المجالات الزنك الاصبع هي في جوهرها خلايا قابلة للاختراق وقادرة على التوسط تسليم البروتين في مجموعة واسعة من أنواع الخلايا الثديية. هنا، يتم تقديم خطوة بخطوة بروتوكول مفصلة لتنفيذ تكنولوجيا الزنك والإصبع للداخل الخلايا تسليم البروتين.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
مقالة منهجية
* These authors contributed equally
المجالات الزنك الاصبع هي في جوهرها خلايا قابلة للاختراق وقادرة على التوسط تسليم البروتين في مجموعة واسعة من أنواع الخلايا الثديية. هنا، يتم تقديم خطوة بخطوة بروتوكول مفصلة لتنفيذ تكنولوجيا الزنك والإصبع للداخل الخلايا تسليم البروتين.
نظرا لنمطيتها وقدرتها على إعادة برمجتها للتعرف على مجموعة واسعة من تسلسلات الحمض النووي ، ظهرت مجالات ربط الحمض النووي Cys2-His 2 بإصبع الزنك كأدوات مفيدة لهندسة الجينوم المستهدفة. مثل العديد من البروتينات الأخرى المرتبطة بالحمض النووي ، تمتلك أصابع الزنك أيضا القدرة الفطرية على عبور أغشية الخلايا. لقد أظهرنا مؤخرا أنه يمكن الاستفادة من نفاذية الخلايا الجوهرية هذه لتوصيل البروتين داخل الخلايا. يؤدي الاندماج الجيني لأشكال أصابع الزنك إلى النقل الفعال لشحنة البروتين والإنزيم إلى مجموعة واسعة من أنواع خلايا الثدييات. على عكس تقنيات نقل البروتين الأخرى ، فإن التوصيل عبر مجالات أصابع الزنك لا يثبط نشاط الإنزيم ويؤدي إلى مستويات عالية من توصيل العصارة الخلوية. هنا يتم تقديم بروتوكول مفصل خطوة بخطوة لتنفيذ تقنية إصبع الزنك لتوصيل البروتين إلى خلايا الثدييات. يتم تسليط الضوء على الخطوات الرئيسية لتحقيق مستويات عالية من التوصيل بوساطة إصبع الزنك داخل الخلايا ومناقشة استراتيجيات تعظيم أداء هذا النظام.
استراتيجيات فعالة للغاية وتنوعا تسليم البروتين حاسمة بالنسبة لكثير من البحوث الأساسية والتطبيقات العلاجية. النقل المباشر لتنقية البروتينات في خلايا يمثل واحدة من أسلم وأسهل الطرق لتحقيق ذلك. وخلافا 1،2 الاستراتيجيات التي تعتمد على التعبير الجيني من الأحماض النووية، 3-5 تسليم البروتين يشكل أي خطر من الطفرات إقحامي، مستقلة عن الخلوية النسخ / الآلات الترجمة وتسمح لها تأثير فوري. ومع ذلك، فإن عدم وجود طرق بسيطة وللتعميم عن ومنح النشاط لاختراق الخلية على البروتينات يفند بشكل روتيني دخولهم المباشر في الخلايا. تستند الأساليب الحالية لتسهيل داخل الخلايا تسليم البروتين على استخدام تحدث بشكل طبيعي 6-8 أو تصميم الببتيد اختراق الخلية، 9-12 المجالات التنبيغ السوبر، 13،14 النانوية 15 والجسيمات الشحمية، 16 للفيروسات مثل الجزيئات 17،18 والمواد البوليمرية المكروية (19). لسوء الحظ، العديد من هذه الطرق ما يعرقل انخفاض معدلات امتصاص الخلوية، 20،21 الاستقرار الفقراء، 22 غير مقصودة الخلية من نوع خصوصية، 23 خصائص الهروب منخفض endosomal 24 وسمية. 25 وبالإضافة إلى ذلك، فإن العديد من البروتين تقنيات التنبيغ تقلل من النشاط الحيوي من البروتينات تسليمها. 14
لدينا مختبر أظهرت في وقت سابق ان نوكلياز الزنك الاصبع (ZFN) بروتينات - تقييد خيالية endonucleases تتألف من السيستئين 2 العاهل 2 الزنك والبروتين إصبع ملزم DNA للبرمجة والمجال انشقاق من FokI تقييد نوكلياز داخلية 26-28 - هم الخلوي بطبيعتها قابلة للاختراق. وقد أظهرت 29 هذا النشاط لاختراق الخلية من المستغرب أن تكون خاصية ذاتية للمجال الزنك إصبع مصمم خصيصا، منصة ملزم DNA التي برزت كأداة قوية لاستهداف الجينوم ENgineering، 30-32 والتي تعتبر نتيجة لكوكبة من ستة بقايا موجبة على سطح البروتين. في الواقع، وقد ثبت عدة البروتينات الحمض النووي ملزم، بما في ذلك ج يونيو وN-دك لامتلاك قدرة فطرية لعبور أغشية الخلايا. 33 وفي الآونة الأخيرة، توسع المختبر لدينا على هذه النتائج وأظهرت أن النشاط لاختراق الخلية من zinc- يمكن الاستدانة الإصبع (زيف) المجالات لداخل الخلايا تسليم البروتين. الانصهار الوراثي إما واحد أو بإصبعين المجالات زيف إلى البضائع البروتين محددة أدى إلى امتصاص الكفاءة التي تجاوزت العديد من أنظمة تسليم الببتيد اختراق الخلية التقليدية. 34 وأبرزها، زيف بوساطة تسليم لا تمس النشاط من البضائع الأنزيمية تنصهر وسهلت مستويات عالية من تسليم عصاري خلوي. بشكل جماعي، تؤكد هذه النتائج على إمكانات المجال زيف لتسهيل التنفيذ الفعال وسطحي من البروتينات، وأنواع يحتمل أن تكون أكثر تنوعا من ماكروالجزيئات، في الخلايا.
