénérescences neurofibrillaires, respectivement. En plus de ces modifications physiopathologiques, AD est également caractérisée par des changements métaboliques certains; un métabolisme anormal du glucose cérébral est l'une des caractéristiques distinctes de la MA. Dans ce contexte, nous avons constaté que l'acide palmitique diminué de manière significative les niveaux de transporteur de glucose astrogliale (GLUT1) et la captation du glucose régulé à la baisse et la libération de lactate par les astrocytes. Nos données présentes établissent un mécanisme sous-jacent par lequel les acides gras saturés induire AD-associé physiopathologique ainsi que des modifications métaboliques, plaçant 'métabolisme des acides gras astrogliales' au centre de la cascade pathogène dans AD.

Identification Des Gènes Qui Régulent De Nombreux Processus Cellulaires Ou Les Réponses Dans Le Contexte De La Lipotoxicité à Des Cellules D'hépatome

BMC Genomics. 2007  |  Pubmed ID: 17925029

Afin de concevoir des traitements efficaces pour complexes, maladies multifactorielles, il est important d'identifier les gènes qui régulent plusieurs processus cellulaires. L'exposition à des niveaux élevés d'acides gras libres (AGL) et facteur de nécrose tumorale alpha (TNF-alpha) modifie plusieurs processus cellulaires, provoquant lipotoxicité. L'accumulation des lipides intracellulaires a été montré pour réduire le lipotoxicité des saturé FFA. Nous émettons l'hypothèse que les gènes qui régulent simultanément l'accumulation de lipides ainsi que la cytotoxicité peut fournir de meilleures cibles pour contrer lipotoxicité des saturé FFA.

Application De L'analyse De Flux Métabolique Pour Identifier Les Mécanismes De Toxicité De L'acide Gras Libres à La Ligne Hépatome De Cellules Humaines

Biotechnology and Bioengineering. Feb, 2008  |  Pubmed ID: 17615559

L'exposition chronique à des niveaux élevés d'acides gras libres (AGL) a été montré pour causer la mort cellulaire (lipotoxicité), mais les mécanismes sous-jacents de la lipotoxicité dans les hépatocytes restent floues. Nous avons précédemment montré que les AGL saturés provoquer une toxicité beaucoup plus grande pour les cellules d'hépatome humain (HepG2) que les insaturés (Srivastava et Chan, 2007). Dans cette étude, l'analyse des flux métaboliques (MFA) a été appliqué pour identifier les changements métaboliques liés à la cytotoxicité de la FFA saturé. Les mesures des flux a révélé que la FFA saturé, le palmitate, a été oxydé à une plus grande mesure que l'oléate de non-toxiques et a la synthèse des triglycérides relativement moins et réduit l'absorption de cystine. Bien que l'oxydation des acides gras avait une forte corrélation positive à la cytotoxicité, les expériences d'inhibiteurs a indiqué que la cytotoxicité n'était pas due à l'oxydation des acides gras plus élevée. Demande de l'AMF a révélé que les cellules exposées à palmitate a également eu un flux constamment réduit de glutathion (GSH), mais la synthèse de novo de céramide plus la synthèse. Ces prédictions ont été confirmées expérimentalement. In silico des analyses de sensibilité a révélé que la synthèse du GSH a été limitée par l'absorption de la cystéine. L'analyse par transfert Western ont révélé que les niveaux de la xCT transporteur cystine, mais pas celle de la GSH-synthèse de l'enzyme glutamyl-cystéine synthase (GCS), ont été réduits dans les cultures palmitate, ce qui suggère la limitation de l'importation cystéine comme la cause de la GSH réduit synthèse. Enfin, complétant avec la N-acétyl-L-cystéine (NAC), une cystéine-fournisseur dont la diffusion ne dépend pas du niveau XCT, réduit la FFA-toxicité significative. Ainsi, les altérations métaboliques qui ont contribué à la toxicité des traitements et a suggéré de réduire la toxicité ont été identifiés, qui ont été validées expérimentalement.

Accordables Résistives Profils D'acides M-DPEG Sur Multicouches De Polyélectrolytes Dans Des Conditions Physiologiques: Modèle De Dépôt Des Réalisé Biomacromolecules

Langmuir : the ACS Journal of Surfaces and Colloids. Jan, 2008  |  Pubmed ID: 18052083

Cet article décrit une nouvelle classe de sel-sensible poly (éthylène glycol) (PEG) monocouches auto-assemblées (SAM) sur le dessus de polyélectrolytes multicouches (PEM) des films. PEM surfaces avec un poly (chlorure de diallyldiméthylammonium) que la couche supérieure sont chimiquement motif par impression par microcontact (PCUM) molécules de PEG oligomères avec un groupe activé d'acide carboxylique terminal (m-dPEG acide). Molécules d'acide du résistif md-poly (éthylène glycol) (m-dPEG) sur les films PEM ont été ensuite enlevée de la surface avec le traitement du sel PEM, convertissant ainsi les surfaces non collantes dans des surfaces adhésives. Les motifs résistifs PEG faciliter le dépôt ordonné de macromolécules telles que des polymères différents, des colorants, des particules colloïdales, les protéines, les liposomes, et les acides nucléiques. En outre, ces motifs PEG agir comme une résistance universelle pour différents types de cellules (par exemple, des cellules primaires, des lignées cellulaires), permettant ainsi une plus grande flexibilité dans une grande variété de fixation de cellules à la surface des matériaux. Les films à motifs ont été caractérisées par microscopie optique et la microscopie à force atomique (AFM). Les modèles PEG ont été retirés de la surface PEM à des conditions salines certains sans affecter les films PEM sous les SAM. Retrait des SAM PEG et la stabilité des films PEM sous lui ont été caractérisés avec ellipsométrie et microscopie optique. Sel et tel pH-sensibles surfaces pourrait conduire à des avancées significatives dans les domaines de l'ingénierie tissulaire, administration ciblée de médicaments, la science des matériaux et la biologie.

Utilisation De Dynamic Analysis Module Carte Gene D'identifier Des Cibles Qui Modulent En Acides Gras Libres Cytotoxicité Induite

Biotechnology Progress. Jan-Feb, 2008  |  Pubmed ID: 18052188

L'objectif de cette étude était d'identifier les voies de régulation de la cytotoxicité induite par les acides gras libres (AGL) dans les cellules humaines (hépatoblastome HepG2/C3A). Profils d'expression génique de cellules HepG2/C3A ont été obtenus à trois points dans le temps, après 24, 48 et 72 h d'exposition à différents types de FFA. D'acides gras saturés (palmitate) a été révélé cytotoxique. Les voies activées par les différents AGL dans les différents points de temps ont été identifiés à l'aide mondiale analyse de la carte génétique du module. AGL insaturés exercée régulation transcriptionnelle principalement dans les premières 24 h, alors que saturé FFA, le palmitate, réglementés voies de production d'énergie, tels que la chaîne de transport d'électrons (CTE) et le cycle de Krebs, dans les premières 24 h. Dans les prochaines 24 h, le palmitate jusqu'à réglementés 36 voies de mort cellulaire pertinentes et régulé à la baisse plusieurs voies de protection, telles que la voie des pentoses phosphates et le glutathion-voies liées. Lors de la finale 24 h, les AGL n'a pas induit la régulation transcriptionnelle significative. Nous avons supposé que le palmitate de cytotoxicité induite par les premiers perturbateurs des voies métaboliques dans les 24 premières heures, ce qui entraîne des changements dans les facteurs, tels que les métabolites ou de molécules de signalisation, qui a ensuite déclenché voies de mort cellulaire pertinentes dans les prochaines 24 h. L'absorption et la libération de 27 métabolites ont été mesurées à élucider davantage les changements métaboliques dans les premières 24 h. Il a été déterminé que les corps cétoniques tels que le bêta-hydroxybutyrate et acétoacétate étaient importants dans la séparation de la toxicité des phénotypes non toxiques. Un modèle de régression a été utilisé pour identifier les gènes pertinents à ces métabolites. Certains des gènes identifiés comme importants ont été validées expérimentalement. Il a été constaté que les gènes ETC comme NADH déshydrogénase et la succinate déshydrogénase ont été impliqués dans la cytotoxicité induite par le palmitate.

Précédent Comportement De Dépistage Du Cancer Comme Prédicteur Du Dépistage Du Cancer Du Côlon Endoscopique Chez Les Femmes âgées De 50 Ans Et Plus, à New York 2002

Journal of Community Health. Feb, 2008  |  Pubmed ID: 18080204

Taux de cancer du côlon de dépistage chez les femmes sont faibles. Que le dépistage du cancer du sein et le cancer du col de l'utérus est associé à un comportement de dépistage du cancer du côlon est inconnue, mais pourrait offrir des possibilités de liaison. Pour identifier la mesure dans laquelle les deux seins et le dépistage du cancer du col utérin augmente l'absorption du dépistage du cancer du côlon chez les femmes à New York. Les femmes moins de 50 ans ont rempli des questionnaires pour le projet de York New cancer. Analyses ont comparé les taux de dépistage du cancer du côlon endoscopique avec le respect des recommandations de dépistage des cancers du sein et le cancer du col de l'utérus. Parmi les 3,386 femmes, 87,8% ont adhéré au cancer du sein et du col des lignes directrices de dépistage du cancer, mais seulement 42,1% avaient reçu endoscopique de dépistage du cancer du côlon. La plupart des femmes avec dépistage du cancer du côlon (95%) ont également rapporté mammographie passé et Pap-frottis. En analyse multivariée, les femmes qui ont adhéré aux deux autres procédures étaient plus susceptibles d'avoir subi un dépistage du cancer du côlon que les femmes n'ayant pas d'antécédents (OR = 4,4; CI = 2,36, 8,20), après prise en compte de l'âge, la race / ethnicité, le statut d'assurance , antécédents familiaux de cancer et le revenu. Les prédicteurs significatifs de dépistage du cancer du côlon endoscopique suivants: âge de plus de 65 ans (OR = 1,63; CI = 1,23, 2,15) avec 50-65 ans comme la référence, aucune assurance-maladie (OR = 2,18; CI = 1,52, 3,13) et une antécédents familiaux de cancer (OR = 1,38; CI = 1,17, 1,61). Dépistage du cancer colorectal reste faible, même chez les femmes qui subissent d'autres tests de dépistage du cancer. Les possibilités d'établir un lien entre les tests de dépistage du cancer afin d'encourager méritent une attention de dépistage du cancer du côlon de plus près.

Des études Expérimentales Et De Calcul D'instruction Protection Tréhalose Des Cellules HepG2 De La Toxicité Induite Par Le Palmitate

Biophysical Journal. Apr, 2008  |  Pubmed ID: 18096630

Comprendre le mécanisme de l'acide gras saturé la toxicité induite par des hépatocytes peut fournir un aperçu des remèdes aux maladies comme l'obésité associée à la cirrhose. Le tréhalose, un disaccharide non réducteur montré pour protéger les protéines et les membranes cellulaires de l'inactivation ou la dénaturation causée par différentes conditions de stress, protège également les hépatocytes de la toxicité induite par le palmitate. Nos résultats suggèrent que le tréhalose sert de capteur de radicaux libres et atténue les dommages causés par le peroxyde d'hydrogène sécrétée par les cellules compromis. Nous observons également que le tréhalose protège les cellules HepG2 en interagissant avec la membrane plasmique pour contrer les changements de la fluidité membranaire induites par le palmitate. Les résultats expérimentaux sont pris en charge par des simulations de dynamique moléculaire des membranes cellulaires modèles qui reflètent étroitement des conditions expérimentales. Des simulations ont été effectuées pour comprendre les interactions spécifiques entre les bicouches lipidiques, le palmitate et le tréhalose. Les résultats des simulations révèlent les premiers stades de la façon dont le palmitate induit des changements biophysiques à la membrane cellulaire et le rôle du tréhalose dans la protection de la structure de la membrane.

D'échantillonnage Et De Recrutement Dans Les études Niveaux Entre Les Populations Urbaines Marginalisées: Les études D'impact

Journal of Urban Health : Bulletin of the New York Academy of Medicine. Mar, 2008  |  Pubmed ID: 18214686

L'usage de drogues illicites en milieu urbain est un problème majeur de santé publique. Une gamme de facteurs individuels sont connus pour influencer la consommation de drogues et ses conséquences, et un certain nombre d'études récentes ont suggéré que le quartier dans lequel vit un individu peut également jouer un rôle. Cependant, des études visant à identifier quartier des déterminants de la consommation de drogues, en particulier chez les populations urbaines marginalisées, doivent surmonter des défis importants, notamment dans le domaine de l'échantillonnage et le recrutement. Une question clé est de définir les quartiers fonctionnels qui sont pertinentes pour les résidents locaux. Une autre provient de la nécessité de goûter à un représentant ou même d'une population diversifiée lorsque l'on étudie les groupes marginalisés tels que les usagers de drogues illicites. Ce sont des problèmes communs qui soulèvent des défis particuliers lorsque les deux doivent être abordées dans la même étude. Par exemple, de nombreuses méthodes d'échantillonnage pour les études au niveau du quartier ont inclus une certaine forme de l'échantillon aléatoire de ménages, mais cela peut ignorer systématiquement les populations marginalisées. D'autre part, l'échantillonnage approches couramment utilisées dans les études de populations cachées telles que le renvoi de la chaîne, boule de neige, et, plus récemment, répondant axée sur l'échantillonnage, généralement s'étendre au-delà une zone géographique "de voisinage". Nous décrivons l'organisation et la justification des études d'impact à New York comme un exemple de cas sur la façon dont ces questions peuvent être adressées.

Short Time-series Analyse De Microarray: Méthodes Et Défis

BMC Systems Biology. 2008  |  Pubmed ID: 18605994

La détection et l'analyse de l'expression génique l'état d'équilibre est devenu une routine. Les séries chronologiques sont des puces de l'intérêt croissant pour les biologistes des systèmes pour déchiffrer la nature dynamique et complexité de la réglementation des biosystèmes. La plupart des données de biopuces temporelles contenir qu'un nombre limité de points dans le temps, donnant lieu à court de séries chronologiques de données, qui impose des défis pour les méthodes traditionnelles d'extraction d'information significative. Pour obtenir des informations utiles à partir de la richesse des données de la série de courte durée il faut s'attaquer aux problèmes qui se posent en raison de l'échantillonnage limité. Les efforts actuels ont montré des résultats prometteurs dans l'amélioration de l'analyse des données de biopuces courtes séries chronologiques, bien que des défis demeurent. Ce commentaire porte sur les progrès récents dans les méthodes d'analyse de séries de courte durée, y compris la simplification des approches fondées sur l'intégration et de la multi-source d'information. Néanmoins, d'autres études et de développement de méthodes de calcul sont nécessaires pour fournir des solutions pratiques pour exploiter pleinement le potentiel de ces données.

Le Stress Associé à L'hormone De, La Norépinéphrine, Augmente Les Niveaux De Prolifération Et De L'IL-6 De L'homme Du Canal Pancréatique Des Cellules épithéliales Et Peut être Inhibée Par L'agent Alimentaire, Le Sulforaphane

International Journal of Oncology. Aug, 2008  |  Pubmed ID: 18636164

Dans la littérature actuelle, il existe des preuves que des facteurs psychologiques peuvent influer sur l'incidence et la progression de certains cancers. Les données obtenues à partir de modèles animaux confirment l'hypothèse que le stress peut être un cofacteur. Les mécanismes sous-jacents pour l'association entre les facteurs psychologiques et le cancer du pancréas sont très mal connus. Dans cette étude, nous avons examiné la croissance possible, de promouvoir les effets de l'hormone du stress associée, la noradrénaline, sur humaines immortalisées du canal pancréatique des cellules épithéliales. Nos résultats suggèrent que la noradrénaline peut augmenter la prolifération des cellules de l'homme du canal pancréatique des cellules épithéliales. Nous avons également évalué la capacité de la noradrénaline pour induire l'interleukine-6 ​​(IL-6), l'interleukine-10 (IL-10), et facteur de croissance vasculaire endothéliale (VEGF). Tous ce qui peut favoriser l'oncogenèse des humaines immortalisées du canal pancréatique des cellules épithéliales. Nous avons constaté que la noradrénaline peut augmenter les IL-6 et VEGF, mais pas les niveaux d'IL-10 sécrétée par l'homme du canal pancréatique des cellules épithéliales. Depuis la noradrénaline peut augmenter la prolifération des cellules de l'homme du canal pancréatique des cellules épithéliales, nous avons effectué d'autres tests pour voir si les agents alimentaires, le sulforaphane et le resvératrol, peuvent inhiber la noradrénaline médiation augmentations de la prolifération cellulaire dans l'homme du canal pancréatique des cellules épithéliales. Fait intéressant, nos résultats ont démontré que le sulforaphane, mais pas le resvératrol inhibe la noradrénaline médiation augmentation de la viabilité des cellules humaines dans du canal pancréatique des cellules épithéliales. En outre, le sulforaphane inhibe également la noradrénaline médiation augmentation des niveaux d'IL-6, mais pas les niveaux de VEGF. Notre étude est la première à démontrer que le stress associé à l'hormone, la noradrénaline, peut augmenter la prolifération cellulaire et de l'IL-6 niveaux de l'homme du canal pancréatique des cellules épithéliales, qui peuvent être inhibées par le sulforaphane, un agent chimio-prévention et un composé naturel des légumes crucifères .

Les Banques Combinatoires De Surrobody

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Aug, 2008  |  Pubmed ID: 18664586

Un type unique de bibliothèques combinatoires de protéines a été construit. Ces bibliothèques sont basés sur le récepteur de cellule pré-B (pré-RCO). Le pré-BCR est une protéine qui est produite pendant le développement normal du répertoire d'anticorps. La différence de celle des anticorps canoniques, la sous-unité de pré-RCO est un trimère qui est composé d'une chaîne lourde d'anticorps lié avec deux chaînes légères de substitution (SLC) composants. Bibliothèques combinatoires à partir de ces protéines pré-BCR dans lequel diverses chaînes lourdes sont appariées avec un fixe SLC ont été exprimées dans Escherichia coli, de mammifères et les systèmes de phagemides. Ces bibliothèques contiennent des membres qui possèdent une affinité nanomolaire pour l'antigène. Nous appellerons ce type de liaison à l'antigène une protéine "surrobody" pour le distinguer de la molécule d'anticorps canonique.

Cerveau Région-spécificité De L'acide Palmitique-induites Anomalies Associées à La Maladie D'Alzheimer

BMC Research Notes. 2008  |  Pubmed ID: 18710535

La maladie d'Alzheimer (AD) est un processus progressif, une maladie neurodégénérative qui touche principalement les du cerveau antérieur basal, le cortex et l'hippocampe alors que le cervelet est relativement épargnée. La raison derrière cela des dommages au cerveau spécifique à la région en l'an n'est pas bien comprise. Ici, nous présentons nos données suggèrent "différentiel métabolisme des acides gras libres dans les différentes zones du cerveau" comme un facteur potentiellement important dans l'origine des dommages propres à la région observée dans le cerveau MA.

Analyse Du Niveau De Gene Module: Identification De Réseaux Et De La Dynamique

Current Opinion in Biotechnology. Oct, 2008  |  Pubmed ID: 18725293

Nature présente la conception modulaire dans les systèmes biologiques. Analyse au niveau du gène module est basé sur ce concept de module, dans le but de comprendre la conception du réseau biologique et le comportement des systèmes dans la maladie et le développement en mettant l'accent sur les modules de gènes plutôt que les gènes individuels. Analyse au niveau du module a été largement appliqué dans l'analyse du génome niveau de l'ensemble, explorer l'organisation des systèmes biologiques de l'identification des modules à la reconstruction de réseaux de modules et analyse de la dynamique de modules. Une telle perspective niveau du module fournit une représentation de haut niveau du scénario réglementaire et la conception de systèmes biologiques, promet de révolutionner notre vision de la biologie des systèmes, le génie génétique ainsi que les mécanismes des maladies et la médecine moléculaire.

Athsq1 Est Un Locus Modificateur Athérosclérose Avec Des Effets Dramatiques Sur L'aire De La Lésion Et D'accumulation De Prominent De Versican

Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. Dec, 2008  |  Pubmed ID: 18818413

La sensibilité à l'athérosclérose est génétiquement complexe, et des gènes modificateurs qui ne fonctionnent pas via les facteurs de risque traditionnels sont largement inconnues. Une approche génétique de la souris permet de simplifier l'analyse génétique et fournir des outils pour des études mécanistiques.

Capteur De Signal Et Activateur De Transcription 3 Activation Est Associée à La Croissance Cellulaire Et La Survie De Cancer De La Vessie

Molecular Cancer. 2008  |  Pubmed ID: 18939995

L'activation constitutive de transduction de signal et activateur de la transcription 3 (Stat3) la voie de signalisation joue un rôle important dans plusieurs cancers humains. Activation de Stat3 dépend de la phosphorylation à l'705 résidu tyrosine-kinases par amont et postérieure de translocation nucléaire après dimérisation. Il reste difficile de savoir si Stat3 oncogénique voie de signalisation est impliquée dans l'oncogenèse du cancer de la vessie.

Corrélats De L'utilisation De Méthadone Illicite à New York: Une étude Transversale

BMC Public Health. 2008  |  Pubmed ID: 18957116

Malgré l'inquiétude croissante sur l'utilisation de méthadone illicite aux États-Unis et d'autres pays, il ya peu de données sur la prévalence et les corrélats de l'utilisation de méthadone dans les grandes zones urbaines. Nous avons évalué la prévalence et examiné les corrélats de la vie et récente utilisation de la méthadone illicite à New York City (NYC).

Un Cadre Bayésien Pour Le Modèle De Régression Fondée Sur La Connaissance En Micro-array Analyse Des Données

International Journal of Data Mining and Bioinformatics. 2008  |  Pubmed ID: 19024497

Ce document aborde le problème des données éparses dans le modèle de régression linéaire, à savoir le nombre de variables est significativement plus grand que le nombre des points de données pour la régression. Nous supposons que, en plus des points de données mesurées, la connaissance a priori sur les variables d'entrée peuvent être fournis sous la forme de la similitude par paire. Nous avons présenté un cadre bayésien complet pour exploiter efficacement les informations de la similitude des variables d'entrée pour la régression linéaire. Les études empiriques avec des données d'expression génique montrent que les erreurs de régression peut être réduit de manière significative en intégrant les informations provenant de l'ontologie similitude génétique.

Une Nouvelle Méthode Information Intégrée Gene Ontology Pour Le Clustering Non Supervisé Et Sélection Des Fonctionnalités

PloS One. 2008  |  Pubmed ID: 19052637

Parmi les principaux objectifs de l'analyse des microréseaux est l'identification de gènes qui pourraient distinguer entre les différents phénotypes (sélection de caractéristiques). Des études antérieures indiquent que l'incorporation de l'information préalable de la fonction des gènes des caractéristiques pourraient aider à identifier physiologiquement pertinents. Toutefois, les méthodes actuelles qui intègrent les informations préalables fonctionnels ne fournit pas une estimation relative de l'effet de gènes différents sur les processus biologiques d'intérêt.

Primary Neuron/Astrocyte Co-Culture on Polyelectrolyte Multilayer Films: A Template for Studying Astrocyte-Mediated Oxidative Stress in Neurons

Advanced Functional Materials. Jan, 2008  |  Pubmed ID: 25400537

We engineered patterned co-cultures of primary neurons and astrocytes on polyelectrolyte multilayer (PEM) films without the aid of adhesive proteins/ligands to study the oxidative stress mediated by astrocytes on neuronal cells. A number of studies have explored engineering co-culture of neurons and astrocytes predominantly using cell lines rather than primary cells owing to the difficulties involved in attaching primary cells onto synthetic surfaces. To our knowledge this is the first demonstration of patterned co-culture of primary neurons and astrocytes for studying neuronal metabolism. In our study, we used synthetic polymers, namely poly(diallyldimethylammoniumchloride) (PDAC) and sulfonated poly(styrene) (SPS) as the polycation and polyanion, respectively, to build the multilayers. Primary neurons attached and spread preferentially on SPS surfaces, while primary astrocytes attached to both SPS and PDAC surfaces. SPS patterns were formed on PEM surfaces, either by microcontact printing SPS onto PDAC surfaces or vice-versa, to obtain patterns of primary neurons and patterned co-cultures of primary neurons and astrocytes. We further used the patterned co-culture system to study the neuronal response to elevated levels of free fatty acids as compared to the response in separated monoculture by measuring the level of reactive oxygen species (ROS; a widely accepted marker of oxidative stress). The elevation in the ROS levels was observed to occur earlier in the patterned co-culture system than in the separated monoculture system. The results suggest that this technique may provide a useful tool for engineering neuronal co-culture systems, that may more accurately capture neuronal function and metabolism, and thus could be used to obtain valuable insights into neuronal cell function and perhaps even the pathogenesis of neurodegenerative diseases.

L'accumulation Du Versican Dans Les Nodules De L'hyperplasie Bénigne De La Prostate

The Prostate. Feb, 2009  |  Pubmed ID: 18819099

Protéoglycanes, un groupe complexe de la matrice extracellulaire (ECM), les molécules sont élevées dans l'hyperplasie bénigne de la prostate (HBP). Versican est un protéoglycane présent dans le tissu du stroma de la prostate. L'expression est élevée Versican dans les tissus avec une prolifération accrue. Sur la base de ces observations, nous avons déterminé l'étendue et la distribution de l'expression dans les prostates versicane atteints d'HBP.

Mediated Multicouche Avant Et Transfection De SiRNA à Motifs Utilisant Linéaire-PEI à Prolongées Ratios N / P

Acta Biomaterialia. Jun, 2009  |  Pubmed ID: 19217360

D'apport de gène à partir d'un substrat dépend, en partie, sur le complexe acide nucléique-vecteur qui est lié à la surface et les propriétés adhésives de la surface de cellules. Ici, nous présentons une méthode pour fournir les modèles de petits ARN interférents (siRNA) qui capitalisent sur une méthode de transfection de l'avant (transfection par l'introduction de complexes réactif de transfection de siRNA sur des cellules en plaqué); ici notée que la transfection de l'avant multicouche médiation (MFT). Ce procédé se sépare de la livraison de substrat à médiation par les propriétés de cellules adhésives de la surface. pH sensibles couche par couche (LBL) multicouches assemblés ont été utilisés comme la plate-forme de livraison et de la technique d'impression par microcontact (microCP) a été utilisé à des nanoparticules de motif de réactif de transfection de siRNA-complexes SUR DES multicouches dégradables. Efficace MFT dépendent de la formulation optimale des nanoparticules. 25 kDa linéaire polyéthylèneimine (LPEI) a été optimisé que l'agent de transfection siARN pour la transfection de l'avant normale (NFT) des nanoparticules. Un large éventail de LPEI-siARN azote / phosphate (N / P) (ratios allant de 5 à 90) a été évaluée pour les quantités relatives de siARN incorporés dans les nanoparticules, la taille des nanoparticules et de l'efficacité NFT. Tout le siRNA a été incorporé dans des nanoparticules à N / P proche de 90. L'augmentation de la quantité de siARN incorporé dans des nanoparticules, avec l'augmentation de N / P en corrélation avec un changement linéaire du bleu dans le spectre d'absorbance UV / visible (UV / VIS) des nanoparticules LPEI-siRNA. L'efficacité NFT supérieure à 80% a été atteint à la cytotoxicité minimale à N / P de 30 et de la concentration de 200 nM siRNA. De même, l'efficacité MFT 60% a été atteint pour LPEI-siRNA nanoparticules à N / P des ratios supérieurs à 30.

Répression De La Médiation PKR Palmitate-apoptose Induite Par Les Cellules HepG2 Par La Réglementation De Bcl-2

Cell Research. Apr, 2009  |  Pubmed ID: 19259124

La présente étude montre que la protéine kinase ARN double-brin-dépendante (PKR) réglemente le niveau d'expression et la phosphorylation de Bcl-2 et joue un rôle anti-apoptotique dans les cellules humaines de carcinome hépatocellulaire (HepG2). Dans divers types de cellules, saturés en acides gras libres (AGL), tels que le palmitate, ont été montrés à induire l'apoptose cellulaire par plusieurs mécanismes. Palmitate régule à la baisse de l'activité de la PKR et diminue ainsi le niveau de protéine Bcl-2, médiée en partie par l'activation réduite du facteur de transcription NF-kappaB. En plus du niveau de la protéine Bcl-2, la phosphorylation de la protéine Bcl-2 à différents résidus d'acides aminés, tels que Ser70 et Ser87, est également important dans la régulation de l'apoptose cellulaire. La diminution de la phosphorylation de la protéine Bcl-2 à Ser70 lors de l'exposition à palmitate est médiée par l'inhibition de la PKR et peut-être par c-Jun N-terminal kinase (JNK), alors que la phosphorylation de la protéine Bcl-2 à Ser87 n'est pas affectée par le palmitate ou PKR . En résumé, la médiation PKR la réglementation de la teneur en protéines et l'état de phosphorylation de Bcl-2, en fournissant un nouveau mécanisme de l'apoptose induite par le palmitate-dans les cellules HepG2.

La Biologie Des Systèmes Pour L'identification Des Voies De Toxicité Du Foie

BMC Proceedings. 2009  |  Pubmed ID: 19278558

Drug-toxicité induite par le foie est l'un des principales causes d'insuffisance hépatique aiguë aux Etats-Unis, dépassant toutes les autres causes combinées. L'objectif de cet article est de décrire les méthodes de biologie des systèmes pour identifier les voies impliquées dans la toxicité hépatique induite par les acides gras libres (FFA) et du facteur de nécrose tumorale (TNF)-alpha dans les cellules humaines (hépatoblastome HepG2/C3A). Approches de la biologie des systèmes ont été développés pour intégrer les données à niveaux multiples, c'est à dire, l'expression des gènes, le profil des métabolites, des mesures de toxicité et d'une connaissance a priori d'identifier les gènes cibles de la toxicité hépatique de modulation. Cibles qui modulent la toxicité hépatique, in vitro, ont été calcul prévu et certains objectifs ont été validés expérimentalement.

Culture Clash: Une Occasion Manquée

Journal of Developmental and Behavioral Pediatrics : JDBP. Apr, 2009  |  Pubmed ID: 19363368

CAS: Erasto est un nourrisson né à terme né par accouchement par voie vaginale à un gravida 7 par 7 femme en Somalie par les soins prénatals plein aux États-Unis. Sa mère a eu un diabète gestationnel. La livraison a été compliquée par une détresse respiratoire et une admission d'urgence à l'unité néonatale de soins intensifs pour une évaluation plus poussée de la maladie pulmonaire possible et une maladie cardiaque congénitale. Un stagiaire féminine a été attribué en pédiatrie pour mettre à jour la mère Erasto sur l'état du bébé et d'obtenir le consentement d'un positionnement de la ligne intravasculaire. Quand elle entra dans la chambre pour parler à la mère, plusieurs membres de la famille d'enchaînement à 3 générations étaient avec la mère du bébé. Ils étaient tous des femmes, à l'exception du père de Erasto qui a été informé de l'état clinique du bébé par le médecin de sexe masculin néonatale plusieurs minutes plus tôt. Grâce à un traducteur par téléphone, le stagiaire a expliqué à la mère de Erasto que son bébé peut avoir des problèmes cardiaques et pulmonaires qui peuvent être liées à son diabète gestationnel. À ce stade, de nombreux membres de la famille a parlé en même temps et avec enthousiasme. Certains ont accusé le stagiaire de garder le bébé dans l'unité néonatale de soins intensifs "pour faire plus d'argent», et d'autres ont dit qu'ils allaient la poursuivre "si quelque chose arrivait à Erasto." La mère a nié qu'elle avait le diabète gestationnel, et a affirmé que parce qu'elle «croyait en Dieu ... rien ne va pas avec mon bébé." Le stagiaire n'a pas été préparé pour cette réponse et elle se demandait, «Qu'est-ce qui a mal tourné?"

Le Rôle De L'insaturation Des Acides Gras Dans Minimisant Les Changements Biophysiques Sur La Structure Et Les Effets Locaux Des Membranes Bicouches

Biochimica Et Biophysica Acta. Jul, 2009  |  Pubmed ID: 19371719

Étudier les effets des saturés et des acides gras insaturés sur les membranes biologiques et le modèle (liposomes) pourrait donner un aperçu de la contribution des effets biophysiques sur la cytotoxicité observée avec les acides gras saturés. Expériences in vitro suggèrent que les acides gras insaturés, tels que l'oléate et linoléate, sont moins toxiques, et ont moins d'impact sur la fluidité de la membrane. Pour comprendre et évaluer les changements biophysiques dans la présence de différents acides gras, nous avons effectué des analyses informatiques de liposomes modèle avec du palmitate, l'oléate, linoléate et. Les résultats des calculs indiquent que la chaîne d'acide gras insaturé sert de stabilisateur de membrane en empêchant les changements à la fluidité de la membrane. Basé sur une analyse tessellation de Voronoï, les acides gras insaturés ont des propriétés structurelles qui peuvent réduire le lipide commande dans les membranes modèles. En outre, l'analyse indique une liaison hydrogène niveau plus uniforme de la membrane hydratation en présence d'oléate et linoléate par rapport à palmitate. Au total, ces observations issues des études informatiques fournir un mécanisme possible par lequel les acides gras insaturés de minimiser les changements biophysiques et de protéger la membrane cellulaire et de la structure. Pour corroborer nos conclusions, nous avons également réalisé une étude de fuite liposomale pour évaluer comment les différents acides gras altérer l'intégrité membranaire des liposomes. Ce a montré que le palmitate, un acide gras saturé, provoquée supérieure déstabilisation de liposomes (suite "percé») que l'oléate, un acide gras insaturé.

Reconstruire Modulaires Réseaux De Gènes Spécifiques Par Phénotype Axée Sur Le Savoir Factorisation De Matrice

Bioinformatics (Oxford, England). Sep, 2009  |  Pubmed ID: 19542155

MOTIVATION: reconstruire des réseaux de gènes à partir de données de microarray a fourni des informations sur les processus cellulaires mécaniste. Une méthode de structure populaire d'apprentissage, l'inférence bayésienne réseau, a été utilisée pour déterminer la topologie du réseau en dépit de ses lacunes, à savoir le coût élevé-de calcul lors de l'analyse un grand nombre de gènes et de l'inefficacité dans l'exploitation de connaissances préalables, telles que l'information co-régulation de la les gènes. Pour remédier à ces limitations, nous mettons en place une méthode alternative, fondée sur la connaissance de factorisation de matrice (KMF) cadre, de reconstituer le phénotype spécifiques des réseaux de gènes modulaires. RÉSULTATS: Compte tenu de la reconstruction de réseaux de gènes en tant que problème de la factorisation de matrice, nous utilisons d'abord les données d'expression génique pour estimer une matrice de corrélation, puis factoriser la matrice de corrélation pour récupérer les modules de gènes et les interactions entre eux. Une connaissance préalable de Gene Ontology est intégré dans la factorisation de la matrice. Nous avons appliqué cet algorithme à KMF carcinome hépatocellulaire (HepG2) des cellules traitées avec des acides gras libres (AGL). En comparant les réseaux de modules pour les différentes conditions, nous avons identifié les modules spécifiques qui sont impliqués dans l'attribution du phénotype cytotoxique induite par le palmitate. Une analyse plus poussée des modules de gènes des conditions différentes suggéré gènes individuels qui jouent des rôles importants dans la cytotoxicité induite par le palmitate. En résumé, KMF peuvent intégrer efficacement les données d'expression génique avec une connaissance préalable, fournissant ainsi une puissante méthode de reconstruction des réseaux de gènes spécifiques et phénotype-précieuses indications sur les mécanismes qui régissent le phénotype.

Endo-laparoscopique De Réduction Et De Résection De Intussuception Gastro Des Tumeurs Stromales Gastro Intestinales (GIST): Un Traitement Endoscopique Et Laparoscopique Synchrone

Surgical Laparoscopy, Endoscopy & Percutaneous Techniques. Jun, 2009  |  Pubmed ID: 19542829

Tumeur stromale gastro-intestinale (GIST) se produit généralement dans l'estomac. Nous tenons à signaler une présentation rare de GIST gastrique avec intussuception gastroduodénale. Un patient présentant des antécédents connus de GIST gastrique à fond pendant 10 ans, présentés au service des urgences avec des douleurs épigastriques récurrentes, la fonction hépatique dérangé, et hyperamylasémie. La tomodensitométrie de l'abdomen a montré intussuception de la GIST gastrique dans le duodénum. Opération d'urgence à la réduction endoscopique synchrone et résection cunéiforme laparoscopique a été réalisée et le patient avait récupéré sans incident. Ce traitement simultané endoscopique et laparoscopique devrait être envisagée pour cette complication rare de la GIST.

Une Analyse Dynamique De L'IRS-PKR Signalisation Dans Les Cellules Du Foie: Une Approche De Modélisation Discrète

PloS One. 2009  |  Pubmed ID: 19956598

Un défi majeur dans la biologie des systèmes est de développer une compréhension détaillée dynamique des fonctions et des comportements dans un système cellulaire particulier, qui dépend des éléments et leurs inter-relations dans un réseau spécifique. La modélisation informatique joue un rôle essentiel dans l'étude de la dynamique des réseaux et de découvrir les mécanismes sous-jacents. Ici, nous avons proposé une approche systématique qui intègre la modélisation dynamique et discrète des données expérimentales pour reconstruire un réseau phénotype spécifique de la signalisation cellulaire. Une analyse dynamique du système signalisation de l'insuline dans les cellules hépatiques fournit une application de proof-of-concept de la méthodologie proposée. Notre groupe a récemment révélé que la protéine kinase ARN double-brin-dépendante (PKR) joue un rôle important dans le réseau signalisation de l'insuline. Le comportement dynamique du réseau signalisation de l'insuline est à l'écoute par une variété de voies de rétroaction, dont beaucoup ont le potentiel de diaphonie avec PKR. Compte tenu de la complexité de la signalisation de l'insuline, il est inefficace de tester expérimentalement toutes les interactions possibles dans le réseau afin de déterminer quelles voies fonctionnent dans notre système cellulaire. Notre modèle discret dynamique fournit un modèle de cadre de silico qui intègre les interactions potentielles et évalue les contributions des diverses interactions sur le comportement dynamique du réseau de signalisation. Les simulations effectuées avec le modèle généré hypothèse vérifiable sur la réponse du réseau à des perturbations, qui ont été évaluées expérimentalement pour identifier les voies qui fonctionnent dans notre système des cellules hépatiques notamment. La modélisation en combinaison avec les résultats expérimentaux amélioré notre compréhension de la signalisation de l'insuline dynamique et a aidé à générer un réseau spécifique au contexte de signalisation.

Analyse Intégrative De La Progression Du Cancer Et La Cohérence Pathway

Proteomics. Clinical Applications. Apr, 2009  |  Pubmed ID: 21136972

Nous avons analysé les voies du cancer dans le KEGG (Encyclopédie de Kyoto des gènes et génomes) de bases de données. La base de données fournit un collectif de signalisation de la voie membres impliqués dans la progression du cancer. Cependant, les voies de cancer KEGG, contrairement à des voies de signalisation, n'ont pas été analysés de façon approfondie avec l'expression des gènes et des données de mutation. Nous avons transformé la voie du cancer colorectal dans X discrètes et les échelles Y et analysé les niveaux d'expression relatifs des échantillons adénome et de carcinome ainsi que la répartition des objectifs de mutation. L'échelle X correspond à l'emplacement en aval dans une voie, tandis que l'échelle Y correspond à l'étape de la tumeur. Les valeurs d'expression des gènes des premiers membres de la voie de scène sont significativement plus élevés que le reste des membres de la voie dans les tissus adénome colorectal. La voie du cancer colorectal montre un certain degré de cohérence dans les échantillons de carcinome. Les paires de gènes corrélés responsables de la cohérence de la voie de cancer colorectal dans les échantillons de carcinome sont pris en charge, en partie, par la littérature et peut suggérer de nouvelles associations de réglementation. Enfin, il existe des objectifs de mutation de plus dans le noyau ainsi que les derniers stades tumoraux de la voie de cancer colorectal KEGG.

