وافقت لجنة الاخلاق UQAM هذه البروتوكولات، التي هي وفقا للمبادئ التوجيهية للجنة الأخلاقيات من سانت لوك مستشفى مركز HOSPITALIER الجامعي مونتريال (مونتريال، كندا). وقع المشاركون على استمارة الموافقة المسبقة.
1. إعداد المتوسطة وعزل زغبي أرومة غاذية خلوية الابتدائية
- إعداد مستنبت لأرومة غاذية خلوية زغبي الإنسان الأساسية من خلال استكمال Dulbecco لتعديل المتوسطة النسر (DMEM) مع 25 ملي HEPES، و 10٪ مصل بقري جنيني (FBS) و 1٪ البنسلين / الستربتومايسين. تصفية المتوسطة استعداد من خلال معقم مرشح 0.22 ميكرون وتخزينها في الثلاجة -20 درجة مئوية في aliquots من 50 مل.
- عزل أرومة غاذية خلوية زغبي الأولية من مشيمة جديدة بعد البروتوكولات القياسية 3.
- باستخدام كماشة، وإزالة غشاء الجنين من الأنسجة عن طريق خدش عليه بلطف، مع الحرص على عدم إزالة الأنسجة زغبي. اقطع التبقى الزغابات المشيمية في مكعبات من حوالي 3 × 3 سم باستخدام مشرط ومقص. يغسل جيدا بالماء تحتوي على 0.9٪ كلوريد الصوديوم لإزالة دم الأم.
- عقد كل مكعب مع كماشة، وإزالة بعناية الأنسجة زغبي من السفن المتبقية ومقص النسيج باستخدام الليفية.
- لمدة 15 إلى 30 ملغ من الأنسجة زغبي، يهضم أربع مرات في محلول ملحي متوازن هانك (HBSS) التي تحتوي على التربسين (من 9.6 × 10 5-1،8 × 10 6 U، التركيز النهائي 1.2 ملغ / مل)، وديوكسي ريبونيوكلياز الأول (الدناز I) ( التركيز النهائي من 200 ميكروغرام / مل) لمدة 30 دقيقة عند 37 درجة مئوية في حمام مائي مع الهز المستمر.
ملاحظة: استخدم 150 مل الحجم الكلي لهضم الأول، و 100 مل لهضم الثاني و 75 مل لمدة المتبقية الهضم.
- جمع طاف تحتوي على خلايا متفرقة وأجهزة الطرد المركزي في 1250 x ج لمدة 15 دقيقة دون فرامل. إزالة طاف والخلايا resuspend في 1 مل من prewarmed DMEM تحتوي على1٪ البنسلين / الستربتومايسين.
- طبقة الخلايا المتفرقة على رأس متقطع 5٪ - 70٪ التدرج المغلفة بوفيدون السيليكا (انظر الجدول رقم 1 لإعداد التدرج) وأجهزة الطرد المركزي لمدة 23 دقيقة في 507 x ج من دون فرامل. إزالة طبقة كثافة بين 1،017-1،033 بواسطة الطموح وجمع طبقات تتراوح بين 40٪ و 50٪ في الانحدار مع ماصة جديدة. غسل الخلايا على نطاق واسع مع 10 مل من DMEM prewarmed تحتوي على 1٪ البنسلين / الستربتومايسين.
ملاحظة: الأجزاء المتجمعة يتوافق مع الكثافة بين 1.048 و 1.062، التي تؤوي أرومة مغذية. - عد الخلايا باستخدام عدادة الكريات. لفترة وجيزة، ومزيج الخلايا وإضافة 10 ميكرولتر في أنبوب microcentrifuge جديد. إضافة 10 ميكرولتر من اللون الأزرق التريبان وتخلط بلطف مرة أخرى. وضع تعليق خلية وملء غرف عدادة الكريات. عد الخلايا تحت الهدف 10X.
- ضع 1 × 10 6 و 4.5 × 10 6 الخلايا في أنابيب منفصلة للاستخدام في أقسام 1.3 و 2، خاص بهلاي. البذور الخلايا المتبقية في مناطق ذات كثافة من 1.5 × 10 6 خلايا / جيد في استكمال DMEM المتوسطة والثقافة في 37 درجة مئوية و 5٪ CO 2 لمدة أقصاها 4 أيام لتجارب أخرى.
- تقييم نقاء أرومة غاذية خلوية زغبي الأولية معزولة
- تدور 1 × 10 6 من أرومة غاذية خلوية المعزولة حديثا في أنابيب microcentrifuge في 300 × ز. تجاهل طاف وإضافة 1 مل من prewarmed الفوسفات مخزنة المالحة (PBS). خلايا الطرد المركزي في 300 x ج وإزالة PBS بواسطة الطموح.
