Name: التصوير الطيفي فائق الدقة لجزيئات الحمض النووي باستخدام التباين الذاتي (فيديو) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-03-06T13:25:00.000+00:00
Duration: 9 min 19 s
Description: اكتشف بروتوكول التصوير الطيفي فائق الدقة للحمض النووي باستخدام التباين الذاتي دون تسميات خارجية. يتيح هذا الأسلوب دراسة الخصائص البصرية الأصلية للجزيئات وتجنب تشوهات التسمية التقليدية.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Ellis, R. J., Minton, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Join+the+crowd%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Join the crowd.</a> Nature. 425 (6953), 27-28 (2003).</li>
<li>Hell, S. W., Wichmann, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Breaking+the+diffraction+resolution+limit+by+stimulated+emission%3A+stimulated+emission-depletion+fluorescence+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Opt+Lett%22%5BJournal%5D)">Breaking the diffraction resolution limit by stimulated emission: stimulated emission-depletion fluorescence microscopy.</a> Opt Lett. 19 (11), 780(1994).</li>
<li>Rust, M. J., Bates, M., Zhuang, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sub-diffraction-limit+imaging+by+stochastic+optical+reconstruction+microscopy+%28STORM%29%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Sub-diffraction-limit imaging by stochastic optical reconstruction microscopy (STORM).</a> Nat Methods. 3 (10), 793-796 (2006).</li>
<li>Betzig, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+intracellular+fluorescent+proteins+at+nanometer+resolution%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Imaging intracellular fluorescent proteins at nanometer resolution.</a> Science. 313 (5793), 1642-1645 (2006).</li>
<li>Gustafsson, M. G. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nonlinear+structured-illumination+microscopy%3A+wide-field+fluorescence+imaging+with+theoretically+unlimited+resolution%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Nonlinear structured-illumination microscopy: wide-field fluorescence imaging with theoretically unlimited resolution.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 102 (37), 13081-13086 (2005).</li>
<li>Hell, S. W., Kroug, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ground-state-depletion+fluorescence+microscopy%3A+a+concept+for+breaking+the+diffraction+resolution+limit%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Phys+B%22%5BJournal%5D)">Ground-state-depletion fluorescence microscopy: a concept for breaking the diffraction resolution limit.</a> Appl Phys B. 60 (5), 495-497 (1995).</li>
<li>Fölling, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fluorescence+nanoscopy+by+ground-state+depletion+and+single-molecule+return%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Fluorescence nanoscopy by ground-state depletion and single-molecule return.</a> Nat Methods. 5 (11), 943-945 (2008).</li>
<li>Ricci, M., Manzo, C., García-Parajo, M. F., Lakadamyali, M., Cosma, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromatin+fibers+are+formed+by+heterogeneous+groups+of+nucleosomes+in+vivo%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Chromatin fibers are formed by heterogeneous groups of nucleosomes in vivo.</a> Cell. 160 (6), 1145-1158 (2015).</li>
<li>Bintu, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Super-resolution+chromatin+tracing+reveals+domains+and+cooperative+interactions+in+single+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Super-resolution chromatin tracing reveals domains and cooperative interactions in single cells.</a> Science. 362 (6413), eaau1783(2018).</li>
<li>Matsuda, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Condensed+mitotic+chromosome+structure+at+nanometer+resolution+using+PALM+and+EGFP-histones%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Condensed mitotic chromosome structure at nanometer resolution using PALM and EGFP-histones.</a> PLoS One. 5 (9), e12768(2010).</li>
