Summary
En anion udveksle harpiks-baserede metode, tilpasset til flydende impingement-baserede bioaerosol prøvetagning af virus er påvist. Når kombineret med downstream molekylær detektion, giver metoden mulighed for facile og følsomme påvisning af virus fra bioaerosols.
Abstract
Denne protokol viser en tilpasset bioaerosol stikprøvemetoden for virus. I dette system, er anion ionbytteren kombineret med flydende impingement-baseret luft prøvetagning enheder for effektiv koncentration af negativt ladede vira fra bioaerosols. Således, harpiks, der fungerer som en yderligere koncentration trin i arbejdsprocessen bioaerosol sampling. Nukleinsyre ekstraktion af virale partikler foretages så direkte fra anion ionbytteren, med den deraf følgende prøve egnet til molekylære analyser. Yderligere, denne protokol beskriver et specialbygget bioaerosol kammer i stand til at generere virus-laden bioaerosols under en række miljøforhold og giver mulighed for løbende overvågning af miljømæssige variabler såsom temperatur, fugtighed, Vindhastighed og aerosol massekoncentration. Den vigtigste fordel ved at bruge denne protokol er øget viral påvisningsfølsomhed, der vurderes via direkte sammenligning med en umodificeret konventionel flydende impinger. Andre fordele omfatter potentiale til at koncentrere sig mangfoldigt negativt ladede virus, de lave omkostninger af anion ionbytteren (~$0.14 per prøve) og brugervenlighed. Ulemper omfatter denne protokol manglende evne til at vurdere smitteevne af harpiks-adsorberet viruspartikler, og potentielt behov for optimering af flydende prøveudtagning buffer anvendes inden for impinger.
Introduction
Formålet med denne metode er at skabe en yderst følsom bioaerosol prøvetagning platform for at lette molekylær detektion af negativt ladede vira fra bioaerosols. Mikroorganismer, herunder viruspartikler, kan overleve i bioaerosols i længere perioder af tid1. Bioaerosols kan rejse over relativt lange distancer og vedligeholde levedygtighed og smitteevne, som det fremgår af et udbrud af legionærsyge ' sygdom, der stammer fra industrielle køletårne beliggende i en afstand af 6 km fra de berørte personer og resulterede i 18 dræbte2. Indirekte overførsel af virus til mennesker medieres af bioaerosols kan forekomme i flere indstillinger og er påvist for norovirus udbrud i skoler og restauranter3,4. Tilsvarende, bioaerosol overførsel af virus kan forekomme i landbruget indstillinger såsom i svin og fjerkræ gårde, med denne transmission rute anses som en væsentlig faktor i bevægelse af virus mellem produktion faciliteter5, 6 , 7 , 8 , 9.
Effektiv prøveudtagning af virus-laden bioaerosols giver mulighed for forbedring i hurtig diagnostik og beredskabet med henblik på forebyggelse af udbrud, som vist i demonstrationer i hvilke H5 influenza en virus blev opdaget fra bioaerosols i levende dyr markeder i Kina og den USA10,11. Nuværende bioaerosol prøvetagning teknologier indebærer en række forskellige partikel capture principper og kan groft inddeles i impingers, cykloner, slaglegemer og filtre12. Det er ud over anvendelsesområdet for denne protokol til udtømmende dækning af alle fordele og ulemper ved disse platforme for udtagning af prøver af virus fra bioaerosols; dog kan det konstateres, at fleste af disse stikprøver enheder ikke er blevet optimeret til indsamling af vira og Bakteriofager13. Derudover er smitteevne af virale partikler ofte negativt berørt, med flydende impingers anses for at opretholde viral infektivitet mere effektivt end prøveudtagning enheder såsom solid slaglegemer eller filtre14. En ulempe ved flydende impingement er dog target fortynding virkning, som opstår, fordi virus er indsamlet i relativt store mængder (typisk ≥20 mL) af væske i indsamlingen fartøjets. En anden vigtig ulempe indebærer suboptimal effektiviteten af flydende impingers at koncentrere partikler < 0,5 µM i størrelse15. Dog kan opsamling effektivitet af disse enheder forbedres ved immobilisering på solid matricer, som immobilisering kan forbedre bevarelsen af viral nukleinsyrer og viral infektivitet16,17.
