本文介绍了从小鼠全肝脏中分离表达CD133的肝干细胞和肿瘤干细胞的方法,该过程包括组织消化、细胞富集和流式细胞术分离。我们还提供了单细胞分离和克隆扩增的先进技术方案。
本文介绍了从小鼠全肝脏中分离表达CD133的肝干细胞和肿瘤干细胞的方法,该过程包括组织消化、细胞富集和流式细胞术分离。我们还提供了单细胞分离和克隆扩增的先进技术方案。
肝干细胞,又称卵圆细胞,在慢性肝损伤期间会增殖,并被认为可分化为肝细胞和胆管细胞。此外,肝干细胞还被认为是肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma)这一肝癌亚型的前体细胞。在肝脏等实体器官中开展干细胞研究的主要挑战之一,是分离出稀有细胞群体以进行深入分析。例如,肝脏中绝大多数细胞为肝细胞(实质细胞组分),其体积显著大于非实质细胞。通过富集肝脏特定的细胞组分(即实质与非实质细胞组分),并筛选CD45阴性细胞,可使起始的干细胞群体富集超过600倍。本报告所述的实验流程可实现对实体器官中相对稀有细胞群体的高效分选。该方法可用于从正常小鼠肝脏以及慢性肝损伤模型中分离肝干细胞,后者表现出肝干细胞增殖的增加。与传统的冷冻或福尔马林固定肝脏组织的免疫组织化学方法相比,本方法具有明显优势,因在初步共定位实验后,还可利用活细胞开展功能研究。为完成本报告所述操作,强烈建议与基于科研的流式细胞术核心平台建立合作关系,因为荧光激活细胞分选(FACS)的细节高度依赖专业仪器设备以及对基础流式细胞术操作的熟练掌握。本方法的特定目标是分离出可进行克隆扩增的肝干细胞群体。 体外.
所有溶液、培养基、仪器、滤器和试管均应无菌,并采用无菌操作技术处理,以降低污染风险。所有缓冲液和培养基需提前24小时配制,并于4°C保存。
1. 从完整肝脏中分离实质和非实质部分
2. 红细胞裂解
在层流罩中操作,保持细胞低温,并使用预冷至指定温度的溶液 4°C.
3. 非实质细胞组分中CD45造血细胞的去除
在超净工作台中操作,保持细胞低温,并使用冷却至4°C的溶液。
4. CD133阳性细胞的流式细胞术分离
5. 细胞培养方法
6. 使用 RT-PCR 验证双潜能状态
该步骤详见于随 RNeasy 试剂盒提供的 RNeasy 操作手册中。
7. CD133+ 干细胞成瘤潜能的验证
8. 代表性结果:
从小鼠正常的健康肝脏中,预期每只肝脏可获得的CD133+肝干细胞数量为1,000至5,000个。这类细胞在静息状态的肝脏中相对稀少,且在体外培养中增殖能力较差。我们不建议对正常肝脏进行单细胞分析,因其可扩增的活细胞得率极低。
对于具有显著慢性损伤的肝脏,例如采用含0.1% DDC的饮食处理6周1,或因基因修饰导致慢性损伤的模型,如MAT1a-/-或肝脏特异性Pten-/-小鼠2-4,所分离得到的细胞数量会增加,每只肝脏最多可分离出100,000个细胞(图2)。若使用基因工程模型,必须了解其自发性肿瘤的发生率,因为肝脏干细胞的分离操作应在无肿瘤动物中进行。例如,若MAT1a-/-模型在18个月时出现自发性肿瘤,则建议在15至16个月龄之前使用动物,以避免任何已报道的自发性肿瘤发生。
从慢性损伤模型中分离单个细胞,一旦掌握操作流程并确保细胞活力,每个96孔板可获得数个(3-9个)由单细胞扩增形成的细胞集落。图3展示了单个CD133+细胞培养7天后扩增出的细胞集落的代表性相差显微图像。
通过Albumin和Krt19的RT-PCR检测验证双潜能状态。由单细胞扩增形成的克隆集落将同时表达肝细胞标志物(Albumin)和胆管上皮细胞标志物(Krt19)。图4展示了三个分离克隆集落的双潜能表达情况,每个集落约含25个细胞,培养7天。
