وتقدم مجموعة من التقنيات المختلفة لتعظيم جمع البيانات من الأنسجة الماوس.
مقالة منهجية
وتقدم مجموعة من التقنيات المختلفة لتعظيم جمع البيانات من الأنسجة الماوس.
تجاوز وظيفة جينة واحدة لقطع أعمق في شبكات الجينات التنظيمية يتطلب تحولات متعددة مجتمعة في حيوان واحد. مثل هذا التحليل من اثنين أو أكثر من الجينات تحتاج إلى أن تستكمل مع التهجين في الموضع الطبيعي للجينات أخرى ، أو من البروتينات المناعية الخاصة بهم ، سواء في أجهزة محمولة كلها النامية أو أقسام لتحليل مفصل للتعديلات التعبير الخلوية والأنسجة. الجمع بين عدة جينات التعديلات يتطلب استخدام لجنة المساواة العرقية أو لحذف flipase مشروط الجينات وتجنب الفتك الجنينية. المخططات المطلوبة تربية تعزز على نحو مثير الجهد والتكاليف بما يتناسب مع عدد من الجينات المتحولة ، مع نتائج قليلة جدا من الحيوانات مع ذخيرة كاملة من التعديلات الوراثية المطلوبة. إطفاء الكم الهائل من الجهد والوقت للحصول على هذه العينات القليلة الثمينة التي تحمل طفرات متعددة يتطلب التحسين الأنسجة. وعلاوة على ذلك ، والتحقيق في حيوان واحد مع تقنيات متعددة يجعل من السهل ربط عيوب الجينات الحذف مع التشكيلات التعبير. قمنا بتطوير تقنية للحصول على مزيد من التحليل الدقيق لحيوان معين ، مع القدرة على تحليل العديد من مختلف هياكل معترف بها تشريحيا وكذلك الجينات والبروتينات التعبير عن نفسه من العينة في كل من الأجهزة كلها صحيحة والمقاطع. على الرغم من أن الفئران قد استخدمت للتدليل على فعالية هذه التقنية يمكن تطبيقها على مجموعة واسعة من الحيوانات. للقيام بذلك جمعنا محبة للدهون صبغ تتبع جبل بأكمله في الموقع التهجين ، المناعية ، والأنسجة لاستخراج أقصى كمية ممكنة من البيانات.
1. صبغ حقن محبة للدهون
نسيج التحضير :
تنفذ جميع تشريح الانسجة والتلاعب في الحيوانات ثابتة في بارافورمالدهيد 4 ٪ (PFA) في 0.1 م العازلة الفوسفات (درجة الحموضة 7.4) عن طريق استخدام مضخات نضح transcardial تمعجية مع الإبر بحجم مناسب. يمكن تخزينها في الأنسجة PFA 4 ٪ في الثلاجة لمدة تصل إلى 6 أشهر. وتجرى جميع الاستعدادات والتلاعب في 0.4 ٪ أو أعلى حتى PFA المتصاعد مع الجلسرين للتصوير. هذا المبلغ من PFA يلغي فعليا RNases ويحافظ على الحمض النووي الريبي لتهجين في الموضع.
صبغ التخزين :
يجب أن يتم تخزين جميع الأصباغ في حجرة مظلمة ومقفلة للحد من دوران الهواء والتعرض لضوء النهار الساطع ، لأنها حساسة للضوء. لتجنب التلوث المتبادل ، يجب استخدام مجموعة منفصلة من الأدوات لمعالجة كل صباغة.

الشكل 1. نظرة عامة على ما يتعرض التخطيطي للتجربة. الأذن للسماح لرؤية جميع الهياكل. ثم يتم حقن صبغة محبة للدهون ، وسمح لنزع فتيل. ويمكن أن ينظر إليه بعد نشر السكان العصبية المسماة متميزة من الأصباغ المختلفة. المقبل ، في الموقع التهجين (Sox2) يتم تنفيذها على الأذن والتسميات التعبير مرنا. ويتم من ثم المناعية(Myo7 ، تويولين) لتصور بروتين تعبير. تليها قطاعات النسيجية والتي على حد سواء في الموقع التهجين والمناعية يمكن تصور.