Vi har tidligere vist, at anion ionbytteren er et effektivt værktøj til opsamling og koncentration af virus fra flydende matricer, herunder F-RNA Bakteriofager, hepatitis A virus, human adenovirus, og rotavirus18,19 ,20. Som defineret af fabrikanten, er anion ionbytteren udnyttet i dette arbejde en macroreticular polystyren stærk base anion ionbytteren, hvor functionalized kvaternære amine grupper mægle tiltrækning og fange af anioner i en flydende medium21 . Derfor forventes anion ionbytteren til at fange virus med net-negative overfladeladninger, herunder mange enteriske virus, influenza-vira og andre vira, der er relevante for menneskers og dyrs sundhed.
Den nuværende protokol omfatter tilføjelse af anion ionbytteren til et flydende impinger. I dette system fungerer harpiks som en sekundær koncentration skridt for virale partikler fanget i impinger væske. Nukleinsyrer kan derefter direkte elueret i små mængder, giver en koncentreret prøve til molekylære analyser. Således, den største fordel ved denne metode er forbedringen af viral påvisning følsomhed, primært gennem reduktion i stikprøven volumen. Desuden, på grund af den iboende uspecifikke erobringen af negativt ladede vira, metoden er sandsynligt anvendes til påvisning af et stort antal virus af interesse. Her, er metoden, der påvist for vaccinestammer af type A og type B-influenzavira og FRNA coliphage MS2 (MS2). Disse vira detekteres efterfølgende ved hjælp af standard qRT-PCR assays som tidligere beskrevet22. End-point brugeren skal ikke forvente at støde på vanskeligheder ved udførelsen af denne metode, fordi ændringer i øjeblikket eksisterende udstyr ikke udgør større afbrydelser i den konventionel flow af bioaerosol prøvetagning og analyse.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
1. installation af Bioaerosol-kammer (Se figur 2)
-
Pre-loade de flydende impingers med 20 mL 0,01 M fosfatbufferet saltvand, pH 7,5 (PBS).
- Der tilsættes 0,5 g anion makroporøst ionbyttermateriale og suspendere inden for PBS af en af de flydende impingers, med en anden flydende impinger tjener som kontrol.
- Stilling flydende impingers parallelt inde i bioaerosol kammer med klemme stande med aerosol fjorde vender forstøver.
Bemærk: Se figur 2 for yderligere detaljer. - Samarbejde finde en direkte-Læs aerosol monitor nær de flydende impingers til at måle massekoncentrationen (mg/m3) af bioaerosol.
- Co finde yderligere direkte-Læs instrumentation (indeluftens kvalitet skærm, og termiske Vindmåler) nær de flydende impingers at overvåge miljøet variabler såsom temperatur, relativ luftfugtighed og vind hastighed, inden for bioaerosol afdeling.
- Køre aksial fans i hjørnerne af bioaerosol kammer at lette blanding af aerosol.
Bemærk: Aksial ventilatorer køre på en fast hastighed og er ikke justerbar.
2. model Bioaerosolization eksperimenter (Se figur 3)
- Udføre seriel, 10-fold fortyndinger af MS2 bacteriophage og influenza vaccine til ønskede koncentrationer i fosfatbufferet saltopløsning (PBS).
Bemærk: for at demonstrere metoden her, 103,5 FFU/mL af type A og B influenza vaccine virusstammer og 105 PFU/mL MS2 bacteriophage er udnyttet. Bestem titers for inocula er Bakteriofager opformeret i Escherichia coli HS (pFamp) R og optalt som tidligere beskrevet20. Den kommercielle vaccine indeholder kendte mængder af fire levende svækkede influenza-virusstammer, to skrive en influenza og to B-typen influenzavirus, udtrykt i fluorescerende fokus enheder eller FFU. - Forberede inocula inden for glas fartøj af en 6-jet kollision nebulizer ved at oprette suspensioner af ønskede koncentrationer af virale partikler i 100 mL PBS og installere inden for brugerdefinerede bioaerosol kammer.
