$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
وينبغي أن تكون على استعداد للكشف عن أجزاء الجهاز المستندة الجزيئية أولا لأن إعدادها وقتا أكثر من تجميع الجهاز الجزيئي. وبناء يعمل بشكل جيد مع 5 أبواب 6μm سميكة من قطع بارافورمالدهيد الثابتة ، وكتل البارافين جزءا لا يتجزأ من النسيج. استخدام العلامات التجارية الشريحة التي تحتفظ المقاطع أيضا ، مثل الشرائح ProbeOn زائد واتهم precleaned (فيشر العلمي) أو ما شابه ذلك. نوصي به لأول مرة في الأنسجة مع نمط معروف من الحمض النووي من التلف الذي يحتوي على كل الدناز I - II الدناز وفواصل من نوع ، مثل ديكساميثازون الفئران المعالجة أفكارك التوتة 13،14.
1. إعداد الأبواب
- وضع المقاطع في رف الشريحة وdewax في الزيلين لمدة 15 دقيقة ، ونقل إلى حمام الزيلين الطازجة لمدة 5 دقائق إضافية.
- ترطيب بعبورها تركيزات الإيثانول متدرج : 96 ٪ الايثانول 2x5min ؛ الايثانول 80 ٪ -- 5min ، والمياه -- 2x5 دقيقة.
- هضم المقطع مع Proteinasه ك استخدم 100μL حل 50μg/mL في القسم. احتضان 15 'في درجة حرارة الغرفة (23 درجة مئوية) في غرفة ترطيب. قد تحتاج إلى وقت للتكيف وفقا لنوع الأنسجة. قد تتطلب الأنسجة الصلبة تعد عملية الهضم. وعادة ما تستخدم أوقات 15-25 دقيقة. قد يؤدي إلى عدم كفاية الهضم الأضعف إشارة. Overdigestion على نتائج ناحية أخرى في اختفاء الإشارات وتعطل القسم.
- شطف في الماء المقطر ل2x10 دقيقة.
- تطبيق القسم 100 ميكروليتر في المائة من 2 ٪ لجيش صرب البوسنة preblocking. احتضان لمدة 15 دقيقة في درجة حرارة الغرفة (23 درجة مئوية). خلال هذا الوقت تجميع الجهاز الجزيئي.
2. آلات التجمع الجزيئي
يتم تحجيم كل الكواشف لحجم إجمالي 25 ميكرولتر ، وهو ما يكفي للكشف عن واحد في المقطع حجم الأنسجة المتوسط (10x10mm). ويمكن تحجيمها ورفع الصوت حسب الحاجة.
- تجمع في أنبوب بلاستيكي صغير في هذا النظام :
- Bidistilled المياه ؛
- 15 ٪ البولي ايثيلين جلايكول - 8000 ؛
- الحل من 66 ملم تريس حمض الهيدروكلوريك ، ودرجة الحموضة 7.5 ، 5 مم MgCl 2 ، 0.1 ملم dithioerythritol ، 1 ملم اعبي التنس المحترفين ، (أي الحمض النووي العادية يغاز T4 العازلة) ؛
- 70 pmoles من قليل النوكليوتيد 1 ،
- 215 pmoles (1،76-7،1 ميكروغرام) VACC TOPO
- 10 وحدات الحمض النووي يغاز T4 (500 U / مل)
|
- المزيج بلطف pipetting. الجزيئي بناء على الفور تقريبا الذاتي تجمع في هذا الحل ، ويمكن استخدامها على الفور في درجة حرارة الغرفة (23 درجة مئوية). زيادة درجة الحرارة إلى 37 درجة مئوية يمنع T4 يغاز الحمض النووي القائم على العناصر المكونة لوضع العلامات.
3. باستخدام الآلات الجزيئية في أقسام الأنسجة ل5'OH التسمية المزدوجة وفواصل الحمض النووي 5'PO4
- نضح الحل preblocking 25μL وتطبيق مزيج من التفاعل الكامل تحتوي على 70 من pmoles قليل النوكليوتيد 1 ، 53-215 pmoles (1،76-7،1 ميكروغرام) VACCTOPO وحدات الحمض النووي يغاز 10 T4 (500 U / مل) في محلول من حمض الهيدروكلوريك 66 ملم تريس ، ودرجة الحموضة 7.5 ، MgCl 5mM 2 ، 0.1 ملم dithioerythritol ، 1 ملم اعبي التنس المحترفين ، والبولي ايثيلين جلايكول 15 ٪ - 8000. وقليل النوكليوتيد نفس تسلسل تحمل تسمية واحدة FITC ، قليل النوكليوتيد 2 ، يمكن أن تستخدم بدلا من ذلك للكشف عن نوع واحد من فواصل الحمض النووي. في مثل هذه الحالة يغاز حذفت من ردود فعل التوسيم. أيضا في هذه الحالة يمكن إيجاد حل ل50mM تريس - HCL ، ودرجة الحموضة 7.4 ، يمكن استخدام 15 ٪ PEG - 8000 بدلا من الحمض النووي T4 يغاز العازلة.
