$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1. الأمر الذي يمهد الطريق
- الحصول على نوع السلالة S. المكورات آي تي سي سي 12600، S. المكورات آي تي سي سي 27690 والعصوية الرقيقة آي تي سي سي 6051. سلالات مقاومة للميثيسيلين من S. الذهبية - MRSA1، MRSA 2، MRSA 5، 13 MRSA، MRSA 26، MRSA 34، 45 MRSA، B. الجمرة الخبيثة ستيرن، السالمونيلا التيفية الفأرية LT2، الشيجلا الفلكسنرية، يرسينيا enterocolotica، المتقلبة الرائعة، الكلبسيلة الرئوية 13882؛ فإن الفيروس التحللي 12600.
- الحصول على الضد حبات اللاتكس مترافق 2A PBP.
- إعداد NZY المتوسطة كما هو موضح 21.
- الحصول على الفوسفات مخزنة محلول ملحي (PBS).
- تحضير الماء منزوع الأيونات كما subphase لانجميور-بلودجيت (LB) ترسب أحادي الطبقة.
2. الدعوة الجراثيم والمعايرة
- احتضان 5 مل من الثقافة بين عشية وضحاها من S. المكورات آي تي سي سي 12600 (3.6 × 10 8 وحدات تشكيل مستعمرة (كفو) / مل) مع 500 ميكرولتر من فج (3 × 10 9 </ sup> في PFU / مل) في 500 مل المتوسطة NZY في 2 L فلاك على شاكر، حاضنة عند 37 درجة مئوية خلال الليل.
- أجهزة الطرد المركزي في الثقافة 4،424 x ج لمدة 10 دقيقة في 4 درجات مئوية.
- طاف إعادة طرد في 11،325 x ج لمدة 10 دقيقة في 4 درجات مئوية.
- تصفية طاف من خلال 0.22 ميكرون ميليبور التصفية.
- أجهزة الطرد المركزي في 75395 XG الترشيح مقابل 1.5 ساعة.
- حل بيليه في 100 ميكرولتر من الماء المقطر.
- تحضير التخفيفات 10 أضعاف من تعليق فج في المتوسط NZY.
- لوحة 1 مل من ليلة وضحاها (ON) ثقافة S. المكورات آي تي سي سي 12600 على كل من لوحات 2 مع أجار NZY للتأكد من تغطية جميع السطح. إزالة الزائدة للثقافة والسماح للسطح جاف لمدة 30 دقيقة.
- بقعة العينة (10 ميكرولتر) من التخفيف فج المناسبة على سطح اللوحة، واحتضان عند 37 درجة مئوية لمدة 18-24 ساعة.
- دراسة تشكيل لويحات وحساب عيار فج. وتقدر التتر الجراثيم (T) على أساس عدد من عlaques (N) التي تشكلت في 10 ميكرولتر حجم (V) من التعليق فج وعامل التخفيف (F). تم حساب عيار بواسطة الصيغة: T = N / (VXF) على سبيل المثال، لعدد من لويحات 75 في التخفيف 10 -7 وحجم 10 ميكرولتر (10 × 10 -3 مل)، وعيار يساوي 75 / (10 × 10 × 10 -3 -7) = 7.5 × 10 10 وحدات تشكيل اللويحات (PFU) لكل مل من التعليق.
3. فج الذهب يجمد
- نظيفة قطعة من الكوارتز مطلية بالذهب (60 ملم 2) بواسطة البلازما الحفر في الأرجون لمدة 10 دقيقة ثم تعقيم لمدة 6 ساعة تحت ضوء الأشعة فوق البنفسجية في مجلس الوزراء عقيمة.
- إضافة 50 ميكرولتر من 1 × 10 9 PFU / مل فج التعليق على سطح الذهب من كل قطعة في طبق بتري معقمة، ثم احتضان بين عشية وضحاها في غرفة رطبة في درجة حرارة الغرفة.
- إزالة وعيار تعليق فج المتبقية.
