1. إعداد متوسطة البلغم الاصطناعي (ASM)
- إضافة 4 غرام من الحمض النووي من الحيوانات المنوية السمك في الماء 250 مل العقيمة ببطء شديد على مدى عدة ساعات. الحمض النووي تستغرق عدة ساعات إلى حل تماما، ويمكن أن يحرك بين عشية وضحاها في درجة حرارة الغرفة.
- إضافة 5 الميوسين ز من معدة الخنزير (النوع الثاني) ببطء إلى 250 مل من الماء المعقم حتى الميوسين قد حلت تماما. يمكن أن يحرك حل بين عشية وضحاها في 4 درجات مئوية.
- حل 0،25 غرام من كل الأحماض الأمينية الأساسية L-وغير الضرورية، مع استثناء من التيروزين-L و L-السيستين، في 100 مل ماء معقم. حل 0،25 غرام من السيستين-L في 25 مل من هيدروكسيد البوتاسيوم 0.5 M (M ص ز / مول 56.11) و 0.25 غرام من التيروزين-L في ماء معقم 25 مل.
- حل 5،9 ملغ حامض diethylenetriaminepentaacetic (DTPA)، و 5 غ من كلوريد الصوديوم وز 2.2 من بوكل في 100 مل من الماء المعقم.
- الجمع بين الحمض النووي، والميوسين والأحماض الأمينية L-، DTPA، كلوريد الصوديوم وبوكل في زجاجة 1 لتر.
- أضف 5 مل من صفار البيض هmulsion والتعبئة إلى حوالي 850 مل مع الماء المعقم.
- ضبط درجة الحموضة إلى 6.9 مع تريس M 1 (درجة الحموضة 8.5؛ م ص 121.14)، وتحقيق وحدة التخزين إلى 1 ليتر مع الماء المعقم.
- تعقيم ASM عن طريق الترشيح باستخدام Vacuubrand لي 2 مضخة فراغ الحجاب الحاجز وحدات ميليبور Steritop فلتر مع حجم المسام والعنق من 0.22 ميكرون و 45 ملم على التوالي. ويمكن لكل وحدة تصفية Steritop إعادة استخدامها على الفور ما يصل إلى ثلاثة أضعاف، إلا أن المرشحات بحاجة الى تشطف مرتين مع الماء المعقم قبل إعادة استخدامها. عملية الترشيح بطيء ويمكن أن يؤديها أكثر من 2 أيام. وقد تم تطوير إصدارات أخرى من ASM التي تستخدم بالإضافة إلى ذلك من المضادات الحيوية بدلا من ترشيح 11 ولكن نظرا لتفاعلات العقاقير ممكن، ونحن لا ننصح هذا الأسلوب لتطبيق معين.
- يجب أن يتم تخزينها دون تدخل وتصفيتها ASM في 4 درجات مئوية في الظلام. استخدام ASM الطازجة ويوصى مع ذلك، يمكن الاحتفاظ به في ظل هذه الظروف لمدة أقصاها شهر واحد.
2. تحديد الحد الأدنى العوالق خلية مثبت مباشرة بالقاعدة تركيز المثبطة الأيض (PSMIC)
- لتحديد الحد الأدنى من تركيز المثبطة الأيض (PSMIC) القيم لمدة 15 P. نمت planktonically العزلات الزنجارية، ينبغي أن يقوم على طريقة microdilution، على النحو المبين في المبادئ التوجيهية للجمعية البريطانية لBSAC العلاج الكيماوي مضادات الميكروبات 12. المضادات الحيوية من خيار، في هذه الحالة كبريتات توبراميسين، يتم تخفيف متسلسل في لوريا، Bertani (LB) المتوسطة الحجم في لوحة 96-microtitre جيد لتقديم مجموعة مناسبة من تركيزات المضادات الحيوية.
- تمييع الثقافات بين عشية وضحاها من P. الزنجارية في LB إلى 600 من OD 0.05 (± 0.01) وإضافة 100 مجلدا ميكروليتر إلى آبار لوحة microtitre 96-جيد يحتوي على 100 ميكرولتر من المضادات الحيوية تضعف متسلسل. في هذه الحالة، وتراوحت التركيزات النهائية للكبريتات توبراميسين بين 512 حتي 0،5 ميكروغرام / مل. ثمانية مكررات من كل antibينبغي أن يقوم تركيز iotic.