- Indlede instrumentering for at måle variabler inden for bioaerosol kammer, såsom temperatur, % relativ luftfugtighed, CO2-koncentration, og vind hastighed (genereres ved hjælp af en axial fan). Bruge en direkte-Læs aerosol monitor til at spore massekoncentration inden for bioaerosol kammer og etablere konsistens inden for og mellem forsøg.
- Forsegle bioaerosol kammer og rense for 10 min med HEPA-filtreret luft.
- Levere filtreret, tørrede luft til forstøver opererer på 6,9 kPa.
- Generere en target koncentration af viral bioaerosols (via forstøver) i kamrene bioaerosol retssag. For denne demonstration, er bioaerosols med en koncentration på 5 mg/m3 genereret.
- Når målet massekoncentration af aerosol er nået, stop nebulization.
- Operere en luftpumpe prøvetagning for hver flydende impinger, der er kalibreret til en gennemstrømningshastighed på 12,5 L/min. adfærd kalibrering ved hjælp af en primær flow standard før og efter hver prøveudtagning begivenhed for at sikre konsistens i prøvetagning volumen. Levering fortynding air bruger en HEPA-filtreret linje i nærheden af forstøver og opretholde konstant presset i lokalet.
- Aktivt prøve bioaerosol kammer atmosfære for en periode på 40 min. til at opnå en prøveudtagning volumen på 500 L pr. prøve.
Bemærk: Prøveudtagning i 40 min. 12,5 L/min. med to pumper parallelt giver mulighed for udtagning af prøver af 1.000 L af bioaerosol. Således, ved afslutningen af forsøget forventes det, at størstedelen af den luft, der er til stede i salen, bioaerosol har stikprøven og udledes i miljøet via en HEPA-filtreret system. Dette fremgår af faldet i partikel koncentration. Efter forsøget, overflader er dekontamineres med 10% husstand blegemiddel og 70% ethanol. Indikatorer er anvendt i denne demonstration; men hvis kendt patogene organismer anvendes i dette system, yderligere biosikkerhed foranstaltninger kan gennemføres efter behov.
3. nukleinsyre udvinding og qRT-PCR påvisning
-
Isolere nukleinsyrer direkte fra anion makroporøst ionbyttermateriale og til komparative formål, fra den væske, der anvendes inden for de flydende impingers. I dette eksempel er en RNA isolering procedure er beskrevet, men en lignende protokol kan bruges til DNA virus.
- Nukleinsyre isolation fra anion ionbytteren.
- Overføre alle anion exchange harpiks-holdige væske af den flydende impinger til en steril 50 mL konisk slange.
- Ionbytteren henstår til at slå sig ned, og langsomt dekanteres flydende prøven fra anion ionbytteren. Bruge en 1 mL pipette tip til at fjerne alle de resterende væske fra anion ionbytteren.
- Fra en viral RNA isolering kit, tilføje 560 µL af viral lysisbuffer indeholdende carrier RNA direkte til anion makroporøst ionbyttermateriale og inkuberes i 10 min. ved stuetemperatur med periodiske blanding.
- Ved hjælp af en 1 mL pipette tip, overføre den virale lysate (den virale lysisbuffer) til en sterile 1,5 mL konisk tube og fortsætte med RNA isolering ved hjælp af en viral RNA isolering kit (Se Tabel af materialer) i overensstemmelse med producentens instruktioner, undtagen at elueret RNA i en samlet maengde paa 60 µL af eluering buffer.
- Nukleinsyre isolation fra flydende impingers.
- Der afpipetteres 140 µL af flydende prøven i et sterile 1,5 mL konisk rør og udføre RNA isolering ved hjælp af viral RNA isolering kit i overensstemmelse med producentens instruktioner, med undtagelse af eluerer RNA i en samlet maengde paa 60 µL af eluering buffer.