Polyinosine-polycytidylique Acide Stimule L'accumulation Versican Dans La Matrice Extracellulaire Promouvoir L'adhésion Des Monocytes

American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. Jul, 2010  |  Pubmed ID: 19717812

Les infections virales sont connues pour aggraver l'asthme et autres maladies pulmonaires dans lesquelles les processus inflammatoires chroniques sont impliqués, mais le mécanisme n'est pas bien comprise. La virale mimétique, polyinosine-polycytidylique acide, provoque l'accumulation d'un versicane et hyaluronane enrichi la matrice extracellulaire (ECM) par les fibroblastes pulmonaires humains dotés de capacités accrues pour l'adhésion des monocytes. Le quintuplement de la rétention dans ce versicane ECM est dû au cloisonnement altérée, avec une dégradation réduite de cellules de la couche associée versicane, plutôt que d'une augmentation de l'accumulation totale dans la culture. Ceci est cohérent avec les niveaux d'ARNm a diminué pour tous les variants d'épissage versicane. Réduire la dégradation versicane est en outre soutenue par de faibles niveaux de l'épitope, DPEAAE, un produit de la digestion versicane par un disintégrine-like et métallopeptidase avec des enzymes de type thrombospondine 1 motif, dans l'ECM. La distribution d'hyaluronane est également modifiée avec une augmentation de 3,5 fois dans la couche cellulaire. Pulse-chase des études de l'acide hyaluronique radiomarqué montrent une réduction de 50% dans le taux de perte de la couche de cellules de plus de 24 heures. Formation d'monocytes retenue, l'hyaluronidase-sensibles ECM peut être bloquée par la présence d'anticorps anti-versicane. En comparaison, les fibroblastes pulmonaires humains traités avec les cytokines, l'IL-1beta ainsi que le TNF-alpha, synthétiser des quantités accrues de l'acide hyaluronique, mais ne conservent pas le ou versicane dans l'ECM, qui, à son tour, ne conserve pas les monocytes. Ces résultats mettent en évidence un rôle important pour versicane dans la liaison hyaluronane-dépendante des monocytes à l'ECM des fibroblastes pulmonaires stimulées par polyinosine-polycytidylique acide.

Effet Différentiel D'hydrocarbures Saturés Et Acides Gras Libres Sur La Génération De L'adhésion Des Monocytes Et Des Facteurs Chimiotactiques Par Les Adipocytes: La Dissociation De L'hypertrophie Des Adipocytes De L'inflammation

Diabetes. Feb, 2010  |  Pubmed ID: 19934003

L'obésité est associée à l'accumulation de monocytes-macrophages dans le tissu adipeux. Auparavant, nous avons montré que la production de glucose stimulée par par les adipocytes de sérum amyloïde A. (ASA), la protéine chimiotactique des monocytes (MCP) -1, et l'acide hyaluronique (HA) a facilité l'accumulation de monocytes L'objectif actuel est de déterminer comment les éléments nutritifs autre grand, les acides gras libres (AGL), affecte ces molécules et de recrutement des monocytes par les adipocytes.

Effet Synergique De L'AMPc Et Palmitate Dans La Promotion De Détérioration De La Fonction Mitochondriale Et La Mort Cellulaire Dans Les Cellules HepG2

Experimental Cell Research. Mar, 2010  |  Pubmed ID: 20026039

Saturés en acides gras libres (AGL), par exemple le palmitate, ont longtemps été montré pour induire une toxicité et la mort cellulaire dans divers types de cellules. Dans cette étude, nous démontrons que l'AMPc amplifie l'effet synergique du palmitate sur l'induction de la mort cellulaire dans la ligne hépatocellulaire cellule humaine cancer, les cellules HepG2. Elevation du niveau d'AMPc dans les cellules traitées palmitate conduit à une fragmentation accrue des mitochondries, mitochondriales espèces réactives de l'oxygène (ROS) et la biogenèse mitochondriale. La fragmentation mitochondriale précède mitochondrial génération de ROS et la biogenèse mitochondriale, et peuvent contribuer à une surproduction mitochondriale de ROS et après la biogenèse mitochondriale. La fragmentation des mitochondries a également facilité la libération de protéines mitochondriales cytotoxiques, tels que Smac, de l'activation subséquente des mitochondries et des caspases. Cependant, la mort cellulaire induite par le palmitate et de l'AMPc était caspase-indépendante et surtout nécrotique.

Synthèse Et D'organisation De L'acide Hyaluronique Et Versican Les Cellules Souches Embryonnaires Subissant La Différenciation Corps Embryoïdes

The Journal of Histochemistry and Cytochemistry : Official Journal of the Histochemistry Society. Apr, 2010  |  Pubmed ID: 20026669

Les cellules souches embryonnaires (CSE) de fournir un modèle pratique pour sonder la dynamique moléculaire et cellulaire de la morphogenèse des cellules de développement. Différenciation in vitro par l'intermédiaire d'ESC corps embryoïdes (EBS) récapitule de nombreux aspects de premiers stades de développement, y compris la transition épithéliale-mésenchymateuse (EMT) de cellules pluripotentes dans la descendance plus différenciée. L'acide hyaluronique et versicane sont importants médiateurs extracellulaires de processus EMT, mais l'expression temporelle et la distribution spatiale de ces matrice extracellulaire (ECM) des molécules lors de la différenciation EB n'est pas encore défini. Ainsi, l'objectif de cette étude était d'évaluer la synthèse et l'organisation de l'acide hyaluronique et versicane en utilisant CES murins cours de la différenciation EB. Hyaluronane et versicane (V0 et isoformes V1), visualisée par immunohistochimie et évaluées biochimiquement, accumulée à l'intérieur EB au cours de la différenciation. Fait intéressant, des quantités croissantes d'un fragment protéolytique de 70 kDa de versicane ont également été détectés au fil du temps, avec ADAMTS-1 et -5 expression de la protéine. CES a exprimé chacun des synthases acide hyaluronique (HAS) -1, -2, -3 et variants d'épissage et versicane (V0, V1, V2 et V3) à travers la différenciation EB, mais a-2, V0, V1 et ont été exprimées lors de manière significative des niveaux accrus à chaque point de temps examinée. L'acide hyaluronique et versicane exposé chevauchement des profils d'expression au sein de EB dans les régions de faible densité cellulaire, et l'expression versicane a été exclu de grappes de cellules épithéliales (cytokératine-positives), mais a été enrichi dans le voisinage de mésenchymateuses (N-cadhérine-positif) des cellules. Ces résultats indiquent que l'acide hyaluronique et versicane synthétisé par les CES au sein de microenvironnements EB sont associées aux processus d'EMT et, en outre penser que les molécules produites de façon endogène ECM jouer un rôle dans la différenciation ESC. Ce manuscrit contient en ligne du matériel supplémentaire à http://www.jhc.org. S'il vous plaît visitez cet article en ligne pour voir ces matériaux.

Facteur De Croissance Dérivé Des Plaquettes Régule Différentiellement La Modification D'expression Et De Post-traductionnelle De Versican Par Cellules Musculaires Lisses Artérielles Grâce Distinct Protéine Kinase C Et Extracellulaires Kinases Signal-regulated

The Journal of Biological Chemistry. Mar, 2010  |  Pubmed ID: 20042606

La synthèse des protéoglycanes comporte des étapes qui régulent à la fois des protéines et glycosaminoglycanes (GAG) de synthèse, mais il est difficile de savoir si ces deux voies sont régis par les mêmes voies de signalisation ou différents. Nous avons donc étudié les voies de signalisation impliquées dans le facteur de croissance dérivé des plaquettes (PDGF) médiées par l'augmentation des protéines de base versicane et la synthèse de la chaîne de GAG ​​dans les cellules musculaires lisses artérielles (ASMCs). Traitement de PDGF ASMCs entraîné synthèse accrue des protéines versicane noyau et de l'allongement des chaînes GAG attachés à la protéine de core versicane. Les effets du PDGF sur l'ARNm versicane ont été bloqués par inhibiteur de kinase, soit la protéine C (PKC) ou les voies ERK, alors que l'effet d'allongement GAG du PDGF a été bloqué par inhibition de la PKC, mais pas par l'inhibition de ERK. Intéressant, la synthèse des protéines de blocage, en présence de cycloheximide abolit l'effet de PDGF, mais pas en présence d'xyloside, indiquant que la synthèse de GAG ​​qui résulte de l'activation de PKC est indépendant de la synthèse protéique de novo. PDGF également stimulé une augmentation de la chondroïtine-6-sulfate de chondroïtine à-4-sulfate de ratio de chaînes de GAG ​​sur versicane, et cet effet a été bloqué par les inhibiteurs de la PKC. Ces données montrent que l'activation PKC est suffisante pour provoquer l'allongement de la chaîne GAG, mais la PKC et l'activation de ERK sont nécessaires pour l'ARNm versicane expression de la protéine de base. Ces résultats indiquent que différentes voies de signalisation de contrôler différents aspects de PDGF-stimulé la biosynthèse versicane par ASMCs. Ces données seront utiles dans la conception de stratégies visant à interférer avec la synthèse de ce protéoglycane dans divers états pathologiques.

La Reconnaissance De L'asymétrie Par SiRNA ARN TAR Binding Protein

Biochemistry. Apr, 2010  |  Pubmed ID: 20184375

La reconnaissance de petits ARN interférents (siRNA) par le complexe ARN-induite silence (RISC) et son précurseur, le chargement complexe RISC (RLC), est une étape clé dans la voie de l'interférence ARN qui contrôle la dégradation de l'ARNm spécifique de la séquence suivante. Chez la drosophile, la sélection du brin guide a été démontré être médiée par la protéine RLC R2D2, qui détecte la stabilité d'hybridation relative entre les deux extrémités de la siARN. Une protéine avec fonction similaire n'a pas encore été identifié avec certitude chez les humains. Nous montrons ici que l'homme ARN TAR protéine de liaison (TRBP) seul peut lier siRNA in vitro et le sens de leur asymétrie. Nous montrons aussi que TRBP peut se lier de 21 nucléotides ARN simple brin, mais avec une affinité beaucoup plus faible que pour le double-brin siARN, et que les liens croisés TRBP préférentiellement aux extrémités 3 'des brins de guidage de les siRNA. Ce suggère que la liaison TRBP dépend à la fois les séquences des brins ARNsi et sur la stabilité d'hybridation relatives des extrémités du duplex. Ensemble, ces résultats démontrent l'importance de l'interaction siRNA-TRBP dans la sélection du brin guide de siRNA dans l'ARNi.

La Libération De Protéines Temps Contrôlée à Partir De La Couche Par Couche Assemblé Multicouches Fonctionnalisés Hydrogels D'agarose

Advanced Functional Materials. Jan, 2010  |  Pubmed ID: 20200599

Les axones du système nerveux central adulte, présentent une capacité extrêmement limitée de se régénérer après une lésion médullaire. Expérimentalement modèles générés de la croissance des axones sont généralement désorganisés et orientés de façon aléatoire. Soutien de la croissance axonale dans la colonne vertébrale des sites linéaire lésion de la moelle a été démontrée en utilisant des tableaux de canaux basés sur des modèles, des uniaxes avec hydrogel d'agarose, et contenant des cellules génétiquement modifiées qui sécrètent des facteurs brain-derived neurotrophic (BDNF). Toutefois, de l'immobiliser neurotrophiques cellules sécrétant des facteurs au sein d'un échafaudage est relativement lourde, et des stratégies alternatives sont nécessaires pour fournir à libération prolongée de BDNF des échafaudages agarose templated. Les méthodes existantes de chargement de la drogue ou de protéines dans les hydrogels ne peut pas fournir à libération prolongée à partir d'hydrogels d'agarose templated. Sinon, ici, il est montré que sensible au pH liaison H poly (éthylène glycol) (PEG) / poly (acide acrylique) (PAA) / protéines hybrides couche par couche (LBL) des films minces, quand il est préparé au cours d'agarose, à condition à libération prolongée de protéines dans des conditions physiologiques pendant plus de quatre semaines. Lysozyme, une protéine de même taille et le point isoélectrique de BDNF, est libéré par les multicouches sur l'agarose et est biologiquement actif au cours des points de temps antérieurs, avec la diminution de l'activité à des moments ultérieurs. Il s'agit de la première démonstration du mois tout au long de la libération de protéines soutenue de la part d'un hydrogel d'agarose, dans lequel le médicament / protéine est chargée séparément du processus de fabrication d'agarose hydrogel.

Cytokines Th1 Promouvoir Des Lymphocytes T Liaison à Cellules Présentatrices D'antigène Par La Production Accrue Et D'accumulation De L'acide Hyaluronique à La Synapse Immunologique

Cellular & Molecular Immunology. May, 2010  |  Pubmed ID: 20228832

L'acide hyaluronique (HA) de production par les cellules dendritiques (CD) est connue pour favoriser la présentation de l'antigène et d'augmenter activation des lymphocytes T et la prolifération. Nous émettons l'hypothèse que l'AH péricellulaire peut fonctionner comme intercellulaire «colle» directement médiation cellulaire T-DC contraignant. En utilisant des cellules humaines primaires, nous avons observé HA-dépendante la liaison entre les cellules T et les PED, qui a été abrogée lors de pré-traitement de la PED avec 4-méthyl (4-MU), un agent qui bloque la synthèse HA. En outre, les cellules T réguler la production de HA par les CD par l'intermédiaire T dérivés de cellules cytokines dans un T helper (Th) sous-ensemble de manière spécifique, comme en témoigne l'observation que les cellules de culture surnageants de Th1, mais non des clones Th2 promouvoir la production HA. Des effets similaires ont été observés lors de l'addition de cytokines Th1 exogènes, l'IL-2, l'interféron gamma (IFN-gamma) et facteur de nécrose tumorale alpha (TNF-alpha). Les facteurs critiques qui ont déterminé l'étendue de la DC-T de liaison cellulaire dans ce système ont été la nature de la pré-traitement, les PED ont reçu et leur capacité à synthétiser HA, comme clones de cellules T qui ont été pré-traitées avec la monensine, a ajouté pour bloquer la sécrétion de cytokines, liée de façon équivalente quel que soit leur sous-ensemble Th. Ces données confirment l'existence d'un feedforward boucle dans laquelle des cellules T cytokines influencent la production continue de HA, qui à son tour influe sur le degré de la DC-T de liaison cellulaire. Nous avons également documenter la présence de dépôts focaux de HA à la synapse immunologique entre les lymphocytes T et APC et sur les processus dendritiques jugées importantes dans la présentation antigénique. Ces données indiquent un rôle central pour HA dans les interactions cellulaires DC-T à l'IS.

Cancer-drogue Associations: Un Système Complexe

PloS One. 2010  |  Pubmed ID: 20368808

L'analyse de réseau a été réalisée à grande échelle des données médicales, la capture de la topologie globale de la drogue, les cibles, et les relations de la maladie. Un réseau à plus petite échelle se prête à une analyse plus détaillée et ciblée de chacun des membres et de leurs interactions dans un réseau, qui peuvent compléter les descriptions globales topologiques d'un système de réseau. L'analyse de ces réseaux plus petits peut aider à adresser des questions, c'est à dire ce qui régit l'appariement des cancers et des médicaments différents, est-il dicté par des découvertes moléculaires ou d'autres facteurs, tels que les statistiques de décès.

Culture Clash: Une Occasion Manquée

Journal of Developmental and Behavioral Pediatrics : JDBP. Apr, 2010  |  Pubmed ID: 20414088

CAS: Erasto est un nourrisson né à terme né par accouchement par voie vaginale à un gravida 7 par 7 femme en Somalie par les soins prénatals plein aux États-Unis. Sa mère a eu un diabète gestationnel. La livraison a été compliquée par une détresse respiratoire et une admission d'urgence à l'unité néonatale de soins intensifs pour une évaluation plus poussée de la maladie pulmonaire possible et une maladie cardiaque congénitale. Un stagiaire féminine a été attribué en pédiatrie pour mettre à jour la mère Erasto sur l'état du bébé et d'obtenir le consentement d'un positionnement de la ligne intravasculaire. Quand elle entra dans la chambre pour parler à la mère, plusieurs membres de la famille d'enchaînement à 3 générations étaient avec la mère du bébé. Ils étaient tous des femmes, à l'exception du père de Erasto qui a été informé de l'état clinique du bébé par le médecin de sexe masculin néonatale plusieurs minutes plus tôt. Grâce à un traducteur par téléphone, le stagiaire a expliqué à la mère de Erasto que son bébé peut avoir des problèmes cardiaques et pulmonaires qui peuvent être liées à son diabète gestationnel. À ce stade, de nombreux membres de la famille a parlé en même temps et avec enthousiasme. Certains ont accusé le stagiaire de garder le bébé dans l'unité néonatale de soins intensifs "pour faire plus d'argent», et d'autres ont dit qu'ils allaient la poursuivre "si quelque chose arrivait à Erasto." La mère a nié qu'elle avait le diabète gestationnel, et a affirmé que parce qu'elle «croyait en Dieu ... rien ne va pas avec mon bébé." Le stagiaire n'a pas été préparé pour cette réponse et elle se demandait, «Qu'est-ce qui a mal tourné?"

Acide Withanolide A Et Asiatique Moduler Cibles Multiples Associés à La Bêta-amyloïde Traitement Precursor Protein Et Le Dédouanement Protéine Bêta-amyloïde

Journal of Natural Products. Jul, 2010  |  Pubmed ID: 20553006

La maladie d'Alzheimer (AD) est un processus progressif, une maladie neurodégénérative caractérisée par histochimiquement dépôts extracellulaires de bêta-amyloïde (Abeta) des protéines et des enchevêtrements neurofibrillaires intracellulaires de la protéine tau hyperphosphorylée. AD est considéré comme un complexe, le syndrome multifactoriel, avec de nombreux facteurs de causalité contribuent à sa pathogénie. Ainsi, pour toute nouvelle molécule thérapeutique d'avoir un "modificateur de la maladie" effet sur AD, il doit être capable de moduler multiples, des objectifs synergiques simultanément. Dans ce contexte, nous avons étudié deux composés d'origine végétale [withanolide Un (1) et l'acide asiatique (2)] pour leurs activités potentielles contre des cibles multiples associées à des voies Abeta (BACE1, ADAM10, IDE, et de la NEP). BACE1 est une enzyme limitante dans la production de l'amyloïde bêta de la protéine précurseur amyloïde bêta (AbetaPP), tandis ADAM10 est impliqué dans le traitement non amyloïdogénique de AbetaPP. IDE et NEP sont deux des enzymes importantes impliquées dans Abeta efficacement dégradants. Il a été constaté que 1 et 2 de manière significative régulé à la baisse BACE1 et aussi jusqu'à réglementé ADAM10 dans les neurones corticaux primaires de rat. En outre, 1 place de manière significative à la réglementation des niveaux IDE, ce qui peut aider à Abeta excès dégradants du cerveau AD. Sur la base des données obtenues, les deux composés multifonctionnels peuvent s'avérer utiles dans le développement de nouveaux, thérapeutiques efficaces pour la prévention et le traitement de la MA-amyloïde associée pathologie.