<li>Bohn, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Localization+microscopy+reveals+expression-dependent+parameters+of+chromatin+nanostructure%5BTitle%5D)+AND+%22Biophys+J%22%5BJournal%5D)">Localization microscopy reveals expression-dependent parameters of chromatin nanostructure.</a> Biophys J. 99 (5), 1358-1367 (2010).</li>
<li>Acosta, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Three-color+single-molecule+localization+microscopy+in+chromatin%5BTitle%5D)+AND+%22Light+Sci+Appl%22%5BJournal%5D)">Three-color single-molecule localization microscopy in chromatin.</a> Light Sci Appl. 14, 7(2025).</li>
<li>Almassalha, L. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Label-free+imaging+of+the+native%2C+living+cellular+nanoarchitecture+using+partial-wave+spectroscopic+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Label-free imaging of the native, living cellular nanoarchitecture using partial-wave spectroscopic microscopy.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 113 (42), E6372-E6381 (2016).</li>
<li>Beerman, T. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+analogs+of+the+DNA+minor+groove+binder+Hoechst+33258+on+topoisomerase+II+and+I+mediated+activities%5BTitle%5D)+AND+%22Biochim+Biophys+Acta%22%5BJournal%5D)">Effects of analogs of the DNA minor groove binder Hoechst 33258 on topoisomerase II and I mediated activities.</a> Biochim Biophys Acta. 1131 (1), 53-61 (1992).</li>
<li>Cadet, J., Anselmino, C., Douki, T., Voituriez, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((New+trends+in+photobiology%5BTitle%5D)+AND+%22J+Photochem+Photobiol+B%22%5BJournal%5D)">New trends in photobiology.</a> J Photochem Photobiol B. 15 (4), 277-298 (1992).</li>
<li>Dong, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Superresolution+intrinsic+fluorescence+imaging+of+chromatin+utilizing+native%2C+unmodified+nucleic+acids+for+contrast%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Superresolution intrinsic fluorescence imaging of chromatin utilizing native, unmodified nucleic acids for contrast.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 113 (35), 9716-9721 (2016).</li>
<li>Vayá, I., Gustavsson, T., Miannay, F., Douki, T., Markovitsi, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fluorescence+of+natural+DNA%3A+from+the+femtosecond+to+the+nanosecond+time+scales%5BTitle%5D)+AND+%22J+Am+Chem+Soc%22%5BJournal%5D)">Fluorescence of natural DNA: from the femtosecond to the nanosecond time scales.</a> J Am Chem Soc. 132 (34), 11834-11835 (2010).</li>
<li>Anders, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+fluorescence+at+room+temperature+excited+by+means+of+a+dye+laser%5BTitle%5D)+AND+%22Chem+Phys+Lett%22%5BJournal%5D)">DNA fluorescence at room temperature excited by means of a dye laser.</a> Chem Phys Lett. 81 (2), 270-272 (1981).</li>
<li>Plessow, R., Brockhinke, A., Eimer, W., Kohse-Höinghaus, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Intrinsic+time-+and+wavelength-resolved+fluorescence+of+oligonucleotides%3A+a+systematic+investigation+using+a+novel+picosecond+laser+approach%5BTitle%5D)+AND+%22J+Phys+Chem+B%22%5BJournal%5D)">Intrinsic time- and wavelength-resolved fluorescence of oligonucleotides: a systematic investigation using a novel picosecond laser approach.</a> J Phys Chem B. 104 (15), 3695-3704 (2000).</li>
<li>Takaya, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((UV+excitation+of+single+DNA+and+RNA+strands+produces+high+yields+of+exciplex+states+between+two+stacked+bases%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">UV excitation of single DNA and RNA strands produces high yields of exciplex states between two stacked bases.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 105 (30), 10285-10290 (2008).</li>
<li>Bancaud, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+fractal+model+for+nuclear+organization%3A+current+evidence+and+biological+implications%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">A fractal model for nuclear organization: current evidence and biological implications.</a> Nucleic Acids Res. 40 (18), 8783-8792 (2012).</li>
