1. تحضير الأنبوب البلوري والفلتر
2. إضافة العينة إلى الأنبوب البلوري
3. نمو البلورات
4. اختيار الكريستال

الشكل 1. صورة لمرشح الماصة. تم تثبيت قطعة صغيرة من المناديل الخالية من النسالة بإحكام عند عنق زجاجة الماصة. يتم تمرير المحاليل من خلال مرشحات الماصة هذه قبل إدخالها إلى الأنبوب البلوري.

الشكل 2. بمجرد وضع المحلول الذي يحتوي على مركب مستهدف في الأنبوب البلوري ، يتم وضع المضاد للمذيبات ببطء في الأعلى عن طريق تمريره عبر مرشح ماصة جديد.
المصدر: مختبر الدكتور جيمي فرانكو - كلية ميريماك
علم البلورات بالأشعة السينية هو طريقة شائعة الاستخدام لتحديد الترتيب المكاني للذرات في مادة صلبة بلورية ، مما يسمح بتحديد الشكل ثلاثي الأبعاد للجزيء أو المركب. يعد تحديد الهيكل ثلاثي الأبعاد للمركب ذا أهمية خاصة ، نظرا لأن بنية المركب ووظيفته مرتبطة ارتباطا وثيقا. غالبا ما تستخدم المعلومات حول بنية المركب لشرح سلوكه أو تفاعله. هذه واحدة من أكثر التقنيات المفيدة لحل الهيكل ثلاثي الأبعاد لمركب أو مركب ، وفي بعض الحالات قد تكون الطريقة الوحيدة القابلة للتطبيق لتحديد الهيكل. تعد زراعة بلورات جودة الأشعة السينية المكون الرئيسي لعلم البلورات بالأشعة السينية. غالبا ما يعتمد حجم وجودة البلورة بشكل كبير على تكوين المركب الذي يتم فحصه بواسطة علم البلورات بالأشعة السينية. عادة ما تنتج المركبات التي تحتوي على ذرات أثقل نمط حيود أكبر ، وبالتالي تتطلب بلورات أصغر. بشكل عام ، تعتبر البلورات المفردة ذات الوجوه المحددة جيدا هي الأمثل ، وعادة بالنسبة للمركبات العضوية ، يجب أن تكون البلورات أكبر من تلك التي تحتوي على ذرات ثقيلة. بدون بلورات قابلة للحياة ، لا يكون علم البلورات بالأشعة السينية ممكنا. بعض الجزيئات بطبيعتها أكثر بلورية من غيرها ، وبالتالي يمكن أن تختلف صعوبة الحصول على بلورات جودة الأشعة السينية بين المركبات. يشبه نمو بلورات الأشعة السينية عملية إعادة التبلور التي تستخدم بشكل شائع لتنقية المركبات ، ولكن مع التركيز على إنتاج بلورات عالية الجودة. في كثير من الأحيان ، يمكن الحصول على بلورات عالية الجودة من خلال السماح لعملية التبلور بالمضي قدما ببطء ، والتي قد تحدث على مدار اليوم أو الأشهر.
1. تحضير الأنبوب البلوري والفلتر
2. إضافة العينة إلى الأنبوب البلوري
3. نمو البلورات
4. اختيار الكريستال

الشكل 1. صورة لمرشح الماصة. تم تثبيت قطعة صغيرة من المناديل الخالية من النسالة بإحكام عند عنق زجاجة الماصة. يتم تمرير المحاليل من خلال مرشحات الماصة هذه قبل إدخالها إلى الأنبوب البلوري.

الشكل 2. بمجرد وضع المحلول الذي يحتوي على مركب مستهدف في الأنبوب البلوري ، يتم وضع المضاد للمذيبات ببطء في الأعلى عن طريق تمريره عبر مرشح ماصة جديد.
مطلوب بلورة واحدة لتحديد هيكلها. تؤثر جودة البلورة بشكل كبير على جودة ودقة التحديد الهيكلي.
البلورة المفردة هي مادة صلبة يتكرر فيها ترتيب الجزيء في جميع الأبعاد الثلاثة. يمكن تحديد الترتيب المكاني للذرات داخل المادة الصلبة البلورية باستخدام علم البلورات بالأشعة السينية. في هذه التقنية ، يتم تغليف عينة بلورية نقية بحزمة من الأشعة السينية. ينتج البلورة الأشعة السينية في نمط مميز يتعلق ببنية البلورات والتركيب الجزيئي. إذا تشكلت البلورة بسرعة كبيرة ، فقد تكون الجزيئات مضطربة ، أو قد يتم دمج الشوائب في البلورة ، أو قد تتشكل بلورتان أو أكثر من البلورات المنصهرة بدلا من بلورة واحدة. لذلك ، هناك حاجة إلى طرق متخصصة مع التركيز على النمو البطيء لإنتاج بلورات ذات جودة كافية لعلم البلورات بالأشعة السينية.