Différenciation Des Cardiomyocytes De Cellules Souches Embryonnaires Humaines Est Accompagnée De Changements Dans La Production De Matrice Extracellulaire De L'acide Hyaluronique Et Versican

Journal of Cellular Biochemistry. Oct, 2010  |  Pubmed ID: 20564236

Protéoglycanes et acide hyaluronique jouent un rôle crucial dans le développement du cœur. Dans cette étude, cellules souches embryonnaires humaines (CSEh) ont été utilisés comme un modèle pour quantifier la synthèse des protéoglycanes et acide hyaluronique dans les CSEh dans les premiers stades de la différenciation, et après dirigée différenciation en cardiomyocytes. Nous avons démontré que les deux CSEh et des cultures de cardiomyocytes synthétiser une matrice extracellulaire (ECM) enrichi en acide hyaluronique et des protéoglycanes. Cours de la différenciation des cardiomyocytes, des protéoglycanes et hyaluronane totale diminuée et la proportion des protéoglycanes de sulfate d'héparane et portant des chaînes a été réduite. Versican, un protéoglycane chondroïtine sulfate, accumulée dans les CSEh et des cultures de cardiomyocytes. En outre, versicane synthétisée par les CSEh contenait plus de N-et O-oligosaccharide lié à versicane de cardiomyocytes. Transcriptions pour les variantes versicane, V0, V1, V2 et V3, augmenté dans les cardiomyocytes par rapport à CSEh, avec V1 le plus abondant. L'acide hyaluronique dans les CSEh avaient poids moléculaire inférieur à l'acide hyaluronique à partir de cultures de cardiomyocytes. Ces modifications ont été accompagnées par une augmentation de HAS-1 et A-2 ARNm dans les cultures de cardiomyocytes, avec A-2 le plus abondant. Fait intéressant, la HAS-3 était absent des cultures de cardiomyocytes, mais exprimée par les CSEh. Ces résultats indiquent que la différenciation des cardiomyocytes humains est accompagnée par des changements spécifiques dans l'expression et l'accumulation de composants ECM et suggèrent un rôle pour versicane et l'acide hyaluronique dans ce processus.

Comportement Cellulaire Adhésif Sur Multicouches De Polyélectrolytes Minces: Cellules Tenter De Parvenir à L'homéostasie De L'énergie D'adhésion

Langmuir : the ACS Journal of Surfaces and Colloids. Aug, 2010  |  Pubmed ID: 20604583

Croissance linéaire ultraminces polyélectrolytes multicouches (PEM) des films de polyélectrolytes forts, les poly (chlorure de diallyldiméthylammonium) (ACPE) et le polystyrène sulfoné, sel de sodium (SPS) présentent un décalage progressif de cytophile au comportement cytophobic, avec une épaisseur croissante de films de moins de 100 nm. Explications antérieures fondées sur l'hydratation du film, de l'enflure et des changements dans le module d'élasticité ne peut pas rendre compte de la cytophobicity observé avec ces films minces que l'augmentation du nombre de bicouches. Nous avons implémenté une analyse par éléments finis pour aider à élucider les tendances observées dans la cellule se propager. Les résultats des simulations suggèrent que les cellules de maintenir un niveau constant de la consommation d'énergie (l'homéostasie énergétique) pendant la phase active de sondage et de répondre ainsi à des changements dans la rigidité du film que les augmentations d'épaisseur de film en ajustant leur morphologie et le nombre des adhésions focales recrutés et, partant, leur attachement à un substrat.

La Kinase à Double Brin Protéines ARN-dépendante Régule Différentiellement Insulin Receptor Substrats 1 Et 2 Dans Les Cellules HepG2

Molecular Biology of the Cell. Oct, 2010  |  Pubmed ID: 20685959

Initialement identifiés pour être activé lors de l'infection du virus, la kinase à double brin protéines ARN-dépendante (PKR) est surtout connu pour le déclenchement de réactions de défense cellulaires en phosphorylant eIF-2α, supprimant ainsi la traduction d'ARN. Nous, ainsi que d'autres ont montré que la phosphorylation de la PKR est régulée à la baisse par l'insuline. Dans la présente étude, nous avons encore découvert une nouvelle fonction de PKR dans la régulation de l'IRS protéines. Nous avons constaté que PKR jusqu'à régule la phosphorylation inhibitrice de IRS1 à Ser312, qui supprime la phosphorylation sur tyrosine de IRS1. Cet effet de la PKR sur la phosphorylation de IRS1 est médiée par deux autres protéines kinases, JNK et IKK. En revanche, PKR régule IRS2, une autre protéine de la famille majeur IRS dans le foie, à la transcription plutôt que le niveau post-traductionnelle, et cet effet est médié par le facteur de transcription, FOXO1, qui a déjà été démontré être régulée par l'insuline et joue un rôle important dans l'homéostasie du glucose et du métabolisme énergétique. En résumé, nous avons trouvé pour la première fois que dans un premier connu sous le nom d'un gène de réponse infection par le virus, PKR réglemente les émetteurs en amont centrales de signalisation de l'insuline, IRS1 et IRS2, grâce à des mécanismes différents.

Microscopie Confocale Pour L'analyse De La Livraison De SiRNA Par Des Nanoparticules Polymériques

Microscopy Research and Technique. Sep, 2010  |  Pubmed ID: 20803695

Les applications cliniques de thérapies génétiques, y compris la livraison de courts ARN interférents (siRNA) pour l'ARN interférence (ARNi), sont limitées en raison de la difficulté de fournir des acides nucléiques à des cellules spécifiques d'intérêt tout en minimisant en même temps la toxicité et l'immunogénicité. L'utilisation de polymères cationiques pour fournir l'acide nucléique thérapeutique a le potentiel pour répondre à ces questions complexes, mais est actuellement limitée par une faible efficacité de prestation. Bien que les études de culture cellulaire ont montré que certains polymères peuvent être utilisés pour fournir des siRNA et d'atteindre taire, il n'est toujours pas clair quelles sont les propriétés physiques ou chimiques sont nécessaires pour veiller à ce que les polymères forment actifs polymère-siRNA complexes. Dans cette étude, nous avons utilisé la fluorescence multicolore microscopie confocale pour analyser la capture cellulaire de siRNA délivrés par de nouvelles nanoparticules polymériques propargyliques glycolide (NPS). Livraison par ces véhicules a été comparée à la livraison par interpolation linéaire polyéthylèneimine (LPEI) et Lipofectamine 2000 (LF2K), qui sont tous deux connus comme vecteurs efficaces pour siRNA. Nos résultats ont montré que lorsque LF2K et LPEI ont été utilisés, de grandes quantités de siRNA ont été livrés rapidement, sans doute accablant les niveaux de base de l'ARNm pour initier silence. En revanche, nos nouveaux polymères IP a montré la livraison de siRNA, mais à des concentrations qui étaient initialement trop faible pour atteindre silence. Néanmoins, la cytotoxicité exceptionnellement bas de nos IP, et la simplicité avec laquelle ils peuvent être modifiés, font de bons candidats pour une étude plus approfondie afin d'optimiser leurs profils de livraison et, à son tour, d'atteindre le silençage efficace.

Conception SiRNA Highly Active, Pour Applications Thérapeutiques

The FEBS Journal. Dec, 2010  |  Pubmed ID: 21078115

La découverte de l'interférence ARN (ARNi) a suscité un intérêt considérable dans le développement à court ARN interférents (siRNA) pour comprendre la biologie de base et que les agents actifs dans une nouvelle variété de produits thérapeutiques. Les premières études ont montré que la sélection d'un siARN active n'était pas aussi simple que de sélectionner simplement une séquence de l'ARNm cible et la synthèse de la siARN complémentaire à cette séquence. Comme l'intérêt pour l'application de l'ARNi a augmenté, les méthodes pour identifier des séquences de siRNA actifs ont évolué de se concentrer sur la simplicité de synthèse et de purification, d'identifier des séquences cibles privilégiées et des structures secondaires, à la prédiction de la stabilité thermodynamique du siRNA. Comme plus de détails spécifiques du mécanisme de l'ARNi ont été définies, celles-ci ont été incorporées dans plus complexes algorithmes de sélection de siRNA, ce qui augmente la fiabilité de la sélection des siRNA actifs contre une seule cible. En fin de compte, la conception des produits thérapeutiques meilleurs siRNA, il faudra la conception du siRNA lui-même, en plus de concevoir du véhicule et d'autres composants nécessaires à son fonctionnement in vivo. Dans cette mini, nous résumons l'évolution des techniques de sélection de siRNA avec un accent particulier sur un enjeu d'importance actuelle sur le terrain, la meilleure façon d'identifier les séquences d'ARNsi susceptibles d'avoir une activité élevée. Les approches de la conception des siARN actifs par des processus chimiques et des modifications structurelles seront également mis en évidence. Comme la compréhension de la façon de contrôler l'activité et la spécificité de siRNA s'améliore, l'utilité potentielle des siRNA comme agents thérapeutiques de l'homme sera en même temps se développent.

Intime Perpétration De La Violence Des Partenaires Et Utilisation Du Préservatif Facteurs Liés: Associations Avec L'utilisation Du Préservatif Pour Hommes Hétérosexuel Conformément

AIDS and Behavior. Jan, 2011  |  Pubmed ID: 20069447

Intime victimisation violence conjugale a été liée à comportement sexuel à risque du VIH chez les femmes hétérosexuelles. Le rôle unique de la perpétration de la violence du partenaire intime (VPI) dans le comportement sexuel à risque parmi les hommes n'a pas été étudiée aussi bien. Basé sur des entretiens avec 518 hommes hétérosexuels recrutés par la rue à l'origine entre 2005 et 2007 à New York, nous avons évalué la relation entre la perpétration de la violence conjugale contre un partenaire principal féminin et l'utilisation irrégulière du préservatif avec ce même partenaire, tout en contrôlant l'utilisation du préservatif liées facteurs. La régression logistique multivariée a révélé que les hommes qui ont perpétré physique VPI étaient deux fois moins susceptibles de déclarer utilisation systématique du préservatif par rapport aux hommes qui n'ont pas recours à la violence, tout en contrôlant les facteurs sociodémographiques des préservatifs, liées à l'usage et les autres. Physique à la perpétration par le VPI hommes hétérosexuels apporte une contribution indépendante à l'utilisation systématique du préservatif. Concevoir des interventions pour les hommes hétérosexuels qui abordent simultanément à la fois le VPI et comportements sexuels à risque est essentiel.

CAMP Initie Très Tôt Changements De Phase Morphologie Neuron-comme Et De Différenciation Neurale Late Phase Sur Les Cellules Souches Mésenchymateuses

Cellular and Molecular Life Sciences : CMLS. Mar, 2011  |  Pubmed ID: 20725762

Le second messager intracellulaire de l'AMPc est fréquemment utilisé dans les médias à induction pour induire des cellules souches mésenchymateuses (CSM) en cellules de la lignée de neurones. À ce jour, une bonne compréhension des rôles exerce AMPc sur MSC et si l'AMPc peuvent induire MSC en neurones fonctionnels est encore défaut. Nous avons trouvé AMPc lancé neurones comme des changements de morphologie et de la différenciation précoce de neurones beaucoup plus tard. Les changements de phase précoce de la morphologie étaient dues au retrait de cellule, qui a ensuite rendu certaines cellules apoptotiques. Bien que les changements de morphologie a eu lieu avant l'expression de marqueurs neuronaux, il n'est pas nécessaire pour l'expression du marqueur neuronal et les deux processus sont régulés différemment en aval de l'AMPc protéine kinase activée par A. camp a permis de gagner MSC expressions marqueurs de neurones avec la fonction neuronale, tels que, montée de calcium en réponse à des activateurs neuronales, la dopamine, le glutamate, et le chlorure de potassium. Toutefois, seule une partie des cellules induites par l'AMPc a répondu aux trois activateurs neuronaux et le manque en outre la morphologie neuronale, ce qui suggère que, bien que l'AMPc est capable de diriger MSC vers une différenciation neurale, elles ne réalisent pas la différenciation terminale.

Mécanisme Moléculaire Par Lequel Palmitate Inhibe L'autophosphorylation PKR

Biochemistry. Feb, 2011  |  Pubmed ID: 21192654

PKR (double brin d'ARN-protéine kinase activée) est une composante importante de l'immunité innée, antiviral, et les voies apoptotiques. Récemment, notre groupe a constaté que le palmitate, un acide gras saturé, est impliqué dans l'apoptose en réduisant l'autophosphorylation de la PKR au niveau du résidu Thr451, mais le mécanisme moléculaire par lequel le palmitate réduit autophosphorylation PKR n'est pas connue. Ainsi, nous avons étudié la façon dont le palmitate affecte la phosphorylation de la protéine PKR aux niveaux moléculaire et biophysique. Des études biochimiques et de calcul montrent que le palmitate se lie à PKR, à proximité du site de liaison ATP, inhibant ainsi son autophosphorylation à Thr451 et Thr446. Des études suggèrent que la mutation Lys296 et Asp432 dans le site de liaison ATP sur la protéine PKR sont importants pour la liaison palmitate. Nous avons en outre confirmé que le palmitate interagit également avec d'autres kinases, en raison de l'conservé ATP-binding site. Une meilleure compréhension de la façon dont le palmitate interagit avec la protéine PKR, ainsi que d'autres kinases, pourrait faire la lumière sur les mécanismes possibles par lesquels palmitate kinase médie voies de signalisation qui pourrait avoir des implications sur l'efficacité de thérapies médicamenteuses actuelles kinases cibles que.

Le Clivage Protéolytique De Versican Et L'implication Des ADAMTS-1 Dans L'angiogenèse Pathologique VEGF-A/VPF-induced

The Journal of Histochemistry and Cytochemistry : Official Journal of the Histochemistry Society. May, 2011  |  Pubmed ID: 21411713

Les tumeurs malignes et les maladies inflammatoires chroniques induire l'angiogenèse en surexprimant vascular endothelial growth factor A (VEGF-A/VPF). VEGF-A-angiogenèse induite pathologique peut être imité chez les souris immunoincompetent avec un vecteur adénoviral exprimant VEGF-A (164) (Ad-VEGF-A (164)). La première étape est la génération de grandement élargie "mère" des navires (MV) de veinules préexistantes normales par un processus impliquant la dégradation de leurs membranes basales rigides. L'analyse par transfert immunohistochimiques et de l'Ouest a révélé que versicane, un composant de la matrice extracellulaire dans les membranes basales des veinules, est dégradée dès le début de la formation MV, ce qui entraîne l'apparition d'un versicane fragment N-terminal DPEAAE associée à MV cellules endothéliales. La protéase ADAMTS-1, connu pour cliver versicane à proximité de son extrémité N-terminale pour générer DPEAAE, est également augmentée par VEGF-A en parallèle avec formation MV et se localise sur l'endothélium de la MV développement. Les auteurs montrent également que la MMP-15 (MT-2 MMP), une protéase qui active ADAMTS-1, est régulée positivement par le VEGF-A dans les cellules endothéliales in vitro et in vivo. Ces données suggèrent VEGF-A initie la formation de MV, en partie, en induisant l'expression des protéases cellulaires endothéliales tels que ADAMTS-1 et MMP-15 qui agissent de concert pour dégrader la membrane basale des veinules versicane. Ainsi, versicane est activement traitées au cours début du VEGF-A-angiogenèse induite pathologique.

Le Choléra, Canaux Et Contagion: Redécouvrir Le Rapport Du Docteur Beck

Journal of Public Health Policy. Aug, 2011  |  Pubmed ID: 21544099

Le choléra est apparu en Amérique du Nord (à Montréal et Québec) en 1832 et s'est rapidement propagé dans la moitié orientale du continent. L'envoi de experts américains de contrôle des maladies au Bas-Canada en prévision de la propagation du choléra implique que les professionnels médicaux devrait se répandre, éventuellement de la contagion, même si la notion que le choléra était contagieux était décriée dans les écrits médicaux de l'époque, et serait jusqu'à ce point de repère de John Snow travailler à Londres dans les années 1850. Un aperçu de Snow proviennent en grande partie de ses observations sur les tendances spatiales et temporelles de cas de choléra. Nous discutons d'un document à partir de l'épidémie de 1832, le rapport de M. Lewis Beck à Throop gouverneur de New York, qui anticipe de neige dans la présentation de données géospatiales qui impliquent la contagiosité du choléra. Beck montre que les mouvements d'immigrants le long de la nouvellement achevés à New York système étatique canal donné lieu à des flambées de choléra séquentielles le long du chemin du canal. Bien que conscient de la mesure dans laquelle cette contagion a suggéré, Beck fait valoir énergiquement contre la contagion du choléra. Nous explorons le contexte social du début du dix-neuvième siècle la médecine qui a probablement conduit à ne pas croire Beck ses propres observations, et de favoriser un modèle médical incompatible avec ses données. Les thèmes qui se dégagent de notre enquête incluent la croyance dans la maladie comme une manifestation physique d'un défaut de la morale, la stigmatisation des pauvres et des groupes d'immigrants, et la réticence à bouleverser en vigueur modèles médicaux qui se reflète la situation économique des praticiens médicaux. Nous montrons que ces thèmes continuent à servir comme des obstacles à l'innovation dans la pratique médicale et de santé publique aujourd'hui.

Apprendre Régulation Transcriptionnelle Sur Une échelle De Génome: Une Analyse Théorique Basée Sur Des Données D'expression Génétique

Briefings in Bioinformatics. May, 2011  |  Pubmed ID: 21622543

L'avènement récent de données de puces à haut débit a permis l'analyse globale du transcriptome, de conduire le développement et l'application des approches computationnelles pour étudier la régulation transcriptionnelle sur l'échelle du génome, en reconstruisant in silico des interactions régulatrices du réseau génique. Bien qu'il existe de nombreux examens approfondis de méthodologies telles «reverse-engineering», la plupart ont mis l'accent sur l'aspect pratique de la fouille de données, et quelques-uns sur le problème biologique et la pertinence biologique de la méthodologie. Par conséquent, dans cette revue, à partir d'un point de vue biologique, nous avons utilisé un ensemble de données de microarray levure comme un exemple de travail, pour évaluer les hypothèses fondamentales implicites à associer facteur de transcription (TF)-cibles niveaux d'expression de gènes et de l'estimation de l'activité des facteurs de transcription, et en outre explorer des modèles de coopération. Enfin, nous confirmons que le mécanisme de la transcription détaillée est trop complexe pour-données d'expression seule à révéler, néanmoins, les futures études de reconstruction du réseau, pourrait bénéficier de l'intégration du contexte spécifique à l'information, la modélisation de multiples couches de réglementation (par exemple les micro-ARN), ou le développement d'approches pour l'analyse dépend du contexte, de découvrir les mécanismes de la régulation des gènes.

POLYELECTROLYTE ESTAMPAGE MULTICOUCHE En Phase Aqueuse Et Mode Sans Contact

Industrial & Engineering Chemistry Research. Aug, 2011  |  Pubmed ID: 21860540

Polyélectrolyte multicouche impression de transfert (PEM) a déjà été réalisé par estampage dans des conditions sèches. Ici, nous montrons pour la première fois, que PEM peuvent être transférées à partir d'un timbre pour le substrat de base dans des conditions aqueuses selon laquelle les deux surfaces sont dans un mode non-contact. Multicouches dégradables de (AAP / PEG) (10.5) suivie par la non-dégradables multicouches de (PDAC / SPS) (80.5) ont été fabriquées dans des conditions de pH acide de part et d'PDMS ou en verre (tampon), et ensuite transférée sur le dessus de l'autre préparé multicouche sur un substrat différent (substrat de base), avec un espacement de ~ 200 um entre la surface d'estampage et le substrat de base. Ce transfert multicouche a été réalisée dans des conditions de pH physiologique. Ce processus est désigné ici comme non-contact, en phase aqueuse multicouche (NAM) de transfert. NAM transfert peut être utile pour des applications telles que la fabrication en trois dimensions (3-D) Les échafaudages cellulaires. Nous avons tenté de créer une 3-D à l'aide d'échafaudage cellulaire NAM transfert, et caractérisé les échafaudages avec la microscopie conventionnelle et de fluorescence.