2. في الموقع التهجين
في حال كنت تريد أن تبدأ في تهجين الموقع (وبعد ذلك تتبع مع الأصباغ محبة للدهون وسوف يكون من المستحيل) ، تشير إلى إعداد الأنسجة في الجزء 1. كل الغسيل ، ما لم يرد ، ونفذت مع 2 مل من محلول في درجة حرارة الغرفة على العاكس / خلاط. احرص على العمل في بيئة نظيفة ريبونوكلياز ، مجانا.
| الجدول 1. بروتين الهضم وقت كاف على أنسجة الماوس. | |
| AGE (اليوم الجنينية) | TIME (دقيقة) |
| E8.5 | 6 |
| E9.5 | 10 |
| E10.5 | 13 |
| E11.5 | 15 |
| E12.5 | 17 |
| E14.5 | 18 |
| E16.5 + | 20 + |
* يمكن تصوير العينات في هذه المرحلة و / أو بعد خطوة المناعية يضاف (الجزء 3 أدناه).
الحلول :
3. المناعية
ويمكن حذف الخطوات 1 و 2 إذا اكتمل الجزء 2. في هذه الحالة ، تأكد من أن يتم غسلها عن الجلسرين أو غيرها المتوسطة المتزايدة قبالة. علما بأن ليس كل الأجسام المضادة سوف تكون لا تزال قادرة على كشف حاتمة بهم بعد الهضم K بروتين. لدينا قائمة قصيرة من الأجسام المضادة التي يمكن أن تستخدم في تركيبة مع التهجين في الموقع في أنسجة الثدييات كما أنها تحتفظ خصوصيتها (انظر الجدول 2).
الحلول
| الجدول 2. الأجسام المضادة التي تعمل مع الأنسجة K بروتين مهضوم. | ||
| القط # | بند | Vender |
| 25-6790 | مكافحة الميوسين - VIIA النسائل المتعددة | العلوم البيولوجية المتقلبة |
| 25-6791 | مكافحة الميوسين إلى السادس النسائل المتعددة | العلوم البيولوجية المتقلبة |
| 9661 | المشقوق كاسباس 3 النسائل المتعددة | خلية اشارة |
| T7451 | مكافحة الأسيتيل تويولين Monoclonبن | سيغما |
| PRB - 238C | النسائل المتعددة Prox1 | كوفانس |
4. الأنسجة
ويمكن إدخال جزء 1 الأنسجة بعد قرار لزيادة الصبغة محبة للدهون في البحث عن المفقودين يتصاعد كله سميكة مثل أدمغة الأحداث أو بعد الانتهاء من قطع غيار 2 أو 3. لأقسام الدماغ المسلسل نوصي VF - 700 Compresstome مشراح (Precisionary الآلات ، وشركة غرينفيل ، كارولينا الشمالية) للحصول على الزي سمك الباب. أقسام المجمدة هي أقل الأمثل بسبب تسرب صبغة أكبر خلال عملية sectioning 3. إعداد الأبواب المسلسل والمتصاعد في الجلسرين 4 هو الأسلوب المفضل لإعداد الأنسجة عندما يتصاعد يتصاعد كليا أو السطحية لا تسمح التصور الملائم للمناطق الأنسجة من الاهتمام. ويمكن أيضا نسيج لاحقا جزءا لا يتجزأ من راتنجات الايبوكسي وقطع سمك ميكرومتر 1-2 في استخدام الزجاج أو السكاكين الماس لTEM. عند استخدام هذه التقنية الأكثر المناعي ستبقى وأكثر استقرارا بعد تضمين البلاستيك ، ومع ذلك ، سيتم تعقب كل محبة للدهون فقدت تماما في هذه المرحلة لأنها تذوب في الكحول وراتنجات الايبوكسي. اتخاذ الاحتياطات كعينات وسيتم الحساسة للضوء حتى تضمهم.