سيوضح هذا الفيديو الخصائص المرغوبة لبلورات جودة الأشعة السينية ، ويوضح إجراء لزراعتها ، ويقدم بعض التطبيقات لهذه التقنية في الكيمياء.
تشتت الإلكترونات الأشعة السينية عن طريق انبعاث موجة كروية من الأشعة السينية عند الاصطدام. إذا كانت الذرات في ترتيب منظم ، فإن التداخل البناء بين الموجات ينتج نمط حيود مميز على كاشف الأشعة السينية. يتم تدوير البلورة داخل الحزمة لجمع أنماط الحيود من زوايا متعددة. مع أنماط حيود كافية ، يمكن اشتقاق التركيب الجزيئي.
تشكل البلورات بجودة الأشعة السينية بشكل عام أشكالا متماثلة ولها وجوه ناعمة وعاكسة للضوء. عند عرضها تحت المجهر المستقطب ، ستكون شفافة ، ولكن يجب أن يصبح معظمها داكنا عند تدويرها 90؟. هذا يشير إلى هيكل عالي الترتيب. لزراعة هذه البلورات ، غالبا ما يتم استخدام الانتشار السائل السائل. هذا يستخدم مذيبين قابلين للامتزاج: مذيب منخفض الكثافة ، أو مرسب ، يكون فيه المركب المراد إعادة بلورة غير قابل للذوبان ؛ ومذيب عالي الكثافة يكون فيه المركب قابلا للذوبان. عادة ما تكون النسبة الحجمية للراسب إلى المذيب 2: 1.
يتم وضع المرسب منخفض الكثافة في طبقات على محلول مركز للمركب في المذيب عالي الكثافة. بمرور الوقت ، يصبح المركب أقل قابلية للذوبان حيث يختلط المرسب بالمحلول. ينتج عن واجهة المذيبات الأصغر معدل انتشار أبطأ ، مما ينتج عنه بلورات أكبر وأنقى. الآن بعد أن فهمت مبادئ زراعة بلورات جودة الأشعة السينية ، دعنا ننتقل إلى إجراء لزراعتها عن طريق الانتشار السائل السائل.
للبدء ، احصل على المعدات اللازمة الموجودة في بروتوكول النص. الحصول على مذيب للمركب ومرسب أقل كثافة.
لتحضير مرشح الماصة، ضع قطعة صغيرة من الكيموياب في الجزء العلوي من الماصة الزجاجية واضغط برفق على الورق لأسفل إلى أسفل جسم الماصة باستخدام قضيب أو ساق ماصة أخرى، مع الحرص على عدم ثقب الورق. قم بإعداد مرشحين للماصة. ضع واحدة في أنبوب الرنين المغناطيسي النووي. إذا لزم الأمر ، قم بتأمين التجميع بمشبك مختبر وحامل حلقي. قم بإذابة حوالي 10 مجم من المركب المراد إعادة تبلوره في 0.75 مل من المذيب.
الآن ، أضف محلول العينة بعناية إلى مرشح الماصة. قم بلصق لمبة في الأعلى واضغط ببطء لتمرير المحلول في أنبوب الرنين المغناطيسي النووي لإزالة الشوائب الصلبة. لا تسمح للمصباح بإعادة التمدد أثناء توصيله ، لأن الشفط سيزيح ورق الترشيح.
بعد ذلك، قم بإزالة مرشح الماصة المستخدم وضع المرشح الثاني في أنبوب الرنين المغناطيسي النووي. الماصة حوالي 1.5 مل من الترسيب في الأنبوب. اسمح للمذيب بالمرور عبر المرشح عن طريق الجاذبية. من الآن فصاعدا ، احرص على عدم إزعاج الفلتر أثناء أي تلاعب. بمجرد ترشيح كل المرسب في الأنبوب ، قم بإزالة المرشح وغطاء الأنبوب. ضعه في خزانة أو مكان آخر يسهل فحصه حيث لن يتم تحريكه.
بعد يوم واحد على الأقل, فحص الأنابيب لنمو الكريستال.? في حالة عدم وجود بلورات أو كانت البلورات صغيرة جدا ، اترك أنبوب العينة دون إزعاج. إذا كانت البلورات مرئية ، فتحقق من حجمها وشكلها دون إزعاج طبقات المذيبات.
