يفصل هذا البروتوكول خطوات تكوين الحشرات المستهدف CRISPR/Cas9 في ذباب الرمل: جمع الأجنة، والحقن، وتربية الحشرات، وتحديد الهوية، فضلا عن اختيار الطفرات ذات الاهتمام.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
مقالة منهجية
يفصل هذا البروتوكول خطوات تكوين الحشرات المستهدف CRISPR/Cas9 في ذباب الرمل: جمع الأجنة، والحقن، وتربية الحشرات، وتحديد الهوية، فضلا عن اختيار الطفرات ذات الاهتمام.
الذباب الرملي هو النواقل الطبيعية لأنواع الليشمانيا ، الطفيليات البروتوزوانية التي تنتج طيفا واسعا من الأعراض التي تتراوح بين الآفات الجلدية إلى علم الأمراض الحشوي. فك طبيعة التفاعلات ناقلات / الطفيلي هو ذات أهمية أساسية لفهم أفضل لانتقال الليشمانيا إلى مضيفيهم. ومن بين البارامترات التي تتحكم في كفاءة ناقلات ذبابة الرمل (أي قدرتها على حمل مسببات الأمراض ونقلها)، تبين أن البارامترات المتأصلة في هذه الحشرات تلعب دورا رئيسيا. الاستجابة المناعية للحشرات ، على سبيل المثال ، تؤثر على كفاءة ناقلات ذبابة الرمل إلى الليشمانيا. وكانت دراسة هذه المعلمات محدودة بسبب عدم وجود أساليب لتعديل التعبير الجيني مكيفة للاستخدام في هذه الكائنات غير النموذجية. التنظيم الجيني من قبل الجيش الملكي النيبالي التدخل الصغيرة (siRNA) ممكن، ولكن بالإضافة إلى كونها صعبة من الناحية الفنية، وإسكات يؤدي إلى فقدان جزئي فقط للوظيفة، والتي لا يمكن أن تنتقل من جيل إلى جيل. تم مؤخرا تكييف mutagenesis المستهدفة من قبل التكنولوجيا CRISPR / Cas9 لذبابة الرمال Phlebotomus papatasi. تؤدي هذه التقنية إلى توليد طفرات قابلة للإنتهاك في مكان تم اختياره خصيصا ، مما يسمح بدراسة الجينات ذات الاهتمام. يعتمد نظام CRISPR/Cas9 على تحريض فواصل الحمض النووي المزدوجة المستهدفة ، التي تم إصلاحها لاحقا إما عن طريق الانضمام إلى النهاية غير المثلية (NHEJ) أو عن طريق إصلاح مدفوع بالهومولوجيا (HDR). يتكون NHEJ من إغلاق بسيط للكسر ويؤدي في كثير من الأحيان إلى أحداث الإدراج / الحذف الصغيرة. في المقابل ، يستخدم HDR وجود جزيء الحمض النووي المانح الذي يشارك علم الأوهام مع الحمض النووي المستهدف كنموذج للإصلاح. هنا ، نقدم طريقة التجميل الدقيق لجنين ذبابة الرمل للطفرات المستهدفة من قبل CRISPR / Cas9 باستخدام NHEJ ، وهي تقنية تعديل الجينوم الوحيدة المكيفة مع ناقلات ذبابة الرمل حتى الآن.
تشكل الأمراض المنقولة بالنواقل تهديدا رئيسيا للصحة العامة في تطور مستمر. مئات الأنواع الناقلة المنتشرة عبر أسر فيلوجينية متميزة جدا (مثل البعوض والقراد والبراغيث) هي المسؤولة عن انتقال عدد كبير من مسببات الأمراض الميكروبية، مما يؤدي إلى أكثر من 700،000 حالة وفاة بشرية سنويا، وفقا لمنظمة الصحة العالمية. ومن بين الحشرات الناقلة، يشكل ذباب الرمل البلوبوتومين (Diptera, Psychodidae) مجموعة واسعة، حيث يظهر 80 نوعا من ناقلات الأمراض المثبتة سمات وصفية وقدرات متجهية متميزة موجودة في مناطق جغرافية مختلفة. وهي ناقلات لطفيليات البروتوزوان من جنس الليشمانيا، مما تسبب في حوالي 1.3 مليون حالة جديدة من الليشمانيات وبين 20،000 و 30،000 حالة وفاة سنويا. نتائج الليشمانيات السريرية متنوعة ، مع أعراض تتراوح بين الآفات الجلدية ذاتية الحد إلى النشر الحشوي الذي هو قاتل في غياب العلاج.
