الاستفادة من سيفيرز الموارد ل

10.2K مشاهدة

استشهد بها 7

10:41 دقيقة

مايو 9, 2017

10.3791/55009-v

مايو 9, 2017

10.2K مشاهدة

يحدد هذا البروتوكول سير عمل مقارن لتجميع النسخ والتعليقات التوضيحية لعلماء المعلوماتية الحيوية المبتدئين. سير العمل متاح مجانا بالكامل من خلال CyVerse ومتصل بواسطة Data Store. يتم استخدام سطر الأوامر وواجهات المستخدم الرسومية ، ولكن كل التعليمات البرمجية المطلوبة متاحة للنسخ واللصق.

استكشف المزيد من الفيديوهات

علم النسخيات من البداية

Chapters in this video

0:05

العنوان

1:03

إعداد المشروع، وتحميل قراءات التسلسل الخام، وتقييم القراءات باستخدام FastQC

3:31

تقليم القراءات الخام وترشيحها نوعياً للحصول على تسلسلات عالية الجودة

4:32

تجميع الترانسكريبتوم بطريقة *De Novo* باستخدام Trinity في Atmosphere

6:42

تحليل التعبير التفاضلي الزوجي باستخدام DESeq2 في بيئة Discovery Environment

7:38

النتائج: تقارير FastQC وrnaQUAST

9:24

الخلاصة

Related Videos