MicroRNA-137/181c Régule Sérine β Amyloïde Palmitoyltransférase Et Dans Le Virage, Nouvelles Cibles Dans Sporadique De La Maladie D'Alzheimer

The Journal of Neuroscience : the Official Journal of the Society for Neuroscience. Oct, 2011  |  Pubmed ID: 21994399

La contribution de mutations dans la protéine précurseur amyloïde (APP) et la préséniline (PSEN) à la maladie d'Alzheimer familiale (AD) est bien établi. Cependant, peu est connu sur les mécanismes moléculaires conduisant à β amyloïde (Aß) dans la génération la MA sporadique. Augmentation des niveaux de céramide cerveau ont été associés à la MA sporadique, et sont un facteur de risque proposé. Serine palmitoyltransférase (SPT) est le premier enzyme limitante dans la synthèse de novo de céramide. Toutefois, la réglementation de la SPT n'est pas encore comprise. Les preuves suggèrent qu'il peut être posttranscriptionally réglementé. Par conséquent, nous avons étudié le rôle des miARN dans la régulation de SPT et β amyloïde (Aß) génération. Nous montrons que SPT est régulée à la hausse dans un sous-groupe de patients sporadiques cerveaux AD. Ceci est confirmé dans les études de modèles murins de facteurs de risque associés à la MA. Nous avons déterminé que la perte de miR-137, 181 quater-, -9, et les augmentations 29a/b-1 SPT et à leur tour les niveaux de Aß, et fournit un mécanisme pour le risque élevé de AD associée avec l'âge, haute-saturée en graisses , et le sexe. Enfin, ces résultats suggèrent SPT et les miARN respectifs peuvent être des cibles thérapeutiques potentielles pour la MA sporadique.

Identification De Nouvelles Cibles Pour Le Cancer Du Sein En Explorant Commutateurs Génétiques Sur Une échelle De Génome

BMC Genomics. 2011  |  Pubmed ID: 22053771

Une caractéristique importante qui se dégage de l'analyse des réseaux de régulation génique est le «switch-comme le comportement» ou «bistabilité», un élément dynamique d'un gène particulier de manière préférentielle basculer entre deux états d'équilibre. L'état de commutateurs génétiques joue un rôle essentiel dans la décision du destin cellulaire, mais l'identification des commutateurs a été difficile. Par conséquent, un défi auquel sont confrontés sur le terrain est de pouvoir identifier systématiquement les commutateurs génétiques.

Analyse Synergy Révèle Association Entre Signalisation De L'insuline Et Desmoplakine Expression Dans Les Cellules HepG2 Traitées Palmitate

PloS One. 2011  |  Pubmed ID: 22132232

La réglementation des activités complexes cellulaires dans les cellules HepG2 traitées palmitate, et le phénotype qui a suivi cytotoxique, implique des interactions coopératives entre les gènes. Alors que les approches précédentes ont surtout porté sur l'identification des gènes cibles individuelles, l'élucidation des gènes qui interagissent a jusqu'ici resté inaccessible. Nous avons appliqué le concept de synergie des informations pour reconstruire un «gène-coopérativité" réseau pour palmititate la cytotoxicité induite par les cellules du foie. Notre approche intégrée des données d'expression génique avec des profils métaboliques pour sélectionner un sous-ensemble de gènes pour la reconstruction du réseau. Une analyse subséquente du réseau a révélé signalisation de l'insuline comme la voie la plus considérablement enrichie, et desmoplakine (DSP) que son voisin en haut. Nous avons déterminé que le palmitate réduit de façon significative l'expression DSP, et le traitement avec l'insuline restaure l'expression a perdu de la DSP. Résistance à l'insuline est une caractéristique commune pathologique de foie gras et les affections connexes, tandis que la perte de la DSP a été noté dans le carcinome du foie. Réduction d'expression DSP peut conduire à la perte de l'adhérence cellule-cellule par l'intermédiaire des desmosomes, et de perturber le réseau de filaments de kératine intermédiaire. Nos résultats suggèrent que l'expression DSP peut être perturbé par le palmitate et, avec résistance à l'insuline, peut jouer un rôle dans la cytotoxicité induite par le palmitate, et de servir de cibles potentielles pour de nouvelles études sur la non-stéatose hépatique (stéatose hépatique non alcoolique).

MiARN Sérum: Biomarqueurs Non-invasifs Pour La Maladie D'Alzheimer

Experimental Neurology. Dec, 2011  |  Pubmed ID: 22155483

Il ya un besoin urgent d'identifier biomarqueurs non-invasifs pour la détection de la maladie d'Alzheimer sporadique (AD). Nous avons déjà étudié les microARN (miARN) dans des échantillons d'autopsie du cerveau AD et a signalé un lien entre miR-137, 181 quater-, -9,-29a / b et AD, à travers la réglementation des céramides. Dans cette étude, le rôle potentiel de ces miARN comme marqueurs diagnostiques de la MA a été étudiée. Nous avons déterminé que ces miARN sont régulés à la baisse dans le sérum sanguin des patients atteints de MA probable. Les niveaux de ces miARN ont également été réduits dans le sérum de modèles AD facteurs de risque. Bien que la capacité de ces miARN à diagnostiquer irréfutablement pour AD est actuellement inconnue, nos résultats suggèrent une utilisation potentielle pour miARN circulant, avec d'autres marqueurs, en tant que biomarqueurs non-invasifs et relativement peu coûteux pour le diagnostic précoce de la MA, cependant, des recherches plus poussées et la validation.

Groupes De Base, La Résistance Aux Antimicrobiens Et De Rebond Dans La Gonorrhée En Amérique Du Nord

Sexually Transmitted Infections. Dec, 2011  |  Pubmed ID: 22169277

Les infections des voies BackgroundGenital causés par Neisseria gonorrhoeae sont une cause majeure de maladies sexuellement transmissibles dans le monde entier. Les données de surveillance suggèrent que l'incidence a augmenté ces dernières années après avoir initialement tomber dans le visage de l'intensification des auteurs efforts.ObjectivesThe de contrôle ont cherché à évaluer la contribution potentielle de la résistance antimicrobienne au rebond, et recenser les stratégies optimales de traitement dans le visage de la résistance en utilisant un modèle mathématique des auteurs gonorrhoea.MethodsThe construites risque structuré «sensible-infectieux sensibles» des modèles avec et sans la possibilité de résistance aux antibiotiques et utilisé ces modèles comme une plate-forme pour l'évaluation des stratégies de traitement concurrents plausibles, y compris le changement de choix aux antimicrobiens lorsqu'ils prévalence de la résistance a surpassé fixé seuils, l'attribution aléatoire de traitement et l'utilisation de la résistance aux antimicrobiens therapy.ResultsAbsent combinaison antimicrobienne, les stratégies qui mettent l'accent sur le traitement des personnes les plus à risque (le groupe de base soi-disant) se traduisent par l'effondrement de la transmission de la maladie. Lorsque la résistance aux antimicrobiens existe, mettant l'accent sur le groupe de base provoque rebond de l'incidence, à la diffusion maximale de la résistance aux antibiotiques. L'assignation aléatoire de la classe de traitement antimicrobien a surperformé l'utilisation de seuils de résistance fixes par rapport à la réduction soutenue de la gonorrhée prevalence.ConclusionsGonorrhoea de contrôle n'est réalisable que lorsque des groupes de base sont traités, mais le traitement des groupes de base maximise la diffusion de souches résistantes aux antimicrobiens. Ce paradoxe pose un grand dilemme pour le contrôle et la prévention de la gonorrhée et souligne la nécessité pour les vaccins gonococciques.

Time Release Contrôlée De Arabinofurannosylcytosine (Ara-C) à Partir D'hydrogels D'agarose En Utilisant La Couche Par Couche Assemblée: Une étude in Vitro

Journal of Biomaterials Science. Polymer Edition. 2012  |  Pubmed ID: 21294967

Induite expérimentalement la régénération axonale est compromise par la formation de cicatrice gliale aux dépens des cellules fibroblastes leptoméningées dans et autour de l'hydrogel échafaudage implantés pour la réparation nerveuse. Des stratégies sont nécessaires pour empêcher une telle formation fibroblastique réactive couche de cellules pour la régénération axonale améliorée. Ici, nous mettons en œuvre la technique de la couche par couche assemblé dégradables, de l'hydrogène multicouches collées sur les hydrogels d'agarose à intégrer un médicament anti-mitotique (1-β-D-arabinofurannosylcytosine (Ara-C)) au sein de la hydrogels d'agarose. On présentent la libération contrôlée d'Ara-C, dans des conditions physiologiques sur une période de jours. Les concentrations d'Ara-C libérés agarose à des moments différents étaient suffisantes pour inhiber la croissance des fibroblastes in vitro, tout en ne nuisant pas à la viabilité des cellules neuronales.

Un Cas De Cardiomyopathie De Stress Récurrente Tremblement De Terre Avec Une Anomalie Divergentes Mouvement De La Paroi

Echocardiography (Mount Kisco, N.Y.). Feb, 2012  |  Pubmed ID: 22067059

Nous présentons le cas d'une femme de race blanche qui a survécu à deux grands tremblements de terre, présentant à chaque fois à une cardiomyopathie de stress, mais avec un modèle différent de régionale anomalie mouvement de la paroi à la seconde occasion. Le premier tremblement de terre Christchurch frappé le Septembre 4, 2010. À 7,1 sur l'échelle de Richter, il était plus grand que le tremblement de terre majeur en Haïti, mais par miracle, aucun décès n'a été directement. Dans la semaine suivante, huit femmes réunion critères modifiés Mayo pour cardiomyopathie de stress présenté à Christchurch Hospital. Le deuxième tremblement de terre Christchurch était le 22 Février, 2011. Il mesurait 6,4 sur l'échelle de Richter et a causé 180 décès directs. Dans la semaine suivant ce tremblement de terre, 24 femmes ont été admises avec cardiomyopathie de stress. Un patient a présenté après les deux tremblements de terre. Cette femme de 76 ans d'abord présenté le Septembre 4 avec 10 heures de douleurs à la poitrine. Électrocardiogramme a montré inférolatérale profonde inversion des ondes T et un allongement du QT. TnI a culminé à 0,81 mg / L. La coronarographie a démontré l'athérome diffus avec une lésion LAD mi modérée qui a été implanté le stent à l'époque. L'échocardiographie a montré un schéma classique Takotsubo. Son suivi échocardiogramme le 28 Septembre était normal et elle était tout à fait bien à ce moment-là. Toutefois, au cours de la deuxième tremblement de terre de Février 22, elle a de nouveau une douleur thoracique et d'essoufflement. TnI a culminé à 1,3 mg / L. Échocardiogramme a montré une paroi centrale variante Takotsubo en épargnant apicale. Elle a quitté l'hôpital le 25, l'intention de quitter Christchurch pour une nouvelle maison dans une autre ville, mais il est revenu pour le suivi échocardiogramme le 27 Juillet. C'était normal. (Échocardiographie 2012; 29: E26-E27).

Monocyte-to-macrophage Differentiation: Synthesis and Secretion of a Complex Extracellular Matrix

The Journal of Biological Chemistry. Apr, 2012  |  Pubmed ID: 22351750

Although monocyte- and macrophage-derived molecules are known to promote extracellular matrix (ECM) disruption and destabilization, it is less appreciated that they also synthesize molecules contributing to ECM formation, stabilization, and function. We have identified and characterized the synthesis of proteoglycans and related proteins, some not previously known to be associated with macrophages. Proteoglycan extracts of [(35)S]sulfate- and (35)S-trans amino acid-radiolabeled culture media from THP-1 monocytes induced to differentiate by treatment with phorbol myristate acetate revealed three major proteins of ~25, 90, and 100 kDa following chondroitin ABC lyase digestion. The 25-kDa protein was predominant for monocytes, whereas the 90- and 100-kDa proteins were predominant for macrophages. Tandem mass spectrometry identified (i) the 25-kDa core protein as serglycin, (ii) the 90-kDa core protein as inter-α-inhibitor heavy chain 2 (IαIHC2), and (iii) the 100-kDa core as amyloid precursor-like protein 2 (APLP2). Differentiation was also associated with (i) a >500-fold increase in mRNA for TNF-stimulated gene-6, an essential cofactor for heavy chain-mediated matrix stabilization; (ii) a >800-fold increase in mRNA for HAS2, which is responsible for hyaluronan synthesis; and (iii) a 3-fold increase in mRNA for versican, which interacts with hyaluronan. Biochemical evidence is also presented for an IαIHC2-APLP2 complex, and immunohistochemical staining of human atherosclerotic lesions demonstrates similar staining patterns for APLP2 and IαIHC2 with macrophages, whereas serglycin localizes to the underlying glycosaminoglycan-rich region. These findings indicate that macrophages synthesize many of the molecules participating in ECM formation and function, suggesting a novel role for these molecules in the differentiation of macrophages in the development of atherosclerosis.

Overall Sulfation of Heparan Sulfate from Pancreatic Islet β-TC3 Cells Increases Maximal Fibril Formation but Does Not Determine Binding to the Amyloidogenic Peptide Islet Amyloid Polypeptide

The Journal of Biological Chemistry. Oct, 2012  |  Pubmed ID: 22936797

Islet amyloid, a pathologic feature of type 2 diabetes, contains the islet β-cell peptide islet amyloid polypeptide (IAPP) as its unique amyloidogenic component. Islet amyloid also contains heparan sulfate proteoglycans (HSPGs) that may contribute to amyloid formation by binding IAPP via their heparan sulfate (HS) chains. We hypothesized that β-cells produce HS that bind IAPP via regions of highly sulfated disaccharides. Unexpectedly, HS from the β-cell line β-TC3 contained fewer regions of highly sulfated disaccharides compared with control normal murine mammary gland (NMuMG) cells. The proportion of HS that bound IAPP was similar in both cell lines (∼65%). The sulfation pattern of IAPP-bound versus non-bound HS from β-TC3 cells was similar. In contrast, IAPP-bound HS from NMuMG cells contained frequent highly sulfated regions, whereas the non-bound material demonstrated fewer sulfated regions. Fibril formation from IAPP was stimulated equally by IAPP-bound β-TC3 HS, non-bound β-TC3 HS, and non-bound NMuMG HS but was stimulated to a greater extent by the highly sulfated IAPP-bound NMuMG HS. Desulfation of HS decreased the ability of both β-TC3 and NMuMG HS to stimulate IAPP maximal fibril formation, but desulfated HS from both cell types still accelerated fibril formation relative to IAPP alone. In summary, neither binding to nor acceleration of fibril formation from the amyloidogenic peptide IAPP is dependent on overall sulfation in HS synthesized by β-TC3 cells. This information will be important in determining approaches to reduce HS-IAPP interactions and ultimately prevent islet amyloid formation and its toxic effects in type 2 diabetes.

Latest Developments in Experimental and Computational Approaches to Characterize Protein-lipid Interactions

Proteomics. Nov, 2012  |  Pubmed ID: 22997137

Understanding the functional roles of all the molecules in cells is an ultimate goal of modern biology. An important facet is to understand the functional contributions from intermolecular interactions, both within a class of molecules (e.g. protein-protein) or between classes (e.g. protein-DNA). While the technologies for analyzing protein-protein and protein-DNA interactions are well established, the field of protein-lipid interactions is still relatively nascent. Here, we review the current status of the experimental and computational approaches for detecting and analyzing protein-lipid interactions. Experimental technologies fall into two principal categories, namely solution-based and array-based methods. Computational methods include large-scale data-driven analyses and predictions/dynamic simulations based on prior knowledge of experimentally identified interactions. Advances in the experimental technologies have led to improved computational analyses and vice versa, thereby furthering our understanding of protein-lipid interactions and their importance in biological systems.

Mise En Commun Du Lait Maternel Exprimé Pour Fournir Une Composition Alimentaire Cohérente Pour Prématurés

Breastfeeding Medicine : the Official Journal of the Academy of Breastfeeding Medicine. Oct, 2012  |  Pubmed ID: 23039396

Objectif abstrait : Nous avons supposé que mise en commun de la mère exprimé du lait maternel pendant 24 heures par rapport à la session de pompe individuelle collecte du lait fournirait un produit calorique plus homogène sans pour autant augmenter la contamination bactérienne. Conception de l'étude : Nous avons étudié la collection 24 heures mise en commun du lait maternel en s'inscrivant 19 mères qui exprimaient le lait pour leurs bébés. Mères suivi un protocole de collecte de lait standardisé pour 4 journées : lait quotidien a été regroupé dans une bouteille de 1 L stérile le jour 1 et le jour 2 lait fut aliquoté pour chaque session de la pompe dans un contenant stérile de 120 mL. La semaine prochaine, l'ordre de la collection a été inversé. Des échantillons de lait ont été plaqués, incubés et évalués pour la colonisation des bactéries. On a analysé des échantillons de lait protéines, matières grasses et en glucides. Résultats : Il y avait intrinsèquement moins de variabilité de la teneur en calories et en nutriments du lait mis en commun par rapport à des échantillons individuels, dont la densité calorique varie de près de 29 %. Lait de la mère avait la numération bactérienne très variable allant de 0 à plus de 100 000 colonies/mL. Numération bactérienne élevée (> 100 000 colonies/mL) chez 14,7 % (31 211) des échantillons individuels contre 8,6 % (trois de 35) des échantillons groupés (p = 0,39). Conclusions : Vingt-quatre heures mise en commun du lait maternel réduit la variabilité nutritive et calorique sans augmenter le nombre de bactéries.

Oligomerization of the Transmembrane Domain of IRE1α in SDS Micelles

Biochemical and Biophysical Research Communications. Nov, 2012  |  Pubmed ID: 23041190

IRE1α (Inositol-requiring enzyme 1 α), an endoplasmic reticulum (ER)-resident sensor for mammalian unfolded protein response, is a type I transmembrane protein which has a bifunctional enzyme containing kinase and RNase domains. Although the luminal domain and cytosolic domain of IRE1α are thought to play crucial roles in regulating the protein activity, no functional and structural studies of the transmembrane domain exist thus far. Herein, using CD spectroscopy, we report that the transmembrane domain of the IRE1α is alpha-helical in a membrane-like environment. In addition, SDS-PAGE and FRET analyses support that the transmembrane domain forms oligomers in SDS micelles. Thus, the study would provide insights into how the transmembrane domain plays a role in regulating the IRE1α protein activity.

Effectiveness and Cost-effectiveness of Pediatric Rotavirus Vaccination in British Columbia: a Model-based Evaluation

Vaccine. Dec, 2012  |  Pubmed ID: 23107595

Rotavirus gastroenteritis (RVGE) is associated with widespread morbidity and mortality in children worldwide. In high-income countries, including Canada, the burden of RVGE relates largely to morbidity and healthcare utilization. Two live rotavirus vaccines (RotaTeq(®) (Merck Frosst Canada Ltd.) and Rotarix™ (GlaxoSmithKline Inc.)), are now approved for use in Canada, but their economic attractiveness has not been evaluated in the Canadian context.

ENDOCYTOSIS PATHWAYS FOR NUCLEIC ACID THERAPEUTICS

Nano LIFE. Sep, 2012  |  Pubmed ID: 23956796

The development of nanoscale delivery vehicles for siRNAs is a current topic of considerable importance. However, little is understood about the exact trafficking mechanisms for siRNA-vehicle complexes across the plasma membrane and into the cytoplasm. While some information can be gleaned from studies on delivery of plasmid DNA, the different delivery requirements for these two vehicles makes drawing specific conclusions a challenge. However, using chemical inhibitors of different endocytosis pathways, studies on which endocytotic pathways are advantageous and deleterious for the delivery of nucleic acid drugs are emerging. Using this information as a guide, it is expected that the future development of effective siRNA delivery vehicles and therapeutics will be greatly improved.

