1. عدوى الفأر مع γHV68
- وتستخدم الفئران littermate ستة إلى ثمانية أسابيع من العمر، والجنس المطابقة (8 إلى 12 الفئران / المجموعة) لعدوى فيروسية. تسمح الفئران ليتأقلم على مدى أربعة أيام كاملة (96 ساعة) بعد الشحن.
- وينبغي إجراء الخطوات باستخدام بروتوكول الفيروس في تشكيل حكومة من مستوى السلامة الأحيائية 2 (BSL2) باستخدام معيار BSL2 الاحتياطات.
- إعداد التعليق الفيروسية (40 إلى 1 × 10 5 البلاك تشكيل وحدات [PFU]) من γHV68 في 30 ميكرولتر من برنامج تلفزيوني العقيمة في الماوس فقط قبل التجربة. إبقاء التعليق على الجليد الفيروسية.
- إعداد الحل الكيتامين / زيلازين (1.5 ملغ الكيتامين و 0.15 ملغ الجسم الوزن ز xylazine/20، 100 ميكرولتر / الماوس) لتخدير الماوس. تأكد من أنه تم مخدرا الفئران عن طريق إجراء قرصة أخمص قدميه.
- رزين الفئران مع الكيتامين ملغ 1.5 و 0.15 ملغ 20 ملغ لكل زيلازين وزن الجسم (100 ميكرولتر / الماوس) من داخل البريتوني الحقن.
- تقديم التعليق الفيروسية (30 ميكرولتر / الماوس) الأنف، في الإفلات من الحكمةأزياء، المنخر إلى واحد من الفئران مخدرا.
- وضع الفئران على جانب واحد لمدة 5 - 10 دقيقة لتسهيل إيصال مجرى الهواء للفيروس في الرئة.
- الفئران في قفص المكان مرة أخرى ورصد الفئران حتى أنهم تعافى تماما من التخدير.
- في أيام مختلفة بعد العدوى، والتضحية الفئران خنقا 2 CO والحصاد الرئتين بعد أن تؤكد وفاة / فقدان الوعي العميق. الرئتين في مكان معقم 1،5 أنابيب المسمار وتوج مل تحتوي على 500 ميكرولتر من 1.0 الخرز الزركونيا / السيليكا مم. إبقاء الأنابيب على الجليد. عينات المحل في -80 درجة مئوية إن لم يكن الانتقال إلى الخطوة التالية في نفس اليوم. يمكن جمع الطحال أو أنسجة الكبد في هذا الوقت لتحليل الكمون الفيروسي اعتمادا على الإطار الزمني للتجربة.
- إضافة 1 مل من DMEM المصل خالية الباردة في أنبوب والتجانس الرئتين من 30 ثانية حبة الضرب. البرد أنابيب على الجليد لمدة لا تقل 1 دقيقة. كرر هذه العملية مرة واحدة.
- أجهزة الطرد المركزي في الرئة لست] 16000 في إطار التعاون الإقليمي C ° 4 ل 1 دقيقة واستخدام supernatant لتحديد عيار الفيروسية قبل الفحص باستخدام لوحة أحادي الطبقة أو NIH3T3 BHK21 (انظر القسم 5 لمزيد من التفاصيل).
2. تحديد حركية النمو γHV68 متعددة الخلايا الليفية الماوس في خطوة الجنينية
- تنمو الخلايا الليفية الماوس الجنينية البرية من نوع (MEFs)، ونقص في تلك الجينات المضيف لكثافة (حوالي 80٪) شبه متموجة قبل خلايا الطلاء.
- تقسيم MEFs في 24 لوحة جيدا في 10،000 خلية / جيدا لأدنى مستوى من بين multipilicity العدوى (وزارة الداخلية) في اليوم قبل الإصابة. وتجرى عادة في التجارب وثلاث مكرارت في وزارة الداخلية بين 0.001 - هو الذي يستخدم عادة 0.05.
- إعداد γHV68 التعليق تحتوي على المبلغ المطلوب من فيروس (0.5 مل لكل بئر).