لVF - 700 Compresstome sectioning مشراح ، اتبع توصيات لشركة الصكوك Precisionary
الايبوكسي تضمينها / Sectioning :
الحلول
5. ممثل النتائج

الشكل 2. تم حقن صبغة موضع محبة للدهون والتصوير في جنين الفأر ثلاثة أصباغ مختلفة الطول الموجي محبة للدهون والمحتضنة للسماح التصور من العصب الثلاثي التوائم (تينيسي) ، عصب (GN) ، والعصب المبهم (VN) إسقاطات المركزية. أ) موضع محبة للدهون في صبغ الأجزاء الطرفية من ثلاثة الأعصاب القحفية للسماح للنشر في الدماغ عن تصور عملياتها المركزية. هو المسمى TN مع الأحمر NeuroVue ، GN : المارون NeurVue وVN : NeuroVue اليشم. B) الماوس في نفس الحضانة بعد (A). ويمكن رؤية بعض نشرها مع brightfield المجهري. C) الفأر نفسه كما في (A و B). وقد تم تشريح الدماغ المؤخر وشنت المسطحة. ويمكن ملاحظة بعض العلامات من العمليات المركزية للأعصاب three المسمى مع brightfield المجهري. د) صورة من متحد البؤر (C). مع ويمكن ملاحظة استخدام الخلايا العصبية المحددة مبائر ، واستخدام ثلاثة ألوان مختلفة يسمح لتقييم توزيع السكان في كل ما يتعلق الآخرين. وقد التقط الأصباغ بشكل تسلسلي. تم تصوير NeuroVue اليشم في جامعة النجاح الإثارة من 488 نانومتر ، والانبعاثات 500-550 نانومتر. تم تصوير NeuroVue الاحمر فى استثارة 535 نانومتر وانبعاث 550-600 نانومتر. تم تصوير NeuroVue المارون في جامعة النجاح الإثارة من 643 نانومتر ، والانبعاثات على 650-700 نانومتر.

الشكل 3 نظرة عامة رسم تخطيطي للتجربة. تتعرض الأذن للسماح لرؤية جميع الهياكل. صبغ هو محبة للدهونثم حقن وسمح لنزع فتيل. ويمكن أن ينظر إليه بعد نشر السكان العصبية المسماة متميزة من الأصباغ المختلفة. المقبل ، في الموقع التهجين (sox2) يتم تنفيذها على الأذن والتسميات التعبير مرنا. ويتم بعد ذلك الخروج المناعية (Myo7 ، تويولين) لتصور بروتين تعبير. تليها قطاعات النسيجية والتي على حد سواء في الموقع التهجين والمناعية يمكن تصور.
في هذا الفيديو ، ونحن يبرهن على وجود طريقة لدمج أربع تقنيات من أجل تحقيق أقصى قدر من التماسك وجمع البيانات عن طريق الربط بين البيانات داخل حيوان معين (الشكل 3). هذا النهج سوف تقلل من كمية تربية ، وبالتالي الوقت اللازم للحصول على بيانات للنشر وتحسين المعلومات حول توطين المشترك والآثار المترابطة من المسوخ. وعلى الرغم من واستخدمت الفئران الجنينية في هذه الفأرة والفيديو الكبار وكذلك الحيوانات الأخرى مثل الدجاج ، والضفدع ، والزرد يتم تحليلها باستخدام هذه التقنيات كذلك. عند استخدام أنواع أخرى قد بروتيناز ك الهضم تحتاج إلى تغييرها. هنا نستخدم الأصباغ المختلفة NeuroVue الاستشعاع لتسمية تحديدا ما يصل إلى ثلاثة من السكان العصبية الفائدة. الاستفادة من هذه الأصباغ هي التي يمكن استخدامها في فئرانا معدلة وراثيا ، والتي قد تكون مشكلة عند الاعتماد فقط على المناعية التي قد تكون أو لا تكون المتضررة من الطفرات التي سيتم تحليلها ، وأنها تسمية الخلايا العصبية وretrogradely anterogradely 5. وزاد أيضا دراسة حديثة أن عدد السكان الخلايا العصبية التي يمكن أن توصف في وقت واحد الى ستة 2. بعد ذلك ، ثم صباغة النسيج محبة للدهون تتبع نفس الفائدة يتم تحليلها باستخدام التهجين في الموقع ، لتحليل الجينات والاستنساخ ويمكن تحليلها في وقت لاحق باستخدام المناعية للتوزيع البروتين. ويمكن استكمال التحليل الأخير الأنسجة التفصيلية التي يمكن أن تضاف إلى توصيف النمط الظاهري 6. هذا التحليل متعدد العوامل لديه القدرة على اكتساب رؤى جديدة من خلال تحليل المتلازم ضمن نفس الحيوان التي يمكن أن يكون الأمر خلاف ذلك واردا ، أو على الأقل في حاجة إلى مزيد من البروتوكولات واسعة وخصبة الماوس.
