本文介绍了一种用于自动筛选适用于蛋白质纯化过程中疏水相互作用色谱(HIC)介质的自动化方法。该方法采用中压液相色谱系统,包含自动缓冲液配制、动态样品环进样、顺序柱切换、多波长分析以及分流收集洗脱组分等功能。
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本文介绍了一种用于自动筛选适用于蛋白质纯化过程中疏水相互作用色谱(HIC)介质的自动化方法。该方法采用中压液相色谱系统,包含自动缓冲液配制、动态样品环进样、顺序柱切换、多波长分析以及分流收集洗脱组分等功能。
与其他蛋白质纯化色谱方法(如凝胶过滤、亲和层析和离子交换层析)不同,疏水相互作用色谱(HIC)通常需要通过实验确定(称为筛选或“ scouting”)以选择最适合纯化特定蛋白质的色谱介质1。本文所述方法介绍了一种自动化的策略,用于筛选最适合蛋白质纯化的HIC介质。
疏水相互作用层析(HIC)根据蛋白质和其他生物分子疏水性的差异,从粗裂解液中将其分离。与亲和层析(AC)和离子交换层析(IEX)类似,HIC 在层析过程中能够对目标蛋白进行浓缩。最适合采用 HIC 进行纯化的蛋白质通常具有疏水性表面区域,并能够耐受高于 2 M 的硫酸铵((NH4)2SO4)盐浓度。当目标蛋白缺乏亲和标签而无法使用 AC,或 IEX 无法实现充分纯化时,HIC 常被选为纯化方法。蛋白质表面的疏水基团会暂时结合到连接于惰性、不溶性基质上的非极性配体。蛋白质与配体之间的相互作用高度依赖于流经层析柱的缓冲液中的盐浓度:高离子强度可增强蛋白质与配体的结合,使蛋白质保持不移动状态(即结合在柱内)2。随着盐浓度降低,蛋白质与配体之间的相互作用减弱,蛋白质重新变为可移动状态并从柱中洗脱出来。目前市面上有多种预装柱形式的 HIC 介质,每种介质均含有不同的疏水性配体(例如 S-丁基、丁基、辛基和苯基),以不同密度交联于特定直径的琼脂糖微球上3。通过自动化的柱筛选系统,可高效地确定在后续更深入的优化实验及蛋白质纯化过程中应选用的 HIC 介质4。
此处纯化的特定蛋白为重组绿色荧光蛋白(GFP);然而,该方法也可适用于纯化具有一个或多个疏水表面区域的其他蛋白。由于GFP具有稳定性、在397 nm处独特的光吸收峰以及在紫外光照射下产生荧光的特性,因此是一种有用的模型蛋白5。含有野生型GFP的细菌裂解液在高盐缓冲液中制备后,加载至Bio-Rad DuoFlow中压液相色谱系统,并吸附到含有不同疏水相互作用层析(HIC)介质的HiTrap HIC柱上。蛋白从层析柱中洗脱,并通过在线及运行后检测方法进行分析。缓冲液梯度混合、动态样品环进样、顺序柱切换、多波长分析以及分流收集洗脱组分等功能增强了系统的操作灵活性及实验方法的可重复性。
1. 缓冲液与样品制备
2. DuoFlow 层析系统的物理组装与管路连接
3. 预处理系统管路、设置运行方法及平衡HIC色谱柱
4. 样品上样
5. 编程软件方法并运行柱筛选方案
6. 代表性结果:
代表性HIC盐梯度、电导率及柱压的初步实验结果如图所示 图4盐浓度的变化(蓝线)是疏水相互作用色谱(HIC)方法的典型特征,通过高盐缓冲液管道中引出的缓冲液百分比进行测定。随着盐浓度降低,结合在柱上的蛋白质逐步洗脱。电导率(红线)反映实际盐浓度,在QuadTec和紫外检测器之后立即进行在线检测。盐梯度与电导率曲线之间的偏移表明缓冲液从缓冲液入口经系统流动至电导监测器所需的时间。在整个样品运行过程中,系统压力(灰色线)和pH值保持相对稳定。
图5显示了连续进行的疏水相互作用色谱(HIC)柱筛选实验的色谱图。通过分别测量280 nm和397 nm波长下的光吸收值,可在线检测总蛋白(A280,蓝线)和绿色荧光蛋白(GFP,A397,绿线)。通过比较这两条曲线,可以估算每次筛选实验中GFP的相对丰度及其分离效果。GFP与所测试的HIC柱结合的亲和力程度不同,其洗脱谱图也有所差异。选择后续纯化实验中优先使用的HIC柱,应基于能够产生最尖锐的GFP洗脱峰以及与其他蛋白实现最佳分离的色谱柱。
在图6中,苯基疏水相互作用层析(Phenyl FF,高取代度)预实验中第10、12、14、16和18组分的培养管分别在环境室内(荧光)光源和紫外(UV)光源下进行观察。为观察绿色荧光蛋白(GFP)的特征性发射光谱,培养管均以正面(左图)和俯视(右图)两种视角进行成像。在两张UV图像中,第14组分均清晰可见GFP(绿色)荧光信号。这些运行后数据与在线检测结果高度一致:通过测定洗脱液在397 nm处的吸光度(A397,绿色曲线),同样可确定第14组分为洗脱GFP的主要峰。左图UV图像中的弥散蓝色光为UV灯本身发出的光源。

