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JoVE Journal
Biology

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JoVE Journal Biology
Deep-Learning-basierte Segmentierung von Kryo-Elektronen-Tomogrammen
Application of Retinoic Acid to Obtain Osteocytes Cultures from Primary Mouse Osteoblasts
Journal (Biology)
Application of Retinoic Acid to Obtain Osteocytes Cultures from Primary Mouse Osteoblasts
Using Microfluidic Devices to Measure Lifespan and Cellular Phenotypes in Single Budding Yeast Cells
Journal (Biology)
Using Microfluidic Devices to Measure Lifespan and Cellular Phenotypes in Single Budding Yeast Cells
 
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Deep-Learning-basierte Segmentierung von Kryo-Elektronen-Tomogrammen

Article DOI: 10.3791/64435-v • 10:25 min • November 11th, 2022
November 11th, 2022 •
1, 1, 1, 2, 1, 1
1Pennsylvania State University-College of Medicine, 2Object Research Systems

Chapters

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Hierbei handelt es sich um ein Verfahren zum Trainieren eines Mehrschicht-U-Netzes für die Mehrklassensegmentierung von Kryo-Elektronen-Tomogrammen, wobei ein Teil eines Tomogramms als Trainingseingabe verwendet wird. Wir beschreiben, wie man dieses Netzwerk auf andere Tomogramme ableiten kann und wie man Segmentierungen für weitere Analysen extrahiert, wie z.B. Subtomogramm-Mittelung und Filament-Tracing.

Tags

Biologie Heft 189
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