هنا، يتم تقديم خطوة بخطوة بروتوكول مفصلة حول كيفية تنفيذ تكنولوجيا زيف للتسليم البروتين في خلايا الثدييات. نحن شيدت من قبل مجموعة من واحد، اثنان، ثلاثة، وأربعة، خمس وستة أصابع المجالات زيف التي تفتقر إلى القدرة على ربط الحمض النووي، ويرجع ذلك إلى استبدال كل من المخلفات ملزم DNA-α حلزونية، ولكن هي قادرة على تقديم البروتينات في خلايا 34 (الشكل 1). يوصف إنتاج وتنبيغ الزمرد GFP (EmGFP) في خلايا هيلا باستخدام بإصبعين زيف المجال. هذا البروتوكول هو للمد إلى ما يقرب من أي بروتين قادر على التعبير القابلة للذوبان في القولونية وأي نوع من الخلايا الثدييات تقريبا. وتقدم النتائج المتوقعة وتناقش أيضا استراتيجيات لتحقيق أقصى قدر من الأداء لهذا النظام.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
1. الاستنساخ
2. التعبير وتنقية
3. البروتين التخزين
تنبيغ 4. البروتين
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ويمكن التعبير عن بإصبعين زيف-EmGFP البروتينات الانصهار في E. القولونية مع> 95٪ التجانس وعوائد عالية (> 25 ملغ / مل) (الشكل 2). بشكل عام، واحدة وبإصبعين يمكن أن تنتج زيف البروتينات الانصهار في كميات مماثلة تقريبا لتلك التي من النوع البري غير معدل البروتين. ومع ذلك، في بعض السياقات، مكونة من خمسة وستة أصابع البروتينات زيف الانصهار غير قادرة على أن تنتج في عوائد عالية بما فيه الكفاية لتطبيقات المصب.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
هنا، يتم تقديم بروتوكول خطوة بخطوة لتسليم البروتين باستخدام الزنك الاصبع (زيف) نطاقات خلية قابلة للاختراق. المجال زيف لا يقلل من نشاط تنصهر البضائع الأنزيمية 34؛ يسمح لإنتاج وتنقية البروتينات في عائدات متطابقة تقريبا لتلك التي لوحظت مع البروتين معدلة. ويمكن نقل البروتينات والإنزيمات إلى مجموعة واسعة من أنواع الخلايا مع الكفاءات التي تتجاوز الببتيد أو البروتين أنظمة النطاق التنبيغ لاختراق الخلية التقليدية. معا، وهذه النتائج تشير إلى إمكانية واسعة من المجالات زيف للوساطة ...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
الكتاب ليس لديهم ما يكشف.
وأيد هذا العمل من قبل المعاهد الوطنية للصحة (DP1CA174426 لكارلوس F. BARBAS) وجامعة ShanghaiTech، شنغهاي، الصين (لJL). تم إنشاؤها باستخدام الرسومات الجزيئية PyMol.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| XmaI | New England Biolabs | R0180L | |
| SacI | New England Biolabs | R0156L | |
| توسيع نظام PCR عالي الدقة | Roche | 11759078001 | |
| dNTPs | New England Biolabs | N0446S | |
| 4٪ -20٪ Tris-Glycine جل بروتين صغير ، 1.5 مم ، 10 آبار | Life Technologies | EC6028BOX | |
| 2x عازلة عينة Laemmli | BioRad | 161-0737 | |
| T4 DNA Ligase | Life Technologies | 15224-017 | |
| BL21 (DE3) المختصة E. القولونية< em> نيو | إنجلاند Biolabs | C2527I | |
| IPTG | Thermo Scientific | R0391 | |
| كلوريد الزنك | سيجما ألدريتش | 208086-5G | |
| كبريتات | الكاناميسينفيشر Scientific | BP906-5 | |
| الجلوكوز | سيجما-ألدريتش | G8270-100G | |
| تريس بيس | فيشر Scientific | BP152-25 | |
| كلوريد الصوديوم | سيجما-ألدريتش | S9888-25G | |
| DTT | فيشر Scientific | PR-V3151 | |
| PMSF | Thermo Scientific | 36978 | |
| Ni-NTA راتنج الاغاروز | QIAGEN | 30210 | |
| الجلسرين | سيجما-ألدريتش | G5516-500ML | |
| إيميدازول | سيجما-ألدريتش | I5513-25G | |
| Amicon Ultra-15 وحدات تصفية الطرد المركزي | EMO Millipore | UFC900324 | |
| DMEM | Life Technologies | 11966-025 | |
| تقنيات مصل الأبقار الجنينية | 10437-028 | ||
| المضادات الحيوية-المضادة للفطريات | Life Technologies | 15240-062 | |
| 24 بئر صفيحة مسطحة | القاع سيجما-ألدريتش | CLS3527-100EA | |
| بولي ليسين | سيجما-ألدريتش | P7280 | |
| DPBS ، بدون كالسيوم ، لا مغنيسيوم | تقنيات الحياة | 21600010 | |
| كبريتات الهيباران | سيجما-ألدريتش | H4777 | |
| التربسين | لايف | 25300054 | |
| خلايا HeLa | ATCC | CCL-2 | |
| Nano Drop ND-1000 مقياس الطيف الضوئي | Thermo Fisher Scientific | ||
| QIAquick PCR | QIAGEN | 28104 | |
| QIAquick Gel Extraction | Kit QIAGEN | 28704 |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.