انتشار علم الأمراض ليوي، والتي pS129-αsyn هو المكون الرئيسي، هو السمة المميزة الهدولوجية من PD. وقف أو إبطاء تراكم pS129-αsyn تجميعها قد تبطئ انحطاط الخلايا العصبية الدوبامين وتطور ألفا سينوكلين. ومع ذلك, فهم ميكانيكي لكيفية pS129-αsyn التجميع يساهم في زوال الخلايا العصبية الدوبامين لا يزال يتعين أن تنشأ. الأدلة من الدراسات بعد الوفاة البشرية على عينات الدماغ من المرضى في مراحل مختلفة من المرض، فضلا عن مراقبة إدراج PS129-αsyn الإيجابية في الخلايا العصبية الجنينية المزروعة يوحي بقوة انتشار علم الأمراض ليوي بين الخلايا16,17,33. وبالتالي، فإن انتشار pS129-αsyn الشبيه بريون تم تلخيصه مؤخرًا باستخدام PFFs α-synuclein9،10. إنشاء قوية, فعالة من حيث التكلفة, نسبيا عالية أو متوسطة الإنتاجية نموذج من PS129-αsyn انتشار وتراكم, على وجه التحديد في الخلايا العصبية الدوبامين, يمكن أن تسرع إلى حد كبير في البحث عن العلاجات الجديدة والمركبات تعديل هذه العملية.
لأن فقدان الخلايا العصبية الدوبامين هو السبب الرئيسي للاعراض الحركية في PD وهذه الخلايا تمتلك العديد من الخصائص الفريدة2,34,35, النمذجة من انتشار مثل بريون pS129-αsyn في الخلايا العصبية الدوبامين هو النوع الأكثر صلة من نموذج من منظور الترجمة. وقد وصفت البروتوكولات التي تستخدم الثقافات الجزرية الصغيرة من الخلايا العصبية في منتصف القرنية الجنينية على 4 لوحات جيدا وتكميم نصف آلي سابقا18. تم تكييف البروتوكول الموصوف هنا مع 96 صفيحة بئر ويوفر إعدادًا أقل جهدًا للجزر الصغيرة ، مما يسمح بإعداد ما يصل إلى أربع لوحات تحتوي على 60 بئرًا لكل بئر من قبل باحث متمرس خلال يوم عمل واحد. زراعة الخلايا العصبية الدوبامين في 96 لوحات جيدا يسمح لاختبار المخدرات بكميات أقل وتمكن من معدلات تحويل عالية مع ناقلات فيروس العدس. من الممكن أيضًا الجمع بين العلاجات المختلفة لإجراء تجارب أكثر تعقيدًا.
قبل تطبيق أي علاجات (بما في ذلك PFFs)، يجب التحقق من جودة الاستزراع باستخدام المجهر مشرق المجال. إذا كان نظام المجهر لا يستخدم غرفة CO2 مع التدفئة، وينبغي عدم الاحتفاظ الخلايا خارج الحاضنة لأكثر من بضع دقائق، وذلك لأن الخلايا العصبية الرئيسية الدوبامين الماوس حساسة وشدد بسهولة. لنفس السبب، ينصح بأن التصوير الأول يجب أن يتم بعد 24 ساعة من الحضانة (بين DIV1-DIV3). وينبغي أن تظهر الخلايا على قيد الحياة مع الهيئات الخلية الحالية وتنتشر بشكل متجانس داخل الجزيرة الصغيرة. كانت الخلايا العصبية الأولية قد استقرت على الأرض المغلفة PO وبدأت في إنشاء إسقاطات عصبية. من الممكن ملاحظة كتلة صغيرة من الخلايا (أي قطر أصغر من 150-200 ميكرومتر) التي يمكن تشكيلها إذا لم يتم إجراء عملية التثابت بشكل صحيح أو كانت كثافة الطلاء أعلى من الموصى بها. هذه الكتل الصغيرة لن تؤثر على التجربة، إلا إذا كانت أكثر من عدد قليل في البئر و / أو أكبر. الخلايا المتجمعة تجعل من الصعب جدا تحديد علامات المناعة الكيميائية والخلايا الفردية أثناء تحليل الصورة. فمن الضروري تجنب مثل هذه الكتل عن طريق طلاء دقيق، triturating، والسيطرة على كثافة الطلاء. وإذا تعذر ملاحظة اتساق هذه الظروف في بعض الآبار، فلا تدرج هذه الآبار المعيبة في التجربة. وينبغي أن يتم هذا الاستبعاد قبل تنفيذ أي علاجات.