Human Metabolic Network: Reconstruction, Simulation, and Applications in Systems Biology

Metabolites. 2012  |  Pubmed ID: 24957377

Metabolism is crucial to cell growth and proliferation. Deficiency or alterations in metabolic functions are known to be involved in many human diseases. Therefore, understanding the human metabolic system is important for the study and treatment of complex diseases. Current reconstructions of the global human metabolic network provide a computational platform to integrate genome-scale information on metabolism. The platform enables a systematic study of the regulation and is applicable to a wide variety of cases, wherein one could rely on in silico perturbations to predict novel targets, interpret systemic effects, and identify alterations in the metabolic states to better understand the genotype-phenotype relationships. In this review, we describe the reconstruction of the human metabolic network, introduce the constraint based modeling approach to analyze metabolic networks, and discuss systems biology applications to study human physiology and pathology. We highlight the challenges and opportunities in network reconstruction and systems modeling of the human metabolic system.

Ensemble Classification of Cancer Types and Biomarker Identification

Drug Development Research. Nov, 2012  |  Pubmed ID: 25221378

Cancer classification is an important step in biomarker identification. Developing machine learning methods that correctly predict cancer subtypes/types can help in identifying potential cancer biomarkers. In this commentary, we presented ensemble classification approach and compared its performance with single classification approaches. Additionally, the application of cancer classification in identifying biomarkers for drug design was discussed.

Evaluating New York City's Smoke-free Parks and Beaches Law: a Critical Multiplist Approach to Assessing Behavioral Impact

American Journal of Community Psychology. Mar, 2013  |  Pubmed ID: 22638901

This article describes the evaluation of the law banning smoking in New York City's parks and beaches that went into effect in 2011. We discuss the practical and methodological challenges that emerged in evaluating this law, and describe how we applied the principles of critical multiplism to address these issues. The evaluation uses data from three complementary studies, each with a unique set of strengths and weaknesses that can provide converging evidence for the effectiveness of the law. Results from a litter audit and an observational study suggest the ban reduced smoking in parks and beaches. The purpose, methodology and baseline results from an ongoing survey that measures how frequently adults in NYC and across New York State notice people smoking in parks and on beaches are presented and discussed. Limitations are considered and suggestions are offered for future evaluations of similar policies.

Astrocytes Palmitate-activé Par L'intermédiaire De Sérine Palmitoyltransférase Augmentent BACE1 Dans Des Neurones Primaires Par Sphingomyélinases

Neurobiology of Aging. Feb, 2013  |  Pubmed ID: 22727944

Les astrocytes jouent un rôle critique dans les maladies neurodégénératives, notamment la maladie d'Alzheimer (ma). Auparavant, nous avons montré que saturé d'acides gras, acide palmitique (PA), enzyme clivant-protéine de précurseur amyloïde de β-site de régule à la hausse 1 (BACE1) niveau et la molécule dans les neurones de rat primaire médiée par les astrocytes. Cependant, les mécanismes moléculaires par quels milieux conditionnés de niveau augmente BACE1 astrocytes PA imprégnées d'insecticide dans les neurones sont inconnus. Cette étude démontre que sérine palmitoyltransférase (SPT) dans les niveaux de céramide augmente les astrocytes, qui augmente la libération de cytokines qui assurent la médiation de l'activation de la sphingomyélinase neuronale et acide (SMase) dans les neurones, pour propager les effets délétères de la PA (c.-à-d. l'upregulation BACE1). À l'appui de la pertinence du SPT dans AD, notre laboratoire a récemment mesuré et mesuré des concentrations de la SPT à être significativement augmenté dans les cerveaux Alzheimer comparativement aux témoins. Cytokines, nommément tumor necrosis factor-α et interleukin-1β, rejetés dans les milieux conditionnés des astrocytes traités PA activent SMase neural et acide dans les neurones. Neutraliser les cytokines dans les médias traités PA astrocyte conditionné réduit upregulation BACE1. Cependant, inhibant la SPT dans les astrocytes diminue les niveaux de facteur de nécrose tumorale-α et interleukin-1β dans les milieux conditionnés, qui à son tour réduit les activités SMase et niveau de BACE1 dans des neurones primaires. Ainsi, nos résultats suggèrent que l'activation des astrocytes de PA est médiée par la SPT, et les astrocytes activés augmente le niveau de la BACE1 dans les neurones ; ce dernier est médiat par le SMases.

Awareness and Impact of New York City's Graphic Point-of-sale Tobacco Health Warning Signs

Tobacco Control. May, 2013  |  Pubmed ID: 22730446

To increase knowledge of smoking-related health risks and provide smoking cessation information at the point of sale, in 2009, New York City required the posting of graphic point-of-sale tobacco health warnings in tobacco retailers. This study is the first to evaluate the impact of such a policy in the USA.

Cleavage of Hyaluronan is Impaired in Aged Dermal Wounds

Matrix Biology : Journal of the International Society for Matrix Biology. Jan, 2013  |  Pubmed ID: 23022999

Changes in extracellular matrix (ECM) are one of many components that contribute to impaired wound healing in aging. This study examined the effect of age on the glycosaminoglycan hyaluronan (HA) in normal and wounded dermis from young (4-6 month-old) and aged (22-24 month-old) mice. HA content and size were similar in the normal dermis of young and aged mice. Dermal explants labeled with [(3)H]-glucosamine showed decreased generation of smaller forms of HA in aged explants relative to young explants. Aged mice exhibited delayed wound repair compared with young mice with the greatest differential at 5 days. Expression of hyaluronan synthase (HAS) 2 and 3, and hyaluronidase (HYAL) 1-3 mRNA in wounds of young and aged mice was similar. There was a trend toward a decreased HYAL protein expression in aged wound dermis, which was accompanied by changes in detectable HYAL activity. Total HA content was similar in young and aged wound dermis. There was significantly less HA in the lower MW range (~250 kDa and smaller) in 5-day wound dermis, but not in 9-day wound dermis, from aged mice relative to young mice. We propose that decreased cleavage of HA is an additional component of impaired dermal wound healing in aging.

Signaling Dynamics of Palmitate-induced ER Stress Responses Mediated by ATF4 in HepG2 Cells

BMC Systems Biology. 2013  |  Pubmed ID: 23339444

Palmitic acid, the most common saturated free fatty acid, has been implicated in ER (endoplasmic reticulum) stress-mediated apoptosis. This lipoapotosis is dependent, in part, on the upregulation of the activating transcription factor-4 (ATF4). To better understand the mechanisms by which palmitate upregulates the expression level of ATF4, we integrated literature information on palmitate-induced ER stress signaling into a discrete dynamic model. The model provides an in silico framework that enables simulations and predictions. The model predictions were confirmed through further experiments in human hepatocellular carcinoma (HepG2) cells and the results were used to update the model and our current understanding of the signaling induced by palmitate.

Global Protein Phosphorylation Dynamics During Deoxynivalenol-induced Ribotoxic Stress Response in the Macrophage

Toxicology and Applied Pharmacology. Apr, 2013  |  Pubmed ID: 23352502

Deoxynivalenol (DON), a trichothecene mycotoxin produced by Fusarium that commonly contaminates food, is capable of activating mononuclear phagocytes of the innate immune system via a process termed the ribotoxic stress response (RSR). To encapture global signaling events mediating RSR, we quantified the early temporal (≤30min) phosphoproteome changes that occurred in RAW 264.7 murine macrophage during exposure to a toxicologically relevant concentration of DON (250ng/mL). Large-scale phosphoproteomic analysis employing stable isotope labeling of amino acids in cell culture (SILAC) in conjunction with titanium dioxide chromatography revealed that DON significantly upregulated or downregulated phosphorylation of 188 proteins at both known and yet-to-be functionally characterized phosphosites. DON-induced RSR is extremely complex and goes far beyond its prior known capacity to inhibit translation and activate MAPKs. Transcriptional regulation was the main target during early DON-induced RSR, covering over 20% of the altered phosphoproteins as indicated by Gene Ontology annotation and including transcription factors/cofactors and epigenetic modulators. Other biological processes impacted included cell cycle, RNA processing, translation, ribosome biogenesis, monocyte differentiation and cytoskeleton organization. Some of these processes could be mediated by signaling networks involving MAPK-, NFκB-, AKT- and AMPK-linked pathways. Fuzzy c-means clustering revealed that DON-regulated phosphosites could be discretely classified with regard to the kinetics of phosphorylation/dephosphorylation. The cellular response networks identified provide a template for further exploration of the mechanisms of trichothecenemycotoxins and other ribotoxins, and ultimately, could contribute to improved mechanism-based human health risk assessment.

Endothelial Deletion of ADAM17 in Mice Results in Defective Remodeling of the Semilunar Valves and Cardiac Dysfunction in Adults

Mechanisms of Development. Apr-May, 2013  |  Pubmed ID: 23354118

Global inactivation of the metalloproteinase ADAM17 during mouse development results in perinatal lethality and abnormalities of the heart, including late embryonic cardiomegaly and thickened semilunar and atrioventricular valves. These defects have been attributed in part to a lack of ADAM17-mediated processing of HB-EGF, as absence of soluble HB-EGF results in similar phenotypes. Because valvular mesenchymal cells are largely derived from cardiac endothelial cells, we generated mice with a floxed Adam17 allele and crossed these animals with Tie2-Cre transgenics to focus on the role of endothelial ADAM17 in valvulogenesis. We find that although hearts from late-stage embryos with ablation of endothelial ADAM17 appear normal, an increase in valve size and cell number is evident, but only in the semilunar cusps. Unlike Hbegf(-/-) valves, ADAM17-null semilunar valves do not differ from controls in acute cell proliferation at embryonic day 14.5 (E14.5), suggesting compensatory processing of HB-EGF. However, levels of the proteoglycan versican are significantly reduced in mutant hearts early in valve remodeling (E12.5). After birth, aortic valve cusps from mutants are not only hyperplastic but also show expansion of the glycosaminoglycan-rich component, with the majority of adults exhibiting aberrant compartmentalization of versican and increased deposition of collagen. The inability of mutant outflow valve precursors to transition into fully mature cusps is associated with decreased postnatal viability, progressive cardiomegaly, and systolic dysfunction. Together, our data indicate that ADAM17 is required in valvular endothelial cells for regulating cell content as well as extracellular matrix composition and organization in semilunar valve remodeling and homeostasis.

Quantitative, Solution-phase Profiling of Multiple Transcription Factors in Parallel

Analytical and Bioanalytical Chemistry. Mar, 2013  |  Pubmed ID: 23361227

Transcription factors are regulatory proteins that bind to specific sites of chromosomal DNA to enact responses to intracellular and extracellular stimuli. Transcription factor signalling networks are branched and interconnected so that any single transcription factor can activate many different genes and one gene can be activated by a combination of different transcription factors. Thus, trying to characterize a cellular response to a stimulus by measuring the level of only one transcription factor potentially ignores important simultaneous events that contribute to the response. Hence, parallel measurements of transcription factors are necessary to capture the breadth of valuable information about cellular responses that would not be obtained by measuring only a single transcription factor. We have sought to develop a new, scalable, flexible, and sensitive approach to analysis of transcription factor levels that complements existing parallel approaches. Here, we describe proof-of-principle analyses of purified human transcription factors and breast cancer nuclear extracts. Our assay can successfully quantify transcription factors in parallel with ~10-fold better sensitivity than current techniques. Sensitivity of the assay can be further increased by 200-fold through the use of PCR for signal amplification.

Inhibition of Serine Palmitoyltransferase Reduces Aβ and Tau Hyperphosphorylation in a Murine Model: a Safe Therapeutic Strategy for Alzheimer's Disease

Neurobiology of Aging. Aug, 2013  |  Pubmed ID: 23528227

The contribution of the autosomal dominant mutations to the etiology of familial Alzheimer's disease (AD) is well characterized. However, the molecular mechanisms contributing to sporadic AD are less well understood. Increased ceramide levels have been evident in AD patients. We previously reported that increased ceramide levels, regulated by increased serine palmitoyltransferase (SPT), directly mediate amyloid β (Aβ) levels. Therefore, we inhibited SPT in an AD mouse model (TgCRND8) through subcutaneous administration of L-cylcoserine. The cortical Aβ₄₂ and hyperphosphorylated tau levels were down-regulated with the inhibition of SPT/ceramide. Positive correlations were observed among cortical SPT, ceramide, and Aβ₄₂ levels. With no evident toxic effects observed, inhibition of SPT could be a safe therapeutic strategy to ameliorate the AD pathology. We previously observed that miR-137, -181c, -9, and 29a/b post-transcriptionally regulate SPT levels, and the corresponding miRNA levels in the blood sera are potential diagnostic biomarkers for AD. Here, we observe a negative correlation between cortical Aβ₄₂ and sera Aβ₄₂, and a positive correlation between cortical miRNA levels and sera miRNA levels suggesting their potential as noninvasive diagnostic biomarkers.

Chronic Back Problems and Labor Force Participation in a National Population Survey: Impact of Comorbid Arthritis

BMC Public Health. 2013  |  Pubmed ID: 23575216

Back problems and arthritis are common chronic conditions, while having back problems is a frequent reason for lost work time. The objective of this study was to investigate employment status amongst individuals who report having both back problems and arthritis, compared to having either condition alone.

The Impact of Cigarette Excise Tax Increases on Purchasing Behaviors Among New York City Smokers

American Journal of Public Health. Jun, 2013  |  Pubmed ID: 23597382

We examined the relationship between cigarette excise tax increases and tax-avoidant purchasing behaviors among New York City adult smokers.

A Multi-layer Inference Approach to Reconstruct Condition-specific Genes and Their Regulation

Bioinformatics (Oxford, England). Jun, 2013  |  Pubmed ID: 23610368

An important topic in systems biology is the reverse engineering of regulatory mechanisms through reconstruction of context-dependent gene networks. A major challenge is to identify the genes and the regulations specific to a condition or phenotype, given that regulatory processes are highly connected such that a specific response is typically accompanied by numerous collateral effects. In this study, we design a multi-layer approach that is able to reconstruct condition-specific genes and their regulation through an integrative analysis of large-scale information of gene expression, protein interaction and transcriptional regulation (transcription factor-target gene relationships). We establish the accuracy of our methodology against synthetic datasets, as well as a yeast dataset. We then extend the framework to the application of higher eukaryotic systems, including human breast cancer and Arabidopsis thaliana cold acclimation. Our study identified TACSTD2 (TROP2) as a target gene for human breast cancer and discovered its regulation by transcription factors CREB, as well as NFkB. We also predict KIF2C is a target gene for ER-/HER2- breast cancer and is positively regulated by E2F1. The predictions were further confirmed through experimental studies.

A Classification Framework Applied to Cancer Gene Expression Profiles

Journal of Healthcare Engineering. 2013  |  Pubmed ID: 23778014

Classification of cancer based on gene expression has provided insight into possible treatment strategies. Thus, developing machine learning methods that can successfully distinguish among cancer subtypes or normal versus cancer samples is important. This work discusses supervised learning techniques that have been employed to classify cancers. Furthermore, a two-step feature selection method based on an attribute estimation method (e.g., ReliefF) and a genetic algorithm was employed to find a set of genes that can best differentiate between cancer subtypes or normal versus cancer samples. The application of different classification methods (e.g., decision tree, k-nearest neighbor, support vector machine (SVM), bagging, and random forest) on 5 cancer datasets shows that no classification method universally outperforms all the others. However, k-nearest neighbor and linear SVM generally improve the classification performance over other classifiers. Finally, incorporating diverse types of genomic data (e.g., protein-protein interaction data and gene expression) increase the prediction accuracy as compared to using gene expression alone.

Early Phosphoproteomic Changes in the Mouse Spleen During Deoxynivalenol-induced Ribotoxic Stress

Toxicological Sciences : an Official Journal of the Society of Toxicology. Sep, 2013  |  Pubmed ID: 23811945

The trichothecene mycotoxin deoxynivalenol (DON) targets the innate immune system and is of public health significance because of its frequent presence in human and animal food. DON-induced proinflammatory gene expression and apoptosis in the lymphoid tissue have been associated with a ribotoxic stress response (RSR) that involves rapid phosphorylation of mitogen-activated protein kinases (MAPKs). To better understand the relationship between protein phosphorylation and DON's immunotoxic effects, stable isotope dimethyl labeling-based proteomics in conjunction with titanium dioxide chromatography was employed to quantitatively profile the immediate (≤ 30min) phosphoproteome changes in the spleens of mice orally exposed to 5mg/kg body weight DON. A total of 90 phosphoproteins indicative of novel phosphorylation events were significantly modulated by DON. In addition to critical branches and scaffolds of MAPK signaling being affected, DON exposure also altered phosphorylation of proteins that mediate phosphatidylinositol 3-kinase/AKT pathways. Gene ontology analysis revealed that DON exposure affected biological processes such as cytoskeleton organization, regulation of apoptosis, and lymphocyte activation and development, which likely contribute to immune dysregulation associated with DON-induced RSR. Consistent with these findings, DON impacted phosphorylation of proteins within diverse immune cell populations, including monocytes, macrophages, T cells, B cells, dendritic cells, and mast cells. Fuzzy c-means clustering analysis further indicated that DON evoked several distinctive temporal profiles of regulated phosphopeptides. Overall, the findings from this investigation can serve as a template for future focused exploration and modeling of cellular responses associated with the immunotoxicity evoked by DON and other ribotoxins.

Acute Myocardial Infarction and Stress Cardiomyopathy Following the Christchurch Earthquakes

PloS One. 2013  |  Pubmed ID: 23844213

Christchurch, New Zealand, was struck by 2 major earthquakes at 4:36 am on 4 September 2010, magnitude 7.1 and at 12:51 pm on 22 February 2011, magnitude 6.3. Both events caused widespread destruction. Christchurch Hospital was the region's only acute care hospital. It remained functional following both earthquakes. We were able to examine the effects of the 2 earthquakes on acute cardiac presentations.

Human Milk Galectin-3 Binding Protein and Breast-feeding-associated HIV Transmission

The Pediatric Infectious Disease Journal. Dec, 2013  |  Pubmed ID: 23899964

Analysis of milk from 247 HIV-infected Zambian mothers showed that galectin-3 binding protein concentrations were significantly higher among HIV-infected mothers who transmitted HIV through breast-feeding (6.51 ± 2.12 μg/mL) than among nontransmitters but were also correlated with higher milk and plasma HIV RNA copies/mL and lower CD4+ cell counts. The association between galectin-3 binding protein and postnatal transmission was attenuated after adjustment for milk and plasma HIV load and CD4+ cell counts. This suggests that although milk galectin-3 binding protein is a marker of advanced maternal disease, it does not independently modify transmission risk.

Palmitate Induces Transcriptional Regulation of BACE1 and Presenilin by STAT3 in Neurons Mediated by Astrocytes

Experimental Neurology. Oct, 2013  |  Pubmed ID: 23968646

Deregulation of calcium has been implicated in neurodegenerative diseases, including Alzheimer's disease (AD). Previously, we showed that saturated free-fatty acid, palmitate, causes AD-like changes in primary cortical neurons mediated by astrocytes. However, the molecular mechanisms by which conditioned medium from astrocytes cultured in palmitate induce AD-like changes in neurons are unknown. This study demonstrates that this condition medium from astrocytes elevates calcium level in the neurons, which subsequently increases calpain activity, a calcium-dependent protease, leading to enhance p25/Cdk5 activity and phosphorylation and activation of the STAT3 (signal transducer and activator of transcription) transcription factor. Inhibiting calpain or Cdk5 significantly reduces the upregulation in nuclear level of pSTAT3, which we found to transcriptionally regulate both BACE1 and presenilin-1, the latter is a catalytic subunit of γ-secretase. Decreasing pSTAT3 levels reduced the mRNA levels of both BACE1 and presenilin-1 to near control levels. These data demonstrate a signal pathway leading to the activation of STAT3, and the generation of the amyloid peptide. Thus, our results suggest that STAT3 is an important potential therapeutic target of AD pathogenesis.