تم الحصول على الصور مبائر في جامعة ولاية ايوا كارفر مركز التصوير. وقدمت وقدمت التمويل عن طريق منح SBIR (MH079805) لدعم BF إضافية لتربية الفئران لهذا المشروع من قبل NIDCD (5R01DC00559007) لBF
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| <مجهر إلكتروني>في الموقع التهجين: | |||
| طقم محاليل الغسل والحجب PC DIG | مجموعة روش | 1585762 | |
| محلول SSC المنظم بتركيز 20x مُعد مسبقاً | مجموعة روش | 1666681 | |
| بروتيناز ك 20 مجم/مل | Ambion | AM2546 | |
| ثنائي إيثيل بيروكربونات (DEPC) | Research Products International Corp. | D43060 | |
| فورماميد | Sigma-Aldrich | F9037 | |
| كبريتات الديكستران | Research Products International Corp. | D20020 | |
| بي إم بيربل (BM Purple) | مجموعة روش (Roche Group) | 11442074001 | |
| شظايا Fab المضادة لـ Dig-AP | مجموعة روش (Roche Group) | 11093274910 | |
| إنزيم RNase A بتركيز 10 ملجم/ملل | Fermentas | EN0531 | |
| RNase Away | Research Products International Corp. | 7003 | |
| حمض نووي ريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) من نطف السلمون بتركيز 10 مجم/مل | Invitrogen | 15632-011 | |
| وحدة ترشيح Stericup 0.22μم؛ ٥٠٠ مل | EMD Millipore | SCGVU05RE | |
| أقراص ترشيح 0.2μم؛ 25 ملم | Whatman, GE Healthcare | 6780-2502 | |
| عبوات محلول ملحي منظم بالفوسفات بدرجة حموضة 7.4 | Sigma-Aldrich | P-5368 | |
| <مجهر إلكتروني (EM)>الكيمياء النسيجية المناعية: | |||
| مصل الماعز | Sigma-Aldrich | G9023 | |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T8532 | |
| هـ–صبغة chst | Polysciences, Inc. | 9460 | |
| <مجهر إلكتروني نافذ>علم الأنسجة: | |||
| طقم Poly/Bed 812 لوسائط التضمين/DMP-30 | Polysciences, Inc. | 08792-1 | |
| أكسيد البروبيلين | Sigma-Aldrich | 110205 | |
| محلول جلوتارالدهيد 50% | Fisher Scientific | G151 | |
| وسيط تثبيت DPX | Fluka | 44581 | |
| هزاز ميكانيكي | ميدساي (MidSci) | 55D1114 | |
| كتلة التسخين | Fisher Scientific | 11-715-125D | |
| دوار | Thermo Fisher Scientific, Inc. | 400110Q | |
| ضبط الحاضنة على 60° | Fisher Scientific | 11-690-625D | |
| <مجهر إلكتروني>تتبع الصبغة: | |||
| مقصات مجهرية | جودر | G-19775 | |
| ملقط دقيق | إي. إم. إس (E.M.S) | 72680-F | |
| صبغة NeuroVue: مارون، حمراء، جاد | مقال MTT | FS-100(1,2,6) | |
| محلول ملحي منظم بالفوسفات (PBS) بتركيز 1X | Sigma-Aldrich | P-5368 | |
| مجهر التشريح | Leica Microsystems | M205 FA | |
| حضّانة مضبوطة على 36 درجة مئوية° | Fisher Scientific | 11-690-506DQ | |
| المجهر البؤري | Leica Microsystems | LSM 510 | |
| شرائح | سيرجيباث (Surgipath) | 00240 | |
| شرائح التغطية | Surgipath | 00106 | |
| معهد رينسيلر للعلوم والتكنولوجيا (RPI) | جليسرول | G22025-0.5 | |
| بارافورمالدهيد (4% و 0.4%) | Fisher Scientific | T353-500 |