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Articles by Kim Stanford in JoVE

 JoVE Immunology and Infection

Carcassa di compostaggio Biocontained per il controllo di focolai di malattie infettive del bestiame


JoVE 1946 5/06/2010

1Agriculture and Agri-Food Canada, Lethbridge Research Centre, 2Department of Bioscience and Biotechnology, Dalian University of Technology, 3Agriculture Centre, Alberta Agriculture and Rural Development

Utilizzando materiali facilmente reperibili, questo sistema consente di compostaggio biocontained efficace sul sito di smaltimento delle carcasse di animali di grandi dimensioni che sorgono nel caso di insorgenza di malattie infettive. Questa procedura uccide maggior parte degli agenti infettivi nelle carcasse e letame contaminato. Una volta che l'agente infettivo è confermata non vitale, compost maturo può essere diffuso come fertilizzante.

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Impatto Dell'alimentazione Di Elaborazione E Misto Ruminale Cultura Sul Destino Del Ricombinante EPSP Sintasi E DNA Vegetale Colza Endogeno

L'impatto della trasformazione alimentare e culture ruminale in vitro sulla persistenza della ricombinante e colza specifico DNA endogeno è stato studiato utilizzando vari substrati di colza (seme intero, semi di cracking, pasto e dieta). Per substrati, parentali sia geneticamente modificati, gene ribulosio-1,5-bisfosfato carbossilasi/ossigenasi è stato amplifiable fino a diversi punti di tempo. Persistenza del DNA ricombinante, codifica 5-enolpiruvilshikimato-3-fosfato sintasi (1.363 bp) è stato rilevato fino a 8 h per pasto e 4 h per dieta mista. All'elaborazione di canola, DNA abbastanza grande per contenere geni pianta intatta rimane. In un ambiente in vitro, pianta del DNA è stato rapidamente degradata dopo il suo rilascio nel fluido del rumine.

Manzi Di Sopravvivenza Di Escherichia Coli O157: H7 Nelle Feci Da Mais E Orzo-alimentati

La sopravvivenza di Escherichia coli O157: H7 nelle feci da manzi alimentati mais (CO) o di orzo (BA) è stata valutata a -10, + 4 e + 22 gradi C. Fecal carezze sono state inoculate con una miscela di quattro-ceppo di resistente all'acido nalidixico e. coli O157: H7 a due livelli: 10 CFU g(-1) (basso, L) e 105 CFU g(-1) (alta, H). A-10 gradi C, durata della sopravvivenza di e. coli O157: H7 è stato ridotto (p < 0.05) in CO-L (35 giorni) rispetto al BA-L (49 giorni), probabilmente dovuto agli effetti di fecali acidi grassi volatili in combinazione con un pH fecale < 6.5. A 4 gradi C, e. coli O157: H7 è stato rilevato in BA-H, H-CO, CO-L e BA-L 77, 77, 56 e 63 giorni, rispettivamente, con nessuna differenza (p &gt; 0.05) osservata nella durata della sopravvivenza o tasso di declino di e. coli O157: H7 tra trattamenti. Sopravvivenza di e. coli O157: H7 è stato due volte come probabile (p < 0,05) a 22 gradi C rispetto a 4 gradi C e -10 gradi C. Mentre pH e tenore di materia secca è aumentato, e concentrazioni di acidi grassi volatili sono diminuiti nel corso 84 giorni in tutte e tre temperature, questi cambiamenti erano più pronunciate a 22 gradi C. sopravvivenza di E. coli O157: H7 per lunghi periodi di tempo nelle feci da entrambi gli animali nutriti a mais e orzo è stata dimostrata, così il materiale fecale può servire come un vettore per la trasmissione dell'organismo. La sopravvivenza maggiore di e. coli O157: H7 a 22 gradi C suggerisce che la temperatura può svolgere un ruolo nella stagionalità della trasmissione e prevalenza di questo batterio nei bovini feedlot. Segnalato una maggiore prevalenza di e. coli O157: H7 in bovini nutriti orzo rispetto a quelli alimentati mais non sembra essere correlata al rischio elevato di trasmissione derivanti da differenziale sopravvivenza del batterio nelle feci.