- إزالة المتوسطة وتغطية MEFs مع 0.5 مل من التعليق γHV68 لكل بئر.
- احتضان لوحة في نسيج الثقافة الحاضنة، الصخرة كل 30 دقيقة، والسماح للمضي قدما الحضانة لمدة 2 ساعة.
- إزالة التعليق الفيروسية، وتغطية الخلايا مع 0.5 مل ج جديدةomplete DMEM المتوسطة التي تحتوي على 8٪ مصل بقري جنيني.
- في أيام مختلفة بعد العدوى، وحصاد الخلايا في المتوسط ومعقمة 1،5 مل أنابيب الطرد المركزي. تجميد أنابيب الفور في -80 ° C.
- الإفراج γHV68 من خلال تجميد MEFs في -80 ° C، ذوبان في 37 ° C حمام مائي وvortexing. عادة يتم تطبيق ثلاث دورات التجميد والذوبان في العينات.
- تحديد عيار الفيروسية قبل الفحص باستخدام لوحة أحادي الطبقة أو NIH3T3 BHK21 (انظر القسم 5 لمزيد من التفاصيل).
- قراءة عيار الفيروسية ومؤامرة γHV68 منحنى النمو متعددة الخطوات على MEFs.
3. الجزيئية تشريح γHV68 تكرار التحللي في الخلايا الليفية الماوس الجنينية
- أداء عدوى فيروسية كما هو موضح في الخطوات 2،1 حتي 2،6 من الباب 2.
- في أيام مختلفة بعد العدوى، وتجاهل طاف. شطف الخلايا مع برنامج تلفزيوني الباردة ويعرض للتريبسين الخلايا. بيليه الخلايا بواسطة الطرد المركزي في إطار التعاون الإقليمي في 1000 درجة حرارة الغرفة لمدة 1 دقيقة. تجاهل طاف والخلايا المحل في -80 درجة مئوية.
- استخراج الحمض النووي الإجمالي (المضيف والجينوم الفيروسي) والحمض النووي الريبي مجموع وفقا للأساليب المنشورة سابقا 5،6.
- أداء في الوقت الحقيقي PCR باستخدام DNA الكلي والاشعال محددة لمحاضر التحللي الفيروسية، مثل هيئة الطرق والمواصلات (ORF50)، وORF57 ORF60. تحديد الكميات النسبية للجينوم γHV68 داخل الخلايا في إشارة إلى مجموعة الجينات التدبير المنزلي (مثل β-أكتين).
- لإزالة التلوث الجيني DNA، العلاج مع ريبونوكلياز خالية الدناز هو أمر حاسم لإعداد [كدنا] مع الحمض النووي الريبي مجموع وبنسبة ضئيلة التمهيدي 11-19 (DT). الرجوع إلى مرجع (5) لمزيد من التفاصيل على استخراج الحمض النووي الريبي بما في ذلك العلاج مع ريبونوكلياز خالية الدناز وRT PCR. أداء في الوقت الحقيقي PCR باستخدام بادئات [كدنا] وعلى النحو الوارد أعلاه لتحديد الكمية النسبية من النصوص الفيروسية في إشارة إلى أن من الجينات التدبير المنزلي المضيف.
4. توليد المؤتلف γHV68 باستخدام كروموسوم اصطناعي البكتيرية
وmethoووصف د هنا يستخدم لإدخال طفرات الجينات في γHV68 التي تشارك في استضافة الفيروسات التفاعل.
- إعداد جزء DNA (حوالي 1.5 كيلو بايت) من البرية من نوع تسلسل أو تسلسل تحمل الطفرات المطلوبة في منطقة الوسط بنسبة PCR.
- إعداد الصبغي الاصطناعي البكتيري (BAC) الذي يحتوي على حوالي 7 ينقول الإدراج في الموقع الطفرة التي يثبط نشاط الجينات الجين على وجه التحديد من الفائدة، وذلك على نطاق وتنقية ميدي (أوريجنس). BAC متجر DNA عند 4 ° C (تجنب تجميد / الذوبان من DNA BAC).
