生きた細胞中のタンパク質のアンサンブルにおける蛍光共鳴エネルギー移動効率の定量への全体の分布と平均ベースのアプローチの比較

Biophysical Journal. May, 2010  |  Pubmed ID: 20483320

個々の細胞または細胞集団からの蛍光を測定するための広視野顕微鏡とspectrofluorometersを用いた研究の数十年から生まれた蛍光共鳴エネルギー移動（FRET）を用いて、タンパク質 - タンパク質相互作用の研究からのデータの分析のための現在の方法。ほとんどの測定に固有のは、タンパク質複合体の化学量論と構造に関する情報を洗うタンパク質複合体の大規模な集団を超える効率をFRETの分布の平均です。原則として、レーザー走査顕微鏡の分布の定量化を促進することができるの導入は、生細胞の効率のFRETが、唯一の比較的最近、この可能性は完全にスペクトルまたは寿命ベースのアプローチの開発を通じて、具体化しなかった。分子イメージングのこの新しい機会を活用するためには、さらにデータ解析の理論モデルと方法を開発する必要があります。モンテカルロシミュレーションを用いて、分子の均質と不均質な空間分布でFRETの検討を行った。我々の結果は、効率のFRETの分布に基づいた分析は、FRETの生物学的に関連の適切な識別を可能に含まれる平均ベースのアプローチは、大きな利点を提示することを示しています。本研究では、FRETの分子クラウディングの影響への洞察を提供し、フィッティング、シミュレーションベースのデータを使用して効率化をFRETのディストリビューションからの情報抽出のための基礎を提供しています。