Rilevamento Della Pianta Transgenica Ed Endogena Del DNA in Digesta E Tessuti Di Ovini E Suini Alimentano Pasto Colza Roundup Ready

La persistenza di vegetali del DNA ricombinante in pecore e maiali nutrito colza geneticamente modificata (Roundup Ready) è stato valutato dalla PCR e l'ibridazione del sud analisi del DNA estratto dai digesta, tessuti di tratto gastrointestinali (GI) e gli organi viscerali. Ovini (n = 11) e suini (n = 36) sono stati alimentati al macello su diete contenenti 6.5 o 15% di colza Roundup Ready. Pianta nativa del DNA (frammenti di gene numero copia ad alta e bassa) e il transgene cp4 epsps che codifica 5-enolpyruvyl shikimato-3-fosfato sintasi sono stati monitorati in digesta intestinale ruminale, abomasal e grande e in tessuto da esofago, rumine, abomaso, piccolo e grosso intestino, fegato, rene di pecore e in tessuto dal duodeno, intestino cieco, fegato, milza e Cecala contenuto e reni di maiali. Alta-copia specifici del cloroplasto DNA (un frammento di 520-bp) è stato rilevato in tutti i campioni di digesta, la maggioranza (89-100%) dei tessuti intestinali e almeno uno di ogni campione di organi viscerali (frequenze di 3-27%) da ovini e suini. Frammenti di basso-copia rubisco (sequenze di 186 - e 540-bp dalla subunità piccola) erano presenti a frequenze leggermente inferiore, variabile in digesta (18-82%) e i tessuti intestinali (9-27% di ovini e 17-25% dei campioni dei suini) e raramente negli organi viscerali (1 di 88 campioni ovini; 3 di 216 campioni dei suini). Ognuno dei cinque cp4 epsps transgene frammenti (179-527 bp) intervistati era presente in almeno il 27% di ovini grandi campioni di contenuto intestinale (massimo = 64%) e almeno il 33% dei campioni contenuti Cecala porcino (massimo = 75%). Negli ovini, frammenti del transgene erano più comuni nei digesta intestinale che nel contenuto ruminale o abomasal. Transgene frammenti sono stati rilevati in 0 (esofago) a 3 dei tessuti del tratto di GI (grosso intestino) da 11 pecore e in 0-10 dei tessuti duodenali e Cecala raccolti da 36 maiali. Il DNA ricombinante di mangime ingerito non è stato rilevato nei tessuti viscerali (fegato, rene) di agnelli o nella milza da maiali. Di nota, tuttavia, un fegato e un rene campione dei suini (diversi animali) erano positive per un frammento di 278-bp del transgenico cp4 epsps (indicata con F3). Esame di librerie genomiche da questi tessuti ha prodotto nessuna informazione conclusiva per quanto riguarda l'integrazione del frammento del DNA dei suini. Questo studio conferma che sopravvivono frammenti di DNA ingerito mangimi (endogeni e transgenici) per il terminale del tratto GI e tale assorbimento nei tessuti epiteliali intestino si verificano. Una molto bassa frequenza di trasmittanza al tessuto viscerale è stata confermata in maiali, ma non negli ovini. È riconosciuto che il numero basso copia dei transgeni in mangimi GM è una sfida per la loro individuazione nei tessuti, ma non non c'era nessuna prova per suggerire che DNA ricombinante avrebbe elaborato nell'intestino in modo diverso dal materiale genetico endogeno ingerito mangimi.

Effetto Dell'acetato Di Melengestrolo Dietetiche Sull'incidenza Della Polmonite Interstiziale Acuta in Giovenche Feedlot

Per un periodo di 3-y, 906.000 bestiame sono stati monitorati in 23 allevamenti nel sud dell'Alberta per sintomi di polmonite interstiziale acuta (AIP). Plasma, urina e tessuto polmonare sono stati raccolti al momento della macellazione da 299 animali clinicamente diagnosticati con AIP e da 156 penmates sano e analizzato per derivati 3-metilindolo (3 MI) e ridotta concentrazione di glutatione. Da ciascun animale, il polmone sinistro era sottocampionato per esame istologico. Sono state ridotte concentrazioni di glutatione nel tessuto polmonare (P < 0.001) negli animali che presentano sintomi clinici di AIP rispetto alle loro penmates asintomatica. Animali confermati istologicamente come avendo AIP aveva più alti livelli di proteina 3 MI addotti nel tessuto del sangue e del polmone (P < 0,05) che ha fatto gli animali macellati d'emergenza senza AIP. All'interno di allevamenti, dove penne di giovenche sono stati alimentati un dosaggio standard di melengestrolo acetato (MGA) o none, il tasso di morte attribuibili all'AIP è stata simile tra i gruppi di trattamento, ma la macellazione d'emergenza dopo la diagnosi clinica dell'AIP è stato fatto 3,2 volte più spesso (P < 0.001) nei MGA-fed giovenche che nel gruppo non alimentato MGA. Uso di MGA ha fatto non influenzano la concentrazione di glutatione. Come performance di crescita di giovenche dato impianti steroidei non può essere migliorata da alimentazione MGA, può essere il metodo più economico di ridurre l'incidenza della macellazione di emergenza AIP-correlati in giovenche feedlot per eliminare MGA dalla dieta.

