بالإضافة إلى ذلك، لتحليل شبكة غشاء TATS عدد من التقنيات بيولوجيا الخلايا تستخدم عادة مثل الكالسيوم داخل الخلايا 2+ التصوير، والتصحيح، المشبك الكهربية، أو دراسات الاستجابة للجرعة الدوائية بشكل حاسم على جودة عالية العزلة الخلية الأولية من الأذينين أو البطينين أو حدد أجزاء من أنسجة القلب لتمكين توصيف myocytes القلب سليمة متباينة، هيكليا والفسيولوجية ناضجة. وبالتالي، فإن العزلة ونوعية لتقييم وAM VM خلايا الموضحة في قسم 1 مفيدة في نهاية المطاف لكثير من الأسئلة المختلفة بما في ذلك تحليل الشبكة TATS هنا وصفها، والتي تعتمد بشكل كبير على الغشاء سليما وسلامة الخلية.
ويقدم الشكل 1 دليل خطوة حكيمة من الصور كيفية المضي قدما في تشريح الأنسجة القلبية بدأت مع الغرف الأذيني في القلب الماوس. بعد ذلك، يتم إعداد غرف البطين والحاجز ود تشريح حسب الحاجة. اختيار دقيق وإعداد الأجزاء الأنسجة الصحيحة هي مهمة لإنشاء موثوق AM VM والعزلة مع نقاء خلية كافية. بعد الهضم كولاجيناز قد يكون من الصعب نسبيا لتحديد الخط الصحيح من بين تشريح الأذيني البطيني والأنسجة، ولكن مرة واحدة ويتم خلط AM VM الخلايا غير المنضبط في تعليق خلية، فإنه من المستحيل لعكس سكان الخلية المختلطة. وبالتالي، التوجه التشريحي، 3D التصور الأنسجة، والخبرة الكافية مع معالجة الأنسجة هضمها، وتحديد الصحيح من أجزاء أنسجة محددة وخطوط تشريح لها سوف تسهم جميعها في نجاح العزلة الخلية.

الرقم 1.Dissection من النسيج الأذيني. (A) مواجهة الجزء الأمامي للقلب، وهما ق الجراحيةutures إصلاح الشريان الأبهر الداني إلى نهاية الجذع من قنية 21 G الصلب. (B) نحو مشاهدة يبين أساس القلب المتبقية أنسجة الرئة التي حجبت الرؤية الغرفة الأذيني أثناء تشريح. LA، الأذين الأيسر. RA، الأذين الأيمن. (C) المتبقية lungtissue والأوعية الدموية الكبرى أزيلت الوصول إلى غرف الأذيني. شغل المثلث الأسود، الشريان الرئوي. مثلث مقلم، الأوردة الرئوية. شغل المثلث الأبيض، الوريد الأجوف العلوي. مثلث محاصر، الوريد الأجوف السفلي (D) أولا، يتم تشريح الجدار الأذيني الأيمن أثناء عقد ملقط أطرافهم الأذيني. (E) عرض في تجويف الأذين الأيمن الغرفة. ويمثل المثلث الأسود الحاجز بين الأذينين سليمة. (F) واستمر تشريح لدخول الأيسر تجويف غرفة الأذيني. (G) وبعد تشريح كامل للالأذينين الأيمن والأيسر، والصمامات الأذينية البطينية تصبح مرئية. يتم تشريح الجهاز صمام ليفي وتجاهل لsubseqحصاد uently الأنسجة العضلية البطين فقط. رأي (H) الخلفي من الأذينين الأيمن والأيسر معزولة. LA، الأذين الأيسر. RA، الحق الحانات atrium.Scale: 700 ميكرون.