来自正常肝脏和化学诱导肝损伤(例如,0.1% DDC 饮食持续 6 周)的 CD133+ 干细胞在裸鼠中不会形成肿瘤。来自特定遗传模型(MAT1a-/- 或肝脏特异性 Pten-/- 小鼠)的 CD133+ 干细胞,若在晚期肿瘤前慢性损伤阶段晚期分离,则可在裸鼠中形成肿瘤。这种成瘤表型目前被认定为癌症干细胞2-4。例如,MAT1a-/- 小鼠在 18 周龄时会自发形成肝肿瘤。在肝病晚期慢性损伤阶段(15–16 周龄)分离的 CD133+ 肝干细胞,在裸鼠中可形成肿瘤。图 5 展示了由体外扩增的单个 CD133+ 肝干细胞(1 × 106 个细胞)双侧注射后形成的代表性肿瘤。
| 基因 | 上游引物 | 下游引物 |
| β-Actin | 5'-TGTTACCAACTGGGACGACA-3' | 5'-GGGGTGTTGAAGGTCTCAAA-3' |
| Albumin | 5'-CATGCCAAATTAGTGCAGGA-3' | 5'-GCTGGGGTTGTCATCTTTGT-3' |
| Keratin 19 | 5'-TGCTGGATGAGCTGACTCTG-3' | 5'-AATCCACCTCCACACTGACC-3' |
表1:RT-PCR引物设计

图 1:方法总体示意图。

图2:在高度富集的CD45阴性非实质细胞组分中鉴定出CD133+肝干细胞。 来自野生型小鼠的未损伤对照肝脏显示,在高度富集的CD45阴性非实质细胞组分中CD133+细胞占0.4%。在MAT1a-/-基因敲除模型(慢性肝损伤模型)中,同一高度富集组分内的CD133+细胞群体扩增了10倍或更多。

图3:单个CD133+克隆扩增形成的菌落。 在层粘连蛋白包被的96孔板上由单个CD133+细胞扩增出的四个菌落的相差显微镜图像。

图 4:CD133+ 肝干细胞单克隆扩增集落的双潜能基因表达。 第 7 天时,集落约含 25 个细胞。基因表达结果显示肝细胞标志物 Albumin 和胆管细胞标志物 Krt19 的表达,证实 CD133+ 细胞具有双潜能特性。

图5:CD133+ 肝干细胞在裸鼠体内形成肿瘤。箭头指示来自MAT1a-/-模型的1×106个CD133+细胞注射后4周形成的肿瘤。来自毒素诱导的慢性肝损伤(如CCl4处理或0.1% DDC饮食)的CD133+细胞则不能形成肿瘤。肿瘤形成能力用于鉴定干细胞群体中的恶性潜能或癌症干细胞表型。
与造血系统不同,在造血系统中,造血干细胞负责维持细胞分化系统,以替换白细胞、红细胞和血小板的正常生理性更新,而肝干细胞或成体肝前体细胞并不参与正常的肝脏稳态5,6。在急性肝损伤或部分肝切除后,作为已分化的肝上皮细胞,肝细胞会经历多轮增殖,以替代丢失的肝组织5,6。只有在慢性损伤情况下,才可观察到肝干细胞的增殖1,5-11。这些成体器官特异性干细胞被认为能够分化为肝细胞和胆管上皮细胞1,5-8。有趣的是,绝大多数肝癌发生在慢性损伤的基础上,因此肝干细胞也被假定为部分肝癌的前体细胞2-4,12-17
肝脏干细胞研究面临的主要挑战之一是从稀有细胞群体中分离出可用于功能分析的细胞。例如,肝脏中绝大多数细胞为肝细胞,其体积显著大于胆管细胞及其他较小的非实质细胞。通过将整个肝脏分解为不同的细胞组分(大的肝细胞——实质细胞组分和较小的细胞——非实质细胞组分),并进一步筛选CD45阴性细胞(非造血来源细胞),我们可将起始的干细胞群体富集600倍以上。1,18-21需要强调的是,我们绝非认为CD133+细胞群体是100%纯的干细胞群体,而显然代表了一类具有不同谱系来源和再增殖潜能的异质性细胞群体。该领域目前面临的主要局限之一在于干细胞与前体细胞的定义尚不明确。本研究中我们对“干细胞”一词的使用较为宽泛;但严格而言,CD133+非实质细胞属于双谱系前体细胞群体。鉴于当前肝脏干细胞与前体细胞研究的现状,本报告为对该领域感兴趣的科研人员提供了一个可行的起点。随着新标志物的出现,例如EpCAM22,23,或转录因子如Sox924,这些分子均可被整合到研究体系中。例如,我们已发现EpCAM+细胞与CD133+细胞之间存在较高的共表达率。
本报告中,我们详细描述了一种从小鼠正常肝脏以及慢性肝损伤模型中分离肝干细胞的方法,这些模型表现出肝干细胞增殖增加。该方法相较于对冷冻或福尔马林固定的肝脏组织进行常规免疫组织化学分析具有明显优势,因为分离后的活细胞可用于功能研究1,3,4。本方法的特定目标是分离出相对纯度较高的肝干细胞群体,以便在体外进行克隆扩增。
该方案的主要局限在于,经过流式细胞术分离后,大多数细胞将失去活性(参见故障排除部分)。这主要是由于细胞制备过程耗时较长,以及在分离前需要进行多项步骤以纯化目标细胞群体。如果将肝脏直接消化为单细胞悬液并立即进行FACS分析,肝细胞与其他非实质细胞之间的大小差异将导致无法有效设置FACS门控。若在未去除造血细胞的情况下使用肝脏非实质细胞,则可能存在大量来源于造血系统的CD133+细胞污染目标组分的风险。此外,通过Miltenyi滤器处理细胞时,仅能收集到单个细胞和极小的细胞簇,从而确保样本不会堵塞FACS进样针头。
该实验方案的替代方法包括针对其他细胞表面标志物(如CD49f、EpCAM)或多种标志物组合(如CD133+EpCAM+)进行调整。另一项已发表的研究采用密度梯度法从非实质细胞组分中分离肝干细胞。该方法需要使用超速离心机(8000 × g),显著延长实验时间,且据我们经验,会明显降低FACS前的细胞得率以及FACS后的细胞活力。8
未来的实验包括更广泛的基因表达分析,如胎儿肝脏基因HNF3、HNF4α和αfp。此外,还可利用蛋白质印迹分析和免疫细胞化学方法检测表达的蛋白质,以验证培养细胞中RT-PCR的结果。
需要注意的一个问题是,近期有研究发现肝星状细胞上表达CD133。25 目前我们常规对样本进行肝星状细胞标志物的筛查(参见故障排除部分),但在我们的组分中未发现明显的污染。这可能与不同的肝脏消化和细胞分离技术有关。2,3,26
基于大多数细胞在流式细胞术分选(FACS)分离后无法立即存活的事实,我们建议在将细胞用于动物实验之前,先将其以批量的CD133+细胞或单细胞形式进行培养。体外培养5至7天可显著改善肿瘤分析结果。此外,鉴于单细胞分离过程较为严苛,应仅在批量分离的CD133+细胞能够扩增形成克隆后,再进行单细胞分离操作。关于培养肝干细胞和前体细胞时可采用的不同培养条件及支架蛋白,Lola Reid 已进行了更为详尽的论述。该研究提供了可供研究人员在掌握基本分离技术后引入其研究体系的替代性条件与优化方案27,28。Reid 博士的工作还对肝干细胞与定向前体细胞之间的谱系生物学及成熟过程进行了更深入的分析。
就……而言 体内 肿瘤分析中,我们已成功使用了 freshly isolated cells 以及来自克隆扩增的 CD133+ 细胞的细胞 体外,主要使用 1x106 细胞。我们重点关注了两种慢性肝损伤的遗传品系,MAT1a-/- 以及肝脏特异性的 Pten-/- 小鼠,我们已使用裸鼠和野生型小鼠作为肿瘤生长的宿主。根据我们的经验,CD133+ 肝干细胞仅在从具有显著肝损伤且处于癌前状态的模型中分离时才能形成肿瘤。需要注意的是,由 CD133+ 细胞形成的肿瘤通常同时具有肝细胞癌和胆管细胞癌的特征,提示这些肿瘤起源于干细胞或前体细胞。2-4,29
在记录肿瘤后,后续工作包括对肿瘤组织进行常规病理学分析(H&E染色)以及免疫组织化学染色。此外,肿瘤组织可被切碎并消化,用于流式细胞术分析或重新培养。2-4,30
综上所述,我们详细描述了一种分离、扩增和基本表征CD133+肝干细胞及CD133+肿瘤干细胞的方法。
故障排除:
CD45 污染:
在步骤3中,如果出现CD45+细胞污染,可在FACS分析和分选前加入CD45-FITC抗体进行评估。此时应检查CD45磁珠抗体是否过期,并确保仅在滤器置于磁力架中时收集滤过液。若在滤器未置于磁力架中时收集滤过液,则其中将含有CD45+细胞。
细胞数量过少:
对于未受损的肝脏,分离得到的CD133+非实质细胞总数可能少于10,000个。这类细胞在静息状态的肝脏中极为稀少。而在慢性损伤模型(如0.1% DDC饮食模型)中,细胞数量将显著增加至100,000个。如果获得的总细胞数明显低于上述范围,应考虑流式细胞术抗体染色环节是否存在问题。需检查CD133抗体是否过期,因为染色效果不佳会导致细胞得率低下。此外,我们建议在进行流式细胞术分离前,先对肝脏非实质细胞进行流式细胞分析,以确定目标细胞的相对比例。
FACS 后细胞活力低:
细胞活力下降的问题可能与细胞处理方式及处理时间有关。理想情况下,整个细胞分离过程(步骤1-4)应连续进行,各步骤之间不得有任何延迟,并在同一天内完成。步骤1至4之间的任何显著延迟都会大幅降低细胞活力。影响细胞活力的第二个因素可能与FACS分离时使用的鞘液压力有关。我们建议使用较低的鞘液压力。最后,细胞分离后应立即接种,因为在分选后若在冰上长时间存放,也会降低细胞活力。
CD133+ 非实质细胞异质性:
近期有报道称,肝星状细胞也可能表达CD133,并具有一定的可塑性。25 因此,除了使用Albumin和Krt19验证双潜能基因外,还可进一步检测与星状细胞相关的基因,例如静息状态星状细胞中的胶质纤维酸性蛋白(glial fibrillary acidic protein),以及活化星状细胞中的α-平滑肌肌动蛋白(alpha-smooth muscle actin)和结蛋白(desmin)。3,4,26 此外,CD133+细胞群代表了一个更广泛的前体细胞群体。加入第二个标记物(如EpCAM)可能有助于进一步细化该细胞群体,减少异质性。
Rountree 博士获得拜耳制药公司的研究资助。丁博士、克罗克斯博士、Dang 女士和 VanKirk 女士无任何利益冲突需要披露。
Rountree 博士感谢儿童奇迹网络、美国国立卫生研究院(NIH)K08DK080928 和 R03DK088013 项目以及美国癌症协会研究学者奖(MGO-11651)提供的当前资助。Rountree 博士指出,本实验方案最初是在儿科科学家发展计划(NICHD 资助项目 K12-HD00850)的资助下开发并优化的。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| DMEM:F12 | Invitrogen | 10565-018 | 含酚红 |
| CD45 磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-052-301 | |
| 肝细胞生长因子 | Sigma-Aldrich | H1404 | |
| 表皮生长因子 | Sigma-Aldrich | E4127 | |
| DNase | Sigma-Aldrich | DN25 | 1 克 |
| 胶原酶 D | Roche Group | 1088874 | |
| 链霉蛋白酶 | Roche Group | 0165921 | |
| 70 微米滤网筛 | Fisher Scientific | 352350 | |
| Omniscript RT | Qiagen | 205111 | 50 次反应 |
| HotStarTaq | Qiagen | 203203 | |
| Miltenyi LD 柱 | Miltenyi Biotec | 130-042-901 | |
| CD133-PE FACS 抗体 | eBioscience | 12-1331-82 | |
| 层粘连蛋白包被板 | BD Biosciences | 354410 | 96 孔 |
| 0.05% EDTA 胰蛋白酶 | Invitrogen | 25300-354 | 100 mL |
| RNeasy 微量提取试剂盒 | Qiagen | 74004 | 50 个柱,适用于 5×105 个细胞或更少 |
| Pharm Lyse | BD Biosciences | 555899 | 10 倍浓度 |