<li>Daban, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High+concentration+of+DNA+in+condensed+chromatin%5BTitle%5D)+AND+%22Biochem+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">High concentration of DNA in condensed chromatin.</a> Biochem Cell Biol. 81 (3), 91-99 (2003).</li>
<li>Bohrmann, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Concentration+evaluation+of+chromatin+in+unstained+resin-embedded+sections+by+means+of+low-dose+ratio-contrast+imaging+in+STEM%5BTitle%5D)+AND+%22Ultramicroscopy%22%5BJournal%5D)">Concentration evaluation of chromatin in unstained resin-embedded sections by means of low-dose ratio-contrast imaging in STEM.</a> Ultramicroscopy. 49 (1-4), 235-251 (1993).</li>
<li>Dong, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Stochastic+fluorescence+switching+of+nucleic+acids+under+visible+light+illumination%5BTitle%5D)+AND+%22Opt+Express%22%5BJournal%5D)">Stochastic fluorescence switching of nucleic acids under visible light illumination.</a> Opt Express. 25 (7), 7929-7944 (2017).</li>
<li>Gong, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+spectroscopic+intrinsic-contrast+photon-localization+optical+nanoscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+SPIE%22%5BJournal%5D)">DNA spectroscopic intrinsic-contrast photon-localization optical nanoscopy.</a> Proc SPIE. 13326, 133260F(2025).</li>
<li>Wang, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Label-free+DNA+spectroscopic+photon-localization+nanoscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Optica+Biophotonic+Congress%22%5BJournal%5D)">Label-free DNA spectroscopic photon-localization nanoscopy.</a> Optica Biophotonic Congress. , (2025).</li>
<li>Eshein, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sub-10-nm+imaging+of+nucleic+acids+using+spectroscopic+intrinsic-contrast+photon-localization+optical+nanoscopy+%28SICLON%29%5BTitle%5D)+AND+%22Opt+Lett%22%5BJournal%5D)">Sub-10-nm imaging of nucleic acids using spectroscopic intrinsic-contrast photon-localization optical nanoscopy (SICLON).</a> Opt Lett. 43 (23), 5817-5820 (2018).</li>
<li>Song, K. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Monolithic+dual-wedge+prism-based+spectroscopic+single-molecule+localization+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Nanophotonics%22%5BJournal%5D)">Monolithic dual-wedge prism-based spectroscopic single-molecule localization microscopy.</a> Nanophotonics. 11 (8), 1527-1535 (2022).</li>
<li>Song, K. H., Sun, C., Zhang, H. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Design+strategy+for+a+dual-wedge+prism+imaging+spectrometer+in+spectroscopic+nanoscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Rev+Sci+Instrum%22%5BJournal%5D)">Design strategy for a dual-wedge prism imaging spectrometer in spectroscopic nanoscopy.</a> Rev Sci Instrum. 94 (2), 023702(2023).</li>
<li>Yeo, W. H., Sun, C., Zhang, H. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Physically+informed+Monte+Carlo+simulation+of+dual-wedge+prism-based+spectroscopic+single-molecule+localization+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biomed+Opt%22%5BJournal%5D)">Physically informed Monte Carlo simulation of dual-wedge prism-based spectroscopic single-molecule localization microscopy.</a> J Biomed Opt. 29 (S1), S11501(2023).</li>
<li>Davis, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((RainbowSTORM%3A+an+open-source+ImageJ+plug-in+for+spectroscopic+single-molecule+localization+microscopy+%28sSMLM%29+data+analysis+and+image+reconstruction%5BTitle%5D)+AND+%22Bioinformatics%22%5BJournal%5D)">RainbowSTORM: an open-source ImageJ plug-in for spectroscopic single-molecule localization microscopy (sSMLM) data analysis and image reconstruction.</a> Bioinformatics. 36 (19), 4972-4974 (2020).</li>
<li>Davis, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aDavis%2C+JL+%22RainbowSTORM+v2+%28MATLAB+app%29%22">RainbowSTORM v2 (MATLAB app)</a>. , https://github.com/FOIL-NU/sSMLM-protocol (2020).</li>