Microcapsule Di Chitosano-alginato Per Somministrazione Orale Di Immunoglobulina Di Tuorlo D'uovo (IgY)

Microcapsule di chitosano-alginato sono stati valutati come un metodo di somministrazione orale di anticorpi IgY. Le caratteristiche fisiche, incapsulamento efficienza (EE %), la capacità di carico per IgY (percentuale di caricamento IgY, % w/w di microcapsule), gastro-resistenza e le caratteristiche di rilascio di queste microcapsule in vitro sotto pH variabili sono state studiate. Fattori fisici ottimali sono stati stabiliti per la preparazione di microcapsule omogenei, sferiche e lisce. IgY carico % non è stato alterato significativamente dal pH del mezzo di incapsulamento. Incapsulamento efficienza era più alto (73.93%) a pH 3.5, sopra cui % EE è diminuito significativamente (p < 0,05). IgY fu pubblicato da microcapsule su esposizione al liquido intestinale simulato (SIF, pH 6,8) e diminuendo il pH aumentato in modo significativo rilascio IgY (p < 0,05). La stabilità dell'IgY nel liquido gastrico simulato (SGF, pH 1.2) è stato notevolmente migliorata dall'incapsulamento in microcapsule chitosano-alginato e l'attività residua non è stata influenzata dal pH del mezzo di incapsulamento. Inoltre, IgY microincapsulati era notevolmente resistente all'idrolisi di pepsina. Questo approccio può consentire IgY intatto raggiungere microrganismi bersaglio all'interno del tratto digestivo inferiore.

Polmonite Interstiziale Acuta Nei Bovini Feedlot: Effetti Della Somministrazione Di Pasto Di Piuma O Vitamina E

Abbiamo valutato gli effetti della somministrazione di pasti ricchi di cisteina piuma 1,5% o 550 UI di vitamina E per 40 d prima della macellazione sui tassi di morte e di macellazione d'emergenza a causa di polmonite interstiziale acuta (AIP) in allevamenti commerciali. Tessuto del polmone e del sangue sono stati raccolti al momento della macellazione da 83 animali clinicamente diagnosticati con AIP, penmates asintomatica 40 e 40 giovenche ricevono il pasto piuma (20) o vitamina E (20); il polmone sinistro era sottocampionato per esame istologico. Tessuto del sangue e del polmone sono stati analizzati per tiolo addotti del 3-methyleneindolenine (3ME) e ridotto il glutatione. Supplementazione con farina di piuma o vitamina E ha avuto alcun effetto sui tassi di morte e di macellazione d'emergenza attribuibile all'AIP e non ha influenzato i livelli di 3ME o ridotto di glutatione nel sangue o del polmone il tessuto. Sebbene la supplementazione con una maggiore quantità di farina di piuma o vitamina E potrebbe essere stato necessaria incidere in modo significativo i fattori correlati alla feedlot AIP, un'integrazione maggiore sarebbe antieconomica per allevamenti commerciali, date la relativamente bassa incidenza dell'AIP.

Emissioni Di Gas Serra Durante Il Co-composting Di Mortalità Di Vitello Con Letame

Concimare con la composta può essere una valida opzione all'interno dell'azienda per lo smaltimento delle carcasse di bovini. Questo studio ha studiato le emissioni di gas serra durante co-composting di mortalità di vitello con letame. Andane erano costruiti che conteneva il concime o letame, paglia + paglia (controllo compost [CK]) + mortalità del vitello (CM) utilizza due tecnologie: un trattrice front-end loader o un secchio di shredder. Compostaggio durò d 289. Andane erano acceso due volte (72 giorni e 190), utilizzando la stessa tecnologia usata nella loro creazione. Trasformare la tecnologia ha avuto alcun effetto sulle emissioni di gas a effetto serra o le proprietà del compost finale. La CO2 (75,2 g d(-1) m(-2)), CH4 (2.503 g d(-1) m(-2)) e N2O (0,370 g d(-1) m(-2)) le emissioni erano più elevati (p < 0.05) in CM rispetto a CK (25,7, 0,094 e m(-2) d(-1) 0.076 g di CO2, CH4 e N2O, rispettivamente), che riflette le differenze nei materiali utilizzati per costruire le andane di compost e quindi loro C totale e totale contenuto N. Il compost finale CM era superiore (p < 0.05) totale N, C totale e il contenuto minerale N (NO3 * + NO2 + NH4 +) che ha fatto compost CK e quindi ha maggiore valore agronomico come fertilizzante.