- إضافة 1 مل من الميثانول الباردة إلى الخلايا واحتضان عند -20 درجة مئوية لمدة 20 دقيقة. خلايا الطرد المركزي في 300 x ج لمدة 5 دقائق وإزالة الميثانول بواسطة الطموح.
تحذير: استخدام قناع اسطوانة، نظارات السلامة والقفازات المطاطية أثناء التعامل مع الميثانول. - إضافة 1 مل من برنامج تلفزيوني في درجة حرارة الغرفة لترطيب الخلايا، الطرد المركزي في 300 x ج وإزالة PBS بواسطة الطموح.
- احتضان الخلايا في برنامج تلفزيوني تحتوي على FBS (01:50 [ت / ت] تمييع) وFCRحجب كاشف (01:10) لمدة 45 دقيقة في درجة حرارة الغرفة لقضاء ملزم انوعي.
- يغسل مرتين مع 500 ميكرولتر من درجة حرارة الغرفة في برنامج تلفزيوني، وخلايا الطرد المركزي في 300 x ج لمدة 5 دقائق وإزالة PBS بواسطة الطموح. Resuspend الخلايا في 100 ميكرولتر درجة حرارة الغرفة في برنامج تلفزيوني.
- احتضان الخلايا مع ثيوسيانات الماوس وحيدة النسيلة فلوريسئين (FITC) -conjugated مكافحة البشرية LP5K cytokeratin-7 الأجسام المضادة استنساخ (1: 200) أو isotype السيطرة المطابقة الأجسام المضادة غير محددة في برنامج تلفزيوني يحتوي على 0.2٪ BSA لمدة 45 دقيقة في درجة حرارة الغرفة في الظلام. غسل الخلايا في برنامج تلفزيوني.
- تحليل الخلايا عن طريق التدفق الخلوي 3. استخدام الاستعدادات الخلية، والتي تبرهن على الحد الأدنى من 96٪ خلايا إيجابية CK-7 التدفق الخلوي لمزيد من التجارب.
2. سيرنا ترنسفكأيشن الابتدائية زغبي أرومة غاذية خلوية الإنسان
- ترنسفكأيشن من أرومة غاذية خلوية زغبي الإنسان الأساسية باستخدام جهاز microporation
- إعداد 6 لوحات جيدة تحتوي على2 مل من المتوسط DMEM تستكمل لاحتضان خلايا microporated.
- بعد عزل أرومة غاذية خلوية الأولية (انظر القسم 1.2)، واتخاذ قسامة من الخلايا في تعليق وتحديد عدد الخلايا باستخدام عدادة الكريات.
- نقل 1.5 × 10 6 خلايا لأنبوب microcentrifuge وخلايا بيليه بواسطة الطرد المركزي في 300 x ج لمدة 5 دقائق في درجة حرارة الغرفة. غسل الخلايا مع 1 مل Dulbecco لبرنامج تلفزيوني (DPBS) (المغنيسيوم 2+، كا 2+ خالية) وبيليه الخلايا بواسطة الطرد المركزي في 300 x ج لمدة 5 دقائق في درجة حرارة الغرفة.
- إزالة طاف و resuspend الخلايا برفق في 100 ميكرولتر من العازلة إعادة تعليق.
ملاحظة: تجنب الاحتفاظ تعليق خلية لمدة أطول من 15-30 دقيقة في درجة حرارة الغرفة، وبقاء الخلية والكفاءة ترنسفكأيشن لتعظيم. - إضافة 300 نانوغرام من Syncytin-2 سيرنا (أو مشوشة تحكم سيرنا) إلى أنبوب microcentrifuge 1.5 مل، ونضح الخليط خلايا سيرنا باستخدام 100 ميكرولتر ترنسفكأيشن ماصة. إدراجماصة في محطة (انظر قائمة من المواد) وإخضاع الخلايا إلى نبض واحد من 30 ميللي ثانية 1300 V.
- على الفور نقل الخلايا إلى 6 لوحات جيدا (المعد في الخطوة 2.1.1) التي تحتوي على درجة حرارة ما قبل 37 ° C المتوسطة تستكمل لتجنب تلف الخلايا.
- كرر الخطوات من 2.1.5 و 2.1.6 لعينات المتبقية.
- صخرة بلطف لوحة لمدة 30 ثانية لضمان التوزيع العادل للخلايا. احتضان لوحة عند 37 درجة مئوية في ترطيب CO 2 حاضنة لل24-48 ساعة. تحديث مستنبت 24 ساعة بعد ترنسفكأيشن.
