يتم تقديم طريقة للكروموسومات المنتشرة على السطح من الخميرة الناشئة. هذه الطريقة مشتقة من طريقة وصفها Loidl و Klein سابقا. بالإضافة إلى ذلك ، نعرض إجراء للتلوين المناعي للكروموسومات المنتشرة.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
يتم تقديم طريقة للكروموسومات المنتشرة على السطح من الخميرة الناشئة. هذه الطريقة مشتقة من طريقة وصفها Loidl و Klein سابقا. بالإضافة إلى ذلك ، نعرض إجراء للتلوين المناعي للكروموسومات المنتشرة.
الحجم الصغير لنوى الخميرة الناشئة Saccharomyces cerevisiae يحد من فائدة الفحص المجهري الضوئي لتحليل التوزيع دون النووي للبروتينات المرتبطة بالكروماتين. يؤدي الانتشار السطحي لنوى الخميرة إلى تمدد الكروماتين دون فقدان البروتينات المقيدة. طريقة لنشر السطح توازن تثبيت البروتينات المرتبطة بالحمض النووي مع معالجة المنظفات. تم تعديل الطريقة الموضحة بشكل طفيف عن تلك التي وصفها جوزيف لويدل وفرانز كلاين1،2. تم استخدام هذه الطريقة لتوصيف توطين العديد من البروتينات المرتبطة بالكروماتين في مراحل مختلفة من دورة الخلية الانقسامية ، ولكنها مفيدة بشكل خاص لدراسة هياكل الكروموسوم الانتصافي مثل المجسومات المؤتلفة الانتصافية والمركب المتشابك. نصف أيضا تعديلا لا يتطلب استخدام Lipsol ، وهو منظف خاص ، والذي تم استدعاؤه في الإجراء الأصلي ، ولكنه لم يعد متاحا تجاريا. كما يتم وصف بروتوكول التلوين المناعي المتوافق مع طريقة نشر الكروموسوم.
الخميرة في مهدها خميرة الخباز توفر العديد من المزايا للدراسات الآليات الجزيئية من العمليات البيولوجية، بما في ذلك دراسة البروتينات التي تتحكم في وظيفة كروموسوم. على الرغم من أن هناك مزايا معروفة من مهدها الخميرة للدراسات الجينية والجزيئية والكيمياء الحيوية، ودراسات الخلوي لتوزيع البروتينات في نواة الخلية معقد بسبب صغر حجمها. نواة الخميرة النموذجية التي يبلغ قطرها ميكرون أقل من واحد، هو فقط حوالي 5 أضعاف الحد قرار من الضوء المرئي. وهكذا، فإن كمية المعلومات حول توزيع البروتينات النووية التي يمكن الحصول عليها من المناعية التقليدية أو باستخدام علامات بروتين فلوري، مثل البروتين الفلوري الأخضر (GFP)، محدودة. نهج مفيد لتميز توزيع النووية الدقيقة من البروتينات السطحية كروموسوم الانتشار. هذا النهج ينطوي على إزالة جدار الخلية، وتعطيل الخلايا والأغشية النووية، والنماذج التالية محتويات غير قابلة للذوبان من نواة ليستقر على سطح شريحة المجهر. وتشمل هذه المكونات غير القابلة للذوبان المصفوفة النووية والكروموسومات. بالإضافة إلى السماح إزالة محتويات النووية القابلة للذوبان، التي تعزز من القدرة على الكشف عن لونين البروتينات ملزمة، الكروموسوم نشر نتائج الأسلوب في الضغط كبيرا من الكروموسومات مثل أن انتشار نواة لها أقطار حوالي 3-5 ميكرون (لنوى الانتصافي مضاعفا) و 2-3 ميكرون لنوى الإنقسامية مضاعفا. هذا الضغط يسمح الكشف عن التحتية النووية التي من الصعب نسبيا أو المستحيل حلها في نواة سليمة.