Un Biosicurezza Compostaggio Sistema Per Lo Smaltimento Delle Carcasse Di Bovini E Letame Dopo Lo Scoppio Di Malattia Infettiva

Durante le epidemie di malattie infettive degli animali, concimare con la composta può essere un efficace metodo di smaltimento della mortalità e potenzialmente contaminati letame. Duplicare biosicurezza strutture contenenti 16 bovini mortalità (Bos taurus) (343 kg peso medio) sono state costruite con carcasse collocato su uno strato di paglia di 40 cm e sovrapposti con 160 cm di letame feedlot. Ad una profondità di 80 cm (P80), compost riscaldata rapidamente, superiore a 55 gradi C, dopo 8 d e mantenute temperature di 55-65 gradi C per &gt; 35 m. temperature a 160 cm (P160) non è riuscito a superare i 55 gradi C, ma è rimasto sopra i 40 gradi C per &gt; 4 mo. Per indagare sulle tariffe di inattivazione microbica, Escherichia coli O157: H7, Campylobacter jejuni e virus della malattia di Newcastle (NDV) sono state inoculate nel letame (e. coli O157: H7 e C. jejuni circa 10, paragrafo 8 CFU g(-1); NDV, circa 10 EID(50) g(-1)), incorporato in P80 e P160 ed Estratto a intervalli durante il compostaggio. Escherichia coli O157: H7 e NDV erano rilevabili dopo 7 d a due profondità. Il DNA di c. jejuni è stato rilevato fino a 84 d a P80 e &gt; d 147 presso P160. Per stimare la degradazione di substrati recalcitranti, cervello bovino, zoccolo e nervatura ossa era anche incorporato in P80 e P160 ed Estratto a intervalli. Residui di tessuti molli è rimasto in carcasse dopo l'apertura alla decomposizione dei tessuti d 147 e bovina ha classificato come cervello &gt; zoccolo &gt; osso. Più di 90% di sostanza secca (DM) del cervello è sparito dopo 7 d e 80% DM zoccolo decomposto dopo 56 degradazione alta d. delle carcasse di bovini, rapida soppressione di e. coli O157: H7 e NDV e riduzione della densità delle cellule vitali di &gt; 6 registri per c. jejuni dimostra che il sistema di compostaggio di biosicurezza può smaltire le carcasse di bovini e letame in un focolaio di malattia infettiva.

Purificazione Della Reazione a Catena Della Polimerasi (PCR)-DNA Amplifiable Da Compost Pali Bovina Contenente La Mortalità

Sistemi di produzione di bestiame utilizzano compostaggio come un metodo di smaltimento della mortalità del bestiame, ma ci sono informazioni limitate sul tasso e l'entità della decomposizione delle carcasse. Individuazione di specifici frammenti di DNA mediante PCR offre un metodo per indagare la degradazione di carcasse e altri materiali biologici durante il compostaggio. Tuttavia, la purezza del DNA estratto è critica per l'analisi PCR successo. Abbiamo applicato un metodo per purificare il DNA dai campioni di compost e hanno testato il metodo analizzando target DNA bovino e pianta dopo 0, 4 e 12 mesi di compostaggio. La concentrazione di materia organica da materiali compostati pone una sfida particolare nell'ottenimento di DNA puro per analisi molecolari. Inizialmente estratti DNA da compostaggio pali al giorno 147 era scolorito, e inibitori della PCR ha impedito di amplificazione dei frammenti di gene bersaglio pianta o bovina. Albumina di siero bovino migliorato rilevamento mediante PCR (volume finale di 25-50 microl) attraverso la rimozione degli inibitori, ma solo quando le concentrazioni di acidi umici estratti del DNA erano 1,0 ng microl(-1) o meno. Ottimale purificazione del DNA da compost è stata ottenuta mediante cromatografia utilizzando Sepharose 4B colonne. Il protocollo di purificazione DNA descritto attivato monitoraggio molecolare dei geni bersaglio altrimenti criptici bovina e piante in tutto il processo di compostaggio. Il dosaggio potrebbe probabilmente essere utilizzato per ottenere DNA PCR-amplifiable che potrebbe essere utilizzato per il rilevamento di patogeni microbici in compost.