- يجب تعيين آبار مراقبة سلبية على كل ما يصل عزل، حيث يتم إضافة أي مضاد حيوي. أيضا، يجب أن تحتوي على ثمانية آبار LB فقط لاستخدامها بوصفها فارغة خلال تحليل المصب (القسم 2.6).
- احتضان لوحات 96-microtitre جيدا لمدة 1 - 2 أيام في 37 درجة مئوية دون أن تهتز في ظل ظروف جوية أو microaerophilic (5٪ O 2، و 10٪ CO 2، و 85٪ N 2). ويتم الحصول على شروط Microaerophilic باستخدام حزم CampyGen توليد الغاز في الجرار اللاهوائية كبير.
- بعد الحضانة، ويتم تحديد نمو البكتيريا عن طريق قياس الامتصاصية للثقافة البكتيرية في كل بئر في الطول الموجي 600 نانومتر باستخدام أوميغا Fluostar microplate قارئ وتحليل بيانات برامج المريخ.
- ينبغي تصحيح امتصاص من ثقافات العوالق المضادات الحيوية المعالجة (مضاد حيوي خلايا العوالق المعالجة) والامتصاص من الضوابط سلبي (A سيطرة السلبية) التي طرحايون لامتصاص خلفية تم الحصول عليها من الآبار التي تحتوي على LB فقط (فارغ). ويحسب لاحقا إلى تثبيط النسبة المئوية للبقاء كما (يعني مضاد حيوي خلايا العوالق المعالجة / يعني سيطرة سلبية) 100٪ س. يتم تعريف PSMIC 90 وتركيز المضادات الحيوية تسبب تثبيط 90٪ من نمو العوالق البكتيرية.
- لتحديد الجدوى الجرثومية بعد العلاج مع المضادات الحيوية من خيار، و 10 ميكرولتر من 0.02٪ (V / V) يضاف ريسازورين (المخفف في الماء المقطر) إلى كل جيدا ويتم تحضين لوحات تحت الظروف الهوائية لمدة 1 - 2 في ساعة 37 درجة سي، في حين تهتز عند 150 دورة في الدقيقة. وخلايا قابلة للحياة تقلل من صبغة زرقاء ريسازورين إلى النموذج resorufin فلوري وردي.
- بعد حضانة مع ريسازورين، ورصد مضان من كل بئر باستخدام الطول الموجي الإثارة من 540 نيوتن متر، وطول موجة من الانبعاثات من 590 نانومتر في القارئ Fluostar microplate أوميغا. وينبغي تحليل البيانات كما هو موضح يكونمنخفض.
3. تقرير من تركيز بيوفيلم خلية مثبت مباشرة بالقاعدة المثبطة الدنيا (BSMIC)
- بين عشية وضحاها ثقافات P. يجب تخفيفه الزنجارية (في هذه الحالة، يتم استخدام 15 عزلات من الزنجارية P.) في LB إلى 600 من OD 0.05 (± 0.01)، ثم 1:100 المخفف في مزيد من ASM الطازجة (إجمالي حجم 1.8 مل).
- ينبغي أن يضاف الثقافات المخفف (1.8 مل) إلى كل بئر من لوحة زراعة الأنسجة 24-جيدا المعالجة. وينبغي أن تحتوي على ثلاثة آبار ASM فقط لاستخدامها بوصفها فارغة خلال تحليل المصب (القسم 3.9).
- تأمين 24 لوحات بشكل جيد مع parafilm المختبرات والحضانة لمدة 3 أيام في ظل ظروف جوية أو microaerophilic على 37 درجة مئوية، في حين تهتز في 75 دورة في الدقيقة. وينبغي الحصول على شروط Microaerophilic باستخدام CampyGen حزم توليد الغاز في الجرار اللاهوائية كبير.
- تمييع للمضادات الحيوية في الاختيار، في هذه الحالة كبريتات توبراميسين، لتوفير مجموعة وتركيز مناسب في الطازجASM. في هذه الحالة، وتراوحت تركيزات النهائي بين 512-1 ميكروغرام / مل. إضافة كل تركيز من المضادات الحيوية، في وحدات التخزين من 200 ميكرولتر، إلى الآبار الملائمة لوحات 24 أيضا. أربع مكررات لكل تركيز المضادات الحيوية يجب أن يؤديها. واستخدمت الأغشية الحيوية لم تتعرض للمضادات الحيوية من خيار كوسيلة لمراقبة سلبية.
- تأمين 24 لوحات بشكل جيد مع parafilm مختبر واحتضانها في ظل ظروف جوية أو microaerophilic عن 24 ساعة إضافية عند 37 درجة مئوية، في حين تهتز في 75 دورة في الدقيقة.
- بعد حضانة في وجود المضادات الحيوية في الاختيار، تعطيل الأغشية الحيوية البكتيرية باستخدام 100 ميكرولتر من 100 ملغ / مل سلولاز (المخفف في 0.05 العازلة سترات M [9.6 غرام / لتر Citrate.H 2 0 في الماء ودرجة الحموضة إلى 4.6 مع هيدروكسيد الصوديوم] )، واحتضان لوحات 24-جيدا في ظل ظروف جوية على 37 درجة مئوية، في حين تهتز عند 150 دورة في الدقيقة لمدة 1 ساعة. إذا لزم الأمر، يمكن أن الأغشية الحيوية عطلت المزيد من pipetting دليل في هذه المرحلة.
- لتحديد الأنشطة الأيضيةمن الخلايا البكتيرية التي صدرت من الأغشية الحيوية تعطلت، وينبغي أن 100 ميكرولتر من 0.02٪ (V / V) تضاف ريسازورين (المخفف في الماء المقطر) إلى كل بئر من لوحات 24 جيدا وحضنت لمدة 1 - 2 في ساعة 37 درجة مئوية ، في حين تهتز عند 150 دورة في الدقيقة.
- بعد حضانة مع ريسازورين، قياس مضان من كل بئر باستخدام الطول الموجي الإثارة من 540 نيوتن متر، وطول موجة من الانبعاثات من 590 نانومتر في القارئ Fluostar microplate أوميغا وتحليل بيانات برامج المريخ.
- ينبغي تصحيح مضان من الأغشية الحيوية المضادات الحيوية المعالجة (F المعالجة بالمضادات الحيوية الأغشية الحيوية)، ومضان من الضوابط السلبية (F سيطرة سلبية) من قبل الطرح للمضان الخلفية التي تم الحصول عليها من الآبار التي تحتوي على ASM فقط (F فارغة). ويحسب لاحقا إلى تثبيط النسبة المئوية للبقاء كما (يعني من الأغشية الحيوية المضادات الحيوية تعالج F / F يعني سيطرة سلبية) 100٪ س. وتعرف ال 90 BSMIC كما antibioعرة تركيز مما تسبب تثبيط 90٪ من النشاط الأيضي.
4. ممثل النتائج
ASM تشكيل بيوفيلم هو ممكن في مجلدات (2 مل) صغيرة ويتم تشكيلها بشكل كامل الأغشية الحيوية في غضون 3 أيام (الشكل 1A). يمكن البرهنة عن طريق pipetting بدقة بيوفيلم، الذي ينبغي أن يكون من الصعب تعطيل. وmicrocolonies هي مماثلة لتلك التي تزرع في كميات أكبر 4 (الشكل 1B). ويبين الشكل 2 اختلافات كبيرة بين الخلايا المزروعة وplanktonically في بيوفيلم كما الكشف عنها بواسطة الإلكترون تحليل الصور المجهرية. الثقافات بيوفيلم تبين بوضوح مستويات كبيرة من المصفوفة خارج الخلية المحيطة الخلايا والهياكل الفردية داخل بيوفيلم يصعب التعرف عليها.
العديد من الدراسات تشير إلى أن نمط الحياة يمكن أن تؤثر على قابلية بيوفيلم مضادات الميكروبات 13 و 14. ويمكن استخدام بلدنا الصغير فحص ASM النطاق لdetermine في BSMIC من المضادات الحيوية متعددة للعزلة متعددة في نفس الوقت. ويرد على سير العمل في الفحص في الشكل 3. ويمكن قياس تأثير المضادات الحيوية على بقاء الخلية البكتيرية باستخدام مقايسة ريسازورين. المضادات الحيوية، في هذه الحالة يمكن توبراميسين، يمكن ان تضاف الى بيوفيلم المنشأة وحضنت لمدة 24 ساعة. بعد أن يتم تعطيل هذا بيوفيلم ويضاف ريسازورين.
يمكن للخلايا نشطة أيضي لحد من صبغ ريسازورين مما أدى إلى تغير لونها من اللون الأزرق (ريسازورين) إلى وردي (resorufin) 15. الشكل 4A يظهر فحص سبيل المثال، في الذي P. وقد حضنت الزنجارية مع تركيزات مختلفة من توبراميسين قبل انقطاع بيوفيلم وإضافة ريسازورين في لوحة microtitre. الأزرق غير فلوري اللون يشير إلى غير قابل للحياة الخلايا، في حين أن خلايا قابلة للحياة تقلل من الصبغة على شكل فلوري وردي، resorufin. ويمكن بعد ذلك SMIC تحسب عن طريق تحويل النسبة المئوية إلى مضانالباقية بقاء البكتيرية. الشكل 4B يظهر التغيير في جدوى٪ مع تركيز توبراميسين متزايد. وقد تم اختيار البقاء بنسبة 10٪ كما وقف انتاج المواد الانشطارية لحساب ال 90 SMIC.
في ظل ظروف جوية، وSMIC توبراميسين 90 قيم أعلى للخلايا نمت باعتبارها بيوفيلم من تلك الثقافات من العوالق. ويبين الجدول 1 اختلاف في PSMIC 90 و BSMIC 90 لجميع العزلات المختبرة. ويبين الجدول 2 أنه في ظل الظروف الهوائية، لوحظ وجود زيادة كبيرة في مقاومة توبراميسين (2 إلى زيادة 32> أضعاف في SMIC) بالنسبة لمعظم العزلات عندما نمت في ASM (بيوفيلم واسطة) مقارنة LB (الوضع العوالق). وبالإضافة إلى ذلك، عرضت الأغشية الحيوية نما في ظل ظروف microaerophilic 1 SMIC زيادة تتراوح بين 2 و> 128 أضعاف بالمقارنة مع الأغشية الحيوية نما في ظل ظروف جوية.

الرقم1. تشكيل بيوفيلم من الزائفة الزنجارية في P. ASM سلالة الزنجارية PAO1 تشكل كتلا مرئية ظاهريا (microcolonies) عندما تزرع في ASM. وتشكيل بيوفيلم، في الثقافات ASM 30 مل (على نطاق واسع) بعد نمو 7 ايام في زجاج المسمار قبعة دوران B. القوارير، تشكيل بيوفيلم في الثقافات 2 مل ASM ( على نطاق صغير) بعد نمو 3 أيام في لوحات البوليسترين 24 أيضا.

الشكل 2. الميكروسكوب تيم من الأغشية الحيوية ASM A / C تيم مجهرية (خ. 27000) من PAO1 نمت وplanktonically في ASM، على التوالي، B / D تيم مجهرية (x57، 000) من العوالق وPAO1grown في ASM على التوالي،. تم الانتهاء من زراعة البكتيريا نما Planktonically بين عشية وضحاها في مرق LB. تم الانتهاء من زراعة الأغشية الحيوية لمدة 7 أيام في الثقافات ASM 30 مل. السهام السوداء تشير إلى خلايا داخل بيوفيلم والنجوم تشير إلى مساحات خارج الخلية. الحانات نطاق = 1ميكرون.

الشكل 3. سير العمل لفحص بيوفيلم حساسية الميكروبات ASM.

الشكل 4. استخدام ريسازورين لتحديد قابلية للمضادات الحيوية وحضنت الخلايا البكتيرية مع تركيزات مختلفة من المضادات الحيوية وكان مصمما على النشاط الأيضي المتبقية باستخدام ريسازورين ألف، واللون الأزرق غير فلوري شكل المؤكسد من ريسازورين يشير إلى غير قابل للحياة الخلايا ويتم تخفيض بواسطة التمثيل الغذائي خلايا نشطة لوردي فلوري B. resorufin، يتم تحويل كثافة الإسفار في النسبة المئوية للبقاء البكتيريا المتبقية. وقد تم اختيار البقاء بنسبة 10٪ كما وقف انتاج المواد الانشطارية من أجل حساب MSMIC90. انقر هنا لعرض لارGER شخصية.
| سلالات | PSMIC 90 (ميكروغرام / مل) 1 | BSMIC 90 (ميكروغرام / مل) 1 |
| الهوائية | Microaerophilic 2 | الهوائية | Microaerophilic 2 |
| PAO1 | 4 | 4 | 8 | > 512 |
| ليفربول وباء سلالة (ليه) يعزل |
| LESB58 21 | 8 | 64 | 64 | 128 |
| LES400 22 | 32 | 128 | 8 | 256 |
| LESB25 | 16 | 32 | 256 | 512 |
| LESB55 | 16 | 64 | 64 | > 512 |
| LESB64 | 16 | 64 | > 512 | > 512 |
| LES431 22 | 4 | 8 | 32 | > 512 |
| LESB49 | 16 | 64 | 64 | 256 |
| LES109 | 32 | 128 | 32 | > 512 |
| غير ليه عزلات |
| 49461 | 16 | 32 | 16 | > 512 |
| 59032 | 0.5 | 2 | 4 | > 512 |
| 59073 | > 512 | > 512 | > 512 | > 512 |
| 59076 | 16 | 32 | 32 | > 512 |
| 27 | 8 | 16 | 4 | > 512 |
| 45 | 16 | 32 | 4 | > 512 |
الجدول رقم 1. قابلية الزائفة الزنجارية إلى توبراميسين.
وقد استخدم (1) لتحديد PSMICs وتوبراميسين BSMICs في 2 أضعاف التخفيفات المسلسل
تتراوح بين 512 حتي 0،5 ميكروغرام / مل (ن = 8 لكل تركيز) و 512-1 ميكروغرام / مل (ن = 4 لكل
تركيز)، على التوالي؛؛ تم تحديد PSMICs باستخدام معيار
طريقة microdilution 1.
وكانت الظروف Microaerophilic 2 5 O 2٪، 10٪ CO 2، و 85٪ N 2.
| توتر | PSMIC 90/90 BSMIC التغيير أضعاف 1 |
PSMIC الهوائية → PSMIC microaerophilic | BSMIC الهوائية → BSMIC microaerophilic | PSMIC الهوائية → BSMIC الهوائية | PSMIC microaerophilic → BSMIC microaerophilic |
| PAO1 | 0 | > 64 | 2 | 128 |
| ليه يعزل |
| LESB58 | 8 | 2 | 8 | 2 |
| LES400 | 4 | 32 | 0.25 | 2 |
| LESB25 | 2 | 2 | 16 | 16 |
| LESB55 | 4 | > 8 | 4 | > 8 |
| LESB64 | 4 | ND | > 32 | > 8 |
| LES431 | 2 | > 16 | 8 | > 64 |
| LESB49 | 4 | 4 | 4 | 4 |
| LES109 | 4 | 16 | 0 | > 4 |
| غير ليه عزلات |
| 49461 | 2 | > 32 | 0 | > 16 |
| 59032 | 4 | > 128 | 8 | > 256 |
| 59073 | ND | ND | ND | ND |
| 59076 | 2 | > 16 | 2 | > 16 |
| 27 | 2 | > 128 | 0.5 | > 32 |
| 45 | 2 | > 128 | 0.25 | > 16 |
الجدول 2. التغيير حظيرة PSMICs وBSMICs إلى توبراميسين.
1 ND، لم تحدد، والقيم في جريئة توضح التغييرات أضعاف SMIC> 10.