ذباب الرمل هي الحشرات الأرضية البحتة. تستمر دورة حياتها، الطويلة نسبيا مقارنة ب Diptera الأخرى، لمدة تصل إلى ثلاثة أشهر، اعتمادا على معايير مختلفة مثل درجة الحرارة والرطوبة والتغذية. وهو يتألف من مرحلة جنينية واحدة (من 6 إلى 11 يوما)، وأربع مراحل يرقية (تدوم ما مجموعه 23 إلى 25 يوما) ومرحلة جروة واحدة (من 9 إلى 10 أيام) يليها التحول ثم البلوغ. الذباب الرملي يتطلب بيئة رطبة ودافئة للتربية. يتغذى كل من الذكور والإناث على السكريات ، التي يتم الحصول عليها في البرية من رحيق الزهور. الإناث فقط هي مغذيات الدم، لأنها تتطلب البروتينات التي تم الحصول عليها من وجبة الدم لإنتاج البيض1.
ومن مجالات التركيز الهامة للبحوث تحديد طبيعة التفاعلات بين ناقلات الأمراض/الطفيليات التي تؤدي إلى تطور العدوى المنقولة. وكما هو الحال مع الحشرات الناقلة الأخرى، ثبت أن البارامترات المتأصلة في ذباب الرمل تؤثر على كفاءتها في ناقلات الأمراض، والتي تعرف بأنها قدرتها على حمل مسببات الأمراض ونقلها إلى مضيفيهم. على سبيل المثال ، يمكن للتعبير عن galectins بواسطة الرمال Phlebotomus papatasi يطير الخلايا midgut ، بوصفها مستقبلات التعرف على مكونات سطح الطفيلي ، تؤثر مباشرة على كفاءتها ناقلات للليشمانيا الرئيسية2،3. مسار الاستجابة المناعية للحشرات ، نقص المناعة (IMD) ، هو أيضا حاسم لكفاءة ناقلات ذبابة الرمال Phlebotomus papatasi للليشمانيا الرئيسية 4. كما تم الإبلاغ عن دور حاسم لمسارات الاستجابة المناعية للحشرات الناقلة في السيطرة على انتقالها لمسببات الأمراض المعدية في بعوض Aedes aegypti 5و6و7، في ذبابة تسيتسي Glossina morsitans8، وفي بعوض Anopheles gambiae 9،10.
وقد تم الحد من دراسات ذبابة الرمل /التفاعلات الليشمانيا بسبب عدم وجود طرق تعديل التعبير الجيني تكييفها للاستخدام في هذه الحشرات. فقط تنظيم الجينات من قبل الجيش الملكي النيبالي التدخل الصغيرة (siRNA) قد أجريت11،12،13،14 حتى وقت قريب. ولا تؤدي هذه التقنية، التي تحد منها الوفيات المرتبطة بالحرمان الدقيق للإناث البالغات، إلا إلى فقدان جزئي للوظيفة، لا يمكن أن ينتقل من جيل إلى جيل.