- BAC بالنقل DNA والطفرات التي تحتوي على المنتج PCR المطلوب من الجينات إلى خلايا ذات الاهتمام (على سبيل المثال، أو NIH3T3 BHK21)، والتي هي متساهلة للغاية لتكرار التحللي γHV68، مع Lipofectamine 2000 (إينفيتروجن).
- إبقاء خلايا تقسيم حتى الأثر الاستسلامي (CPE) يظهر في أحادي الطبقة. جمع الفيروسات التي تحتوي على طاف وإذا لزم الأمر، تضخيم الفيروس في NIH3T3 أو BHK21 الخلايا.
- تصيب الخلايا مع NIH3T3المؤتلف الفيروس عن طريق الطرد المركزي عند 1،800 دورة في الدقيقة، 30 ° C لمدة 30 دقيقة.
- الحصاد γHV68 الخلايا المصابة NIH3T3 وإعداد circularized الجينوم الفيروسي باستخدام بروتوكول هيرت ل8،9.
- تحويل الخلايا الكهربائية-MAX DH10B المختصة (إينفيتروجن) بواسطة الصعق الكهربائي وكشف عن المستعمرات التي هي مقاومة الكلورامفينيكول (سم)، ولكن حساسية للالكاناميسين (اساسه) (سم مقاومة للالجين هو العمود الفقري في BAC، في حين اساسه مقاومة الجينات في ينقول الإدراج).
- تنمو المستعمرات سم R S اساسه في chlorophenicol المتوسطة التي تحتوي على الحمض النووي وإعداد BAC مع تنقية مصغرة أو ميدي النطاق (أوريجنس).
- تحقق من طفرة في الجين المطلوب من الهدف PCR، وذلك باستخدام بادئات محددة لمناطق المحيطة موقع الطفرة، والتسلسل.
- لا تأكيد إعادة ترتيب الكروموسومات في BAC بواسطة الهضم مع الانزيمات قيود المحددة ونبض الميدان الكهربائي للهلام.
- المؤتلف BAC بالنقل إلى خلايا 3T3 المعاهد الوطنية للصحة أو BHK21 مع Lipofectamine2000 (إينفيتروجن) لإعداد المؤتلف γHV68.
- الحفاظ على الركض الخلايا حتى CPE يظهر في أحادي الطبقة. جمع الفيروسات التي تحتوي على تضخيم وطاف في المؤتلف γHV68 NIH3T3 أو BHK21 الخلايا.
- تحديد عيار المؤتلف للفيروس وتميز النمو الفيروسي فيفو السابقين وخصائص في الجسم الحي كما هو موضح في المقاطع 1 و 2.
5. تحديد عيار الفيروسية قبل الاختبار الصفائحي
- تنمو الخلايا لNIH3T3 الكثافة (حوالي 80٪) شبه متموجة قبل خلايا الطلاء.
- تقسيم NIH3T3 في 24 لوحة جيدا في 20000 خلية / جيدا في اليوم قبل الإصابة.
- إعداد 10-أضعاف supernatants الفيروس متسلسل-المخفف مع DMEM المتوسطة التي تحتوي على 8٪ مصل العجل الوليد (NCS).
- إزالة المتوسطة وتغطية الخلايا NIH3T3 مع 0.5 مل من γHV68 التعليق.
- احتضان لوحة في نسيج الثقافة الحاضنة، صخرة كل 30 دقيقة، والسماح للمضي قدما الحضانةلمدة 2 ساعة.
- إزالة التعليق الفيروسية والخلايا الغطاء مع 0.5 مل المتوسطة DMEM تحتوي على 2٪ NCS وميثيل 0.75٪ (سيغما).
- احتضان لوحة في نسيج الثقافة الحاضنة. عد لويحات في يوم 6 بعد العدوى. قد تلطيخ للأحادي الطبقة، على سبيل المثال البنفسجي مع الكريستال، وتسهيل فرز البلاك.
