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Articles by Joel R. Meyerson in JoVE
JoVE Immunology and Infection
Cryo - 전자 Tomography 및 자동 하위 tomogram 평균을 사용하여 HIV의 봉투 Glycoproteins의 분자 구조 결정
1Laboratory of Cell Biology, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health, 2The Medical Research Council Mitochondrial Biology Unit, University of Cambridge, 3National Library of Medicine, National Institutes of Health, 4Massachusetts Institute of Technology, 5William Fremd High School, 6University of Virginia, 7Duke University, 8Yale University, 9University of Notre Dame, 10Washington University in St. Louis, 11Bioinformatics and Computational Biosciences Branch, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, 12Thomas Jefferson High School for Science and Technology
프로토콜은 cryo - 전자 tomography와 3 차원 영상 처리를 사용하여 막 단백질의 구조를 결정하기 위해 높은 처리량 접근 방식을 설명합니다. 이것은 시편 준비의 세부 사항, 데이터 수집, 데이터 처리 및 해석을 포함하고, 접근, HIV - 1 봉투 당단백질에 대한 대표적인 대상의 생산 마칩니다. 이러한 계산 절차는 원격 작업 및 데이터 처리 및 구조 분석에 기여하는 연구자와 학생을 수있는 방식으로 설계되었습니다.
Other articles by Joel R. Meyerson on PubMed
진 핵 유전자 발현에 DNA 복제와 DNA 복제 원점 활동의 글로벌 효과
이 보고서의 DNA 복제 유전자 발현에 미치는 영향을 전체 볼 수 있습니다. 우리는 Saccharomyces cerevisiae 세포 주기 진행을 지연 없이 DNA 복제 개시를 방지 하는 조건 하에서 동기화 된 문화를 분석 했다. 여러 시간 코스에서 측정 글로벌 mRNA 식 통합, 감지 및 제거 실험 및 유전자, 시간 점 및 조건 식 변화의 패턴의 중요 한 조합을 식별 높은 단 수 값 분해를 사용 합니다. 우리는, 첫째, 글로벌 mRNA 식의 약 88%는 DNA 복제에 관계 없이 찾으십시오. 둘째, 효율적인 히스톤 유전자 발현을 위한 DNA 복제 요구 DNA 손상 검사점 응답을 유도 하는 조건의 독립적입니다. 셋째, 그들의 3' 끝, 다운스트림 기원 업스트림 유전자 표현 조절 수 공개 근처 기원과 유전자의 표현 감소 원본 라이선스. 이 DNA 복제 원점 활동과 mRNA 식 간의 글로벌 인과 조정의 수학적 모델링에서 이전 예측을 확인 하 고 수학적 모델링의 DNA microarray 데이터 사용할 수 있는 올바르게 이전에 알려지지 않은 생물 학적 모드 레 귤 레이 션의 예측을 보여줍니다.
그대로 바이러스에 Trimeric SIV와 에이즈-1 봉투 Glycoproteins의 분자 구조: 제 사기 구조의 스트레인 종속 변형
대상 셀 인간과 밀접 하 게 관련 된 유인원 면역 결핍 바이러스에 의해 감염의 초기 단계 (에이즈와 SIV, 각각) trimeric 봉투 glycoproteins (Env)의 바인딩 바이러스 성 막 횡단 당단백질 (gp41) 및 표면 당단백질 (gp120) 대상 T-셀의 heterodimers의 구성에서 발생 합니다. 지식의 분자 구조의 trimeric 환경 그대로 바이러스 기본 바이러스 세포 상호 작용 하는 분자 메커니즘을 이해 하는 것에 대 한 및 HIV/에이즈를 방지 하기 위해 효과적인 immunogen 기반 백신의 설계에 대 한 중요 하다. Unliganded trimeric 환경의 구조 그대로 HIV 1 발 virions의 이전 분석 결과가 이미와 CD4 liganded 상태 ~ 20 Å 해상도에서. 여기, SIVmac239 및 V 1 R3A 종자 V1 및 v 2를 가변 루프 바이러스와 세포 사이의 접촉 영역에 가까운 스파이크의 꼭대기에 있는 에이즈-1 발에 대 한 결정 이전에 밀접 하 게 유사한 하 우리는 SIVmneE11S에서 trimeric 환경의 분자 구조를 보여줍니다. Trimeric 환경 V1/V2 루프의 위치는 결정적으로 HIV 1 R3A virions 이러한 루프의 삭제와 익스프레스 환경을 위하여 설계 구조 분석에 의해 확인 됩니다. 기 막히게, SIV CP-맥, CD4 독립적인 스트레인 trimeric 환경을 이다 constitutively "열기" 나 란에 gp120 trimers 때 Scd4와 CD4i 항 체 17b complexed 에이즈 1 발 환경을 위해 본 비슷한 나 란에 펼쳐져 있는. 우리의 연구 결과 CD4 독립적인 바이러스 항목의 분자 메커니즘에 대 한 구조적 설명을 제안 하 고 그 곳을 알아내는-전자 단층 촬영 환경 그대로 바이러스에 표시의 고유한 기능적으로 관련 제 사기 구조를 발견 하는 설정 추가.
