$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
يكتشف تفاعل البوليميراز المتسلسل الذائب عالي الدقة ، HRM-PCR ، اختلافات تسلسل الحمض النووي المزدوج الشريطة ، وتسلسل dsDNA بدقة عالية.
ابدأ بمزيج رئيسي يحتوي على بوليميراز Taq غير النشط وثلاثي فوسفات الديوكسي ريبونوكليوتيد - dNTPs - وصبغة مراسل الفلورسنت. أضف الاشعال الأمامية والخلفية. ماصة الخليط في آبار لوحة PCR.
أضف قالب dsDNA. أغلق اللوحة ، مما يمنع تبخر الخليط. ابدأ تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR).
تعمل درجة حرارة تغيير الطبيعة العالية على تغيير طبيعة dsDNA إلى الحمض النووي أحادي الشريطة ، ssDNA ، وتنشط البوليميراز. ثم يتم تبريد التفاعل إلى درجة حرارة التلدين ، مما يسهل الارتباط التمهيدي الأمامي والعكسي ب ssDNAs عبر الاقتران الأساسي التكميلي الخاص بالموقع.
يتم تجنيد البوليميراز المنشط ، مما يوسع الازدواج على الوجهين للحمض النووي التمهيدي عن طريق إضافة dNTP.
صبغة مراسل الفلورسنت - صبغة خاصة ب dsDNA موجودة بتركيزات مشبعة - تتداخل داخل الطباعة على الوجهين بأكملها ، وتتألق بشكل ساطع. يخضع الطباعة المزدوجة لدورات PCR متعددة ، مما ينتج عنه العديد من الأجزاء المحتوية على متغيرات.
بعد تفاعل البوليميراز المتسلسل ، قم بإجراء تحليل منحنى الذوبان عن طريق إعادة رفع درجة حرارة التفاعل بشكل مطرد بمرور الوقت.
اعتمادا على تسلسل النيوكليوتيدات ، قد يغير الموقع المحتوي على المتغير طبيعته أولا ، مما يؤدي إلى إطلاق الصبغة. نظرا لأن مواقع ربط الصبغة المتبقية مشبعة ، تفشل الصبغة في إعادة الإقحام ، مما يقلل من شدة التألق. علاوة على ذلك ، ينفصل dsDNA إلى ssDNA عند التسخين التدريجي.
حدد درجة حرارة الانصهار ، حيث يتغير نصف dsDNA إلى ssDNA مع انخفاض حاد في التألق. يحدد التحول في منحنى الذوبان لشظايا الحمض النووي المضخم اختلافات تسلسل النيوكليوتيدات للعينة.
لتنفيذ بروتوكول HRM-PCR ، أولا ، قم بتخفيف عينات الحمض النووي في أنابيب سعة 1.5 مليلتر بالماء إلى تركيز 10 نانوجرام لكل ميكرولتر. بعد ذلك ، قم بتخفيف المحاليل التمهيدية المذابة في أنابيب سعة 1.5 ملليلتر بالماء إلى نفس تركيز 6 ميكرومولار. قم بإذابة حلول مجموعة HRM-PCR ، واخلطها بعناية عن طريق الدوامة لضمان استعادة جميع المحتويات.
قم
بتدوير القوارير الثلاث التي تحتوي على خليط إنزيمي مع صبغة ملزمة للحمض النووي وكلوريد المغنيسيوم والماء في جهاز طرد مركزي دقيق قبل فتحها. في أنبوب سعة 1.5 ملليلتر في درجة حرارة الغرفة ، استخدم المكونات لتحضير مزيج PCR لتفاعل 120 ميكرولتر ، كما هو موضح في بروتوكول النص. تخلط بعناية عن طريق الدوامة.
من الأهمية بمكان أن تعمل باهتمام وملاحة وفقا للممارسات الجيدة في البيولوجيا الجزيئية.
ماصة 19 ميكرولترا من تفاعل البوليميراز المتسلسل تمزج في كل بئر من لوحة بيضاء متعددة الآبار. أضف 1 ميكرولتر من قالب الحمض النووي المعدل بالتركيز ، ثم أغلق اللوحة البيضاء متعددة الآبار بورق مانع للتسرب. الطرد المركزي للوحة بيضاء متعددة الآبار لمدة دقيقة واحدة بمعدل 1500 مرة جم في جهاز طرد مركزي قياسي ذو دلو متأرجح يحتوي على دوار لألواح متعددة الآبار مع محولات مناسبة. قم بتحميل اللوحة البيضاء متعددة الآبار في أداة HRM-PCR. ابدأ برنامج HRM-PCR بشروط PCR الموجودة في بروتوكول النص.
بعد تفاعل HRM-PCR ، قم بإجراء تحليل إدارة الموارد البشرية لتحديد تعدد أشكال طول CR1 ، كما هو موضح في بروتوكول النص.