- غسل قطعة مع فج منضم 5 مرات مع برنامج تلفزيوني لإزالة غير منضمفج.
4. اختبار مشلول العدوى فج على سطح جاف
- انتشر على O / N ثقافة S. الذهبية آي تي سي سي 12600 على لوحة آغار NZY والسماح التجفيف.
- ضع قطعة الذهب مع فج يجمد على طبق وجهه لأسفل.
- مراقبة منطقة من تحلل بعد 12 ساعة حضانة في 37 ° C تشير إلى العدوى.
- استخدام الذهب قطعة مغطاة لا فج في تجارب السيطرة.
5. اختبار نشاط التحللي من فج الحرة وملزمة في السائل
- أضف ثقافة ON من S. المكورات آي تي سي سي 12600-10 مل من NZY في كل من أربعة قوارير 300 مل أسلحة شخصية (6 × 10 6 خلية / مل في كل قارورة).
- إضافة في اثنين من قوارير 2 × 10 6 PFU / مل من فج مجانا.
- استخدام الأخريين قوارير والضوابط.
- رصد مدار الساعة من S. تحلل الخلايا العنقودية الذهبية ل 570 دقيقة قبل قياس الكثافة الضوئية (OD 600) في 30 دقيقة فترات لجميع القوارير.
- أخذ قياس النهائي في 24 ساعة.
- كرر الخطوات من 5،1-5،5، ولكن استخدام قطعة الذهب مع فاجات المربوطة بدلا من فاجات الحرة، وقطعة ذهبية مع عدم وجود فج في قوارير السيطرة.
6. فقدان فاجات ملزمة أثناء الحضانة
- إضافة 50 ميكرولتر من 1 × 10 9 PFU / مل فج على سطح معقم قطعة ذهبية في طبق بتري التي يتم وضعها في غرفة رطبة بين عشية وضحاها في درجة حرارة الغرفة.
- إزالة التعليق مع فج غير منضم من سطح الذهب وعيار.
- غسل قطعة الذهب مع فج منضم 5 مرات مع برنامج تلفزيوني ومكان في 1 مل من محلول NZY في 15 مل أنبوب في شاكر-حاضنة عند 37 درجة مئوية لمدة 8 ساعات.
- تحديد عيار من فج منفصلة كما هو موضح في 2.
7. فج الأجسام الشبه الكروية التحضير
- الجمع بين 400 ميكرولتر من الأسهم فج 12600 تعليق (10 11 PFU / مل) مع حجم مساو من كلوروفورم الصف الطيفي في 1 مل قارورةفي درجة حرارة الغرفة.
- دوامة بلطف تعليق فج كلوروفورم 5-6 مرات (5 فترات ثانية) على مدى مدة دقيقة واحدة.
- يسمح بتعليق لتحقيق الاستقرار لمدة 30 ثانية ثم ماصة للمرحلة الأعلى التي تحتوي على وpipetted الأجسام الشبه الكروية قبالة لإعداد أحادي الطبقة.
- يستغرق بضع ميكرولتر لتعليق الأجسام الشبه الكروية لنقل والمجهر الإلكتروني.
- استخدام التعليق كروي المتبقية لتصنيع جهاز الاستشعار البيولوجي.
8. إعداد جهاز الاستشعار البيولوجي
- نظيفة أجهزة الاستشعار QCM-D بواسطة البلازما الحفر في الأرجون لمدة 10 دقيقة PDC-32G [هريك] نظافة البلازما.
- شطف مع استشعار الهكسان لإزالة أي الشوائب العضوية.
- إعداد وتنظيف الحوض من التوازن الفيلم كما هو موضح في 22.
- ملء الحوض الصغير LB مع حل subphase وتنظيفه مع حاجز الحوض الصغير وتحقيق الاستقرار في الحوض الصغير في 20 ± 0.1 ° C
- انتشار 300 ميكرولتر من فج 12600 في suspensi مائيعلى (10 11 PFU / مل) على subphase LB.