والقصور الواضح للكروموسوم نشر هو إمكانية أن الإجراء قد نشر جزئيا أو كليا يعطل بنية الفائدة. ومما يثير القلق بشكل خاص هو أن كروموسوم ملزمة بروتين معين قد تضيع نتيجة لهذا الإجراء الانتشار. هذا شو المضاعفات المحتملةأن تبقى دينار في الاعتبار عند تفسير البيانات. مثال واحد من البروتين التي تعتبر حساسة لإجراء نشر هو بيتا تويولين. تحت بعض الظروف، المغزل، التي تتألف أساسا من تويولين، يتم الاحتفاظ خلال نشر 3. التصور من المغزل في كثير من الأحيان من المفيد تنظيم نوى الفائدة. ومع ذلك، تصور تويولين يتطلب العلاج مع تثبيتي تركيز عال. يتم فقدان مغزل وفقا للشروط القياسية الموضحة أدناه. يوضح هذا المثال، عند تحليل توزيع بروتين لم يسبق توصيفها، من المهم أن تختلف تركيز تثبيتي لتحديد مدى حساسية البروتين هو هذا الاختلاف. على الرغم من القلق بشأن تأثير الظروف نشر على بنية الصبغي، فقد ثبت فائدة وقوة الأسلوب تنتشر في العديد من السياقات ولها فائدة واسعة في توصيف الإنقسامية، وخصوصا الخلايا الانتصافي 4-7.
TWس استخدمت أساليب نشر على نطاق واسع. أول هذه الطرق، التي وضعتها تسريحة وجيرو 8، ويتجنب استخدام المنظفات ويمكن أن تسفر عن منتشرة الاستعدادات التي يبدو أن لها نسبيا المحفوظة جيدا التشكل كروموسوم عندما الملون لDNA محددة صبغ دابي. ومع ذلك، وهذه الطريقة من الصعب نسبيا لاتقان وجودة انتشار نوى يختلف بشكل كبير، وعندما تتم مقارنة منطقة واحدة من الانزلاق إلى مناطق أخرى. هذه المشكلة يمكن أن يعقد النهج الكمي التي تنطوي على تصوير العديد من الأنوية غير محددة من شريحة واحدة لتجنب الحصول على البيانات التحيز. الكروموسوم الثاني نشر الطريقة، التي وضعتها LOIDL وكلاين 1، ينطوي على موازنة التثبيت بواسطة امتصاص العرق، مع تحلل وإزالة الضغط لونين التي يروج لها حل المنظفات. عندما أدائها على الوجه الصحيح، وهذا الأسلوب يعطي نتائج استنساخه جدا مع أقل التباين من منطقة إلى منطقة مقارنة لطريقة تسريحة وجيرو. ويركز هذا العرض على modifieنسخة يوميا من طريقة LOIDL وكلاين، بسبب موثوقيتها والبساطة.
كروموسوم نشر ليست معقدة أو تستغرق وقتا طويلا. ما يصل الى 100 الشرائح يمكن أن تكون على استعداد لالمناعية في يوم واحد. وعلاوة على ذلك، قد يتم تخزين انتشار الاستعدادات في الثلاجة لسنوات قبل المناعية، وبالتالي مختبرات يمكن أن تتطور مستودعا للهوامش كروموسوم المجمدة التي يمكن استخدامها عندما تنشأ أسئلة البيولوجية الجديدة أو أصبح الكواشف تلطيخ الجديدة المتاحة.
يتم استخدام طريقة كروموسوم نشر الأكثر شيوعا في تركيبة مع المناعية وwidefield مضان المجهر، ولكن من الممكن أيضا لإعداد الشرائح لسوبر قرار ضوء أساليب المجهرية مثل استنزاف الانبعاث المستحث (STED) المجهري.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ملاحظة: بعض الخطوات للبروتوكول تتطلب أدناه العمل في غطاء الدخان نظيفة. بالإضافة إلى ذلك، يتطلب طريقة المجهر تشريح الخميرة الرباعيات مجهزة هدفا بعد 10X العمل الطويلة لمراقبة spheroplasting. يجب تعيين المجهر يصل في غطاء محرك السيارة في وقت مبكر. إزالة الذراع micromanipulator وحامل لوحة من نطاق ووضع هذه العناصر في مكان آمن بعيدا عن منطقة العمل.