Bemærk: 140 µL er stikprøvens bind, der kan behandles med specifikke viral RNA isolering kit ansat her i et enkelt trin forberedelse.
- Der afpipetteres 140 µL af flydende prøven i et sterile 1,5 mL konisk rør og udføre RNA isolering ved hjælp af viral RNA isolering kit i overensstemmelse med producentens instruktioner, med undtagelse af eluerer RNA i en samlet maengde paa 60 µL af eluering buffer.
- Nukleinsyre isolation fra anion ionbytteren.
- Udføre qRT-PCR til påvisning af MS2 og influenza A og B virus som tidligere beskrevet23,24. I denne demonstration bruges 5 µL af nukleinsyre eluater for qRT-PCR.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
Figur 1 viser princippet bag gebyr-baserede erobringen af virus fra bioaerosols via inddragelse af harpiks i væske-baseret impingers. Figur 2 viser opsætningen af specialbyggede bioaerosol kammer. Figur 3 beskriver de forskellige trin i oprettelsen af aerosolization eksperiment og foranstaltninger til at sikre kvalitetskontrol. Figur 4 viser forstærkning kurver for qRT-PCR påvisning af negativt ladede vira hentet fra bioaerosols. Tabel 1 viser primere og sonder anvendes til qRT-PCR for eksempel vira, der anvendes i denne undersøgelse.
Hjælp MS2 og influenza virus indeholdt i influenza-vaccine som modeller i den brugerdefinerede bioaerosol kammer, de flydende impingers modificeret med anion ionbytteren tilladt for ca. 3 x 9 x forbedring i viral påvisning, afhængigt af specifikke virus, i forhold til direkte test for impingement flydende22. Som vist i repræsentative qRT-PCR forstærkning kurver (figur 4), påvisning af typen en influenzavirus kan opnås op til 3.26 cyklusser før når anion ionbytteren blev brugt i forhold til direkte test for impingement væske. I betragtning af at en gevinst på en Ct en qRT-PCR, som er 100% effektiv, svarer til en 2-fold stigning i target koncentration, svarer denne forskel til en 9,58 x forbedring i påvisning.
Figur 1: flydende impingement kombineret med anion ionbytteren. Hvert af de modificerede bioaerosol prøvetagning indarbejder en anion ionbytteren i sit design. Hver harpiks perle er en 0,5 til 1,0 mm kugle med en porøs overflade, en egenskab, der øger anion exchange areal. Funktionelle kvaternære ammonium grupper giver mulighed for opsamling af ioner i flydende medier, mægle erobringen af vira med net-negative overfladeladninger, herunder MS2 coliphages og influenza vira, der anvendes i denne protokol som modelorganismer (en hale bacteriophage tegnes her som eksempel for erobrede virus). Nukleinsyre isolering udføres derefter direkte fra harpiks (ved hjælp af kommercielt tilgængelige kits), med den prøve, der er egnet til de fleste molekylær detektion strategier (qRT-PCR ansat her). Venligst klik her for at se en større version af dette tal.
Figur 2: Custom bioaerosol kammer skematisk. A: 6-jet nebulizer leveres med filtreret og tørrede luft ved et indtægtsskabende Tryk på 6,9 kPa. B: aksial fans til at lette ensartet bioaaerosol blanding; C: aerosol monitor til at identificere relative bioaerosol koncentrationerne; D: flydende impinger med harpiks; E: flydende impinger uden harpiks; F: termisk vindmåler at måle vindhastigheden; G: luft kvalitet monitor til at måle andre miljø variabler herunder temperatur, kuldioxid og procent relativ luftfugtighed; H: aktive prøveudtagning pumper kalibreret til 12,5 L/min. I: pneumatisk forseglet handske havne for positionering prøveudtagningsudstyr inden for bioaerosol kammer; J: observation vindue. Dette tal blev genbrugt fra tidligere arbejde med tilladelse fra udgiveren22. Venligst klik her for at se en større version af dette tal.