- إعداد أحادي الطبقة فج على LB حل subphase بالسماح 300 قسامة ميكرولتر من فج 12600 تعليق مائي (10 11 PFU / مل) لتشغيل أسفل قضيب زجاج قابل للبلل ميلا التي يتم المغمورة جزئيا في subphase 22،23.
- استقرار أحادي الطبقة المعدة لمدة 10 دقيقة، ثم ضغط عليه بمعدل 30 ملم / دقيقة (45 سم 2 / دقيقة)، حتى يتحقق الضغط المستمر 19 نيوتن / متر.
- إجراء ترسب الفيلم عمودي على وضع عمودي استشعار QCM-D بمعدل 4.5 مم / دقيقة عن طريق غمس تباعا استشعار داخل وخارج أحادي الطبقة سبع مرات. المجهر الإلكتروني المودعة الطبقات الوحيدة فج قبل أظهر التعرض لعينات بكتيرية أن طبقات كانت مستمرة، متجانسة، وموحدة (لا تظهر البيانات).
- كرر الخطوات من 4،5-4،8 مع تعليق كروي فج التي يتم إعدادها في 3.
- استخدام أجهزة الاستشعار فج ملفقة لكشف الجرثومة، والإلكترونالمجهري، وellipsometry.
9. اختبار جهاز الاستشعار البيولوجي والتمييز من ميثيسيلين مقاومة البكتيريا العنقودية وحساس
- في هذا البروتوكول، يتم إعداد أجهزة الاستشعار مع فج غير معدلة وتعديلها والأجسام الشبه الكروية فج. ويستخدم توازن دقيق الكريستال الكوارتز مع أربع غرف تدفق الاستشعار لرصد ملزم من البكتيريا إلى فج ثبتوا على سطح QCM الاستشعار. وتستخدم PBP 2A الضد حبات اللاتكس مترافق على التمييز بين ميثيسيلين مقاومة (MRSA) وبكتيريا المكورات العنقودية الحساسة. ويتم إجراء جميع القياسات في نمط التدفق (50 ميكرولتر / دقيقة) في 5 ميغاهرتز.
- إنشاء خط تردد صدى قاعدة من أجهزة الاستشعار QCM في الماء (~ 30 دقيقة).
- رسم تعليق حية المكورات العنقودية الذهبية الحساسة الخلايا البكتيرية في المياه (10 9 وت م / مل) من خلال خلية الاختبار.
- ترصد باستمرار التغيرات في تردد صدى أجهزة الاستشعار وتبديد الطاقة لليغلب الأول، USIنانوغرام برنامج Q-لينة.
- عندما وصلت التغييرات في تردد صدى أجهزة الاستشعار وتبديد مستويات التشبع، إضافة تعليق الضد حبات اللاتكس مترافق PBP (6.77 X10 10 حبات / مل) إلى تدفق خلال الرصد المستمر لتردد وتبديد.
- كرر الخطوات من 9،2-9،5 عن المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للخلايا البكتيرية (MRSA).
- تعريف تيرة التغيير من خلال كتلة التغيير بسبب البكتيريا ملزمة من قبل سوربري المعادلة 24،25 Δf =-Δm XN / C، حيث C هو حساسية كتلة ثابتة (C = 17.7 نانوغرام X سم X -2 هرتز -1 في 5 ميغاهرتز )، M هي الكتلة و n هو عدد يغلب (ن = 1).
- تعريف التغيير تبديد الطاقة (Δ D) من تسجيل اضمحلال الأسي من التذبذب (التردد والسعة الملطف، مما سمح الكمي من الطاقة تبدد وتخزينها خلال فترة واحدة من التذبذب،E تبدد وE المخزنة، على التوالي: Δ D = E تبدد / 2 πE المخزنة. يتم قياس Δ D في وحدات تبديد (DU)، واحدة DU = 10 -6 وحدات النسبية).