1. إعداد Spheroplasts
2. كروموسوم نشر
ملاحظة: الواجهات الزجاجية التي تقوم عليها سيتم الشرائح أو بإحدى هاتين العقوبتين تنتشر الكروموزومات coverslips-يجب أن يكون مستعدا في وقت مبكر. يجب أن يغطس كل شريحة أو ساترة في الماء، ثم ETOH، ثم يترك ليجف، ومصقول مع ورقة العدسة. إذا كان سيتم نشر الكروموسومات coverslips على أنه ينبغي اضافته ساترة لشريحة بشريط لاصق أو الاسمنت والمطاط. ما لم يذكر غير ذلك، فإن بقية بروتوكول يصف نشر على أي شريحة أو ساترة
3. المناعية
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ظهور انتشار نوى يعتمد بشكل حاسم على التوازن بين تثبيت كروموسوم وإزالة الضغط. حتى عندما يتم متوازنة الكواشف بشكل صحيح، يمكن أن يحدث الاختلاف في درجة كروموسوم دي الضغط في مناطق مختلفة من نفس الشريحة و / أو بين الشرائح المختلفة. وبالتالي، ينبغي تقييم نوعية ينتشر في منطقة معينة من الانزلاق قبل أن يتم تفسير الصور.
آثار "overspreading" و "underspreading" يمكن توضيح باستخدام أجسام مضادة ضد بروتينات إ...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
يعتمد ظهور النوى المنتشرة بشكل حاسم على التوازن بين التثبيت ومعالجة التحلل / المنظفات. كما نوقش أعلاه ، يتطلب الحفاظ على الهياكل الخلوية المختلفة استخدام تركيزات مختلفة من PFA. بالنسبة لمعظم البروتينات ، 3٪ PFA هو الأمثل. ومع ذلك ، فإن الحفاظ على المغازل يتطلب استخدام 4٪ PFA. حتى مع وجود مجموعة واحدة من الكواشف ، يمكن أن يؤثر توقيت التحلل بالنسبة إلى التثبيت أيضا على جودة نوى الانتشار. للحصول على النتائج الأكثر اتساقا ، يجب تطبيع وقت التحلل لكل عينة من البلاستيدات الكروية عن طريق الملاحظة المباشرة للتحلل بمجهر ضوئي. ...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
يعلن المؤلفون عدم وجود مصالح مالية متنافسة.
تم دعم هذا العمل من خلال GM50936 منح المعاهد الوطنية للصحة إلى DKB.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| Zymolyase | US Biological | Z1004 | تحضير محلول 20 مجم / مل في 50 ملي مولار تريس درجة الحموضة 7.5 مكملة بجلوكوز 2٪. تحضير كل تجربة طازجة وتخزينها في 4 درجات ؛ ج حتى تصبح جاهزة للاستخدام. |
| ليبسول | L.I.P. المحدودة  | لم يعد متاحا تجاريا | قم بإعداد محلول 1٪ (حجم / حجم) في الماء. تخزينها على الثلج. |
| NP-40 | USB | 19628 | تحضير محلول 1٪ (حجم حجمي) في الماء. تخزينها على الثلج. |
| Tween 20 | Sigma | P2287 | |
| Slides Corning | 2948-75x25 | ||
| غطاء قياسي | Fisher | 12-544-E أو 12-540-B | |
| أغطية عالية الدقة | Fisher | 12-542-B | |
| Photo-Flo 200 solution | Kodak | P-7417 | تحضير محلول 0.2٪ (v / v) في الماء. |
| TBS | 137 ملي كلوريد الصوديوم ، 2.7 ملي كلوريد الصوديوم ، 24.7 ملي تريس ، درجة الحموضة 8 | ||
| BSA | سيجما | A2153 | قم بإعداد محلول 1٪ (وزن / حجم) في TBS. تخزينها في 4 درجات ؛ ج لمدة تصل إلى شهر. |
| المضاد الأساسي | |||
| Alexa Fluor 488 الحمار المضاد للأرانب | Invitrogen | A-21206 | |
| IgG (H + L) وسائط تركيب الأجسام المضادة | |||
| Vectashield مع | مختبرات DAPI Vector | H-1200 | |
| ProLong Gold | Invitrogen | P36930 | |
| صندوق الشرائح البلاستيكي | فيشر | 03-448-1 | قم بتخزين الشرائح التي تحتوي على دهن جاف في فتحات عند -20 درجة مئوية. أيضا ، استخدم كغرفة مبللة. |
| صندوق منزلق من الورق المقوى | فيشر | 12-587-10 | يستخدم لنقل الشرائح الملطخة / المختومة بسهولة أو تخزينها في درجة حرارة 4 درجة مئوية. |
| جرة كوبلين | فيشر | 08-816 | استخدم كحوض غسيل للشرائح. |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.