- احتضان لمدة 1 ساعة على درجة حرارة الغرفة (23 درجة مئوية) في غرفة ترطيب مع ساترة البلاستيك. بعيدا عن الضوء. خفض درجة الحرارة إلى 16 درجة مئوية يقلل إشارة يغاز مقرها ، وارتفاع درجة الحرارة إلى 37 درجة مئوية يزيل تماما الإشارة يغاز مقرا لها. وتثبيط جزئي ليغاز يحدث أحيانا في مزيج التفاعل ، وربما بسبب الملوثات المقدمة مع الاستعدادات topoisomerase. لذا ، قد يكون مطلوبا حضانة أطول (2-4 ساعات) خصوصا عندما قأرقام ignificant من يغاز المسمى فواصل موجودة. على الرغم من أن يمكن ملاحظة كلا يغاز وإشارات توبو في هذه المرحلة ، في كثير من الحالات يمكن الإشارة يغاز يتعزز من خلال تطبيق إعادة المزيج من دون رد فعل TOPO VACC وصفت قليل النوكليوتيد المزدوجة ، ولكن يحتوي على قليل النوكليوتيد شكل دبوس (قليل النوكليوتيد 3) (35 ملغ / مل) و T4 يغاز الحمض النووي (250 U / مل). لتعزيز إشارة المضي قدما إلى الخطوة 3 ، لمعرفة رد الفعل من دون تعزيز انتقل إلى الخطوة 5.
- إزالة coverslips بغمر بلطف الشرائح عموديا في وعاء يحتوي على الماء Coplin في درجة حرارة الغرفة. نضح المياه الزائدة.
- تعزيز إشارة يغاز من خلال تطبيق 25 ميكرولتر من دون رد فعل مزيج TOPO VACC وقليل النوكليوتيد 1 ، ولكن تحتوي على قليل النوكليوتيد 3 : 66 ملم تريس حمض الهيدروكلوريك ، ودرجة الحموضة 7.5 ، 5 مم MgCl 2 ، 0.1 ملم dithioerythritol ، 1 ملم اعبي التنس المحترفين ، و- غليكول البولي ايثيلين بنسبة 15 ٪ 8000 ، 5 وحدات الحمض النووي يغاز T4 ، و 35 ملغ / مل قليل النوكليوتيد 3 (كليلة القاسي انتهى). الحجم الكلي للوسم حل كاليفورنيايمكن تحجيمها ن يصل إلى استيعاب أكبر أقسام. احتضان لمدة 18 ساعة (بين عشية وضحاها) في درجة حرارة الغرفة (23 درجة مئوية) في غرفة ترطيب مع ساترة البلاستيك.
- إزالة coverslips بغمر بلطف الشرائح عموديا في جرة Coplin تحتوي على الماء في درجة حرارة الغرفة. دقيقة ثم يغسل القسم 3x10 في الماء المقطر.
- التشطيف مع العازلة بيكربونات الصوديوم. محلول قلوي شطف يعزز FITC مضان ، وهي حساسة ويتم تخفيض درجة الحموضة أقل بكثير من درجة الحموضة 7.
- تغطية الجزء بمحلول antifading (Vectashield مع دابي) ، ساترة وتحليل الإشارات باستخدام المجهر الفلورسنت. سوف فواصل الحمض النووي المزدوج حبلا 5'OH يتألق مع الأخضر ، فواصل 5'PO 4 -- سوف يتألق باللون الأحمر (الشكل 2).
4. ممثل النتائج

الشكل 1. شبه آلة جزيئية اصطناعية يكشف نوعين منالحمض النووي من التلف في الموقع. الجهاز الفلورسنت الذاتي عندما تجمع VACC TOPO بربط القاسي مزدوجة - 32 - سورمير. يبدأ تشغيل الجهاز عن طريق تقسيم نفسها إلى وحدات للكشف عن يومين عبر topoisomerase صنع قطع في نهاية 3 'من تسلسل الاعتراف. هذه النتائج في عملية دورية حيث وحدة FITC المسمى يفصل باستمرار وreligates العودة إلى الوحدة ، رودامين المسمى. استمر ذلك حتى يتم كسر اجه الحمض النووي للكشف. عندما يكون هذا متقبل البديلة (DNA 5'OH نهاية حادة كسر) موجود في قسم الأنسجة ، فإن الجزء FITC ligate إليه. والجزء المتبقي رودامين نعلق على 5 'فواصل الحمض النووي ص 4 نهاية صريحة مع مساعدة من الحمض النووي يغاز T4. وبالتالي ، يتم الكشف في وقت واحد كلا النوعين من فواصل الحمض النووي.

الشكل 2. تسميات آلة الجزيئية المزدوجة نوعين من فواصل الحمض النوويفي مقطع من أنسجة الغدة الصعترية ديكساميثازون المعاملة. فواصل الحمض النووي كليلة العضوية للالدناز يتم الكشف عن الدناز I - II - واكتب في المناطق القشرية التوتة تمر موت الخلايا المبرمج. مضان هيولي خضراء (DNA 5'OH فواصل) علامات الضامة القشرية هضم المواد النووية من thymocytes أفكارك. ويتم إنتاج هذه الإشارة التي TOPO VACC ، ويموضع لphagolysosomes مع الحمض النووي يحتوي على 5'OH مزدوج الجديلة 11،12. مضان أحمر (4 5'PO فواصل) تسميات نوى thymocytes أفكارك لا اجتاحت بواسطة الضامة. أعداد هائلة من الخلايا في وقت واحد thymocytes الخضوع يرافقه جيل من 4 فواصل المزدوج حبلا 5'PO ، التي تصور يغاز المستندة إلى وضع العلامات. وتقع هذه الانقطاعات على هامش النووية ، وتشكيل عصابة على شكل أنماط. جميع النوى الخلوية هي التي تصور counterstaining مع دابي (الأزرق مضان).