تفاصيل هذا البروتوكول طريقة لقياس كمية كبيرة إزفاء الببتيد في الحويصلات unilamellar الدهون. هذا الأسلوب يوفر أيضا معلومات حول معدل إزفاء الغشاء ، ويمكن استخدامها لتحديد الببتيدات التي بكفاءة وبشكل عفوي عبر طبقات ثنائية الدهون.
مقالة منهجية
تفاصيل هذا البروتوكول طريقة لقياس كمية كبيرة إزفاء الببتيد في الحويصلات unilamellar الدهون. هذا الأسلوب يوفر أيضا معلومات حول معدل إزفاء الغشاء ، ويمكن استخدامها لتحديد الببتيدات التي بكفاءة وبشكل عفوي عبر طبقات ثنائية الدهون.
هناك اهتمام فعلي في الببتيدات التي عبر أغشية الخلايا بسهولة دون مساعدة من مستقبلات غشاء الخلية 1. ويشار إلى أن العديد من هذه الخلايا واختراق الببتيدات ، والتي كثيرا ما لاحظت لإمكاناتهم وناقلات تسليم المخدرات 1-3. وعلاوة على ذلك ، هناك اهتمام متزايد في الببتيدات المضادة للجراثيم التي تعمل عبر آليات غير غشاء lytic 4،5 ، ولا سيما تلك التي تعبر الأغشية الجرثومي دون أن تسبب تحلل الخلايا وتقتل الخلايا عن طريق التدخل في العمليات داخل الخلايا 6،7. في الواقع ، لقد أشار الكتاب على نحو متزايد إلى العلاقة بين الخلية الببتيدات المضادة للميكروبات واختراق 1،8. الفهم الراسخ لعملية إزفاء الغشاء ، والعلاقة بين هيكل الببتيد وقدرتها على نقل من مكان لآخر يتطلب فعالة ، لإزفاء المقايسات استنساخه. وقد اقترحت عدة مجموعات أساليب لقياس إزفاء في unilamel كبيرةحويصلات الدهنية لار (LUVs) 9-13. LUVs بمثابة نماذج مفيدة لأغشية الخلايا البكتيرية وحقيقية النواة ، وكثيرا ما تستخدم في الدراسات الفلورية الببتيد 14،15. هنا ، ونحن طلبنا من وصف الطريقة التي وضعت في بادئ ماتسوزاكي وزملاء العمل للنظر في الببتيدات المضادة للجراثيم ، مثل magainin buforin والثاني 16،17. بالإضافة إلى توفير بروتوكول لدينا لهذا الأسلوب ، فإننا نقدم أيضا مقاربة مباشرة لتحليل البيانات التي الكمي قدرة إزفاء باستخدام هذا الاختبار. مزايا هذا الاختبار إزفاء بالمقارنة مع الآخرين هي أنه لديه القدرة على تقديم معلومات حول معدل إزفاء غشاء ولا تتطلب إضافة تسمية فلوري ، الذي يمكن أن يغير خصائص الببتيد 18 ، لالتربتوفان التي تحتوي على الببتيدات. لفترة وجيزة ، يتم قياس قدرة إزفاء في الحويصلات الدهون بوصفها وظيفة من طاقة نقل الرنين فوستر (الحنق) بين الأم ومخلفات التربتوفان دansyl فسفاتيديل إيثانولامين عندما ترتبط مع بروتينات الغشاء الخارجي LUV (الشكل 1). والمشقوق اختراق الخلية والببتيدات التي يواجهونها التربسين يحتاطون مغلفة مع LUVs ، مما أدى إلى disassociation من غشاء LUV وانخفاضا في إشارة الحنق. انخفاض الحنق لاحظ إشارة الببتيد translocating أكبر بكثير من تلك التي لوحظت في نفس الببتيد عندما LUVs تحتوي على كل ومثبط التربسين التربسين ، أو عندما يتعرض الببتيد الذي لا يعبر بشكل عفوي الأغشية الدهنية المحتوية على التربسين LUVs. هذا التغيير في مضان يوفر الكمي المباشر لإزفاء الببتيد مع مرور الوقت.
1. اعداد كبيرة الحويصلات الدهن Unilamellar (LUVs)
2. قياس تركيز LUV
3. إعداد حلول الببتيد
4. إزفاء الكمي
5. توليد نسبة الكمية إزفاء
.
لعينات سيطرة
لنماذج تجريبية للحصول على تصحيح قيمة مضان النهائي. الشكل 2 يبين نتائج هذا الفحص عن ممثل الببتيد التي أظهرت إزفاء قوية. إشارة في هذه التجربة (أسود التتبع) يظهر انخفاضا ملحوظا في إشارة الحنق على مر الزمن. ومع ذلك ، فمن المهم للتحكم عن الخسارة المحتملة للإشارة الحنق بسبب تثبيط التربسين ناقصة أو عوامل أخرى لا علاقة لها القدرة إزفاء. تحقيقا لهذه الغاية ، ونحن دائما أيضا قياس إشارة الحنق بين الببتيد وتحتوي على كل LUVs التربسين وبومان ، Birk التربسين المانع (رمادي التتبع ، الشكل 2). في أيدينا ، فقد كان من المهم أن تؤدي هذه السيطرة على كل الببتيد في كل مرة يتم تشغيل التجربة. وهذا يسمح لنا لتصحيح بوضوح عن أية تغييرات في إشارة إلى أي نتيجة الاختلافات بين الاستعدادات حويصلة الدهون أو ضوضاء الصك ، والتي يمكن أن تكون كبيرة بالنسبة للإشارات ضعيفة نسبيا الفلورسنت احظ عادة في هذه التركيزات.
أهمية السيطرة بةومن ابرز riment باستخدام LUVs تحتوي التربسين المانع من البيانات الواردة في الشكل 3. في هذه الحالة ، فقد انخفض إشارة الببتيد كمية مماثلة لتلك التي في الشكل 2 في العينة التجريبية (تتبع السوداء). ومع ذلك ، فإن نموذج التحكم أكثر انخفاضا سريعا لهذا الببتيد ، لذلك إزفاء صافي أقل.
المادة 5 من بروتوكول يصف لنا طريقة واضحة لقياس إزفاء من هذه التجربة. نسب أعلى إزفاء تدل على الببتيدات التي نقل من مكان لآخر بكفاءة ، ونسبة إزفاء لالببتيد اختراق الخلية هو مبين في الشكل 2 هو 1.16 ، في حين أن الببتيدات ضعيفة translocating وقد نسب إزفاء أقرب إلى 1. في تجربتنا ، والخطأ المعياري لأداء ثلاث تجارب مستقلة مع الاستعدادات الحويصلة المختلفة في مجموعة من 0،01-0،06.