لتحديد نوعية الخلية العزلة، ويبين الشكل 2 أمثلة خلية نموذجية خلال تقييم العائد والجدوى من قضيب نموذجي أو الطوب على شكل myocytes سليمة مقلم، سواء بالنسبة AMS ونظام رصد السفن. تضررت قليلا، غير واضحة بصريا وكذلك الخلايا التالفة بشدة مع غير طبيعية الأشكال التضاريسية منحنية بشكل مفرط، أو كروية على شكل خلايا غير طبيعية، ويمكن تحديدها بسهولة بما في ذلك الاستبعاد التريبان الأزرق كما هو موضح في القسم 1.11. في حين لا تزال myocytes سليمة مشرقة والمخططة متجانس عندما تتعرض لالتريبان الأزرق خارج الخلية، تظهر الخلايا التالفة عادة الفقاعات غشاء متعددة و / أو تتراكم بسرعة التريبان الأزرق يدل الضرر غشاء داخل الخلية. ومع ذلك، الأزرق التريبان في حد ذاته يمكن ان تضر الخلايا من خلال unnecessariلاي حضانة طويلة والفوري تقييم جودة الخلية وبالتالي إلزامية. وترد أمثلة لأشكال أكثر وضوحا من تلف الخلايا مثل انكماش خيط عضلي أو أضرار جسيمة سطح التأثير على سلامة الخلايا في أرقام 4C و 4D. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2. التريبان تلطيخ خلية الأزرق الاستبعاد. معزولة (A) صباحا ويتم خلط الخلايا (B) VM في تعليق مع التريبان الأزرق وتصور بواسطة ضوء المجهر المقلوب هو موضح في 40Xmagnification. ملاحظة thatabnormal خلايا كروية في (A) و (B) تناول التريبان الأزرق، الذي indicatesmembrane leakaجنرال الكتريك والضرر الهيكلي. في المقابل، فإن خلايا centralAM وVM مع أغشية سالمة استبعاد التريبان الأزرق كما هو مبين. وعلاوة على ذلك، لاحظ أنه AM سليمة وتظهر خلايا VM التصدعات قسيم عضلي في جميع أنحاء حجم الخلية، والفقاعات nomembrane، والحواف الحادة في كلا الجانبين على حد سواء الجانبية وأقراص مقحم. أشرطة النطاق: 20 ميكرون.
بعد نجاح عوائد العزلة، خلية من نظام رصد السفن من 5 × 10 مايو - 10 يونيو يمكن توقعه من واحد الهضم الماوس القلب. العائد من AMS هو أقل من ذلك بكثير في حدود 3 × 3-3 أكتوبر × 10 4 على شكل قضيب، أزرق التريبان باستثناء الخلايا. على النقيض من VM، صباحا تفشل العزلة أحيانا حتى في أيدي ذوي الخبرة. خطوة 1.11 تلخص الإجراءات كيفية تقدير العائد من الخلايا السليمة المعزولة في تعليق. بالإضافة إلى ذلك، تحديد متوسط أبعاد الخلية من خلال خطوة 1.13 كما هو مبين في الشكل رقم 3 لAM الفردية أو المعزولة خلية VM أو لمقارنة AM مقابل السكان الخلية VM جنبا إلى جنب (حسب الحاجة). يرجى النقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.

الرقم 3.Bright تحليل المورفولوجية مجال myocytes القلب. تم الكشف عن كفاف VM بواسطة أدوات تحليل الصور خطوة وصفها تحت 1.13. استخدام أداة التحديد المضلع علامة على بصريا وتحديد الحدود خارج الخلية خلية يحددها غشاء السطح الخارجي للتحليل. إعلان المنطقة المحددة ذات الاهتمام (ROI) إلى مدير ROI تليها قياسات المسافة 1D. للدراسات المقارنة للAM مقابل أبعاد VM، فمن المفيد لتوثيق طول الخلية، والعرض، والمنطقة، وحساب طول: نسبة العرض.
الإقليم الشمالي "> لfluorescently أغشية صمة عار TATS إما صباحا أو VM الخلايا الصبغة الغشاء لا يتجزأ-ANEPPS دى 8 يستخدم كما هو موضح في القسم
2 تليها المجهري متحد البؤر، والتي أسفرت عن الصور الممثلة لشبكات TATS هو مبين في
الأرقام 4A و
4B. وبالإضافة إلى ذلك، يبين
الشكل 4A المقابلة التي تنتقل صورة ضوئية لAM سليمة جنبا إلى جنب مع صورة TATS مبائر (لالتقاط صور انظر القسم
3). كما هو موضح خطوة
1.12، والشكلية والسطحية سلامة غشاء المعيشة يتم الحكم myocytes من خلال الصور الضوئية المرسلة. المنطقة تضخيم للإشارة دى 8 ANEPPS تسلط الضوء على التشكل الأساسي للشبكة TATS في هيئة علماء المسلمين، والتي تتميز المحوري وفرة (الطولية) الأنابيب الغشاء. وفي المقابل، فإن التشكل TATS صحي من نظام رصد السفن كما هو مبين في
الشكل 4B يتميز أرقام مماثلة تقريبا من محوري ومكونات عرضية د. في المقابل،
أرقام 4C و
4D تظهر أمثلة من myocytes القلب التالفة التي ينبغي استبعادها من مزيد من التحليل. على وجه الخصوص، تعاقدت AM الخلية في
الشكل 4C كما يتضح من طول قسيم عضلي قصيرة بشكل غير طبيعي من 1.2 ميكرون وغير النظامية، مشوهة شبكة TATS بينما الخلية VM في
الشكل 4D يسلك الفقاعات غشاء متعددة (بعض أبرز المثلثات الحمراء) تشير اضطرابات غشاء ، والتي قد تحدث في غشاء السطح الخارجي ولكن أيضا في الأغشية TATS.
الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم. 
الرقم 4.Live تلطيخ غشاء الأذيني البطيني سليمة وميوcytes الموافق تنتقل الضوء والصور مبائر المعيشة دى 8 ANEPPS الملون سليمة (A) صباحا وخلايا (B) VM. في المقابل، أظهرت AM التعاقد جزئيا ويحتمل أن تلف مع طول قسيم عضلي من 1.2 ميكرومتر في (C). myocytes التعاقد عادة ما تظهر بشكل غير طبيعي تقصير والهياكل TATS مشوهة، وبالتالي استبعادها من مزيد من التحليل. آخر مؤشر مهم للعيوب غشاء الخلية وغشاء الفقاعات (المثلثات الحمراء) كما هو مبين في VM في (D). تمثل ينبغي استبعاد الفقاعات غشاء تضررت الهياكل غشاء السطحية والخلايا مع الفقاعات من مزيد من التحليل TATS. وعلاوة على ذلك، يظهر VM الضرر الإجمالي على ما يبدو في عداد المفقودين جزء كامل من الجزء السفلي الأيسر (تميزت النجمة). وباختصار، من خلال مقارنة الضوء المرسل والصور مبائر، مورفولوجيا الخلايا ويتم توثيق intactness السطحية ومجتمعة مع المعلومات إشارة الفلورسنت. علامات 'N' نوحذف clei من تحليل وصمة عار غشاء TATS. القضبان الصفراء تشير إلى تضخيم رويس من نفس الصورة مبائر الواردة أعلاه. أشرطة النطاق: 10 ميكرون الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.
وتقبل الصور مبائر الأغشية TATS مع نسبة كافية إشارة إلى الضجيج كما هو موضح في الشكلين 4A و 4B لمزيد من التحليل الكمي. ويستند التحليل غشاء TATS على هيكل عظمي البيانات المستمدة من مكونات إشارة الفلورسنت مستقيمة الشكل 5 يظهر الرسم البياني لسير العمل الفردية خطوات معالجة الصور والتي تم وصفها بالتفصيل الخطوات 4،3-4،5. هذه الخطوات تنتج صورا هيكل عظمي تمثل TATS مستقيمة شبكات الغشاء كما هو مبين في كل VM معزولة (الشكل 5A)، وأنا الخلايا (فايجوري 5B).

ويمثل الرقم 5.Workflow لskeletonization من الصور TATS الفلورسنت. معالجة الصور الخطوات التي تؤدي إلى صورة هيكل عظمي لشبكة TATS خطوة بخطوة الأمثلة صورة فردية على حد سواء لدى 8 ANEPPS الملون VM (A) وAM (B). لخطوة فردية ومعالجة الصور، يرجى الرجوع إلى القسم 4. ملاحظة الاختلافات في الحانات النطاق: 20μm (A) و10μm (B) يرجى النقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.