Escherichia Coli O157: H7 Lignaggi in Carne Sana E Bovini Da Latte E Casi Clinici Umani in Alberta, Canada

Lo scopo di questo studio era di esaminare la prevalenza e la distribuzione di analisi di polimorfismo di Escherichia coli O157: H7 specifico lignaggio (LSPA) 6 genotipi da bovini (n = 313) e clinici umani (n = 203) isolati da nord e sud Alberta, Canada, per capire le associazioni possibili genotipi con host e posizione geografica. La maggior parte degli isolati del bestiame (feedlot e prodotti lattiero-caseari) tipizzata come LSPA-6 111111 (72,2%), con proporzionalmente superiore 222222 LSPA-6 (19,4%) rispetto a altri genotipi LSPA-6 (10,7%). Isolati clinici umani anche digitato principalmente come LSPA-6 111111 (90,1%), ma è stata osservata una maggiore percentuale di genotipi (6,8%) diverso da 222222 LSPA-6 (3,1%). Una frequenza significativamente più elevata di LSPA-6 111111 in bestiame Alberta meridionale (P < 0,0001) e una differenza significativa in LSPA-6 genotipi tra umani contro il bestiame feedlot da Alberta settentrionale (P 0.0001 <) sono stati rilevati. LSPA-6 211111 genotipo era terza e seconda più comune nei bovini e umani, rispettivamente e nuovi LSPA-6 diversi genotipi (n = 19) sono stati anche scoperti. Nonostante evitando sovrarappresentazione degli isolati da specifici allevamenti o focolai, è stata osservata maggiore diversità di ceppo tra bovini tramite elettroforesi del gel di pulsare-campo (attrezzature; 50 genotipi) contrariamente a umani isolati (9 genotipi di attrezzature). La maggior parte del bestiame (74,4%) e umani (90,6%) isolati sono stati sensibile agli antimicrobici testati. All'interno degli isolati resistenti al bestiame, sulfisoxazolo-tetraciclina resistenza era comune (62,5%) ed è stato rappresentato dalla presenza di fattori determinanti sul1 sul2 e tet(A) e tet(B). Un'associazione tra genotipi LSPA-6 e attrezzature ma non tra la posizione geografica e genotipo attrezzature per entrambi gli host era evidente.

Somministrazione Orale E Rettale Di Batteriofagi Per Controllo Di Escherichia Coli O157: H7 in Bestiame Feedlot

Questo studio ha confrontato somministrazione orale e rettale dei batteriofagi specifici O157 per mitigare lo spargimento fecale di Escherichia coli O157 da manzi sperimentalmente inoculati. Fecale spargimento di resistente all'acido nalidixico (Nal(R)) E. coli O157: H7 è stato monitorato in 83 giorni dopo orale (ORL; 3,3 x 10(11) PFU), rettale (REC; 1,5 x 10(11) PFU), orale e rettale (O + R; 4,8 x 10(11) PFU), o no (CON; controllo) il trattamento con un batteriofago O157 specifico ceppo di quattro cocktail in dosi multiple. Batteriofagi sono stati enumerati da dosaggio di placca e NalR E. coli O157: H7 da placcatura in diretta su sorbitol MacConkey agar supplementato con cefixime Tellurito di potassio e acido nalidixico. Manzi oralmente trattati prodotta il minor Nal(R) E. coli O157: H7 campioni coltura-positivi (P < 0,06) rispetto ai manzi REC e O + R, ma questo numero è stato solo nominali inferiore (P = 0,26) rispetto a quello CON manzi. La media complessiva spargimento di livello (log CFU per grammo di feci) era più alta per i manzi REC (P < 0.10) rispetto per i manzi dell'altro trattamento gruppi. Nonostante lo spargimento di batteriofago media livelli più elevati (registro PFU per grammo di feci) da ORL e O + R più di manzi CON e REC, non non c'era alcuna differenza (P &gt; 0.05) del numero di campioni di e. coli O157-positivo tra trattamenti. Batteriofago è stato isolato da CON Manzi, indicando che questi Manzi ha acquisito il batteriofago dall'ambiente e versò il fago a un livello simile a quello di REC Manzi (P = 0.39). La terapia del batteriofago continua può essere un metodo efficacia per mitigare spargimento di e. coli O157: H7 in bestiame, fornendo che il batterio ospite non sviluppa resistenza. Questa terapia può essere particolarmente vantaggiosa se il bestiame possono acquisire questo agente di biocontrollo dall'ambiente feedlot.

