方法文章

自动疏水相互作用色谱柱筛选在蛋白质纯化中的应用

DOI:

10.3791/3060

2011年9月21日

本文内容

摘要

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$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

本文介绍了一种用于自动筛选适用于蛋白质纯化过程中疏水相互作用色谱(HIC)介质的自动化方法。该方法采用中压液相色谱系统,包含自动缓冲液配制、动态样品环进样、顺序柱切换、多波长分析以及分流收集洗脱组分等功能。

摘要

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$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

与其他蛋白质纯化色谱方法(如凝胶过滤、亲和层析和离子交换层析)不同,疏水相互作用色谱(HIC)通常需要通过实验确定(称为筛选或“ scouting”)以选择最适合纯化特定蛋白质的色谱介质1。本文所述方法介绍了一种自动化的策略,用于筛选最适合蛋白质纯化的HIC介质。

疏水相互作用层析(HIC)根据蛋白质和其他生物分子疏水性的差异,从粗裂解液中将其分离。与亲和层析(AC)和离子交换层析(IEX)类似,HIC 在层析过程中能够对目标蛋白进行浓缩。最适合采用 HIC 进行纯化的蛋白质通常具有疏水性表面区域,并能够耐受高于 2 M 的硫酸铵((NH4)2SO4)盐浓度。当目标蛋白缺乏亲和标签而无法使用 AC,或 IEX 无法实现充分纯化时,HIC 常被选为纯化方法。蛋白质表面的疏水基团会暂时结合到连接于惰性、不溶性基质上的非极性配体。蛋白质与配体之间的相互作用高度依赖于流经层析柱的缓冲液中的盐浓度:高离子强度可增强蛋白质与配体的结合,使蛋白质保持不移动状态(即结合在柱内)2。随着盐浓度降低,蛋白质与配体之间的相互作用减弱,蛋白质重新变为可移动状态并从柱中洗脱出来。目前市面上有多种预装柱形式的 HIC 介质,每种介质均含有不同的疏水性配体(例如 S-丁基、丁基、辛基和苯基),以不同密度交联于特定直径的琼脂糖微球上3。通过自动化的柱筛选系统,可高效地确定在后续更深入的优化实验及蛋白质纯化过程中应选用的 HIC 介质4

此处纯化的特定蛋白为重组绿色荧光蛋白(GFP);然而,该方法也可适用于纯化具有一个或多个疏水表面区域的其他蛋白。由于GFP具有稳定性、在397 nm处独特的光吸收峰以及在紫外光照射下产生荧光的特性,因此是一种有用的模型蛋白5。含有野生型GFP的细菌裂解液在高盐缓冲液中制备后,加载至Bio-Rad DuoFlow中压液相色谱系统,并吸附到含有不同疏水相互作用层析(HIC)介质的HiTrap HIC柱上。蛋白从层析柱中洗脱,并通过在线及运行后检测方法进行分析。缓冲液梯度混合、动态样品环进样、顺序柱切换、多波长分析以及分流收集洗脱组分等功能增强了系统的操作灵活性及实验方法的可重复性。

