JoVE Encyclopedia of Experiments
علم الأحياء
0 مشاهدات • 3:24 د • April 30th, 2023
- في C. ايليجانس، يمكن تحفيز الحمض النووي الريبي عن طريق تغذية بكتيريا الديدان التي تعبر عن الحمض النووي الريبي مزدوج الشريطة أو dsRNA من بلازميد الحمض النووي المؤتلف.
للبدء ، قم بزراعة HT115 الإشريكية القولونية المقاومة للتتراسيكلين المنقولة مع البلازميد L4440 بين عشية وضحاها على ألواح أجار LB الانتقائية التي تحتوي على التتراسيكلين والأمبيسلين ، أو الكربنيسيلين التناظري الوظيفي. بالإضافة إلى الحمض النووي المستهدف ، يحتوي البلازميد على جين لمقاومة الأمبيسلين. يمكن أن تنمو مستعمرات البكتيريا التي ترث البلازميد فقط في وجود هذه المضادات الحيوية.
بعد ذلك ، قم بحصاد مستعمرات البكتيريا وتوسيعها في وسط LB السائل إلى التركيز المطلوب. للحث على تعبير dsRNA ، انقل محلول البكتيريا إلى وسط نمو الديدان الخيطية المحضرة ، أو NGM ، ألواح أجار التي تحتوي على IPTG.
في نظام التعبير هذا ، يحاكي IPTG اللاكتوز لتعطيل مثبط lac الذي يتيح التعبير عن بوليميراز T7 RNA. على البلازميد ، يتم تنظيم تعبير الحمض النووي المستهدف بواسطة اثنين من محفزي T7 المتقاربين. وبالتالي ، يتم نسخ التسلسلات الحسية والمضادة للمعنى مما يؤدي إلى التعبير عن dsRNA.
أخيرا ، تستخدم الدودة معلومات التسلسل من dsRNA المبتلع لتقليل تنظيم mRNAs الذاتية مع التسلسلات التكميلية. في هذه التجربة ، سنقوم بإعداد ألواح RNAi مع بكتريا قولونية معدلة وراثيا لتغذية C. ايليجانس.
- بالنسبة لألواح RNAi ، قم بتحميل ألواح بطول 6 سم مع أجار NGM الذي يحتوي على IPTG و carbenicillin. دعهم يجفوا لمدة 24 إلى 48 ساعة في درجة حرارة الغرفة في الظلام. ثم انقلها إلى 4 درجات مئوية لمدة تصل إلى 14 يوما.
بعد ذلك ، قم بتجميع الألواح الانتقائية الخطية التي تحتوي على الكربينيسلين والتتراسيكلين مع استنساخ بكتيريا RNAi مع بلازميد L4440 الذي يحمل جين lin-53. استخدم نمط خطوط ثلاثي الأطوار وتأكد من لوحة عنصر تحكم متجه فارغ. ثم قم بزراعة الصفائح بين عشية وضحاها عند 37 درجة مئوية.
في اليوم التالي ، اختر ما لا يقل عن ثلاث مستعمرات مفردة وقم بتلقيح كل منها في أنبوب استزراع منفصل مع 2 مل من LB مكمل بالكاربينيسيلين ، ولكن ليس التتراسيكلين. خطط للحصول على ثلاث ثقافات صحية لكل حالة.
بعد ذلك ، قم بزراعة الثقافات بين عشية وضحاها عند 37 درجة مئوية حتى تصل إلى كثافة بصرية عند 600 نانومتر من 0.6 إلى 0.8. بعد ذلك ، أضف 500 ميكرولتر من كل مزرعة بكتيرية إلى صفيحة NGM أجار RNAi بحجم 6 سم. احتضن الأطباق طوال الليل في درجة حرارة الغرفة في الظلام.
تصف هذه المقالة طريقة لتحفيز تداخل الحمض الريبي النووي (RNAi) في ديدان *C. elegans* باستخدام بكتيريا تعبر عن الحمض الريبي النووي مزدوج السلسلة (dsRNA). يتضمن البروتوكول تحضير أطباق RNAi باستخدام بكتيريا *E. coli* المعدلة وراثياً وتغذيتها للديدان من أجل تقليل تعبير mRNAs المستهدفة.
يتيح التغذية بـ RNAi في C. elegans باستخدام بكتيريا E. coli المهندسة تعطيل الجينات بشكل سريع وقابل للتوسع من أجل علم الجينوم الوظيفي والتحقق من الأهداف في مراحل الاكتشاف المبكرة. ويدعم هذا النهج تقليل المخاطر الميكانيكية من خلال السماح بالاستقصاء المباشر لوظيفة الجينات في سياق الكائن الحي الكامل. وتتموضع هذه الطريقة عند نقطة التقاطع بين التحقق من الأهداف وتطوير المقايسات، مما يوفر ثقة تنبؤية لعمليات الفرز اللاحقة والأبحاث الانتقالية.
تتكامل طريقة التغذية هذه باستخدام تداخل الحمض النووي الريبوزي (RNAi) ضمن سلسلة عمليات الاكتشاف، بدءاً من التحقق الأولي من الهدف وصولاً إلى تطوير المقايسات والنمذجة قبل السريرية.
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
آخر تحديث: 29 أغسطس 2026