<li>Brenner, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Implementation+and+calibration+of+spectroscopic+single-molecule+localization+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Methods%22%5BJournal%5D)">Implementation and calibration of spectroscopic single-molecule localization microscopy.</a> BMC Methods. 2 (1), 2(2025).</li>
<li>sSMLM for DNA intrinsic fluorescence (Python scripts). , Backman Lab. 
 <a target="_blank" href="https://github.com/BackmanLab/sSMLM-for-DNA-intrinsic-fluorescence">https://github.com/BackmanLab/sSMLM-for-DNA-intrinsic-fluorescence</a> (2025).</li>
<li>N-STORM protocol. , Molecular Vista. Available from: 
 <a target="_blank" href="https://www.mvi-inc.com/wp-content/uploads/N-STORM+Protocol.pdf">https://www.mvi-inc.com/wp-content/uploads/N-STORM+Protocol.pdf</a> (2014).</li>
<li>Abdelsayed, V., Boukhatem, H., Olivier, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+optimized+buffer+for+repeatable+multicolor+STORM%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Photonics%22%5BJournal%5D)">An optimized buffer for repeatable multicolor STORM.</a> ACS Photonics. 9 (12), 3926-3934 (2022).</li>
<li>Zumbusch, A., Holtom, G. R., Xie, X. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Three-dimensional+vibrational+imaging+by+coherent+anti-Stokes+Raman+scattering%5BTitle%5D)+AND+%22Phys+Rev+Lett%22%5BJournal%5D)">Three-dimensional vibrational imaging by coherent anti-Stokes Raman scattering.</a> Phys Rev Lett. 82 (20), 4142(1999).</li>
<li>Benninger, R. K. P., Piston, D. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Two%E2%80%90photon+excitation+microscopy+for+the+study+of+living+cells+and+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Protoc+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Two‐photon excitation microscopy for the study of living cells and tissues.</a> Curr Protoc Cell Biol. 59 (1), 4-11 (2013).</li>
<li>Zhang, C., Zhang, D., Cheng, J. X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Coherent+Raman+scattering+microscopy+in+biology+and+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Ann+Rev+Biomed+Eng%22%5BJournal%5D)">Coherent Raman scattering microscopy in biology and medicine.</a> Ann Rev Biomed Eng. 17 (1), 415-445 (2015).</li>
<li>Song, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((SNR+enhanced+high-speed+two-photon+microscopy+using+a+pulse+picker+and+time+gating+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">SNR enhanced high-speed two-photon microscopy using a pulse picker and time gating detection.</a> Sci Rep. 13 (1), 14244(2023).</li>
<li>Luu, P., Fraser, S. E., Schneider, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((More+than+double+the+fun+with+two-photon+excitation+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Comm+Biol%22%5BJournal%5D)">More than double the fun with two-photon excitation microscopy.</a> Comm Biol. 7 (1), 364(2024).</li>
<li>Van de Linde, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Direct+stochastic+optical+reconstruction+microscopy+with+standard+fluorescent+probes%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Direct stochastic optical reconstruction microscopy with standard fluorescent probes.</a> Nat Protoc. 6 (7), 991-1009 (2011).</li>
<li>Wang, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Research+progress+on+the+luminescence+of+biomacromolecules%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mater+Sci+Technol%22%5BJournal%5D)">Research progress on the luminescence of biomacromolecules.</a> J Mater Sci Technol. 76, 60-75 (2021).</li>
<li>Varejão, N., Reverter, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Using+intrinsic+fluorescence+to+measure+protein+stability+upon+thermal+and+chemical+denaturation%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Using intrinsic fluorescence to measure protein stability upon thermal and chemical denaturation.</a> Methods Mol Biol. 2581, 229-241 (2023).</li>
