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Articles by Natalia Novoradovskaya in JoVE
JoVE General
DNAベースの魚種の識別プロトコル
この出版物は、DNAを抽出し、PCRとRFLP解析を行うことにより、魚の種を識別するために、アジレントの魚種の識別システムを使用する方法について説明します。
Other articles by Natalia Novoradovskaya on PubMed
マイクロ アレイの実験のための標準と RNA。
信頼性と再現性のある 2 色のマイクロ アレイ遺伝子発現データを取得するセルラ システムで作られた摂動の生物学的意義を理解するため非常に重要です。マイクロ アレイ デザイン、RNA の準備およびラベリング、交配の条件とデータの集録および解析変数を同時に制御することは困難です。監視および experimental 間変化を制御するための便利なツールは、普遍的な参照 RNA （各マイクロ アレイ プローブの場所 （スポット） で交配信号を提供することを目標として開発 URR）、です。各スポットで信号を参照 RNA ターゲット実験的 RNA の比率として測定、絶対信号強度に頼らず変動信号出力任意 2 色交配実験での正規化によって減少します。
RNA のサンプル滴定はマイクロ アレイ ・ プラットフォームのパフォーマンスと正規化手法を評価するために使用。
RNA 滴定サンプル マイクロ アレイ プラットフォームのパフォーマンスと得られた結果の異なる正規化メソッドの影響を評価するためのユーティリティを評価しています。マイクロ アレイ品質管理プロジェクトの一環として、2 つの独立した RNA のサンプルと 2 つの滴混合これらのサンプルを使用して 5 つの商業マイクロ アレイ プラットフォームの性能を調査しました。すべてのプラットフォームで共通の 12,091 遺伝子を中心に、サンプルを介して正しい滴定反応を検出する各プラットフォームの能力を決定しました。グローバル偏差滴定比によって予測した応答からが観察されました。これらの違いは 2 つの独立したサンプル間の総 RNA の一部分としてメッセンジャー RNA の相対的な量の変化によって説明できます。全体的にみて、定性的および定量的対応関係のプラットフォーム間では高かった。要約すると、サンプル滴定はマイクロ アレイのプラットフォームのパフォーマンスと異なる解析手法を評価するだけでなく、サンプルのいくつかの基になる生物学的機能を決定するための貴重なツールとしてみなされるかもしれない。
マイクロ アレイの品質管理 (MAQC) プロジェクトを示しています Inter-遺伝子発現測定と Intraplatform 再現性。
最後のディケイド マイクロ アレイ技術の導入遺伝子発現研究に深い影響を与えたがあります。異なるマイクロ アレイのプラットフォームを使用して同一の RNA のサンプルを分析する得られた異種または完全に矛盾した結果との研究の出版物は、この技術の信頼性についての懸念を調達しています。マイクロ アレイの品質管理 (MAQC) プロジェクトは、他のパフォーマンスとデータ解析の問題と同様にこれらの懸念に対処するため開始されました。4 つの滴定プール 2 つの異なる参照の RNA のサンプルから上の式のデータは、さまざまなマイクロ アレイ ・ ベースおよび代替技術プラットフォームを使用して複数のテスト サイトで生成されました。ここでは実験的なデザインとプローブ マッピング努力 MAQC プロジェクトの背後にある説明します。我々 intraplatform 一貫性テスト サイトだけでなく、高全体として特異的に表現識別遺伝子の面で interplatform の一致のレベル表示します。本研究は、臨床と規制の設定の使用のマイクロ アレイのためのフレームワークを確立に向けての重要な第一歩を表すリソースを提供します。
エンドトキシン受容 CD14 PiZ α 1 アンチトリプシン欠乏個人。
CD14、リポ多糖 (LPS) の受容体は膜結合フォーム (mCD14) と可溶性のフォーム (sCD14) の両方で発見です。その sCD14 プロテアーゼを介したセリン放出に主に血液単球から解放されることをお勧めします。ひと単球の in vitro における CD14 発現を調節するアルファ 1-アンチトリプシン (AAT) のセリーンのプロテアーゼの阻害剤が示されているので、年齢 30 歳通常ミリメートルと被験者の mCD14 の sCD14 と単球式と AAT の欠乏 PiZZ とピシュ遺伝子型の血漿中濃度を調査するために求めた。