وعلاوة على ذلك، فإن استخدام 96 لوحة من الآبار يسمح باستخدام الماصات المتعددة القنوات أثناء إجراءات التلطيخ والتصور المباشر مع المجاهر التلقائية للصفائح، مما يزيد من الإنتاجية. ولا غنى عن استخدام القياس الآلي للصورة لتحليل البيانات من منصات التصوير عالية المحتوى. بالإضافة إلى القدرة على معالجة آلاف الصور التي تم الحصول عليها من كل تجربة ، فإنه يضمن تحديدًا كميًا غير متحيزًا مطابقًا لجميع مجموعات العلاج. ويستند سير العمل المقترح لتحليل الصورة على مبادئ بسيطة من تقسيم الخلايا العصبية الدوبامين, تصفية الخلايا المجزأة بشكل صحيح عن طريق التعلم الآلي تحت إشراف, وبعد ذلك quantification من الأنماط الظاهرية (pS129-αsyn إيجابية وpS129-αsyn السلبية), مرة أخرى من خلال التعلم الآلي تحت إشراف. على الرغم من أن العديد من النهج المختلفة لهذه المهمة يمكن تصورها, لقد وجدنا مزيج من تجزئة مع التعلم الآلي لتكون أقوى لثقافات الدوبامين بسبب كثافة الطلاء عالية, الأشكال المتنوعة من الخلايا العصبية الدوبامين, ووجود نيوريت ملطخة بقوة. تم تنفيذ خوارزمية تحليل الصور المقترحة في CellProfiler و CellProfiler المحلل ، مفتوحة المصدر ، متاحة بحرية عالية المحتوى صورة تحليل البرمجيات26،27. ويمكن أيضا تنفيذ الخوارزمية مع برامج أخرى لتحليل الصور، إما مفتوحة المصدر (مثل ImageJ/FIJI، KNIME) أو الملكية. ومع ذلك ، في تجربتنا هذه غالبا ما تضحي قدرات التخصيص لسهولة الاستخدام ، وبالتالي قد لا يكون أداء جيدا في التحليلات المعقدة. لقد وجدنا أن CellProfiler و CellProfiler محلل حزم البرامج تعطي نتائج موثوق بها بشكل خاص من خلال الجمع بين عدد كبير من الخوارزميات المنفذة ، والمرونة القصوى في تصميم سير العمل ، والتعامل مع البيانات ذات المحتوى العالي ومعالجتها بكفاءة.
ويمكن أيضاً تكييف البروتوكول الموصوف لتحديد كميّة الأنماط الظاهرية الخلوية الأخرى التي تتميز بالمناعة مع الأجسام المضادة المختلفة، مثل علامات مجموعات الخلايا العصبية الأخرى (مثل DAT و GAD67 و5-HT إلخ) ومجاميع البروتين (مثل فوسبو تاو، أوبيكيتين). ويمكن أيضاً الجمع بين عدة علامات فلورية للتمييز بين أنماط ظاهرية متعددة (على سبيل المثال، الخلايا التي تحتوي على اضمائر في مراحل مختلفة من النضج). وينبغي أيضا أن يكون من السهل تنفيذ التصنيف الآلي للعلامات الظاهرية المتعددة في خطوط أنابيب تحليل الصور الموصوفة بمجرد إضافة قناة تحتوي على صور مناعية لعلامات إضافية إلى خطوات القياس وفرز الخلايا في صناديق متعددة. ومع ذلك، فإن استخدام علامات متعددة في الوقت نفسه يتطلب تحسين ظروف الكبت المناعي والتصوير. بالإضافة إلى ذلك، لتحسين جودة التصوير المناعي، ينصح باستخدام خاص أسود الجدران 96 لوحات جيدا مصممة خصيصا للمجهر الفلورسنت. ومع ذلك، يمكن أن تكون هذه أكثر تكلفة بكثير من لوحات ثقافة الخلية القياسية، والتي تكون كافية للتحليل الموضح في بروتوكول لدينا.