<li>Sindrewicz, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Intrinsic+tryptophan+fluorescence+spectroscopy+reliably+determines+galectin-ligand+interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Intrinsic tryptophan fluorescence spectroscopy reliably determines galectin-ligand interactions.</a> Sci Rep. 9 (1), 11851(2019).</li>
<li>Ho, C. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+identification+of+pathogenic+bacteria+using+Raman+spectroscopy+and+deep+learning%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Rapid identification of pathogenic bacteria using Raman spectroscopy and deep learning.</a> Nat Commun. 10 (1), 4927(2019).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>فلتر انبعاث 488 نانومتر للتصوير</td><td>شركة كروما تكنولوجي كورب.</td><td>ET525/50M</td><td></td></tr><tr><td>فلتر تمرير النطاق 532 نانومتر للمعايرة</td><td>ثورلابز</td><td>FL532-3</td><td></td></tr><tr><td>مرشح انبعاث 532 نانومتر للتصوير</td><td>شركة كروما تكنولوجي كورب.</td><td>ET620/60M</td><td></td></tr><tr><td>فلتر تمرير النطاق 580 نانومتر للمعايرة</td><td>ثورلابز</td><td>FB580-10</td><td></td></tr><tr><td>فلتر تمرير النطاق 633 نانومتر للمعايرة</td><td>ثورلابز</td><td>FL632.8-3</td><td></td></tr><tr><td>فلتر تمرير النطاق 680 نانومتر للمعايرة</td><td>ثورلابز</td><td>FB680-10</td><td></td></tr><tr><td>فلتر تمرير النطاق 750 نانومتر للمعايرة</td><td>ثورلابز</td><td>FB750-10</td><td></td></tr><tr><td>بيتا-ميركابتوإيثانول&nbsp;</td><td>سيغما</td><td>M6250</td><td></td></tr><tr><td>مخزن تصوير الطب الحيوي</td><td>NA</td><td>NA</td><td>7 & mu; إل غلوكس، 7 ومو؛ L بيتا-ميركابتوإيثانول و 690 & mu; مخزن جلوكوز L</td></tr><tr><td>كاتالاز من كبد البقر</td><td>سيغما</td><td>C100</td><td></td></tr><tr><td>DABCO (1,4-di-azobicyclo- (2.2.2.)-أوكتان)</td><td>سيغما</td><td>D27802</td><td></td></tr><tr><td>مخزن تصوير DABCO</td><td>NA</td><td>NA</td><td>65 ملليموتر DABCO+30 ملموتر كبريتات الصوديوم + 30 ملمولار DTT 1 ميلي & nbsp; في الحمض النووي DNAse، المياه منزوعة الأيونات خالية من الحمض النووي الريني. يجب إذابة كبريتات الصوديوم في PBS 10&؛ إلى 1 M قبل إنشاء المخزن التصويري.</td></tr><tr><td>استبعاد الحمض النووي للتحليل الطيفي SMLM</td><td>IDT</td><td>NA</td><td>زوج من 20 قاعدة GC_alter و GC_conti و AT_alter و AT_conti. مثلا GC_alter له كلا الخيطين بطول 5' - GCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGC - 3'; GC_conti لديه خيط واحد بحجم 5 أقدام - GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG - 3' والآخر ب 5' - CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC - 3' جميع العينات موجودة بمعيار HPLC.</td></tr><tr><td>أوليغونيوكليوتيدات الحمض النووي (DNA أوليجونكليوتيدات/الحمض النووي مزدوج السلسلة</td><td>IDT</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>قبطات الحمض النووي للتحليل الطيفي SMLM</td><td>IDT</td><td>NA</td><td>20 قاعدة A، G، C، T؛ سلسلة تيار متردد أحادية السلسلة ذات 40 قاعدة (A1C1، A5C5، A10C10، A20C20)؛ &nbsp; الجوانين أحادي السلسلة 5، 8، 12، 16 قاعدة. مثلا A10C10 هو 5'- AAAAAAAAACCCC CCCCCAAAAAAAAA AACCCCCCCCCC - 3' جميع العينات في معيار HPLC.</td></tr><tr><td>الماء المقطر الخالي من DNase/RNase</td><td>إنفيتروجين</td><td>10977015</td><td></td></tr><tr><td>DTT (DL-Dithiothreitol)</td><td>سيغما</td><td>43816</td><td></td></tr><tr><td>غلوكس</td><td>NA</td><td>NA</td><td>14 ملغ جلوكوز أوكسيداز، 50 & mu; L كاتالازي (17 ملغ/مل) + 200 & mu; مخزن L A، وهو 10 مللي مولار تريس (pH 8.0) و50 مللي مولار NaCl.&nbsp؛</td></tr><tr><td>مخزن الجلوكوز</td><td>NA</td><td>NA</td><td>50 مللي مولار تريس (رقم الهيدروجيني 8.0)، 50 ملليمولار NaCl و10٪ جلوكوز.</td></tr><tr><td>داز الجلوكوز أوكسيداز</td><td>سيغما</td><td>G7141</td><td></td></tr><tr><td>الجلوكوز، المسحوق</td><td>ثيرمو فيشر</td><td>15023021</td><td></td></tr><tr><td>PBS (10X)</td><td>ثيرمو فيشر</td><td>J62036. K3</td><td></td></tr><tr><td>PBS (1X)</td><td>جيبكو</td><td>10010023</td><td></td></tr><tr><td>كلوريد الصوديوم</td><td>ثيرمو فيشر</td><td>424290010</td><td></td></tr><tr><td>كبريتات الصوديوم&nbsp;</td><td>سيغما</td><td>S0505</td><td></td></tr><tr><td>تريس (1M) pH 8.0</td><td>إنفيتروجين</td><td>AM9856</td><td></td></tr></tbody></table>