方案

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1. 缓冲液和样品制备

  1. 技术说明:所有缓冲液均应冷藏,除非另有说明,本方案的每一步操作均需在冰上或 4 °C 下进行。低温对于防止待纯化蛋白降解以及确保最佳操作条件至关重要。若在室温下操作,疏水相互作用层析(HIC)介质可能会产生不同的分离效果,因此层析系统应在 4 °C 的冷藏室或冷箱中运行。
  2. 配制以下缓冲液各 500 ml:200 mM NaH2PO4(缓冲液 A1)、200 mM Na2HPO4(缓冲液 A2)和 4.8 M (NH4)2SO4(缓冲液 B2)。同时将使用去离子水(缓冲液 B1)。对缓冲液进行脱气处理,以确保最佳层析操作条件。系统优化器将混合缓冲液 A1 和 A2 以生成低盐磷酸盐洗脱缓冲液,并混合缓冲液 B1 和 B2 以生成高盐硫酸铵起始缓冲液(2.4 M (NH4)2SO4)。
  3. 通过将含有待纯化蛋白的 10 ml 细胞裂解液与 10 ml 缓冲液 B2 混合,制备 20 ml 上样样品。细胞裂解液样品溶液中硫酸铵的终浓度应约为 2.4 M (NH4)2SO4,使其大致与起始缓冲液相当。可通过将细菌细胞沉淀重悬于 TE 缓冲液(10 mM Tris,1 mM EDTA,pH 8.0)中,随后进行超声处理,或加入 1 mg/ml 溶菌酶并在 3,700 × g 下离心 10 分钟,来制备细胞裂解液。
  4. 将裂解液与缓冲液的混合物通过低蛋白吸附的 0.45 μm 注射器滤膜过滤,以去除溶液中的颗粒物。样品在上样前应始终保持在冰上。

2. DuoFlow 层析系统的物理安装与管路连接

  1. 确保所有设备的电源和通信连接均已正确连接。设备应在 Biologic DuoFlow 层析软件的手动控制窗口中可见。设备汇总见表1。系统示意图和管路连接图见图2。
  2. 将阀门的电气连接分别连接至泵工作站和系统扩展器(system maximizer)端口,确保端口号按逻辑顺序排列。为每个阀门标注其对应的端口号,以便后续参考。泵工作站和系统扩展器作为计算机/控制器与层析系统之间的主要通信接口。当阀门连接至任一设备时,软件将自动识别并显示该阀门。
  3. 技术说明:在手动模式下操作层析系统时,各阀门独立控制。在启动缓冲液流动前,特别是在切换阀门时,务必确认已正确配置所需的流路。
  4. 将聚四氟乙烯(Teflon)管路分别浸入缓冲液 A1、A2、B1 和 B2 中。确保缓冲液体积充足,能够满足整个实验流程所需,并保证管路在整个过程中持续浸没于液体中。准备 500 ml 的缓冲液 A1、A2 和 B2,以及 1 L 的缓冲液 B1 即可满足需求。
  5. 按照图2所示及制造商说明书,连接样品加载阀和动态样品环。使用尽可能短的管路将样品环连接至样品阀进样口(位置3),以最大程度减少样品加载过程中的样品稀释。
  6. 尽量缩短样品、样品加载泵与样品加载阀进样口(位置2)之间的管路长度,以减少填充样品环所需的样品量。
  7. 准备8对尺寸完全相同的1/16英寸外径PEEK管路,每对通过一个1/4-28母对1/4-28母接头连接。将这些管路对分别连接至两个柱切换阀的位置1至8。其中,连接在柱切换阀位置2至8的7个接头后续将被待测试的层析柱替换;而连接在位置1的接头将保留作为层析柱旁路。
  8. 技术说明:确保每对管路连接在两个柱切换阀的相同位置上。
  9. 打开四波长紫外/可见光检测器(QuadTec)灯和固定波长280 nm紫外检测器灯。本实验方案中,QuadTec检测的波长包括214 nm、280 nm和397 nm。同时使用固定波长紫外检测器和QuadTec检测280 nm信号,可提供系统冗余,确保数据有效性。
  10. 根据制造商说明书确认所有检测器已完成校准。背压调节器(backpressure regulator)用于减少检测器中气泡的积聚,应安装在检测器下游、pH监测器上游的位置。
  11. 本系统配置了两个组分收集器,为运行后的洗脱液分析提供了极大便利。按照图2所示连接组分收集器、分流阀和分流控制器。连接至分流阀位置1的组分收集器将在12 ml培养管中收集900 μl的洗脱组分,而连接至位置2的组分收集器将在96孔微孔板中收集100 μl的洗脱组分。
  12. 位置2的组分收集器、分流阀和分流控制器独立于层析工作站运行。分流控制器集成于Bio-Rad Econo Gradient Pump设备中,但该设备的泵组件不被使用。当分流阀连接至Econo Gradient Pump时,设备上将显示“% Split”设置选项。
  13. 将% Split设置为10。位置1的组分收集器将收集90%的洗脱液(900 μl/组分),位置2的组分收集器将收集10%的洗脱液(100 μl/组分)。两个组分收集器将同步推进,使两者的组分编号相互对应。
  14. 将位置2组分收集器上的标准滴头更换为微孔板专用滴头。微孔板滴头具有更小的出口孔径,可实现比标准50 μl更小50%的液滴体积(即25 μl),在收集≤500 μl的组分时尤为有利。
  15. 通过屏幕控制面板,设置位置2的组分收集器在96孔板中收集组分,并以1个样品/分钟的速度推进。分流控制器和位置2组分收集器将在首次层析运行开始后立即手动启动。
  16. 使用缓冲液B1冲洗位置2的组分收集器和微孔板滴头。