图 1。本实验方案的示意图。制备含有目标蛋白(GFP,目标蛋白)的细菌裂解液,将其稀释至与色谱起始缓冲液盐浓度相当的高盐缓冲液中,并进行过滤。液相色谱系统准备就绪后,将样品上样,并利用预装填的疏水相互作用色谱(HIC)柱中的疏水色谱介质,将目标蛋白与裂解液中的其他蛋白分离。通过使用不同的色谱介质重复多次分离步骤(称为柱筛选),以确定哪种介质可实现最佳的GFP分离效果。洗脱出的蛋白(洗脱液)通过色谱系统内置的检测器进行在线分析,并被收集为较小的组分,用于后续(运行后)分析。根据GFP活性及分离效果的在线和运行后分析结果,确定最优的HIC柱及色谱介质。

表1. 本实验方案中使用的色谱系统关键组件。

图 2. 所使用的 Bio-Rad DuoFlow 中压液相色谱系统的示意图。该系统的主要特点包括自动缓冲液混合、连续上样进行多柱运行、自动选择不同的色谱柱、洗脱液的在线分析,以及分步收集洗脱组分。详见正文及表 1。

表 2. 所测试疏水相互作用色谱介质的生物物理特性。HiTrap HIC 柱的名称表示其配体、配体密度和珠粒大小。
*FF = 快流速;HP = 高性能。较大的微珠粒径可提高配体结合能力和流速,较小的微珠粒径可提高色谱分辨率。信息来源于制造商提供的文献。

图3. GE Healthcare HiTrap HIC 色谱柱与 Bio-Rad DuoFlow 系统的连接方式。在上游的 1/4-28 Delrin 螺母和卡套(A1)上,连接一个公Luer转母1/4-28接头(B1)和一个公1/16"转母Luer接头(C)。在用缓冲液冲洗并去除所有气泡后,将这些接头连接至 HiTrap 色谱柱。色谱柱出口连接一个母1/16"转公M6接头(D)、公Luer转母M6接头(E)以及母Luer转母1/4-28接头(B2)。整个组件最终连接至下游的1/4-28 Delrin螺母和卡套(A2)。上方面板显示各接头分离状态,下方面板显示接头组装后的状态。
| 步骤 # | 体积 (mL) | 描述 | 参数 | |
| 1 | 0.00 | 在整个运行过程中收集 1.0 mL 的组分 | ||
| 2 | 0.00 | 切换色谱柱 | HIC 色谱柱 1 (位置 2) | |
| 3 | 0.00 | 等度洗脱 | pH: 6.80 100% B | 体积: 2.00 mL 流速: 1.00 mL/min |
| 4 | 2.00 | 基线归零 | QuadTec | |
| 5 | 2.00 | 基线归零 | UV 检测器 | |
| 6 | 3.00 | 进样 | 样品加载 动态环 | 自动进样阀 体积: 0.50 mL 流速: 1.00 mL/min |
| 7 | 8.00 | 等度洗脱 | pH: 6.80 100%B | 体积: 5.00 mL 流速: 1.00 mL/min |
| 8 | 18.00 | 线性梯度洗脱 | pH: 6.80 100%B -> 0%B | 体积: 10.00 mL 流速: 1.00 mL/min |
| 9 | 21.00 | 等度洗脱 | pH: 6.80 0%B | 体积: 3.00 mL 流速: 1.00 mL/min |
| 10 | 26.00 | 等度洗脱 | pH: 6.80 100%B | 体积: 5.00 mL 流速: 1.00 mL/min |
| 11 | 26.00 | 切换色谱柱 | 连接头 (位置 1) | |
| 结束 | 26.00 | 程序结束 | 自动重复使用另外 5 根 HIC 色谱柱 (位置 3–7) | |
| 预筛查类型 | 运行次数: 6 | 预筛查步骤数: 1 | ||
表3. 所采用的HIC初步筛选方法的BioLogic软件方案。

图 4. 典型的疏水相互作用色谱(HIC)盐梯度、电导率和柱压变化。随着盐浓度(蓝线)降低,电导率(红线)也随之下降。盐梯度与电导率曲线之间的偏移反映了缓冲液从缓冲液入口到达电导监测器所需的时间。在初步摸索运行期间,系统压力(灰线)保持相对稳定。

图 5. 连续进行的HiTrap疏水相互作用色谱(HIC)柱筛选实验的合并色谱图。通过分别测量280 nm和397 nm波长下的光吸收值,实现对总蛋白(A280,蓝色线)和绿色荧光蛋白(GFP,A397,绿色线)的在线检测。在本系列实验中,使用苯基FF(高取代)柱时观察到最尖锐的GFP洗脱峰,且该柱对GFP与其他蛋白质的分离效果也最佳。其他测试的1 ml HiTrap HIC柱包括苯基快速流低取代(Phenyl FF (low sub))、丁基快速流(butyl FF)、丁基-S快速流(butyl-S FF)和辛基快速流(octyl FF)。

图6. 样品洗脱液中GFP的典型运行后可视化结果。洗脱组分以每分钟1管的速率收集,并对每管进行GFP含量分析。在此代表性图示中,苯基FF(高取代)预实验的第10、12、14、16和18组分的培养管在环境室内(荧光)光和紫外(UV)光下进行观察。各管均以正面(左图)和俯视(右图)两种视角观察。左侧UV图中的弥散蓝色为UV灯发出的光。在两张UV图像中,第14组分均清晰可见GFP(绿色)信号。上方图示显示了被观察的5个组分的总蛋白(A280,蓝线)和GFP(A397,绿线)色谱图谱。
液相色谱技术已被证明在制备高纯度蛋白质方面具有重要价值,这些蛋白质是开展免疫学6、生物化学7和结构学8研究所必需的。疏水相互作用色谱(HIC)纯化方法通常需要通过实验确定最佳介质,且配体结构、配体密度以及基质微球的性质均已被证明会影响色谱结果2, 3。自动柱筛选是一种高效的方法,可用于选择适合后续优化及蛋白质纯化的HIC介质4。所介绍的自动柱筛选方法可轻松适用于多种HIC蛋白质纯化策略。改变盐浓度、盐种类、盐梯度和pH值可能进一步优化纯化条件,这些关键参数的影响此前已有综述13,14。含有部分纯化目标蛋白的HIC洗脱液可进一步采用互补的色谱技术进行纯化,例如离子交换色谱(IEX)或凝胶过滤/尺寸排阻色谱9,10。
由于绿色荧光蛋白(GFP)具有独特的光吸收和发射特性,因此可通过在线检测和运行后分析方法来识别其洗脱曲线。基于此,本方案还可进一步适用于重组GFP融合蛋白的纯化,其中将目标蛋白与GFP进行“标记”。GFP标记的目标蛋白可通过紫外光检测11,并利用多种色谱方法进行纯化,包括上述的疏水相互作用色谱(HIC)纯化策略。此外,GFP的纯化已成为生物化学实验教学中的经典内容,广泛用于讲授现代蛋白质科学技术12。
尽管使用性能较弱的色谱系统也可进行基本的疏水相互作用层析(HIC)蛋白纯化,但本文所介绍的仪器系统在获得理想实验结果方面具有多项显著优势。使用高度自动化系统的显著优点包括:提高了运行间条件的重现性、节省时间,并减少了空气进入系统的可能性10。由系统增强模块(system maximizer)支持的系统控制缓冲液混合功能,有助于提高缓冲液配制的一致性和实验的可重复性。在所有预实验运行中,将足量样品加载至动态样品环中,可进一步确保加入每根层析柱的样品均一,并支持连续运行而无需中断或手动重新加样。通过样品环将样品可控地注入层析柱,可降低手动加样可能带来的变异性。成对的层析柱选择阀允许连续进行样品运行,每次使用不同的HIC层析柱,而无需重新连接管路。多波长分析在检测具有独特分光光度特征的蛋白质时尤为有利。