التصوير الطيفي فائق الدقة لجزيئات الحمض النووي باستخدام التباين الذاتي

Spectroscopic Super-resolution Imaging of DNA Molecules using Intrinsic Contrast

Super-resolution imaging has revolutionized biological research by revealing structural details at the nanoscale. Most optical super-resolution methods ...

spectroscopic-super-resolution-imaging-dna-molecules-using-intrinsic

Research

JoVE Journal

Bioengineering

الهندسة الحيوية

يصف هذا الفيديو طريقة لتصور تجميع مكثفات بروتين الاندماج على جزيئات الحمض النووي في مواقع محددة باستخدام التصوير أحادي الجزيء. تتشكل هذه المكثفات بسبب تفاعلات LCD-LCD و LCD-DBD ، والتي تسمح بتجنيد بوليميراز الحمض النووي الريبي II وتحسين نسخ الجينات.

تصوير أحادي الجزيء لتصور تجميع مكثفات بروتين الاندماج على ستائر الحمض النووي

وصفنا قرار فائقة التصوير طريقة للتحقيق في التنظيم الهيكلي للالدائري FtsZ البكتيرية، جهاز ضروري لانقسام الخلية. ويستند هذا الأسلوب على التحليل الكمي للصور توطين photoactivated (PALM) والمجهر يمكن تطبيقها على هيكل الخلية البكتيرية البروتينات الأخرى.

فائقة التصوير القرار من ماكينات شعبة الجرثومي

المكتشفة حديثا المؤكسد أشكال 5-ميثيلسيتوسيني (أوكسي-mCs)، 5-هيدروكسيميثيلسيتوسيني (5hmC)، 5-فورميلسيتوسيني (إف سي 5) و 5-كاربوكسيلسيتوسيني (5caC) قد تمثل تعديلات الحمض النووي متميزة مع أدوار وظيفية فريدة من نوعها. هنا هو وصف سير عمل شبه كمي للتصور oxi-الإشراف على التوزيع المكاني والتنميط كثافة إشارة كولوكاليزيشن.

إيمونوستينينج لإدخال تعديلات على الحمض النووي: التحليل الحسابي للصور [كنفوكل]

والهدف العام لهذه المنهجية إعطاء أفضل الظروف التجريبية من إعداد نموذج للحصول على الصور، وإعادة الإعمار من أجل أداء 2D ثنائي اللون دستورم الصور ميكروتوبوليس وخيوط متوسطة في الخلايا...