أحدثت تقنية CRISPR/Cas9 ثورة في البحوث الجينومية الوظيفية في الكائنات غير النموذجية مثل ذباب الرمل. تم تعديل نظام المناعة التكيفي في prokaryotes للدفاع ضد البكتيريا15،16، تم تكييف نظام CRISPR Cas9 بسرعة كأداة لتحرير الجينوم للكائنات الحية eukaryotic متفوقة ، بما في ذلك الحشرات. ويستند مبدأ CRISPR/Cas9 المستهدفة الجينوم التحرير على التكامل من الحمض النووي الريبي دليل واحد (sgRNA) إلى مكان الجينوم محددة. ترتبط نواة Cas9 بالسرنا وتخلق كسر الحمض النووي المزدوج (dsDNA) في الحمض النووي الجينومي حيث يرتبط sgRNA بتسلسلها التكميلي. يتم توجيه مجمع Cas9-sgRNA إلى التسلسل المستهدف من خلال 17 إلى 20 قاعدة تكميلية في sgRNA إلى الموضع المختار ، ويمكن بعد ذلك إصلاح كسر dsDNA بواسطة مسارين مستقلين: نهاية انضمام nonhomologous (NHEJ) أو إصلاح موجهة بالهومولوجيا (HDR)17. إصلاح NHEJ ينطوي على إغلاق بسيط للكسر ولكن كثيرا ما يؤدي إلى أحداث الإدراج / الحذف الصغيرة. إصلاح الحمض النووي من خلال تقرير التنمية البشرية يستخدم جزيء الحمض النووي المانحة تقاسم homology مع الحمض النووي الهدف كنموذج للإصلاح. تمتلك الحشرات كلا الجهازين.
يمكن أن تولد تقنية CRISPR/Cas9 طفرات في مكان مختار ، من خلال مسار إصلاح NHEJ ؛ أو لاستراتيجيات تحرير الجينوم الأكثر تعقيدا، مثل طرق أو مراسلي التعبير، من خلال مسار HDR مع قالب المانح المناسب. في ذباب الرمل ، تم إنشاء الأليل المتحولة الخالية من عامل الاستجابة المناعي Relish من خلال CRISPR بوساطة NHEJ في Phlebotomus papatasi4. كما تم حقن أجنة ذبابة الرمل في دراسة أخرى مع مزيج CRISPR/Cas9 الذي يستهدف ترميز الجينات الأصفر. ومع ذلك ، لم يتم إنتاج أي بالغين يحملون الطفرة18. ونصف هنا طريقة مفصلة لتولد ذبابة الرمل المستهدفة من قبل CRISPR/Cas9 بوساطة NHEJ ، مع التركيز بشكل خاص على التجميل الدقيق للجنين ، وهي خطوة حاسمة في البروتوكول.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
تم استخدام الفئران كمصدر للدم لتغذية ذبابة الرمل وفقا للتوصيات الواردة في دليل رعاية واستخدام المختبر للمعاهد الوطنية للصحة (NIH). تمت الموافقة على البروتوكول من قبل لجنة رعاية الحيوان واستخدامه من NIAID ، المعاهد القومية للصحة (رقم البروتوكول LPD 68E). اللافقاريات غير مشمولة بالمبادئ التوجيهية للصحة القومية للصحة.