Figur 3: arbejdsgang for forsøget, bioaerosolization. Venligst klik her for at se en større version af dette tal.
Figur 4: Anion ionbytteren forbedrer qRT-PCR baseret påvisning af negativt ladede virus i bioaerosols. I dette eksempel type A influenza-vira i en inokulum koncentration på 103,5 FFU/mL blev aerosolmaterialer ind i brugerdefinerede bioaerosol salen indtil bioaerosol massekoncentration nåede 5 mg/m3. Flydende impingers med og uden harpiks var samtidig beskæftiget hver prøve (500 L) af bioaerosol. Viral RNA blev fremstillet af ionbytteren anion eller af væsken, impinger og analyseres af qRT-PCR. Eksperimentet blev gentaget i tre eksemplarer. Nukleinsyrer fremstillet af harpiks prøver blev opdaget på en gennemsnitlig Ct af 26.76, hvorimod impinger flydende prøver blev opdaget på en gennemsnitlig Ct af 30.02 (ΔCt af 3.26). Denne forskel i Ct er svarende til en forbedring af 9,58 x påvisning ved hjælp af ionbytteren anion. Venligst klik her for at se en større version af dette tal.
| Virus | Primer navn | Primer sekvens | Reference | |
| MS2 | GI Fwd | 5'-ATCCATTTTGGTAACGCCG-3' | 23 | |
| GI sonde | 5'-(6-FAM)-TAGGCATCTACGGGGACGA-(BBQ)-3' | |||
| GI Rev | 5'-TGCAATCTCACTGGGACATAT-3' | |||
| IAC Fwd (46F) | 5'-GACATCGATATGGGTGCCG-3' | |||
| IAC sonde | 5'-(Cy5) - CACATTCACCAGGGAGACGCATGAGA-(BBQ) -3 ' | |||
| IAC Rev (186R) | 5'-CGAGACGATGCAGCCATTC-3' | |||
| type et influenzavirus | CDC universal influenza A virus fremad primer | 5'-GAC CRA TCC TGT CAC CTC TGA C-3' | 24 | |
| CDC universal influenza virus reverse primer | 5'-AGG GCA TTY TGG ACA AAK KBRT CTA-3' | |||
| CDC universal influenza A virus sonde | 5'-(FAM) - TGC AGT FTT CGC TCA CTG GGC ACG-(BHQ1) -3 ' | |||
| type B-influenza-virus | CDC universal influenza B virus fremad primer | 5'-TCCTCAACTCACTCTTCGAGCG-3' | 24 | |
| CDC universal influenza B virus reverse primer | 5'-CGGTGCTCTTGACCAAATTGG-3' | |||
| CDC universal influenza B virus sonde | 5'-(JOE) - CCAATTCGAGCAGCTGAAACTGCGGTG-(BHQ1) -3 ' | |||
Tabel 1: primere og sonder anvendes i denne undersøgelse. Alle primere og sonder var fra Friedman et al. 201123 og Maria Skovbo & Selvarangan 201024.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
Denne protokol beskriver en metode til følsomme viral opsamling fra bioaerosols ved hjælp af modificerede flydende impingers. Metoden er optimeret til påvisning og kvantificering af virusmængde i bioaerosols. Den specifikke ændring demonstrerede her omfatter tilføjelse af anion ionbytteren til flydende indeholdt i en fælles flydende impinger. Denne metode blev udviklet for sin enkelhed i downstream prøve behandling, mens andre prøve behandling teknikker såsom centrifugering, filtrering og nedbør-baserede metoder ikke tilbyder denne fordel. Ekstraktion af nukleinsyrer foretages direkte fra harpiks, hos behovet for high-volume elutions og flere prøve forberedelsestrin, i sidste ende bidrage til forbedret afsløring følsomhed via reduktion i effektiv prøven volumen. Desuden, det har vist at immobilisering af virale partikler på faste overflader kan bidrage til øget stabilitet af viral nukleinsyre eller tilbageholdelse af viral infektivitet17,25. Immobilisering kan yderligere bidrage til øget capture effektivitet ved at reducere tab på grund af reaerosolization16. Metoden kan kobles nemt til downstream molekylære analyser (qRT-PCR vist her). Anion ionbytteren kan felt-udvindes og sendes til et referencelaboratorium til analyse, mens luft-prøveudtagningsudstyr kan blive dedikeret til overvågning i området prøveudtagning. Da princippet bag proceduren, der indebærer ikke-specifikke erobringen af virus bærer en net-negative overflade afgift, er metoden forventes at være modtagelig til påvisning af flere patogene vira af betydning for menneskers sundhed og veterinærmedicin. Gennemses af Michen og Graule26, har et stort antal virus vigtigt for menneskers og dyrs sundhed net-negative overfladeladninger, med få kendte undtagelser, såsom visse stammer af rotaviruses og polioviruses.