خطوة حاسمة خلال معالجة الصور، وتحديد عتبة مناسبة للbinarization البيانات كما هو موضح في القسم 4.5.6. ينبغي أن يتضمن صورة ثنائية الناتج إلا إشارات غشاء الحقيقية من الشبكة TATS لكن ليس الهياكل الكاذبة التي يجنيها العتبة الخاطئة عن الضوضاء إشارة الخلفية. ومع ذلك فمن المهم أن عتبة منخفضة بما فيه الكفاية للكشف عن جميع الهياكل TATS الحقيقية بحيث مكونات TATS الحقيقية لا تضيع خطأ أثناء تحليل الصور. الشكل 6 يوضح كيفية عملية تحديد عتبة خلال binarization البيانات. في حين أن عتبة 40 كما هو موضح في الشكلين 6B و 6C يبدو مناسبا للكشف عن جميع الهياكل TATS الحقيقية بشكل فردي، واختيار أعلى عتبة على سبيل المثال، من 60 كما هو مبين في الشكل 6A لا يكشف عن الهياكل غشاء خفوتا المحورية (ATS) كما يتبين من مثلثات صفراء . في المقابل، اختيار أقل عتبة على سبيل المثال، من 20 كما هو مبين في الشكل 6D يؤدي إلى الكشف الخاطئ من الضوضاء في الخلفية الهياكل TATS كما إيجابية كاذبة كما يتبين منمثلثات صفراء.

الرقم 6.How لتحديد عتبة إشارة skeletonizing من خلال بيانات الصورة TATS. توضح الأمثلة الهياكل العظمية TATS كل المولدة للعتبات مختلفة خلال binarization البيانات (موضح في الخطوة 4.5). الصور العليا: وتظهر التعديلات عتبة باستخدام فيجي. صور الدنيا: تراكب الصور هيكلا عظميا مع ما يوازيها من الصورة المدخلة مضان والمناطق تضخيم كما هو مبين. عتبة عالية مثل 60 المطبقة في (A) هو على ما يبدو غير مناسب للكشف عن جميع الهياكل TATS الحقيقية كما يتبين من مثلثات صفراء في قسم المكبرة. عتبة من 40 تطبيق في (B) و (C) بالكشف عن جميع الهياكل TATS وبشكل صحيح لا يكشف عن الضوضاء في الخلفية، في حين أن عتبة منخفضة مثل، 20 في (D) ويحدد خطأ الضوضاء الخلفية عن الهياكل TATS وتنتج إشارات إيجابية كاذبة الهياكل غشاء غير موجودة وبالتالي. يشار إشارات إيجابية كاذبة من مثلثات صفراء في أقحم المكبرة. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.
و"تحليل الهيكل العظمي (2D / 3D)" المساعد يدعم تحليلا مفصلا لهياكل TATS هيكل عظمي. مرة واحدة أعدموا، والمساعد ينتج جدول البيانات مع المعلمات التالية الهيكل العظمي: #branches، #junctions، # voxels نقطة النهاية، ومتوسط طول الفرع، #triple نقاط، ونقاط #quadruple، والحد الأقصى لطول الفرع. للحصول على وصف مفصل لجميع معلمات الإخراج الممكنة يرجى الرجوع tohttp: //fiji.sc/wiki/index.php/AnalyzeSkeleton والمواد ذات الصلة 29-31. ويرد جدول بيانات الناتج نموذجي في الشكل 7A.
إجمالي طول الهيكل العظمي في العائد على الاستثمار:
Σ (#branches س متوسط طول فرع) = 5155 بكسل = 515.5 ميكرومتر
ويبلغ طول الهيكل العظمي يمكن أن يكون طبيعيا لمنطقة الصورة. للمثال هو مبين في الشكل (7) وطول الهيكل العظمي تطبيع 0.64μm / 2 ميكرون ومجموع كل تقاطعات تحسب كما هو مبين أدناه:
تطبيع طول الهيكل العظمي:
515.5 ميكرون / 803.6 ميكرون 2 = 0.64 ميكرون / ميكرون 2
عدد تطبيع تقاطعات:
تقاطعات 155 / 803.6 ميكرون 2 سوب> = 0.19 تقاطعات / 2 ميكرون

الرقم إخراج البيانات 7.Automated من صور هيكل عظمي. (A) وجدول البيانات النموذجية التي تم إنشاؤها بواسطة "تحليل الهيكل العظمي (2D / 3D) 'البرنامج المساعد من هيكل عظمي هو مبين في الصورة (B). للحصول على وصف مفصل لمعلمات الإخراج الممكنة يرجى الرجوع إلى http://fiji.sc/wiki/index.php/AnalyzeSkeleton . الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.
خطوات معالجة الصور الموضحة ضمن 4.5 و موضح في الشكل (5) يمكن أن يكون آليا باستخدام ماكرو فيجي المقدمة كملف كود التكميلية 4.3 و 4.4. الماكرو يمكن أن يكون مفيدا لتحليل مجموعات بيانات كاملة، على سبيل المثال من خلال إعداد الفردية مداخن صورة المدخلات لكل مجموعة معالجة مستقلة للتحليل الآلي باستخدام أوامر الماكرو.
تمكن استراتيجية البرامج المذكورة كذلك تحليل توجهات الشبكة TATS لجميع المكونات. لهذا، استخدم "الاتجاهية" المساعد (http://fiji.sc/Directionality) التي تنتج 29،31 أظهرت بيانات الرسم البياني توزيع توجه جميع TATS توجهات المكون. إذا كان محور س من الصورة المدخلة يتوافق مع المحور الرئيسي للAM معين أو VM الخلية، محوري سيمثل (الطولية) مكونات TATS من 0 ° بن، في حين سيمثل مكونات مستعرضة من قبل 90 و# 176؛ بن الشكل 8 يبين اتجاهها المثالي رسوم بيانية من الصور TATS هيكل عظمي لVM (8A) في مقابل AM (8B) الخلية. في حين أن الرسم البياني اتجاهها من VM نموذجي يبين توزيع ذروة مزدوجة عند 0 درجة و 90 درجة، ويظهر الرسم البياني AM ذروة المهيمنة واحدة في 0 درجة. هذه الأمثلة هي في الاتفاق مع الملاحظات السابقة التي TATS المكونات الفردية للنظام رصد السفن وموزعة بالتساوي تقريبا بين T-A-الأنابيب والأنابيب، في حين أن مكونات TATS في هيئة علماء المسلمين قد تتكون في الغالب من A-الأنابيب.

الرقم 8.Representative الاتجاهية الرسم البياني من TATS شبكات الخلايا الفردية. تم إنشاء رسوم بيانية الاتجاهية من صور هيكل عظمي من الأفراد VM (A) مقابل AM (B قوية>) شبكات TATS. وبالنظر إلى أن محور س للصورة تحليلها يناظر الرئيسي (الطولي) محور العضلية كما هو مبين، وتتمثل المكونات-A أنبوب صغير من 0 ° بن، في حين تتمثل المكونات T-أنبوب صغير قبل 90 ° بن. غاوس يناسب فقط على الرسم البياني peakasshown الكبرى كما رسم بياني الخلفية. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.
| نضح عازلة | ملي |
| كلوريد الصوديوم | 120.4 |
| بوكل | 14.7 |
| KH 2 PO 4 | 0.6 |
| نا 2 هبو 4 | 0.6 |
| MgSO 4 | 1.2 |
| HEPES | 10 |
| NaHCO 3 | 4.6 |
| التورين | 30 |
| 2،3-Butanedione-monoxime | 10 |
| الجلوكوز | 5.5 |
| ودرجة الحموضة 7.4 |
| عازلة الهضم | ملي (إذا لم يكن محددا) |
| كلوريد الصوديوم | 120.4 |
| بوكل | 14.7 |
| KH 2 PO 4 | 0.6 |
| نا 2 هبو 4 | 0.6 |
| MgSO 4 | 1.2 |
| HEPES | 10 |
| NaHCO 3 | 4.6 |
| التورين | 30 |
| 2،3-Butanedione-monoxime | 10 |
| الجلوكوز | 5.5 |
| نوع كولاجيناز الثاني | 600 U / مل |
| ودرجة الحموضة 7.4 |
| توقف عازلة | ملي (إذا لم يكن محددا) |
| كلوريد الصوديوم | 120.4 |
| بوكل | 14.7 |
| KH 2 PO 4 | 0.6 |
| نا 2 هبو 4 | 0.6 |
| MgSO 4 | 1.2 |
| HEPES | 10 |
| NaHCO 3 | 4.6 |
| التورين | 30 |
| 2،3-Butanedione-monoxime | 10 |
| الجلوكوز | 5.5 |
| CaCl 2 | 0.0125 |
| مصل العجل البقري | 10٪ |
| ودرجة الحموضة 7.4 |
الجدول 1.Buffer solutالأيونات. وتتلخص محتوى ثلاثة المحاليل الفيزيولوجية المختلفة لعزل الخلايا والتصوير.