除绿色荧光蛋白(GFP)外,细胞色素、黄素蛋白以及其他含血红素的蛋白质也可能从该技术中受益。电导率和pH监测装置可用于实时验证实验条件。分流式组分收集功能可改善组分处理,并便于将少量样品转移至后续分析方法(如ELISA、SDS-PAGE、Western印迹和Experion微流控电泳)。尽管第二台组分收集器离线操作需要手动同步,但这提供了在选择组分收集器时的最大灵活性。使用如此高性能的色谱系统进行HIC层析柱筛选和蛋白纯化最主要的缺点是仪器购置和操作人员培训所需的初始时间和经费投入。
本文所述方案采用 Bio-Rad DuoFlow 层析系统;然而,其他厂商生产的性能相当的仪器,例如 GE Healthcare 的 ÄKTA Avant,同样可以使用,并能够获得等效的结果。即使类似的层析系统也具有各自独特的特性(如方法编程、组件命名、操作者偏好以及可放大性限制),在启动纯化程序或采购仪器之前应予以充分考虑。
层析试剂及补充仪器由 Bio-Rad 提供。
本工作由美国国立卫生研究院资助项目 GM086822 和美国国家科学基金会重大研究仪器项目 DBI-0960313 资助。作者谨此感谢 Bio-Rad 公司的 Jon Miyake 博士与 Donna Hardy 博士以及西雅图大学的 Jennifer Loertscher 在技术方面的专业支持。部分层析试剂和补充仪器由 Bio-Rad 公司慷慨提供。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| BioLogic DuoFlow Pathfinder 20 系统 | Bio-Rad | 7602257 | 包含系统增强模块、混合器、F10 工作站、AVR7-3 阀、带流通池的 QuadTec UV/Vis 检测器、BioFrac 组分收集器、BioLogic 软件和入门套件 |
| AVR9-8 流路选择阀 | Bio-Rad | 7600408 | |
| 分流阀 SV3-2 | Bio-Rad | 7500410 | |
| 流路分流阀 | Bio-Rad | 7410017 | |
| DynaLoop 25 套件 | Bio-Rad | 7500451 | |
| BioFrac 组分收集器 | Bio-Rad | 7410002 | 使用两个组分收集器 |
| BioFrac 微孔板滴加头适配器 | Bio-Rad | 74010088 | |
| BioFrac 微量滴定板适配器 | Bio-Rad | 7410017 | |
| 紫外光学模块 | Bio-Rad | 7500202 | |
| 卤素灯 | Bio-Rad | 7601331 | |
| Econo 梯度泵 | Bio-Rad | 7319001 | |
| Experion 系统 | Bio-Rad | 7007001 | |
| Experion Pro260 分析试剂盒 | Bio-Rad | 7007102 | |
| HiTrap HIC 柱筛选试剂盒 | GE Healthcare | 28-4110-07 | 包含 7 支 1 ml 预装 HIC 介质的层析柱,用于条件筛选 |
| GE Healthcare 至 Bio-Rad 柱接头 | GE Healthcare | 18111251 和 18111257 |
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