التصوير خيوط متوسطة وميكروتوبوليس مع الفحص المجهري 2-الأبعاد التعمير البصرية العشوائية المباشرة

ويرد وصف تعليمات مفصلة حول كيفية بناء يميل درجة عالية اجتاحت مجهر بلاط (هيست) واستخدامها لتصوير جزيء واحد.

دليل لبناء يميل درجة عالية اجتاحت بلاط المجهر لتصوير جزيء مفرد الحقل لعرض موسع

تمثل الـ DNA FISH ثلاثية الأبعاد أداة لتصور اللوية الجينومية المتعددة داخل النوى المحفوظة ثلاثية الأبعاد، مع تحديد تفاعلاتها المتبادلة وتوطينها بشكل لا لبس فيه داخل الفضاء النووي على مستوى خلية واحدة. هنا ، يتم وصف بروتوكول خطوة بخطوة لمجموعة واسعة من الخلايا الأساسية البشرية.

3D متعدد الألوان أداة الحمض النووي الأسماك لدراسة العمارة النووية في الخلايا الأساسية البشرية

يصف البروتوكول الحالي طريقة لقياس كثافة الحمض النووي المطلقة داخل نوى الخلية الملتصقة باستخدام فسيفساء Voronoi لبيانات الفحص المجهري للتوطين أحادي الجزيء ، والحجم المعروف ، وحجم الجينوم ، ومرحلة دورة الخلية.

رسم خرائط كثافة الحمض النووي المطلقة في نوى الخلية باستخدام الفحص المجهري للتوطين أحادي الجزيء

يوضح هذا البروتوكول إجراء اختبار أحادي الجزيء للتصور المباشر لفك الحمض النووي بواسطة CMG helicase. يصف (1) تحضير ركيزة الحمض النووي ، (2) تنقية ذبابة الفاكهة السوداء CMG helicase المسمى بالفلورسنت ، (3) إعداد خلية تدفق الموائع الدقيقة للفحص المجهري للانعكاس الداخلي الكلي (TIRF) ، و (4) مقايسة فك الحمض النووي أحادي الجزيء.

تصور أحادي الجزيء في الوقت الحقيقي لفك الحمض النووي بواسطة CMG Helicase

يوضح هذا البروتوكول إجراء إجراء المجهر العميق لتحديد الموقع لجزيء واحد (SMLM) باستخدام مجهر كونفوكال قرصي دوار مع إعادة تعيين فوتونات بصرية، مما يمكن تصوير DNA-PAINT دون الحاجة إلى بصريات مخصصة أو إضاءة معقدة.

تصوير فائق الدقة للخلية بالكامل عبر DNA-PAINT على قرص دوار مع إعادة تعيين فوتونات بصرية

"E - DNA" وأجهزة الاستشعار ، reagentless ، وقد تم تكييف أجهزة الاستشعار الكهروكيميائية التي تحقق أداء جيدا حتى عندما تحدى مباشرة في الدم والمصفوفات المعقدة الأخرى ، إلى الكشف عن مجموعة واسعة من الحمض النووي والبروتين وanalytes جزيء صغير. هنا نقدم إجراء العامة للتصنيع واستخدام أجهزة الاستشعار من هذا القبيل.

تصنيع أجهزة الاستشعار الكهروكيميائية الدنا للكشف Reagentless من الأحماض النووية والبروتينات والجزيئات الصغيرة

اكتشف بروتوكول التصوير الطيفي فائق الدقة للحمض النووي باستخدام التباين الذاتي دون تسميات خارجية. يتيح هذا الأسلوب دراسة الخصائص البصرية الأصلية للجزيئات وتجنب تشوهات التسمية التقليدية.

التصوير الطيفي فائق الدقة لجزيئات الحمض النووي باستخدام التباين الذاتي

استكشف المزيد من الفيديوهات