Denne protokol, evalueres ikke direkte påvirkning af miljøforhold følsomheden af påvisning; men når luften prøvetagning er udført i Feltindstillinger, det er tænkeligt, at variabler som relativ luftfugtighed og temperatur kan påvirke samling effektivitet på tværs af flere typer af luft samplere12. Således kan betingelser inden for bioaerosol kammer ændres for at passe disse miljømæssige parametre efter behov. Anion exchange harpiks metode har vist sig at effektivt koncentrere flere vira fra vandprøver med en bred vifte af fysisk-kemiske egenskaber, der angiver, at interferens fra partikler, bakterier og andre miljømæssige forurenende stoffer forventes at blive minimal18. Derudover kan samling buffere kræve optimering for specifikke virus, som i nogle tilfælde har det vist sig, at optimere samling bufferen kan føre til forbedret fastholdelse af viral stabilitet27. En største ulempe ved metoden som præsenteret er det faktum, at det ikke kan fastslåes viral infektivitet. En anden ulempe ved denne protokol er den manglende evne til at vurdere potentielt negative virkninger af nebulization og luft prøvetagning på viral stabilitet, herunder udtørring, klipning og uspecifikke adsorption til bioaerosol kammer overflader22.
Modificerede bioaerosol prøvetagning enheder kunne være indstillet til feltbaserede prøveudtagning i flere indstillinger, herunder sygehuse, skoler, landbrugs operationer og andre steder. Fordi der foretages ændringer til eksisterende luft prøveudtagningsudstyr, er det forventet de modificerede enheder ville være nemt adoptere af operatørerne i øjeblikket prøvetagning bioaerosols for virus. Protokollen er vist her i en specialbygget bioaerosol kammer ved hjælp MS2 og influenza virus, som er nyttige mål for metodeudvikling, at de repræsenterer eksempler på ikke-kappebærende og kappebærende virus, MS2 er anerkendt som en surrogat enteriske virus og er almindeligvis ansat i evalueringen af impingers22,26,27,28,29.
Fremtidige arbejde omfatter optimering af udtagningsvilkårene (dvs. prøveudtagning lufthastighed, samling buffere) og medtagelse af yderligere relevante virus i test protokoller.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
Forfatterne har ikke noget at oplyse.
Acknowledgments
Dette arbejde blev støttet af midler fra CDC/NIOSH High Plains Intermountain Center for landbruget og sundhed (5U54OH008085) og Colorado Bioscience Discovery evaluering Grant Program (14BGF-16).