A Prospective, Assessor-blind Evaluation of Surgeon-performed Transcutaneous Laryngeal Ultrasonography in Vocal Cord Examination Before and After Thyroidectomy

Surgery. Dec, 2013  |  Pubmed ID: 23969288

Transcutaneous laryngeal ultrasonography (TLUSG) is a promising alternative to direct laryngoscopy in assessing perioperative vocal cord function. This study sought to evaluate the accuracy of TLUSG in assessing vocal cord function.

Design of SiRNA Therapeutics from the Molecular Scale

Pharmaceuticals (Basel, Switzerland). 2013  |  Pubmed ID: 23976875

While protein-based therapeutics is well-established in the market, development of nucleic acid therapeutics has lagged. Short interfering RNAs (siRNAs) represent an exciting new direction for the pharmaceutical industry. These small, chemically synthesized RNAs can knock down the expression of target genes through the use of a native eukaryotic pathway called RNA interference (RNAi). Though siRNAs are routinely used in research studies of eukaryotic biological processes, transitioning the technology to the clinic has proven challenging. Early efforts to design an siRNA therapeutic have demonstrated the difficulties in generating a highly-active siRNA with good specificity and a delivery vehicle that can protect the siRNA as it is transported to a specific tissue. In this review article, we discuss design considerations for siRNA therapeutics, identifying criteria for choosing therapeutic targets, producing highly-active siRNA sequences, and designing an optimized delivery vehicle. Taken together, these design considerations provide logical guidelines for generating novel siRNA therapeutics.

Historical Epidemiology of the Second Cholera Pandemic: Relevance to Present Day Disease Dynamics

PloS One. 2013  |  Pubmed ID: 23991117

Despite nearly two centuries of study, the fundamental transmission dynamic properties of cholera remain incompletely characterized. We used historical time-series data on the spread of cholera in twelve European and North American cities during the second cholera pandemic, as reported in Amariah Brigham's 1832 A Treatise on Epidemic Cholera, to parameterize simple mathematical models of cholera transmission. Richards growth models were used to derive estimates of the basic reproductive number (R0) (median: 16.0, range: 1.9 to 550.9) and the proportion of unrecognized cases (mean: 96.3%, SD: 0.04%). Heterogeneity in model-generated R0 estimates was consistent with variability in cholera dynamics described by contemporary investigators and may represent differences in the nature of cholera spread. While subject to limitations associated with measurement and the absence of microbiological diagnosis, historical epidemic data are a potentially rich source for understanding pathogen dynamics in the absence of control measures, particularly when used in conjunction with simple and readily interpretable mathematical models.

Challenges in the Practice of Human Milk Nutrition in the Neonatal Intensive Care Unit

Early Human Development. Oct, 2013  |  Pubmed ID: 23998449

The use of human milk for preterm infants has increased over the past decade reflecting an improved awareness of the benefits of human milk. Inherent in this paradigm shift is the recognition that human milk is a living tissue; full of immune cells, probiotics and hundreds of compounds that confer bioactivity and immune protective properties. Together these factors deliver a powerful effect in reducing clinical morbidities such as necrotizing enterocolitis and sepsis in the preterm infant. However, as breastfeeding is not possible for the very premature infant, human milk needs to be introduced in the neonatal intensive care unit through alternative means, resulting in significant handling and manipulation of maternal milk. This presents risks in quality control and provision of optimal nutrition delivery. Therefore, a comprehensive approach to standardizing preterm infant nutrition is essential to optimize the collection, storage, fortification and delivery of human milk to preterm neonates. In this paper we discuss the challenges presented by supporting human milk nutrition, and the rationale for the development of the Supporting Premature Infant Nutrition (SPIN) program at our institution.

Curcumin-induced Upregulation of the Anti-tau Cochaperone BAG2 in Primary Rat Cortical Neurons

Neuroscience Letters. Oct, 2013  |  Pubmed ID: 24035895

Alzheimer's disease (AD) is a progressive, neurodegenerative disease characterized by extracellular deposits of amyloid beta (Aβ) protein and intracellular neurofibrillary tangles of hyperphosphorylated tau protein. Various studies suggest that the tau tangle pathology, which lies downstream to Aβ pathology, is essential to produce AD-associated clinical phenotype and thus treatments targeting tau pathology may prevent or delay disease progression effectively. In this context, our present study examined three polyphenol compounds (curcumin, EGCG and resveratrol) for their possible activity against two endogenous proteins (BAG2 and LAMP1) that are shown to play a vital role in clearing tau tangles from neurons. Human epidemiological and animal data suggest potential positive effects of these polyphenols against AD. Here, primary rat cortical neurons treated with these polyphenols significantly up-regulated BAG2 levels at different concentrations, while only EGCG upregulated LAMP1 levels, although at higher concentrations. Importantly, curcumin doubled BAG2 levels at low micromolar concentrations that are clinically relevant. In addition, curcumin also downregulated levels of phosphorylated tau, which may be potentially attributed to the curcumin-induced upregulation in BAG2 levels in the neurons. The present results demonstrate novel activity of polyphenol curcumin in up-regulating an anti-tau cochaperone BAG2 and thus, suggest probable benefit of curcumin against AD-associated tauopathy.

Association Between Mycoplasma-specific Polymerase Chain Reaction Assay Results and Oral Bacterial Contamination of Bronchoalveolar Lavage Fluid Samples from Dogs with Respiratory Tract Disease: 121 Cases (2005-2012)

Journal of the American Veterinary Medical Association. Dec, 2013  |  Pubmed ID: 24261807

To determine whether an association exists between oral bacterial contamination of bronchoalveolar lavage fluid (BALF) and positive PCR assay results for the detection of Mycoplasma spp in BALF samples of dogs with lower respiratory tract (LRT; portion from the trachea to the lungs) disease.

ADAMTS-4 and Biglycan Are Expressed at High Levels and Co-localize to Podosomes During Endothelial Cell Tubulogenesis in Vitro

The Journal of Histochemistry and Cytochemistry : Official Journal of the Histochemistry Society. Jan, 2014  |  Pubmed ID: 24051360

Proteolysis of the extracellular matrix influences vascular growth. We examined the expression of ADAMTS-1, -4, and -5 metalloproteinases and their proteoglycan substrates versican, decorin, and biglycan as human umbilical vein endothelial cells (HUVECs) formed tubes within type I collagen gels in vitro. Tubulogenic and control HUVEC cultures expressed low levels of ADAMTS-1 and -5 mRNAs, but ADAMTS-4 mRNA was relatively abundant and was significantly elevated (as was ADAMTS-4 protein) in tubulogenic cultures versus controls. Immunocytochemistry revealed ADAMTS-4 in f-actin- and cortactin-positive podosome-like puncta in single cells and mature tubes. Tubulogenic and control cultures expressed low levels of versican and decorin mRNAs; however, peak levels of biglycan mRNA were 400- and 16,000-fold that of versican and decorin, respectively. Biglycan mRNA was highest at 3 hr, declined steadily through day 7 and, at 12 hr and beyond, was significantly lower in tubulogenic cultures than in controls. Western blots of extracellular matrix from tubulogenic cultures contained bands corresponding to biglycan and its cleavage products. By immunocytochemistry, biglycan was found in the pericellular matrix surrounding endothelial tubes and in cell-associated puncta that co-localized with ADAMTS-4 and cortactin. Collectively, our results suggest that ADAMTS-4 and its substrate biglycan are involved in tubulogenesis by endothelial cells.

IPAF Inflammasome is Involved in Interleukin-1β Production from Astrocytes, Induced by Palmitate; Implications for Alzheimer's Disease

Neurobiology of Aging. Feb, 2014  |  Pubmed ID: 24054992

Inflammatory response has been strongly implicated in the pathogenesis of numerous diseases, including Alzheimer's disease (AD). However, little is known about the molecular mechanisms initiating the generation of inflammatory molecules in the central nervous system, such as interleukin-1β (IL-1β). Previously we identified that palmitate can induce primary astrocytes to produce cytokines, causing AD-like changes in primary neurons. Here we investigated and identified that palmitate induced the activation of ice protease-activating factor (IPAF)-apoptosis-associated speck-like protein containing a caspase activation and recruitment domains (CARD) (ASC) inflammasome in astrocytes leading to the maturation of IL-1β, thereby implicating that not only pathogen-related factors can activate the IPAF-ASC inflammasome. Moreover, downregulating IPAF (which was found to be regulated by cAMP response element-binding protein) in astrocytes through silencing to decrease IL-1β secretion from the astrocytes reduced the generation of amyloid-β42 by primary neurons. Furthermore, the expression levels of IPAF and ASC were found significantly elevated in a subgroup of sporadic AD patients, suggesting an involvement of the IPAF-ASC inflammasome in the inflammatory response associated with AD, and thus could be a potential therapeutic target for AD.

Is Vocal Cord Asymmetry Seen on Transcutaneous Laryngeal Ultrasonography a Significant Predictor of Voice Quality Changes After Thyroidectomy?

World Journal of Surgery. Mar, 2014  |  Pubmed ID: 24271694

Vocal cord asymmetry (VCA) on laryngoscopic examination (LE) may suggest voice impairment after thyroidectomy, but LE may cause patient discomfort. We aimed to correlate the presence of postoperative VCA assessed by noninvasive transcutaneous laryngeal ultrasonography (TLUSG) with voice quality changes after thyroidectomy.

Improved Asymmetry Prediction for Short Interfering RNAs

The FEBS Journal. Jan, 2014  |  Pubmed ID: 24393396

In the development of RNA interference therapeutics, merely selecting short interfering RNA (siRNA) sequences that are complementary to the mRNA target does not guarantee target silencing. Current algorithms for selecting siRNAs rely on many parameters, one of which is asymmetry, often predicted through calculation of the relative thermodynamic stabilities of the two ends of the siRNA. However, we have previously shown that highly active siRNA sequences are likely to have particular nucleotides at each 5'-end, independently of their thermodynamic asymmetry. Here, we describe an algorithm for predicting highly active siRNA sequences based only on these two asymmetry parameters. The algorithm uses end-sequence nucleotide preferences and predicted thermodynamic stabilities, each weighted on the basis of training data from the literature, to rank the probability that an siRNA sequence will have high or low activity. The algorithm successfully predicts weakly and highly active sequences for enhanced green fluorescent protein and protein kinase R. Use of these two parameters in combination improves the prediction of siRNA activity over current approaches for predicting asymmetry. Going forward, we anticipate that this approach to siRNA asymmetry prediction will be incorporated into the next generation of siRNA selection algorithms.

Prediction of Therapeutic MicroRNA Based on the Human Metabolic Network

Bioinformatics (Oxford, England). Jan, 2014  |  Pubmed ID: 24403541

MicroRNA (miRNA) expression has been found to be deregulated in human cancer, contributing, in part, to the interest of the research community in using miRNAs as alternative therapeutic targets. Although miRNAs could be potential targets, identifying which miRNAs to target for a particular type of cancer has been difficult due to the limited knowledge on their regulatory roles in cancer. We address this challenge by integrating miRNA-target prediction, metabolic modeling and context-specific gene expression data to predict therapeutic miRNAs that could reduce the growth of cancer.

A Rapid Increase in Macrophage-derived Versican and Hyaluronan in Infectious Lung Disease

Matrix Biology : Journal of the International Society for Matrix Biology. Feb, 2014  |  Pubmed ID: 24472738

The goals of this study were to characterize the changes in chondroitin sulfate proteoglycans and hyaluronan in lungs in acute response to gram-negative bacterial infection and to identify cellular components responsible for these changes. Mice were treated with intratracheal (IT) live Escherichia coli, E. coli lipopolysaccharide (LPS), or PBS. Both E. coli and LPS caused rapid selective increases in mRNA expression of versican and hyaluronan synthase (Has) isoforms 1 and 2 associated with increased immunohistochemical and histochemical staining for versican and hyaluronan in the lungs. Versican was associated with a subset of alveolar macrophages. To examine whether macrophages contribute to versican and hyaluronan accumulation, in vitro studies with primary cultures of bone marrow-derived and alveolar macrophages were performed. Unstimulated macrophages expressed very low levels of versican and hyaluronan synthase mRNA, with no detectible versican protein or hyaluronan product. Stimulation with LPS caused rapid increases in versican mRNA and protein, a rapid increase in Has1 mRNA, and concomitant inhibition of hyaluronidases 1 and 2, the major hyaluronan degrading enzymes. Hyaluronan could be detected following chloroquine pre-treatment, indicating rapid turnover and degradation of hyaluronan by macrophages. In addition, the effects of LPS, the M1 macrophage classical activation agonist, were compared to those of IL-4/IL-13 or IL-10, the M2a and M2c alternative activation agonists, respectively. Versican and Has1 increased only in response to M1 activation. Finally, the up-regulation of versican and Has1 in the whole lungs of wild-type mice following IT LPS was completely abrogated in TLR-4(-/-) mice. These findings suggest that versican and hyaluronan synthesis may play an important role in the innate immune response to gram-negative lung infection.

Augmenting Protein Release from Layer-by-layer Functionalized Agarose Hydrogels

Carbohydrate Polymers. Mar, 2014  |  Pubmed ID: 24528743

Recent work demonstrated the efficacy of combining layer-by-layer assembly with hydrogels to provide the controlled delivery of proteins for use in nerve repair scaffolds. In this work, we augmented the protein dose response by controlling and increasing the hydrogel internal surface area. Sucrose was added to agarose during gelation to homogenize the nanopore morphology, resulting in increased surface area per unit volume of hydrogel. The surface area of a range of compositions (1.5-5.0 wt% agarose and 0, 50 and 65 wt% sucrose) was measured. Gels were supercritically dried to preserve porosity enabling detailed pore morphology measurements using nitrogen adsorption and high resolution scanning electron microscopy. The resulting surface area, normalized by superficial gel volume, ranged between 6m(2)/cm(3)gel and 56 m(2)/cm(3)gel. Using the layer-by-layer process to load lysozyme, a neurotrophic factor analog, a relationship was observed between surface area and cumulative dose response ranging from 176 to 2556 μg/mL, which is in the range of clinical relevance for the delivery of growth factors. In this work, we demonstrated that the ability to control porosity is key in tuning drug delivery dose response from layer-by-layer modified hydrogels.

The Role of Inflammasome in Alzheimer's Disease

Ageing Research Reviews. May, 2014  |  Pubmed ID: 24561250

Alzheimer's disease (AD) is a chronic, progressive and irreversible neurodegenerative disease with clinical characteristics of memory loss, dementia and cognitive impairment. Although the pathophysiologic mechanism is not fully understood, inflammation has been shown to play a critical role in the pathogenesis of AD. Inflammation in the central nervous system (CNS) is characterized by the activation of glial cells and release of proinflammatory cytokines and chemokines. Accumulating evidence demonstrates that inflammasomes, which cleave precursors of interleukin-1β (IL-1β) and IL-18 to generate their active forms, play an important role in the inflammatory response in the CNS and in AD pathogenesis. Therefore, modulating inflammasome complex assembly and activation could be a potential strategy for suppressing inflammation in the CNS. This review aims to provide insight into the role of inflammasomes in the CNS, with respect to the pathogenesis of AD, and may provide possible clues for devising novel therapeutic strategies.

Systematic Modeling for the Insulin Signaling Network Mediated by IRS(1) and IRS(2)

Journal of Theoretical Biology. Aug, 2014  |  Pubmed ID: 24703981

The hepatic insulin signaling mediated by insulin receptor substrates IRS1 and IRS2 plays a central role in maintaining glucose homeostasis under different physiological conditions. Although functions of individual components in the signaling network have been extensively studied, our knowledge is still limited with regard to how the signals are integrated and coordinated in the complex network to render their functional roles. In this study, we construct systematic models for the insulin signaling network mediated by IRS1 and IRS2, through the integration of current knowledge in the literature into mathematical models of insulin signaling pathways. We hypothesize that the specificity of the IRS signaling mechanisms emerges from the wiring and kinetics of the entire network. A discrete dynamic model is first constructed to account for the numerous dynamic features in the system, i.e., complex feedback circuits, different regulatory time-scales and cross-talks between pathways. Our simulation shows that the wiring of the network determines different functions of IRS1 and IRS2. We further collate and reconstruct a kinetic model of the network as a system of ordinary differential equations to provide an informative model for predicting phenotypes. A sensitivity analysis is applied to identify essential regulators for the signaling process.

Reprint Of: A Rapid Increase in Macrophage-derived Versican and Hyaluronan in Infectious Lung Disease

Matrix Biology : Journal of the International Society for Matrix Biology. Apr, 2014  |  Pubmed ID: 24727035

The goals of this study were to characterize the changes in chondroitin sulfate proteoglycans and hyaluronan in lungs in acute response to gram-negative bacterial infection and to identify cellular components responsible for these changes. Mice were treated with intratracheal (IT) live Escherichia coli, E. coli lipopolysaccharide (LPS), or PBS. Both E. coli and LPS caused rapid selective increases in mRNA expression of versican and hyaluronan synthase (Has) isoforms 1 and 2 associated with increased immunohistochemical and histochemical staining for versican and hyaluronan in the lungs. Versican was associated with a subset of alveolar macrophages. To examine whether macrophages contribute to versican and hyaluronan accumulation, in vitro studies with primary cultures of bone marrow-derived and alveolar macrophages were performed. Unstimulated macrophages expressed very low levels of versican and hyaluronan synthase mRNA, with no detectible versican protein or hyaluronan product. Stimulation with LPS caused rapid increases in versican mRNA and protein, a rapid increase in Has1 mRNA, and concomitant inhibition of hyaluronidases 1 and 2, the major hyaluronan degrading enzymes. Hyaluronan could be detected following chloroquine pre-treatment, indicating rapid turnover and degradation of hyaluronan by macrophages. In addition, the effects of LPS, the M1 macrophage classical activation agonist, were compared to those of IL-4/IL-13 or IL-10, the M2a and M2c alternative activation agonists, respectively. Versican and Has1 increased only in response to M1 activation. Finally, the up-regulation of versican and Has1 in the whole lungs of wild-type mice following IT LPS was completely abrogated in TLR-4(-/-) mice. These findings suggest that versican and hyaluronan synthesis may play an important role in the innate immune response to gram-negative lung infection.

Binding Site Multiplicity with Fatty Acid Ligands: Implications for the Regulation of PKR Kinase Autophosphorylation with Palmitate

Proteins. Oct, 2014  |  Pubmed ID: 24862841

Saturated long chain-free fatty acids (FFAs), especially palmitate, have been implicated in apoptosis by inhibiting the activity of PKR (double-stranded RNA-dependent protein kinase). We recently found evidence that palmitate interacts directly with the kinase domain of PKR, subsequently inhibiting the autophosphorylation of PKR. To investigate the interactions of palmitate with PKR and its effects on PKR autophosphorylation, we performed extensive unbiased MD simulations combined with biochemical and biophysical experiments. The simulations predict multiple putative binding sites of palmitate on both the phosphorylated and unphosphorylated PKR with similar binding affinities. Ligand-protein interactions involving a large variety of different binding modes challenge the conventional view of highly specific, single binding sites. Key interactions of palmitate involve the αC-helix of PKR, especially near residue R307. Experimental mutation of R307 was found to affect palmitate binding and reduce its inhibitory effect. Based on this study a new allosteric mechanism is proposed where palmitate binding to the αC-helix prevents the inactive-to-active transition of PKR and subsequently reduces its ability to autophosphorylate.

One-year Follow-up of the 2011 Christchurch Earthquake Stress Cardiomyopathy Cases

The New Zealand Medical Journal. Jun, 2014  |  Pubmed ID: 24997460

A major earthquake struck Christchurch on 22 February 2011 causing extensive damage to the city and 185 direct fatalities. Within 4 days 21 postmenopausal women presented to Christchurch Hospital with stress cardiomyopathy. We were able to closely examine these patients in the immediate phase of presentation and at 12 months.

