JoVE Encyclopedia of Experiments
التقنيات البيولوجية
0 مشاهدات • 3:25 د • July 8th, 2025
لتعداد العاثيات عن طريق تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي ، qPCR ، احصل على كوكتيل تفاعل qPCR يحتوي على بوليميراز Taq DNA ، والبادئات ، وثلاثي فوسفات الديوكسي نوكليوتيد - dNTPs - وجزيئات صبغ مراسل الفلورسنت في مخزن مؤقت محسن. انقله إلى آبار لوحة qPCR.
أضف العاثيات المعالجة حراريا. تطلق المعالجة الحرارية الحمض النووي للعاثيات من جزيئات العاثيات. أغلق اللوحة ، مما يمنع تبخر الخليط. قم بتحميل اللوحة في نظام qPCR ، مع ضبط ظروف ركوب الدراجات المناسبة.
يؤدي التسخين إلى درجات حرارة عالية إلى تغيير طبيعة الحمض النووي المزدوج الذي تقطعت به السبل إلى خيوط مفردة. كما أنه ينشط بوليميراز Taq DNA. يتسبب التلدين في ارتباط الاشعال الخاصة بالتسلسل بخيوط الحمض النووي للعاثيات التكميلية. يسمح التمديد لبوليميراز الحمض النووي Taq المنشط بإضافة dNTPs إلى نهاية 3 'من التمهيدي ، مما يمتد إلى خيط الحمض النووي المتنامي في اتجاه 5 إلى 3'.
تتكامل جزيئات الصبغة في الحمض النووي المزدوج الذي تقطعت به السبل حديثا ، مما يتسبب في زيادة شدة الفلورة. تضاعف كل دورة تفاعل البوليميراز المتسلسل كمية الحمض النووي المستهدفة ، مما يزيد من شدة التألق.
حدد دورة العتبة ، CT ، القيمة ، التي يتجاوز فيها التألق المقاس مستوى الخلفية.
ترتبط قيمة Ct عكسيا بكمية الحمض النووي الأولية ، حيث يعادل كل جينوم عاثية جسيم واحد من العاثيات ، مما يسهل القياس الكمي للعاثية من منحنى الحمض النووي للعاثيات.
بعد التضخيم ، قم بإجراء تحليل منحنى الذوبان ، وزيادة درجة حرارة التفاعل تدريجيا. عند درجة حرارة انصهار معينة ، ينفصل نصف الحمض النووي إلى خيوط مفردة ، مما يؤدي إلى إطلاق جزيئات الصبغة ويسبب انخفاضا مفاجئا في التألق.
تتحقق درجة حرارة الانصهار المميزة ، الفريدة لمنتج qPCR ، من خصوصية المنتج.
قم بإعداد الخلطة الجاهزة qPCR ل 10 عينات من العاثيات ذات التركيز غير المعروف و 7 عينات من التركيزات القياسية بثلاث نسخ ، مما ينتج عنه خلط أولي ل 51 عينة تحتوي على 255 ميكرولتر من qPCR Master Mix ، و 51 ميكرولتر من البادئات ، و 102 ميكرولتر من الماء.
Aliquot 8 ميكرولتر من مزيج PCR المحضر في 51 بئرا من لوحة qPCR 96 بئرا. بعد ذلك ، أضف ميكرولترين من عينات العاثيات T7 المعالجة حراريا إلى كل من هذه الآبار ، وقم بتوزيعها تحت سطح الخلطة الجاهزة qPCR. باستخدام فيلم لاصق ، أغلق اللوحة.
لف اللوحة بورق الألمنيوم لتقليل التبييض الضوئي الفلوري ، ثم تابع تشغيل اللوحة على جهاز qPCR. قم بإعداد ظروف ركوب الدراجات وإعدادات منحنى الذوبان كما هو موضح في بروتوكول النص.
توضح هذه المقالة طريقة لتعداد العاثيات (bacteriophages) باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي (qPCR). وتتضمن العملية تحضير مزيج تفاعل qPCR، وإضافة العاثيات المعالجة حراريًا، وتحليل الفلورية الناتجة لكمية جزيئات العاثيات.
يتيح التعداد القائم على تقنية qPCR للبكتيريوفاجات التحديد الكمي الدقيق وعالي الإنتاجية للجزيئات الفيروسية في سير عمل مرحلة الاكتشاف. ويدعم هذا النهج التحقق القوي من الهدف وتطوير المقايسات من خلال توفير مخرجات كمية وقابلة للتكرار، وهي أمور حاسمة لاتخاذ القرارات المبكرة. كما أن دمج تعداد qPCR في مسارات العمل الخاصة بالصيدلة الحيوية يعزز الثقة التنبؤية وفرز المحفظة العلاجية للعلاجات القائمة على الفاجات أو تلك التي تعدل الميكروبيوم.
يتناسب تعداد العاثيات المعتمد على qPCR ضمن التسلسل الممتد من الاكتشاف المبكر إلى تحديد المركبات الرائدة، مما يوفر مخرجات كمية لاختبار الفرضيات ومدى جاهزية المقايسة.
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
فيديوهات ذات صلة
0 مرات المشاهدة
آخر تحديث: 22 أغسطس 2026