3. 预处理系统管路、设置运行方法及平衡HIC色谱柱

  1. 将系统增强器的进液管浸入已脱气的缓冲液A1、A2、B1和B2中,按照制造商说明启动工作站泵,冲洗样品环并清洗层析系统。为彻底去除残留气泡,需依次完成全部4个增强器系统进液口(A1、A2、B1和B2)的预冲洗步骤。
  2. 系统准备需通过BioLogic软件手动操作系统控制器。在启动缓冲液流动前,确认样品加载阀和柱选择阀的位置正确。
  3. 按照步骤3.4–3.5所述,准备以1 ml/分钟的手动流速将洗脱缓冲液(0 %B)流经系统。
  4. 在BioLogic程序软件的“设置”窗口中,选择“使用缓冲液混合”和“含硫酸铵的磷酸盐缓冲液”。确认“设置”窗口中列出的缓冲液A1、A2、B1和B2与实际配制的缓冲液一致。
  5. 手动将流速设定为1 ml/分钟的洗脱缓冲液(0 %B)。观察背压、电导率、UV信号和pH值保持稳定且在正常操作范围内。若出现异常,表明存在气泡或柱堵塞,需在继续操作前予以排除。
  6. 用5 ml洗脱缓冲液冲洗全部8条柱选择管路。操作方法为:先停止流动,将两个柱选择阀均置于位置2,然后恢复1 ml/分钟流速、0 %B条件下的流动。对位置3–8的柱选择管路重复此操作。
  7. 将1 ml HiTrap HIC柱连接至柱选择阀的位置2–8。步骤3.8–3.13需逐个柱依次完成。注意记录每个HIC柱所安装的阀位。HIC柱介质特性的汇总见表2
  8. 将GE Healthcare的HiTrap柱连接至Bio-Rad DuoFlow系统时,需使用一系列接头,包括1/4-28、M6和鲁尔接头。拆下连接位置2柱选择阀的接头,按照图3所示对齐Bio-Rad与GE Healthcare的接头。
  9. 将柱上游接头连接至DuoFlow系统。为避免在柱或管路中截留气泡,应牢固连接上游柱接头与上游选择阀接头。让洗脱缓冲液流经接头,直至所有气泡排出,并在末端形成一大滴缓冲液。暂时停止缓冲液流动。
  10. 取下连接于柱入口的堵头,并在柱顶部加入一大滴低盐缓冲液(0 %B)。将柱连接至上游接头。确保柱入口和入口接头均被缓冲液滴充满,以保证连接处无气泡。
  11. 若柱为首次使用,需折断柱出口端。将出口连接至下游柱接头和选择阀管路。确认所有接头均已牢固拧紧。
  12. 将背压限值设为40 psi。以1 ml/分钟的流速,用5个柱体积(5柱体积 = 5 ml)的洗脱缓冲液(0 %B)清洗柱。如有必要,继续清洗直至pH、UV信号和背压稳定。
  13. 以1 ml/分钟的流速,用10个柱体积(10 ml)的起始缓冲液(100 %B)清洗柱。如有必要,继续清洗直至前一步骤中列出的系统参数以及电导率均达到稳定。
  14. 上述准备完成的HIC柱现已可进行样品上样。当所有待测试柱均准备完毕后,手动将柱选择阀切换至位置1(接头连接状态),并停止缓冲液流动。

4. 样品上样

  1. 将样品进样管浸入20 ml样品中,开始将样品加载至动态样品环。在BioLogic软件的手动设置窗口中,将样品环加载/清洗阀切换至位置1(样品),并将样品加载阀切换至冲洗位。
  2. 启动样品环加载泵,以1 ml/分钟的流速将样品吸入泵管,直至样品刚刚到达样品加载阀。此步骤可去除样品加载管路中的缓冲液和/或空气。
  3. 停止加载泵的流动,将样品加载阀从冲洗位切换至加载位。以1 ml/分钟的流速重新启动样品环加载泵,直至有10 ml样品被吸入动态样品环中。
  4. 此时动态样品环中已加载足够样品,可用于最多10次连续的HIC柱筛选运行。

5. 编程软件方法并运行柱筛选方案

  1. 在 BioLogic 软件的设置窗口中,选择 表 1 中用星号标记的系统设备。
  2. 选择 6 根疏水相互作用色谱(HIC)柱进行分析。按照表 3 所示,程序化设置一个线性递减盐梯度和 6 柱筛选方法。该方法程序基于 BioLogic 软件 HIC 柱设置修改而成,并已针对当前应用进行了优化。
  3. 由于馏分收集器的限制,建议采用 6 柱筛选方法。如果将程序方法调整为收集更大体积的馏分,则可对全部 7 根色谱柱进行筛选。在程序尚未完全设定完成前,不要添加筛选步骤,因为一旦启用筛选功能,将无法进行后续编辑。
  4. 开始筛选运行。手动启动起始缓冲液(100 %B)流动,流速为 1 ml/分钟。按下分流控制器上的“开始”按钮,使洗脱液流按 90%-10% 的比例分别进入 12 ml 培养管馏分收集器(位置 1)和 96 孔板馏分收集器(位置 2)。技术说明:请注意,96 孔板馏分收集器是脱离 BioLogic 软件离线操作的。
  5. 运行程序方法。在启动程序方法运行后,立即点击离线 96 孔板馏分收集器屏幕控制面板上的“开始”按钮。如果两个馏分收集器未完全同步,则当另一个馏分收集器进入第二个收集管时,需手动推进离线 96 孔板馏分收集器。
  6. 观察实时显示以确认预期的运行参数。反压、电导率和 %B(图 4)是可用于监测的运行参数,以确保各色谱柱之间运行条件的可重复性。还应监测阀位、pH 值和样品上样情况。可通过比较紫外(UV)图谱来验证流出液洗脱峰的相似性。
  7. 利用在线和运行后洗脱液分析技术,确定目标蛋白(即“目标蛋白”)的洗脱曲线和纯化效果。
  8. 对于含有绿色荧光蛋白(GFP)的样品,可通过蛋白在 397 nm 处特有的紫外吸收在线观察洗脱过程。将 GFP 特异性的 397 nm 吸收图谱与普通蛋白的 280 nm 吸收图谱进行比较,以评估使用不同 HIC 介质进行筛选时的相对分离和纯化效果(图 5)。
  9. 运行后对 GFP 及其他目标蛋白的分析可通过多种方法完成。可将 96 孔板中各馏分的 5–50 μl 等分试样转移至新板,通过 ELISA 或 Western 印迹法检测特异性蛋白含量;各馏分的总蛋白含量可通过常规 SDS-PAGE 或 Experion 微流控电泳系统进行分析。GFP 荧光可通过紫外光在 12 ml 培养管中检测(图 6)。
  10. 通过比较 GFP 洗脱峰相对于样品中其他蛋白的洗脱情况,可确定最具前景的 HIC 介质。随后可根据其他参数(包括起始缓冲液类型、浓度和 pH 值)进一步优化该介质的纯化条件。
  11. 技术说明:实验结束后,将所有进液管插入缓冲液 B1(脱气 H2O)中,用水彻底冲洗泵、阀门和所有管路。请遵循制造商关于色谱系统和 HIC 柱清洁及长期储存的说明。

6. 代表性结果:

代表性HIC盐梯度、电导率及柱压的初步实验结果如图所示 图4盐浓度的变化(蓝线)是疏水相互作用色谱(HIC)方法的典型特征,以高盐缓冲液流出比例表示。随着盐浓度降低,结合在柱上的蛋白质逐步洗脱。电导率(红线)反映实际盐浓度,在QuadTec和紫外检测器之后通过在线方式实时测定。盐梯度与电导率曲线之间的偏移反映了缓冲液从缓冲液入口经系统流动至电导监测器所需的时间。在整个样品运行过程中,系统压力(灰色线)和pH值保持相对稳定。

图5展示了连续进行的疏水相互作用色谱(HIC)柱筛选实验的色谱图。通过分别测量280 nm和397 nm波长下的光吸收值,可在线检测总蛋白(A280,蓝线)和绿色荧光蛋白(GFP,A397,绿线)。通过比较这两条曲线,可以估算每次筛选实验中GFP的相对丰度及其分离效果。GFP与所测试的HIC柱结合的亲和力程度不同,其洗脱谱图也有所差异。选择后续纯化所用的最佳HIC柱的依据是:找出能够产生最尖锐的GFP洗脱峰以及与其他蛋白质分离度最高的色谱柱。

图6中,苯基FF(高取代)预实验中第10、12、14、16和18组分的培养管分别在环境室内(荧光)光和紫外光(UV)下进行观察。培养管以正面朝向(左图)和自上而下(右图)两种视角观察,以检测特征性的GFP发射光谱。在两张紫外光图像中,第14组分均清晰检测到GFP(绿色)信号。这些运行后的数据与通过在线检测洗脱液在397 nm处的吸光度(A397,绿色曲线)所获得的结果高度一致,后者同样识别出第14组分为洗脱GFP的主要峰。左侧紫外光图像中的弥散蓝色光来自紫外灯本身的发射光。

figure-protocol-1
图1. 本实验方案的示意图。制备含有目标蛋白(GFP,目标蛋白)的细菌裂解液,将其稀释至与层析起始缓冲液相当的高盐缓冲液中,并进行过滤。待液相层析系统准备就绪后,将样品上样,并利用预装填的疏水相互作用层析(HIC)柱中的疏水层析介质,将目标蛋白从裂解液中的其他蛋白中分离出来。通过使用不同的层析介质(称为柱筛选)多次重复该分离方法,以确定哪种介质可实现最佳的GFP分离效果。洗脱出的蛋白(洗脱液)通过层析系统内置的检测器进行在线分析,并收集为较小的组分,用于后续(运行后)分析。根据对GFP活性及分离效果的在线和运行后分析结果,确定最优的HIC柱及层析介质。

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表1. 本实验方案中使用的关键色谱系统组件。

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图2. 所采用的Bio-Rad DuoFlow中压液相色谱系统的示意图。该系统的主要特点包括自动缓冲液混合、连续上样进行多轮柱层析、自动选择不同的色谱柱、洗脱液的在线分析,以及分级洗脱液的串联收集。详见正文及表1。

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表2. 所测试的疏水相互作用层析介质的生物物理特性。HiTrap HIC色谱柱的名称反映了其配体、配体密度和微球粒径。

*FF = 快流速;HP = 高性能。较大的微珠粒径可提高配体结合能力和流速,较小的微珠粒径可提高色谱分辨率。信息来源于制造商提供的文献。

figure-protocol-5
图3. GE Healthcare HiTrap 疏水相互作用色谱柱与 Bio-Rad DuoFlow 系统的连接方式。在上游的 1/4-28 Delrin 螺母和卡环(A1)上,连接一个阳螺纹鲁尔接头转阴螺纹 1/4-28 接头(B1)以及阳螺纹 1/16 英寸接头转阴螺纹鲁尔接头(C)。在用缓冲液冲洗并排除所有气泡后,将这些接头连接至 HiTrap 色谱柱。色谱柱出口连接一个阴螺纹 1/16 英寸接头转阳螺纹 M6 接头(D)、阳螺纹鲁尔接头转阴螺纹 M6 接头(E)以及阴螺纹鲁尔接头转阴螺纹 1/4-28 接头(B2)。整个组件最终连接至下游的 1/4-28 Delrin 螺母和卡环(A2)。上图显示各接头分离状态,下图显示接头组装完成状态。

步骤 #体积 (mL)描述参数
10.00在整个运行过程中收集 1.0 mL 的组分  
20.00切换色谱柱HIC 色谱柱 1
(位置 2)
 
30.00等度洗脱pH: 6.80
100% B
体积: 2.00 mL
流速: 1.00 mL/min
42.00基线归零QuadTec 
52.00基线归零UV 检测器 
63.00进样样品加载
动态环
自动进样阀
体积: 0.50 mL
流速: 1.00 mL/min
78.00等度洗脱pH: 6.80
100% B
体积: 5.00 mL
流速: 1.00 mL/min
818.00线性梯度洗脱pH: 6.80
100% B → 0% B
体积: 10.00 mL
流速: 1.00 mL/min
921.00等度洗脱pH: 6.80
0% B
体积: 3.00 mL
流速: 1.00 mL/min
1026.00等度洗脱pH: 6.80
100% B
体积: 5.00 mL
流速: 1.00 mL/min
1126.00切换色谱柱连接头
(位置 1)
 
结束26.00程序结束将自动使用另外 5 根 HIC 色谱柱重复运行
(位置 3–7)
预筛查类型运行次数: 6被筛查的步骤数: 1

表3. 所采用的HIC初步筛选方法的BioLogic软件方案。

figure-protocol-6
图4. 典型的疏水相互作用层析(HIC)盐浓度梯度、电导率及柱压变化。随着盐浓度(蓝线)降低,电导率(红线)也随之下降。盐梯度与电导率曲线之间的偏移反映了缓冲液从缓冲液入口流至电导监测器所需的时间。在初步摸索运行期间,系统压力(灰线)保持相对稳定。

figure-protocol-7
图5. 连续进行的HiTrap疏水相互作用色谱(HIC)柱筛选实验的合并色谱图。通过分别测量280 nm和397 nm波长下的光吸收值,实现对总蛋白(A280,蓝色线)和绿色荧光蛋白(GFP,A397,绿色线)的在线检测。在本系列实验中,使用苯基FF(高取代度,Phenyl FF (high sub))色谱柱时观察到最尖锐的GFP洗脱峰,该柱对GFP与其他蛋白的分离效果也最为显著。此外还测试了其他几种1 ml HiTrap HIC柱,包括苯基快速流速低取代度柱(Phenyl FF (low sub))、丁基快速流速柱(butyl FF)、丁基-S快速流速柱(butyl-S FF)和辛基快速流速柱(octyl FF)。

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图6. 样品洗脱液中GFP的代表性运行后可视化结果。洗脱组分以每分钟1管的速率收集,每管均检测GFP含量。在此代表性图示中,苯基FF(高取代度)预实验的第10、12、14、16和18组分在环境室内荧光灯和紫外光(UV)下进行观察。各管均以正面(左图)和俯视(右图)两种视角观察。左图UV图像中的弥散蓝色为UV灯发出的光。在两幅UV图像中,第14组分均清晰可见GFP(绿色)信号。上方图示显示了被观察的5个组分的总蛋白(A280,蓝线)和GFP(A397,绿线)色谱图谱。

讨论

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液相色谱技术已被证明在制备高纯度蛋白质方面具有重要价值,这些蛋白质是开展免疫学6、生物化学7和结构学8研究所必需的。疏水相互作用色谱(HIC)纯化方法通常需要通过实验确定最佳介质,且配体结构、配体密度以及基质微球的性质均已被证明会影响色谱结果2, 3。自动柱筛选是一种高效的方法,可用于选择适合后续优化及蛋白质纯化的HIC介质4。所介绍的自动柱筛选方法可轻松适用于多种HIC蛋白质纯化策略。改变盐浓度、盐种类、盐梯度和pH值可能进一步优化纯化条件,这些关键参数的影响此前已有综述13,14。含有部分纯化目标蛋白的HIC洗脱液可进一步采用互补的色谱技术进行纯化,例如离子交换色谱(IEX)或凝胶过滤/尺寸排阻色谱9,10

由于绿色荧光蛋白(GFP)具有独特的光吸收和发射特性,因此可通过在线检测和运行后分析方法来识别其洗脱曲线。基于此,本方案还可进一步适用于重组GFP融合蛋白的纯化,其中将目标蛋白与GFP进行“标记”。GFP标记的目标蛋白可通过紫外光检测11,并利用多种色谱方法进行纯化,包括上述的疏水相互作用色谱(HIC)纯化策略。此外,GFP的纯化已成为生物化学实验教学中的经典内容,广泛用于讲授现代蛋白质科学技术12

尽管使用性能较弱的色谱系统也可进行基本的疏水相互作用层析(HIC)蛋白纯化,但本文所介绍的仪器系统在获得理想实验结果方面具有多项显著优势。使用高度自动化系统的显著优点包括:提高了运行间条件的重现性、节省时间,并减少了空气进入系统的可能性10。由系统增强模块(system maximizer)支持的系统控制缓冲液混合功能,有助于提高缓冲液配制的一致性和实验的可重复性。在所有预实验运行中,将足量样品加载至动态样品环中,可进一步确保加入每根层析柱的样品均一,并支持连续运行而无需中断或手动重新加样。通过样品环将样品可控地注入层析柱,可降低手动加样可能带来的变异性。成对的层析柱选择阀允许连续进行样品运行,每次使用不同的HIC层析柱,而无需重新连接管路。多波长分析在检测具有独特分光光度特征的蛋白质时尤为有利。除绿色荧光蛋白(GFP)外,细胞色素、黄素蛋白以及其他含血红素的蛋白质也可能从该技术中受益。电导率和pH监测装置可用于实时验证实验条件。分流式组分收集功能可改善组分处理,并便于将少量样品转移至后续分析方法(如ELISA、SDS-PAGE、Western印迹和Experion微流控电泳)。尽管第二台组分收集器离线操作需要手动同步,但这提供了在选择组分收集器时的最大灵活性。使用如此高性能的色谱系统进行HIC层析柱筛选和蛋白纯化最主要的缺点是仪器购置和操作人员培训所需的初始时间和经费投入。

本文所述方案采用 Bio-Rad DuoFlow 层析系统;然而,其他厂商生产的性能相当的仪器,例如 GE Healthcare 的 ÄKTA Avant,同样可以使用,并能够获得等效的结果。即使类似的层析系统也具有各自独特的特性(如方法编程、组件命名、操作者偏好以及可放大性限制),在启动纯化程序或采购仪器之前应予以充分考虑。

披露

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$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

层析试剂及补充仪器由 Bio-Rad 提供。

致谢

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$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

本工作由美国国立卫生研究院资助项目 GM086822 和美国国家科学基金会重大研究仪器项目 DBI-0960313 资助。作者谨此感谢 Bio-Rad 公司的 Jon Miyake 博士与 Donna Hardy 博士以及西雅图大学的 Jennifer Loertscher 在技术方面的专业支持。部分层析试剂和补充仪器由 Bio-Rad 公司慷慨提供。