CREB Modulates Calcium Signaling in CAMP-induced Bone Marrow Stromal Cells (BMSCs)

Cell Calcium. Oct, 2014  |  Pubmed ID: 25154887

Calcium signaling has a versatile role in many important cellular functions. Despite its importance, regulation of calcium signaling in bone marrow stromal cells (BMSCs, also known as bone marrow-derived mesenchymal stem cells) has not been explored extensively. Our previous study revealed that cyclic adenosine monophosphate (cAMP) enabled BMSCs to generate calcium signal upon stimulation by dopamine, KCl and glutamate. Concurrently, cAMP transiently activated the transcription factor cAMP response element binding protein (CREB) in BMSCs. Activity of CREB can be modulated by the calcium/calmodulin-dependent kinase signaling pathway, however, whether the calcium signaling observed in cAMP-induced BMSCs requires CREB has not been investigated. In an effort to uncover the role of CREB in the generation of calcium signaling in response to modulators such as dopamine and KCl, we knocked down CREB activity in BMSCs. Our study indicated that BMSCs, but not its close relative fibroblasts, are responsive to dopamine and KCl after cAMP treatment. Calcium signal elicited by dopamine depends, in part, on calcium influx whereas that elicited by KCl depends completely on calcium influx. Knock-down of CREB activity significantly reduced or abolished the cAMP-induced calcium response, and reintroducing a constitutively active CREB partially restored the calcium response.

Detection of Glaucoma and Its Association With Diabetic Retinopathy in a Diabetic Retinopathy Screening Program

Journal of Glaucoma. Sep, 2014  |  Pubmed ID: 25264989

To determine the type of glaucoma in subjects with diabetes mellitus detected during a diabetic retinopathy screening program and to determine any association between diabetic retinopathy (DR) and glaucoma.

Hospital Admission for Community-acquired Pneumonia in a First Nations Population

Canadian Journal of Rural Medicine : the Official Journal of the Society of Rural Physicians of Canada = Journal Canadien De La Médecine Rurale : Le Journal Officiel De La Société De Médecine Rurale Du Canada. 2014  |  Pubmed ID: 25291038

Northwestern Ontario is a large rural area with a high concentration of remote First Nations communities. In Ontario, the highest hospital admission rates for pneumonia are reported from northern and rural regions. However, data are lacking on the epidemiology of community-acquired pneumonia in northwestern Ontario. We sought to characterize cases of community-acquired pneumonia requiring admission at the Sioux Lookout Meno Ya Win Health Centre, which serves a primarily First Nations population of 28,000.

The Impact of Lack of Government-insured Routine Eye Examinations on the Incidence of Self-reported Glaucoma, Cataracts, and Vision Loss

Investigative Ophthalmology & Visual Science. Dec, 2014  |  Pubmed ID: 25491296

We determined the impact of lack of government insured routine eye examinations on the incidence of self-reported glaucoma, cataracts and vision loss.

Public Opinions on Tax and Retail-based Tobacco Control Strategies

Tobacco Control. Mar, 2015  |  Pubmed ID: 24365700

While tobacco taxes and smoke-free air regulations have significantly decreased tobacco use, tobacco-related illness accounts for hundreds of thousands of annual deaths. Experts are considering additional strategies to further reduce tobacco consumption.

Hyaluronan in Aged Collagen Matrix Increases Prostate Epithelial Cell Proliferation

In Vitro Cellular & Developmental Biology. Animal. Jan, 2015  |  Pubmed ID: 25124870

The extracellular matrix (ECM) of the prostate, which is comprised primarily of collagen, becomes increasingly disorganized with age, a property that may influence the development of hyperplasia and cancer. Collageous ECM extracted from the tails of aged mice exhibits many characteristics of collagen in aged tissues, including the prostate. When polymerized into a 3-dimensional (3D) gel, these collagen extracts can serve as models for the study of specific cell-ECM interactions. In the present study, we examined the behaviors of human prostatic epithelial cell lines representing normal prostate epithelial cells (PEC), benign prostatic hyperplasia (BPH-1), and adenocarcinoma (LNCaP) cultured in contact with 3D gels made from collagen extracts of young and aged mice. We found that proliferation of PEC, BPH-1, and LNCaP cells were all increased by culture on aged collagen gels relative to young collagen gels. In examining age-associated differences in the composition of the collagen extracts, we found that aged and young collagen had a similar amount of several collagen-associated ECM components, but aged collagen had a much greater content of the glycosaminoglycan hyaluronan (HA) than young collagen. The addition of HA (of similar size and concentration to that found in aged collagen extracts) to cells placed in young collagen elicited significantly increased proliferation in BPH-1 cells, but not in PEC or LNCaP cells, relative to controls not exposed to HA. Of note, histochemical analyses of human prostatic tissues showed significantly higher expression of HA in BPH and prostate cancer stroma relative to stroma of normal prostate. Collectively, these results suggest that changes in ECM involving increased levels of HA contribute to the growth of prostatic epithelium with aging.

The Detection of Glycosaminoglycans in Pancreatic Islets and Lymphoid Tissues

Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2015  |  Pubmed ID: 25325969

In this chapter, we describe the detection of the glycosaminoglycans hyaluronan and heparan sulfate in pancreatic islets and lymphoid tissues. The identification of hyaluronan in tissues is achieved by utilizing a highly specific hyaluronan binding protein (HABP) probe that interacts with hyaluronan in tissue sections. The HABP probe is prepared by enzymatic digestion of the chondroitin sulfate proteoglycan aggrecan which is present in bovine nasal cartilage, and is then biotinylated in the presence of bound hyaluronan and the link protein. Hyaluronan is then removed by gel filtration chromatography. The biotinylated HABP-link protein complex is applied to tissue sections and binding of the complex to tissue hyaluronan is visualized by enzymatic precipitation of chromogenic substrates. To determine hyaluronan content in tissues, tissues are first proteolytically digested to release hyaluronan from the macromolecular complexes that this molecule forms with other extracellular matrix constituents. Digested tissue is then incubated with HABP. The hyaluronan-HABP complexes are extracted and the hyaluronan concentration in the tissue is determined using an ELISA-like assay. Heparan sulfate is identified in mouse tissues by Alcian blue histochemistry and indirect immunohistochemistry. In human tissues, heparan sulfate is best detected by indirect immunohistochemistry using a specific anti-heparan sulfate monoclonal antibody. A biotinylated secondary antibody is then applied in conjunction with streptavidin-peroxidase and its binding to the anti-heparan sulfate antibody is visualized by enzymatic precipitation of chromogenic substrates.

Brain Derived Neurotrophic Factor Release from Layer-by-layer Coated Agarose Nerve Guidance Scaffolds

Acta Biomaterialia. May, 2015  |  Pubmed ID: 25712385

Agarose nerve guidance scaffolds (NGS) seeded with cells expressing brain derived neurotrophic factor (BDNF) have demonstrated robust nerve regeneration in the rat central nervous system. The purpose of this work was to explore whether agarose NGS coated with hydrogen-bonded layer-by-layer (HLbL) could provide an acellular method of delivering prolonged and consistent dosages of active BDNF. Our results show that HLbL-coated agarose NGS could release BDNF over 10days in consistent dosages averaging 80.5±12.5(SD)ng/mL. Moreover, the BDNF released from HLbL was confirmed active by in vitro cell proliferation assays. To our knowledge, this is the first report demonstrating that HLbL assembled onto a hydrogel can provide consistent, prolonged release of active BDNF in clinically relevant dosages.

Pharmacologic Evaluation of Ammonium Tetrathiomolybdate After Intravenous and Oral Administration to Healthy Dogs

American Journal of Veterinary Research. May, 2015  |  Pubmed ID: 25909377

To evaluate pharmacokinetics of ammonium tetrathiomolybdate (TTM) after IV and oral administration to dogs and effects of TTM administration on trace mineral concentrations.

Polymeric Micelle-Mediated Delivery of DNA-Targeting Organometallic Complexes for Resistant Ovarian Cancer Treatment

Small (Weinheim an Der Bergstrasse, Germany). Aug, 2015  |  Pubmed ID: 25963931

Three half-sandwich iridium and ruthenium organometallic complexes with high cytotoxicity are synthesized, and their anticancer mechanisms are elucidated. The organometallic complexes can interact with DNA through coordination or intercalation, thereby inducing apoptosis and inhibiting proliferation of resistant cancer cells. The organometallic complexes are then incorporated into polymeric micelles through the polymer-metal coordination between poly(ethylene glycol)-b-poly(glutamic acid) [PEG-b-P(Glu)] and organometallic complexes to further enhance their anticancer effects as a result of the enhanced permeability and retention effect. The micelles with particle sizes of ≈60 nm are more efficiently internalized by cancer cells than the corresponding complexes, and selectively dissociate and release organometallic anticancer agents within late endosomes and lysosomes, thereby enhancing drug delivery to the nuclei of cancer cells and facilitating their interactions with DNA. Thus, the micelles display higher antitumor activity than the organometallic complexes alone with a lack of the systemic toxicity in a mouse xenograft model of cisplatin-resistant human ovarian cancer. These results suggest that the polymeric micelles carrying anticancer organometallic complexes provide a promising platform for the treatment of resistant ovarian cancer and other hard-to-treat solid tumors.

Nanomedicine for Combination Therapy of Cancer

EBioMedicine. May, 2015  |  Pubmed ID: 26137577

Rapid Fine Conformational Epitope Mapping Using Comprehensive Mutagenesis and Deep Sequencing

The Journal of Biological Chemistry. Oct, 2015  |  Pubmed ID: 26296891

Knowledge of the fine location of neutralizing and non-neutralizing epitopes on human pathogens affords a better understanding of the structural basis of antibody efficacy, which will expedite rational design of vaccines, prophylactics, and therapeutics. However, full utilization of the wealth of information from single cell techniques and antibody repertoire sequencing awaits the development of a high throughput, inexpensive method to map the conformational epitopes for antibody-antigen interactions. Here we show such an approach that combines comprehensive mutagenesis, cell surface display, and DNA deep sequencing. We develop analytical equations to identify epitope positions and show the method effectiveness by mapping the fine epitope for different antibodies targeting TNF, pertussis toxin, and the cancer target TROP2. In all three cases, the experimentally determined conformational epitope was consistent with previous experimental datasets, confirming the reliability of the experimental pipeline. Once the comprehensive library is generated, fine conformational epitope maps can be prepared at a rate of four per day.

Cost-Effectiveness of Screening for Intermediate Age-Related Macular Degeneration During Diabetic Retinopathy Screening

Ophthalmology. Nov, 2015  |  Pubmed ID: 26315045

To determine whether screening for age-related macular degeneration (AMD) during a diabetic retinopathy (DR) screening program would be cost effective in Hong Kong.

How Can Novel Microscopic Approaches Shed Light on the Function of Nucleic Acid-based Drugs?

Future Medicinal Chemistry. 2015  |  Pubmed ID: 26381477

Elevated Free Fatty Acid Uptake Via CD36 Promotes Epithelial-mesenchymal Transition in Hepatocellular Carcinoma

Scientific Reports. 2015  |  Pubmed ID: 26424075

Hepatocellular carcinoma (HCC) is the second-leading cause of cancer-related death worldwide, and the factors influencing HCC progression are poorly understood. Here we reveal that HCC progression via induction of epithelial-mesenchymal transition (EMT) is closely associated with the expression of CD36/fatty acid translocase and elevated free fatty acid (FFA) levels. Although obesity is manifested as elevated FFA levels, the degree of EMT was not associated with the body mass index of the patients, highlighting the specific roles of CD36 and FFA uptake. Treatment of human liver cancer cell lines with FFAs exacerbated the EMT phenotype, whereas chemical inhibition of CD36 mitigated these effects. Furthermore, the Wnt and TGF-β signaling pathways were activated upon FFA treatment, potentially acting as upstream activators of the EMT program. These results provide the first direct evidence associating CD36 and elevated FFAs with HCC progression.

The Impact of a Co-payment on the Cost-effectiveness of Screening for Diabetic Retinopathy

Journal of Public Health (Oxford, England). Nov, 2015  |  Pubmed ID: 26568327

To determine the impact of a co-payment on the cost-effectiveness of systematic screening for diabetic retinopathy in Hong Kong (HK).

Systematic Screening for Diabetic Retinopathy (DR) in Hong Kong: Prevalence of DR and Visual Impairment Among Diabetic Population

The British Journal of Ophthalmology. Feb, 2016  |  Pubmed ID: 26271268

To determine the prevalence of diabetic retinopathy (DR), sight threatening DR (STDR), visual impairment and other eye diseases in a systematic DR screening programme among primary care Chinese patients with diabetes mellitus (DM) in Hong Kong.

The Impact of Prestretch Induced Surface Anisotropy on Axon Regeneration

Tissue Engineering. Part C, Methods. Jan, 2016  |  Pubmed ID: 26563431

Nerve regeneration after spinal cord injury requires proper axon alignment to bridge the lesion site and myelination to achieve functional recovery. Significant effort has been invested in developing engineering approaches to induce axon alignment with less focus on myelination. Topological features, such as aligned fibers and channels, have been shown to induce axon alignment, but do not enhance axon thickness. We previously demonstrated that surface anisotropy generated through mechanical prestretch induced mesenchymal stem cells to align in the direction of prestretch. In this study, we demonstrate that static prestretch-induced anisotropy promotes dorsal root ganglion (DRG) neurons to extend thicker axon aggregates along the stretched direction and form aligned fascicular-like axon tracts. Moreover, Schwann cells, when cocultured with DRG neurons on the prestretched surface colocalized with the aligned axons and expressed P0 protein, are indicative of myelination of the aligned axons, thereby demonstrating that prestretch-induced surface anisotropy is beneficial in enhancing axon alignment, growth, and myelination.

Genetic Alterations in Fatty Acid Transport and Metabolism Genes Are Associated with Metastatic Progression and Poor Prognosis of Human Cancers

Scientific Reports. 2016  |  Pubmed ID: 26725848

Reprogramming of cellular metabolism is a hallmark feature of cancer cells. While a distinct set of processes drive metastasis when compared to tumorigenesis, it is yet unclear if genetic alterations in metabolic pathways are associated with metastatic progression of human cancers. Here, we analyzed the mutation, copy number variation and gene expression patterns of a literature-derived model of metabolic genes associated with glycolysis (Warburg effect), fatty acid metabolism (lipogenesis, oxidation, lipolysis, esterification) and fatty acid uptake in >9000 primary or metastatic tumor samples from the multi-cancer TCGA datasets. Our association analysis revealed a uniform pattern of Warburg effect mutations influencing prognosis across all tumor types, while copy number alterations in the electron transport chain gene SCO2, fatty acid uptake (CAV1, CD36) and lipogenesis (PPARA, PPARD, MLXIPL) genes were enriched in metastatic tumors. Using gene expression profiles, we established a gene-signature (CAV1, CD36, MLXIPL, CPT1C, CYP2E1) that strongly associated with epithelial-mesenchymal program across multiple cancers. Moreover, stratification of samples based on the copy number or expression profiles of the genes identified in our analysis revealed a significant effect on patient survival rates, thus confirming prominent roles of fatty acid uptake and metabolism in metastatic progression and poor prognosis of human cancers.

Haplotype-Phased Synthetic Long Reads from Short-Read Sequencing

PloS One. 2016  |  Pubmed ID: 26789840

Next-generation DNA sequencing has revolutionized the study of biology. However, the short read lengths of the dominant instruments complicate assembly of complex genomes and haplotype phasing of mixtures of similar sequences. Here we demonstrate a method to reconstruct the sequences of individual nucleic acid molecules up to 11.6 kilobases in length from short (150-bp) reads. We show that our method can construct 99.97%-accurate synthetic reads from bacterial, plant, and animal genomic samples, full-length mRNA sequences from human cancer cell lines, and individual HIV env gene variants from a mixture. The preparation of multiple samples can be multiplexed into a single tube, further reducing effort and cost relative to competing approaches. Our approach generates sequencing libraries in three days from less than one microgram of DNA in a single-tube format without custom equipment or specialized expertise.

Does Classroom-based Crew Resource Management Training Have an Effect on Attitudes Between Doctors and Nurses?

International Journal of Medical Education. 2016  |  Pubmed ID: 27060788

To evaluate participant reactions and attitudes to crew resource management teamwork classroom-based training by comparing Likert responses before and after the intervention and exploring potential differences in attitudes across the different healthcare professionals.

Nanoscale Coordination Polymers Codeliver Chemotherapeutics and SiRNAs to Eradicate Tumors of Cisplatin-Resistant Ovarian Cancer

Journal of the American Chemical Society. May, 2016  |  Pubmed ID: 27088560

Drug resistance impedes the successful treatment of many types of cancers, especially ovarian cancer (OCa). To counter this problem, we developed novel long-circulating, self-assembled core-shell nanoscale coordination polymer (NCP) nanoparticles that efficiently deliver multiple therapeutics with different mechanisms of action to enhance synergistic therapeutic effects. These NCP particles contain high payloads of chemotherapeutics cisplatin or cisplatin plus gemcitabine in the core and pooled siRNAs that target multidrug resistant (MDR) genes in the shell. The NCP particles possess efficient endosomal escape via a novel carbon dioxide release mechanism without compromising the neutral surface charge required for long blood circulation and effectively downregulate MDR gene expression in vivo to enhance chemotherapeutic efficacy by several orders of magnitude. Even at low doses, intraperitoneal injections of nanoparticles led to effective and long-lasting tumor regression/eradication in subcutaneous and intraperitoneal xenograft mouse models of cisplatin-resistant OCa. By silencing MDR genes in tumors, self-assembled core-shell nanoparticles promise a more effective chemotherapeutic treatment for many challenging cancers.

Schwann Cells Migration on Patterned Polydimethylsiloxane Microgrooved Surface

Tissue Engineering. Part C, Methods. Jul, 2016  |  Pubmed ID: 27216726

Schwann cells (SCs) aid in nerve repair in the peripheral nervous system, and their ability to migrate into the injury site is critical for nerve regeneration after injury. The majority of studies on SC behavior have focused on SC alignment through contact guidance, rather than migration. The few studies on SC migration primarily investigated the migration of individual cells over several hours with time-lapse microscopy. However, during neural tissue repair, SCs do not migrate as single cells but as a population of cells over physiologically relevant time and length scales. Thus from a practical perspective, there is a need to understand the migration of large populations of SC and the collective guidance cues from the surrounding environment in designing optimal transplantable scaffolds. This study investigates a large population of migrating SCs over a period of 2 weeks on patterned polydimethylsiloxane (PDMS) microgrooved channels of different sizes. Two methods were used to quantify the migration velocity of a large cell population that minimized the confounding effect due to cell proliferation: one based on a leading edge velocity and a second based on a binary velocity. Both approaches showed that the SC population migrated the fastest on the smallest sized microgrooved channels. The insights provided in this study could inform on future designs of transplantable scaffolds for peripheral nerve regeneration.

Core-shell Nanoscale Coordination Polymers Combine Chemotherapy and Photodynamic Therapy to Potentiate Checkpoint Blockade Cancer Immunotherapy

Nature Communications. 2016  |  Pubmed ID: 27530650

Advanced colorectal cancer is one of the deadliest cancers, with a 5-year survival rate of only 12% for patients with the metastatic disease. Checkpoint inhibitors, such as the antibodies inhibiting the PD-1/PD-L1 axis, are among the most promising immunotherapies for patients with advanced colon cancer, but their durable response rate remains low. We herein report the use of immunogenic nanoparticles to augment the antitumour efficacy of PD-L1 antibody-mediated cancer immunotherapy. Nanoscale coordination polymer (NCP) core-shell nanoparticles carry oxaliplatin in the core and the photosensitizer pyropheophorbide-lipid conjugate (pyrolipid) in the shell (NCP@pyrolipid) for effective chemotherapy and photodynamic therapy (PDT). Synergy between oxaliplatin and pyrolipid-induced PDT kills tumour cells and provokes an immune response, resulting in calreticulin exposure on the cell surface, antitumour vaccination and an abscopal effect. When combined with anti-PD-L1 therapy, NCP@pyrolipid mediates regression of both light-irradiated primary tumours and non-irradiated distant tumours by inducing a strong tumour-specific immune response.

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