- حساب عيار الفيروسية في الأنسجة غير مخفف أو لست] الخلية لست] باستخدام الصيغة التالية: العيار الحجمي (PFU / مل) = D X N × 1000 ميكرولتر / مل ميكرولتر V ÷. وأضاف D، تخفيف أضعاف (مثل 10، 5، 100 .....) V (ميكرولتر)، حجم طاف متسلسل-المخففة أيضا؛ N، ومتوسط عدد وحة في التخفيف من مناسبة.
6. ممثل النتائج:
وتظهر ثلاث شخصيات ممثلة هنا، بما في ذلك تكرار التحللي γHV68 في الرئة من مافريكس والبرية من نوع - / - الماوس 10، γHV68 الظواهر تكرار التحللي في الخلايا الليفية الماوس الجنينية (MEF)، وrecombinالنمل يحمل γHV68 الطفرات في المواقع الفسفرة التي هي عن طريق التضمين والتي تعتمد على IKKβ مافريكس. هذه التجارب الثلاث تشكل مساندة خطة لتحديد دور كل من مكونات المناعة الفطرية في γHV68 تكرار التحللي في الجسم الحي وفيفو السابقين.

الشكل 1 γHV68 الأحمال في الرئتين من مافريكس + / + ومافريكس - / - الفئران. A) اثنان إشارات الفطرية المسارات الرئيسية المصب مافريكس. الجزيء محول مافريكس التبديلات إشارة من مستقبلات RIG-I-عصاري خلوي لتفعيل مثل NFκB والعوامل التنظيمية للفيروسات (IRFs) وهذا بدوره، يصل تنظيم التعبير الجيني من السيتوكينات proinflammatory وإنترفيرون. B) مافريكس + / + ومافريكس - أصيب الفئران مع 40 PFU γHV68 الأنف والأحمال الفيروسية في الرئة عند نقاط الوقت المشار إليه وردع - / الملغومة من قبل الفحص باستخدام لوحة NIH3T3 أحادي الطبقة. كل رمز يمثل الماوس.

الشكل 2. γHV68 حركية تكرار التحللي في الخلايا الليفية الجنينية الماوس (MEFs). تكرار التحللي من γHV68 على مافريكس + / + ومافريكس - / - تم تقييم MEFs من منحنيات النمو متعددة الخطوات (A) والكمية في الوقت الحقيقي PCR (B). لكل من التجارب، واستخدمت عدد متساو من MEFs وكمية γHV68 لعدوى فيروسية في تعدد العدوى، من (وزارة الداخلية) من 0.01. (A) الخلايا تم حصادها وsupernatants في نقاط الوقت المشار إليه وتخضع لفحص اللوحة لتحديد التتر الفيروسية. (B) تم استخراج الحمض النووي الريبي مجموع من γHV68 المصابين وتحليلها بواسطة MEFs PCR الكمي في الوقت الحقيقي مع الاشعال محددة لمحاضر التحللي المحددة (RTA، ORF57، وORF60).
ig3.jpg "/>
الشكل 3. وحركية تكرار التحللي من الطفرات المؤتلف γHV68 تحمل ضمن المجال transactivation هيئة الطرق والمواصلات أن إلغاء الفسفرة من IKKγ. (A) منحنيات النمو متعددة الخطوات من الفيروسات البرية من نوع المؤتلف (γHV68.wt) والفيروس متحولة (γHV68.mut) في دالاس + / + ومافريكس - / - الخلايا MEFs (MOI = 0.01). أصيب MEFs مع وزارة الداخلية لفي γHV68 من 0.01. الخلايا تم حصادها وsupernatants في نقاط زمنية المشار إليها وكانوا مصممين التتر الفيروسية قبل الفحص باستخدام لوحة NIH أحادي الطبقة 3T3. (B) مرنا RTA γHV68 مستوى في الخلايا المصابة NIH3T3 γHV68 (MOI = 0.01). في 30 ساعة بعد الإصابة، تم استخراج الحمض النووي الريبي مجموع من الخلايا المصابة NIH γHV68 3T3 وتحليلها بواسطة PCR الكمي في الوقت الحقيقي.