材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
BioLogic DuoFlow Pathfinder 20 系统Bio-Rad7602257包含系统增强模块、混合器、F10 工作站、AVR7-3 阀、带流通池的 QuadTec UV/Vis 检测器、BioFrac 组分收集器、BioLogic 软件和入门套件
AVR9-8 流路选择阀Bio-Rad7600408
分流阀 SV3-2Bio-Rad7500410
流路分流阀Bio-Rad7410017
DynaLoop 25 套件Bio-Rad7500451
BioFrac 组分收集器Bio-Rad7410002使用两个组分收集器
BioFrac 微孔板滴加头适配器Bio-Rad74010088
BioFrac 微量滴定板适配器Bio-Rad7410017
紫外光学模块Bio-Rad7500202
卤素灯Bio-Rad7601331
Econo 梯度泵Bio-Rad7319001
Experion 系统Bio-Rad7007001
Experion Pro260 分析试剂盒Bio-Rad7007102
HiTrap HIC 柱筛选试剂盒GE Healthcare28-4110-07包含 7 支 1 ml 预装 HIC 介质的层析柱,用于条件筛选
GE Healthcare 至 Bio-Rad 柱接头GE Healthcare18111251 和 18111257

参考文献

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  1. Cummins, P. M., O'Connor, B. F. Hydrophobic interaction chromatography. Methods Mol. Biol. 681, 431-437 (2011).
  2. Nagrath, D., Xia, F., Cramer, S. M. Characterization and modeling of nonlinear hydrophobic interaction chromatographic systems. J. Chromatogr. A. 1218, 1219-1226 (2011).
  3. To, B. C., Lenhoff, A. M. Hydrophobic interaction chromatography of proteins. IV. Protein adsorption capacity and transport in preparative mode. J. Chromatogr. A. 1218, 427-440 (2011).
  4. Huddleston, J. G., Wang, R., Lyddiatt, A. On the use of mild hydrophobic interaction chromatography for "method scouting" protein purification strategies in aqueous two-phase systems: a study using model proteins. Biotechnol Bioeng. 44, 626-635 (1994).
  5. Arun, K. H., Kaul, C. L., Ramarao, P. Green fluorescent proteins in receptor research: an emerging tool for drug discovery. J. Pharmacol. Toxicol. Methods. 51, 1-23 (2005).
  6. Terrizzi, S. C., Banh, C., Brossay, L.A Protocol for the Production of KLRG1 Tetramer. J. Vis. Exp. (35), e1701-e1701 (2010).
  7. Murphy, P. J. M., Morishima, Y., Kovacs, J. J., Yao, T. P., Pratt, W. B. Regulation of the dynamics of hsp90 action on the glucocorticoid receptor by acetylation/deacetylation of the chaperone. J. Biol. Chem. 280, 33792-33799 (2005).
  8. Zeytuni, N., Zarivach, R. Purification of the M. magneticum strain AMB-1 Magnetosome Associated Protein MamAΔ41. J. Vis. Exp. (37), 10-3791 (2010).
  9. Kong, Y., Li, X., Bai, G., Ma, G., Su, Z. An automatic system for multidimensional integrated protein chromatography. J. Chromatogr. A. 1217, 6898-6904 (2010).
  10. Camper, D. V., Viola, R. E. Fully automated protein purification. Anal. Biochem. 393, 176-181 (2009).
  11. Hammon, J., Palanivelu, D. V., Chen, J., Patel, C., Minor, D. L. A green fluorescent protein screen for identification of well-expressed membrane proteins from a cohort of extremophilic organisms. Protein Sci. 18, 121-133 (2009).
  12. Wu, Y. Using green and red fluorescent proteins to teach protein expression, purification, and crystallization. Biochem. Mol. Biol. Educ. 36, 43-54 (2008).
  13. Queiroz, J. A., Tomaz, C. T., Cabral, J. M. Hydrophobic interaction chromatography of proteins. J. Biotechnol. 87, 143-159 (2001).
  14. McCue, J. T. Theory and use of hydrophobic interaction chromatography in protein purification applications. Methods Enzymol. 463, 405-414 (2009).

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