1. إعداد إبرة (الشكل 1)
2. جمع الأجنة وmicromanipulation (الشكل 2)
3. حقن الأجنة (الشكل 3)
4. تربية ما بعد الحقن (G0) (الشكل 4)
5. اختيار وفحص الأليل متحولة (الشكل 5)
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
تم إنشاء بروتوكول CRISPR/Cas9 microinjection الموصوف هنا لتوليد طفرات ذبابة الرمل في منشور سابق4. وقد أدى هذا النهج إلى توليد طفرات عالية الكفاءة، حيث نجا 11 فردا من أصل 540 شخصا من هذا الإجراء، منهم 9 متحولين. عند تصميم أدلة لطفرة CRISPR/Cas9 ، فإن الخطوة الأولى الحرجة هي تسلسل المنطقة المحيطة بالمنطقة التي سيتم استهدافها. يجب أن يكون نموذج التسلسل من السلالة التي سيتم استخدامها كمصدر للأجنة للحقن. ومن الخطر الاعتماد فقط على تسلسل الجينوم المنشور لتصميم الأدلة. ليس من غير المألوف أن يكون هناك اخت...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
نحن نقدم هنا طريقة التلقيح الدقيق الجنين التي تم تطويرها مؤخرا لتولد الطفرات المستهدفة من قبل CRISPR / Cas9 في ذباب الرمال Phlebotomus papatasi. تم تطوير الميكرونجيكشن الجنيني للتعديل الوراثي للحشرات في دروسوفيلا في منتصف الثمانينيات21 ويستخدم الآن بشكل روتيني في مجموعة واسعة من الحشرات. تم تطوير طرق أخرى لتوصيل مواد التعديل الوراثي لاستخدامها في الحشرات ، مثل ReMOT20و21و22و
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
يشكر المؤلفون فانيسا ميلدينر هاريل على القراءة النقدية للمخطوطة.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| ورق ترشيح أسود 4.25 سم PK100 | VWR | 28342-012 | مقطعة إلى مستطيلات مقاس 46 × 22 مم تقريبا. يتم وضعها بين الشريحة والغطاء وتعمل كطبقة أساسية رطبة للأجنة أثناء الحقن. |
| Coverslips | Fisher Scientific | 12-543A | |
| تشريح المجهر | أي علامة تجارية | لمحاذاة الأجنة شرائح | |
| زجاجية | Fisher Scientific | 12-550-A3 | الطبقة الأساسية من إعداد الحقن المجهري الشكل 2 أ |
| قفص حشرات | مخصص أو عدة خيارات | تجاريةقفص البولي كربونات للبالغين الذين يحملون وتزاوج محامي ، فيليب ، ميراي كيليك كندريك ، توبين رولاند ، إدغار روتون ، وبيتر فولف. “ الاستعمار المختبري والتربية الجماعية لذباب الرمل الفليبوتومين (Diptera ، Psychodidae)." الطفيلي 24. تم الوصول إليه في 6 أغسطس 2020. https://doi.org/10.1051/parasite/2017041. | |
| طعام اليرقات | المخصص | مزيجا من طعام الأرانب وبراز الأرانب المحامي ، فيليب ، ميراي كيليك كندريك ، توبين رولاند ، إدغار روتون ، وبيتر فولف. " الاستعمار المختبري والتربية الجماعية لذباب الرمل الفليبوتومين (Diptera ، Psychodidae)." الطفيلي 24. https://doi.org/10.1051/parasite/2017041. | |
| مايكروكابس 100 مل | دروموند | 1-000-1000 | تستخدم لملء إبر الحقن المجهري |
| شفاط الفم | جون دبليو هوك شركة | موديل 612 | شفاط الفم مع فلتر HEPA |
| أوليمبوس SZX12 | علوم | المجهر الحقن | |
| المجهري شركة Ovipots | Nalge | تصنع أوعية البيض من برطمانات بلولي بروبيلين ذات جوانب ضيقة سعة 125 مل أو 500 مل تم تعديلها عن طريق حفر ثقوب 2.5 سم في الأسفل ومليئة ب 1 سم من الجص في باريس. المحامي ، فيليب ، ميراي كيليك كندريك ، توبين رولاند ، إدغار روتون ، وبيتر فولف. “ الاستعمار المختبري والتربية الجماعية لذباب الرمل الفليبوتومين (Diptera ، Psychodidae)." الطفيلي 24. تم الوصول إليه في 6 أغسطس 2020. https://doi.org/10.1051/parasite/2017041. | |
| فرشاة الطلاء 6-0 | أي شركة توريد | فنية غير | مستخدمة لمحاذاة الأجنة |
| حمض البروبيونيك | سيجما ألدريتش | 402907 | عامل مضاد للفطريات |
| الشعيرات الدموية الزجاجية القياسية | أدوات الدقة العالمية | 1B100-3 | تستخدم لصنع إبر الحقن المجهري |
| وحدة تحكم Trio-MPC100 و MP845 مناور | أدوات الحقن | و معالج دقيق |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.