إن نوع ونوعية PFFs المستخدمة أمران حاسمان بالنسبة لنتائج التجارب. PFFs يمكن أن تؤثر على كل من قوة من المقايسة وتفسير النتائج. وقد تؤثر ظروف التحضير على كفاءة البذر من PFFs ، وبالفعل ، PFF "سلالات" مع خصائص فسيولوجية مختلفة وقد تم الإبلاغ عن36. ومع ذلك، فإن إعداد PFFs والتحقق من صحتها خارج نطاق هذه المقالة وقد تم وصفها في العديد من المنشورات11و28و29و30. وبالإضافة إلى بروتوكول الإعداد، ينبغي النظر في أنواع منشأ α-synuclein في PFFs (مثل الفأر والإنسان) واستخدام النوع البري أو البروتين المتحول (مثل الإنسان A53T α-synuclein) حسب الظروف التجريبية الخاصة. وقد تبين أن تحريض تراكم pS129-αsyn من قبل PFFs يعتمد على عمر الثقافة (أي أيام في المختبر) ، مع ثقافات أكثر نضجا تظهر التعريفي أكثر وضوحا11. وربما يرجع ذلك إلى زيادة عدد الاتصالات العصبية في الثقافات الأكثر نضجا، وزيادة مستويات البروتين α-synuclein. في أيدينا, أعطى العلاج مع PFFs في DIV8 النتائج الأكثر قوة, مع تراكم واضح من pS129-αsyn في السوما الخلايا العصبية الدوبامين, في حين لا المساس البقاء على قيد الحياة العصبية. البروتوكول الموصوف مناسب تمامًا لدراسة العلاجات التي تعدل الأحداث المبكرة مما يؤدي إلى تجميع α-synuclein الذاتية لأننا نقوم بقياس التضمينات الإيجابية pS129-αsyn في وقت مبكر نسبيًا ، بعد 7 أيام من التطعيم مع PFFs. في هذه المرحلة، تكون التضمينات داخل الجسم موجودة في جزء كبير من الخلايا ويمكن تمييزها بسهولة عن طريق الكبت المناعي في حين لا يلاحظ موت الخلايا الناجم عن PFF، مما يبسط تفسير النتائج. الأهم من ذلك، كما يمكن أن تتغير مورفولوجيا وتكوين إدراجات الناجمة عن PFF مع مرور الوقت12،13، البروتوكول الموصوف ، من حيث المبدأ ، يمكن تعديلها لدراسة إدراج أكثر نضجا عن طريق التثبيت والمناعة في وقت لاحق من النقاط. ومع ذلك, الحفاظ على الخلايا العصبية الدوبامين في الثقافة لفترة أطول من 15 يوما يتطلب عناية بالغة, وقد تحفز على الاختلاف إضافية بسبب فشل الخلايا في البقاء على قيد الحياة بشكل مستقل عن التطعيم PFF. وبالإضافة إلى ذلك، فإن الثقافات الأكثر توسعاً تعقد جداول العلاج من المخدرات. العديد من المركبات محدودة أو لا تتميز بشكل سيئ الاستقرار في خلية ثقافة المتوسطة، وتجديد المخدرات ليست تافهة لأن التبادل الكامل للوسط يعرض للخطر بقاء الثقافات الدوبامين.
يتم الإبلاغ عن استقلاب α-synuclein في Ser129 باستمرار في نماذج مستندة إلى PFF من تجميع α-synuclein وتجميل مع علامات من الطي والتجميع مثل ثيوفلافين S، أو ubiquitin، أو الأجسام المضادة للتكين11،12. في أيدينا، والمناعة لpS129-αsyn يعطي أيضا أقوى إشارة مع أدنى الخلفية والأكثر مباشرة لتحليل، وإعطاء نتائج قوية عندما يتم فحص علاجات متعددة. الأهم من ذلك، لا يكشف الكبت المناعي بالأجسام المضادة pS129-αsyn PFFs التي تبقى خارج الخلايا، مما يقلل بشكل كبير من الخلفية. ومع ذلك، من المهم أن نتذكر أن Ser129 الفوسفور هو على الأرجح واحدة من العمليات الأولى المرتبطة باختلال α-synuclein وقد يتم تنظيمها بشكل مختلف في ظل ظروف محددة. ولذلك، ينبغي تأكيد أي نتائج تظهر آثار إيجابية على pS129-αsyn من قبل علامات أخرى.
وينبغي أن يصمم التحليل الإحصائي وفقا للتصميم التجريبي. من الضروري إجراء التجارب في ما لا يقل عن ثلاثة نسخ بيولوجية مستقلة (أي، ثقافات الخلايا العصبية الأولية المنفصلة). وينبغي أن تكون مطلية هذه النسخ المتماثلة على لوحات مختلفة وتعامل بشكل مستقل. نحلل البيانات التي تم الحصول عليها من النسخ المتماثلة على لوحات مختلفة مع تصميم كتلة عشوائية ANOVA37 لتأخذ في الاعتبار الاقتران من البيانات للوحات تجريبية مختلفة.