الشكل 1. التخطيطي لtranslocatايون مقايسة. LUV عينات تجريبية (A) هي مخدر مع البابا دانسيل الفلورسنت (القضبان السوداء) وتحتوي على مغلفة التربسين (المقص). يستخدم مثبط التربسين (دائرة حمراء) لكبح التربسين خارج LUVs. يتعرض لLUVs الببتيد (اللون الأرجواني). الببتيد بالتعاون مع LUV الأغشية تعطي إشارة الحنق (الأخضر) الذي يتناقص مع الببتيدات translocting قاء التربسين الداخلية غير مأهولة. يتم تغليف كل من التربسين ومثبط التربسين في السيطرة LUV عينات (B) لقياس الانخفاضات في إشارة الحنق لا علاقة لها إزفاء.

الشكل 2. بيانات تمثيلية للالببتيد اختراق الخلية. ممثل translocating pepide مضادات الميكروبات تظهر انخفاضا كبيرا في إشارة الحنق مقارنة سيطرتها.

شخصية3. بيانات تمثيلية تسليط الضوء على أهمية السيطرة. تثبيط غير كاملة الهضم زيتية من الببتيد غير translocating يؤدي إلى انخفاض في إشارة الحنق على مر الزمن في كل من التجريبية والسيطرة LUV الحلول. لأن الفرق بين المراقبة والتعقب تجريبية صغيرة نسبيا ، ويتميز هذا المسخ والببتيد translocating ضعيفة.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ويمكن استخدام بروتوكول المعروضة هنا لتقييم التغير النسبي في تركيز الببتيد داخل وخارج حويصلات الدهنية. وترتبط هذه التغييرات القدرة إزفاء. ويمكن استخدام هذا البروتوكول لتحديد الخلايا اختراق الببتيدات مع إمكانات وناقلات تسليم المخدرات. كما مصلحة في اختراق الخلية الببتيدات ينمو ، فإنه سيكون من المثير رؤية كيف يتم تطوير أساليب لقياس الحدث مباشرة إزفاء واستخدامها بطريقة كمية.
في مختبرنا وجدنا أنه يمكن تحسين اتساق مقايس...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
الإعلان عن أي تضارب في المصالح.
فإن الكتاب أود أن أشكر اليانور فليمينغ وتشن جيسيكا لإجراء مناقشات مفيدة. تم توفير التمويل من قبل المعهد الوطني للحساسية والأمراض المعدية (NIH - NIAID) جائزة R15AI079685 ومؤسسة البحوث كلية العلوم جائزة كوتريل. وقدمت دعما إضافيا من الطلاب من معهد هوارد هيوز الطبي وصندوق ستالي.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| اسم الكاشف | شركة | فهرس العدد | |
| 16:00 حتي 18:01 PG | الدهون أفانتي القطبية | 840457C | |
| 01:18 دانسيل PE | الدهون أفانتي القطبية | 810330C | |
| 16:00 حتي 18:01 PC | الدهون أفانتي القطبية | 850457C | |
| الخنزيري التربسين | سيغما | T - 0303 | |
| بومان ، Birk التربسين / المانع كيموتربسين | سيغما | T - 9777 | |
| مصغرة الطارد | الدهون أفانتي القطبية | 610000 | |
| موليبدات الأمونيوم (الفقرة) | Aesar ألفا | 10811 | |
| L - حمض الاسكوربيك | سيغما | A1417 | |
| بيروكسيد الهيدروجين ، حل 30 ٪ | مالينكرودت المواد الكيميائية | 5240-05 | |
| HEPES | سيغما | H - 3375 | |
| كلوريد الصوديوم | سيغما | S - 9625 | |
| EDTA | سيغما | E5134 | |
| ناه 2 ص 4 | سيغما | S - 0751 |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن