
رسوم بيانية لمحة عامة: تقليد الطبيعة من عملية الغزل
تقليد الطبيعة من المسار العنكبوت إنتاج الحرير الطبيعي:. الطريق لتصنيع حرير صناعي هذه الصورة تبين غدة أمبولي الشكل الرئيسي من ويفر فلك الذهبي، clavipes Nephila، ومكونات تستخدم لانتاج الحرير الطبيعي (نص أبيض). منطقة الذيل يجمع كميات كبيرة من بروتينات الحرير التي يتم نقلها إلى أمبولة، وهي منطقة تخزين للمنشطات الغزل. هذا مخدر المركزة هو مقذوف من خلال القناة الغزل حيث حل يواجه التبادل الأيوني والجفاف قبل قذف الألياف. يشار إلى أن عمليات بيوميمتيك المستخدمة في مختبرنا من قبل نص أحمر. يتم توليد المؤتلف إنتاج الحرير باستخدام بكتيريا معدلة وراثيا، تليها تنقية البروتين باستخدام اللوني. المقبل، والبروتين النقي هو دونject إلى lyophilization للتركيز للمادة. وأخيرا، هو البروتين إعادة حله في HFIP ومقذوف من إبرة الحقنة في حمام الأيزوبروبانول.
1. البلازميد البناء والبكتيرية تحضير خلية ثقافة
- أداء PCR باستخدام حرير العنكبوت المطلوب مجموعات التمهيدي [كدنا] ومحددة. هلام استخراج وligate [كدنا] تضخيم الى ناقلات التعبير بروكاريوتيك ThioFusion pBAD / TOPO على سبيل المثال (الشكل 1A). هذا المتجه لديه بطاقة thioredoxin N-محطة لتسهيل الحرير الإذابة بروتين و6X C-محطة له، شعارا لتنقية البروتين. تحويل المنتجات إلى ربط E. المختصة كولاي الخلايا.
- حدد المستعمرات التي تحتوي على ناقلات الاستنساخ المؤتلف واستخدام واحد مستعمرة لتطعيم 200 مل من LB معقم تستكمل مع الأمبيسيلين (الشكل 1B). تنمو هذه الثقافة بين عشية وضحاها إلى التشبع عن طريق هز بسرعة 200 دورة في الدقيقة في حاضنة في المدار 37 درجة مئوية.
- الجمع بين 200 مل من saturatإد ثقافة مع 800 مل من ثقافة LB الطازجة. حث العنكبوت التعبير بروتين الحرير لمدة 4 ساعات وذلك بإضافة أرابينوز 0.2٪ (W / V). تأكد للحفاظ على ثقافة تحت اختيار المضادات الحيوية.
- بيليه الخلايا في 16000 XG لمدة 10 دقائق في 4 درجات مئوية (الشكل 1C). عن البساطة، وبيليه وحدة التخزين بالكامل في حاوية واحدة. قد خطوات الطرد المركزي متعددة يكون من الضروري تبعا لقدرة حجم أنابيب الطرد المركزي. إذا لزم الأمر، صب حجم السائل بعد الغزل وإعادة بيليه مواد إضافية لضمان الخلية بأكملها بيليه هو في حاوية واحدة. ويمكن تخزين كريات خلية في -80 درجة مئوية لحين الحاجة إليها.
- قبل التخلص منها وسائل الإعلام ثقافة المستهلك، إضافة مبيض أو الأوتوكلاف لتعقيم.
2. انحلال الخلايا
- إضافة 20 مل من عازلة تحلل 1X إلى بيليه 1 خلية L (الشكل 2A). تأكد من resuspend وبيليه الخلية تماما.
- أضف الليزوزيم إلى التركيز من 1 ملغ / مل لمواصلة تعزيزانحلال الخلايا. ويمكن أيضا أن يضاف الدناز في هذه الخطوة لهضم الحمض النووي الصبغي للمساعدة في خفض اللزوجة من الحل. وضع عينة على شاكر المدارية وصخرة بلطف لمدة 20 دقيقة.
- يصوتن الحل في الحد الأقصى لمدة 1 دقيقة.
- لتوضيح الحل، وأجهزة الطرد المركزي في 16000 XG لمدة 10 دقائق في 4 درجات مئوية (الشكل 2B).
3. تنقية البروتين: ني NTA الانجذاب كروماتوغرافيا العمود
- إزالة طاف وتحويلها إلى بيئة نظيفة 25 عمود اللوني مل. تأكد من أن طاف هو غير لزجة واضحة. إذا الحل هو لزج وغائم، إضافة المزيد من الدناز أو يصوتن و / أو إعادة بيليه طاف (كرر الخطوات 2،3-2،4).
- إضافة 1 مل من ني NTA الطين (0.5 مل الخرز) في العمود. تأمين غطاء محكم ومحبس، ووضع بعد ذلك على الكرسي الهزاز لتتوازن لمدة 1 ساعة للسماح ملزم لل6X له، علامة على حبات ني NTA (الشكل 3A).
- تعيين عمود قائم علىالوقوف والسماح للالخرز ني NTA لتسوية لحوالي 2 دقيقة. يمكن رؤية طبقة الضوء الأزرق في أسفل عندما يتم تسويتها تماما الخرز.
- إزالة الغطاء، والسماح للحل لتتدفق من خلال محبس. جمع هذا الحل لمزيد من التحليل (الشكل 3B).
- إضافة 20 مل من عازلة غسيل 1X والسماح حبات لتسوية. فتح محبس والسماح بالتدفق من خلال حل. جمع هذا الحل في aliquots مل 4 (5) لمزيد من التحليل ملاحظة: يمكن استخدام وحدات التخزين غسيل إضافية للحد من تلوث البروتينات، ولكن هناك احتمال وجود انخفاض في العائد النهائي من البروتين.
- إضافة 20 مل من عازلة شطف 1X والسماح للراتنج لتسوية. فتح محبس والسماح بالتدفق من خلال حل. جمع هذا الحل في aliquots 5 4 مل لمزيد من التحليل. ملاحظة: يمكن جمع كميات إضافية من شطف الراتنج ني NTA إذا لم يتم الانتهاء من شطف.
- قد يتم تخزين العينات في 4درجة مئوية أو -80 درجة مئوية للتخزين على المدى القصير أو الطويل، على التوالي.
- الحجم يجزئ العينات باستخدام SDS-PAGE تحليل. تصور البروتينات مع الفضة أو Coomassie بريليانت الأزرق R-250 (الشكل 3C). وينبغي أن تستخدم الكسور فقط نقي للخطوات التالية ملاحظة: يمكن استخدام تحليل اللطخة الغربية لتأكيد هوية من البروتين النقي.
4. غسيل الكلى وLyophilization
- Dialyze العينات ضد ما لا يقل عن 100X حجم العينة (استخدام الماء منزوع الأيونات) لمدة 2 ايام. تغيير محلول كل 6 ساعات لازالة جميع الأملاح ملاحظة: حجم الوزن الجزيئي قطع من أنابيب غسيل الكلى يعتمد على حجم بروتين الحرير المؤتلف.
- وزن 6 1،5 مل microfuge أنابيب فارغة وتسجيل كتلها. قد يكون من المفيد لثقوب ثقب صغير أو الشقوق في مباراة دولية من الأنابيب قبل وزنها عن تجميد تجفيف لتسهيل lyophilization (الشكل 4A).
- AFثالثا غسيل الكلى، ونقل 1 مل من العينة مدال في كل من ال 6 السابقة للوزن أنابيب microfuge (الشكل 4B). فلاش تجميد باستخدام النيتروجين السائل وتجفيف العينات لأسفل باستخدام مجفف تجميد (الشكل 4C).
- جفاف مرة واحدة، ونقل آخر 1 مل من العينة لغسيل الكلى في كل من أنابيب 6. كرر حتى يتم تجفيفها على عينة غسيل كامل لأسفل في أنابيب microfuge.
- ويمكن تخزين عينات تجميد المجفف في -80 درجة مئوية للتخزين على المدى الطويل.
5. الغزل تحضير المخدر
- وزن كل واحد من أنابيب microfuge التي تحتوي على مسحوق البروتين المجفف. طرح الكتلة الأولية للأنابيب فارغة للحصول على مجموع كتلة بروتين جاف ملاحظة: اعتمادا على محصول البروتين، قد تحتاج لتنقية مواد إضافية لعملية الغزل.
- حساب حجم Hexafluoroisopropanol (HFIP) لإضافة إلى كل أنبوب للحصول على 200 ملغ / مل إلى 500 ملغ / مل، أو 20٪ إلى 50٪ في حجم الوزن. إضافة اعتماداتأكلت كمية من HFIP في كل أنبوب (الشكل 4D) ملاحظة:. HFIP متقلبة جدا وسامة، ماصة بعناية وغطاء الأنبوب في أسرع وقت ممكن. وينبغي التعامل مع HFIP تحت غطاء سلامة.
- Parafilm الأنابيب ومكان على الكرسي الهزاز إلى ذوبان البروتين. دوامة والطرد المركزي من حين لآخر لتسهيل الإذابة. وهذا قد يستغرق ما يصل الى 2 يوما.
6. تحضير حقنة وجهاز الإعداد
- تحميل لا يقل عن 25 ميكرولتر من مخدر الغزل solubilized إلى الحقنة. تأكد من عدم وجود المجاميع تقديم لأنها قد تسد حقنة ملاحظة: هذا النموذج هو لزج بشكل لا يصدق، حتى تأخذ الرعاية عندما pipetting.
- دفع مخدر إلى الجزء الأمامي من حقنة عموديا، وإزالة جميع فقاعات الهواء (الشكل 5A) ملاحظة:. فقاعات الهواء خلق تناقضات في الألياف.
- قفل المحقنة إلى المضخة. رفع كوب 400 مل مملوءة حتى الأيزوبروبانول 95٪ لذلك غيض من حقنةوكسر للتو على سطح الكحول (الشكل 5B).
- تعيين مضخة محقنة إلى 15 ميكروليتر / دقيقة، وبدء تشغيل البرنامج. السماح للألياف ونسج على الجلوس في الأيزوبروبانول لمدة 20 دقيقة لكي تتوازن تماما ملاحظة: لا تزال هذه الألياف يتم استخدامها من قبل MS / MS تحليل للتأكد من هوية من البروتينات في الألياف.
7. بعد زيادة ونقصان رسم وجمع العينات
- تنطبق على الوجهين الشريط لكلا الجانبين من مشط على الجهاز التخزين المؤقت. تم إنشاء جهاز التخزين المؤقت من الأمشاط المعدنية الإلتصاق إلى الفرجار الرقمية (الشكل 6A). نعلق جهاز التخزين المؤقت لمحرك (الشكل 6B). نوصي التخزين المؤقت على المواضيع في 2 دورة في الدقيقة. ملاحظة: أسرع نتيجة التخزين المؤقت في معدلات كميات كبيرة من التباين في جودة الألياف والتكاثر.
- باستخدام ملقط انتزاع بلطف واحدة من نهاية الألياف وسحب ببطء للخروج من الأيزوبروبانول، إرفاقها إلى حافة واحدة من الأسلحة مشط على بكرة (التين. 6C). وينبغي القيام بالخطوات القليلة المقبلة من دون توقف لمنع الألياف من الجفاف.
- تشغيل المحرك وتوجيه بلطف والألياف على مذكرة جهاز التخزين المؤقت: خلال التخزين المؤقت، لا تسمح للألياف لمضاعفة وكومة فوق بعضها البعض.
- بمجرد أن يتم لف الألياف كامل، فصل بكرة من المحرك وتطبيق الغراء على حافة كل من الألياف الحريرية على الشريط مزدوجة من جانب (الشكل 6D). هذا تسمر على حرير العنكبوت على جهاز ملاحظة: من خلال تطبيق الغراء على الشريط على الوجهين قبل بعد زيادة ونقصان الرسم، يمنع الليف كامل من الانزلاق، ويسمح للانتقائية التي تمتد من القطع الداخلية من ألياف داخل الفرجار الأسلحة.
- نعلق بكرة على خطي المحرك (الشكل 7A). تسجيل طول الأولية للألياف باستخدام الفرجار لاحظ أن هذا هو طول الداخلية من الألياف، بل لا يشمل طول لاصق وملفوفة ARound التخزين المؤقت.
- خفض التخزين المؤقت إلى حمام الأيزوبروبانول 75٪. السماح للألياف لكي تتوازن لمدة 10 دقائق ملاحظة: يمكن استخدام حلول أخرى التجفيف لعملية الغزل، مثل كبريتات والميثانول، والأسيتون والأمونيوم.
- تعيين سرعة المحرك الخطي إلى 1.5 مم / ثانية. بناء على طول الأولي، حساب طول النهائية لنسبة التعادل المطلوب في مرحلة ما بعد زيادة ونقصان. يمكن التحكم في كمية امتدت استنادا إلى سرعة أو طول، اعتمادا على اقامة. على سبيل المثال، مع وجود طول الأولي 15 ملم، والمطلوب نسبة التعادل بعد دوران 3X، يجب أن يكون الطول النهائي 45 مم. ويمكن أيضا أن تحسب هذه والمحرك لخطي المحرك لمدة 20 ثانية وبمعدل 1.5 مم / ثانية.
- مرة واحدة تدور آخر المرجوة التعادل كاملة، ورفع ببطء التخزين المؤقت للخروج من الأيزوبروبانول. السماح لقطرات من الأيزوبروبانول لتجف لمدة 1 دقيقة، ثم جمع عينات (الشكل 7B). يجب أن يتم تنظيمها على عينات من إطارات البطاقات أو احباط لاختبار بوريطرح.
- إذا ما المطلوب مزيد من نسب التعادل آخر تدور، وانخفاض مرة أخرى إلى التخزين المؤقت للحمام الأيزوبروبانول 75٪. السماح للألياف لكي تتوازن لمدة 10 دقائق، ثم انتقل إلى نسبة المشاركة اللاحقة تعادل زيادة ونقصان.
8. اختبار الشد
- تسمح العينات التي تم جمعها لتتوازن في بيئة معملية مستوى لا يقل عن 1 ساعة قبل الاختبار الميكانيكي. وينبغي تسجيل نسبة الرطوبة ودرجة الحرارة لأنها قد تؤثر على خصائص الألياف والميكانيكية. وينبغي أن الرطوبة والشروط القياسية درجة الحرارة تكون حوالي 40٪ و 25 درجة مئوية، على التوالي.
- الغراء على حواف البطاقات أو احباط لتأمين الألياف على الإطار. يحيط علما حجم افتتاح الإطار. هذا هو طول الأولية للألياف الخاص التي تم اختبارها. ويرد إطار افتتاح 1 بوصة (25.4 ملم) هنا (الشكل 8A).
- باستخدام مجهر الضوء مع التكبير 100X أو أكثر، وأخذ قياسات القطر على طول محور الألياف الطولية.وينبغي تسجيل ما لا يقل عن 3 القياسات. كلما ارتفع التكبير المستخدمة وأكثر القياسات التي اتخذت، كان ذلك أفضل للدقة.
- تأمين إطار لتحميل إطار مقياس التوتر الميكانيكية (8B الشكل). خفض الإطار على الجانبين وبالتالي فإن التوتر يعمل إلا من خلال الألياف. الفارغة على مقياس التوتر وجمع البيانات. ينصح معدل سلالة معيار من 2٪ في الثانية الواحدة.
- باستخدام البيانات التي تم جمعها وقطر متوسط، يمكن منحنى إجهاد المرسومة.
- ويمكن الآن لكسر الألياف يمكن تركيبه على المجهر الإلكتروني الماسح (SEM) كعب للتحاليل والقياسات المورفولوجية انقطاع القطر نقطة. ويمكن استخدام جزء من الألياف بعيدا عن نقطة فاصل لتقدير والتحقق من قطر الأولي تقاس ضوء المجهر.
9. ممثل النتائج
من الخطوة 3، ينبغي تحليل للأجزاء المختلفة من قبل SDS-PAGE وتحليل البروتينات تصور مع الفضةأو Coomassie بريليانت الأزرق R-250. من الشروط القياسية عمود ني NTA، يمكن الحصول على الكسور شطف مع الطهارة> 90٪ (الشكل 9). يمكن أن تكون صغيرة من البروتينات تلويث أبعد من غسيل الكلى واسعة النطاق. باستخدام 25 ميكرولتر من الغزل منشطات في 20٪ (W / V)، يمكن جمع ما لا يقل عن 30 عينات من الألياف منفصلة عن الألياف الجرح المستمر على بكرة (يفترض وجود طول الأولي 13 ملم المستخدمة و). ويمكن تحليل الخصائص الميكانيكية عن طريق اختبارات مقياس التوتر (شكل 10). اعتمادا على بروتين الحرير المؤتلف المستخدمة في عملية الغزل، وسوف تدور نسب آخر تعادل الحد الأقصى يجب أن يتم تحديد تجريبيا. بشكل عام، إضافة تدور رسم نسب 4.0x لا يمكن أن يتحقق من دون فشل الألياف (الشكل 10). ألياف شباك، قبل أو بعد تعادله زيادة ونقصان آخر، يمكن تحليل مع المجهر الإلكتروني الماسح لتصور التركيب الدقيق (الشكل رقم 11A، B). ويمكن أيضا الألياف شباك لإجراء اختبارات ميكانيكية، وعرض النتائجمع أن التباين المنخفض في فخ التعادل تدور مجموعة آخر عينة نسبة (الشكل 10).

الشكل 1. التعبير من حرير العنكبوت [كدنا] في البكتيريا. أ) يتم تحويل TOPO / ثيو pBAD ناقلات تحتوي على حرير العنكبوت [كدنا] من الاهتمام إلى هاء المختصة كولاي الخلايا. ب) يتم تلقيح مستعمرة واحدة في 200 مل من LB ونمت من التشبع بين عشية وضحاها. بعد التلقيح، ويضاف 800 مل من LB الطازجة والتي يسببها للثقافة للتعبير باستخدام أرابينوز. C) في ختام الاستقراء، والثقافة هي مكعبات بواسطة الطرد المركزي. انقر هنا لعرض أكبر شخصية .

الشكل 2. تحلل من الخلايا البكتيرية بعد حرير العنكبوت الاستقراء بروتين. أ) عشرون milliliيضاف النسب من عازلة تحلل 1X والدناز إلى بيليه الخلية وضعت على شاكر المدارية وsonicated إلى ليز الخلايا. B) ونسج والمحللة خلية في جهاز للطرد المركزي لمسح طاف من الحطام الخلوية، ويتم جمعها وطاف. انقر هنا لعرض أكبر شخصية .

الشكل 3. تنقية البروتينات حرير العنكبوت المؤتلف باستخدام التقارب اللوني. أ) يتم إضافة خلية المحللة طاف والخرز ني NTA إلى عمود اللوني وحضنت لمدة 1 ساعة. B) بعد أن يتم جمع flowthrough، وتستخدم 20 مل من عازلة غسيل و 20 مل من شطف العازلة في تسلسل وجمعت في 5 مل من الكسور. C) ويتم تحليل كسور مختلفة بواسطة SDS-PAGE، ويتم نقل العينات التي تحتوي على بروتين نقي هدف إلى كيس غسيل الكلى ومدال ضد الماء إلى DIالانتهاء. انقر هنا لعرض أكبر شخصية .