Uso Della PCR Quantitativa E Convenzionale Per Valutare La Biodegradazione Dei Bovini E Pianta Del DNA Durante Il Compostaggio Mortalità Di Bestiame

Comprensione mortalità compostaggio richiede di valutare l'efficacia di biodegradazione di carcasse e altri materiali di origine animale e vegetale. Biosicurezza compost (avvolto in plastica) erano strutture contenenti 16 carcasse di bovini posto sulla paglia di 40 cm e coperto con 160 cm di letame feedlot. Compost è stato raccolto dalla profondità di 80 e 160 cm (P80, P160) e degradazione del DNA valutato oltre 147 giorni di compostaggio statico e nel corso di 180 giorni di compostaggio attivo. Residuali dei tessuti molli da carcasse sono state raccolte il giorno 147. A P80, copie di un DNA mitocondriale bovina (Mt171) di 171-bp e 138-bp pianta Rubisco frammento gene (Rub138) sono state ridotte rispetto al numero di copie iniziali (CN) del 79% e del 99% dopo 147 giorni, rispettivamente. Presso P160, Mt171 e Rub138 sono diminuiti rispetto al CN iniziale del 20% e 99% di giorno 147, rispettivamente. 327 Giorni, dopo la degradazione di Mt171 aumentato al 91% rispetto al CN iniziale. Rispetto ai tessuti freschi, tessuti residui al giorno 147 avevano una riduzione del 99% nel rendimento del DNA genomico. Resa di DNA era imparentato con copie di un frammento (Mt760) mitocondriale bovina 760-bp che erano &gt; 93% ridotto a P80 sia P160 dopo 147 giorni. Secondaria compostaggio migliorata decomposizione di tessuti bovini e Mt760 non era rilevabile dopo 208 giorni. Una riduzione del 99% in DNA genomic compostati tessuto e &gt; 93% riduzione della Mt760 suggerisce quasi completa decomposizione dei tessuti molli carcassa dopo 147 giorni.

Biodegradazione Dei Tessuti Di Sementi E Piante Geneticamente Modificati Durante Il Compostaggio

Il crescente mercato globale di colture geneticamente modificate (GM) amplifica il potenziale per contaminazione accidentale di alimenti e mangimi con piante geneticamente modificate. Metodi proposti per lo smaltimento dei residui delle colture dovrebbero essere valutate per evitare involontarie distribuzione di materiale GM. Compostaggio di materiale organico è poco costoso e indipendenti dalla posizione. L'obiettivo di questo studio era di determinare l'efficacia di compostaggio per lo smaltimento delle piante geneticamente modificate in termini di ridurre la vitalità del seme e promuovendo la degradazione del DNA endogeno come pure transgenico.

Campo Scala Valutazione Del DNA Bovino-specifici Come Un Indicatore Della Degradazione Del Tessuto Durante Il Compostaggio Mortalità Di Bestiame

Attualmente, compost di mortalità è gestito dalla temperatura come misura della degradazione del tessuto è difficile da valutare. Nel presente studio, compost campo-scala di mortalità è stato costruito con tessuto cerebrale compostati (cervello) e compost adiacenti al tessuto cerebrale (CAB) campionate oltre 230 d. Dopo estrazione del DNA genomico, bovina-specifica DNA mitocondriale (Mt-DNA) e batterici 16S rDNA frammenti sono stati quantificati mediante PCR in tempo reale. Rendimento del DNA genomico del cervello e CAB è diminuito rapidamente (89-98%) e stabilizzato dopo 7 m. rispetto a d 0, cervello Mt-DNA è diminuito rapidamente (84-91% di sconto su d 7). In carrozza, Mt-DNA drammaticamente aumentato fino a d 28 (fino a 34.500 volte) diminuendo in seguito dai 77-93% su d 112. Quantificazione del Mt-DNA bovino indica il degrado del tessuto inizialmente era caratterizzato da rapida decomposizione e rilascio del contenuto della cella in circostante matrice compost seguita da ulteriore degrado del Mt-DNA di fiorente microrganismi. Di conseguenza, bovine Mt-DNA copie nella matrice composta erano affidabili indicatori di degradazione dei tessuti.

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