- تقييم كفاءة ترنسفكأيشن عن طريق تحليل لطخة غربية (انظر الخطوات 3-6).
- Lipofection من سيرنا في أرومة غاذية خلوية الإنسان الأساسية
- بعد عزل أرومة غاذية خلوية زغبي، البذور الخلايا في مناطق ذات كثافة من 1.5 × 10 6 خلايا لكل بئر في 6 لوحات جيدة في 2 مل من مستنبت واحتضان لمدة 18 ساعة.
- تمييع 300 نانوغرام من Syncytin-2-محددة سيرنا (أو سارعت ضبطسيرنا) و 5 ميكرولتر من الدهون على أساس ترنسفكأيشن الكاشف في منفصلة 1.5 مل الأنابيب في حجم ما مجموعه 10 ميكرولتر من المتوسطة antibiotic- وخالية من المصل. احتضان لمدة 5 دقائق.
- مزيج من الكواشف المخفف واحتضان لمدة 20 دقيقة إضافية في درجة حرارة الغرفة لتشكيل مجمع ترنسفكأيشن. إضافة 90 ميكرولتر من المتوسطة antibiotic- وخالية من المصل إلى المزيج إلى الحجم النهائي من 100 ميكرولتر.
- إزالة مستنبت من 6 لوحات جيدا (الخطوة 2.2.1). إضافة 2 مل من المتوسط الطازجة ومزيج ترنسفكأيشن 100 ميكرولتر إلى كل بئر. احتضان الخلايا عند 37 درجة مئوية في حاضنة CO 2 ل24 إلى 48 ساعة. تحديث مستنبت 24 ساعة بعد ترنسفكأيشن.
- تقييم كفاءة ترنسفكأيشن عن طريق تحليل لطخة غربية (انظر الخطوات 3-6).
3. إعداد لست] من ثقافة كله خلية
- إزالة وسائل الإعلام وشطف كل بئر (من خطوات 2.1.8 و 2.2.4) باستخدام DPBS استعد مسبقا (المغنيسيوم 2+، كا 2+ مجانا). نضح DPBS وإضافة 500 ميكرولتر من 0.25٪ التربسين ثنائي أمين الإيثيلين رباعي حمض الخل / (EDTA). احتضان لمدة 1-3 دقائق عند 37 درجة مئوية في حاضنة CO 2. إيقاف العلاج التربسين وذلك بإضافة 500 ميكرولتر من مصل يحتوي على وسائط النمو.
ملاحظة: استخدام حجم وسائل الإعلام المناسبة وفقا لنوع من قارورة / طبق: 1 مل لكل 10 7 خلية / 100 طبق ملم / 150 سم 2 قارورة. 0.5 مل لكل 5 × 10 6 خلايا / 60 طبق مم / 75 سم 2 قارورة. - نقل الخلايا إلى أنبوب microcentrifuge 1.5 مل، وخلايا بيليه بواسطة الطرد المركزي في 300 x ج لمدة 2 دقيقة في درجة حرارة الغرفة. غسل الخلايا مع DPBS (المغنيسيوم 2+، كا 2+ خالية) وخلايا بيليه بواسطة الطرد المركزي في 300 x ج لمدة 2 دقيقة في درجة حرارة الغرفة.
- إزالة بعناية طاف دون الإخلال بيليه. وضع أنبوب على الجليد. Resuspend وبيليه في 50-200 راديو مناعي الفحص (المعهد الملكي) العازلة الجليد الباردة ميكرولتر (انظر الجدول رقم 2 لتكوين عازلة) التي تحتوي على إضافة حديثاإد البروتيني ومثبطات إنزيم الفوسفاتيز بتركيز نهائي 1X. لفترة وجيزة، دوامة أنبوب وترك على الجليد لمدة 30 دقيقة.
- تدور في 16000 x ج لمدة 20 دقيقة على 4 درجات مئوية. وضع بعناية أنبوب على الجليد. باستخدام ماصة، طاف لنقل أنبوب microcentrifuge جديدة قبل تبريده أبقى على الجليد. تجاهل بيليه.
4. إعداد مقتطفات النووية من الخلايا المستزرعة
- لكل (الخطوة 1.2.5) جيدا، وغسل أرومة غاذية خلوية مثقف مرتين مع 1 مل من قبل تحسنت DPBS (المغنيسيوم 2+، كا 2+ مجانا). نضح DPBS وإضافة 500 ميكرولتر من 0.25٪ التربسين / EDTA. احتضان لمدة 1-3 دقائق عند 37 درجة مئوية في حاضنة CO 2 ووقف العلاج التربسين وذلك بإضافة 500 ميكرولتر من مصل يحتوي على وسائط النمو.
