微量滴定板生物膜形成实验

摘要

该实验方法描述了一种快速检测细菌和真菌早期生物膜形成的手段。该方法以微量滴定板作为微生物形成生物膜的基质，并利用结晶紫染色对生物膜进行可视化观察。该实验可提供针对早期生物膜形成的定性或定量分析。

摘要

生物膜是附着在表面的微生物群落，可在医疗、工业和自然环境中发现。事实上，在大多数环境中，微生物以生物膜形式生长可能是其主要的生长模式。成熟的生物膜具有一些明显特征：生物膜中的微生物通常被包裹在一种细胞外基质中，该基质为群落提供结构支持和保护；在生物膜中生长的微生物还具有特定的结构特征，通常由包含数千个细胞的巨集落组成，巨集落周围分布着充满液体的通道；此外，生物膜中的微生物还以对多种抗菌剂（包括临床上重要的抗生素）具有强耐受性而著称。

微量滴定板实验是研究生物膜形成早期阶段的重要工具，主要用于细菌生物膜的研究，尽管该实验也已被用于研究真菌生物膜的形成。由于该实验采用静态、分批培养条件，无法形成通常与流动腔系统相关的成熟生物膜。然而，该实验已成功鉴定出许多生物膜形成起始所必需的因素，例如鞭毛、菌毛、黏附素以及参与环二鸟苷酸（cyclic-di-GMP）结合与代谢的酶，同时也鉴定了参与胞外多糖合成的相关基因。此外，已有发表的研究表明，在微量滴定板中生长的生物膜确实会发展出某些成熟生物膜的特性，例如对抗生素的耐受性以及对免疫系统效应分子的抗性。

这种简单的微量滴定板检测法可使生物膜在微量滴定板的壁面和/或底部形成。该检测方法通量高，适用于遗传筛选，以及在不同生长条件下对多种菌株的生物膜形成能力进行测试。该检测方法的多种改良版本已被用于评估多种微生物的早期生物膜形成，包括但不限于假单胞菌、Vibrio cholerae、Escherichia coli、staphylocci、enterococci、mycobacteria 和真菌。

在本方案中，我们将重点介绍利用该检测方法研究模式生物Pseudomonas aeruginosa的生物膜形成。该检测通过结晶紫染料（CV）来测定生物膜形成的程度。然而，已有多种其他比色法和代谢染色法被报道用于微孔板检测中生物膜形成的定量分析。微孔板检测操作简便、成本低廉且具有高度灵活性，已成为生物膜研究中的关键工具。

方案

1. 生物膜的培养

1. 在丰富培养基（如 LB 培养基）中过夜培养野生型 Pseudomonas aeruginosa 或突变株。
2. 将过夜培养物按 1:100 的比例稀释至新鲜培养基中用于生物膜检测。一种用于 P. aeruginosa 的标准生物膜检测培养基是 M63 最小培养基，添加硫酸镁、葡萄糖和酪蛋白氨基酸（见表格）。作为另一种促进生物膜形成的替代培养基，可仅以精氨酸作为唯一碳源和能源，以减少浮游生长并形成更牢固的生物膜。
3. 在 96 孔板中每孔加入 100 μL 稀释液。进行定量检测时，每个处理组通常设置 4–8 个重复孔。
4. 将微孔板在 37°C 下孵育 4–24 小时。

2. 生物膜染色

1. 孵育结束后，将培养板倒置并倾出液体，弃去细胞。
2. 将培养板轻轻浸入盛有水的小容器中（例如，可使用 P1000 移液枪吸头盒的底部作为容器），摇晃去除水分。重复此过程一次。该步骤有助于去除未贴壁的细胞及培养基成分，避免在后续染色步骤中产生非特异性染色，显著降低背景染色。
3. 向微孔板的每个孔中加入 125 μL 的 0.1% 结晶紫水溶液。配制溶液时需佩戴手套和实验服。称量结晶紫粉末时应小心，因其具有吸湿性，且易染色衣物、皮肤等。
4. 将微孔板在室温下孵育 10–15 分钟。

讨论

该方法可经修改后用于多种微生物。运动型微生物通常附着在孔壁和/或孔底，而非运动型微生物通常仅附着在孔底。每种微生物形成生物膜的最佳条件（即培养基、温度、培养时间）需通过实验确定。建议每种菌株或条件进行多次重复（4–8 次），并在每块板上设置阳性对照，若可能，同时设置阴性对照。

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材料

本文使用的材料清单

姓名	公司	目录编号	评论
1 X M63			按以下方法配制5X M63浓缩液：溶解15 g KH₂PO₄2PO4，35克 K2HPO4 和10 g (NH4)2SO4 在 1 L 水中。此储备液 d–无需高压灭菌，可于室温保存。将5倍浓度储备液按1:5稀释，高压灭菌后冷却，再加入所需组分。
KH2PO4	Fisher Scientific	P285-500
K2HPO4	Fisher Scientific	P288-500
(NH4)2SO4	Sigma-Aldrich	A5132
硫酸镁	Fisher Scientific	M63-500	加入至终浓度为 1 mM。用纯水配制成 1 M 储存液，并进行高压灭菌。
葡萄糖	Fisher Scientific	D16-3	加入至终浓度为0.2%。用去离子水配制成20%的储存液，并经高压灭菌。
酪蛋白氨基酸	BD 生物科学	223050	加入至终浓度为0.5%。用纯水配制成20%的储存液，并进行高压灭菌。
精氨酸	Sigma-Aldrich	A5131	加入至终浓度为0.4%。用纯水配制成20%的储存液，并经滤膜除菌。该替代性碳源/能源可替代葡萄糖和酪蛋白氨基酸
微量滴定板	BD 生物科学	353911	Falcon 3911，Microtest III，可拆卸酶标板，96孔，U型底，非无菌，非组织培养处理
微量滴定板盖	BD 生物科学	353913	盖子可用95%乙醇水溶液清洗后重复使用。
结晶紫	Sigma-Aldrich	229641000	配制成水中0.1%的溶液。