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Escherichia coli bacteriophage MS2 (ATCC 15597-B1) | American Type Culture Collection | ATCC 15597-B1 | |
| FluMist Quadrivalent | AstraZeneca | Contact manufacturer | Viral constitutents of this vaccine are subject to change on an annual basis |
| CFX96 Touch Real-Time PCR Detection System | Bio-Rad | 1855195 | |
| Primers and probes | Integrated DNA Technologies | NA | |
| 0.2 µM sterile filter | NA | NA | |
| 1 L pyrex bottles or equivalent | NA | NA | |
| 1 mL pipet tips | NA | NA | |
| 1 mL pipettor | NA | NA | |
| 50 mL serological pipet | NA | NA | |
| PCR tubes | NA | NA | |
| Pipet-aid or equivalent | NA | NA | |
| QIAamp Viral RNA Mini Kit | Qiagen | 52904 | |
| QuantiTect Probe RT-PCR Kit | Qiagen | 204443 | |
| Amberlite IRA-900 chloride form | Sigma-Aldrich | 216585-500G | |
| Phosphate buffered saline | Sigma-Aldrich | P5368-10PAK | |
| Water (molecular biology grade) | Sigma-Aldrich | W4502-1L | |
| Eppendorf DNA LoBind Microcentrifuge Tubes | ThermoFisher | 13-698-791 | |
| Falcon 50 mL Conical Centrifuge Tubes | ThermoFisher | 14-432-22 | |
| Falcon Polypropylene Centrifuge Tubes | ThermoFisher | 05-538-62 | |
| SuperScript III Platinum One-Step qRT-PCR Kit w/ROX | ThermoFisher | 11745100 | |
| SKC Biosampler 20 mL, 3-piece glass set | SKC Inc. | 225-9593 | |
| Vac-u-Go sample pumps | SKC Inc. | 228-9695 | |
| Collison nebulizer (6-jet) | BGI Inc. | NA | |
| HEPA capsule | PALL | 12144 | |
| Q-TRAK indoor air quality monitor 8554 | TSI Inc. | NA | |
| Alnor velometer thermal anemometer AVM440-A | TSI Inc. | NA | |
| SidePak AM510 personal aerosol monitor | TSI Inc. | NA | |
| Bioaerosol chamber | NA | NA |
References
- Pirtle, E. C., Beran, G. W. Virus survival in the environment. Revue scientifique et technique (International Office of Epizootics). 10 (3), 733-748 (1991).
- Nguyen, T. M., et al. A community-wide outbreak of legionnaires disease linked to industrial cooling towers--how far can contaminated aerosols spread? The Journal of Infectious Diseases. 193 (1), 102-111 (2006).
- Marks, P. J., et al. Evidence for airborne transmission of Norwalk-like virus (NLV) in a hotel restaurant. Epidemiology and Infection. 124 (3), 481-487 (2000).
- Marks, P. J., et al. A school outbreak of Norwalk-like virus: Evidence for airborne transmission. Epidemiology and Infection. 131 (1), 727-736 (2003).
- Corzo, C. A., Culhane, M., Dee, S., Morrison, R. B., Torremorell, M. Airborne detection and quantification of swine influenza a virus in air samples collected inside, outside and downwind from swine barns. PLoS One. 8 (8), e71444 (2013).
- Anderson, B. D., et al. Bioaerosol sampling in modern agriculture: A novel approach for emerging pathogen surveillance. The Journal of Infectious Diseases. 214 (4), 537-545 (2016).
- Hietala, S. K., Hullinger, P. J., Crossley, B. M., Kinde, H., Ardans, A. A. Environmental air sampling to detect exotic Newcastle disease virus in two California commercial poultry flocks. Journal of Veterinary Diagnostic Investigation. 17 (2), 198-200 (2005).
- Jonges, M., et al. Wind-mediated spread of low-pathogenic avian influenza virus into the environment during outbreaks at commercial poultry farms. PLoS One. 10 (5), e0125401 (2015).
- Otake, S., Dee, S. A., Jacobson, L., Torremorell, M., Pijoan, C. Evaluation of aerosol transmission of porcine reproductive and respiratory syndrome virus under controlled field conditions. The Veterinary Record. 150 (26), 804-808 (2002).
- Wu, Y., et al. Aerosolized avian influenza A (H5N6) virus isolated from a live poultry market, China. The Journal of Infection. 74 (1), 89-91 (2017).
- Choi, M. J., et al. Live animal markets in Minnesota: A potential source for emergence of novel influenza A viruses and interspecies transmission. Clinical Infectious Diseases. 61 (9), 1355-1362 (2015).
- Haig, C. W., Mackay, W. G., Walker, J. T., Williams, C. Bioaerosol sampling: Sampling mechanisms, bioefficiency and field studies. The Journal of Hospical Infection. 93 (3), 242-255 (2016).
- Anderson, B. D., Lednicky, J. A., Torremorell, M., Gray, G. C. The use of bioaerosol aampling for airborne virus surveillance in swine production facilities: A mini review. Frontiers in Veterinary Science. 4, 121 (2017).
- Verreault, D., Moineau, S., Duchaine, C. Methods for sampling of airborne viruses. Microbiology and Molecular Biology Reviews. 72 (3), 413-444 (2008).
- Hogan, C. J. Jr Sampling methodologies and dosage assessment techniques for submicrometre and ultrafine virus aerosol particles. Journal of Applied Microbiology. 99 (6), 1422-1434 (2005).
- Yu, K. -P., Chen, Y. -P., Gong, J. -Y., Chen, Y. -C., Cheng, C. -C. Improving the collection efficiency of the liquid impinger for ultrafine particles and viral aerosols by applying granular bed filtration. Journal of Aerosol Science. 101, 133-143 (2016).
- Perez-Mendez, A., et al. Evaluation of a simple and cost effective filter paper-based shipping and storage medium for environmental sampling of F-RNA coliphages. J Virol Methods. 194 (1-2), 60-66 (2013).
- Chandler, J. C., et al. Field-based evaluation of a male-specific (F+) RNA coliphage concentration method. Journal of Virological Methods. 239, 9-16 (2017).
- Perez-Mendez, A., Chandler, J. C., Bisha, B., Goodridge, L. D. Concentration of enteric viruses from tap water using an anion exchange resin-based method. Journal of Virological Methods. 206, 95-98 (2014).
- Perez-Mendez, A., Chandler, J. C., Bisha, B., Goodridge, L. D. Evaluation of an anion exchange resin-based method for concentration of F-RNA coliphages (enteric virus indicators) from water samples. Journal of Virological Methods. 204, 109-115 (2014).
- Kammerer, J., Carle, R., Kammerer, D. R. Adsorption and ion exchange: Basic principles and their application in food processing. Journal of Agricultural and Food Chemistry. 59 (1), 22-42 (2011).
- Chandler, J. C., et al. A method for the improved detection of aerosolized influenza viruses and the male-specific (F+) RNA coliphage MS2. Journal of Virological Methods. 246, 38-41 (2017).
- Friedman, S. D., Cooper, E. M., Calci, K. R., Genthner, F. J. Design and assessment of a real time reverse transcription-PCR method to genotype single-stranded RNA male-specific coliphages (Family Leviviridae). Journal of Virological Methods. 173 (2), 196-202 (2011).
- Selvaraju, S. B., Selvarangan, R. Evaluation of three influenza A and B real-time reverse transcription-PCR assays and a new 2009 H1N1 assay for detection of influenza viruses. Journal of Clinical Microbiology. 48 (11), 3870-3875 (2010).
- Cademartiri, R., et al. Immobilization of bacteriophages on modified silica particles. Biomaterials. 31 (7), 1904-1910 (2010).
- Michen, B., Graule, T.
- Turgeon, N., Toulouse, M. J., Martel, B., Moineau, S., Duchaine, C. Comparison of five bacteriophages as models for viral aerosol studies. Applied and Environmental Microbiology. 80 (14), 4242-4250 (2014).
- Vergara, G. G., et al. Evaluation of FRNA coliphages as indicators of human enteric viruses in a tropical urban freshwater catchment. Water Research. 79, 39-47 (2015).
- Tung-Thompson, G., Libera, D. A., Koch, K. L., de Los Reyes, F. L. 3rd, Jaykus, L. A. Aerosolization of a human norovirus surrogate, bacteriophage MS2, during simulated vomiting. PLoS One. 10 (8), e0134277 (2015).