- نقل الخلايا إلى أنبوب microcentrifuge 1.5 مل، وخلايا بيليه بواسطة الطرد المركزي في 300 x ج لمدة 2 دقيقة في درجة حرارة الغرفة. غسل الخلايا مع DPBS (المغنيسيوم 2+، كا 2+ خالية) وخلايا بيليه بواسطة الطرد المركزيفي 300 x ج لمدة 2 دقيقة في درجة حرارة الغرفة. إزالة بعناية كل طاف دون الإخلال بيليه ووضع أنبوب على الجليد.
- استخراج البروتين النووي وفقا لتعليمات الشركة الصانعة. تحديد تركيز البروتين من كل عينة باستخدام فحص البروتين الكمي (برادفورد أو حمض bicinchoninic فحص (BCA)).
5. تحضير العينة والكهربائي
- تحديد تركيز البروتين لكل استخراج الخلايا باستخدام فحص البروتين الكمي (على سبيل المثال، برادفورد 8 أو BCA 9).
- وفقا لتعليمات الشركة الصانعة (إذا كان يمكن استخدام الأجسام المضادة في ظروف انخفاض وتمسخ)، إضافة حجم مساو من 2X Laemmli عينة العازلة (الجدول 2) إلى 20-30 ميكروغرام من البروتين الكلي.
- لست] خلية يغلي عند 100 درجة مئوية لمدة 5 دقائق. قسامة 50-100 ميكرولتر من المحللة لتجنب تكرار تجميد دورات / الذوبان وتخزين أنابيب المتبقية في -20 درجة مئوية لاستخدامها في المستقبل.
- في حين أن العينات يتم تسخين، وإعداد 1 لتر من 1X العازلة على التوالي (الجدول 2).
- تدور العينات في 16000 x ج لمدة بضع ثوان، ووضعها على الجليد.
- تحميل كمية متساوية من البروتين في كل بئر من 12٪ هلام SDS-PAGE (انظر الجدول رقم 2 لتكوين هلام)، جنبا إلى جنب مع الوزن الواسمات الجزيئية. تشغيل هلام ل1-2 ساعة على 100 V.
6. نقل البروتين من جل إلى غشاء
- تفعيل فلوريد البولي (PVDF) الغشاء مع الميثانول لمدة 1 دقيقة ويشطف نقل 1X حل العازلة / 10٪ الميثانول. وفقا لتعليمات الشركة الصانعة، ونقل لمدة 30 دقيقة إلى 1 ساعة اعتمادا على حجم البروتين.
ملاحظة: كفاءة نقل يمكن تقييم باستخدام الشقائقية الأحمر تلطيخ قبل خطوة الحجب.
7. تلوين الأجسام المضادة
- منع الغشاء لمدة 1 ساعة في درجة حرارة الغرفة أو بين عشية وضحاها في 4 درجة مئوية باستخدام 5٪ عرقلة الحل.
- احتضان الغشاء مع المضادة Syncytin-2-الأجسام المضادة (4 ميكروغرام / مل، 1: 5000) 6 أو مع مكافحة غليسيرألدهيد-3-فوسفات نازعة (GAPDH؛ 0.4 ميكروغرام / مل، 1: 500) في 5٪ عرقلة الحل بين عشية وضحاها في 4 ° C (مكافحة Syncytin-2) أو لمدة 45 دقيقة في درجة حرارة الغرفة. يغسل الغشاء ثلاث مرات في مخزنة المالحة تريس توين (TBST، انظر الجدول 2 لتكوين العازلة) لمدة 5 دقائق.
- احتضان الغشاء مع المناسبة البيروكسيديز الفجل (HRP) -conjugated المضادة للأرنب أو الأجسام المضادة لمكافحة فأر (1: 10000) في 5٪ عازلة تمنع في TBST في درجة حرارة الغرفة لمدة 1 ساعة. يغسل الغشاء ثلاث مرات في TBST لمدة 5 دقائق ثم يشطف في TBS. كشف الإشارات باستخدام الركيزة النشاف القائم على التوهج.
8. Radiolabeling من واحدة الذين تقطعت بهم السبل قليل النوكليوتيد
- رد فعل الفسفرة
- في أنبوب microcentrifuge، إضافة 50 نانوغرام من النوكليوتيد إلى الأمام جنبا إلى جنب مع 1X T4 عازلة عديد النوكليوتيد كيناز، 1 UT4 كيناز عديد النوكليوتيد و 20 μCi (γ- 32 P) ATP وتشكل حجم رد الفعل إلى 20 ميكرولتر مع nuclease خالية من المياه.
- احتضان عند 37 درجة مئوية لمدة 30 دقيقة. وقف رد فعل عن طريق إضافة 5 ميكرولتر من 0.5 M EDTA. تشكل وحدة التخزين إلى 50 ميكرولتر مع nuclease خالية من المياه.
- إزالة النيوكليوتيدات الفردية من أليغنوكليوتيد]
- إعداد العمود G-25 معايرتها مع العازلة TE (الجدول 2) بعد تعليمات الشركة الصانعة. وضع عمود في 1.5 مل أنبوب microcentrifuge خالية الدناز جديدة.
- ببطء إضافة 50 ميكرولتر من التحقيق (من الخطوة 8.1.2) على الراتنج، والحرص على عدم تعكير صفو السرير الراتنج. تدور لمدة 2 دقيقة في 350 x ج لجمع عينة النقاء في أنبوب microcentrifuge 1.5 مل. غسل العمود G-25 مع 36 ميكرولتر من nuclease خالية من المياه وتدور لمدة 2 دقيقة في 350 x ج لأنه جمع في أنبوب microcentrifuge.
- التهجين مع رأ حبلا التكميليةigonucleotide
- نقل التحقيق رديولبلد (86 ميكرولتر) إلى أنبوب microcentrifuge 1.5 مل وإضافة 200 نانوغرام من قليل النوكليوتيد العكسي و1X العازلة الصلب (الجدول 2). الحرارة 5 دقائق في درجة حرارة 95 درجة مئوية، وتترك ليلة وضحاها في درجة حرارة الغرفة لتبريد.
- إعداد أليغنوكليوتيد المزدوج تقطعت بهم السبل غير المشعة عن طريق إضافة 50 نانوغرام من ليس لها علامة إلى الأمام وعكس أليغنوكليوتيد و1X العازلة الصلب في أنبوب microcentrifuge 1.5 مل. تشكل وحدة التخزين إلى 100 ميكرولتر مع nuclease خالية من المياه. الحرارة والحفاظ على درجة حرارة الغرفة كما هو موضح في الخطوة 8.3.1.
9. إعداد عدم تغيير طبيعة بولي أكريلاميد جل لEMSA
- إعداد 4٪ هلام الأصلي (10 × 12 سم) مع 1.5 ملم الفضاء مشط (انظر الجدول رقم 2 لتكوين هلام). تنظيف جميع لوحات الزجاج باستخدام الماء المقطر.
ملاحظة: من المهم للغاية أن لوحات تكون خالية تماما من المنظفات الأيونية، مثل SDS. - على الفور صلدينا الحل الأكريلاميد في بين لوحات والسماح البلمرة للمضي قدما (حوالي 30 دقيقة).
- تجميع الأجهزة الكهربائي وملء خزان مع TBE 0.5X. قبل تشغيل هلام لمدة 30 دقيقة إلى 1 ساعة على 150 V قبل تحميل عينة.
10. الحمض النووي ملزم رد الفعل
- في أنبوب microcentrifuge 1.5 مل، إضافة 10 ميكروغرام من استخراج النووي (الخطوة 4.3) في 1X جل ملزم التحول عازلة (الجدول 2) ويشكلون الحجم النهائي إلى 10 ميكرولتر مع nuclease خالية من المياه. كعنصر تحكم، وإعداد أنبوب مع عدم وجود مستخلص النووي. للتفاعل المنافسة، إضافة 1 ميكرولتر من النوكليوتيد البارد غير محددة أو معينة المزدوج تقطعت بهم السبل (الخطوة 8.3.2).
- إضافة 1 ميكرولتر من التحقيق المشع من الخطوة 8.3.1 لكل رد فعل. احتضان رد الفعل في درجة حرارة الغرفة لمدة 20 دقيقة. إضافة 1 ميكرولتر من العازلة تحميل 10X جل في رد الفعل وتحميل كل عينة على هلام أعدت في الباب 9.
- تشغيل هلام ل1 1/2 إلى 2 ساعة على 150 خامسا بعد الهجرة، والتفاف جل والزجاج في غلاف بلاستيكي وموقف في الكاسيت التعرض أدناه شاشة الفوسفور. ترك كاسيت عند 4 درجة مئوية لمدة 24 ساعة.
- إزالة الشاشة من الكاسيت التعرض وضعه في الجهاز الفوسفور التصوير للمسح الضوئي.