الشكل 4. إعداد حرير العنكبوت لتنقية البروتين الغزل الرطب. أ) يتم نقل المنتجات إلى مدال أنابيب الطرد المركزي قبل وزنه في aliquots 1 مل. B) وميض وaliquots 1 مل المجمدة مع النيتروجين السائل. ج) مجفف بالتجميد العينات المجمدة ويتم إضافة المزيد من عينة لغسيل الكلى. D) ويتم حساب كتلة المجفف ويضاف HFIP إلى مسحوق جاف لإنتاج مخدر 20٪ (W / V) الغزل. انقر هنا لعرض أكبر شخصية .

الشكل 5. التحميل من مخدر الغزل في محقنة زجاجية للالغزل الرطب. أ) على الرغم من اجراء syrinجنرال الكتريك عموديا، يتم الضغط على مخدر الغزل إلى أعلى العمود حقنة، وإزالة فقاعات الهواء. ب) ويرد المحاقن تحميلها إلى المضخة المحاقن وإنزالها في حمام من الأيزوبروبانول 95٪ لذلك الطرف هو كسر للتو على سطح الحمام.

الشكل (6). تغليف من ألياف تركيبية حرير العنكبوت على جهاز مخصص تترنح. أ) يتم إنشاء جهاز التخزين المؤقت من الفرجار الرقمية مع الأمشاط المعدنية المرفقة. يتم تطبيق الشريط مزدوجة من جانب لكلا الجانبين من مشط لنعلق نهايات الألياف. ب) ويرد التخزين المؤقت إلى محرك سرعة بطيئة باستخدام مشبك التمساح. ج) يتم سحبها ببطء والالياف من حمام الكحول وجرح حوالي التخزين المؤقت. D) يتم تطبيق الغراء على حافة كل قطعة من الألياف لعقد لهم في المكان. أظهرت نوعان من الألياف مختلف نسج من البروتينات المختلفة.
الشكل 7. في مرحلة ما بعد زيادة ونقصان رسم من الألياف الاصطناعية باستخدام جهاز محلية الصنع. A) ويرد جهاز التخزين المؤقت إلى الإعداد المحرك الخطي باستخدام مقاطع التمساح. ب) بعد التعادل خطوة آخر زيادة ونقصان، ورفع بكرة من الحمام. ويسمح قطرات الأيزوبروبانول لتتبخر قبل مجموعة من الألياف.

الرقم 8. تركيب ألياف حرير صناعي في الصعود إلى البطاقات للدراسات الميكانيكية. A) هي التي شنت الألياف التي يتم جمعها على إطارات البطاقات مع 1 انقطاع "س 1". وتعقد في البداية الألياف في مكان مع الشريط مزدوجة من جانب، وثابتة ثم مع الغراء. ب) تم إصلاح الإطار البطاقات في الصعود إلى مقياس التوتر. ثم يتم قطع الاطراف وبالتالي فإن التوتر يعمل فقط على الرغم من أن الألياف.

الشكل 9. الحجم تجزئة من تنقية البروتينات المؤتلف MaSp1ن الكسور باستخدام SDS-PAGE تحليل تليها التصور مع تلطيخ الفضة. ويصور سلم بروتين في كيلو دالتون. العينات يغسل 2 تظهر غير محددة ملزمة للحبات، في حين أن العينات شطف تكشف عن الحاجة لمدة 6 مجموعات لضمان انتعاش إجمالي البروتين.

الشكل 10. منحنيات إجهاد من ألياف نسج من البروتينات TuSp1 المؤتلف. 8 ألوان تظهر الألياف التي كانت خاضعة لنسب مختلفة تدور التعادل آخر، بدءا من 2.5x و حتى 6x. ألياف إظهار التباين المنخفض ضمن مجموعة نسبتهم، كما تدور آخر تعادل نسب الزيادة، وزاد من قوة من الألياف بينما انخفضت التمدد.

الرقم 11. مسح الصور المجهر الإلكتروني من ألياف نسج من البروتينات TuSp1 المؤتلف. أ) في تكبير 500x، وخارجي سلسويمكن رؤية السطح. ب) في 5000X، يمكن ملاحظة جوهر الداخلية الكثيفة من فاصل طبيعي للألياف.