إذا كانت البلورات كبيرة ومحددة جيدا وغير متجمعة معا ، فافحص البلورات تحت المجهر للتحقق من قدرتها على أن تكون جودة الأشعة السينية. لا تقم بإزالة البلورات من الأنبوب حتى يصبح مقياس الحيود جاهزا لبدء الفحص. إذا تم دمج جزيئات المذيبات في التركيب البلوري ، فإن السماح للبلورة بالجفاف سيؤدي إلى تدهور البلورة. باستخدام علم البلورات بالأشعة السينية ، تم التحقق من أن التركيب الجزيئي لهذه البلورات ذات اللون الأرجواني المحمر الداكن هو رباعي الفينيل بورفيرين.
يعد علم البلورات بالأشعة السينية أداة تحليلية أساسية في الكيمياء والكيمياء الحيوية.
تشمل طرق إعادة التبلور التسخين والتبريد ، والانتشار السائل السائل ، وانتشار البخار ، والتبخر البطيء. في التبخر البطيء لنظام مذيب واحد ، يتم إذابة المركب في كمية صغيرة من المذيبات ووضعه في وعاء به ثقب صغير في الغطاء. عندما يتبخر المذيب ، يزداد التركيز حتى يبدأ المركب في التبلور.
غالبا ما ترتبط وظيفة البروتينات بهيكلها. ومع ذلك ، قد يكون من الصعب جدا تبلور البروتينات. يجب تطوير تقنيات متخصصة لزراعة بلورات بروتينات بجودة الأشعة السينية. هنا ، يتم خلط قطرة من محلول البروتين مع قطرة من الراسب ويتم إغلاق هذا الخليط في غرفة بها راسب نقي. عندما ينتشر بخار المذيب خارج القطرة ، تقل قابلية ذوبان البروتين في القطرة ، ويتبلور البروتين ببطء. تقنية أخرى تمزج بين محلول البروتين والمرسب تحت الزيت المعدني. باستخدام هذه التقنيات ، يمكن بلورة مجموعة متنوعة من البروتينات لتحليلها.
في حيود المسحوق ، يتم تمثيل كل اتجاه مكاني محتمل في العينة في وقت واحد. حيود المسحوق ليس مفيدا حول الهيكل مثل حيود الأشعة السينية أحادية البلورة بسبب فقدان بيانات الهيكل ثلاثي الأبعاد. بدلا من ذلك ، يتفوق حيود المسحوق في تحليل مخاليط المواد الصلبة البلورية وتقييم بلورة الهياكل غير المتبلورة.
لقد شاهدت للتو مقدمة JoVE لزراعة البلورات لتصوير البلورات بالأشعة السينية. يجب أن تكون الآن على دراية بخصائص الأشعة السينية - بلورات الجودة ، وإجراء زراعتها ، وبعض التطبيقات لهذه التقنية في الكيمياء.
شكرا للمشاهدة!
تم استخدام تقنية الانتشار السائل السائل لإنشاء بلورات بجودة الأشعة السينية من رباعي الفينيل بورفيرين. باستخدام ثنائي كلورو ميثان كمذيب والميثانول كمضاد للمذيب ، سمح للسوائل بالانتشار ببطء على مدار أسبوع دون إزعاج. بلورات كبيرة ومحددة جيدا وأرجوانية داكنة ضارب إلى الحمرة تشكلت عند واجهة المذيبين ( الشكل 3 ). يمكن ملاحظة نمو البلورات بصريا. نمت البلورات بوجوه محددة جيدا ، والتي يمكن رؤيتها بالمجهر.
يمكن زراعة بلورات جودة الأشعة السينية عن طريق الانتشار السائل السائل. يسمح الانتشار البطيء لنظام المذيبات الثنائي بإنشاء بلورات مناسبة لحيود الأشعة السينية. تسمح هذه الطريقة للشبكة البلورية بالتشكل ببطء ، مما يؤدي غالبا إلى بلورات أكبر وأكثر تحديدا. يسهل استخدام أنابيب الرنين المغناطيسي النووي الانتشار البطيء للمذيبات ، مما يسمح بنمو البلورات الأمثل. يمكن أن تستغرق هذه العملية من بضعة أيام إلى عدة أشهر. في كثير من الأحيان أثناء عملية التبلور يتم دمج جزيئات المذيبات في الشبكة البلورية. وبالتالي ، من المهم تجنب السماح للبل...
Chapters in this video
0:00
Overview
1:23
Principles of Growth for X-ray Crystallography
3:04
Sample Preparation
3:57
Liquid-Liquid Diffusion
4:57
Crystal Selection and Results
5:49
Applications
7:34
Summary
Videos from this collection: